Maria Dulcetti Vibranovski

possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (2000), mestrado em Ciências Biológicas (Genética) pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (2002) e doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica) pela Universidade de São Paulo (2005) e pós-doutoramento pela Universidade de Chicago, departamento de ecologia e evolução (2010). Foi pesquisadora associada na Universidade de Chicago (2011-2012). Foi Professora Associada da Arizona State University no período de 2022 a 2023. Atualmente é professora doutora do Departamento de Genética e Biologia Evolutiva da Universidade de Sao Paulo e Jovem Pesquisadora (Fapesp). Tem experiência na área de Genética e Evolução, com ênfase no estudo de cromossomos sexuais, expressão genica na gametogênese, evolução de genes novos e bioinformática.

Informações coletadas do Lattes em 23/02/2024

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)

2002 - 2005

Universidade de São Paulo
Título: O papel do fenômeno de exon-shuffling antigo e moderno na evolução de proteínas
, Ano de obtenção: 2005. Sandro José de Souza. Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Palavras-chave: Exon-shuffling; Intron; Introns-early; Introns-late; Domínios protéicos.Grande área: Ciências Biológicas

Mestrado em Ciências Biológicas (Genética)

2000 - 2002

Universidade Federal do Rio de Janeiro
Título: IDENTIFICAÇÃO DE GENES DO CROMOSSOMO Y DE DROSOPHILA MELANOGASTER
, Ano de Obtenção: 2002.Antonio Bernardo de Carvalho.Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: heterocromatina; genômica; Bioinformática; Evolução; WGS.Grande área: Ciências BiológicasSetores de atividade: Outro.

Graduação em Ciências Biológicas

1996 - 2000

Universidade Federal do Rio de Janeiro
Título: Polimorfismo não neutro no cromossomo Y em populações naturais de Drosophila mediopunctata: estável ou transitório?
Orientador: Antonio Bernardo de Carvalho
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

Pós-doutorado

2006 - 2011

Pós-Doutorado. , University of Chicago, U OF C, Estados Unidos. , Bolsista do(a): Pew Latin American Fellows Program in the Biomedical Sciences, PEW, Estados Unidos. , Grande área: Ciências Biológicas

Formação complementar

2004 - 2004

Embo Phylogenetics Course. (Carga horária: 40h). , Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil.

2003 - 2003

Bioinformatics International Course Icgeb. (Carga horária: 80h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2001 - 2001

Curso de Linux Básico. (Carga horária: 40h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2001 - 2001

Curso de Programação Em Linguagem C. (Carga horária: 40h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

1998 - 1999

Extensão universitária em Curso de Extensão Em Programação de Computadores. , Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro, PUC-Rio, Brasil.

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.

Francês

Compreende Pouco.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Evolução de Genes Novos.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Evolução/Especialidade: Inativação do cromossomo X durante a espermatogenese.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Expressão gênica Gametogenses.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: BIOINFORMATICA.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Animal/Especialidade: Evolução do Cromossomo Y Em Drosophila.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Evolução/Especialidade: Evolução e Origem dos Introns.

Organização de eventos

LONG, M. ; Gilad, Y. ; Bergelson, J ; Steffen, J. ; VIBRANOVSKI, M. D. . Annual Conference of the Society for Molecular Biology and Evolution. 2013. (Congresso).

Participação em eventos

64th Annual Drosophila Research Conference. Single and repetitive oligopaints probes label specifically neo-Y chromosome of Drosophila miranda. 2023. (Congresso).

Evolunch - Institute of Science and Technology.Evolution of Drosophila sex chromosome expression in spermatogenesis. 2021. (Seminário).

Institute of Ecology and Evolution - Friedrich Schiller University Jena.Male germline and the evolution of new genes. 2021. (Seminário).

Institute of Zoology, Chinese Academy of Science.Spermatogenesis role on the evolution of new genes. 2019. (Seminário).

Pequim University seminar.Spermatogenesis role on the evolution of new genes. 2019. (Seminário).

Center for Systems Biology in Soochow University.Haploid selection and the origin of new genes. 2018. (Seminário).

Department of Applied Mathematics, Xi'an Jiaotong University.The Use of Genomic and Gene Expression Large-Scale Data for the Analyses of Sexual Evolution. 2018. (Seminário).

Drosophila Research Conference. Haploid selection model for new gene evolution. 2018. (Congresso).

Germ Cells Cold Spring Harbor. Haploid selection on male germline and the origin of new genes. 2018. (Congresso).

International Chengdu Symposium on the Evolution of Genes and Genomes.Spermatogenesis expression and evolution of new genes. 2018. (Simpósio).

Society of Molecular Biology and Evolution. Resolving differences on the chromosomal distributions of Drosophila new genes. 2017. (Congresso).

56th Annual Drosophila Research Conference. Evolutionary aspects of gene expression during Drosophila melanogaster spermatogenesis. 2015. (Congresso).

Dept. Drosophila Genomics and Genetic Resources, Kyoto Institute of Technology.Spermatogenesis and the Evolutionary Reorganization of the Genome. 2015. (Seminário).

IX Simpósio de Ecologia, Genética e Evolução de Drosophila.Aspectos evolutivos da espermatogênese de Drosophila. 2015. (Simpósio).

2014 Annual Meeting for the Society for Molecular Biology & Evolution. Meiotic Sex Chromosome Inactivation in Drosophila and its evolutionary impacts. 2014. (Congresso).

55th Annual Drosophila Research conference. A Novel Dataset for Identifying Sex-Biased Genes in Drosophila. 2014. (Congresso).

54th Annual Drosophila Research Conference. A long term demasculinization of X-linked intergenic noncoding RNAs in Drosophila melanogaster. 2013. (Congresso).

59 Congresso Brasileiro de Genética. Recrutamento Genômico Acelerado de Novos Genes Expressos Durante o Desenvolvimento do Cérebro Humano.. 2013. (Congresso).

Annual Conference Society for Molecular Biology and Evolution. A long term demasculinization of X-linked intergenic noncoding RNAs in Drosophila melanogaster. 2013. (Congresso).

