Nicolas da Matta Freire Araujo
Graduado em Biomedicina pela Universidade Federal Fluminense (20152018). Realizou iniciação científica no Núcleo de Estudo de Neurofibromatose (NENF), no Hospital Universitário Antônio Pedro (20162018), com experiência em cultura de células, especialmente em linhagens de células de Schwann relacionadas à neurofibromatose tipo 1. Foi bolsista FAPERJ (20172018) no projeto Avaliação da ação do hormônio do crescimento em culturas 2D e 3D de células de Schwann isoladas de neurofibromas e tumores malignos da bainha do nervo periférico associados à neurofibromatose tipo 1.Defendeu monografia no Laboratório de Hematologia do HUAP (2018), adquirindo experiência em hematoscopia. Em 2022, concluiu o mestrado em Biologia Computacional e Sistemas pelo Instituto Oswaldo Cruz (IOC/Fiocruz), atuando na montagem Hi-C do genoma de Rhodnius prolixus, incluindo predição gênica, conciliação com predições anteriores e disponibilização dos dados em um navegador web.Após o mestrado, direcionou sua carreira para programação e desenvolvimento de software. Desenvolveu um site para a Dosimagem, startup vinculada à Incubadora de Empresas da Coppe/UFRJ, como bolsista do programa de Inserção de Pesquisadores em Empresas. Atualmente é bioinformata no GISAID, onde atua no processamento de dados e no desenvolvimento de pipelines. Também prestou serviços para a Fiocruz, incluindo a criação de um site para o CABGen e o desenvolvimento de um modelo de inteligência artificial para predição de resistência bacteriana.
Informações coletadas do Lattes em 16/12/2025
Acadêmico
Formação acadêmica
Mestrado em Biologia Computacional e Sistemas
2020 - 2022
Fundação Oswaldo Cruz
Título: Genoma de Rhodnius prolixus: predição gênica, conciliação com versões anteriores e disponibilização em navegador web, Ano de Obtenção: 2022
Rafael Dias Mesquita.Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Grande área: Ciências Biológicas
Graduação em Biomedicina
2015 - 2018
Universidade Federal Fluminense
Título: Monocitose na rotina laboratorial do Hospital Universitário Antônio Pedro nos meses de junho e julho: frequência, possíveis causas e patologias associadas
Orientador: Georgina Ribeiro Severo
Bolsista do(a): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ, FAPERJ, Brasil.
Formação complementar
2025 - 2025
Aprenda Golang do Zero! Desenvolva uma aplicação completa!. (Carga horária: 27h). , Udemy, UDEMY, Brasil.
2023 - 2023
Padrões de Projeto com Python. (Carga horária: 11h). , Udemy, UDEMY, Brasil.
2022 - 2022
Programação em JavaScript do básico ao avançado. (Carga horária: 27h). , Udemy, UDEMY, Brasil.
2022 - 2022
React do Zero a Maestria. (Carga horária: 29h). , Udemy, UDEMY, Brasil.
2022 - 2022
AWS Academy Graduate - AWS Academy Cloud Foundations. (Carga horária: 20h). , Udemy, UDEMY, Brasil.
2022 - 2022
Git e Github Essencial para o Desenvolvedor. (Carga horária: 12h). , Udemy, UDEMY, Brasil.
2022 - 2022
TypeScript do básico ao avançado. (Carga horária: 14h). , Udemy, UDEMY, Brasil.
2021 - 2022
Git e GitHub Essencial para o Desenvolvedor. (Carga horária: 12h). , Udemy, UDEMY, Brasil.
2021 - 2022
Python para Análises de Dados I. (Carga horária: 36h). , Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro, PUC-Rio, Brasil.
2021 - 2022
Git e GitHub essencial para o Desenvolvedor. (Carga horária: 12h). , Udemy, UDEMY, Brasil.
2021 - 2021
Python Basics. (Carga horária: 10h). , Let's Code, LET'S CODE, Brasil.
