Wandemberg Paiva Ferreira

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Produções bibliográficas

• DOMINGOS, JORGE L. C. ; POTIGUAR, F. Q. ; OLIVEIRA, C. L. N. ; FERREIRA, W. P. . Emergence of synchronization-induced patterns in two-dimensional magnetic rod systems under rotating magnetic fields. Soft Matter , v. 21, p. 488-498, 2025.

• FERREIRA, A. E. O. ; DE ARAÚJO, J. L. B. ; FERREIRA, W. P. ; DE SOUSA, J. S. ; OLIVEIRA, C. L. N. . Sublinear drag regime at mesoscopic scales in viscoelastic materials. PLoS One , v. 19, p. e0299296, 2024.

• LIMA, I.V.M. ; SILVA, A.V.S. ; SOUSA, F.D. ; FERREIRA, W.P. ; FREIRE, R.S. ; DE OLIVEIRA, C.L.N. ; DE SOUSA, J.S. . Measuring the viscoelastic relaxation function of cells with a time-dependent interpretation of the Hertz-Sneddon indentation model. HELIYON , v. 10, p. e30623-e30623-12, 2024.

• NASCIMENTO, K. S. ; OSTERNE, VINICIUS JOSE SILVA ; OLIVEIRA, MESSIAS VITAL ; DOMINGOS, J. L. C. ; FERREIRA, W. P. ; DAMME, Els J. M. V. ; CAVADA, B. S. ; PINTO-JUNIOR, VANIR REIS . Lectin-carbohydrate analysis by molecular dynamics: Parkia lectins case study. ANAIS DA ACADEMIA BRASILEIRA DE CIÊNCIAS , v. 96, p. e20230677_1-e20230677_14, 2024.

• JÚNIOR, FELIPE P.S. ; DOMINGOS, JORGE L.C. ; POTIGUAR, F.Q. ; FERREIRA, W.P. . Correlations between two vortices in dry active matter. PHYSICA A-STATISTICAL MECHANICS AND ITS APPLICATIONS , v. 656, p. 130181-130181-10, 2024.

• COSTA, D. F. S. ; PONTES, J. H. M. ; FERREIRA, W. P. ; DE SOUSA, J. S. ; OLIVEIRA, C. L. N. . Indenting fractal-edged elastic materials. JOURNAL OF APPLIED PHYSICS , v. 136, p. 214701-1-214701-8, 2024.

• CAVADA, BENILDO SOUSA ; PINTO-JUNIOR, VANIR REIS ; OSTERNE, VINICIUS JOSE SILVA ; OLIVEIRA, MESSIAS VITAL ; SILVA, IVANICE BEZERRA ; LARANJEIRA, EVA POLLYANNA PEIXE ; PIRES, ALANA FREITAS ; DOMINGOS, JORGE LUIZ COELHO ; FERREIRA, WANDEMBERG PAIVA ; SOUSA, JEANLEX SOARES ; ASSREUY, ANA MARIA SAMPAIO ; NASCIMENTO, KYRIA SANTIAGO . In depth analysis on the carbohydrate-binding properties of a vasorelaxant lectin from Dioclea lasiophylla Mart Ex. Benth seeds. JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS , v. 0000, p. 1-14, 2021.

• C. DOMINGOS, JORGE L. ; DE FREITAS, EVERTON A. ; FERREIRA, W. P. . Steady states of non-axial dipolar rods driven by rotating fields. Soft Matter , v. 16, p. 1201-1210, 2020.

• CAVADA, BENILDO SOUSA ; OSTERNE, VINICIUS JOSE SILVA ; PINTO-JUNIOR, VANIR REIS ; SOUZA, LUIZ AUGUSTO GOMEZ ; LOSSIO, CLAUDIA FIGUEIREDO ; SILVA, MAYARA TORQUATO LIMA ; CORREIA-NETO, CORNEVILLE ; OLIVEIRA, MESSIAS VITAL ; CORREIA, JORGE LUIS ALMEIDA ; NECO, ANTONIO HADSON BASTOS ; DOMINGOS, JORGE LUIZ COELHO ; FERREIRA, WANDEMBERG PAIVA ; FARIAS, GIL AQUINO ; NASCIMENTO, KYRIA SANTIAGO . Molecular dynamics and binding energy analysis of Vatairea guianensis lectin: a new tool for cancer studies. JOURNAL OF MOLECULAR MODELING , v. 26, p. 1-9, 2020.