53rd Annual Drosophila Research Conference. Methodological studies on development and duplicate datasets revealed new evidence for Meiotic Sex Chromosomal Inactivation. 2012. (Congresso).

Biological Department, University of New Mexico.Genetic Analyses of the Gene Movement between Sex Chromosomes and Autosomes. 2012. (Seminário).

Biological Sciences Department, University of Illinois at Chicago.Genetic Analyses of the Gene Movement between Sex Chromosomes and Autosomes. 2012. (Seminário).

Department of Biology, University of Syracuse.Spermatogenesis and the Evolutionary Reorganization of the Genome. 2011. (Seminário).

Department of Biology, Wayne State University.Spermatogenesis and the Evolutionary Reorganization of the Genome. 2011. (Seminário).

Drosophila Conference 2011. Retrogene movement out of the Z chromosome in Silkworm. 2011. (Congresso).

Genetics, Epigenetics and Evolution of Sex Chromosomes meeting.Genomic Distribution of Sex-biased Genes and its Implication for the Evolution of Sex Chromosomes. 2011. (Simpósio).

50th Annual Drosophila Research Conference. Post-meiotic transcription in Drosophila spermatogenesis. 2009. (Congresso).

SMBE. Postmeiotic transcription in Drosophila melanogaster spermatogenesis. 2009. (Congresso).

Institute of Biodesign - ASU.Male germline X inactivation and its consequences on the evolution of male related genes in Drosophila. 2008. (Seminário).

SMBE. Male Germline X inactivation and the Evolution of Male Genes in Drosophila. 2008. (Congresso).

The Ninth Annual International Conference on Resarch in Computational Biology. The Ninth Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology (Recomb 2005). 2005. (Congresso).

2nd International Conference on Bioinformatics and Computatonal Biology (ICoBiCoBi). 2nd International Conference on Bioinformatics and Computational Biology (ICoBiCoBi). 2004. (Congresso).

1st International Conference on Bioinformatics and Computational Biology - ICoBiCoBi. 1st International Conference on Bioinformatics and Computational Biology - ICoBiCoBi. 2003. (Congresso).

Biomat 2003 III Brazilian Symposium on Mathematical and Computational Biology.Biomat 2003 III Brazilian Symposium on Mathematical and Computational Biology - Conferencista convidada. 2003. (Simpósio).

2o Simpósio de Ecologia, Genética e Evolução de Drosophila.2o Simpósio de Ecologia, Genética e Evolução de Drosophila. 2001. (Simpósio).

53a Reunião Anual da SBPC. 53a Reunião Anual da SBPC. 2001. (Congresso).

Congresso Nacional de Genética. 46o Congresso Nacional de Genética. 2000. (Congresso).

Simpósio Molecular Evolution 2000, Pathogenic microorganisms, vectors and reservoirs".Simpósio Mlecular Evolution 2000, Pathogenic microorganisms, vectors and reservoirs. 2000. (Seminário).

XXII Jornada Interna de Iniciação Científica.XXII Jornada Interna de Iniciação Científica. 2000. (Outra).

VII Congress of the European Society for Evolutionary Biology. VII Congress of the European Society for Evolutionary Biology. 1999. (Congresso).

Congresso Nacional de Genética. 44o Congresso Nacional de Genética. 1998. (Congresso).

II Reunião Anual Arthromint.II Reunião Anual Arthromint. 1998. (Encontro).

IV Eugene Warming Lectures in Evolutionary Ecology.IV Eugene Warming Lectures in Evolutionary Ecology. 1998. (Simpósio).

XX Jornada de Inciação Científica.XX Jornada interna de Iniciação Científica da UFRJ. 1998. (Outra).

Congresso Nacional de Genética. 43o Congresso Nacional de genética. 1997. (Congresso).

XIX Jornada de Iniciação Científica.XIX Jornarda Interna de Iniciação Científica da UFRJ. 1997. (Outra).

Participação em bancas

Aluno: Rafaella Ferreira Soares

KUHN, G. C. E. S.; LOBO, F. P.;VIBRANOVSKI, M. D.. Evolução do gene da proteína centromérica Cenp-C em espécies de Drosophila do grupo montium. 2022. Dissertação (Mestrado em Genética) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: William Vilas Boas Nunes,

VIBRANOVSKI, M. D.; CARARETO, C. M. A.; GAIESKY, V. L. S. V.. História evolutiva e divergência funcional do gene de especiação OdsH e sua duplicata unc-4 em Drosophilidae. 2022. Dissertação (Mestrado em Biociências) - Universidade Estadual Paulista.

Aluno: Walkiria Karla Resende

BRENTANI, H.;Vibranovski, M.D.; HASHIMOTO, R. F.. Uso de tecnicas de reconhecimento de padroes e genetica para a predicao de transtornos psiquiatricos da infancia. 2017. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Érica Ramos

MARTINS, C.;VIBRANOVSKI, M. D.; DOMINGUES, D. S.. Genomica Comparativa para estudos de evolucao de ciclideos sul americanos. 2016. Dissertação (Mestrado em Ciência Biológica AC.: Genética) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Débora Yoshihara Caldeira Brandt

MEYER, D.; SCHRAGO, C. E. G.;VIBRANOVSKI, M. D.. Diferenciação populacional em genes sob forte seleção balanceadora: um estudo de caso com genes HLA. 2015. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Ana Paula Urlass

VIBRANOVSKI, M. D.; CAMARGO, A. A.. Avaliação da Ocorrência e das Implicações Funcionais de Eventos de Retrotransposição Somática de Transcrito Processados em Tumores de Reto. 2015. Dissertação (Mestrado em Ciências da Saúde) - Hospital Sírio-Libanês.

