Roberto Medeiros de Souza

Pós-doutorado

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Participação em eventos

Orientou

Produções bibliográficas

• BUGLER, HANNA ; BERTO, RODRIGO ; Souza, Roberto ; HARRIS, ASHLEY D. . Frequency and phase correction of GABA-edited magnetic resonance spectroscopy using complex-valued convolutional neural networks. MAGNETIC RESONANCE IMAGING , v. 111, p. 186-195, 2024.

• DUBLJEVIC, NATALIA ; MOORE, STEPHEN ; LAUZON, MICHEL LOUIS ; Souza, Roberto ; FRAYNE, RICHARD . Effect of MR head coil geometry on deep-learning-based MR image reconstruction. MAGNETIC RESONANCE IN MEDICINE , v. 92, p. 1404-1420, 2024.

• NOGOVITSYN, NIKITA ; BALLESTER, PEDRO ; LASBY, MIKE ; DUNLOP, KATHARINE ; CENITI, AMANDA K. ; SQUIRES, SCOTT ; ROWE, JESSIE ; HO, KEITH ; SUH, JEESU ; HASSEL, STEFANIE ; Souza, Roberto ; CASSEB, RAPHAEL F. ; HARRIS, JACQUELINE K. ; ZAMYADI, MOJDEH ; ARNOTT, STEPHEN R. ; STROTHER, STEPHEN C. ; HALL, GEOFFREY ; LAM, RAYMOND W. ; POPPENK, JORDAN ; LEBEL, CATHERINE . An empirical analysis of structural neuroimaging profiles in a staging model of depression. JOURNAL OF AFFECTIVE DISORDERS , v. 351, p. 631-640, 2024.

• BERTO, RODRIGO POMMOT ; BUGLER, HANNA ; DIAS, GABRIEL ; OLIVEIRA, MATEUS ; UEDA, LUCAS ; DERTKIGIL, SERGIO ; COSTA, PAULA D. P. ; RITTNER, LETICIA ; MERKOFER, JULIAN P. ; VAN DE SANDE, DENNIS M. J. ; AMIRRAJAB, SINA ; DRENTHEN, GERHARD S. ; VETA, MITKO ; JANSEN, JACOBUS F. A. ; BREEUWER, MARCEL ; VAN SLOUN, RUUD J. G. ; QAYYUM, ABDUL ; RODERO, CRISTOBAL ; NIEDERER, STEVEN ; Souza, Roberto . Results of the 2023 ISBI challenge to reduce GABA-edited MRS acquisition time. Magnetic Resonance Materials In Physics Biology And Medicine , v. 37, p. 449-463, 2024.

• KAKAVAND, REZA ; PALIZI, MEHRDAD ; TAHGHIGHI, PEYMAN ; AHMADI, REZA ; GIANCHANDANI, NEHA ; ADEEB, SAMER ; Souza, Roberto ; EDWARDS, W. BRENT ; KOMEILI, AMIN . Integration of Swin UNETR and statistical shape modeling for a semi-automated segmentation of the knee and biomechanical modeling of articular cartilage. Scientific Reports , v. 14, p. 2748, 2024.

• GIANCHANDANI, NEHA ; DIBAJI, MAHSA ; OSPEL, JOHANNA ; VEGA, FERNANDO ; Bento, Mariana ; MACDONALD, M. ETHAN ; Souza, Roberto . A voxel-level approach to brain age prediction: A method to assess regional brain aging. Machine Learning for Biomedical Imaging , v. 2, p. 761-795, 2024.

• DIAS, GABRIEL ; BERTO, RODRIGO POMMOT ; OLIVEIRA, MATEUS ; UEDA, LUCAS ; DERTKIGIL, SERGIO ; COSTA, PAULA D.P. ; SHAMAEI, AMIRMOHAMMAD ; BUGLER, HANNA ; SOUZA, R. M. ; HARRIS, ASHLEY ; RITTNER, Leticia . Spectro-ViT: A vision transformer model for GABA-edited MEGA-PRESS reconstruction using spectrograms. MAGNETIC RESONANCE IMAGING , v. 113, p. 110219, 2024.

• ABYANE, AMIN ESLAMI ; ZHU, DERUI ; Souza, Roberto ; MA, LEI ; HEMMATI, HADI . Towards understanding quality challenges of the federated learning for neural networks: a first look from the lens of robustness. EMPIRICAL SOFTWARE ENGINEERING , v. 28, p. 44, 2023.

