Marcelo Mendes Brandão

2009 - 2014

Pós-Doutorado. , Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz", ESALQ - USP, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Evolução. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética.

2007 - 2009

Pós-Doutorado. , Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz", ESALQ - USP, Brasil. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Biologia computacional. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.

2003 - 2005

Pós-Doutorado. , Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Biologia computacional.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Filogenômica.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Evolução.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética.

BRANDÃO, MARCELO ; AZEVEDO, V. A. C. ; SCHERER, N. ; GUIMARAES, A. C. R. ; LOPES, F. M. ; FARIAS, S. T. ; TARLA, M. ; CIAMPONI, F. E. ; MAGALHAES, M. ; PASCHOAL, A. R. ; MACHADO, L. ; MARTINS, M. . 19th - Brazilian Bioinformatics Conference - X-meeting. 2023. (Congresso).

BRANDÃO, MARCELO ; AZEVEDO, V. A. C. ; FARIAS, S. T. ; SCHERER, N. ; GUIMARAES, A. C. R. ; LOPES, F. M. ; TARLA, M. . Congresso Brasileiro de Genética - Drops X-meeting. 2022. (Congresso).

Brandão, M M ; AZEVEDO, V. A. C. ; PATRONI, F. M. S. ; SCHERER, N. ; TARLA, M. ; LIMA, J. P. M. S. ; GRUBER, A. ; SANTANA, L. ; LOPES, F. M. . X-meeting XPerience. 2021. (Congresso).

LEMKE, N. ; Brandão, M M ; SCHERER, N. ; TARLA, M. ; KASHIWABARA, A. Y. ; AZEVEDO, V. A. C. ; GRUBER, A. ; LOPES, F. M. . X-meeting XPerience. 2020. (Congresso).

LEMKE, N. ; Brandão, M M ; SCHERER, N. ; TARLA, M. ; KASHIWABARA, A. Y. ; AZEVEDO, V. A. C. ; GRUBER, A. ; LOPES, F. M. ; PASCHOAL, A. R. . 15th Annual Conference of the AB3C - X-meeting. 2019. (Congresso).

DURHAM, A. M. ; LEMKE, N. ; Brandão, M. M. ; LOPES, F. M. ; SCHERER, N. ; GRYNBERG, P. ; TARLA, M. . 14th Annual Conference of the AB3C - X-meeting. 2018. (Congresso).

DURHAM, A. M. ; LEMKE, N. ; Brandão, M. M. ; LOPES, F. M. ; SCHERER, N. ; GRYNBERG, P. ; TARLA, M. . 13 Annual Conference of the AB3C - X-meeting. 2017. (Congresso).

Franco, G R ; DURHAM, A. M. ; LEMKE, N. ; PASSETTI, F. ; Brandão, M. M. ; SCHERER, N. ; GRYNBERG, P. . 13th Annual Conference of the AB3C - X-meeting. 2016. (Congresso).

Brandão, M. M. . 2° Workshop Interno do CBMEG. 2016. (Outro).

Brandão, M M ; Franco, G R ; DURHAM, A. M. ; LEMKE, N. ; GRYNBERG, P. ; PASSETTI, F. ; SCHERER, N. . 11th Annual Conference of the AB3C - X-meeting. 2015. (Congresso).

Franco, G R ; DURHAM, A. M. ; LEMKE, N. ; Brandão, M. M. ; PASSETTI, F. ; TARLA, M. ; GRYNBERG, P. ; SCHERER, N. . 10th Annual Conference of the AB3C. 2014. (Congresso).

VITORELLO, C. B. M. ; PINHEIRO, J. B. ; VIEIRA, M. L. C. ; BANDEL, G. ; Varani, A. M. ; BRANDAO, M. M. . 28º Encontro Sobre temas em Genética e Melhoramento. 2011. (Outro).

BRANDAO, M. M. . 3ºinternational conference of the AB3C. 2007. (Congresso).

20º Congresso Brasileiro de Bioinformática - X-meeting. An analysis of the transcriptional profile in Spodoptera frugiperda comparing feeding behaviour in its natural habitat and laboratory conditions.. 2024. (Congresso).

20º Congresso Brasileiro de Bioinformática - X-meeting. BRAINYBOARD, THE UNION BETWEEN ACADEMY AND PLAYFUL TEACHING. 2024. (Congresso).

19º Congresso Brasileiro de Bioinformática - X-meeting. How I Found Out the Wrong Genome Was Sequenced (CSI: Bioinformatics). 2023. (Congresso).

19º Congresso Brasileiro de Bioinformática - X-meeting. Comparative study of transcriptional profile between the thermotolerant Saccharomyces Cerevisiae LBGA-1 and CAT-1 strains reveals a set of genes involved in the temperature response and fermentation efficiency.. 2023. (Congresso).

19º Congresso Brasileiro de Bioinformática - X-meeting. Genome Quest: How AI can help with bioinformatics education. 2023. (Congresso).