2021 - 2021
BLAST: Ferramenta de Alinhamentos Locais de Sequências. (Carga horária: 2h). , Udemy, UDEMY, Brasil.
2021 - 2021
Terminal Linux. (Carga horária: 1h). , Udemy, UDEMY, Brasil.
2021 - 2021
Introdução ao Sistema Operacional Linux. (Carga horária: 2h). , Udemy, UDEMY, Brasil.
2021 - 2021
Programação em Python do básico ao avançado. (Carga horária: 64h). , Udemy, UDEMY, Brasil.
2020 - 2020
Introdução ao Python. (Carga horária: 2h). , Udemy, UDEMY, Brasil.
2020 - 2020
Curso de programação com Perl para Bioinformática. (Carga horária: 3h). , Udemy, UDEMY, Brasil.
2020 - 2020
Data Science: Visualização de dados com Python. (Carga horária: 2h). , Udemy, UDEMY, Brasil.
2018 - 2018
Malária na Atenção Básica à Saúde. (Carga horária: 60h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
Idiomas
Inglês
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.
Espanhol
Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.
Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Áreas de atuação
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Biologia Molecular.
Grande área: Ciências da Saúde / Área: Medicina / Subárea: Clínica Médica/Especialidade: Hematologia.
Grande área: Ciências da Saúde / Área: Saúde Coletiva / Subárea: Análises Clínicas.
Participação em eventos
Bioinformática aplicada ao estudo de bactérias multirresistentes. 2021. (Outra).
Encontro Virtual do Grupo Arthromint.Genoma de Rhodnius prolixus: predição gênica, conciliação com versões anteriores e disponibilização em navegador web. 2020. (Encontro).
IV Encontro Carioca de Biomedicina. 2020. (Encontro).
Simplificando o currículo lattes: elaboração e atualização. 2020. (Outra).
Workshop de Python para dados biológicos. 2020. (Oficina).
II Dia Internacional da Imunologia. 2018. (Outra).
II Workshop de Computação Aplicada à Saúde. 2018. (Oficina).
1° Workshop de Resistência Bacteriana aos Antimicrobianos. 2017. (Oficina).
XVII Encontro Científico do Instituto Biomédico. 2017. (Encontro).
XXII Semana de Microbiologia e Imunologia. 2016. (Outra).
Histórico profissional
Experiência profissional
2022 - 2023
Dosimagem, DosimagemVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Desenvolvedor React, Carga horária: 40
Outras informações:
Manutenção do site na Wix;Desenvolvimento de um novo site em ReactJS;Integração com API Django usando ReduxJS;Deploy do site na AWS;
2022 - Atual
GISAIDVínculo: Prestador de Serviço, Enquadramento Funcional: Bioinformata, Carga horária: 40
Outras informações:
Utilização de Web Scraping para coleta de dados;Processamento de dados com Python|Go;Criação de scripts em Python|Go;Automação de processos;
2024 - Atual
Fundação Oswaldo CruzVínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Desenvolvedor Python, Carga horária: 40
Outras informações:
Configuração do servidor Rocky Linux;Refatoração da pipeline em Python para permitir paralelismo;Utilização do repositório DeepRC para criar modelos de IA;Treinamento de modelos de IA para prever a resistência antimicrobiana através das ORFs do genoma;
2024 - 2024
Fundação Oswaldo CruzVínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Desenvolvedor Full Stack, Carga horária: 40
Outras informações:
Design do novo site do CABGen usando o Figma;Desenvolvimento do site usando NextJS;Integração com o backend antigo;Deploy do site em NextJS no servidor Linux usando apache2;Conversão da pipeline em Perl para Python;
Criando um monitoramento
Nossos robôs irão buscar nos nossos bancos de dados todos os processos de Nicolas da Matta Freire Araujo e sempre que o nome aparecer em publicações dos Diários Oficiais, avisaremos por e-mail e pelo painel do usuário
Criando um monitoramento
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