Viviane Demetrio do Nascimento

Formação complementar

Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• NETO, SEBASTIÃO VENANCIO ; AZAMBUJA, MATHEUS ; NASCIMENTO, VIVIANE DEMETRIO ; NOGAROTO, VIVIANE ; VICARI, MARCELO RICARDO ; NOLETO, RAFAEL BUENO . Molecular characterization and chromosomal distribution of Tc1/mariner transposons in Boana species (Anura, Hylidae). GENOME , v. 68, p. 1-9, 2025.

• DULZ, THAIS APARECIDA ; AZAMBUJA, MATHEUS ; LORSCHEIDER, CARLA ANDREA ; NOLETO, RAFAEL BUENO ; MOREIRA-FILHO, ORLANDO ; NOGAROTO, VIVIANE ; NASCIMENTO, VIVIANE DEMETRIO ; DINIZ, DÉBORA ; DE MELLO AFFONSO, PAULO ROBERTO ANTUNES ; VICARI, MARCELO RICARDO . Repetitive DNAs and chromosome evolution in Megaleporinus obtusidens and M. reinhardti (Characiformes: Anostomidae). GENETICA (DORDRECHT. ONLINE) , v. 152, p. 63-70, 2024.

• OLIVEIRA, F. S. ; AZAMBUJA, M. ; NASCIMENTO, V. D. ; OLIVEIRA, J. I. N. ; WOLF, I. R. ; NOGAROTO, VIVIANE ; MARTINS, C. ; VICARI, MARCELO RICARDO . Caracterização da superfamília do transposon hAT DNA no genoma do peixe neotropical Apareiodon sp.. MOLECULAR GENETICS AND GENOMICS , v. 299, p. 96, 2024.

• SLOTY, A. M. ; NASCIMENTO, V. D. ; NOLETO, R. B. ; OLIVEIRA, R. G. ; RIBEIRO, M. O. . A influência do horário do arraçoamento no desempenho produtivo de alevinos de Tilápia. LUMINÁRIA , v. 24, p. 15-20, 2021.

• DULZ, THAIS APARECIDA ; AZAMBUJA, MATHEUS ; NASCIMENTO, VIVIANE DEMETRIO ; LORSCHEIDER, CARLA ANDREA ; NOLETO, RAFAEL BUENO ; MOREIRA-FILHO, ORLANDO ; NOGAROTO, VIVIANE ; DINIZ, DÉBORA ; AFFONSO, PAULO ROBERTO ANTUNES DE MELLO ; VICARI, MARCELO RICARDO . Karyotypic Diversification in Two Megaleporinus Species (Characiformes, Anostomidae) Inferred from In Situ Localization of Repetitive DNA Sequences. Zebrafish , v. 17, p. 333-341, 2020.

• DULZ, THAIS APARECIDA ; LORSCHEIDER, CARLA ANDREA ; NASCIMENTO, VIVIANE DEMETRIO ; NOLETO, RAFAEL BUENO ; MOREIRA-FILHO, ORLANDO ; NOGAROTO, VIVIANE ; VICARI, MARCELO RICARDO . Comparative cytogenetics among Leporinus friderici and Leporellus vittatus populations (Characiformes, Anostomidae): focus on repetitive DNA elements. COMPARATIVE CYTOGENETICS , v. 13, p. 1-16, 2019.

• SCHEMBERGER, MICHELLE ORANE ; NASCIMENTO, VIVIANE DEMETRIO ; COAN, RAFAEL ; RAMOS, ÉRICA ; NOGAROTO, VIVIANE ; ZIEMNICZAK, KALINE ; VALENTE, GUILHERME TARGINO ; MOREIRA-FILHO, ORLANDO ; MARTINS, CESAR ; VICARI, MARCELO RICARDO . DNA transposon invasion and microsatellite accumulation guide W chromosome differentiation in a Neotropical fish genome. CHROMOSOMA , v. 128, p. 547-560, 2019.

