Sabrina Thaise Amorim

Formação complementar

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Orientou

Produções bibliográficas

• MORALES, A. ; AMORIM, S.T. ; LIZANA, C. ; PULIDO, R. ; HANIGAN, M. D. ; COCKRUM, R. ; MOROTA, GOTA . Incorporating heterosis effects enhances genetic evaluations for milk production and functional traits in Chilean crossbred dairy cows. JOURNAL OF DAIRY SCIENCE , v. 108, p. 13565-13576, 2025.

• AMORIM, SABRINA T. ; RETALLICK, KELLI J. ; GARCIA, ANDRÉ ; IBAÑEZ'ESCRICHE, NOELIA ; MOROTA, GOTA . Genetic Heterogeneity of Residual Variance for Foot Score Traits in American Angus Cattle. JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS , v. 125, p. 1-11, 2025.

• MARINHO DE NEGREIROS, MARIA PAULA ; AMORIM, SABRINA THAISE ; LÔBO, RAYSILDO BARBOSA ; BRUNES, LUDMILLA COSTA ; MAGNABOSCO, CLAUDIO ULHOA ; BERGMANN, JOSÉ AURÉLIO GARCIA ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; CRAVO PEREIRA, ANGELICA SIMONE ; BALDI, FERNANDO . Genetic correlation estimates between calving ease in primiparous cows and economically important traits in Nellore cattle. JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS , v. 1, p. 1, 2024.

• SOARES, BYANKA B. ; BRUNES, LUDMILLA C. ; BALDI, FERNANDO SEBASTIAN ; CARMO, ADRIANA S. DO ; PEREIRA, LETÍCIA S. ; CARVALHO, RAFAEL A. ; NARCISO, MARCELO G. ; AMORIM, SABRINA T. ; SAINZ, ROBERTO DANIEL ; MAGNABOSCO, CLÁUDIO U. . Genetic parameters for visual scores, growth and carcass traits in Nellore Cattle. ANAIS DA ACADEMIA BRASILEIRA DE CIÊNCIAS , v. 96, p. 1, 2024.

• TEMP, LARISSA BORDIN ; BRUNES, LUDMILLA COSTA ; PEREIRA, LETÍCIA SILVA ; AMORIM, SABRINA THAISE ; MAGNABOSCO, CLÁUDIO ULHÔA ; LOBO, RAYSILDO BARBOSA ; DE BRITO, OVIDIO CARLOS ; VIACAVA, RICARDO ; BALDI, FERNANDO . Effect of genetic and sex effect on genomic prediction for horn development in Nellore cattle. Livestock Science , v. 284, p. 105478, 2024.

• BODMER, J.S. ; BELINE, M. ; YEN, C.N. ; WICKS, J.C. ; AMORIM, S.T. ; ROTH, E.C. ; BIASE, F.H. ; KOOHMARAIE, M. ; MATARNEH, S. ; SHI, T.H. ; SILVA, S.L. ; GERRARD, D.E. . In vitro proteolysis mirrors intact muscle maturation in beef carcasses. MEAT SCIENCE , v. 220, p. 109695, 2024.

• CARDONA'CIFUENTES, DANIEL ; NEIRA, JUAN DIEGO RODRIGUEZ ; ALBUQUERQUE, LUCIA G. ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; GONZALEZ'HERRERA, LUIS GABRIEL ; AMORIM, SABRINA THAISE ; LÓPEZ'CORREA, RODRIGO D. ; AGUILAR, IGNACIO ; BALDI, FERNANDO . Influence of variance component estimates on genomic predictions for growth and reproductive¿related traits in Nellore cattle. JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS , v. 00, p. 1-14, 2024.

• SILVA NETO, JOÃO B. ; MOTA, LUCIO F. M. ; AMORIM, SABRINA T. ; PERIPOLLI, ELISA ; BRITO, LUIZ F. ; MAGNABOSCO, CLAUDIO U. ; BALDI, FERNANDO . Genotype-by-environment interactions for feed efficiency traits in Nellore cattle based on bi-trait reaction norm models. GENETICS SELECTION EVOLUTION , v. 55, p. 1, 2023.

• AMORIM, S. T. ; TSUYUZAKI, K. ; NIKAIDO, I. ; MOROTA, G. . Improved MeSH analysis software tools for farm animals. Animal Genetics , v. 53, p. 171-172, 2022.