• HARRIS, ASHLEY D. ; AMIRI, HOUSHANG ; Bento, Mariana ; COHEN, RONALD ; CHING, CHRISTOPHER R. K. ; CUDALBU, CHRISTINA ; DENNIS, EMILY L. ; DOOSE, ARNE ; EHRLICH, STEFAN ; KIROV, IVAN I. ; MEKLE, RALF ; OELTZSCHNER, GEORG ; PORGES, ERIC ; Souza, Roberto ; TAM, FRIEDERIKE I. ; TAYLOR, BRIAN ; THOMPSON, PAUL M. ; QUIDÉ, YANN ; WILDE, ELISABETH A. ; WILLIAMSON, JOHN . Harmonization of multi-scanner in vivo magnetic resonance spectroscopy: ENIGMA consortium task group considerations. Frontiers in Neurology , v. 13, p. 1-10, 2023.

• NOGOVITSYN, NIKITA ; ADDINGTON, JEAN ; Souza, Roberto ; PLACSKO, THEA J. ; STOWKOWY, JACQUELINE ; WANG, JIANLI ; GOLDSTEIN, BENJAMIN I. ; BRAY, SIGNE ; LEBEL, CATHERINE ; TAYLOR, VALERIE H. ; KENNEDY, SIDNEY H. ; MACQUEEN, GLENDA . Childhood trauma and amygdala nuclei volumes in youth at risk for mental illness. PSYCHOLOGICAL MEDICINE , v. 52, p. 1192-1199, 2022.

• LOOS, WALLACE S. ; Souza, Roberto ; ANDERSEN, LINDA B. ; LEBEL, R. MARC ; FRAYNE, RICHARD . Extraction of a vascular function for a fully automated dynamic contrast-enhanced magnetic resonance brain image processing pipeline. MAGNETIC RESONANCE IN MEDICINE , v. 87, p. 1561-1573, 2022.

• BEAUFERRIS, YOUSSEF ; TEUWEN, JONAS ; KARKALOUSOS, DIMITRIOS ; MORIAKOV, NIKITA ; CAAN, MATTHAN ; YIASEMIS, GEORGE ; RODRIGUES, LÍVIA ; LOPES, ALEXANDRE ; PEDRINI, HELIO ; RITTNER, LETÍCIA ; DANNECKER, MAIK ; STUDENYAK, VIKTOR ; GRÖGER, FABIAN ; VYAS, DEVENDRA ; FAGHIH-ROOHI, SHAHROOZ ; KUMAR JETHI, AMRIT ; CHANDRA RAJU, JAYA ; SIVAPRAKASAM, MOHANASANKAR ; LASBY, MIKE ; SOUZA, R. M. . Multi-Coil MRI Reconstruction Challenge-Assessing Brain MRI Reconstruction Models and Their Generalizability to Varying Coil Configurations. Frontiers in Neuroscience , v. 16, p. 00, 2022.

• SAAT, PARISA ; NOGOVITSYN, NIKITA ; HASSAN, MUHAMMAD YUSUF ; GANAIE, MUHAMMAD ATHAR ; Souza, Roberto ; HEMMATI, HADI . A domain adaptation benchmark for T1-weighted brain magnetic resonance image segmentation. Frontiers in Neuroinformatics , v. 16, p. 1-10, 2022.

• METZAK, PAUL D. ; SHAKEEL, MOHAMMED K. ; LONG, XIANGYU ; LASBY, MIKE ; Souza, Roberto ; BRAY, SIGNE ; GOLDSTEIN, BENJAMIN I. ; MACQUEEN, GLENDA ; WANG, JIANLI ; KENNEDY, SIDNEY H. ; ADDINGTON, JEAN ; LEBEL, CATHERINE . Brain connectomes in youth at risk for serious mental illness: an exploratory analysis. BMC Psychiatry , v. 22, p. 611, 2022.

• LOPES, ALEXANDRE ; Souza, Roberto ; PEDRINI, HELIO . A survey on RGB-D datasets. COMPUTER VISION AND IMAGE UNDERSTANDING , v. 222, p. 103489, 2022.

• NOGOVITSYN, NIKITA ; METZAK, PAUL D. ; CASSEB, RAPHAEL F. ; Souza, Roberto ; HARRIS, JACQUELINE K. ; PRATI, LIONEL M. ; ZAMYADI, MOJDEH ; BRAY, SIGNE L. ; LEBEL, CATHERINE ; HASSEL, STEFANIE ; STROTHER, STEPHEN ; GOLDSTEIN, BENJAMIN I. ; WANG, JIANLI ; KENNEDY, SIDNEY H. ; MACQUEEN, GLENDA M. ; ADDINGTON, JEAN . Cerebello-limbic functional connectivity patterns in youth at clinical high risk for psychosis. SCHIZOPHRENIA RESEARCH , v. 240, p. 220-227, 2022.