• DO NASCIMENTO, VIVIANE DEMÉTRIO ; COELHO, KARINA ALMEIDA ; NOGAROTO, VIVIANE ; DE ALMEIDA, RAFAEL BONFIM ; ZIEMNICZAK, KALINE ; CENTOFANTE, LIANO ; PAVANELLI, CARLA SIMONE ; TORRES, RODRIGO AUGUSTO ; MOREIRA-FILHO, ORLANDO ; VICARI, MARCELO RICARDO . Do multiple karyomorphs and population genetics of freshwater darter characines ( Apareiodon affinis ) indicate chromosomal speciation?. ZOOLOGISCHER ANZEIGER , v. 272, p. 93-103, 2018.

• NASCIMENTO, V. D. ; SCHEMBERGER, M. O. ; SANTOS, M. A. ; DULZ, T. A. ; NOGAROTO, V. ; MARTINS, C. ; MOREIRA FILHO, O. ; K. ZIEMNICZAK ; VICARI, M. R. . ELEMENTO MÓVEL EN/SPM SENESCENTE EM UM GENOMA DE PEIXE NEOTROPICAL: GÊNESE DE REPETIÇÕES IN TANDEM E MECANISMOS MOLECULARES NA DIFERENCIAÇÃO DOS CROMOSSOMOS SEXUAIS ZW. In: VI Reunião Brasileira de Citogenética e Citogenômica, 2019, Goiânia. Anais da VI Reunião Brasileira de Citogenética e Citogenômica, 2019.

• AZAMBUJA, M. ; K. ZIEMNICZAK ; NASCIMENTO, V. D. ; SCHEMBERGER, M. O. ; NOGAROTO, V. ; MOREIRA FILHO, O. ; MARTINS, C. ; VICARI, M. R. . THE HISTONE CLUSTER IN PARODONTIDAE (ACTINOPTERYGII: CHARACIFORMES): CHROMOSOMAL MAPPING AND MOLECULAR CHARACTERIZATION. In: VI Reunião Brasileira de Citogenética e Citogenômica, 2019, Goiânia. Anais da VI Reunião Brasileira de Citogenética e Citogenômica, 2019.

• NASCIMENTO, V. D. ; NASCIMENTO, V. D. ; SCHEMBERGER, M. O. ; NOGAROTO, V. ; MOREIRA FILHO, O. ; MARTINS, C. ; K. ZIEMNICZAK ; DULZ, T. A. ; VENANCIO NETO, S. ; AZAMBUJA, M. ; VICARI, M. R. . Molecular characterization of Retrotransposable- LTR superfamily Gysy in Parodontidadae (Teleostei: Characiformes). In: 2018 International Congress of Genetics, 2018, foz de Iguaçú. Molecular characterization of Retrotransposon - LTR superfamily Gypsy in Parodontidae (Teleostei: Characiformes), 2018.

• AZAMBUJA, M. ; NASCIMENTO, V. D. ; NOGAROTO, V. ; VICARI, M. R. ; SCHEMBERGER, M. O. ; MARTINS, C. . Identification of MITEs and prediction of miRNAs in the genome of Apereiodon sp. (Characiformes: Parodontidae). In: 2018 INternational Congress of Genetics, 2018, Foz do Iguaçu. Identification of MITEs and prediction of miRNAs in the genome of Apereiodon sp. (Characiformes: Parodontidae), 2018.

• VENANCIO NETO, S. ; NOLETO, R. B. ; NASCIMENTO, V. D. ; DULZ, T. A. ; VICARI, M. R. ; NOGAROTO, V. . Comparative chromosome mapping of U2 snRNA gene in species of the genus Boana (Anura, Hylidae). In: 2018 International Congress of Genetics, 2018, Foz do Iguaçu. omparative chromosome mapping of U2 snRNA gene in species of the genus Boana (Anura, Hylidae), 2018.

• DULZ, T. A. ; LORSCHEIDER, C. A. ; NASCIMENTO, V. D. ; NASCIMENTO, V. D. ; DEON, G. A. ; NOLETO, R. B. ; NOGAROTO, V. ; MOREIRA FILHO, O. ; VICARI, M. R. . Análise citogenética de Leporinus cf. obtusidens e Leporellus vittatus (Characiformes, Anostomidae) da bacia do rio São Francisco. In: V Reunião Brasileira de Citogenética e Citogenômica, 2017, Londrina. Reunião Brasileira de Citogenética e Citogenômica. Londrina: Semina, 2017. v. 38. p. 77-77.

