Jefferson Gonçalves Pinheiro Silva

Formação complementar

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Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em eventos

Orientou

Produções bibliográficas

• SANTOS-OLIVEIRA, PEDRO HENRIQUE ; SILVA, JEFFERSON GONÇALVES PINHEIRO ; BLANK, LARS MATHIAS ; SILVA, LUIZIANA FERREIRA ; GOMEZ, JOSÉ GREGÓRIO CABRERA . Constant fed-batch cultivation with glucose and propionate as co-substrate: A strategy to fine-tune polyhydroxyalkanoates monomeric composition in Pseudomonas spp.. INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES , v. 256, p. 128287, 2024.

• OLIVEIRA-FILHO, EDMAR R. ; SILVA, JEFFERSON G. P. ; DE MACEDO, MATHEUS ARJONA ; TACIRO, MARILDA K. ; GOMEZ, JOSÉ GREGÓRIO C. ; SILVA, LUIZIANA F. . Investigating Nutrient Limitation Role on Improvement of Growth and Poly(3-Hydroxybutyrate) Accumulation by Burkholderia sacchari LMG 19450 From Xylose as the Sole Carbon Source. FRONTIERS IN BIOENGINEERING AND BIOTECHNOLOGY , v. 7, p. 416, 2020.

• Silva, JGP . O Fantástico Mundo Microbiológico. 1. ed. São Paulo: Jefferson Gonçalves Pinheiro Silva, 2023. v. 1. 60p .

• SILVA, J. G. P. . Microbiologia para técnicos. 1. ed. São Paulo: Jefferson Gonçalves, 2023. v. 3. 96p .

• SILVA, J. G. P. . 46 questões comentadas sobre Biologia celular e microbiologia. 1. ed. São Paulo: Jefferson Gonçalves, 2023. v. 1. 62p .

• Silva, JGP . ?O FANTÁSTICO MUNDO MICROBIOLÓGICO?: LIVRO DE JEFFERSON GONÇALVES PINHEIRO SILVA CONECTA SABERES CIENTÍFICOS E COTIDIANO. Jornal Nota, 16 jul. 2025.

• Silva, JGP . Workshop Nanobactérias. 2025. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• Silva, JGP . Reconstrução de redes metabólicas- Curso de inverno em Microbiologia e Biologia celular. 2023. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Silva, JGP . Reconstrução de redes metabólicas e a área da saúde. 2023. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• SILVA, J. G. P. . Estudo em biorreator e análise de fluxos metabólicos em cepas recombinantes de Burkholderia sacchari na conversão de xilose e hexanoato em copolímero poli-3-hidroxibutirato-co-3-hidroxihexanoato. 2019. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• OLIVEIRA FILHO, E. R. ; SILVA, J. G. P. ; TACIRO, M. K. ; GUAMAN, L. P. ; GOMEZ, J. G. C. ; SILVA, L. F. . Engineering Burkholderia sacchari to improve PHA production from biomass. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SILVA, J. G. P. . A Methodological Approach to Assess the Quality of Bacterial Genomes 2023 (REVIEW PROPOSAL).

• SILVA, J. G. P. . In silico ANALYSIS ON ANTIBIOTIC RESISTANCE AND VIRULENCE FACTORS IN Burkholderia sacchari 2023 (ORIGINAL RESEARCH PROPOSAL).

• SILVA, J. G. P. . GENOMIC-SCALE RECONSTRUCTION OF THE METABOLIC NETWORK IN Burkholderia sacchari TO EXPAND ITS BIOTECHNOLOGICAL APPLICATIONS 2023 (ORIGINAL RESEARCH PROPOSAL).

• SILVA, J. G. P. . INCONSISTENCIES IN BIOREACTOR ASSAYS OF A NON-MODEL STRAIN AND THEIR IMPACTS ON THE STUDY AND DEVELOPMENT OF BIOMOLECULES 2023 (REVIEW PROPOSAL).