Aluno: Isabelle Hernandez Cantão

VIBRANOVSKI, M. D.. REPROGRAMAÇÃO EPIGENÉTICA DAS CÉLULAS GERMINATIVAS PRIMORDIAIS DE RATO. 2014. Dissertação (Mestrado em Biologia Estrutural e Funcional) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Fábio Henrique Kuriki Mendes

de BRITO, R. O. A. A.;VIBRANOVSKI, M. D.; MEYER, D.. Selec~ao natural em genes HLA e seu efeito sobre regi~oes adjacentes do genoma. 2013. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Fabiana Uno de Souza

VIBRANOVSKI, M. D.CARVALHO, A. B.; JUNQUEIRA, A. C. M.; PAIVA, P. C.; HENNING, F.. The Y chromosome of the Ephydridae family (Diptera). 2022. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Eduarda Morgana da Silva Montenegro Malaguti de Souza

BUENO, M. R. S. E. P.; STUMPP, T; JORGE, A. A. L.;VIBRANOVSKI, M. D.. Investigação de variantes de novo e alterações no número de cópias na etiologia do transtorno do espectro autista. 2020. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Tatiana Ferreira de Almeida

BUENO, M. R. S. E. P.; MEYER, D.; OTTO, P. A.; BRENTANI, H.;Vibranovski, M.D.. Diagnóstico molecular do transtorno do espectro autista através do sequenciamento completo de exoma. 2018. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Octavio Manuel Palacios-Gimenez

Vibranovski, M.D.; MELLO, D. C. C.; MALTEMPI, P. P. P.; VANZELA, A. L. L.; LOURENCO, L. B.. Padroes de evolucao de sistemas de cromossomos sexuais em grilos: uma abordagem integrada entre citogenetica e genomica. 2017. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Andrei Rozanski

GALANTE, P. A. F.; MENCK, C. F. M.; de SOUZA, R. F.; MEYER, D.;VIBRANOVSKI, MARIA. Estudos de Caracteristicas Evolutivas e dos Retrovirus Endogenos. 2016. Tese (Doutorado em Ciências da Saúde) - Hospital Sírio-Libanês.

Aluno: Bárbara Domingues Bitarello

MEYER, D.; SCHRAGO, C. E. G.; COGNI, R.; SETUBAL, J. C.;M.D. Vibranovski. Seleção balanceadora no genoma humano: relevância biológica e consequências deletérias. 2016. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Luciano Abreu Brito

BUENO, M. R. S. E. P.; NETTO, R. C. M.;M.D. Vibranovski; PEREIRA, A. C.; CEIDE, R. M. Z.. Variantes Genéticas de Risco às Fissuras Orofaciais. 2016.

Aluno: Renato Borges Tesser

VIBRANOVSKI, M. D.; STUMPP, T. Reprogramação epigenética das Células Germinativas de Rato e sua Associação com a Expressão de Retrotransposons e de Genes de Defesa do Genoma. 2015. Tese (Doutorado em Biologia Estrutural e Funcional) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Suzana Casaccia Vaz

CARVALHO, A. B.; SCHEEPMAKER, D. S.;VIBRANOVSKI, M. D.; SKLORZ, R. T.; LORETO, E. L. S.. Drosofilídeos (Diptera) associados a flores e fungos da mata atlântica: identificação de novas espécies e evolução do cromossomo Y. 2014. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Daniela Munhoz Rossoni

Marroig, G;VIBRANOVSKI, M. D.; Monteiro. LR; Moraes, DA; Quental, TB. Integração morfológica craniana em morcegos da Família Phyllostomidae. 2013. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Pietro Enrico Vicari Vento,

TORRES, T. T.; ANDRADE, S. C.;Vibranovski, M.D.. Análise de efeitos pleitrópicos de genes na determinação sexual em Anastrepha sp. 1 affinis fraterculus (Diptera, Tephritidae). 2018. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Danielle de Paula Moreira

PEREIRA, L. V.; ROSENBERG, C.;VIBRANOVSKI, M. D.. Modelos biológicos usados para entender as variantes genéticas associadas ao transtorno do espectro autista. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Diogo Amaral Rebouças Melo

MEYER, D.;VIBRANOVSKI, M. D.; ANDRADE, S. C. S.. A Evolução do Mapa Genótipo-fenótipo e suas Consequências para Covariação. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Luiz Gustavo Dufner de Almeida

VIBRANOVSKI, M. D.; GORAB, E.; VASQUES, L. R.. Elementos Reguladores do RNAm: Estudo de Mutações e da Estabilidade Molecular. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Ighor Luiz Azevedo Teixeira

VIBRANOVSKI, M. D.; TORRES, T. T.; ARIAS, M. C.. Silenciamento gênico para estudo de comportamento reprodutivo em espécies do complexo Anastrepha fraterculus (Diptera, Tephritidae. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Luciano Abreu de Brito

MEYER, D.;VIBRANOVSKI, M. D.; MAGALHAES, M. L.. Sequenciamento de nova geração para a identificação de variantes de suscetibilidade as fissuras labiopalatinas. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Natália de Souza Araujo

GORAB, E.;VIBRANOVSKI, M. D.; EGGERS, S.. Expressão de genes envolvidos no comportamento social em abelhas que apresentam diferentes níveis de Eussocialidade. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Fabio de Andrade Machado

Matioli SR; EGGERS, S.;VIBRANOVSKI, M. D.. Implicações evolutivas da integração morfológica do crânio e mandíbula em Caniformia (Carnívora;Mammalia). 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Departamento de Genética e Biologia Evolutiva) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Ana Paula Aprígio Assis

VIBRANOVSKI, M. D.; Matioli SR; OTTO, P. A.. Força e ritmo da seleção direcional na natureza. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Ester Silva Chang

RIBEIRO, A. A. G. F. C.; Matioli SR;Vibranovski, M.D.. Análise comparativa entre espécies generalistas e especialistas de moscas-das-frutas do gênero Anastrepha (Diptera: Tephritidae): aspectos morfológicos e moleculares. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Fátima Beatriz Annetta

M.D. Vibranovski; SIMOES, A. C. Q.; KASHIWABARA, A. Y.. Estudo da relação entre microRNAs oriundos de cromossomos sexuais, a expressão diferencial de genes autossômicos no cérebro humano durante o neurodesenvolvimento e o Transtorno do Espectro Autista. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Jaqueline Yu Ting Wang

MEYER, D.;M.D. Vibranovski; SOLER, J. M. P.. Determinação prénatal não invasiva de paternidade utilizando SNPs e microhaplótipos. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Anna Paula Casselli Penna