19º Congresso Brasileiro de Bioinformática - X-meeting. Characterization of the geno-transcriptomic profile of an industrial Saccharomyces cerevisiae strain in response to stress induced by para-coumaric acid. 2023. (Congresso).

19º Congresso Brasileiro de Bioinformática - X-meeting. Comparative study of transcriptional profile between the thermotolerant Saccharomyces Cerevisiae LBGA-1 and CAT-1 strains reveals a set of genes involved in the temperature response and fermentation efficiency.. 2023. (Congresso).

19º Congresso Brasileiro de Bioinformática - X-meeting. From Bias to Brilliance: Using AdaptRescue to improve RNA-seq data reliability from unstructured datasets. 2023. (Congresso).

19º Congresso Brasileiro de Bioinformática - X-meeting. Machine Learning Models Applied to the Subtypes Classification of the Myeloid Malignancies. 2023. (Congresso).

19º Congresso Brasileiro de Bioinformática - X-meeting. Metabarcoding study in soil of vineyards in Brazil ? a correlation between microbial diversity and nutrient content with the quality and fertility of the soil. 2023. (Congresso).

Unicamp Portas Abertas. Conheça o projeto LUDIS. 2023. (Feira).

Unicamp Portas Abertas. Conheça um Cientista. 2022. (Feira).

V SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE MICROBIOLOGIA E BIOTECNOLOGIA. %. 2022. (Congresso).

IV Workshop de Biotecnologia.Big Data em transcritptoma. 2018. (Simpósio).

X-meeting 2018. IT. 2018. (Congresso).

X-meeting 2017. BioIT and Bioinformatics. 2017. (Congresso).

2016 International Congress of Entomology. Gene regulatory networks applied to transcriptome data to detect differences in adaptation to herbivory of two Spodoptera frugiperda strains focusing on peptidases. 2016. (Congresso).

2016 International Congress of Entomology. The spruce budworm transcriptome and its use in identifying the molecular and endocrine correlates of early instar diapause. 2016. (Congresso).

2016 International Congress of Entomology. Gene expression plasticity response to alternative host plants in the speciation process of Spodoptera frugiperda strains. 2016. (Congresso).

Congresso Brasileiro de Hematologia, Hemoterapia e Terapia Celular. SCREENING OF GENETIC VARIANTS IN FAMILIAL CASES OF MYELOID NEOPLASMS BY EXOME SEQUENCING. 2016. (Congresso).

X-Meeting + BSB 2015. DeNSAS - De Novo Sequence Annotation System. 2015. (Congresso).

third International Society for Computational Biology Latin America X-Meeting on Bioinformatics with BSB and SoiBio. DNA sequences do have a mathematical structure! Ancient DNA sequence can be revealed by error-Correcting codes. 2014. (Congresso).

IV Encuentro de Lepdoptera Neotropicales.The proteinase flare: How Spodoptera frugiperda dodges from plant herbivore protective barrier. 2012. (Encontro).

7th International Conference of th Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X-Meeting. Transcriptomic profile of the Spodoptera frugiperda midgut. 2011. (Congresso).

Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Biologia Molecular e Bioquímica. Structural and Phylogenetic Analysis of Spodoptera frugiperda Chymotrypsins Involved on Insect Chemical Protective Barrier Against Plant Proteinase Inhibitors (PIs). 2011. (Congresso).

1st International Workshop on Bioinformatics.The dual-targeted proteins evolutionary pathways. 2010. (Encontro).

2ª Jornada Acadêmica.Uma breve história da Bioinformática. 2010. (Simpósio).

26º Encontro sobre temas de genética e melhoramento. 2009. (Encontro).

5th International Conference of the AB3C. ATPIN: ARABIDOPSIS THALIANA PROTEIN INTERACTION NETWORK. 2009. (Congresso).

ISMB. Horizontal gene transfer evidences on a dual target protein, the tRNA synthetase family.. 2008. (Congresso).

XIV Seminário de Iniciação Científica.Informática e comunicação em pesquisa. 2008. (Seminário).

X-meeting. 2008. (Congresso).

3rd International conference of the AB3C. Molecular evolution on MASK and Formins proteins. 2007. (Congresso).

Congresso Brasileiro de Hematologia e Hemoterapia. Impaired. 2007. (Congresso).

Semana de Biologia marinha e gerenciamento costeiro.Biologia Computacional para Biólogos. 2007. (Simpósio).

14th annual international conference on Intelligent systems for molecular biology. ISMB2006. 2006. (Congresso).

Encontro dos usuários de PCR em tempo real. 2006. (Encontro).

Genômica e Biologia Estrutural para aplicações Biotecnológicas e Médicas.Genômica e Biologia Estrutural para aplicações Biotecnológicas e Médicas. 2006. (Simpósio).

IV Semana da Informática Biomédica.Bioinformática: Da Predição à Realidade. 2006. (Encontro).