• BORBA, A. D. ; DOMINGOS, JORGE L. C. ; MORAES, E. C. B. ; POTIGUAR, F. Q. ; FERREIRA, W. P. . Controlling the transport of active matter in disordered lattices of asymmetrical obstacles. PHYSICAL REVIEW E , v. 101, p. 022601-1-022601-7, 2020.

• RIBEIRO, H. E. ; FERREIRA, W. P. ; F. Q. Potiguar . Trapping and sorting of active matter in a periodic background potential. PHYSICAL REVIEW E , v. 101, p. 032126, 2020.

• CAVADA, B. S. ; Mayara Torquato Lima Silva ; OSTERNE, VINICIUS JOSE SILVA ; PINTO-JUNIOR, VANIR REIS ; LOSSIO, CLAUDIA FIGUEIREDO ; Juliana Costa Madeira ; Maria Gonçalves Pereira ; Rodrigo Bainy Leal ; FERREIRA, W. P. ; NASCIMENTO, K. S. ; ASSEURY, A. M. S. . Exploring the carbohydrate-binding ability of Canavalia bonariensis lectin in inflammation models. Journal of Molecular Recognition , v. e2870-, p. e2870-1-e2870-10, 2020.

• DE ARAÚJO, J. L. B. ; DE SOUSA, J. S. ; FERREIRA, W. P. ; OLIVEIRA, C. L. N. . Viscoelastic multiscaling in immersed networks. Physical Review Research , v. 2, p. 033222-1-033222-10, 2020.

• DOMINGOS, JORGE L. C. ; PEETERS, FRANÇOIS M. ; FERREIRA, W. P. . Self-assembly and clustering of magnetic peapod-like rods with tunable directional interaction. PLoS One , v. 13, p. e0195552, 2018.

• PINTO-JUNIOR, VANIR REIS ; OSTERNE, VINICIUS JOSÉ SILVA ; SANTIAGO, MAYARA QUEIROZ ; CORREIA, JORGE LUIS ALMEIDA ; PEREIRA-JUNIOR, FRANCISCO NASCIMENTO ; LEAL, RODRIGO BAINY ; PEREIRA, MARIA GONÇALVES ; CHICAS, LARISSA SILVA ; NAGANO, CELSO SHINITI ; ROCHA, BRUNO ANDERSON MATIAS ; SILVA-FILHO, JOSÉ CAETANO ; FERREIRA, WANDEMBERG PAIVA ; ROCHA, CÍNTIA RENATA COSTA ; NASCIMENTO, KYRIA SANTIAGO ; ASSREUY, ANA MARIA SAMPAIO ; CAVADA, BENILDO SOUSA . Structural studies of a vasorelaxant lectin from Dioclea reflexa Hook seeds: Crystal structure, molecular docking and dynamics. International Journal of Biological Macromolecules , v. 98, p. 12-23, 2017.

• DA COSTA, D R ; CHAVES, A ; Ferreira, W P ; Farias, G A ; FERREIRA, R . Electronic properties of superlattices on quantum rings. JOURNAL OF PHYSICS. CONDENSED MATTER (ONLINE) , v. 29, p. 165501, 2017.

• ARAUJO, J. L. B. ; Munarin, F. ; Farias, G A ; PEETERS, Francois M ; FERREIRA, W. P. . Structure and reentrant percolation in an inverse patchy colloidal system. PHYSICAL REVIEW E , v. 95, p. 062606, 2017.

• DOMINGOS, JORGE L. C. ; PEETERS, FRANÇOIS M. ; FERREIRA, W. P. . Self-assembly of rigid magnetic rods consisting of single dipolar beads in two dimensions. PHYSICAL REVIEW E , v. 96, p. 012603-1-012603-9, 2017.

• FROTA, D. A. ; CHAVES, A. ; FERREIRA, W. P. ; FARIAS, G. A. ; MILO?EVI', M. V. . Superconductor-ferromagnet bilayer under external drive: The role of vortex-antivortex matter. Journal of Applied Physics , v. 119, p. 093912, 2016.