MIYAKI, C. Y.; ARIAS, M. C.;VIBRANOVSKI, M. D.. Diversificação em ilhas: o caso dos Lemures de Madagascar. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Valeria Lis Le Gall

VIBRANOVSKI, M. D.; ARIAS, M. C.; MEYER, D.. Bases Moleculares da Resistência à Ivermectina em Rhipicephalus (Boophilus) microplus. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Alejandra Badaracco

TORRES, T. T.;VIBRANOVSKI, M. D.; SCHEEPMAKER, D. S.. Aspectos da atividade de transcrição induzida pelo choque de temperatura e pela anestesia em Rhynchosciara americana. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Guilherme Rodrigues Gomes Garcia

OTTO, P. A.; Matioli SR;VIBRANOVSKI, M. D.. Modularidade, Evolução e a "Revolução Morfométrica". 2013. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade de São Paulo.

ANDRADE, S. C.; Matioli SR;M.D. Vibranovski. Professor substituto para o Departamento de Genetica e Biologia Evolutiva. 2016. Universidade de São Paulo.

Orientou

Henry Bonilla Bruno

O papel dos territórios cromossômicos na evolução da regulação transcricional do cromossomo X durante a espermatogênese em Drosophila; Início: 2023; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo; (Orientador);

Ana Beatriz Stein Machado Ferretti

Conteúdo molecular, padrões de modificações epigenéticas e interferência dos cromossomos supranumerários em Drosophila melanogaster; Início: 2020; Tese (Doutorado em Ciencias Biologicas (Genetica)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; (Coorientador);

Camila Correia Avelino

Estudo da Inativação meiótica do cromossomo X através da análise de expressão de genes da espermatogênese de Drosophila melanogaster; Início: 2018; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; (Orientador);

Henry Angel Bonilla Bruno

Evolução da inativação meiótica do cromossomo X em Drosophila; 2023; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Maria Dulcetti Vibranovski;

Isabela Almeida

Técnica para construção de oligopaints completos a partir sequências heterocromáticas usando como modelo o cromossomo Y de Drosophila melanogaster; 2022; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Maria Dulcetti Vibranovski;

Carolina de Athayde Mendonça

Funções de genes novos do cromossomo Y de Drosophila por meio da análise de expressão na espermatogênese; 2020; Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Maria Dulcetti Vibranovski;

Julia Raices

Contribuição da seleção natural e de processos mutacionais na expressão dos genes novos durante a espermatogênese; 2017; Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Maria Dulcetti Vibranovski;

Domitille Chalopin

Post-meiotic transcription in Drosophila; 2010; Dissertação (Mestrado em Genetics) - University of Lyon,; Coorientador: Maria Dulcetti Vibranovski;

Gabriel Nassar Reich Goldstein

Análise evolutiva de Genes Novos em Drosophila através dos Transcriptomas da Gametogênese; 2022; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Maria Dulcetti Vibranovski;

Nicholas W

VanKuren; New gene evolution in Drosophila melanogaster; 2016; Tese (Doutorado em Ecology and Evolution) - University of Chicago,; Coorientador: Maria Dulcetti Vibranovski;

Joana Carvalho Moreira de Mello

Estado Epigenético do Cromossomo X em Tecidos Extra Embrionários Humanos e Bovinos; 2015; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Maria Dulcetti Vibranovski;

Jun Wang

Natural Selection Impacts Gene Traffic; 2011; Tese (Doutorado em Ecology and Evolution) - University of Chicago,; Orientador: Maria Dulcetti Vibranovski;

Eduardo Guimarães Dupim

2022; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Maria Dulcetti Vibranovski;

Joana Carvalho Moreira de Mello

2019; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Maria Dulcetti Vibranovski;

Felipe Bastos Rocha

2017; Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Maria Dulcetti Vibranovski;

Amanda Luvisotto Gomes Leite Silva

Análise e classificação de translocações cromossômicas X-2 em Drosophila Melanogaster; 2021; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biomédicas) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Maria Dulcetti Vibranovski;

Camila Correia Avelino

Inativação meiótica do cromossomo X através da expressão de genes da espermatogênese de Drosophila; 2017; Iniciação Científica - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Maria Dulcetti Vibranovski;

Mariana Teixeira Kanbe

Duplicação gênica em Drosophila e expressão diferencial entre sexos; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biomédicas) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Maria Dulcetti Vibranovski;

Julia Raices

Expressão de genes novos em Drosophila e mamíferos durante a espermatogênese; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Maria Dulcetti Vibranovski;

Produções bibliográficas

MAHADEVARAJU, SHARVANI ; FEAR, JUSTIN M. ; AKEJU, MIRIAM ; GALLETTA, BRIAN J. ; PINHEIRO, MARA M. L. S. ; AVELINO, CAMILA C. ; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO C. ; CONLON, KATIE ; DELL?ORSO, STAFANIA ; DEMERE, ZELALEM ; MANSURIA, KUSH ; MENDONÇA, CAROLINA A. ; PALACIOS-GIMENEZ, OCTAVIO M. ; ROSS, ELI ; SAVERY, MAX ; YU, KEVIN ; SMITH, HAROLD E. ; SARTORELLI, VITTORIO ; YANG, HAIWANG ; RUSAN, NASSER M. ; VIBRANOVSKI, MARIA D. ; MATUNIS, ERIKA ; OLIVER, BRIAN . Dynamic sex chromosome expression in Drosophila male germ cells. Nature Communications , v. 12, p. 892, 2021.
RODRIGUES, MURILLO F. ; VIBRANOVSKI, MARIA D. ; COGNI, RODRIGO . Clinal and seasonal changes are correlated in Drosophila melanogaster natural populations. EVOLUTION , v. 75, p. 2042-2054, 2021.
XIA, SHENGQIAN ; VANKUREN, NICHOLAS W. ; CHEN, CHUNYAN ; ZHANG, LI ; KEMKEMER, CLAUSE ; SHAO, YI ; JIA, HANGXING ; LEE, UNJIN ; ADVANI, ALEXANDER S. ; GSCHWEND, ANDREA ; VIBRANOVSKI, MARIA D. ; CHEN, SIDI ; ZHANG, YONG E. ; LONG, MANYUAN . Genomic analyses of new genes and their phenotypic effects reveal rapid evolution of essential functions in Drosophila development. PLoS Genetics , v. 17, p. e1009654, 2021.
RAICES, J. ; OTTO, P. A. ; Vibranovski, M.D. . Haploid selection drives new gene male germline expression. GENOME RESEARCH , v. 29, p. 1115-1122, 2019.
SAMOGY-COSTA, CLAUDIA ISMANIA ; VARELLA-BRANCO, ELISA ; MONFARDINI, FREDERICO ; FERRAZ, HELEN ; FOCK, RODRIGO AMBRÓSIO ; BARBOSA, RICARDO HENRIQUE ALMEIDA ; PESSOA, ANDRÉ LUIZ SANTOS ; PEREZ, ANA BEATRIZ ALVAREZ ; LOURENÇO, NAILA ; VIBRANOVSKI, MARIA ; KREPISCHI, ANA ; ROSENBERG, CARLA ; PASSOS-BUENO, MARIA RITA . A Brazilian cohort of individuals with Phelan-McDermid syndrome: genotype-phenotype correlation and identification of an atypical case. Journal of Neurodevelopmental Disorders , v. 11, p. 13, 2019.
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VIBRANOVSKI, M. D. ; LOPES, H. F. ; KARR, T. L. ; LONG, M. . Spermpress Database. 2009.