• KADLEC, R. ; INDEST, S. ; CASTRE, K. ; WAQAR, S. ; CAMPOS, L. M. ; AMORIM, S. T. ; BI, Y. ; HANIGAN, M. D. ; MOROTA, G. . Automated acquisition of top-view dairy cow depth image data using an RGB-D sensor camera.. Translational Animal Science , v. 6, p. 1-10, 2022.

• FEITOSA, F. L. B. ; PEREIRA, A. S. C. ; MUELLER, L. ; FONSECA, P. ; BRAZ, C. ; AMORIM, S. T. ; ESPIGOLAN, R. ; LEMOS, M. V. A. ; ALBUQUERQUE, L. G. ; SCHENKEL, F. ; BRITO, L. ; STAFUZZA, N. B. ; BALDI, F. . Genome-wide association study for beef fatty acid profile using haplotypes in Nellore cattle  . Livestock Science , v. 104396, p. 1-12, 2021.

• BERTON, M. P. ; LEMOS, M. ; CHUD, T. ; STAFUZZA, N. B. ; KLUSKA, S. ; AMORIM, S. T. ; LOPES, L. S. F. ; PEREIRA, A. S. C. ; BICKHART, D. ; LIU, G. ; ALBUQUERQUE, L. G. ; BALDI, FERNANDO . Genome-wide association study between copy number variation regions and carcass and meat quality traits in Nellore cattle. Animal Production Science , v. 61, p. 731-744, 2021.

• AMORIM, S. T. ; STAFUZZA, NEDENIA BONVINO ; KLUSKA, S. ; PERIPOLLI, E. ; PEREIRA, A. S. C. ; MUELLER, L. ; ALBUQUERQUE, L. G. ; BALDI, F. . Genome-Wide Interaction Study reveals Epistatic Interactions for beef lipid-related traits in Nellore Cattle. Animal Genetics , v. 1, p. 1-14, 2021.

• TONUSSI, RAFAEL LARA ; LONDOÑO-GIL, MARISOL ; DE OLIVEIRA SILVA, RAFAEL MEDEIROS ; MAGALHÃES, ANA FABRÍCIA BRAGA ; AMORIM, SABRINA THAISE ; KLUSKA, SABRINA ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; PERIPOLLI, ELISA ; PEREIRA, ANGELICA SIMONE CRAVO ; LÔBO, RAYSILDO BARBOSA ; AGUILAR, IGNÁCIO ; LOURENÇO, DANIELA ANDRESSA LINO ; BALDI, FERNANDO . Accuracy of genomic breeding values and predictive ability for postweaning liveweight and age at first calving in a Nellore cattle population with missing sire information. TROPICAL ANIMAL HEALTH AND PRODUCTION , v. 53, p. 1-10, 2021.

• AMORIM, S. T. ; YU, H. ; MOMEN, M. ; ALBUQUERQUE, L. G. ; PEREIRA, A. S. C. ; BALDI, F. ; MOROTA, G. . An assessment of genomic connectedness measures in Nellore cattle. JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE , v. 98, p. 1-12, 2020.

• STIVANIN, T. ; MAIA, F. M. C. ; MIGLIORINI, E. ; KLUSKA, S. ; AMORIM, S. T. ; LOVATTO, F. S. ; MARTINS, E. N. . Evaluation of selection criteria in laying quails (Coturnix coturnix japonica). Livestock Research for Rural Development , v. 31, p. 1/142-12, 2019.

• PERIPOLLI, E. ; STAFUZZA, N. B. ; AMORIM, S. T. ; LEMOS, M. V. A. ; GRIGOLETTO, L. ; KLUSKA, S. ; FERRAZ, J. B. S. ; ELER, J. P. ; MATTOS, E. C. ; BALDI, FERNANDO . Genome-wide scan for runs of homozygosity in composite Montana Tropical® beef cattle. JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS , v. 00, p. 1-11, 2019.

• FEITOSA, F. L. B. ; PEREIRA, A. S. C. ; AMORIM, S. T. ; PERIPOLLI, E. ; SILVA, R. M. O. ; URBANO, C. ; FERRINHO, A. M. ; SCHENKEL, F. ; BRITO, L. F. ; ESPIGOLAN, R. ; ALBUQUERQUE, L. G. ; BALDI, F. . Comparison between haplotype-based and individual SNP-based genomic predictions for beef fatty acid profile in Nelore cattle'. JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS , v. 24, p. 1-9, 2019.