• NASCIMENTO, V. D. ; SCHEMBERGER, M. O. ; NOGAROTO, V. ; RAMOS, E. ; ALMEIDA, R. B. ; VICARI, M. R. ; MARTINS, C. . Análise do sequenciamento em larga escala na caracterização e localização in situ de elementos repetitivos no genoma de Apareiodon sp. (Characiformes: Parodontidae). In: V Reunião Brasileira de Citogenética e Citogenômica, 2017, Londrina. Reunião Brasileira de Citogenética e Citogenômica. Londrina: Semina, 2017. v. 38. p. 86-86.

• K. ZIEMNICZAK ; NASCIMENTO, V. D. ; NOGAROTO, V. ; ALMEIDA, M. C. ; ARTONI, R. F. ; VICARI, M. R. ; MOREIRA FILHO, O. . Chromosome Mapping of Microsatellites in Parodontidade (Teleostei, Characiformes): Emphasis on Sex Cromosomes. In: 21st International Chromosome Conference (ICC), 2016, Foz do Iguaçu. Chromosome Mapping of Microsatellites in Parodontidade (Teleostei, Characiformes): Emphasis on Sex Cromosomes, 2016.

• DULZ, T. A. ; LORSCHEIDER, C. A. ; NASCIMENTO, V. D. ; K. ZIEMNICZAK ; NOGAROTO, V. ; MOREIRA FILHO, O. ; VICARI, M. R. . Caracterização cromossômica de Leporinus cf. obtusidens e Leporellus vittatus (Characiformes, Anostomidae) do rio Piumhi, bacia do rio São Francisco. In: XVII Simpósio de Citogenética e Genética de Peixes, 2016, São Carlos. Anais do XVII Simpósio de Citogenética e Genética de Peixes, 2016. p. 97-97.

• NASCIMENTO, V. D. ; COELHO, K. A. ; K. ZIEMNICZAK ; SCHEMBERGER, M. O. ; NOGAROTO, V. ; ALMEIDA, M. C. ; BELLAFRONTE, E. ; CENTOFANTE, L. ; PAVANELLI, C. S. ; TORRES, R. A. ; MOREIRA FILHO, O. ; DULZ, T. A. ; VICARI, M. R. . Incertezas taxonômicas em Apareiodon affinis (Characiformes: Parodontidae): uma análise integrada de dentes sinfiseanos, citogenética e DNA barcode. In: XVII Simpósio de Citogenética e genética de peixes, 2016, São Carlos. Anais do XVII Simpósio de Citogenética e Genética de Peixes, 2016. p. 103-103.

• NASCIMENTO, V. D. ; Santos, R.C.T ; SILVA, K. G. ; COSTA, J. M. ; MACHADO, E. F. ; BIRK, N. L. B. . COM (CIÊNCIA), TECNOLOGIAS SOCIAIS E SUSTENTÁVEIS NA FORMAÇÃO DOCENTE: USO DO ARDUINO COMO TECNOLOGIA SOCIAL NO ENSINO DE BIOLOGIA. 2024. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• NASCIMENTO, V. D. . Caracterização Molecular do Retrotransposon Gypsy em Parodontidae. 2018. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• NASCIMENTO, V. D. . Análise do sequenciamento em larga escala na caracterização e localização in situ de elementos repetitivos no genoma de Apareiodon sp. (Characiformes: Parodontidae). 2017. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• NASCIMENTO, V. D. ; ALMEIDA, M. C. ; VICARI, M. R. . CHROMOSOMAL DIFFERENTIATION, GENETIC DIVERGENCE and MORPHOLOGICAL SIMILARITY: IN THE CASES OF Apareiodon ibitiensis and Apareiodon sp. (Characiformes: Parodontidae). 2016. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• NASCIMENTO, V. D. ; VICARI, M. R. ; SCHEMBERGER, M. O. . Análise e sequenciamento em larga escala na caracterização e localização in situ de elementos repetitivos no genoma de Apareiodon sp. (Characiformes: Parodontidade)?,. 2016. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• K. ZIEMNICZAK ; NASCIMENTO, V. D. ; NOGAROTO, V. ; ALMEIDA, M. C. ; ARTONI, R. F. ; VICARI, M. R. ; MOREIRA FILHO, O. . Chromosome Mapping of Microsatellites in Parodontidae (Teleostei, Characiformes): Emphasis on Sex Chromosomes. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• NASCIMENTO, V. D. . Análise e sequenciamento em larga escala na caracterização e localização in situ de elementos repetitivos no genoma de Apareiodon sp. (Characiformes: Parodontidade). 2015. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• NASCIMENTO, V. D. ; Machado, R. R ; MORALES, A. G. . Um estudo sobre o processo de ensino e aprendizagem das disciplinas de ciências e biologia com estudantes surdos inclusos no ensino regular. 2011. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• LUZ, F. B. ; GONCALVES, I. R. D. ; NASCIMENTO, V. D. ; LUZ, D. Z. ; MORALES, A. G. ; ROSA, M. S. . Projeto Biotema: Educação Ambiental. 2010. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• NASCIMENTO, V. D. ; LUZ, D. Z. ; BRAGA, B. R. ; AYUB, C. L. S. C. . O reino vegetal e suas propriedades nutricionais/medicinais. 2009. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• MENDES, N. ; NASCIMENTO, V. D. ; MORALES, A. G. ; LUZ, D. Z. ; NOGUEIRA, M. K. . A utilização do jogo-didático Rolentrando no ensino de Zoologia. 2008. (Apresentação de Trabalho/Outra).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2020 - Atual