• NOGOVITSYN, NIKITA ; MULLER, MEGHAN ; Souza, Roberto ; HASSEL, STEFANIE ; ARNOTT, STEPHEN R. ; DAVIS, ANDREW D. ; HALL, GEOFFREY B. ; HARRIS, JACQUELINE K. ; ZAMYADI, MOJDEH ; METZAK, PAUL D. ; ISMAIL, ZAHINOOR ; DOWNAR, JONATHAN ; PARIKH, SAGAR V. ; SOARES, CLAUDIO N. ; ADDINGTON, JEAN M. ; MILEV, ROUMEN ; HARKNESS, KATE L. ; FREY, BENICIO N. ; LAM, RAYMOND W. ; STROTHER, STEPHEN C. . Hippocampal tail volume as a predictive biomarker of antidepressant treatment outcomes in patients with major depressive disorder: a CAN-BIND report. NEUROPSYCHOPHARMACOLOGY , v. 45, p. 283-291, 2020.

• CHUNG, KEVIN J. ; Souza, Roberto ; FRAYNE, RICHARD . Restoration of Lossy JPEG-Compressed Brain MR Images Using Cross-Domain Neural Networks. IEEE SIGNAL PROCESSING LETTERS , v. 27, p. 141-145, 2020.

• Souza, Roberto ; BEAUFERRIS, YOUSSEF ; LOOS, WALLACE ; LEBEL, ROBERT MARC ; FRAYNE, RICHARD . Enhanced Deep-Learning-Based Magnetic Resonance Image Reconstruction by Leveraging Prior Subject-Specific Brain Imaging: Proof-of-Concept Using a Cohort of Presumed Normal Subjects. IEEE Journal of Selected Topics in Signal Processing , v. 14, p. 1126-1136, 2020.

• Souza, Roberto ; Bento, Mariana ; NOGOVITSYN, NIKITA ; CHUNG, KEVIN J. ; LOOS, WALLACE ; LEBEL, R. MARC ; FRAYNE, RICHARD . Dual-domain cascade of U-nets for multi-channel magnetic resonance image reconstruction. MAGNETIC RESONANCE IMAGING , v. 71, p. 140-153, 2020.

• NOGOVITSYN, NIKITA ; Souza, Roberto ; MULLER, MEGHAN ; SRAJER, AMELIA ; METZAK, PAUL D. ; HASSEL, STEFANIE ; ISMAIL, ZAHINOOR ; PROTZNER, ANDREA ; BRAY, SIGNE L. ; LEBEL, CATHERINE ; MACINTOSH, BRADLEY J. ; GOLDSTEIN, BENJAMIN I. ; WANG, JIANLI ; KENNEDY, SIDNEY H. ; ADDINGTON, JEAN ; MACQUEEN, GLENDA M. . Aberrant limbic brain structures in young individuals at risk for mental illness. PSYCHIATRY AND CLINICAL NEUROSCIENCES , v. 74, p. 294-302, 2020.

• Bento, Mariana ; Souza, Roberto ; SALLUZZI, MARINA ; RITTNER, LETÍCIA ; ZHANG, YUNYAN ; FRAYNE, RICHARD . Automatic identification of atherosclerosis subjects in a heterogeneous MR brain imaging data set. MAGNETIC RESONANCE IMAGING , v. 62, p. 18-27, 2019.

• NOGOVITSYN, NIKITA ; Souza, Roberto ; MULLER, MEGHAN ; SRAJER, AMELIA ; HASSEL, STEFANIE ; ARNOTT, STEPHEN R. ; DAVIS, ANDREW D. ; HALL, GEOFFREY B. ; HARRIS, JACQUELINE K. ; ZAMYADI, MOJDEH ; METZAK, PAUL D. ; ISMAIL, ZAHINOOR ; BRAY, SIGNE L. ; LEBEL, CATHERINE ; ADDINGTON, JEAN M. ; MILEV, ROUMEN ; HARKNESS, KATE L. ; FREY, BENICIO N. ; LAM, RAYMOND W. ; STROTHER, STEPHEN C. . Testing a deep convolutional neural network for automated hippocampus segmentation in a longitudinal sample of healthy participants. NEUROIMAGE , v. 197, p. 589-597, 2019.

• LUCENA, OESLLE ; SOUZA, R. M. ; RITTNER, Leticia ; FRAYNE, RICHARD ; Lotufo, Roberto . Convolutional neural networks for skull-stripping in brain MR imaging using silver standard masks. ARTIFICIAL INTELLIGENCE IN MEDICINE , v. 98, p. 48-58, 2019.

• GHAMISI, PEDRAM ; MAGGIORI, EMMANUEL ; LI, SHUTAO ; Souza, Roberto ; TARABLAKA, YULIYA ; MOSER, GABRIELE ; DE GIORGI, ANDREA ; FANG, LEYUAN ; CHEN, YUSHI ; CHI, MINGMIN ; SERPICO, SEBASTIANO B. ; BENEDIKTSSON, JON ATLI . New Frontiers in Spectral-Spatial Hyperspectral Image Classification: The Latest Advances Based on Mathematical Morphology, Markov Random Fields, Segmentation, Sparse Representation, and Deep Learning. IEEE Geoscience and Remote Sensing Magazine , v. 6, p. 10-43, 2018.