Semana da Biologia da UNESP de Rio Claro.A necessidade da Bioinformática para biólogos experimentais e a necessidade de biólogos experimentais para a bioinformática. 2006. (Encontro).

X-meeting. X-Meeting, 1° Conferencia internacional da Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional. 2005. (Congresso).

Fórum permanente de conhecimento e tecnologia da informação. 2004. (Encontro).

25º Congresso brasileiro de Hematologia e Hemoterapia. Deformabilidade de células AS estocadas medida por pinça óptica. 2002. (Congresso).

6TH ANNUAL MEETING OF THE EUROPEAN HAEMATOLOGY ASSOCIATION. Impaired elasticity of red blood cells with different membrane protein defects measured by optical tweezers technique. 2001. (Congresso).

ANNUAL MEETING OF THE AMERICAN SOCIETY OF HEMATOLOGY. Reduction of erythrocyte deformability in iron deficiency measured by optical tweezers. 2001. (Congresso).

41TH ANNUAL MEETING OF THE AMERICAN SOCIETY OF HEMATOLOGY. Differences in mechanical properties of Hbs Cells measured by optical tweezers technique. 1999. (Congresso).

4TH ANNUAL MEETING OF THE EUROPEAN HAEMATOLOGY ASSOCIATION. Expression of inducible nitric oxide synthase (inos) is increased in acute myeloid leukaemia. 1999. (Congresso).

FESBE. Relação da expressão de RAS e formação de NO em linhagens leucêmicas. 1998. (Congresso).

XII Colóquio de Incentivo à Pesquisa.Comparação das estruturas tridimensionais homólogas entre aldolases de Drosophila melanogaster e Homo sapiens. 1995. (Encontro).

MERZEL, V. M.;Brandão, M M; NAKAYAMA, C. R.. Genômica funcional de bactérias degradadoras de hidrocarbonetos do petróleo. 2022. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Brandão, M M; CARAZZOLLE, M. F.; HOTTA, C. T.. Análise da variação diurna de carboidratos e metabólitos de cana-energia e cana-de-açúcar. 2021. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

NERY, M. F.;BRANDÃO, M.M.; VIANNA, J. A.. Evolução molecular de genes do Sistema Imunológico Adaptativo em mamíferos aquáticos. 2021. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

ARRUDA, P.;BRANDÃO, M.M.; PERSINOTI, G. F.. Desvendando a interação mutualística planta-microbiota sob a perspectiva do genoma de uma bactéria isolada do microbioma da cana-de-açúcar. 2020. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

SILVEIRA, W. B.;BRANDÃO, M.M.; BRUSTOLINI, O. J. B.; VENTORIM, R. Z.; SILVEIRA, S. A.. PROTEIN ABUNDANCE PREDICTION THROUGH MACHINE LEARNING METHODS. 2020. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agrícola) - Universidade Federal de Viçosa.

DIAS, S. M. G.;BRANDÃO, M.M.; MASCHIETTO, M.. Identificação dos Genes Regulados pelas diferentes isoformas de HIF-3Alfa: Desenvolvimento de ferramenta para análise de Dados Tumorais. 2019. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

CARAZZOLLE, M. F.; LABATE, C. A.;BRANDÃO, M.M.. Construção do atlas transcriptômicop de 3 genótipos de agave com potencial aplicação bioenergética em regiões áridas e semiáridas. 2019. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

ARRUDA, P.;BRANDÃO, M.M.; PERSINOTI, G. F.. Desvendando a Interação Mutualística planta-microbiota sob a perspectiva do genoma de uma bactéria isolada do microbioma da cana-de-açúcas. 2019. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

VALENTE, G. T.;BRANDÃO, M.M.; CARVALHO, R. F.. Busca e análise de lncRNA (long non coding RNA) importantes para a tolerância ao etanol em Saccharomyces cerevisae. 2019. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

BRANDÃO, M.M.; PINHEIRO, F.; AMARAL, F. S. R.. Genética de populações da Borboleta especialista de ecossistemas de areia branca Heliconius hermathena (Lepdoptera: Nymphalidae. 2019. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Brandão, M M; FIGUEIRA, A.. Estudo da evolução da fitopatogenicidade em Moniliophthora perniciosa através de análises de genômica comparativa de seus biótipos. 2018. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

OLIVEIRA, J. V. C.;BRANDÃO, M.M.; GROSS, J.. Genomica Comparativa de cepas de Saccharomyces cerevisiae produtoras de etanol. 2018. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Brandão, M. M.Saad, S T O; CARDENAS, R. G. C. C. L.. Rastreamento de variantes genéticas em neoplasias mieloides por sequenciamento completo do exoma. 2016. Dissertação (Mestrado em Fisiopatologia Médica) - Universidade Estadual de Campinas.