  Estudo da diversificação dos cromossomos sexuais e determinação do sexo em Parodontidae (Teleostei: Characiformes), Descrição: Parodontidae pode ser considerado um bom grupo de peixes para estudos da evolução de cromossomos sexuais e determinação do sexo por apresentar espécies sem cromossomos sexuais, com proto-cromossomos sexuais e com cromossomos sexuais bem diferenciados, do tipo simples ZZ/ZW ou múltiplo ZZ/ZW1W2. Dados genômicos em Apareiodon sp. (ZZ/ZW) permitiram a caracterização da fração repetitiva e o conhecimento dos DNAs repetitivos que participaram da diferenciação do cromossomo W nesta espécie. Os dados genômicos propiciaram também um início de prospecção de genes candidatos à diferenciação gonadal, a análise das suas estruturas moleculares e regiões cis regulatórias. É conhecido que as modificações das rotas de regulação gênica em genes do desenvolvimento geram grande impacto para a especiação e, estas podem ser influenciadas pela invasão de elementos transponíveis (TEs) em regiões cis regulatórias. A co-opção molecular é o processo pelo qual um TE degenerado passa a servir para alguma função a favor no genoma. Os TEs são conhecidos por doar novos sítios para a formação de sítios de ligação para fatores de transcrição (TFBS) e por gerar novos genes com função RNA não codificante, entre outros. Em peixes Neotropicais estas análises são praticamente inexistentes, principalmente quando relacionadas às cascatas da determinação sexual. Assim, este estudo tem por objetivo a avaliação da diversificação cromossômica em Parodontidae utilizando sequências repetitivas, com foco nos cromossomos sexuais e; prospectar e avaliar genes que possam estar restritos ao cromossomo W ou envolvidos nas cascatas de diferenciação gonadal a partir de dados genômicos e de transcriptomas de gônadas. Para isto, serão utilizadas ferramentas de genômica, biologia molecular, sequenciamento de DNA/RNA, caracterização das sequências, citogenética molecular e bioinformática, com intuito de integrar os dados, permitindo a compreensão de mecanismos atuantes na diversificação cromossômica e genética da determinação do sexo.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Viviane Demetrio do Nascimento - Integrante / Viviane Nogaroto - Integrante / Marcelo Ricardo Vicari - Coordenador / Michele Orane Schemberger - Integrante / Matheus Azambuja - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2018 - 2020