• SOUZA, R. M. ; LUCENA, OESLLE ; GARRAFA, JULIA ; GOBBI, DAVID ; SALUZZI, MARINA ; Appenzeller, Simone ; RITTNER, Leticia ; FRAYNE, RICHARD ; Lotufo, Roberto . An open, multi-vendor, multi-field-strength brain MR dataset and analysis of publicly available skull stripping methods agreement. NEUROIMAGE , v. 1, p. 1, 2017.

• SOUZA, R. M. ; RITTNER, Leticia ; MACHADO, RUBENS ; Lotufo, Roberto . iamxt: Max-tree toolbox for image processing and analysis. Softwarex , v. 6, p. 81-84, 2017.

• GHAMISI, PEDRAM ; SOUZA, R. M. ; BENEDIKTSSON, JON ATLI ; ZHU, XIAO XIANG ; RITTNER, Leticia ; Lotufo, Roberto A. . Extinction Profiles for the Classification of Remote Sensing Data. IEEE Transactions on Geoscience and Remote Sensing , v. 54, p. 5631-5645, 2016.

• MENDES JÚNIOR, PEDRO R. ; DE SOUZA, ROBERTO M. ; WERNECK, RAFAEL DE O. ; STEIN, BERNARDO V. ; PAZINATO, DANIEL V. ; DE ALMEIDA, WALDIR R. ; PENATTI, OTÁVIO A. B. ; TORRES, RICARDO DA S. ; ROCHA, ANDERSON . Nearest neighbors distance ratio open-set classifier. MACHINE LEARNING , v. 106, p. 359-386, 2016.

• GHAMISI, PEDRAM ; SOUZA, R. M. ; BENEDIKTSSON, JON ATLI ; RITTNER, Leticia ; Lotufo, Roberto ; ZHU, XIAO XIANG . Hyperspectral Data Classification Using Extended Extinction Profiles. IEEE Geoscience and Remote Sensing Letters , v. 1, p. 1-5, 2016.

• SOUZA, ROBERTO ; RITTNER, LETÍCIA ; LOTUFO, ROBERTO . A Comparison between k-Optimum Path Forest and k-Nearest Neighbors Supervised Classifiers. Pattern Recognition Letters , v. 39, p. 2-10, 2013.

• Bento, Mariana ; DE Souza, Roberto ; LOTUFO, ROBERTO ; FRAYNE, RICHARD ; RITTNER, LETÍCIA . WMH Segmentation Challenge: A Texture-Based Classification Approach. Lecture Notes in Computer Science. 1ed.: Springer International Publishing, 2018, v. , p. 489-500.

• SOUZA, ROBERTO ; RITTNER, LETÍCIA ; MACHADO, RUBENS ; LOTUFO, ROBERTO . A Comparison Between Extinction Filters and Attribute Filters. Lecture Notes in Computer Science. 12ed.: Springer International Publishing, 2015, v. , p. 63-74.

• OMIDI, A. ; MOHAMMADSHAHI, A. ; GIANCHANDANI, N. ; KING, R. ; LEIJSER, L. ; SOUZA, ROBERTO . Unsupervised Domain Adaptation of MRI Skull-Stripping Trained on Adult Data to Newborns. In: IEEE/CVF Winter Conference on Applications of Computer Vision (WACV), 2024, Hawaii. Proceedings of the IEEE/CVF Winter Conference on Applications of Computer Vision (WACV).

• OMIDI, A. ; SHAMAEI, A. ; VERSCHUU, A. ; KING, R. ; LEIJSER, L. ; SOUZA, ROBERTO . Unsupervised Domain Adaptation of Brain MRI Skull Stripping Trained on Adult Data to Newborns: Combining Synthetic Data with Domain Invariant Features. In: Medical Imaging with Deep Learning, 2024, Paris. Proceedings of Machine Learning Research, 2024.

• TAHGHIGHI, P. ; ZHANG, Y. ; Souza, Roberto ; KOMEILI, A. . Enhancing New Multiple Sclerosis Lesion Segmentation via Self-supervised Pre-training and Synthetic Lesion Integration. In: Medical Image Computing and Computer Assisted Interventions, 2024, Marrakesh. MICCAI 2024, 2024.

• SAHNOON, M. ; MANUEL, A. ; DEMISSIE, M. ; SOUZA, ROBERTO . UNET and UNETR Based Frameworks for Predicting the Short-term Spatiotemporal Demand of E-Scooter Sharing Services. In: IEEE International Conference on Intelligent Transportation Systems, 2024, Edmonton. Proceedings of the IEEE International Conference on Intelligent Transportation Systems, 2024.

• BIGLARBEIKI, M. ; Souza, Roberto ; MOHAMMED, E. ; FAR, B. . Enhancing Choroidal Nevi Segmentation in Fundus Images Using YOLO. In: IEEE International Conference on Information Reuse and Integration, 2024, San Jose. Proceddings of the IEEE International Conference on Information Reuse and Integration, 2024.

