Diego Marques Coelho

Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade do Estado do Rio de Janeiro (2013), mestrado em Ciências Biológicas (Biofísica) pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (2016), doutorado em Bioinformática pela Universidade Federal do Rio Grande do Norte (2018) e doutorado em Bioinformática pela Universidade Federal do Rio Grande do Norte (2021). Seu último trabalho acadêmico teve ênfase em uso de dados de scRNAseq e RNAseq para responder perguntas sobre neurobiologia do desenvolvimento assim como a neuropatologia Alzheimer. Trabalhou para Mendelics S/A como analista em Bioinformática e na EMBL-EBI como desenvolvedor em bioinformática. Hoje, trabalha na empresa Ryvu Therapeutics, além de colaborar com pesquisadores e empresas de biotecnologia.

Informações coletadas do Lattes em 24/04/2026

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Bioinformática

2017 - 2018

Universidade Federal do Rio Grande do Norte
Título: Differential expression levels of Sox9 in early neocortical radial glial cells regulate the decision between stem cell maintenance and differentiation.
Orientador: em Johns Hopkins University ( Ulrich Mueller)
com Marcos Romualdo Costa. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

Doutorado em Bioinformática

2016 - 2021

Universidade Federal do Rio Grande do Norte
Título: RNAseq: como o uso da expressão diferencial em dados de células e tecido nos auxiliam a encontrar novos marcadores?
Marcos Romulado Costa. Coorientador: Sandro José de Souza. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Transcriptômica; scRNAseq; Alzheimer; Neurobiologia do Desenvolvimento; RNAseq.Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.

Mestrado em Ciências Biológicas (Biofísica)

2013 - 2016

Universidade Federal do Rio de Janeiro
Título: Proteínas do complexo Hsp90 como mediadoras de migração neuronal na zona subventricular
, Ano de Obtenção: 2016.Cecília Hedin Pereira.Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Migração neuronal; Zona subventricular; Complexo Hsp90.Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Neurodesenvolvimento.

Graduação em Ciências Biológicas

2009 - 2013

Universidade do Estado do Rio de Janeiro
Título: Influência do complexo Hsp90 na migração dos neuroblastos da zona subventricular
Orientador: Cecília Hedin Pereira

Formação complementar

2016 - 2016

VI Latin Am. School on Computational Neuroscience.. (Carga horária: 120h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2013 - 2013

International School for Criativity on Science & PRIMO's Next III. (Carga horária: 40h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Bandeira representando o idioma Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Alemão

Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Neurociência.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Neurodesenvolvimento.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Bioquímica.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.

Organização de eventos

Marques-Coelho, D. ; Hedin-Pereira C. . Semana Nacional do Cérebro II - À Flor da pele, à dos olhos. 2013. 2013. (Exposição).

Marques-Coelho, D. ; Hedin-Pereira C. . Semana Nacional do Cérebro - Flor da pele, à dos olhos. 2012. (Exposição).

Marques-Coelho, D. ; Hedin-Pereira C. . Semana Nacional do Cérebro - Flor da pele, à dos olhos. 2012. (Exposição).

Marques-Coelho, D. ; Hedin-Pereira C. . Semana Nacional do Cérebro II - À Flor da pele, à dos olhos. 2013. 2013. (Exposição).

Participação em eventos

9th World Congress - International Brain Research Organization. Hsp90 heterocomplex proteins influence SVZ cell migration in a non-classical manner. 2015. (Congresso).

Scientiarum Historia VII. 2014. (Congresso).

XXXVIII Reunião Anual da SBNeC. 2014. (Congresso).

XXXVII Reunião anual da SBNec. Influência do heterocomplexo Hsp90 na migração dos neuroblastos da zona subventricular. 2013. (Congresso).

XXXV Jornada Giulio Massarani de Iniciação Científica, Tecnológica, Artística e Cultural da UFRJ. Papel extracelular do heterocomplexo Hsp90 na regulação da migração de neuroblastos da zona subventricular pós-natal. 2013. (Congresso).

Prion Science Brazil & Canada. 2012. (Simpósio).

XXVII Reunião Anual da Federação de Sociedades de Biologia Experimental - FeSBE. 2012. (Congresso).