• LEITE, L. R. ; Lucena, D. ; F. Q. Potiguar ; FERREIRA, W. P. . Depletion forces on circular and elliptical obstacles induced by active matter. PHYSICAL REVIEW E , v. 94, p. 062602, 2016.

• Lucena, D. ; GALVÁN-MOYA, J. E. ; FERREIRA, W. P. ; PEETERS, F. M. . Single-file and normal diffusion of magnetic colloids in modulated channels. Physical Review. E, Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics (Print) , v. 89, p. 032306, 2014.

• GALVÁN-MOYA, J. E. ; Lucena, D. ; FERREIRA, W. P. ; PEETERS, F. M. . Magnetic particles confined in a modulated channel: Structural transitions tunable by tilting a magnetic field. Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics) , v. 89, p. 032390, 2014.

• POTIGUAR, FABRICIO Q. ; FARIAS, G. A. ; FERREIRA, W. P. . Self-propelled particle transport in regular arrays of rigid asymmetric obstacles. Physical Review. E, Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics (Print) , v. 90, p. 012307, 2014.

• RAMOS, I. R. O. ; FERREIRA, W. P. ; MUNARIN, F. F. ; PEETERS, F. M. . Dynamical properties and melting of binary two-dimensional colloidal alloys. Physical Review. E, Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics (Print) , v. 90, p. 062311, 2014.

• Lucena, D. ; Ferreira, W. ; Munarin, F. ; Farias, G. ; Peeters, F. . Tunable diffusion of magnetic particles in a quasi-one-dimensional channel. Physical Review. E, Statistical, Nonlinear and Soft Matter Physics (Online) , v. 87, p. 012307-1-012307-9, 2013.

• Lucena, D. ; Tkachenko, D. ; Nelissen, K. ; Misko, V. ; Ferreira, W. ; Farias, G. ; Peeters, F. . Transition from single-file to two-dimensional diffusion of interacting particles in a quasi-one-dimensional channel. Physical Review. E, Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics (Print) , v. 85, p. 031147, 2012.

• Ramos, I. ; Ferreira, W. ; Munarin, F. ; Farias, G. ; Peeters, F. . Bilayer crystals of charged magnetic dipoles: Structure and phonon spectrum. Physical Review. E, Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics (Print) , v. 85, p. 051404, 2012.

• Carvalho, J. ; Nelissen, K. ; Ferreira, W. ; Farias, G. ; Peeters, F. . Diffusion in a quasi-one-dimensional system on a periodic substrate. Physical Review. E, Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics (Print) , v. 85, p. 021136, 2012.

• Carvalho, J. ; Ferreira, W. ; Farias, G. ; Peeters, F. . Yukawa particles confined in a channel and subject to a periodic potential: Ground state and normal modes. Physical Review. B, Condensed Matter and Materials Physics , v. 83, p. 094109, 2011.

• FERREIRA, W. P. ; Farias, G A ; Peeters, F M . A two-component mixture of charged particles confined in a channel: melting. Journal of Physics. Condensed Matter , v. 22, p. 285103, 2010.

• FERREIRA, W. P. ; CARVALHO, João Cláudio Nunes ; P. W. S. Oliveira ; FARIAS, Gil de Aquino ; PEETERS, Francois M . Structural and dynamical properties of quasi-one-dimensional binary system. Physical Review. B, Condensed Matter and Materials Physics , v. 77, p. 014112-1-014112-11, 2008.

• F. F. Munarin ; NELISSEN, Kwinten ; FERREIRA, W. P. ; FARIAS, Gil de Aquino ; PEETERS, Francois M . Hysteresis and reentrant melting of a self-organized system of classical particles confined in a parabolic trap. Physical Review. E, Statistical, Nonlinear and Soft Matter Physics , v. 77, p. 031608-1-031608-8, 2008.

• F. F. Munarin ; FERREIRA, W. P. ; FARIAS, Gil de Aquino ; PEETERS, Francois M . Ground state and normal-mode spectra of a two-dimensional system of dipole particles confined in a parabolic trap. Physical Review. E, Statistical, Nonlinear and Soft Matter Physics , v. 78, p. 031405-1-031405-12, 2008.

• FREITAS, Felipe Munarin de ; FERREIRA, W. P. ; FARIAS, Gil de Aquino ; PEETERS, Francois M . Molecular states of two vertically coupled systems of classical charged particles confined by a Coulomb potential. Physical Review. B, Condensed Matter and Materials Physics , v. 76, p. 035336, 2007.