PARMIGIANI, R. B. ; VIBRANOVSKI, M. D. ; de SOUZA, S. J. ; CAMARGO, A. A. . CTSP Cancer Testis Antigens. 2006.

VIBRANOVSKI, M. D. ; WATTS, A. ; WALLING, M. . Fighting fruit flies. 2022. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

VIBRANOVSKI, M. D. . Espermatozoide tem função mais importante na evolução do que se sabia. 2019. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

VIBRANOVSKI, M. D. ; SALLES, S. . Pesquisadora busca genes novos para conhecer a evolução. 2017. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

VIBRANOVSKI, M. D. ; MARQUES, F. . a inativação do cromossomo X em embriões de mulheres ocorre seis dias após a fertilização.. 2017. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

Vibranovski, M.D. ; FRANCA, G. S. . Vibranovski Lab. 2016. (Site).

VIBRANOVSKI, M. D. . Integrative Biology I. 2023. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Curso Online para mestrado profissional).

M.D. Vibranovski . Nature Plants: Receipt of review for NPLANTS-18085254. 2018. (Revisão).

VIBRANOVSKI, M. D. . Introduction of Bioinformatics for Sequence Analyses. 2015. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

VIBRANOVSKI, M. D. ; MEYER, D. ; TORRES, T. T. . Brazilian Edition of the summer Institute in Statistical Genetics. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

VIBRANOVSKI, M. D. . Evolutionary aspects of the Human Genome Map. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

VIBRANOVSKI, M. D. . Bioinformatica e Evolucao Molecular. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

VIBRANOVSKI, M. D. . Origem e Evolução de Introns. 2007. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

Projetos de pesquisa

2022 - Atual

Training in Genomics Research (TiGeR), Descrição: This application will augment our newly established Masters in Biological Data Science program at the School ofMathematical and Natural Sciences (SMNS), Arizona State University (ASU) West, with the implementation of agenomics research component and purposeful recruitment of candidates from under-represented communities. While inthe Training in Genomics Research (TiGeR) Track, students will gain expertise in the computational aspects of genomics,improve their marketability, and meet the demands for genomics-trained bioinformaticians. By recruiting from a diversepopulation of students from the populations surrounding ASU, we will create a diverse and competitive science workforcethat fosters deeper engagement between the biomedical and biosciences sector and the greater Phoenix community.Diversity in college education readies students for life, work, and leadership in a more global economy by fosteringthought leaders who are creative, collaborative, and able to navigate dynamic and multicultural environments skillfully.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: / Mestrado profissional: (25) . , Integrantes: Maria Dulcetti Vibranovski - Integrante / Valentin Dinu - Integrante / Jonathan Parrott - Integrante / Maria Sanin Perez - Integrante / Pamela Marshall - Integrante / Kim Bussey - Integrante / Sree Kanthaswamy - Coordenador.
2017 - 2023

Sex and B chromosome enigmas: model systems for the study of chromosome and genome evolution, Descrição: Chromosomes are major components of cells, packing the genetic material in a perfect organized structural and functional pattern. However, the chromosomes behavior during cell cycle is subjected to genomic rearrangements producing a wide variety of functional consequences with impact in cell disorders and also generating evolutionary novelties. Although several factors that mediate genomic rearrangements are now known, there are still many unanswered questions. In the light of high throughput era in generation of biological data, chromosome studies have also advanced to a higher level exploring high scale analyses of DNA, RNA, and proteins, and their interactive networks. Therefore, this grant application intend to explore chromosomal polymorphism (associated to B chromosomes and sex chromosomes) as models to investigate the structural and functional nature of chromosomal rearrangements during evolution. In this way, the objective of this project is to analyze chromosome rearrangements in the light of massive molecular data obtained from different biological models, in order to advance in the identification of origin and fate of chromosome changes and to comprehend their evolutionary and disease consequences. Additionally, the project also aims to perform the scientific divulgation of chromosome facts, in the light of an evolutionary and function perspective, in order to enforce a dialog between science and society.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (5) / Doutorado: (10) . , Integrantes: Maria Dulcetti Vibranovski - Integrante / Cesar Martins - Coordenador / Adriane Pinto Wasko - Integrante / Danillo Pinhal - Integrante / David Ray - Integrante / Diogo Cavalcanti Cabral de Mello - Integrante / Flávia Karina Delella - Integrante / Guilherme Targino Valente - Integrante / Lucilene Delazari dos Santos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2017 - Atual