• AMORIM, S. T. ; KLUSKA, S. ; BERTON, M. P. ; LEMOS, M. V. A. ; PERIPOLLI, E. ; STAFUZZA, N. B. ; MARTIN, J. F. ; ALVAREZ, M. S. ; GAVINA, B. V. ; TORO, M. A. ; BANCHERO, G. ; OLIVEIRA, P. S. ; GRIGOLETTO, L. ; ELER, J. P. ; BALDI, F. ; FERRAZ, J. B. S. . Genomic study for maternal related traits in Santa Inês sheep breed. Livestock Science , v. 217, p. 76-84, 2018.

• BONAMY, M. ; KLUSKA, S. ; PERIPOLLI, E. ; LEMOS, M. V. A. ; AMORIM, S. T. ; VACA, R. J. ; LOBO, R. B. ; CASTRO, L. M. ; FARIA, C. U. ; FERRARI, F. B. ; BALDI, F. . Genetic association between different criteria to define sexual precocious heifers with growth, carcass, reproductive, and feed efficiency indicator traits in Nellore cattle using genomic information.. JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS , v. 136, p. 15-22, 2018.

• AMORIM, S. T. ; ELER, J. P. ; MATOS, E. ; GRIGOLETO, L. ; LEMOS, M. V. A. ; BALDI, F. ; FERRAZ, J. B. S. . Genome wide association study (GWAS) for body weight traits in Santa Inês sheep breed. In: World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, 2018, Auckland. Proceedings of the World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Volume Genetic gain - In Challenging Environments, 2018. v. 11. p. 708-708.

• BERTON, M. ; AMORIM, S. T. ; KLUSKA, S. ; LEMOS, M. V. A. ; OLIVIERI, B. ; TONUSSI, R. ; PERIPOLLI, E. ; ELER, J. P. ; BALDI, F. ; FERRAZ, J. B. S. . Genetic parameters and genome wide association study (GWAS) for maternal related traits in Santa Inês sheep breed. In: World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, 2018, Auckland. Proceedings of the World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Volume Electronic Poster Session - Species - Ovine,, 2018. v. 11. p. 826-826.

• Machado, Djonatan ; MALLMANN, D. H. ; Erpen, J.G. ; AMORIM, S. T. ; Selig, P.M. ; MARIAN, P. ; OLIVEIRA, P.P. ; HOSRTMANN, R. . Knowledge Intensive Livestock: Knowledge Management Maturity Model applied on Dairy Farming in Santa Catarina. In: 54ª Reunião Anual da SBZ, 2017, Foz do Iguaçu. A NEW VIEW OF ANIMAL SCIENCE: CHALLENGES AND PERSPECTIVES, 2017.

• LEITE, A. A. ; AMORIM, S. T. ; ROSA, V. L. ; LEMES, M. ; FRANCISCO, L. ; HAUPTLI, L. ; IRGANG, R. ; LIMA, A. L. F. . Exon IV Polymorphism of Prolactin gene on ?Crioulo Lageano? Cattle. In: 54ª Reunião Anual da SBZ, 2017, Foz do Iguaçu. A NEW VIEW OF ANIMAL SCIENCE: CHALLENGES AND PERSPECTIVES, 2017.

• AMORIM, S. T. ; LEITE, A. A. ; LEMES, M. ; FRANCISCO, L. ; CHIARELLI, A. C. ; PEREIRA, M. C. ; DALHKE, F. ; LIMA, A. L. F. . Genetic monomorphism of Insulin-like Growth Hormone on ?Crioulo Lageano? cattle (Bos taurus). In: 54ª Reunião Anual da SBZ, 2017, Foz do Iguaçu. A NEW VIEW OF ANIMAL SCIENCE: CHALLENGES AND PERSPECTIVES, 2017.

• ROSA, V. L. ; AMORIM, S. T. ; CHIARELLI, A. C. ; LEITE, A. A. ; CARVALHO, S. R. S. T. ; QUADROS, S. A. F. ; OLIVEIRA, P.P. ; LIMA, A. L. F. . Identification of polymorphisms on the IGF-I gene in ?Crioulo Lageano? cattle (Bos taurus). In: 54ª Reunião Anual da SBZ, 2017, Foz do Iguaçu. A NEW VIEW OF ANIMAL SCIENCE: CHALLENGES AND PERSPECTIVES, 2017.