Mini-Curso de Bioenergética da fermentação. 2010. (Oficina).

Mini-Curso de Paleoparasitologia Molecular e Paleogenética. 2010. (Oficina).

XVII SEMANA DE BIOLOGIA - AS DIFERENÇAS FAZEM O EQUILÍBRIO. 2010. (Seminário).

Produções bibliográficas

  • DE AMORIM, JULIA A ; CAVALCANTE, JOÃO VITOR F ; MARQUES-COELHO, DIEGO ; DALMOLIN, RODRIGO J S ; LAGOU, VASILIKI . Causeway: a pipeline for genome-wide effector gene screening with Mendelian Randomization and colocalization. Bioinformatics Advances , v. 5, p. 110, 2025.

  • HARRISON, PETER W ; AMODE, M RIDWAN ; AUSTINE-ORIMOLOYE, OLANREWAJU ; AZOV, ANDREY G ; BARBA, MATTHIEU ; BARNES, IF ; BECKER, ARNE ; BENNETT, RUTH ; BERRY, ANDREW ; BHAI, JYOTHISH ; BHURJI, SIMARPREET KAUR ; BODDU, SANJAY ; BRANCO LINS, PAULO R ; BROOKS, LUCY ; RAMARAJU, SHASHANK BUDHANURU ; CAMPBELL, LAHCEN I ; MARTINEZ, MANUEL CARBAJO ; CHARKHCHI, MEHRNAZ ; CHOUGULE, KAPEEL ; Marques-Coelho, D. ; et.al . Ensembl 2024. NUCLEIC ACIDS RESEARCH , v. 52, p. D891-D899, 2024.

  • MARTIN, FERGAL J ; AMODE, M RIDWAN ; ANEJA, ALISHA ; AUSTINE-ORIMOLOYE, OLANREWAJU ; AZOV, ANDREY G ; BARNES, IF ; BECKER, ARNE ; BENNETT, RUTH ; BERRY, ANDREW ; BHAI, JYOTHISH ; BHURJI, SIMARPREET KAUR ; BIGNELL, ALEXANDRA ; BODDU, SANJAY ; BRANCO LINS, PAULO R ; BROOKS, LUCY ; RAMARAJU, SHASHANK BUDHANURU ; CHARKHCHI, MEHRNAZ ; COCKBURN, ALEXANDER ; DA RIN FIORRETTO, LUCA ; Marques-Coelho, D. ; et.al . Ensembl 2023. NUCLEIC ACIDS RESEARCH , v. 51, p. D933-D941, 2023.

  • MARQUES-COELHO, DIEGO ; IOHAN, LUKAS DA CRUZ CARVALHO ; MELO DE FARIAS, ANA RAQUEL ; FLAIG, AMANDINE ; LAMBERT, JEAN-CHARLES ; COSTA, MARCOS ROMUALDO . Differential transcript usage unravels gene expression alterations in Alzheimer?s disease human brains. npj Aging and Mechanisms of Disease , v. 7, p. 2, 2021.

  • FABRA-BESER, JAIME ; ALVES MEDEIROS DE ARAUJO, JESSICA ; MARQUES-COELHO, DIEGO ; GOFF, LOYAL A. ; COSTA, MARCOS R. ; MÜLLER, ULRICH ; GIL-SANZ, CRISTINA . Differential Expression Levels of Sox9 in Early Neocortical Radial Glial Cells Regulate the Decision between Stem Cell Maintenance and Differentiation. JOURNAL OF NEUROSCIENCE , v. 41, p. 6969-6986, 2021.

  • KILINC, DEVRIM ; VREULX, ANAÏS-CAMILLE ; MENDES, TIAGO ; FLAIG, AMANDINE ; MARQUES-COELHO, DIEGO ; VERSCHOORE, MAXIME ; DEMIAUTTE, FLORIE ; AMOUYEL, PHILIPPE ; EYSERT, FANNY ; DOURLEN, PIERRE ; CHAPUIS, JULIEN ; COSTA, MARCOS R ; MALMANCHE, NICOLAS ; CHECLER, FRÉDÉRIC ; LAMBERT, JEAN-CHARLES . Pyk2 overexpression in postsynaptic neurons blocks amyloid β1-42-induced synaptotoxicity in microfluidic co-cultures. Brain Communications , v. 2, p. 1, 2020.