PEREIRA, G.A. G.;BRANDAO, M. M.; YAMAGISHI, M. E. B.. Identificação e padrões de expressão de transcritos derivados de RNA-seq: caracterização molecular do fungo Moniliophtora perniciosa, causador da vassoura de bruxa do cacauero. 2014. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

SANTOS, R. V.;BRANDAO, M. M.; Kobarg, J. Identificação e caracterização de lncRNAs e genes codificantes linhagem-específicos em Andropogoneae: Padroes comuns de genes emergentes. 2014. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

SILVA FILHO, M. C.; AMORIM, H. V.;Brandão, M. M.. Caracterização molecular da Linhagem Pedra 2 de Saccharomyces cerevisiae sob condições de alto etanol em fermentadores industriais. 2014. Dissertação (Mestrado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade de São Paulo.

VIEIRA, M. L. C.;BRANDAO, M. M.; VITORELLO, C. B. M.. Exploração de uma biblioteca genômica de Passiflora edulis f. flavicarpa por sequenciamento de BAC-ends. 2013. Dissertação (Mestrado em Genética e Melhoramento de Plantas) - Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz".

BRANDAO, M. M.; TEXEIRA, M. M.; PAPES, F.. análise de microtranscriptoma em variedades de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) submetida a estresse hídrico. 2011. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

BRANDAO, M. M.; FALCÃO, Paula Regina Kuser; YAMAGISHI, M. E. B.. Estudos estruturais das enzimas envolvidas com o mecanismo de produção de ácidos orgânicos da bactéria Gluconacetobacter diazotrophicus utilizando métodos computacionais. 2011. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

BRANDAO, M. M.; YAMAGISHI, M. E. B.; SANTOS, R. V.. Estudos estruturais das enzimas envolvidas com a produção de ácidos orgânicos da bactéria G. diazotrophicus por métodos computacionais. 2010. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

BRANDAO, M. M.; TEXEIRA, M. M.; VINCENTZ, M. G. A.. análise de microtranscriptoma e variedades de cana (Saccharum spp) submetidas a estresse hídrico. 2010. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

BRANDAO, M. M.; Matioli, S. R.; SANTOS, R. V.. Identificação e filogenia de genes relacionados a fotossíntese na Cana de açúcar. 2010. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

BRANDAO, M. M.; FALCÃO, Paula Regina Kuser; YAMAGISHI, M. E. B.. Estudos estruturais das enzimas envolvidas com o mecanismo de produção de ácidos orgânicos da bactéria Gluconacetobacter diazotrophicus utilizando métodos computacionais. 2010. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

YUNES, J. A.; SCRIDELI, C. A.; CARAZZOLLE, M. F.;Brandão, M M; CAMARGO, R.. CARACTERIZAÇÃO DO REPERTÓRIO DE CÉLULAS B EM CRIANÇAS COM LEUCEMIA LINFOIDE AGUDA. 2025. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

BRANDÃO, M.M.; CAMPOS, Paula de Melo; MASCHIETTO, M. C.; OLIVEIRA, P. S. L.; SCHLEDER, G. R.. "APRENDIZADO DE MÁQUINA APLICADO AO ESTUDO DE SUBTIPOS DAS MALIGNIDADES MIELOIDES. 2024. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

BRANDÃO, M.M.; DAMASIO, A. R. L.; PERSINOTI, G. F.; GOMBERT, A. K.; SILVEIRA, W. B.. CARACTERIZAÇÃO DO PERFIL GENO-TRANSCRIPTOMICO DE UMA LINHAGEM INDUSTRIAL DE SACCHAROMYCES CEREVISIAE EM RESPOSTA A ESTRESSE INDUZIDO POR ÁCIDO PARA-CUMÁRICO. 2022. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

SQUINA, F. M.; BASSO, T. O.;BRANDÃO, M.M.; ALMEIDA, J. R. M.; BILSLAND, E.. ANÁLISE MULTIOMICA DA LEVEDURA RHODOSPORIDIUM FLUVIALE-LM2 VISANDO A VALORIZAÇÃO BIOCATALÍTICA DA LIGNINA. 2022. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

LEMKE, N.; HORMAZA, J. M.; FELISBINO, S. L.;Brandão, M. M.; GREGIANIN, L. J.. INVESTIGAÇÃO SOBRE O PAPEL DOS RNAS LONGOS NÃO CODIFICANTES NO CONTEXTO DO SARCOMA DE EWING,. 2022. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

NERY, M. F.; SOLFERINI, V. N.;Brandão, M M; EIZIRIK, E.; TORRES, T. T.. A história evolutiva de peixes-boi contata através do Genoma. 2022. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

RAVAZZI, L. M.; CARARETO, C. M. A.; VIEIRA, C.; LORETO, E. L. S.;BRANDAO, M. M.; Varani, A. M.; MOUTON, L.. Desregulação de genes e elementos de transposição e incompatibilidade híbrida entre subespécies de Drosophila mojavensis e D. arizonae.. 2020. Tese (Doutorado em Biociências) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

MERZEL, V. M.;Brandão, M M; LACERDA JUNIOR, G. V.; NAKAYAMA, C. R.; VASCONCELLOS, S. P.. Influência da salinidade e temperatura sobre a dinâmica estrutural e funcional do microbioma de reservatórios de petróleo em microcosmos. 2020. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

GOLDBECK, R.; FRANCO, T. T.;Brandão, M. M.; SEGATO, F.; KAMIMURA, E. S.. Otimização da produção de celo-oligossacarídeos por hidrólise enzimática de palha de canade-açúcar pré-tratada utilizando enzimas celulolíticas e oxidativas. 2020. Tese (Doutorado em Bioenergia) - Universidade Estadual de Campinas.