• SILVA, J. G. P. . NON-MODEL BACTERIUM FOR METABOLIC NETWORK RECONSTRUCTION: CHALLENGES AND OPPORTUNITIES 2023 (REVIEW PROPOSAL).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2020 - Atual

  AVALIAÇÃO DE DADOS GENÔMICOS E ENZIMÁTICOS PARA SUBSIDIAR A RECONSTRUÇÃO DA REDE METABÓLICA DE Burkholderia sacchari, Descrição: O impacto ambiental de produtos provenientes do petróleo, como os plásticos, têm levado ao desenvolvimento de materiais similares que sejam ambientalmente corretos. Uma alternativa são os polihidroxialcanoatos (PHA), uma família de poliésteres termoplásticos ou elastoméricos, biodegradáveis e biocompatíveis, acumulados por algumas bactérias.Cerca de 50% dos custos de produção de PHA são provenientes da matéria-prima, nesse sentido, utilizar resíduos agroindustriais tende a reduzir custos do processo. A xilose pode ser obtida a partir do bagaço da cana, resíduo agroindustrial altamente disponível no Brasil. A bactéria Burkholderia sacchari possui a capacidade de produzir até 60% da biomassa celular na forma de PHA a partir do fornecimento de xilose como fonte de carbono. Estudos recentes indicaram que ainda há espaço para explorar o acúmulo de PHA em Burkholderia sacchari a partir do fornecimento de xilose como fonte de carbono. Nos últimos anos, pesquisas têm se concentrado na otimização da produção de PHA em B. sacchari. A otimização na produção de PHA pode ser obtida a partir do melhor conhecimento do metabolismo do microrganismo, que pode resultar desde ajustes experimentais até manipulações genéticas. O melhor estudo do metabolismo pode ser obtido através reconstrução de redes metabólicas baseadas em anotação do genoma, refinamento da rede, dados experimentais em cultivo contínuo e adição de informações como a dependência de enzimas chaves na síntese de PHA por cofatores NADH ou NADPH. Neste contexto, esta proposta de doutorado, com o auxílio de ferramentas multiômicas (genômica, proteômica e metabolômica) realizará a reconstrução da rede metabólica de B. sacchari frente ao fornecimento de xilose.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Jefferson Gonçalves Pinheiro Silva - Integrante / LUIZIANA FERREIRA DA SILVA - Coordenador / José Gregório Cabrera Gomez - Integrante.

