Milena Magalhães

Pós-doutorado

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Participação em eventos

Produções bibliográficas

• PINEAU, FANNY ; CAIMMI, DAVIDE ; MAGALHÃES, MILENA ; FREMY, ENORA ; MOHAMED, ABDILLAH ; MELY, LAURENT ; LEROY, SYLVIE ; MURRIS, MARLÈNE ; CLAUSTRES, MIREILLE ; CHIRON, RAPHAEL ; DE SARIO, ALBERTINA . Blood co-expression modules identify potential modifier genes of diabetes and lung function in cystic fibrosis. PLoS One , v. 15, p. e0231285, 2020.

• MAGALHÃES, MILENA ; TOST, JÖRG ; PINEAU, FANNY ; RIVALS, ISABELLE ; BUSATO, FLORENCE ; ALARY, NATHAN ; MELY, LAURENT ; LEROY, SYLVIE ; MURRIS, MARLÈNE ; CAIMMI, DAVIDE ; CLAUSTRES, MIREILLE ; CHIRON, RAPHAËL ; SARIO, ALBERTINA DE . Dynamic changes of DNA methylation and lung disease in cystic fibrosis: lessons from a monogenic disease. Epigenomics , v. 10, p. 1131-1145, 2018.

• MAGALHÃES, MILENA ; RIVALS, ISABELLE ; CLAUSTRES, MIREILLE ; VARILH, JESSICA ; THOMASSET, MÉLODIE ; BERGOUGNOUX, ANNE ; MELY, LAURENT ; LEROY, SYLVIE ; CORVOL, HARRIET ; GUILLOT, LOÏC ; MURRIS, MARLÈNE ; BEYNE, EMMANUELLE ; CAIMMI, DAVIDE ; VACHIER, ISABELLE ; CHIRON, RAPHAËL ; DE SARIO, ALBERTINA . DNA methylation at modifier genes of lung disease severity is altered in cystic fibrosis. Clinical Epigenetics , v. 9, p. 19, 2017.

• SALGADO, LEONARDO ; KOOP, DANIELA ; PINHEIRO, DANIEL ; RIVALLAN, RONAN ; LE GUEN, VINCENT ; NICOLÁS, MARISA ; DE ALMEIDA, LUIZ GONZAGA ; ROCHA, VIVIANI ; MAGALHÃES, MILENA ; GERBER, ALEXANDRA ; FIGUEIRA, ANTONIO ; CASCARDO, JÚLIO CÉZAR DE ; DE VASCONCELOS, ANATEREZA ; SILVA, WILSON ; COUTINHO, LUIZ ; GARCIA, DOMINIQUE . De novo transcriptome analysis of Hevea brasiliensis tissues by RNA-seq and screening for molecular markers. BMC Genomics , v. 15, p. 236, 2014.

• BERGOUGNOUX, ANNE ; RIVALS, ISABELLE ; LIQUORI, ALESSANDRO ; RAYNAL, CAROLINE ; VARILH, JESSICA ; MAGALHÃES, MILENA ; PEREZ, MARIE-JOSÉ ; BIGI, NICOLE ; DES GEORGES, MARIE ; CHIRON, RAPHAËL ; SQUALLI-HOUSSAINI, AHMED SAAD ; CLAUSTRES, MIREILLE ; DE SARIO, ALBERTINA . A balance between activating and repressive histone modifications regulates ) expression in vivo. Epigenetics (Austin) , v. 9, p. 1007-1017, 2014.

• MAIA, M. H. T. ; de Lima Peixoto, Raquel ; LIMA, C. P. S. ; MAGALHAES, M ; SENA, L. S. ; COSTA, P. S. S. ; BARBOSA, F. B. ; OLIVEIRA, L. F. ; ROMERO, M. ; SILVA, C. N. A. . Predisposition to idiopathic thrombocytopenic purpura maps close to the major histocompatibility complex class I chain-related gene A. Human Immunology , v. 70, p. 179-183, 2009.

• PD Ewerton ; MM Leite ; MAGALHÃES, M. ; SENA, L. S. ; EJM Santos . Amazonian Amerindians exhibit high variability of KIR profiles. IMMUNOGENETICS , v. 59, p. 625-630, 2007.