CARAZZOLLE, M. F.; CUNHA, A. F.;BRANDÃO, M.M.; PERSINOTI, G. F.; KRIEGER, J. E.. Variações Gênicas e transcricionais associadas a vantagens evolutivas e robustez em leveduras industriais para a produção de etanol 2G. 2019. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

PEREIRA, G.A. G.; SANTOS, R. V.;BRANDÃO, M.M.; NAKAYA, H. T. I.; YAMAGISHI, M. E. B.. Desenvolvimento de métodos de análises e integração de dados de ômicas aplicados à construção de leveduras industriais para a produção de bioetanol 2G. 2019. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

PEREIRA, G.A. G.; BASSO, T. O.; CUNHA, A. F.;BRANDÃO, M.M.; ANTONINI, S. R. C.. Mapeamento de QTLs relacionados a características que conferem robustez fermentativa a levedura industrial PEDRA-2 (Saccharomyces cerevisiae. 2019. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

AZEREDO-SPIN, A. M. L.; CONSOLI, F. L.; ALVARENGA, R. O.; SILVA, C. C.;BRANDÃO, M.M.. De genes à Fenótipos: Um estudo de Genômica Funcional na Mosca-da-Bicheira, Cochliomyia hominivoravax (Diptera: Calliphoridae). 2019. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

OLIVEIRA, J. V. C.; SOUZA, A. P.; RIBEIRO, R. V.; WARD, R. J.;BRANDÃO, M.M.. Análise da co-regulação transcricional e identificação de genes de interesse biotecnológico em Tricoderma reesei. 2019. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

BRANDAO, M. M.; FUJITA, A.; Carvalho, B S; YAMAGISHI, M. E. B.; CARVALHO, R. A.. Redes de regulação gênica para a identificação de adaptações de duas raças de Spodoptera frugiperda a diferentes dietas. 2018. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Brandão, M. M.; ANDREOTE, F. D.; TAKETANI, R. G.. Estudos de interações e função microbiana em reservatórios de petróleo brasileiros. 2018. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

DAMASIO, A. R. L.; MALAVAZI, I.; SEGATO, F.; PERSINOTI, G. F.;Brandão, M. M.. aspergillus nidulans como modelo para manipulação de genes envolvidos no processo de unfolded protein response. 2018. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

MONDEGO, J. M. C.; TAKITA, M. A.;Brandão, M. M.. Caracterização genômica e desempnho agronômico de Erianthus arundinaceus: Uma planta com potencial para bioenergia. 2018. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

PALAZZO JR, R.; CAMARA, C. E.; ANDRADE, A. A.;Brandão, M M; BENGTSON, M. H.. Modelagem da síntese de proteínas e sua estrutura organizacional atraves de códigos corretores de erro. 2017. Tese (Doutorado em Engenharia Elétrica) - Universidade Estadual de Campinas.

FUENTES, A. S. C.; FREIRE, C. C. M.; ALVARENGA, R. O.; BRAGA, M. R. B.;Brandão, M. M.. Estudos transcriptômicos do inseto Migdolus fryanus, a broca do rizoma da cana-de-açúcar. 2017. Tese (Doutorado em GENÉTICA EVOLUTIVA E BIOLOGIA MOLECULAR) - Universidade Federal de São Carlos.

SILVA FILHO, M. C.Brandão, M M; CONSOLI, F. L.; MICHEL, A. P.. Caracterização Molecular da Lagarta do cartucho (Spodoptera frugiperda) resistente a proteína VIP3Aa20 em milho. 2017. Tese (Doutorado em INTERNACIONAL BIOLOGIA) - Universidade de São Paulo.

Brandão, M M; FRANCO, T. T.; BASSO, T. O.; LENCZAK, J. L.; CAVALETT, O.. Produção de Lipídios a partir do Hidrolisado Hemicelulósico do Bagaço de Cana e Engenharia Metabólia da Levedura Lipomyces starkeyi. 2016. Tese (Doutorado em Engenharia Química) - Universidade Estadual de Campinas.

Brandão, M M; MOURA, D. S.;Silva-Filho, M. C.; Silva, F. H.. Componentes genéticos que afetam a via de direcionamento do proteínas organelares em Arabidopsis thaliana. 2016. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade de São Paulo.