Evolutionary Genomics of Diptera Y Chromosomes, Descrição: Y chromosomes are directly involved with sex-determination and male fertility. Despite theirbiological importance they remain largely uncharacterised in most species because their very highPage 11 of 40content of repetitive DNA poses formidable obstacles to genetic, genomic and evolutionary studies.A significant effort and contribution of my group has been on the development of methods tofacilitate these studies (see Carvalho and Clark Genome Research 2013, and Carvalho, Dupim andGoldstein Genome Research 2016 for two recent examples), which resulted in the identification ofnearly all known Drosophila Y-linked genes (Carvalho and Clark Science 2005; Koerich et al.Nature 2008; Carvalho et al. TIG 2009). Here we propose to apply these methods to obtain Y-linkedmarkers for mosquito species which transmit malaria, dengue, leishmaniosis and other diseases, toimprove the assembly of the highly repetitives Aedes aegypti genome and human segmentalduplications, to investigate Y-chromosome evolution in Diptera, and to further improve theassembly methods of long reads (PacBio and Oxford Nanopore).. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Maria Dulcetti Vibranovski - Integrante / Antonio Bernardo de Carvalho - Coordenador / Evan Eichler - Integrante / Jeffrey Powell - Integrante / José Bento Pereira Lima - Integrante / Joaquín Ezpeleta - Integrante / Attilio Pane - Integrante / Luisa Rona - Integrante., Financiador(es): Wellcome Trust - Auxílio financeiro.
2016 - 2022

The role of Gametogenesis on the Origin and Evolution of New genes, Descrição: Resumo em InglêsNew genes are frequently formed during evolution in a wide variety of organisms playing a key role in the emergence of novel traits. Recently, studies have shown that new genes can quickly assume critical roles in developmental pathways by producing essential structures. Despite their importance, new genes are still seriously under-characterized in functional studies and inconsistently annotated in large-scale genome projects. Hence, biased estimations of gene gain and loss prevent us to establish how mutational processes and selective forces contribute to the source of new genes. Therefore, determining relations between genotype and phenotype in the emergence of a new gene requires current researches to apply a biological developmental system approach and perspective. Gametogenesis is a system of great importance for survival and evolution of species that varies temporally with the development and has a profound impact on new genes. Spermatogenesis, the male gametogenesis, provides half of the raw genetic material for the next generation and is enriched with new genes expression. The main goal of this project is to study processes and evolutionary forces determinant for evolution and origin of new genes. To achieve this goal, I will: 1- investigate the role of mutation and selective processes in the Drosophila and mammal spermatogenesis impacting new gene evolution; 2: take advantage of gametogenesis gene expression to generate unbiased rates of gene origin in Drosophila; 3- investigate new gene origination associated with sex chromosome evolution. I expect that the systems biology approach in an integrated framework will help understand trajectories of new gene origination and its impact in genome evolution, speciation and phenotypic consequences.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Maria Dulcetti Vibranovski - Coordenador / Manyuan Long - Integrante / Timothy L Karr - Integrante / Antonio Bernardo de Carvalho - Integrante / Yong E Zhang - Integrante / Julia Raices - Integrante / Bernado Lemos - Integrante / Gabriel N R Goldstein - Integrante / Camila Avelino - Integrante / Carolina Mendonca - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2013 - Atual

CEGH-CEL - Human Genome and Stem Cell Research Center, Descrição: Resumo em Inglês The Human Genome Research Center (HGRC-CEPID I) was initiated in 2000 with the main goal of increasing our basic knowledge and diagnosis of prevalent genetic diseases in the Brazilian population. The HGRC concentrated largely on Mendelian disorders, mainly neuromuscular, craniofacial, and mental disability. The scope was expanded in 2005 by incorporating stem-cell research, both as a tool to understand gene expression and differentiation in genetic disorders and to evaluate its potential in disease therapy. Our research has allowed us to address questions on the genetic regulation of particular complex disorders such as autism and various neurodegenerative diseases. However, the unanticipated complexity of the transcriptional mechanisms regulating gene expression in humans that emerged from the Human Genome Project, and the modest advances in improving the effectiveness of genetic health care have opened new fields of investigation. In this CEPID 11 application, we have expanded the scientific breadth to include ageing and degeneration and how factors such as genome instability contribute to the aging process; the role of imprinting mechanisms on disease manifestation; which factors determine differences in the rate of brain degeneration between individuals, which constitutes a rapidly increasing health care burdon as the average life-span of the world population rises; what determines phenotypic variability between individuals carrying the same mutation. To address these questions we will use up to date approaches, particularly the use of second generation sequencing and sophisticated cell sorting, incorporate a much broader base of scientific expertise, optimize inter-group synergy as well as national and international research collaboration. The plan also contributes to translational medicine mainly in the application of stem-cells in preclinical studies and therapeutic trials for particular genetic disorders. The great number of patients with different genetic disorders that have been ascertained and registered in our center, the largest one in Latin America, and the ethnic variability of the Brazilian population provides an extremely rich foundation for the proposed studies. We are positive that the knowledge gained from CEPID 11 will have an important impact on genetic health care in Brazil. However, such an ambitious and integrated program can only be expedited by the flexibility and long term security offered by CEPID funding.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Maria Dulcetti Vibranovski - Coordenador / Carla Rosenberg - Integrante / Maria Rita dos Santos e Passos Bueno - Integrante / Regina Celia Mingroni Netto - Integrante / Mayana Zatz - Integrante / Angela Maria Vianna Morgante - Integrante / Celia Priszkulnik Koiffmann - Integrante / Eliana Maria Beluzzo Dessen - Integrante / Esper Abrao Cavalheiro - Integrante / Mariz Vainzof - Integrante / Merari de Fátima Ramires Ferrari - Integrante / Oswaldo Keith Okamoto - Integrante / Ana Cristina Victorino Krepischi - Integrante / Carlos Frederico Martins Menck - Integrante / Débora Romeo Bertola - Integrante / Fernando Kok - Integrante / Luis Eduardo Soares Netto - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2012 - 2015