• DALHKE, F. ; DAHMER, A. P. ; OLIVEIRA, P.P. ; AMORIM, S. T. ; HAUPTLI, L. ; LIMA, A. L. F. . Evaluate of the influence of astaxanthin inclusion in feed for quails (Cuturnix cuturnix japonica) on performance and egg quality traits. In: 54ª Reunião Anual da SBZ, 2017, Foz do Iguaçu. a, 2017.

• OLIVEIRA, R. N. ; Machado, Djonatan ; PEREIRA, M. C. ; CORREA JUNIOR, A. C. ; AMORIM, S. T. ; CARVALHO, S. R. S. T. ; QUADROS, S. A. F. ; LIMA, A. L. F. . Association between productive performance and gastrointestinal nematodes infection in Ile de France lambs. In: 54ª Reunião Anual da SBZ, 2017, Foz do Iguaçu. A NEW VIEW OF ANIMAL SCIENCE: CHALLENGES AND PERSPECTIVES, 2017.

• WAGNER, B. ; AMORIM, S. T. ; PEREIRA, T. C. ; IRGANG, R. ; LIMA, A. L. F. ; PEREIRA, M. C. ; QUADROS, S. A. F. ; CARVALHO, S. R. S. T. . Beef consumers preferences: an approach on the cities of Florianópolis-SC and Botucatu-SP. In: 54ª Reunião Anual da SBZ, 2017, Foz do Iguaçu. A NEW VIEW OF ANIMAL SCIENCE: CHALLENGES AND PERSPECTIVES, 2017.

• XAVIER, A. C. ; Machado, Djonatan ; AMORIM, S. T. ; TAVARES, S. ; IRGANG, R. ; HAUPTLI, L. . Efficiency of the questionnaire application ?Classic Swine Fever Situation in terms of risks by municipality in Santa Catarina. In: 54ª Reunião Anual da SBZ, 2017, Foz do Iguaçu. A NEW VIEW OF ANIMAL SCIENCE: CHALLENGES AND PERSPECTIVES, 2017.

• AMORIM, S. T. ; LIMA, A. L. F. ; LEMES, M. ; IRGANG, R. ; PEREIRA, M. C. ; CHIARELLI, A. C. . 'Eficiência na conversão alimentar em suínos: Associação de alelos favoráveis com a modelagem nutricional'.. In: Seminário de Iniciação Científica, 2017, Florianópolis. Seminário de Iniciação Científica 2017, 2017.

• AMORIM, S. T. ; LIMA, A. L. F. ; BENTO, L. L. ; LEITE, A. A. ; PEREIRA, T. C. ; PACHECO, L. ; PEREIRA, M. C. ; IRGANG, R. . Isolamento e aplicação de PCR-RFLP na região correspondente ao Éxon-II do gene do hormônio grelina de reprodutores suínos. In: Semana de Iniciação Científica - UFSC, 2015, FLORIANOPOLIS. 25° Seminário de Iniciação Científica da UFSC, 2015.

• AMORIM, S.T. ; STAFUZZA, NEDENIA BONVINO ; CARDONA'CIFUENTES, DANIEL ; MORAES, J. G. N. ; REIS, B. R. ; MESSMANN, R. ; CAMARIPANO, L. ; BALDI, FERNANDO . Genomic Study for Pregnancy Loss in Brahman Cattle. JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE , 2025.

• AMORIM, S. T. . Implementation of Medical Subject Headings (MeSH) analysis in farm animals.. 2022. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• AMORIM, S. T. . Collaborative Innovation. 2022. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• AMORIM, S. T. ; YU, H. ; BALDI, F. ; MOROTA, G. . Genomic connectedness in Nellore beef cattle. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• AMORIM, S. T. ; ELER, J. P. ; GRIGOLETO, L. ; LEMOS, M. V. A. ; BALDI, F. ; FERRAZ, J. B. S. . Genome wide association study (GWAS) for body weight traits in Santa Ines sheep breed. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• AMORIM, S. T. ; LIMA, A. L. F. ; LEMES, M. ; IRGANG, R. ; PEREIRA, M. C. ; CHIARELLI, A. C. . 'Eficiência na conversão alimentar em suínos: Associação de alelos favoráveis com a modelagem nutricional'.. 2017. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• AMORIM, S. T. . Genetic monomorphism of Insulin-like Growth Hormone on Crioulo Lageano cattle (Bos taurus).. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• ROSA, V. L. ; AMORIM, S. T. . Identification of polymorphisms on the IGF-I gene in Crioulo Lageano cattle (Bos taurus).. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SMILNAK, D. ; AMORIM, S.T. ; POWELL, J. ; MULLINS, E. ; SCHERER, H. . Agricultural Cyberbiosecurity: Biotechnology 2023 (Extensão).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2024 - Atual