Projetos de pesquisa

• 2012 - 2012

  Bioinformática aplicada ao sequenciamento usando tecnologia de pirosequenciamento e de semicondutores: desenvolvimento de novas ferramentas utilizando computação paralela e distribuída, Descrição: O Laboratório Nacional de Bioinformática - LABINFO, em função de seu extraordinário desenvolvimento técnico-científico, vem sendo responsável pelo recebimento, processamento, armazenamento e pela análise das seqüências de muitos dos genomas gerados no Brasil. Os softwares e banco de dados desenvolvidos pela equipe, utilizando métodos computacionais e matemáticos avançados, têm sido utilizados por vários grupos no exterior e no Brasil. Um exemplo é a ferramenta SABIA, totalmente desenvolvida no LABINFO. Desde 2008, foi criada a Unidade de Genômica Computacional Darcy Fontoura de Almeida (UGCDFA), sendo esta uma Unidade Multiusuário destinada a atender aos projetos genomas de todo o país. Assim, um ambiente de desenvolvimento de pesquisa em Genômica Computacional, associado ao LABINFO, utilizando a infra-estrutura de Computação de Alto desempenho do LNCC/MCT, foi instalado. Em um primeiro momento com financiamento do Ministério da Ciência e Tecnologia e do Ministério da Saúde foi possível adquirir um seqüenciador de segunda geração, o 454 da Roche Applied Science. No presente momento estamos adquirindo outro equipamento, o Ion Torrent Personal Genoma Machine (PGMTM), adquirido com verba do MCT, e que é um seqüenciador de última geração de alta acurácia, com a vantagem desta nova tecnologia de sequenciamento usar técnica de semicondutores e estar em pleno desenvolvimento, com um campo de aplicações mais amplo. Por se tratar de uma tecnologia diferente e complementar à já existente na UGCDFA, este equipamento poderá atender projetos de pesquisa antes inviabilizados, seja pelo alto custo e/ou limitação da tecnologia, dando um salto tecnológico importante. A presente proposta tem por objetivo desenvolver novas ferramentas de Bioinformática (montagem, anotação e comparação de genomas) usando computação de alto desempenho, assim como realizar sequenciamentos utilizando as duas plataformas disponíveis na UGCDFA... , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Milena Magalhães - Integrante / Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos - Coordenador / Marisa Fabiana Nicolás - Integrante / Oberdan de Lima Cunha - Integrante / Alex Sandro Mundstein - Integrante / Vicente de Araujo Calfo - Integrante / Alexandra Lehmkuhl Gerber - Integrante / Luciane Prioli Ciapina - Integrante / Luiz Gonzaga Paula de Almeida - Integrante / Claudia Elizabeth Thompson - Integrante / Luiz Fernando Goda Zuleta - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2012 - Atual

