Gabriel Soares da Silva

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Participação em eventos

Produções bibliográficas

• LOPES, BRUNO RAFAEL PEREIRA ; DA SILVA, GABRIEL SOARES ; DE LIMA MENEZES, GABRIELA ; DE OLIVEIRA, JULIANA ; WATANABE, ARIPUANÃ SAKURADA ARANHA ; PORTO, BÁRBARA NERY ; DA SILVA, ROOSEVELT ALVES ; TOLEDO, KARINA ALVES . Serine proteases in neutrophil extracellular traps exhibit anti-Respiratory Syncytial Virus activity. INTERNATIONAL IMMUNOPHARMACOLOGY , v. 106, p. 108573, 2022.

• SOUZA, PRISCILA SILVA SAMPAIO ; BARBOSA, LIA VEZENFARD ; DINIZ, LARISSA FIGUEIREDO ALVES ; DA SILVA, GABRIEL SOARES ; LOPES, BRUNO RAFAEL PEREIRA ; SOUZA, PEDRO MIYADAIRA RIBEIRO ; DE ARAUJO, GABRIELA CAMPOS ; PESSOA, DIOGO ; DE OLIVEIRA, JULIANA ; SOUZA, FÁTIMA PEREIRA ; TOLEDO, KARINA ALVES . Neutrophil extracellular traps possess anti-human respiratory syncytial virus activity: Possible interaction with the viral F protein. VIRUS RESEARCH , v. 251, p. 68-77, 2018.

• SILVA, G. S. ; TOLEDO, KARINA ALVES ; DE OLIVEIRA, JULIANA . Um estudo de docking molecular das interações entre e a Proteína F do vírus hRSV com Elastase, Mieloperoxidase e Proteinase 3 presentes nas NETs (Neutrophil Extracellular Traps). In: I Congresso de Biologia, 2018. Livro de Resumos. v. 1. p. 110-112.

• SILVA, G. S. ; OLIVEIRA, J. ; TOLEDO, K. A. . Um estudo de docking molecular das interações entre a proteína F do hRSV e MMP-9, Lisozima e Catepsina G presentes nas NETs. 2018. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• SILVA, G. S. ; OLIVEIRA, J. ; TOLEDO, K. A. . Um estudo de docking molecular das interações entre a proteína F do vírus hRSV com Elastase, Mieloperoxidase e Proteinase 3 presentes nas NETs (Neutrophil Extracellular Traps). 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SILVA, G. S. ; LOPES, BRUNO RAFAEL PEREIRA ; TOLEDO, K. A. ; OLIVEIRA, J. . Docking molecular das interações entre as proteínas das NETs e a proteína F pós-fusão do vírus hRSV. 2018. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• SILVA, G. S. ; LOPES, BRUNO RAFAEL PEREIRA ; TOLEDO, KARINA ALVES ; DE OLIVEIRA, JULIANA . A molecular docking study of interactions between NET proteins and hRSV virus F protein (pre and post-fusion). 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• MENDES, S. ; SILVA, G. S. ; TOLEDO, KARINA ALVES . Efeitos do flavonoide miricetina nas atividades inflamatórias de neutrófilos ativados por Acetato Miristato de Forbol. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• MENDES, S. ; SILVA, G. S. ; TOLEDO, KARINA ALVES . Inibição da Liberação e Atividade da Enzima Mieloperoxidase pelo flavonoide Miricetina: um estudo in vitro e in silico. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SILVA, G. S. ; LOPES, BRUNO RAFAEL PEREIRA ; TOLEDO, K. A. ; OLIVEIRA, J. . In silico screening and in vitro validation of Neutrophil Extracellular Traps proteins that interact with Respiratory Syncytial Virus. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• MENDES, S. ; SILVA, G. S. ; TOLEDO, KARINA ALVES . Análise in vitro e in silico dos efeitos dos flavonoides quercertina, miricetina e rutina na liberação e atividade da mieloperoxidase em neutrófilos humanos. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Projetos de pesquisa

• 2019 - 2020

  RESPIRATORY SYNCYTIAL VIRUS FUSION PROTEIN AS A TARGET FOR SMALL LIGANDS INHIBITORS, Descrição: One of the most efficient strategy to stop RSV activity is to block the entry of the virus in the cell so the fusion process does not occur. Some molecules with low molecular weight that are considered small ligands can act as fusion inhibitors and inhibit RSV fusion. The main objective of this study was to find some of these small ligands existed in chemical libraries and test them in silico against a trimer model of RSV fusion protein to obtain good score results. A full characterization of RSV F protein was made and a trimer model was built to be used in all analysis. Some of the already described RSV inhibitors were used as parameters for the built model. Two chemical libraries were selected to perform a screening analysis, a commercial one and an internal library from Skaggs School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences. Screening results presented about 28 viable compounds that are promising candidates that could be used as RSV fusion inhibitors, 13 from the commercial library and 15 from the internal library. This hitlist was analyzed again, resulting in the best 10 candidates, 5 from commercial library and 5 from internal library, suggesting that these molecules are the best candidates to be RSV fusion inhibitors between all the 50,000 initial molecules.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Gabriel Soares da Silva - Integrante / Ruben Abagyan - Integrante / Juliana de Oliveira - Integrante / Karina Alves de Toledo - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

• 2017 - 2020

  PROTEÍNAS DAS REDES EXTRACELULARES DE NEUTRÓFILOS INTERAGEM COM A PROTEÍNA F DO VÍRUS SINCICIAL RESPIRATÓRIO HUMANO (hRSV): UMA ABORDAGEM IN SILICO E IN VITRO, Descrição: O Vírus Sincicial Respiratório Humano (hRSV) é o principal agente etiológico das infecções virais agudas do trato respiratório inferior, interagindo com neutrófilos humanos e induzindo a formação de Redes Extracelulares de Neutrófilos (NETs) através da Proteína F existente em sua superfície, sendo ainda capturado por tais estruturas. Com o propósito de descrever as moléculas responsáveis pelas interações entre o hRSV e as NETs, análises in silico e in vitro foram realizadas. As análises in silico utilizando docking molecular foram realizadas entre a Proteína F viral, em suas conformações F0 e F1, contra proteínas das NETs (Elastase, Mieloperoxidase, Proteinase-3, Catepsina G, Lisozima, BPI, Gelatinases A e B e Defensinas 1 e 3). As proteínas das NETs interagiram diferentemente com F0 e F1. Com exceção de Gelatinase A e Defensina-1, todas as demais proteínas apresentaram energia de interação favorável com F0 em regiões antigênicas importantes para a infecção viral. Com relação á F1, todas as proteínas neutrofílicas apresentaram energia de interação favorável mas Mieloperoxidase, Catepsina G e Lisozima não interagiram com regiões antigênicas importantes. Os ensaios imunobiológicos com análises in vitro (Eletroforese, Western Blotting, Imunoprecipitação), associados ao sequenciamento proteico das amostras, apontaram moléculas sugestivas de Actina, Mieloperoxidase e Defensinas. O cruzamento de dados, apresentados pelos ensaios in silico e in vitro, sugerem que futuros esforços devem ser concentrados nas proteínas Mieloperoxidase e Defensinas. Tais informações auxiliarão na busca por moléculas das NETs que sejam potenciais alvos na inativação e/ou neutralização do ciclo viral do hRSV.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Gabriel Soares da Silva - Integrante / Juliana de Oliveira - Coordenador / Karina Alves de Toledo - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

Prêmios