  Understanding the genetic basis of variation among functional terms and gene products in cattle, Descrição: Understanding the genetic factors behind complex traits in livestock production is a major focus in animal genetics. Researchers use techniques such as whole-genome scans and gene expression studies to identify genes linked to important traits in livestock species. These studies often result in long lists of genes that may influence these traits. The challenge is interpreting how these genes contribute to the underlying biological processes. The gene lists are typically analyzed by exploring the biological functions and biochemical pathways associated with the selected genes. A common approach for such analysis is called overrepresentation analysis (ORA), which evaluates whether certain annotations, such as specific functions or pathways, appear more frequently in the selected group of genes than would be expected by chance in a background or reference set of genes (Dr#462;ghici et al., 2003). ORA provides valuable insights by highlighting pathways or functions that may be crucial in expressing complex traits. Recently, the Medical Subject Headings (MeSH) system, a comprehensive vocabulary for life sciences, has gained attention in overrepresentation analysis (ORA). MeSH includes over 25,000 clinical and biological terms used to categorize articles in the MEDLINE database. Unlike traditional approaches, which link functions directly to genes, MeSH assigns terms to literature, offering a broader gene coverage than conventional approaches, making it an increasingly useful tool for biological research.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Sabrina Thaise Amorim - Coordenador / Fernando Baldi - Integrante / Jackson Hartman - Integrante.

• 2021 - Atual

  Computer vision systems for data-driven monitoring in Animal Sciences, Descrição: Live body weight and body condition scores are essential markers of animal development and health in the beef cattle sector, helping producers to make better management decisions. Sensing technologies are used in precision livestock farming to capture morphometric changes in animal growth and body composition dynamics. This cutting-edge technology boosts output while also assuring long-term viability and welfare. Computer vision technologies, in particular, are critical for speeding up phenotyping efforts by providing non-intrusive structural assessments of animals with high temporal and spatial resolution. In this sense, our goal is to create a computer vision system that uses depth sensor cameras to automatically estimate body weight and evaluate body condition scores of beef cattle. Deep neural networks will be used once sufficient training data are collected. We expect that a depth sensor camera-based phenotyping can be used to collect data more frequently than before and enhance beef production efficiency by promoting precision livestock farming.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Sabrina Thaise Amorim - Integrante / Gota Morota - Coordenador / Ye Bi - Integrante / Chun-Peng James Chen - Integrante.

• 2019 - Atual

  An assessment of the relationship between genomic connectedness and prediction accuracy for fat composition traits in Nellore beef cattle, Descrição: Genetic connectedness assesses the extent to which estimated breeding values can be fairly compared across management units. Connectedness in genetic evaluation is important if management units differ in their genetic mean. The concept of genetic connectedness in the whole-genome prediction era can be extended to measure the connectedness level between the reference and validation sets. In genomic prediction (GP), several statistical models address additive and non-additive effects parametrically and nonparametrically. When non-additive genetic variation is accounted, it can be used to predict total genetic values, to increase the efficiency of mate allocation procedures as well as crossbreeding or purebred selection schemes. However, the relationship between the estimated level of connectedness and prediction accuracies in the presence of non-additive genetic variation is less well understood and little is known about the impact of non-additive gene action on genomic connectedness measures. Despite the recent achievements in GP, there is still a drastic shortage of non- additive gene action studies in cattle breeds. The objective of this study is to investigate the relationship between genomic connectedness and prediction accuracy from additive and non- additive gene actions for fat composition traits in Nellore cattle. For fatty acid profile, data from 943 Nellore male animals from farms that integrate DeltaGen, CRV PAINT, and Nelore Qualitas breeding programs, the Thematic Project (FAPESP Process: 2009 / 16118-5), and the Young Researcher Project (FAPESP Process: 2011 / 21241-0) will be used. The fatty acid profile was analyzed in Longissimus thoracis samples using gas chromatography, and capillary column of 100m. Animals were genotyped using the BovineHD BeadChip (High- Density Bovine BeadChip) Illumina® with 777,000 SNPs. The data set for fat composition traits encompasses records from 66,496 females and their relatives, totaling 176,069 phenotypic records for growth, carcass, reproductive, and feed efficiency indicator traits. The pedigree contained information from 244,254 animals, born between 1977 and 2016. A total of 8,652 animals were genotyped with the low-density panel (CLARIFIDE® Nellore 2.0). Genotypes were imputed to a panel containing 735,044 markers using the FIMPUTE 2.2 software. We will assess genome-based connectedness across management units by applying prediction error variance of difference and coefficient of determination. The present project provides a unique opportunity to characterize non-additive gene actions associated with fat composition traits in Nellore cattle. Given that connectedness and prediction accuracies have important influences on genomic selection, this project will be of interest to wider community members including academics and industry professionals. Processo FAPESP: 2019/04929-0.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Sabrina Thaise Amorim - Integrante / Fernando Baldi - Integrante / Gota Morota - Coordenador / Haipeng Yu - Integrante / Mehdi Momem - Integrante.