  Bases genômicas, imunológicas e ultraestruturais das diferenças patogênicas de distintas linhagens evolutivas do parasito Trypanosoma cruzi, Descrição: A doença de Chagas, causada pelo protozoário Trypanosoma cruzi, continua sendo um grave problema de saúde pública. Atualmente, não há vacinas nem drogas efetivas para o tratamento da doença de Chagas crônica. Além disso, a ausência de métodos de diagnóstico eficientes dificulta a identificação de indivíduos infectados e, portanto, o tratamento. Mesmo na possibilidade de tratamento, sua eficácia raramente pode ser devidamente avaliada. A identificação de novos alvos de tratamento, diagnóstico, profilaxia e marcadores de cura pós-tratamento ainda são necessários para o controle da doença de Chagas. Um dos fatores que dificulta a identificação destes alvos é a grande variabilidade genética do parasito. Atualmente, seis linhagens evolutivas são reconhecidas, as quais apresentam características moleculares, imunológicas, epidemiológicas bastante distintas. Até o momento, entretanto, poucos são os estudos multidisciplinares e em larga escala visando a caracterização sistemática de distintas linhagens do parasito. Apenas os genomas das cepas CL Brener e Sylvio foram publicados e, além disto, os dados de expressão gênica são limitados e não há relatos na literatura sobre estudos ultraestruturas comparativos entre cepas do parasito. Pouco se sabe, portanto, sobre as importantes diferenças que devem existir no genoma, transcriptoma e na organização ultraestrutural das diferentes cepas de T. cruzi e que poderiam contribuir para as diferenças no comportamento biológico e nos dados de epidemiologia da doença de Chagas. Neste projeto propomos o uso de abordagens multidisciplinares envolvendo componentes de genômica, biologia molecular e celular e imunologia, visando contribuir para um melhor entendimento da patogênese diferencial causada por distintas linhagens evolutivas e cepas do T. cruzi. Este projeto objetiva ainda a identificação de novos alvos de diagnóstico que considerem a grande diversidade genética do parasito.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Milena Magalhães - Coordenador / Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos - Integrante / Marisa Fabiana Nicolás - Integrante / Alexandra Lehmkuhl Gerber - Integrante / Luciane Prioli Ciapina - Integrante / Luiz Gonzaga Paula de Almeida - Integrante / Claudia Elizabeth Thompson - Integrante / Luiz Fernando Goda Zuleta - Integrante / Rosane Silva - Integrante / Maria Cristina Machado Motta - Integrante / Aline Zuma - Integrante / Ana Paula Campos de Guimarães - Integrante / Francisco Prosdocimi - Integrante / Turan Peter Urmenyi - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Apoio à Rede de Bioinformática e de Genômica: geração, processamento e interpretação de dados genômicos e proteômicos, Descrição: Adequar a Unidade de Genômica Computacional Darcy Fontoura de Almeida (UGCDFA) e o Laboratório de Bioinformática (LABINFO) do LNCC ao sequenciamento de alto desempenho, bem como melhorar os softwares desenvolvidos pelo LABINFO, para poder tratar a enorme quantidade de dados que estão sendo gerados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Milena Magalhães - Coordenador / Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos - Integrante / Marisa Fabiana Nicolás - Integrante / Oberdan de Lima Cunha - Integrante / Alex Sandro Mundstein - Integrante / Vicente de Araujo Calfo - Integrante / Alexandra Lehmkuhl Gerber - Integrante / Luciane Prioli Ciapina - Integrante / Luiz Gonzaga Paula de Almeida - Integrante / Claudia Elizabeth Thompson - Integrante / Luiz Fernando Goda Zuleta - Integrante / Rangel Celso Souza - Integrante / Maurício Egídio Cantão - Integrante / Viviani Ribeiro Rocha - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Plataforma de sequenciamento usando tecnologia de semicondutores: atualização da unidade multiusuário UGCDFA com aplicação direta em pesquisas nas áreas de saúde animal, vegetal e humana, Descrição: Modernização da Unidade de Geôomica Computacional Darcy Fontoura de Almeida (UGCDFA) com a instalação de um seqüenciador de última geração de alta acurácia, que permitirá desenvolver projetos cujos objetivos sejam a geração de sequências de miRNAs, amplicons, RNAseq, barcoding, além de melhorar a qualidade dos genomas já seqüenciados em outras plataformas, principalmente para solução de problemas, tais como, geração de homopolímeros e de regiões com alto conteúdo de GC.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Milena Magalhães - Coordenador / Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos - Integrante / Marisa Fabiana Nicolás - Integrante / Alexandra Lehmkuhl Gerber - Integrante / Luciane Prioli Ciapina - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2008

  Associação de polimorfismo de genes KIR e seus ligantes com hanseníase e suas formas polares, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Eduardo José Melo dos Santos em 13/09/2012., Descrição: A Hanseníase é uma doença que afeta a pele e os nervos sensoriais periféricos, resultante da infecção pelo Mycobacterium leprae, A evolução clínica para Hanseníase gera uma patologia com características clínicas e imunológicas variáveis, podendo ser classificada como as formas polares paucibacilar e multibacilar. Entretanto, muitos pacientes apresentam características intermediárias entre esses dois pólos. A proteção contra parasitas intracelulares como o M. leprae depende criticamente da função de células Natural Killer (NK) nos estágios iniciais da resposta imune e de células Th1 em estágios posteriores. Monócitos/macrófagos infectados produzem IL-12 que é necessária para estimulação da produção de interferon gama por células NK e por sua proliferação. Além da IL-12, IL-1, IL-2, IL-18 e TNFa também induzem a produção de interferon em células NK e T. Em infecções por micobactérias, a liberação de IL-2 e interferon gama é geralmente associada com a resistência a infecções intracelulares, enquanto que a liberação de IL-4 e IL-10 parecem estar associadas com uma doença mais progressiva. A ativação de células NK envolve não só fatores solúveis, como também contato celular, principalmente através de KIR com seus ligantes, especificamente moléculas de HLA de classe I. Após o advento da poliquimioterapia 112 dos 122 países onde a Hanseníase era considerada endêmica em 1985, foram bem sucedidos em sua erradicação, ficando o Brasil em segundo lugar em prevalência (4,6/10000). Entretanto, a incidência da Hanseníase permaneceu inalterada nos últimos quinze anos. Assim, permanece desconhecida a razão da Hanseníase ainda ter uma incidência tão alta, apesar da eficácia da quimioterapia e do fato da espécie humana ser o único reservatório relevante de M. leprae. Nesse contexto evoca-se a modulação genética, por parte do hospedeiro, da evolução da Hanseníase. A elucidação de fatores genéticos do hospedeiro, moduladores de sua relação com o M. leprae, mostra-se fundamental em farma. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Milena Magalhães - Integrante / Mauro de Meira Leite - Integrante / Paloma Daguer Ewerton - Integrante / Eduardo José Melo dos Santos - Coordenador / danuta sastre - Integrante / janaina vasconcelos - Integrante / claudio salgado - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2008