  Pontos de quebras de DNA e rearranjos cromossômicos em peixes da família Loricariidae (Teleostei, Siluriformes): Uma abordagem citogenética e molecular, Descrição: Os peixes da família Loricariidae (Teleostei, Siluriformes) apresentam uma ampla variação morfológica, assim como uma ampla diversidade cromossômica numérica (2n) e estrutural decorrentes de rearranjos cromossômicos ocorridos ao longo da história evolutiva das espécies. A ocorrência de rearranjos cromossômicos está intimamente associada a quebras do DNA em sítios ricos em sequências repetitivas. Telômeros são sequências de DNA repetitivo in tandem, localizadas na região terminal dos cromossomos, que tem como função manter a sua estabilidade e integridade. Tais sequências podem eventualmente ser encontradas em outras regiões do cromossomo, os chamados sítios teloméricos intersticiais (ITS). É proposto que os ITS surgiram como resultado de rearranjos cromossômicos na evolução dos genomas e que sua ocorrência pode causar instabilidade cromossômica. Adicionalmente, há também indícios da participação dos DNAs ribossomais em parte das quebras e reorganizações cromossômicas. O re-uso da mesma sequência de DNA na origem dos rearranjos cromossômicos em genomas de linhagens próximas é a característica chave do modelo evolutivo dos pontos de quebras da dupla fita. Essa predisposição à instabilidade e quebras de certas regiões genômicas é descrita como ?ponto de quebras evolutivas?, os quais são considerados hotspots para rearranjos cromossômicos. Entretanto, o estudo de caracterização de famílias de DNAs repetitivos em peixes Neotropicais, correlacionando estes DNAs repetitivos aos eventos de rearranjos cromossômicos, ainda são bastante escassos. Assim, este trabalho tem como objetivo a caracterização de DNAs repetitivos em peixes da família Loricariidae, com enfoque em pontos de quebras cromossômicas responsáveis pela sua diversidade cariotípica, visando o entendimento da evolução genômica desse especioso grupo da ictiofauna Neotropical... , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (6) . , Integrantes: Viviane Demetrio do Nascimento - Integrante / Viviane Nogaroto - Integrante / Marcelo Ricardo Vicari - Integrante / Orlando Moreira Filho - Coordenador / Michele Orane Schemberger - Integrante / Larissa Glugoski - Integrante / Thaís Aparecida Dulz - Integrante / Geize Aparecida Deon - Integrante / Marcelo de Bello Cioffi - Integrante / Geovana de Cassia Malimpensa - Integrante / Gabriela Casani Cardoso - Integrante / Cassia Fernanda Yano - Integrante / Ezequiel Aguiar de Oliveira - Integrante / Fernanda Souza de Oliveira - Integrante / Jeniffer Dias Aguiar - Integrante / Sebastião Venâncio Neto - Integrante / Daiane Santana Marcondes - Integrante / L.A.C. Bertollo - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2017 - 2021

  Citogenética e genômica em Parodontidae (Teleostei: Characiformes): caracterização de genes e DNAs repetitivos, Descrição: Na evolução biológica é proposto que a modificação de rotas de regulação gênica em genes do desenvolvimento tem grande impacto para a especiação. Este projeto aborda a linha de investigação em peixes neotropicais de diversificação cariotípica, estudos de genes do desenvolvimento gonadal, co-opção molecular de elementos transponíveis, determinação da região restrita ao cromossomo W e, estudos genômicos em Parodontidae. A família Parodontidae detém número diploide conservado de 54 cromossomos, com espécies sem sistemas de cromossomos sexuais heteromórficos, com proto-cromossomos sexuais e, outras com sistemas de cromossomos sexuais do tipo ZZ/ZW ou ZZ/ZW1W2. Aliado a estes fatores, grande parcela da diversificação cariotípica observada nas espécies desta família é devida a movimentação de DNAs repetitivos, proporcionando os rearranjos cariotípicos. Ainda, inúmeros estudos demonstraram que os elementos transponíveis podem ser co-optados (quando um elemento transponível degenerado passa a servir para alguma função no genoma). Nesta temática, esta linha de pesquisa possui sequenciamento de nova geração e a organização dos genomas macho, fêmea, ambos, e ?cromossomo W? de uma espécie de Parodontidae portadora de cromossomos sexuais ZW. Com estes genomas, serão realizadas análises de recuperação de sequências de DNA acumuladas em um determinado sexo e, análises comparativas de genes do desenvolvimento gonadal para avaliar a co-opção molecular de elementos transponíveis nas regiões reguladoras de genes. Para isto, serão utilizadas ferramentas de genômica, biologia molecular, sequenciamento de DNA, caracterização das sequências, citogenética convencional/molecular e bioinformática, com intuito de integrar os dados, permitindo a compreensão de mecanismos atuantes na diversificação cromossômica e genética em modelos de peixes Neotropicais... , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (7) . , Integrantes: Viviane Demetrio do Nascimento - Integrante / Viviane Nogaroto - Integrante / Mara Cristina de Almeida - Integrante / Michele Orane Schemberger - Integrante / Alain Victor Barros - Integrante / Rafael Bonfim de Almeida - Integrante / Larissa Glugoski - Integrante / Lucas Roselen A Mello - Integrante / Emanoel Oliveira dos Santos - Integrante / Thaís Aparecida Dulz - Integrante / Geize Aparecida Deon - Integrante / MICHELE ANDRESSA VIER wolski - Integrante / VICARI, MARCELO RICARDO - Coordenador., Financiador(es): Fundação Araucária de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2017 - 2020