• 2016 - 2017

  Eficiência na conversão alimentar em suínos: Associação de alelos favoráveis com a modelagem nutricional., Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Sabrina Thaise Amorim - Integrante / André Luis Ferreira Lima - Integrante / armando albertazzi gonçalves júnior - Coordenador.

• 2016 - Atual

  Grupo de Pesquisa em Produção Animal, Descrição: Nomes de Linha de Pesquisa: - Exigências Nutricionais - Ambiência e Bem-estar animal - Análise e Avaliação de Alimentos - Análise Genômica e Melhoramento Genético Animal - Ciência e Tecnologia de Produtos de Origem Animal - Ciências Agrárias e Zootecnia - Manejo de animais de interesse zootécnico dgp.cnpq.br/dgp/espelhogrupo/8347190925552631. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (7) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sabrina Thaise Amorim - Integrante / André Luis Ferreira Lima - Integrante / Tuanne Capella Pereira - Integrante / Márcio Cinachi Pereira - Integrante / Renato Irgang - Integrante / Djonatan Machado - Integrante / Andriele Andrade Leite - Integrante / Milena Lemes - Integrante / Larissa Francisco - Integrante / Lucélia Hauptli - Coordenador / Aline Cristofolini Chiarelli - Integrante / Fabiano Dalhke - Integrante / Sandra Regina Souza Teixeira de Carvalho - Integrante / Sérgio Augusto Ferreira de Quadros - Integrante / Rafaela Nunes de Oliveira - Integrante / Milene Puntel Osmari - Integrante / Priscila de Oliveira Moraes - Integrante / Alexandre Maciel Vieira - Integrante / Elizabeth Machado Candido - Integrante / Thaylú Figueredo Cascaes - Integrante.

• 2016 - Atual

  Análise das variações no número de cópias no genoma e suas associações com características quantitativas, qualitativas e perfil de ácidos graxos da carne em bovinos Nelore, Descrição: Em função do limitado número de estudos sobre características quantitativas, qualitativas, perfil de ácidos graxos da carne e a saúde humana, o desenvolvimento de trabalhos que utilizam informações genômica visando melhorar tais características em bovinos da raça Nelore torna-se primordial. O objetivo do presente projeto é identificar e validar regiões no genoma de bovinos da raça Nelore que apresentam variações no número de cópias (CNV: Copy Number Variation) e associar estes CNV com características qualitativas, quantitativas e perfil de ácidos graxos da carne. Os objetivos específicos são: 1. Identificar regiões do genôma que apresentam variações no número de cópias a partir das informações genômicas obtidas no BovineSNP BeadChip (High-Density Bovine BeadChip); 2. Quantificar a frequência e distribuição do número de cópias no genôma de bovinos da raça Nelore; 3. Utilizar PCR em tempo real quantitativa (qPCR) para validar 10 CNVs; 4. Estudar a associação genética entre os CNVs com as características estudadas. Serão utilizados aproximadamente, entre 1500 a 1700 animais machos da raça Nelore terminados em confinamento (mínimo 90 dias) com idade em torno de dois anos de idade... , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Sabrina Thaise Amorim - Integrante / Fernando Baldi - Coordenador / Elisa Peripolli - Integrante / Fabio Pablos Souza - Integrante / Arione Augusti Boligon - Integrante / Nedênia Bonvino Stafuzza - Integrante / Daniele Fernanda Revoredo Jovino - Integrante / Larissa Simielli - Integrante / Fabieli Loise Braga Feitosa - Integrante / Bianca Ferreira Olivieri - Integrante / Marcos Vinícius Antunes de Lemos - Integrante / Hermenegildo Lucas Justino Chiaia - Integrante / Mariana Piatto Berton - Integrante / Rafael Lara Tonussi - Integrante / Rafael Medeiros de Oliveira Silva - Integrante.