SOUZA, A. P.;Brandão, M M; MARGARIDO, G. R. A.; RIBEIRO, R. V.; MALUF, M. P.. Mapeamento Genético-molecular e análise de QTLs associados ao crescimento em Hevea brasiliensis utilizando marcadores microssatélites e SNPs. 2016. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Brandão, M. M.; LEMKE, N.; MARUYAMA, S. R. C.; FERREIRA, C. P.; MAGRO, A. J.. Predição de Fenótipos de E. coli através de redes biológicas e aprendizado de máquina. 2015. Tese (Doutorado em Ciencias Biologicas (Genetica)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

SOUZA, G. M.;Brandão, M. M.; DIGIAMPIETRI, L. A.; ARAUJO, L. V.; PACHON, D. M. R.. Desenvolvimento da plataforma CaneRegNet para anotação funcional e análises do transcriptoma de cana de açúcar. 2015. Tese (Doutorado em Interunidades em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

VIEIRA, M. L. C.;BRANDAO, M. M.; Inomoto, M M; Camargo, L E A; Grossi-de-Sá, M F. Análise, via RNA-seq, do transcriptoma do feijoeiro e identificação de genes expressos em resposta à infecção pelo nematoide das galhas. 2014. Tese (Doutorado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade de São Paulo.

Camargo, L E A;Brandão, M. M.; PIROVANI, C. P.; SOUZA, A. A.; VITORELLO, C. B. M.. Análise transcriptômica de plantas de cana de açúcar inoculadas com Leifsonia xyli subsp. xyli, agente causal do raquitismo das soqueiras. 2014. Tese (Doutorado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade de São Paulo.

BRANDAO, M. M.; PEREIRA, G.A. G.; Mazzafera, P.; YAMAGISHI, M. E. B.; Marraccini, P.. Avaliação in silico do transcriptoma do café: identificação de SNPs e inferência de mecanismos de regulação da expressão gênica. 2010. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

BRANDÃO, M.M.; BILSLAND, E.; ALMEIDA, J. R. M.. A stressful place to live: A deep understanding of selective pressures on yeast during alcoholic fermentation. 2021. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

ROGERIO, F.;BRANDÃO, M.M.; SECOLIN, R.. Sistemas escaláveis para pesquisa genômica reprodutível em ambientes de computação de alto desempenho. 2020. Exame de qualificação (Doutorando em Fisiopatologia Médica) - Universidade Estadual de Campinas.

FRANCO, T. T.; FORTE, M. B. S.;BRANDÃO, M.M.. OPTIMIZATION OF CELLO-OLIGOSACCHARIDES PRODUCTION BY ENZYMATIC HYDROLYSIS OF HYDROTHERMALLY PRETREATED SUGARCANE STRAW USING CELLULOLYTIC AND OXIDATIVE ENZYMES. 2020. Exame de qualificação (Doutorando em Bioenergia) - Universidade Estadual de Campinas.

Saad, S T O; RODRIGUES, M. R.;BRANDÃO, M.M.. metodologias em Bioinformática aplicadas à análise de dados de sequenciamento de alta resolução. 2019. Exame de qualificação (Doutorando em Fisiopatologia Médica) - Universidade Estadual de Campinas.

MONDEGO, J. M. C.;BRANDÃO, M.M.; TEIXEIRA, P. J. P. L.. Investigando as alterações transcricionais massais do patossistema Theobroma cacao X Moniliophtora perniciosa durante a progressão da doença vassoura de bruxa do cacaueiro. 2019. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

FRANCO, T. T.; DAMASIO, A. R. L.;Brandão, M. M.. Otimização da produção de celo-oligossacarídeos a partir da hidrólise enzimática da palha da cana-de-açúcar via expressão heteróloga de enzimas celulolíticas e oxidativas. 2018. Exame de qualificação (Doutorando em Interunidades em Bioenergia) - Universidade Estadual de Campinas.

Brandão, M. M.; RIBEIRO, R. V.; VIEIRA, S. A.. (Pré Banca) Adaptações locais de uma espécie de mangue Neotropical reveladas por Ecofisiologia e Transcriptômica Comparativa e Scans Genômicos para Seleção Natural. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

SANTOS, R. V.;Brandão, M. M.; PERSINOTI, G. F.. Desenvolvimento de métodos de análise e integração de dados de ômicas aplicados à construção de leveduras insdustriais para produção de bioetanol de segunda geração. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

VINCENTZ, M. G. A.;BRANDÃO, M.M.; MURAKAMI, L. M. Z.. Identificação e caracterização de genes e regiões genômicas de Trichoderma harzianum relacionados à hidrólise de compostos lignocelulósicos. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Brandão, M. M.; MATIOLLI, C. C.; VALENTE, G. T.. Evolução da transcrição pervasiva em populações de Arabidopsis thaliana. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

VINCENTZ, M. G. A.;Brandão, M. M.; CANCADO, G. M. A.. Ciclo circadiano na cana-de-açúcar: como a expressão de genes relacionados ao metabolismo de carboidratos é controlada por fotoperíodos distintos?. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Brandão, M. M.; GIANCHETTO, P. F.; MARGARIDO, G. R. A.. Integrando variação alélica e fisiologia com dados de expressão gênica para inferir relações entre genótipo e fenótipo em cana-de-açúcar.. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

BRANDAO, M. M.. Caracterização Molecular do fenótipo RhD fraco na população brasileira. 2004. Exame de qualificação (Doutorando em Clínica Médica) - Universidade Estadual de Campinas.