  Citogenética molecular em Parodontidae e Loricariidae: caracterização de genes e DNAs repetitivos, Descrição: O projeto aborda duas linhas de investigação em peixes neotropicais: (i) a diversificação cariotípica, estudos de genes do desenvolvimento gonadal, co-opção molecular, determinação da região restrita ao cromossomo W e estudos genômicos em Parodontidae e; (ii) a caracterização de sequências de DNA envolvidas em pontos frágeis para quebras e rearranjos cromossômicos em Loricariidae. A família Parodontidae detém número diploide conservado de 54 cromossomos, com espécies sem sistemas de cromossomos sexuais heteromórficos, com proto-cromossomos sexuais e, outras com sistemas de cromossomos sexuais do tipo ZZ/ZW ou ZZ/ZW1W2. Aliado a estes fatores, grande parcela da diversificação cariotípica observada nas espécies desta família é devida a movimentação de DNAs repetitivos, proporcionando os rearranjos cariotípicos. Com o sequenciamento de nova geração e a organização dos genomas macho, fêmea, ambos, e ?cromossomo W? de uma espécie portadora de cromossomos sexuais ZW foram iniciadas as análises de recuperação de sequências de DNA acumuladas em um determinado sexo e, análises comparativas de genes do desenvolvimento gonadal para avaliar a co-opção molecular de elementos transponíveis nas regiões reguladoras. Por sua vez, os peixes loricariídeos apresentam ampla variação de números diploides e fórmulas cariotípicas, porém pouco compreendidos quanto as sequências de DNA que levam às quebras e rearranjos cromossômicos. Desta forma, em Loricariidae, especialmente nos gêneros Ancistrus e Rineloricaria, serão avaliadas as sequências de DNA propensas a pontos frágeis para quebras cromossômicas, instabilidade telomérica e mecanismos que atuaram na diversificação cromossômica. Com isso, são objetivos do projeto avaliar a diversificação cromossômica em peixes buscando compreender regiões de DNA ou genes presentes na região específica do cromossomo sexual, co-opção molecular de elementos transponíveis para modulação da expressão gênica e sequências de DNA pontos frágeis para quebras cromossômicas. Para isto, utilizamos os peixes parodontídeos como modelo para estudos da diferenciação dos cromossomos sexuais e genes do desenvolvimento gonadal e, representantes de Loricariidae para buscar sequências propensas a pontos de quebras cromossômicas. Nesta estratégia, serão utilizadas ferramentas de genômica, biologia molecular, sequenciamento de DNA, caracterização das sequências, citogenética convencional e molecular e bioinformática, com intuito de integrar os dados, permitindo a compreensão de mecanismos atuantes na diversificação cromossômica e genética em modelos de peixes Neotropicais.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Viviane Demetrio do Nascimento - Integrante / Viviane Nogaroto - Integrante / Marcelo Ricardo Vicari - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2017 - Atual