• 2016 - Atual

  Avalição genômica em populações comerciais de bovinos de corte utilizando dados reais e simulados, Descrição: O objetivo deste projeto é avaliar o impacto da aplicação de informações genômicas em situações de incerteza de paternidade e diferentes estratégias de genotipagem sobre as avaliações genéticas em rebanhos de bovinos de corte utilizando dados reais e simulados. Como objetivos específicos este projeto pretende: 1) Avaliar a aplicação dos métodos BLUP e do ssGBLUP em populações comerciais de bovinos de corte com diferentes estruturas populacionais e diferentes estratégias de genotipagem, usando dados simulados e dados reais; 2) Avaliar diferentes estratégias para escalar a matriz genômica de parentesco em situações com incerteza de paternidade. Neste estudo, um rebanho bovino comercial será simulado considerando diferente proporção de animais jovens genotipados com touros e avôs maternos desconhecidos. Além disso, uma população de bovinos de corte pertencentes a um programa de melhoramento com registros fenotípicos, pedigree completo e informação genômica será simulada. A ideia principal é através dos animais jovens genotipados estabelecer ligações genéticas de forma mais rápida com as informações genômicas (matriz G) entre a população de gado de corte comercial e a população programa de melhoramento. Para avaliar a aplicação dos métodos BLUP e ssGBLUP (single step genomic BLUP) em populações comerciais de bovinos de corte (PCBC) com diferentes estruturas populacionais e diferentes estratégias de genotipagem será criada uma matriz A com diferentes proporções de animais jovens (bezerros) com touros desconhecidos (25, 50 e 75%) e matrizes com pais desconhecidos (0, 25, 50, 75 e 100%). Nesta população, os bezerros das ultimas 3 gerações serão genotipados numa proporção de 25, 50, 75 e 100% dos animais. A simulação será executada para dois características, uma de baixa herdabilidade (0,12) como stayability (STAY), e outra de herdabilidade moderada (0,34), como peso ao sobreano (PS). Para o estudo com os dados reais, serão utilizados registros para as características STAY e PS de animais da raça Nelore, pertencentes ao programa de Melhoramento Genético da Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP), programa Nelore Brasil. Serão utilizadas informações de 18 fazendas localizadas nas regiões Sudeste, Centro-oeste e Norte do Brasil, e que integram o programa de melhoramento genético Nelore Brasil (Nelore). Os resultados do presente projeto irão permitir: 1) Avaliar o impacto do uso da informação genômica em rebanhos de gado de corte comerciais com diferentes estruturas populacionais; 2) Verificar a proporção de animais genotipados jovens necessárias para obter avaliações genéticas confiáveis em rebanhos bovinos de corte comerciais; 3) Avaliar a viabilidade técnica e econômica das avaliações genômicas usando o ssGBLUP em rebanhos bovinos de corte comerciais; 4) Formar e consolidar uma equipe de trabalho no âmbito nacional e internacional, constituído por diferentes especialistas de reconhecida trajetória, esta equipe deverá formar uma plataforma sólida para a concreção de futuros projetos de pesquisa; 5) Implementar metodologias estatísticas para a utilização de dados genômicos no melhoramento animal... , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Sabrina Thaise Amorim - Integrante / Marcos Vinicius Antunes Lemos - Integrante / Fernando Baldi - Coordenador / Elisa Peripolli - Integrante / Henrique Nunes de Oliveira - Integrante / Angélica Simone Cravo Pereira - Integrante / Fabieli Loise Braga Feitosa - Integrante / Bianca Ferreira Olivieri - Integrante / Hermenegildo Lucas Justino Chiaia - Integrante / Mariana Piatto Berton - Integrante / Rafael Lara Tonussi - Integrante / Rafael Medeiros de Oliveira Silva - Integrante / Danísio Prado Munari - Integrante / Claudio Magnabosco - Integrante / Ignacio Aguilar - Integrante / Carina U. Faria - Integrante / Luiz Antônio Bezerra - Integrante / Washington Olivato - Integrante / Luis Gustavo Figuereido - Integrante / Raysildo Barbosa Lôbo - Integrante / Daniela Andressa Lino Lourenço - Integrante / Breno O. Fragomeni - Integrante / Jason Osterstock - Integrante / Fernando Di Croce - Integrante.