• GIANCHANDANI, N. ; OSPEL, J. ; MACDONALD, E. ; SOUZA, ROBERTO . A Multitask Deep Learning Model for Voxel-level Brain Age Estimation. In: MICCAI Workshop on Machine Learning for Medical Imaging, 2023, Vancouver. Proceedings of the MICCAI Workshop on Machine Learning for Medical Imaging, 2023.

• DIBAJI, MAHSA ; GIANCHANDANI, N. ; NAIR, A. ; SIGHAL, M. ; SOUZA, ROBERTO ; Bento, Mariana . Studying the Effects of Sex-related Differences on Brain Age Prediction using brain MRImaging. In: MICCAI Workshop Fairness of AI in Medical Imaging, Vancouver, 2023, Vancouver. Proceedings of the MICCAI Workshop Fairness of AI in Medical Imaging, Vancouver, 2023.

• SOUZA, ROBERTO ; LEBEL, R. M. ; FRAYNE, R. . A Hybrid, Dual Domain, Cascade of Convolutional Neural Networks for Magnetic Resonance Image Reconstruction. In: Medical Imaging with Deep Learning, 2019, London. Proceedings of The 2nd International Conference on Medical Imaging with Deep Learning, 2024.

• SOUZA, ROBERTO ; LUCENA, OESLLE ; BENTO, MARIANA P. ; GARRAFA, JULIA ; APPENZELLER, SIMONE ; RITTNER, LETICIA ; LOTUFO, ROBERTO ; FRAYNE, RICHARD . Reliability of Using Single Specialist Annotation for Designing and Evaluating Automatic Segmentation Methods: A Skull Stripping Case Study. In: International Symposium on Biomedical Imaging, 2018, Washington, D.C.. 2018 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, 2018.

• LUCENA, OESLLE ; SOUZA, ROBERTO ; FRAYNE, RICHARD ; RITTNER, LETICIA ; LOTUFO, ROBERTO . Silver Standard Masks for Data Augmentation Applied to Deep-Learning-Based Skull-Stripping. In: International Symposium on Biomedical Imaging, 2018, Washington, D.C.. 2018 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, 2018.

• RODRIGUES, LIVIA MARIA DE AGUIAR ; SOUZA, ROBERTO MEDEIROS DE ; RITTNER, LETICIA ; FRAYNE, RICHARD ; LOTUFO, ROBERTO DE ALENCAR . Common Carotid Artery Lumen Segmentation from Cardiac Cycle-Resolved Cine Fast Spin Echo Magnetic Resonance Imaging. In: 2017 30th SIBGRAPI Conference on Graphics, Patterns and Images (SIBGRAPI), 2017, Niteroi. 2017 30th SIBGRAPI Conference on Graphics, Patterns and Images (SIBGRAPI), 2017. p. 442.

• GHAMISI, PEDRAM ; SOUZA, ROBERTO ; RITTNER, LETICIA ; BENEDIKTSSON, JON A. ; LOTUFO, ROBERTO ; ZHU, XIAO X. . Extinction profiles: A novel approach for the analysis of remote sensing data. In: IGARSS 2016 2016 IEEE International Geoscience and Remote Sensing Symposium, 2016, Beijing. 2016 IEEE International Geoscience and Remote Sensing Symposium (IGARSS), 2016. p. 5122.

• TAVARES, LUIS A. ; SOUZA, ROBERTO M. ; RITTNER, LETICIA ; MACHADO, RUBENS C. ; LOTUFO, ROBERTO A. . A Max-Tree Simplification Proposal and Applications for the Interactive Max-Tree Visualization Tool. In: 2016 29th SIBGRAPI Conference on Graphics, Patterns and Images (SIBGRAPI), 2016, Sao Paulo. 2016 29th SIBGRAPI Conference on Graphics, Patterns and Images (SIBGRAPI). p. 313.

• SOUZA, ROBERTO ; TAVARES, LUIS ; RITTNER, LETICIA ; LOTUFO, ROBERTO . An Overview of Max-Tree Principles, Algorithms and Applications. In: 2016 29th SIBGRAPI Conference on Graphics, Patterns and Images Tutorials (SIBGRAPIT), 2016, Sao Paulo. 2016 29th SIBGRAPI Conference on Graphics, Patterns and Images Tutorials (SIBGRAPI-T), 2016. p. 15.

• SOUZA, ROBERTO ; RITTNER, LETICIA ; LOTUFO, ROBERTO ; MACHADO, RUBENS . An array-based node-oriented max-tree representation. In: 2015 IEEE International Conference on Image Processing (ICIP), 2015, Quebec City. 2015 IEEE International Conference on Image Processing (ICIP). p. 3620.