Meiotic Sex Chromosome Inactivation in Drosophila, Descrição: In several different taxa, there is indubitable evidence of transcriptional silencing of the X and Y chromosomes in male meiotic cells of spermatogenesis. However, the so called meiotic sex chromosome inactivation (MSCI) has been recently a hot bed for debate in Drosophila melanogaster. There are cytological and genetic observations, data from transgenic constructs with testis-specific promoters, global expression profiles obtained from mutant, wild-type, larvae and adult testes as well as from cells of different stages of spermatogenesis. There is no dispute on that D. melanogaster spermatogenesis presents a down-regulation of X chromosome that does not result from the lack of dosage compensation. However, the issue is currently focused on the level of reduction of X-linked expression, the precise time it occurs and how many genes are affected. The deep examination of data and experiments exposes the limitations intrinsic to the methods of studying MSCI in D. melanogaster. The current methods do not allow us to affirm anything else than the X chromosome down-regulation in meiosis (MSCI). Therefore, conclusion about level, degree or precise timing is inadequate. This project will implement new approaches to know the details of MSCI or other processes involved for D. melanogaster model.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (1) . , Integrantes: Maria Dulcetti Vibranovski - Coordenador., Financiador(es): The Pew Charitable Trusts - Auxílio financeiro.
2002 - 2006

Evolução e origem dos introns e do fenômeno de exon-shuffling, Descrição: A partir da descoberta dos introns na década de setenta, questões sobre sua origem vêm sendo discutidas (Gilbert 1978). Na verdade, as perguntas principais são: qual a função dos introns, quando e como eles surgiram e porque eles existem em eucariotos e não são encontrados em procariotos. Basicamente duas hipóteses existem para explicar a origem dos introns: "introns-early" e "introns-late". A primeira sugere que introns e exons formavam os primeiros genes e este tipo de organização estrutural permitiria e facilitaria a formação de novos genes através da troca de exons, fenômeno conhecido por "exon-shuffling". Já a hipótese "introns-late" assume que os introns foram adicionados somente em eucariotos e que o fenômeno de "exon-shuffling" surgiu recentemente (Li and Graur 2000). Cada uma destas hipóteses tem predições diferentes quanto a características dos introns e dos exons. Uma delas é a fase de introns, isto é, a posição em que estes estão localizados dentro de um códon. A versão mais simples da hipótese "introns-late" prevê a distribuição igual das fases dos introns devido à inserção aleatória destes em sequências contínuas. Segundo a hipótese "introns-early", se os introns já faziam parte da sequência de DNA dos primeiros genes atuando no processo de "exon-shuffling", espera-se que uma das fases de introns seja mais frequente: a troca de exons entre genes tem mais probabilidade de formar um proteína funcional se seus introns forem de mesma fase para que seja conservado o seu quadro de leitura (Li and Graur 2000; Long et al. 1995)... , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Maria Dulcetti Vibranovski - Integrante / Sandro Jose de Souza - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
2002 - 2006

Identificação e caracterização de um novo antígeno tumoral CTSP-1, Descrição: A necessidade de identificar novos antígenos tumorais, que possam ser utilizados no tratamento e diagnóstico do câncer, tem levado ao desenvolvimento de técnicas eficientes para essa finalidade. Antígenos de diferentes categorias foram identificados e caracterizados e, entre eles, os antígenos cancer-testis (CT) e os antígenos de diferenciação (CD) são os de maior importância clínica dado seu restrito padrão de expressão. Utilizando alinhamentos entre seqüências expressas e a seqüência do genoma humano, identificamos um novo gene localizado no cromossomo 21, denominado CTSP-1. Este gene apresenta alta similaridade com o antígeno tumoral NY-BR-1, o qual codifica um fator de transcrição tecido específico e é alvo potencial para imunoterapia de câncer. Para verificar se o gene CTSP-1 realmente corresponde a um novo antígeno tumoral, nós realizamos a completa caracterização do mesmo.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Maria Dulcetti Vibranovski - Integrante / Sandro Jose de Souza - Integrante / Rafael Bessa Parmigiani - Integrante / Anamaria A Camargo - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 3
2000 - 2002

Identificação de genes no cromossomo Y de Drosophila, Descrição: Muito poucos genes do cromossomo Y de Drosophila melanogaster foram identificados até o momento, diferentemente da grande quantidade de genes já conhecidos no restante do seu genoma. Contudo, sabe-se que este cromossomo possui seis fatores responsáveis pela fertilidade dos machos. Mesmo depois do sequenciamento, poucos genes haviam sido identificados (kl-2, kl-3, kl-5, PRY, Pp1-Y1, Pp1-Y2, PPr-Y, ORY, CCY). Oito destes genes foram identificados através de uma abordagem que usa as seqüências não mapeadas do genoma de Drosophila ("armU"), seqüências expressas em testículo e proteínas conhecidas, incluindo métodos computacionais e testes experimentais para procura de novos genes. Neste trabalho estendemos essa análise computacional às novas seqüências de proteínas e ESTs disponíveis, identificando três novos genes (EF-Y, ARY e L7RY). Além disso, esclarecemos uma questão importante sobre dois genes já descritos: comparações filogenéticas permitiram mostrar que as proteínas fosfatases catalíticas (Pp1-Y1, Pp1-Y2) resultaram de duas transposições independentes para o cromossomo Y, e não de uma duplicação ocorrida após a transposição. Além da identificação desses três novos genes, discutimos suas características (homologia, função e expressão) dentro do padrão já encontrado do restante do Y: um cromossomo com genes de função macho específica e homólogos a seqüências autossômicas. Posteriormente, expandimos nossas procuras a genes heterocromáticos em geral de Drosophila, usando principalmente as seqüências expressas (ESTs) em diversos órgãos e tecidos. Esses resultados demonstram a importação do uso da bioinformática para os estudos em genética, possibilitando neste caso a identificação, em seqüências já disponíveis, de genes novos em um cromossomo ainda tão desconhecido como o Y de Drosophila.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Maria Dulcetti Vibranovski - Integrante / Antonio Bernardo de Carvalho - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa., Número de produções C, T & A: 5
1996 - 2002