• 2015 - 2017

  Raça bovina Crioula Lageana no ambiente dos campos de altitude de Santa Catarina, Descrição: Dentre os diferentes recursos genéticos disponíveis, o Brasil possui algumas raças de animais domésticos que se desenvolveram a partir de raças trazidas pelos colonizadores portugueses e espanhóis durante a ocupação territorial do novo continente. Estes animais sofreram seleção natural por vários séculos e adquiriram resistência as mais diversas condições ambientais, calor extremo, terrenos alagadiços, frio,escassez alimentar, restrição a água etc. Dentre essas raças destaca-se a raça Crioula Lageana, que possui características únicas de adaptação à região mais fria do Brasil, situado no Planalto Catarinense. A conservação da diversidade genética das raças crioulas torna-se de extrema importância para que se promova o acesso a genes desejáveis e complexos gênicos que possam contribuir para o estoque futuro de alimentos. A caracterização genética e fenotípica de raças naturalizadas poderão oferecer informações valiosas para a tomada de decisões adequadas, visando a melhoria e desenvolvimento de programas de melhoramento genético e de conservação, e consequentemente, o incremento da produtividade da bovinocultura estadual e nacional. Desse modo, é de grande importância a iniciativa em promover e desenvolver pesquisas que tenha como alvo de estudo a Raça Crioula Lageana com o objetivo de se obter mais informações fenotípicas e genéticas para ampliar o conhecimento e melhorar o gerenciamento deste valioso patrimônio genético adaptado às condições de Santa Catarina. Assim, o objetivo deste projeto é produzir informações científicas a respeito da raça Crioula Lageana com o intuito de ampliar os conhecimentos sobre essa raça de bovino naturalizada no Planalto Catarinense, bem como fornecer subsídios para um eficiente programa de melhoramento genético e de conservação, com auxílio da seleção assistida por marcadores moleculares. O projeto será desenvolvido entre a Universidade Federal de Santa Catarina, Universidade do Estado de Santa Catarina e a Associação Brasileira de Criadores de Crioula Lageana para que sejam visitadas e coletadas as informações dos principais criadores da raça, de modo a gerar um banco de dados representativo. Serão coletados dados de genealogia, medidas fenotípicas para características de crescimento, reprodutivas e de qualidade da carcaça medidas por ultrassonografia, bem como outras características de interesse dos criadores. Além disso, serão realizadas análises moleculares, de qualidade de carne, parasitológicas e caracterização dos sistemas de criação dos bovinos da raça Crioula Lageana em Santa Catarina.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Sabrina Thaise Amorim - Integrante / André Luis Ferreira Lima - Integrante / Andrielle Andrade Leite - Integrante / Márcio Cinachi Pereira - Coordenador / Sandra Regina Souza Teixeira de Carvalho - Integrante / Sérgio Augusto Ferreira de Quadros - Integrante.

• 2015 - 2015

  Study of the genetic variability of meat fatty acid profile in Nelore cattle finished in feedlot, Descrição: Despite the major advances in genetic molecular techniques that allow the genotyping of hundreds of animals in less time and in an automated fashion, there are still being developed methodologies that allow the incorporation of genomic information in animal breeding programs. The objective of this project is to study the genetic variability of meat fatty acid profile in Nelore cattle finished in feedlot conditions, and implement models and methods that use genomic information to improve the fatty acid composition of beef meat. To attain this objective we propose the following specific objectives: 1) Study and characterize the profile of meat fatty acids of Nelore cattle finished in feedlot 2) Estimate genetic parameters for meat fatty acid composition in Nelore cattle finished in feedlot 3) Implement genome wide association studies between single nucleotide polymorphisms markers (SNPs) with meat fatty acid composition 4) Predict the genomic breeding values for meat fatty acid profile considering different models 5) Verified the expression patterns of genes involved in lipid metabolism and fatty acid synthesis... , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Sabrina Thaise Amorim - Integrante / Fernando Baldi - Coordenador / Elisa Peripolli - Integrante / Henrique Nunes de Oliveira - Integrante / Roberto Carvalheiro - Integrante / Fabio Pablos Souza - Integrante / Arione Augusti Boligon - Integrante / Guilherme Costa Venturini - Integrante / Guilherme J. M. Rosa - Integrante / Angélica Simone Cravo Pereira - Integrante / Lucia Galvão de Albuquerque - Integrante / Humberto Tonhati - Integrante.

Prêmios