  Associação de Polimorfismos do Complexo de Genes KIR e seus Ligantes HLA-C com Infecções Relevantes em Saúde Pública da Amazônia: Tuberculose e Hepatites Virais B e C, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Eduardo José Melo dos Santos em 13/09/2012., Descrição: A infecção por HBV, HCV e M. tuberculosis constituem um problema considerável em Saúde Pública. No Brasil, em 2002, a incidência de casos novos (em 10000 habitantes), para hepatite B, C e Tuberculose foi de 0,4, 0,4 e 4,5, respectivamente. A Região Norte possui incidência maior que a observada nacionalmente para hepatite B (0,6) e tuberculose (5,3) e mais baixa para hepatite C (0,2). O presente projeto enfoca a predisposição genética a infecção por estes patógenos. Os dois agentes virais, HBV e HCV, estão sujeitos a rigorosa vigilância sanitária, pois ocupam lugar de destaque epidemiológico em bancos de sangue e centros de diálise. O agente bacteriano, responsável pela tuberculose, representa epidemia extremamente relevante em Saúde Pública, refletindo em políticas e programas governamentais de vigilância epidemiológica. Assim, evoca-se a modulação genética por parte do hospedeiro, da evolução destas doenças. A elucidação destes fatores genéticos mostra-se fundamental em farmacogenética, além de seu potencial prognóstico-preditivo poder ser amplamente usado em Saúde Pública, permitindo o desenvolvimento de estratégias profiláticas específicas, guiadas pelo perfil genético das populações alvo. As células NK têm um papel central na resposta imune inata a estas patologias. Sua ativação se dá em resposta a citocinas e, principalmente, por meio de contato celular, o que envolve seus receptores e respectivos ligantes. Polimorfismos relacionados aos genes KIR têm sido relacionados à predisposição a doenças virais e neoplasias, no entanto não é de nosso conhecimento nenhum estudo de associação de KIR com Tuberculose, havendo poucos estudos com hepatites virais. Assim o objetivo geral do projeto é investigar a associação de polimorfismos dos genes KIR com a predisposição à infecção por HBV, HBC e M. tuberculosis, bem como o papel desses polimorfismos na evolução dessas doenças.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Milena Magalhães - Integrante / Mauro de Meira Leite - Integrante / Paloma Daguer Ewerton - Integrante / Eduardo José Melo dos Santos - Coordenador / danuta sastre - Integrante / janaina vasconcelos - Integrante / Clayton Pereira Silva de Lima - Integrante / Antônio Carlos do Rosário Vallinoto - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2003 - 2004

  Ensino, extensão e pesquisa em histocompatibilidade e transplante, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Eduardo José Melo dos Santos em 13/09/2012., Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) . , Integrantes: Milena Magalhães - Integrante / Mauro de Meira Leite - Integrante / Paloma Daguer Ewerton - Integrante / Eduardo José Melo dos Santos - Coordenador / Maria Helena Thomaz Maia - Integrante / Clayton Pereira Silva de Lima - Integrante / Bruna Tamegão Lopes - Integrante., Financiador(es): Fundação HEMOPA - Auxílio financeiro / Universidade Federal do Pará - Bolsa.

Prêmios