  • GUIMARÃES, ROBERTA PEREIRA DE MELO ; LANDEIRA, BRUNA SOARES ; COELHO, DIEGO MARQUES ; GOLBERT, DAIANE CRISTINA FERREIRA ; SILVEIRA, MARIANA S. ; LINDEN, RAFAEL ; DE MELO REIS, RICARDO A. ; COSTA, MARCOS R. . Evidence of Müller Glia Conversion Into Retina Ganglion Cells Using Neurogenin2. Frontiers in Cellular Neuroscience , v. 12, p. 410, 2018.

  • ARAÚJO, JESSICA ALVES DE MEDEIROS ; HILSCHER, MARKUS M. ; MARQUES-COELHO, DIEGO ; GOLBERT, DAIANE C. F. ; CORNELIO, DEBORAH A. ; BATISTUZZO DE MEDEIROS, SILVIA R. ; LEÃO, RICHARDSON N. ; COSTA, MARCOS R. . Direct Reprogramming of Adult Human Somatic Stem Cells Into Functional Neurons Using Sox2, Ascl1, and Neurog2. Frontiers in Cellular Neuroscience , v. 12, p. 12/155, 2018.

  • MIYAKOSHI, LEO M. ; MARQUES-COELHO, DIEGO ; DE SOUZA, LUIZ E. R. ; LIMA, FLAVIA R. S. ; MARTINS, VILMA R. ; ZANATA, SILVIO M. ; HEDIN-PEREIRA, CECILIA . Evidence of a Cell Surface Role for Hsp90 Complex Proteins Mediating Neuroblast Migration in the Subventricular Zone. Frontiers in Cellular Neuroscience , v. 11, p. 1/138-12, 2017.

  • COELHO, DIEGO ; DE SOUZA, SANDRO JOSÉ ; COSTA, MARCOS . Transcriptional profile of induced and primary neurons reveals new candidate genes for lineage reprogramming. Matters , v. none, p. Standalone, 2017.

  • Marques-Coelho, D. ; MIYAKOSHI, L. M. ; ZANATA, S. M. ; LIMA, F. R. S. ; MARTINS, V. R. ; Hedin-Pereira C. . Hsp90 complex influence SVZ cell migration in a non-classical manner. 2015. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • Marques-Coelho, D. ; MIYAKOSHI, L. M. ; ZANATA, S. M. ; LIMA, F. R. S. ; MARTINS, V. R. ; Hedin-Pereira C. . Hsp90 heterocomplex proteins influence SVZ cell migration in a non-classical manner. 2015. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • Marques-Coelho, D. ; MIYAKOSHI, L. M. ; ZANATA, S. M. ; MARTINS, V. R. ; Hedin-Pereira C. . Hsp90 heterocomplex proteins influence SVZ cell migration in a non-classical manner. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Outras produções

MARQUES-COELHO, DIEGO . Scientia Nihil Praeponere. 2017; Tema: Filosofia e ciência. (Blog).

Projetos de pesquisa

  • 2025 - Atual

    Modelos de perturbação para priorização de tipos celulares e alvos terapêuticos putativos, Descrição: Este projeto visa identificar e priorizar alvos terapêuticos por meio da modelagem de redes regulatóriasgênicas específicas por tipo celular, utilizando dados de transcriptômica e epigenômica de célula única.Integramos em diferentes contextos biológicos, aplicando algoritmos de inferência de redes e simulaçãode perturbações farmacológicas. O objetivo é mapear mecanismos moleculares comuns e específicos,identificar tipos celulares responsivos e propor novos alvos terapêuticos com base em evidênciascomputacionais e funcionais.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Diego Marques Coelho - Coordenador / LEONARDO GABRIEL DE QUEIROZ AMORIM - Integrante / ISAAC MEDEIROS - Integrante / JULIA APOLONIO DE AMORIM - Integrante / BEATRIZ MORAIS - Integrante / JOÃO VITOR FERREIRA CAVALCANTE - Integrante / JOÃO PAULO ALVES - Integrante.