• FERREIRA, W. P. ; FREITAS, Felipe Munarin de ; FARIAS, Gil de Aquino ; PEETERS, Francois M . Melting of a two-dimensional binary cluster of charged particles confined in a parabolic trap. Journal of Physics. Condensed Matter , v. 18, p. 9385-9401, 2006.

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• FERREIRA, W. P. ; FREITAS, Felipe Munarin de ; NELISSEN, Kwinten ; COSTA FILHO, Raimundo Nogueira ; PEETERS, Francois M ; FARIAS, Gil de Aquino . Structure, normal mode spectra and mixing of a binary system of charged particles confined in a parabolic trap. Physical Review E - Statistical Physics, Plasmas, Fluids and Related Interdisciplinary Topics , http://pre.aps.org, v. 72, p. 021406-1-021406-13, 2005.

• FERREIRA, W. P. ; PEETERS, Francois M ; FARIAS, Gil de Aquino . Melting and evaporation in classical two-dimensional clusters. Physical Review E - Statistical Physics, Plasmas, Fluids and Related Interdisciplinary Topics , v. 72, p. 041502-1-041502-7, 2005.

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• KONG, Minghui ; VAGOV, Alexei ; PARTOENS, Bart ; PEETERS, Francois M ; FERREIRA, W. P. ; FARIAS, Gil de Aquino . Nonlinear screening in large two-dimensional Coulomb clusters. Physical Review E - Statistical Physics, Plasmas, Fluids and Related Interdisciplinary Topics , v. 70, p. 051807-1-051807-6, 2004.

• FERREIRA, W. P. ; MATULIS, Algirdas ; FARIAS, Gil de Aquino ; PEETERS, Francois M . Structure and correlations effects in classical artifial atom confined by a Coulomb potential. Physical Review E - Statistical Physics, Plasmas, Fluids and Related Interdisciplinary Topics , v. 67, p. 046601-1-046601-8, 2003.

• FERREIRA, W. P. ; PEETERS, Francois M ; FARIAS, Gil de Aquino . Normal mode spectra of two-dimensional classical atoms confined by a Coulomb potential. Physical Review E. (Cessou em 2000. Cont. 1539-3755 Physical Review. E, Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics) , v. 68, p. 066405-1-066405-10, 2003.

• FERREIRA, W. P. ; CARMONA, H. A. ; FARIAS, Gil de Aquino ; PEETERS, Francois M . Structural transitions in a Classical two-dimensional molecule system. Solid State Communications , v. 122, n.12, p. 665-669, 2002.

• FERREIRA, W. P. ; MATULIS, Algirdas ; FARIAS, Gil de Aquino ; PEETERS, Francois M . Structure, dynamic properties, and correlations in 2D classical atificial atoms confined by Coulomb potential. In: International Meeting of the Belgian Physics Society, 2003, Gent, 2003.

• FERREIRA, W. P. ; MATIAS, J. G. N. ; JULIÃO, J. F. . Estudo do comportamento eletroquímico da interface CdS/polissulfeto por técnicas eletroquímicas. In: XI Simpósio Brasileiro de Eletroquímica e Eletroanalítica, 1999, Maragogi , AL. Anais, 1999. p. 52-53.

• FERREIRA, W. P. ; SILVA, M. A. A. ; MATIAS, J. G. N. ; JULIÃO, J. F. . Characterization of the CdS/polysulfide interface by Electrochemical Impedance Spectroscopy and Diferential Capacitance. In: II Workshop on Optoelectronic Materials and their applications (including solar cells), 1998, Havana, 1998.

• FERREIRA, W. P. ; PARTOENS, Bart ; PEETERS, Francois M ; FARIAS, Gil de Aquino . Structural phase transitions and unusual melting behavior in a classical 2D Coulomb bound cluster. In: XXVIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2005, Santos, 2005.

• FERREIRA, W. P. ; PARTOENS, Bart ; FARIAS, Gil de Aquino ; PEETERS, Francois M . Unusual melting behavior in small coulomb clusters. In: XXIII Encontro de Físicos do Norte e Nordeste, 2005, Alagoas, 2005.