Genética e evolução da proporção sexual, Descrição: Em Drosophila mediopunctata e em algumas outras espécies desse gênero existe um caráter chamado sex ratio que acarreta na alteração da proporção sexual da prole (Gersheson, 1928; James & Jaenike, 1990; Carvalho et al., 1989). Machos portadores de determinado cromossomo X (chamado de SR) produzem proles com excesso de fêmeas devido a degeneração dos espermatozóides Y (impulso meiótico) (Policansky & Ellison, 1970; Hauschteck-Jungen & Maurer, 1976). Em Drosophila mediopunctata, os cromossomos SR possuem o arranjo gênico X:21 ou X:2 (Figura 1; Carvalho et al.,, 1989). Em populações naturais, em geral, estes cromossomos coexistem com cromossomos X "normais", chamados genericamente de "ST" (Standard). O cromossomo SR possui uma vantagem de transmissão em relação ao cromossomo ST: machos SR/Y produzem um proporção maior de espermatozóides SR, enquanto machos ST/Y produzem espermatozóides ST e Y em igual quantidade. Devido a essa vantagem de transmissão, não é difícil prever um rápido aumento do número de indivíduos portadores de SR e, consequentemente, da proporção de fêmeas na população. Por causa desse desvio da proporção sexual, teoricamente a população ou até a espécie pode se extinguir devido a ausência de machos (Figura 2) (Hamilton, 1967). Entretanto, Drosophila mediopunctata não é uma espécie extinta. A presença de supressores podem diminuir a vantagem do cromossomo SR. Nesta espécie (como em algumas outras) existem genes supressores no Y e nos autossomos (Carvalho e Klaczko, 1993; Carvalho e Klaczko, 1994; Stalker, 1961; Voelker, 1972). Machos SR/Y com genes supressores no Y ou nos autossomos produzem proles normais ( 50% de machos). Assim sendo, este conjunto de genes (SR e seus supressores) estão envolvidos em um importante fenômeno biológico: a evolução da proporção sexual.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Maria Dulcetti Vibranovski - Integrante / Suzana Casaccia Vaz - Integrante / Antonio Bernardo de Carvalho - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa., Número de produções C, T & A: 8

Prêmios

2015

Melhor trabalho na categoria "Evolução-Mestrado" da aluna Julia Beck Raices, IX Simpósio de Ecologia, Genética e Evolução de Drosophila.

2009

Grant award for the Evolution of Sex & Recombination: in theory & in practice ? Iowa City, IA, SMBE.

2006

Bolsa de Pos-doutorado no Exterior, CNPq.

2006

Bolsa de Pos-doutorado, Pew Latin American Fellows Program in the Biomedical Sciences.

2004

Bolsa estudos para o curso EMBO Phylogenetics Course - RJ, Brazil, European Molecular Biology Organisation (EMBO).

2003

Bolsa de estudos para o curso Bioinformatics International Course ICGEB/LNNC - RJ, Brazil, MEC.

2000

Menção Honrosa, Jornada de Iniciação Científica / UFRJ.

1997

Menção Honrosa, Jornada de Iniciação Científica / UFRJ.

Histórico profissional

Endereço profissional

Universidade de São Paulo, Instituto de Biociências. , Rua do Matao 277, Cidade Universitaria, 05508090 - São Paulo, SP - Brasil, Telefone: (11) 30910952, URL da Homepage:

Experiência profissional

2017 - Atual

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

Vínculo: , Enquadramento Funcional:

2012 - Atual

Universidade de São Paulo

Vínculo: , Enquadramento Funcional: Professor Doutor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

04/2016
Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Biociências, Departamento de Biologia.,Linhas de pesquisa
11/2014
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Biologia.,Cargo ou função, CCP de Ciências Biológicas (Biologia Genética).
08/2014
Ensino, Abi - Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, BIO0514 - Introdução a Programação de Computadores para Biologia
08/2013
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Biologia.,Cargo ou função, Titular a representação dos Professores Doutores junto ao Conselho do Departamento de Genética e Biologia Evolutiva.
03/2013
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Ciências Biomédicas.,Cargo ou função, Representante Titular do Departamento de Genética e Biologia Evolutiva do Instituto de Biologia na Comissão de Coordenação do Curso de Ciências Biomédicas.
08/2012
Ensino, Ciências Biomédicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bio0230 - Genetica e Evolucao

2011 - 2012

University of Chicago

Vínculo: University of Chicago, Enquadramento Funcional: Pesquisadora Associada, Carga horária: 40

2006 - 2011

University of Chicago

Vínculo: Pos-doutorado, Enquadramento Funcional: Pos-doutoramento, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

06/2008
Pesquisa e desenvolvimento, Department of Ecology and Evolution.,Linhas de pesquisa
06/2008
Pesquisa e desenvolvimento, Department of Ecology and Evolution.,Linhas de pesquisa
04/2006
Pesquisa e desenvolvimento, Department of Ecology and Evolution.,Linhas de pesquisa

2002 - 2005

Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer

Vínculo: Estudante, Enquadramento Funcional: Estudante, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

1996 - 2002

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Outro, Enquadramento Funcional: Estudante, Carga horária: 40

Atividades

08/2000 - 07/2002
Extensão universitária , Instituto de Biologia, Departamento de Genética.,Atividade de extensão realizada, Pós-graduação / Mestrado.
07/1996 - 07/2002
Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Biologia, Departamento de Genética.,Linhas de pesquisa
07/1996 - 07/2000
Estágios , Instituto de Biologia, Departamento de Genética.,Estágio realizado, Iniciação Científica no Laboratório de Genética de Populações de Drosophila.

1999 - 1999

Pennsylvania State University

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Outro, Carga horária: 40

Atividades

09/1999 - 12/1999
Estágios , Laboratory Animal Resources Program, Department Of Biology Dr Andrew Clark Laboratory.,Estágio realizado, Pesquisa sobre um marcador molecular do car[ater sex-ratio no cromossomo X de Drosophila mediopunctata sobre orienta;áo do Dr. Antonio Bernardo de Carvalho.

2022 - 2023

Arizona State University

Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professora Associada, Carga horária: 40

Propriedade Intelectual

Patentes (1)

Tipo	Título	Data depósito
INVENTOR	Antígeno de cncer de testículo ctsp	29/01/2007