  Sex and B chromosome enigmas: model systems for the study of chromosome and genome evolution, Descrição: Chromosomes are major components of cells, packing the genetic material in a perfect organized structural and functional pattern. However, the chromosomes behavior during cell cycle is subjected to genomic rearrangements producing a wide variety of functional consequences with impact in cell disorders and also generating evolutionary novelties. Although several factors that mediate genomic rearrangements are now known, there are still many unanswered questions. In the light of high throughput era in generation of biological data, chromosome studies have also advanced to a higher level exploring high scale analyses of DNA, RNA, and proteins, and their interactive networks. Therefore, this grant application intends to explore chromosomal polymorphism (associated to B chromosomes and sex chromosomes) as models to investigate the structural and functional nature of chromosomal rearrangements during evolution. In this way, the objective of this project is to analyze chromosome rearrangements in the light of massive molecular data obtained from different biological models, in order to advance in the identification of origin and fate of chromosome changes and to comprehend their evolutionary consequences. Additionally, the project also aims to perform the scientific divulgation of chromosome facts, in the light of an evolutionary and function perspective, in order to enforce a dialog between science and society.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Viviane Demetrio do Nascimento - Integrante / Marcelo Ricardo Vicari - Integrante / ADRIANE PINTO WASKO - Integrante / Diogo Cavalcanti Cabral de MELLO - Integrante / Guilherme Targino Valente - Integrante / MARTINS, CESAR - Coordenador / Vladimir Pavan Margarido - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de SP - Auxílio financeiro.

• 2013 - 2016

  Caracterização de genes relacionados a diferenciação gonadal e elementos transponíveis: modelo em peixes Neotropicais, Descrição: Descrição: Parodontidae é um grupo de peixes Neotropicais constituído por três gêneros: Parodon; Apareiodon e Saccodon. Esta família conta com 32 espécies válidas distribuídas na América do Sul e parte do Panamá, exceto nas bacias costeiras do Atlântico Sul, Patagônia e canal do rio Amazonas. O número diploide tem sido conservado de 54 cromossomos entre os Parodontidae. Nesta família de peixe, a origem e diferenciação dos cromossomos sexuais morfologicamente diferenciados têm sido determinadas com avanços no entendimento da diferenciação cariotípica. Nosso grupo de pesquisa tem caracterizado por pintura cromossômica W específica espécies sem cromossomos sexuais diferenciados, espécies com proto cromossomos sexuais e, espécies com sistemas de cromossomos sexuais heteromórficos ZZ/ZW e ZW1W2. Diante deste aspecto, temos utilizado este grupo de peixes como modelo de investigação da diferenciação sexual em peixes Neotropicais. Em peixes a determinação sexual é pouco compreendida para quase a totalidade das espécies. Surge como candidatos aos eventos de diferenciação sexual um conjunto de genes que atuam como reguladores do desenvolvimento, alguns com expressão testicular específica, outros de expressão ovariana específica. No entanto, a caracterização destas sequências para modelos de peixes Neotropicais é ainda pequena, justificando o entendimento destas famílias de reguladores genéticos em Parodontidae. Ainda, o controle e a coordenação da expressão gênica demanda redes regulatórias transcricionais e pós transcricionais. Tem sido postulado que elementos transponíveis (TEs) podem contribuir para novas interações regulatórias. Mais recentemente foi determinado que estes TEs quando capturados em elementos promotores geram alterações e podem trazer novos sítios para ligação de proteínas regulatórias. Ainda, este mecanismo tem sido visualizado em genes do desenvolvimento e sua atuação para a formação de novas redes de regulação para genes determinantes sexuais. Neste contexto, o objetivo é caracterizar genes relacionados a determinação sexual e seus promotores em Parodontidae, bem como, investigar a ocorrência de DNAs repetitivos como prováveis reguladores da atividade genética.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (5) . , Integrantes: Viviane Demetrio do Nascimento - Integrante / Kaline Ziemniczak - Integrante / Viviane Nogaroto - Integrante / Mara Cristina de Almeida - Integrante / Roberto Ferreira Artoni - Integrante / Marcelo Ricardo Vicari - Coordenador / Michele Orane Schemberger - Integrante / Cleberson Cesario Primo - Integrante / Marcela Baer Pucci - Integrante / Alain Victor Barros - Integrante / Josiani Baccarin Traldi - Integrante / Alex Sandro Silveira Pavlak - Integrante / Caroline Regina Machado - Integrante / COELHO, KARINA ALMEIDA - Integrante / Jordana Inácio Nascimento Oliveira - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.