Nicolas da Matta Freire Araujo

Graduado em Biomedicina pela Universidade Federal Fluminense (20152018). Realizou iniciação científica no Núcleo de Estudo de Neurofibromatose (NENF), no Hospital Universitário Antônio Pedro (20162018), com experiência em cultura de células, especialmente em linhagens de células de Schwann relacionadas à neurofibromatose tipo 1. Foi bolsista FAPERJ (20172018) no projeto Avaliação da ação do hormônio do crescimento em culturas 2D e 3D de células de Schwann isoladas de neurofibromas e tumores malignos da bainha do nervo periférico associados à neurofibromatose tipo 1.Defendeu monografia no Laboratório de Hematologia do HUAP (2018), adquirindo experiência em hematoscopia. Em 2022, concluiu o mestrado em Biologia Computacional e Sistemas pelo Instituto Oswaldo Cruz (IOC/Fiocruz), atuando na montagem Hi-C do genoma de Rhodnius prolixus, incluindo predição gênica, conciliação com predições anteriores e disponibilização dos dados em um navegador web.Após o mestrado, direcionou sua carreira para programação e desenvolvimento de software. Desenvolveu um site para a Dosimagem, startup vinculada à Incubadora de Empresas da Coppe/UFRJ, como bolsista do programa de Inserção de Pesquisadores em Empresas. Atualmente é bioinformata no GISAID, onde atua no processamento de dados e no desenvolvimento de pipelines. Também prestou serviços para a Fiocruz, incluindo a criação de um site para o CABGen e o desenvolvimento de um modelo de inteligência artificial para predição de resistência bacteriana.

Informações coletadas do Lattes em 16/12/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Mestrado em Biologia Computacional e Sistemas

2020 - 2022

Fundação Oswaldo Cruz
Título: Genoma de Rhodnius prolixus: predição gênica, conciliação com versões anteriores e disponibilização em navegador web, Ano de Obtenção: 2022
Rafael Dias Mesquita.Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Grande área: Ciências Biológicas

Graduação em Biomedicina

2015 - 2018

Universidade Federal Fluminense
Título: Monocitose na rotina laboratorial do Hospital Universitário Antônio Pedro nos meses de junho e julho: frequência, possíveis causas e patologias associadas
Orientador: Georgina Ribeiro Severo
Bolsista do(a): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ, FAPERJ, Brasil.

Formação complementar

2025 - 2025

Aprenda Golang do Zero! Desenvolva uma aplicação completa!. (Carga horária: 27h). , Udemy, UDEMY, Brasil.

2023 - 2023

Padrões de Projeto com Python. (Carga horária: 11h). , Udemy, UDEMY, Brasil.

2022 - 2022

Programação em JavaScript do básico ao avançado. (Carga horária: 27h). , Udemy, UDEMY, Brasil.

2022 - 2022

React do Zero a Maestria. (Carga horária: 29h). , Udemy, UDEMY, Brasil.

2022 - 2022

AWS Academy Graduate - AWS Academy Cloud Foundations. (Carga horária: 20h). , Udemy, UDEMY, Brasil.

2022 - 2022

Git e Github Essencial para o Desenvolvedor. (Carga horária: 12h). , Udemy, UDEMY, Brasil.

2022 - 2022

TypeScript do básico ao avançado. (Carga horária: 14h). , Udemy, UDEMY, Brasil.

2021 - 2022

Git e GitHub Essencial para o Desenvolvedor. (Carga horária: 12h). , Udemy, UDEMY, Brasil.

2021 - 2022

Python para Análises de Dados I. (Carga horária: 36h). , Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro, PUC-Rio, Brasil.

2021 - 2022

Git e GitHub essencial para o Desenvolvedor. (Carga horária: 12h). , Udemy, UDEMY, Brasil.

2021 - 2021

Python Basics. (Carga horária: 10h). , Let's Code, LET'S CODE, Brasil.

2021 - 2021

BLAST: Ferramenta de Alinhamentos Locais de Sequências. (Carga horária: 2h). , Udemy, UDEMY, Brasil.

2021 - 2021

Terminal Linux. (Carga horária: 1h). , Udemy, UDEMY, Brasil.

2021 - 2021

Introdução ao Sistema Operacional Linux. (Carga horária: 2h). , Udemy, UDEMY, Brasil.

2021 - 2021

Programação em Python do básico ao avançado. (Carga horária: 64h). , Udemy, UDEMY, Brasil.

2020 - 2020

Introdução ao Python. (Carga horária: 2h). , Udemy, UDEMY, Brasil.

2020 - 2020

Curso de programação com Perl para Bioinformática. (Carga horária: 3h). , Udemy, UDEMY, Brasil.

2020 - 2020

Data Science: Visualização de dados com Python. (Carga horária: 2h). , Udemy, UDEMY, Brasil.

2018 - 2018

Malária na Atenção Básica à Saúde. (Carga horária: 60h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.

Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.

Bandeira representando o idioma Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Biologia Molecular.

Grande área: Ciências da Saúde / Área: Medicina / Subárea: Clínica Médica/Especialidade: Hematologia.

Grande área: Ciências da Saúde / Área: Saúde Coletiva / Subárea: Análises Clínicas.

Participação em eventos

Bioinformática aplicada ao estudo de bactérias multirresistentes. 2021. (Outra).

Encontro Virtual do Grupo Arthromint.Genoma de Rhodnius prolixus: predição gênica, conciliação com versões anteriores e disponibilização em navegador web. 2020. (Encontro).

IV Encontro Carioca de Biomedicina. 2020. (Encontro).

Simplificando o currículo lattes: elaboração e atualização. 2020. (Outra).

Workshop de Python para dados biológicos. 2020. (Oficina).

II Dia Internacional da Imunologia. 2018. (Outra).

II Workshop de Computação Aplicada à Saúde. 2018. (Oficina).

1° Workshop de Resistência Bacteriana aos Antimicrobianos. 2017. (Oficina).

XVII Encontro Científico do Instituto Biomédico. 2017. (Encontro).

XXII Semana de Microbiologia e Imunologia. 2016. (Outra).

Histórico profissional

Experiência profissional

2022 - 2023

Dosimagem, Dosimagem

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Desenvolvedor React, Carga horária: 40

Outras informações:
Manutenção do site na Wix;Desenvolvimento de um novo site em ReactJS;Integração com API Django usando ReduxJS;Deploy do site na AWS;

2022 - Atual

GISAID

Vínculo: Prestador de Serviço, Enquadramento Funcional: Bioinformata, Carga horária: 40

Outras informações:
Utilização de Web Scraping para coleta de dados;Processamento de dados com Python|Go;Criação de scripts em Python|Go;Automação de processos;

2024 - Atual

Fundação Oswaldo Cruz

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Desenvolvedor Python, Carga horária: 40

Outras informações:
Configuração do servidor Rocky Linux;Refatoração da pipeline em Python para permitir paralelismo;Utilização do repositório DeepRC para criar modelos de IA;Treinamento de modelos de IA para prever a resistência antimicrobiana através das ORFs do genoma;

2024 - 2024

Fundação Oswaldo Cruz

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Desenvolvedor Full Stack, Carga horária: 40

Outras informações:
Design do novo site do CABGen usando o Figma;Desenvolvimento do site usando NextJS;Integração com o backend antigo;Deploy do site em NextJS no servidor Linux usando apache2;Conversão da pipeline em Perl para Python;