Brandão, M M; SANTOS, L. V.; LACERDA JUNIOR, G. V.. Assessment of the effect of different biorremediation approaches on the soil microbiome of fuel-affected areas. 2022. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

SILVA, N. C. C.;BRANDÃO, M.M.; ROCHA, L. O.. "DIVERSIDADE BACTERIANA DE CARNES DRY AGED E WET AGED POR SEQUENCIAMENTO DE NOVA GERAÇÃO DO GENE 16S (rRNA). 2021. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência de Alimentos) - Universidade Estadual de Campinas.

BRANDÃO, M.M.; BORIN, E.; Neto, A Z. Caracterização evolutiva e funcional de transportadores de xilose. 2019. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

BRANDÃO, M.M.; CARAZZOLLE, M. F.; BENDIA, A. G.. Potencial genético do microbioma de sedimentos das ilhas Deception e Livingston na Antártida marítima para a degradação de hidrocarbonetos do petróleo. 2019. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

MORI, M. A. S.; LEME, A. F. P.;BRANDÃO, M.M.. Identificação de biomarcadores em depressão geriátrica através da análise proteômica. 2019. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

BRANDAO, M. M.; JOSE, J.; SANTOS, L. V.. Genômica comparativa de Leveduras Industriais para produção de Etanol. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Brandão, M. M.; DAMASIO, A. R. L.; MURAKAMI, L. M. Z.. Análise transcricional de Trichoderma harzianum CBMAI-0179 durante a degradação de celulose e glicose. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

BRANDÃO, M.M.; LABORDA, P. R.; MARGARIDO, G. R. A.. Estudo genéticos-moleculares em Panicum maximum: mapeamento genético com marcadores SNPs baseados em genotipagem por sequenciamento. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Brandão, M. M.; KITAJIMA, J. P. F. W.; PERSINOTI, G. F.. Identificação de vias metabólicas indutoras de crescimento vegetal em bactérias isoladas do microbioma da cana-de-açũcar. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Brandão, M M; AZEREDO-SPIN, A. M. L.; FREITAS, A. V. L.. Diversidade Genética e estrutura populacional da praga Helicoverpa armigera recentemente introduzida na América do Suil. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Brandão, M M; MARTINEZ, C. E. A.; DESTEFANO, S. A. L.. Aplicação de multilocus sequence analysis (MLSA) para identificação de espécies de Chromobacterium spp.. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Brandão, M M; SOUZA, A. P.; CANCADO, G. M. A.. Caracterização genético-molecular em Panicum maximum: Identificação de marcadores moleculares SNPs e mapeamento genético. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Brandão, M. M.; VINCENTZ, M. G. A.; MALUF, M. P.. Análise do transcriptoma de Rhizophora mangle: adaptações de árvores extremófilas em um cenário de mudanças climáticas. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

YAMAGISHI, M. E. B.;Brandão, M. M.; MARGARIDO, G. R. A.. Desenvolvimento de método para haplotipagem de genes a partir de dados de RNA-SEQ de nova geração e aplicação em cana-de-açúcar. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

SANTOS, R. V.;Brandão, M M; REIS, L. L. B.. Caracterização genético-molecular em Panicum maximum: identificação de marcadores moleculares SNPs e mapeamento genético da espécie. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Brandão, M M; Carvalho, B S; SECOLIN, R.. Rastreamento de Variantes genéticas em neoplasias mielóides por sequenciamento completo do exoma. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Fisiopatologia Médica) - Universidade Estadual de Campinas.

Brandão, M M; BLOTTA, M. H. S.; FERTRIN, K. Y.. Avaliação da expressão da PAD4 e de genes induzidos pelo heme livre em pacientes com anemia falciforme. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências Médicas) - Universidade Estadual de Campinas.

SANTOS, R. V.;BRANDAO, M. M.; Neto, A Z. Aplicação de ferramentas de Biologia de Sistemasem levedura industrial para produção de bioetanol de segunda geração. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Silva, F R;BRANDAO, M. M.; Carvalho, B S. Identificação de genes relacionados à qualidade da carne de bovinos das raças Angus e Nelore por análise de expressão diferencial. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

BRANDAO, M. M.; PEREIRA, G.A. G.; SANTOS, R. V.. Identificação e padrões de expressão de transcritos derivados de RNA-seq: caracterização molecular do fungo Moniliophtora perniciosa, causador da vassoura de bruxa do cacaueiro. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

BRANDAO, M. M.; YAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H.. Redes de regulação gênica do metabolismo de sacarose em cana-de-açúcar utilizando redes bayesianas. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

BRANDAO, M. M.; Moraes, S; Toledo, M.D.. Evolução molecular das famílias proteícas MASK e FORMINA. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Pontifícia Universidade Católica de São Paulo.