• COOK, TESSA S. ; ZHANG, JIANGUO ; RITTNER, LETICIA ; BENTO, MARIANA P. ; COSTA, ANDRÉ L. ; SOUZA, ROBERTO M. ; MACHADO, RUBENS C. ; LOTUFO, ROBERTO A. . Web-based platform for collaborative medical imaging research. In: SPIE Medical Imaging, 2015, Orlando. p. 94180B.

• TAVARES, LUIS A. ; SOUZA, ROBERTO M. ; RITTNER, LETICIA ; MACHADO, RUBENS C. ; LOTUFO, ROBERTO A. . Interactive max-tree visualization tool for image processing and analysis. In: 2015 International Conference on Image Processing Theory, Tools and Applications (IPTA), 2015, Orleans. 2015 International Conference on Image Processing Theory, Tools and Applications (IPTA). p. 119.

• SOUZA, ROBERTO ; RITTNER, LETICIA ; MACHADO, RUBENS ; LOTUFO, ROBERTO . Maximal Max-Tree Simplification. In: 2014 22nd International Conference on Pattern Recognition (ICPR), 2014, Stockholm. 2014 22nd International Conference on Pattern Recognition. p. 3132.

• SOUZA, ROBERTO ; LOTUFO, ROBERTO ; RITTNER, LETICIA . A Comparison between Optimum-Path Forest and k-Nearest Neighbors Classifiers. In: SIBGRAPI 2012 (XXV Conference on Graphics, Patterns and Images, 2012, Ouro Preto. Proceedings of SIBGRAPI 2012. p. 260.

• PANTOJA, R.V.M.P. ; SOUZA, R. M. ; Rodrigues, R. M. ; Borges, G. S. ; SALES, C.S. ; COSTA, J. C. W. A. . Design of thin film filters using differential evolution optimization technique. In: SBMO/IEEE MTTS INTERNATIONAL MICROWAVE AND OPTOELECTRONICS CONFERENCE IMOC, 2009, Belém. 2009 SBMO/IEEE MTT-S International Microwave and Optoelectronics Conference (IMOC). p. 447.

• ASHRAF, S. ; AKTAR, M. ; SOUZA, ROBERTO ; Bento, Mariana . Neonatal Brain MRI Motion Correction Using Adult MRI.. In: ISMRM Workshop on Motion Correction in MR, 2024, Montreal. Proceedings of the ISMRM Workshop on Motion Correction in MR, 2024.

• LUCENA, OESLLE ; SOUZA, ROBERTO ; FRAYNE, RICHARD ; RITTNER, LETICIA ; LOTUFO, ROBERTO . 2D Single Plane Big Data Convolutional Neural Network for Skull-Stripping. In: International Society for Magnetic Resonance in Medicine, 2018, Paris. International Society for Magnetic Resonance in Medicine, 2018.

• SOUZA, ROBERTO ; BENTO, MARIANA P. ; GARRAFA, JULIA ; APPENZELLER, SIMONE ; RITTNER, LETICIA ; LOTUFO, ROBERTO ; FRAYNE, RICHARD . Can brain MRI skull-stripping methods be further improved using manual segmentation as ground-truth for validation?. In: International Society for Magnetic Resonance in Medicine, 2018, Paris. International Society for Magnetic Resonance in Medicine, 2018.

• SOUZA, ROBERTO ; RODRIGUES, L. ; RITTNER, LETICIA ; LOTUFO, ROBERTO ; FRAYNE, RICHARD . Towards a fully Automated Time-context Sensitive Convolutional Neural Network for Common Carotid Artery Lumen Segmentation on Dynamic MRI. In: International Society for Magnetic Resonance in Medicine, 2018, Paris. International Society for Magnetic Resonance in Medicine, 2018.

• RODRIGUES, L. ; SOUZA, ROBERTO ; RITTNER, LETICIA ; FRAYNE, RICHARD ; LOTUFO, ROBERTO . Common Carotid Artery Lumen Segmentation from Cine Fast Spin Echo Magnetic Resonance Images. In: Society for Magnetic Resonance Angiography, 2017, Stellenbosch. Society for Magnetic Resonance Angiography, 2017.

• Santos, D. ; SOUZA, R. M. ; RITTNER, Leticia ; LOTUFO, R. A. . First Steps towards a Web-based platform for Processing and Visualizing MRI using FreeSurfer. In: Congresso BRAINN, 2015, Campinas. Journal of Epilepsy and Clinical Neurophysiology, 2015. v. 21. p. 66-66.

• Lucena, O ; Junior, A. ; Moia, V. ; SOUZA, R. M. ; Valle, E. ; LOTUFO, R. A. . Transfer Learning Using Convolutional Neural Networks for Face Anti-Spoofing. Lecture Notes in Computer Science , 2017.