• 2017 - 2020

  Estudo em biorreator e análise de fluxos metabólicos em cepas recombinantes de Burkholderia sacchari na conversão de xilose e ácido hexanóico em copolímero poli-3-hidroxibutirato-co-3-hidroxihexanoato [P(3HB-co-3HHx)], Descrição: O impacto ambiental de produtos de origem petroquímica, como os plásticos, têm levado à busca por materiais similares que sejam ambientalmente corretos e possam ser produzidos a partir de fontes renováveis. Uma alternativa são os polihidroxialcanoatos (PHA), uma família de poliésteres termoplásticos ou elastoméricos, biodegradáveis e biocompatíveis, acumulados por algumas bactérias. A incorporação e a modulação de monômeros variáveis à estrutura dos PHA apresentam potencial para o desenvolvimento de novos materiais para aplicações médicas. A literatura e patentes recentes apontam copolímeros de poli-3-hidroxibutirato-co-3-hidroxihexanoato (3HB-co-3HHx) como produtos de grande potencial nesta área. Foram construídos, no laboratório de Bioprodutos do Instituto de Ciências Biomédicas-USP, recombinantes da bactéria Burkholderia sacchari, abrigando genes de Aeromonas sp, com o objetivo de se ter um organismo seguro capaz de produzir altos teores do copolímero. Este trabalho estudou aspectos da produção do copolímero 3HB-co-3HHx a partir de xilose e ácido hexanóico, por esses recombinantes, para dar subsídios à produção deste material com diferentes teores de 3HHx, potencialmente capazes de conferir variações nas propriedades e aplicações deste. Analisaram-seos perfis desses recombinantes, frente ao consumo de xilose e ácido hexanóico, para propor alternativas metabólicas para o aprimoramento no consumo de xilose por esses mutantes a partir da análise de fluxos metabólicos. A xilose foi selecionada como principal fonte de carbono por ser uma pentose oriunda de hidrolisados hemicelulósicos do bagaço de cana-de-açúcar que se apresenta como um resíduo da produção de etanol de segunda geração. Foram testados seis recombinantes, abrigando os genes P, C e J de Aeromonas sp. ou Aeromonas hydrophila, em frascos agitados, selecionando-se o recombinante B. sacchari LFM344 pBBR1MCS-2::phaPCJAsp para ensaios em biorreator.Esses experimentos, em meio de cultura contendo xilose mais ácido hexanóico como fontes de carbono,permitiram delimitar: a velocidade específica máxima de crescimento (μmaxX=0,18 h-1), a eficiência de conversão de xilose em monômeros de 3HB (Y3HB/xil=0,40 g.g-1) e a eficiência de conversão de ácido hexanóico em monômeros de 3HHx (Y3HHx/AHex=0,89 g.g-1), este último maior do que dados reportados na literatura.Foram propostas e aplicadas condições para experimentos visando modular o teor de 3HHx no copolímero a partir de xilose e ácido hexanóico em biorreator.As células foram capazes de acumular entre35 a 64% da biomassa na forma de PHA.Os teores de 3HHx nos copolímeros variaram de 10 mol% a 40mol %, mostrando que é possível controlar a composião monomérica e as propriedades do material. Os valores obtidos foram superiores a experimentos da literatura com glicose e ácido hexanóico. Finalmente, utilizaram-se os programas Metatool e Matlab para analise preliminar de fluxos metabólicos, sendo observada a necessidade de se melhorar a produção de poder redutor (NADPH) pela célula.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Jefferson Gonçalves Pinheiro Silva - Integrante / LUIZIANA FERREIRA DA SILVA - Coordenador / Edmar Ramos Oliveira Filho - Integrante / Marilda Keiko Taciro - Integrante / José Gregório Cabrera Gomez - Integrante.

• 2015 - 2016

  Seleção de bactérias isoladas de diversos pontos do Rio Tietê e avaliação da sua capacidade de acumular polímeros biodegradáveis, Descrição: A indústria petrolífera alimenta a produção de muitos produtos de uso comum, como o plástico e os combustíveis, que são empregados em diversas atividades da sociedade moderna. Entretanto, a exploração desses hidrocarbonetos tem sido considerada agressiva ao meio ambiente e seus reservatórios não são renováveis em intervalos de tempo compatíveis com o tempo de vida humana. Têm se buscado alternativas para a produção de combustíveis e materiais similares ao plástico que provenham de fontes renováveis e menos agressivas ao meio ambiente. Dentre as alternativas em estudo, destaca-se a produção de polihidroxialcanoatos (PHA), uma classe de polímeros produzidos por certas bactérias, utilizado na fabricação de bioplástico. Os PHA podem ser obtidos a partir de fontes renováveis, e em sua produção podem ser empregados resíduos agroindustriais, como o hidrolisado de bagaço da cana-de-açúcar. Diversos micro-organismos são capazes de acumular PHA. O presente estudo foi realizado em cerca de 1055 bactérias coletadas recentemente de diversos pontos do Rio Tietê, buscando avaliar seu potencial de produzir PHA a partir de diferentes fontes de carbono usualmente presentes em resíduos agroindustriais (glicose, glicerol, sacarose e xilose). Após análises qualitativas empregando corante Sudan Black B, foram selecionados 6 culturas bacterianas isoladas potencialmente produtoras de PHA. Tais culturas pertencem a 4 gêneros, sendo eles Chormobacterium, Staphyloccoccus, Pseudomonas e Ferroglobus. Os isolados selecionados são candidatos promissores para testar a capacidade de produzir PHA a partir de diversas fontes de carbono e o tipo de PHA acumulado.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Jefferson Gonçalves Pinheiro Silva - Integrante / LUIZIANA FERREIRA DA SILVA - Coordenador / Renata Santucci - Integrante.

Prêmios