SARTORATO, E. L.; SCARANO, S. L.; MORAIS, G. B.;BRANDAO, M. M.; MELO, M. B.. Comissão de avaliação interna do CBMEG para a avaliação institucional UNICAMP 2014-2018.. 2020. Universidade Estadual de Campinas.

BRANDAO, M. M.. Membro suplente da Comissão Examinadora de qualificação para obtenção de título de Doutorado da aluna Ártemis Socorro do Nascimento Rodrigues. 2004. Universidade Estadual de Campinas.

Correlação funcion; Início: 2023; Dissertação (Mestrado em Biologia Molecular e Morfofuncional) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Coorientador);

Differential gene expression in Spodoptera Frugiperda in different field diets; Início: 2020; Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Abordagens de Bioinformática para Identificação das Contribuições Genéticas à Doença de Alzheimer e ao Diabetes; Início: 2024; Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Impactos sistêmicos de Microplásticos em Spodoptera frugiperda; Início: 2023; Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas; (Orientador);

AVALIAÇÃO DA CORRELAÇÃO GENÉTICA E A CASUALIDADE ENTRE SÍNDROME METABÓLICA, DIABETES MELLITUS TIPO 2 E DOENÇA DE ALZHEIMER COM O FOCO EM PROSPECTAR POTENCIAIS ALVOS PARA O DESENVOLVIMENTO TERAPIAS PARA REMEDIAÇÃO E PREVENÇÃO DA DOENÇA DE ALZHEIMER; ; Início: 2022; Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Saccharomyces cerevisiae industrial fermentation multiomics time course; Início: 2019; Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas; (Orientador);

Population genomics of the Amazonian white sand specialist Heliconius hermathena (Lepidoptera:Nymphalidae); 2018; Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Marcelo Mendes Brandao;

Análise do transcriptoma de Rhizophora mangle: adaptações de árvores extremófilas em um cenário de mudanças climáticas; 2017; Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Marcelo Mendes Brandao;

Aprendizado de Máquina aplicado ao estudo de subtipos de Leucemia Mieloide Aguda e Síndrome Mielodisplásica; ; 2020; Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marcelo Mendes Brandao;

Redes de Regulação gênica para identificação de adaptações de duas raças de Spodoptera frugiperda a diferentes dietas; 2018; Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Marcelo Mendes Brandao;

Systemic and integrative characterization of the transcriptomic landscape of Saccharomyces cerevisiae in the presence of lignocellulosic inhibitory compounds and identification of candidate genes for development of a strain capable of oligosaccharide transport and processing for bioethanol and other bioproducts production; 2018; Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Marcelo Mendes Brandao;

?REDES DE REGULAÇÃO GÊNICA PARA IDENTIFICAR ADAPTAÇÕES À HERBIVORIA EM DUAS RAÇAS DE Spodoptera frugiperda?; 2015; Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Marcelo Mendes Brandao;

2019; Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Marcelo Mendes Brandao;

Análise filogenética de proteínas MASK e forminas humanas; 2007; Monografia; (Aperfeiçoamento/Especialização em Ciências Biológicas) - Pontifícia Universidade Católica de São Paulo; Orientador: Marcelo Mendes Brandao;

Evolução molecular das famílias protéicas MASK e FORMINA; 2007; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Pontifícia Universidade Católica de São Paulo; Orientador: Marcelo Mendes Brandao;

Evolução das serino peptidases dentro da ordem Lepidoptera; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Ensino Médio) - Escola Estadual ADONIRAM BARBOSA, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marcelo Mendes Brandao;

EVOLUÇÃO DAS SERINO PEPTIDASES DENTRO DA ORDEM DAS LEPDOPTERAS; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Ensino Médio) - Escola Estadual São Judas Tadeu, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marcelo Mendes Brandao;

Análise por Biologia Computacional do conteúdo de miRNAs e seus alvos em ​Spodoptera frugiperda; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Ensino Médio) - Escola Estadual Dom João Nery, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marcelo Mendes Brandao;

Correlação entre eventos de transferência horizontal de genes e a filogenia de papilionidae; 2007; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista; Orientador: Marcelo Mendes Brandao;

An integrated approach to explore a novel paradigm for biofuel production from lignocellulosic feedstocks; 2019; Orientação de outra natureza - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marcelo Mendes Brandao;

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2024

Finalista do Santander Explorer, Santander.

2023

Best poster on education and outreach, Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional.

2022

Honorable Mention, Best Poster, Sociedade Brasileira de Bioinformática.

2022

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2011

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2009

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2002

Young investigator award, Fondazione Italiana Ricerca Sul Cancro.

2001

Prêmio Oswaldo Melone, Sociedade Brasileira de Hematologia.

2001

Young investigator travel grant, European Haematololgy Association.