• SOUZA, ROBERTO ; LUCENA, OESLLE ; RITTNER, LETICIA ; LOTUFO, ROBERTO ; FRAYNE, RICHARD . Reliability of Using Single Specialist Annotation for Designing and Evaluating Automatic Segmentation Methods: A Skull Stripping Case Study. 2018. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• LUCENA, OESLLE ; SOUZA, ROBERTO ; RITTNER, LETICIA ; FRAYNE, RICHARD ; LOTUFO, ROBERTO . Silver Standard Masks for Data Augmentation Applied to Deep-Learning-Based Skull-Stripping. 2018. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• SOUZA, ROBERTO ; BENTO, MARIANA P. ; FRAYNE, RICHARD . Hands-on Machine Learning Workshop. 2017. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• RODRIGUES, L. ; SOUZA, ROBERTO ; RITTNER, LETICIA ; FRAYNE, RICHARD ; LOTUFO, ROBERTO . Common Carotid Artery Lumen Segmentation from Cine Fast Spin Echo Magnetic Resonance Images. 2017. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• SOUZA, ROBERTO M. ; RITTNER, Leticia ; FRAYNE, R. ; LOTUFO, R. A. . Max-tree/Watershed Combination for Medical Image Segmentation. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SOUZA, ROBERTO M. ; Tavares, L. A. ; RITTNER, Leticia ; LOTUFO, ROBERTO A. . An Overview of Max-Tree Principles, Algorithms and Applications. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SOUZA, R. M. ; RITTNER, Leticia ; MACHADO, R. C. ; LOTUFO, ROBERTO . Maximal Max-tree Simplification. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• SOUZA, R. M. ; RITTNER, Leticia ; MACHADO, RUBENS ; LOTUFO, R. A. . A Comparison between Extinction Filters and Attribute Filters. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SOUZA, R. M. ; RITTNER, Leticia ; MACHADO, RUBENS C. ; LOTUFO, R. A. . An Array-based Node-oriented Max-tree Representation. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SOUZA, ROBERTO M. ; RITTNER, Leticia ; FRAYNE, R. ; LOTUFO, ROBERTO A. . Analysis of the Watershed Tie-zone Influence on the Skull-stripping. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SOUZA, R. M. ; LOTUFO, R. A. ; RITTNER, Leticia . A Comparison between Optimum-Path Forest and k-Nearest Neighbors Classifiers. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

Projetos de pesquisa

• 2024 - Atual

  Translation of Deep Learning Models of Fast Brain MRI Trained on Adult Data to Newborns, Descrição: Adaptação de modelos de aprendizado profundo treinados em dados de adultos para dados pediátricos,. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (3) Doutorado: (1) . , Integrantes: Roberto Medeiros de Souza - Coordenador / BENTO, MARIANA P. - Integrante / FRAYNE, RICHARD - Integrante / Lara Leijser - Integrante., Financiador(es): Alberta Innovates - Outra.

• 2023 - Atual

  Increasing the scanning time efficiency of magnetic resonance imaging systems through data integration and deep learning, Descrição: Intergração de informação longitudinal durante aquisição e reconstrução de exames de ressonância magnética.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Roberto Medeiros de Souza - Coordenador / BENTO, MARIANA P. - Integrante / Gouri Deshpande - Integrante., Financiador(es): Natural Sciences and Engineering Research Council - Outra.

• 2021 - Atual

  Integrated Magnetic Resonance Imaging (iMRI): Integrating Multi-sequence and Multi-visit Information to Accelerate MRI Exams and Detect Temporal Image Changes, Descrição: Aceleração de exames de ressonância magnética com aprendizado profundo.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado profissional: (3) . , Integrantes: Roberto Medeiros de Souza - Coordenador., Financiador(es): Natural Sciences and Engineering Research Council - Outra.

Projetos de desenvolvimento

• 2008 - 2010

  Técnicas Avançadas para qualificação de enlaces telefônicos e mitigação de ruído em sistemas VDSL/VDSL2+, Descrição: Esse projeto tem como objetivo melhorar a robustez dos métodos de qualificação desenvolvidos pela UFPA nos projetos anteriores com a Ericsson, integra-los em um software genérico para qualificação de enlaces, e criar métodos de identificação de ruídos comuns em sistemas xDSL. . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (5) . , Integrantes: Roberto Medeiros de Souza - Integrante / Roberto Menezes Rodrigues - Integrante / Ramon Villar Monte Palma Panoja - Integrante / Claudomiro de Souza Sales - Integrante / Gilvan Soares Borges - Integrante / João Crisóstomo Weyl Alburquerque Costa - Coordenador / Vinicius Duarte Lima - Integrante / Lamartine Vilar Souza - Integrante / Gervásio Protásio dos Santos Cavalcante - Integrante., Financiador(es): Ericsson Telecomunicações - Matriz - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2010