  • 2016 - Atual

    Efeitos da eliminação seletiva de neurônios e progenitores neurais sobre a organização do córtex cerebral, Descrição: Neste trabalho, utilizamos técnicas de eletroporação in utero para inserir plasmídeos contendo os genes para a síntese de proteínas indutoras de apoptose em diferentes grupos de neurônios do córtex cerebral em desenvolvimento. Em seguida, avaliamos o efeito da eliminação destes grupos de neurônios sobre a organização histológica e atividade elétrica das áreas corticais afetadas, assim como as alterações comportamentais resultantes da manipulação.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Diego Marques Coelho - Integrante / Bruna Soares Landeira - Integrante / Ulrich Mueller - Integrante / Marcos Romualdo Costa - Coordenador.

  • 2011 - 2016

    Influência do complexo Hsp90 sobre a migração de neuroblastos da zona subventricular, Descrição: A zona subventricular (SVZ) é uma camada germinativa que mantém sua atividade neurogênica ao longo da vida adulta no cérebro da maioria dos mamíferos. Precursores neuronais oriundos desta região formam cadeias migratórias que se deslocam para o interior do bulbo olfatório, onde irão se diferenciar e integrar à circuitaria local. Ao longo dos últimos anos, esta migração tem sido alvo de diversos estudos, que buscam compreender os mecanismos envolvidos em sua regulação. Apesar de diferentes classes de moléculas já terem sido implicadas, pouco se sabe sobre o papel de chaperonas na mediação deste processo.Chaperonas tem funções intracelulares bem definidas, em alguns casos associando-se a outras moléculas, formando complexos proteicos que auxiliam na homeostase celular. A partir de evidências prévias que indicam que a co-chaperona Hop/STI1 é capaz de influenciar a migração de neuroblastos da SVZ in vitro. Sendo assim, investigamos se outras proteínas do chamado complexo Hsp90, da qual Hop/STI1 faz parte, desempenham papel funcional nesta migração, e além disso, caracterizar a localização dessas proteínas nas células da zona subventricular.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Diego Marques Coelho - Integrante / Cecília Hedin-Pereira - Coordenador / Leo Morita Miyakoshi - Integrante.

Histórico profissional

Experiência profissional

2024 - Atual

Ryvu Therapeutics

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Associate Director, Carga horária: 40

Outras informações:
* Responsible for 2 of our senior bioinformaticians and a junior team member, giving directions for our team to achieve our OKRs and Personal KPIs.* Established a culture of code sharing that allow us to increase our company wise features and make our tasks less repetitive.* Daily programming in R, python, Nextflow, shell.

2023 - 2024

Ryvu Therapeutics

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Senior Scientist II, Carga horária: 40

Outras informações:
* Developing solutions for cancer therapy with research-based data from several bioinformatics technologies.* Analyzed scRNAseq, bulk RNAseq and WES data related to our patients and experimental cell line models.* Daily programming in R, python, Nextflow, shell.

2022 - 2023

European Bioinformatics Institute

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Bioinfromatics Developer, Carga horária: 39, Regime: Dedicação exclusiva.

2020 - 2021

Mendelics Análise Genômica

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Analista de Bioinformática, Carga horária: 40

2025 - Atual

Universidade Federal do Rio Grande do Norte

Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor titular, Carga horária: 20

Outras informações:
Pro-bono position known as "Jovem Doutor" (Young PhD) to advise students and develop independent research in Bioinformatics at PPGBioinfo - UFRN.Focus on:* An advisor / co-advisor to doctors / masters / undergraduate students.* Teacher of full / partial courses at graduate program. * Develop independent research within UFRN infrastructure.* Publishing new articles in bioinformatics journals.

2016 - 2021

Universidade Federal do Rio Grande do Norte

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Doutorado, Carga horária: 40

Atividades

  • 06/2025

    Pesquisa e desenvolvimento, Instituto Metrópole Digital.Linhas de pesquisa

  • 03/2016 - 05/2021

    Pesquisa e desenvolvimento, Instituto Metrópole Digital.Linhas de pesquisa

2013 - 2016

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Mestrado, Carga horária: 40

2011 - 2013

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 30

Atividades

  • 04/2013 - 02/2016

    Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho.Linhas de pesquisa

2010 - 2011

Universidade do Estado do Rio de Janeiro

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Monitoria, Carga horária: 30