  Técnicas Avançadas para qualificação de enlaces telefônicos e mitigação de ruído em sistemas VDSL/VDSL2+, Descrição: Esse projeto tem como objetivo melhorar a robustez dos métodos de qualificação desenvolvidos pela UFPA nos projetos anteriores com a Ericsson, integra-los em um software genérico para qualificação de enlaces, e criar métodos de identificação de ruídos comuns em sistemas xDSL. . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (5) . , Integrantes: Roberto Medeiros de Souza - Integrante / Roberto Menezes Rodrigues - Integrante / Ramon Villar Monte Palma Panoja - Integrante / Claudomiro de Souza Sales - Integrante / Gilvan Soares Borges - Integrante / João Crisóstomo Weyl Alburquerque Costa - Coordenador / Vinicius Duarte Lima - Integrante / Lamartine Vilar Souza - Integrante / Gervásio Protásio dos Santos Cavalcante - Integrante., Financiador(es): Ericsson Telecomunicações - Matriz - Auxílio financeiro.

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  Técnicas Avançadas para qualificação de enlaces telefônicos e mitigação de ruído em sistemas VDSL/VDSL2+, Descrição: Esse projeto tem como objetivo melhorar a robustez dos métodos de qualificação desenvolvidos pela UFPA nos projetos anteriores com a Ericsson, integra-los em um software genérico para qualificação de enlaces, e criar métodos de identificação de ruídos comuns em sistemas xDSL. . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (5) . , Integrantes: Roberto Medeiros de Souza - Integrante / Roberto Menezes Rodrigues - Integrante / Ramon Villar Monte Palma Panoja - Integrante / Claudomiro de Souza Sales - Integrante / Gilvan Soares Borges - Integrante / João Crisóstomo Weyl Alburquerque Costa - Coordenador / Vinicius Duarte Lima - Integrante / Lamartine Vilar Souza - Integrante / Gervásio Protásio dos Santos Cavalcante - Integrante., Financiador(es): Ericsson Telecomunicações - Matriz - Auxílio financeiro.

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  Técnicas Avançadas para qualificação de enlaces telefônicos e mitigação de ruído em sistemas VDSL/VDSL2+, Descrição: Esse projeto tem como objetivo melhorar a robustez dos métodos de qualificação desenvolvidos pela UFPA nos projetos anteriores com a Ericsson, integra-los em um software genérico para qualificação de enlaces, e criar métodos de identificação de ruídos comuns em sistemas xDSL.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (5) . , Integrantes: Roberto Medeiros de Souza - Integrante / Roberto Menezes Rodrigues - Integrante / Ramon Villar Monte Palma Panoja - Integrante / Claudomiro de Souza Sales - Integrante / Gilvan Soares Borges - Integrante / João Crisóstomo Weyl Alburquerque Costa - Coordenador / Vinicius Duarte Lima - Integrante / Lamartine Vilar Souza - Integrante / Gervásio Protásio dos Santos Cavalcante - Integrante., Financiador(es): Ericsson Telecomunicações - Matriz - Auxílio financeiro.

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  Técnicas Avançadas para qualificação de enlaces telefônicos e mitigação de ruído em sistemas VDSL/VDSL2+, Descrição: Esse projeto tem como objetivo melhorar a robustez dos métodos de qualificação desenvolvidos pela UFPA nos projetos anteriores com a Ericsson, integra-los em um software genérico para qualificação de enlaces, e criar métodos de identificação de ruídos comuns em sistemas xDSL.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (5) . , Integrantes: Roberto Medeiros de Souza - Integrante / Roberto Menezes Rodrigues - Integrante / Ramon Villar Monte Palma Panoja - Integrante / Claudomiro de Souza Sales - Integrante / Gilvan Soares Borges - Integrante / João Crisóstomo Weyl Alburquerque Costa - Coordenador / Vinicius Duarte Lima - Integrante / Lamartine Vilar Souza - Integrante / Gervásio Protásio dos Santos Cavalcante - Integrante., Financiador(es): Ericsson Telecomunicações - Matriz - Auxílio financeiro.

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  Técnicas Avançadas para qualificação de enlaces telefônicos e mitigação de ruído em sistemas VDSL/VDSL2+, Descrição: Esse projeto tem como objetivo melhorar a robustez dos métodos de qualificação desenvolvidos pela UFPA nos projetos anteriores com a Ericsson, integra-los em um software genérico para qualificação de enlaces, e criar métodos de identificação de ruídos comuns em sistemas xDSL.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (5) . , Integrantes: Roberto Medeiros de Souza - Integrante / Roberto Menezes Rodrigues - Integrante / Ramon Villar Monte Palma Panoja - Integrante / Claudomiro de Souza Sales - Integrante / Gilvan Soares Borges - Integrante / João Crisóstomo Weyl Alburquerque Costa - Coordenador / Vinicius Duarte Lima - Integrante / Lamartine Vilar Souza - Integrante / Gervásio Protásio dos Santos Cavalcante - Integrante., Financiador(es): Ericsson Telecomunicações - Matriz - Auxílio financeiro.

Prêmios