• FERREIRA, W. P. ; MATULIS, Algirdas ; FARIAS, Gil de Aquino ; PEETERS, Francois M . Structure, dynamic properties, and correlations in 2D classical artificial atoms confined by a Coulomb potential. In: XXVII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2004, Poços de Caldas, 2004.

• FERREIRA, W. P. ; CARMONA, H. A. ; FARIAS, Gil de Aquino ; PEETERS, Francois M . Transição molécula-átomo clássico em um sistema 2D finito. In: XIX Encontro de Físicos do Norte e Nordeste, 2001, Natal, 2001.

• FERREIRA, W. P. ; JULIÃO, J. F. ; MATIAS, J. G. N. ; SILVA, M. A. A. . Caracterização da interface CdS/Polissulfeto por espectroscopia de impedância eletroquímica. In: XXI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 1998, Caxambú, 1998.

• FERREIRA, W. P. ; SILVA, M. A. A. ; MATIAS, J. G. N. ; JULIÃO, J. F. . Estudo da interface CdS/Polissulfeto para filmes tratados termicamente em diferentes atmosferas. In: XVI Encontro de Físicos do Norte e Nordeste, 1998, São Luís, MA, 1998.

• FERREIRA, W. P. ; MATIAS, J. G. N. ; JULIÃO, J. F. ; SILVA, M. A. A. ; SANTANA, J. A. A. ; SALES, E. O. P. . Efeitos do potencial de crescimento nas propriedades eletro-óticas da interface CdS/Polissulfeto. In: XVI Encontro de Físicos do Norte e Nordeste, 1998, São Luís, 1998.

• FERREIRA, W. P. ; JULIÃO, J. F. . Estudo de Filmes de CdS por espectroscopia de Impedância Eletroquímica. In: XV Encontro de Físicos do Norte e Nordeste, 1997, Natal, 1997.

• FERREIRA, W. P. ; SIQUEIRA, A. F. . Modelagem Monte Carlo do Sistema imunológico. In: XIII Encontro de Físicos do Norte e Nordeste, 1995, Salvador, 1995.

• FERREIRA, W. P. ; JULIÃO, J. F. . Medidas de constante dielétrica de filmes anódicos de pentóxido de nióbo. In: XII Encontro de Físicos do Norte e Nordeste, 1994, Fortaleza, 1994.

• FERREIRA, W. P. ; JULIÃO, J. F. . Índice de refração de filmes de pentóxido de nióbio Nb2O_{5}. In: XI encontro de Físicos do Norte e Nordeste, 1993, João Pessoa, 1993.

• CAVADA, BENILDO SOUSA ; OSTERNE, VINICIUS JOSE SILVA ; OLIVEIRA, MESSIAS VITAL ; FERREIRA, WANDEMBERG PAIVA ; NETO, CORNEVILE CORREIA ; NASCIMENTO, KYRIA SANTIAGO ; PINTO-JUNIOR, VANIR REIS . Bridging Viral Glycobiology and Lectin Biotechnology for Antiviral and Diagnostic Strategies. Acs Bio & Med Chem Au , 2025.

• Igor Rochaid Oliveira Ramos ; FERREIRA, W. P. ; FARIAS, Gil de Aquino ; PEETERS, Francois M . XXIX Encontro de Físicos do Norte e Nordeste. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Projetos de pesquisa

• 2023 - 2024

  Aplicações de dinâmica molecular e mecânica estatística em fluidos complexos, Descrição: Projeto de Iniciação Científica. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Wandemberg Paiva Ferreira - Coordenador / Matheus Figueiredo Bravo - Integrante / Emerson Mesquita Guimarães - Integrante.

• 2022 - Atual

  Estudo de Fluidos Complexos, Descrição: O projeto de pesquisa presente visa contribuições científicas e formação de recursos humanos. Especificamente:- Contribuir para o entendimento da dinâmica de sistemas ativos, intrinsecamente fora do equilíbrio, confinados em substratos padronizados;- Estudar a termodinâmica de sistemas ativos confinados, caracterizando a performance de trabalho extraído destes sistemas;Em todos objetivos deste projeto haverá participação de estudantes de pós-graduação e, eventualmente, de graduação (iniciaçãocientífica).. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Wandemberg Paiva Ferreira - Coordenador / DOMINGOS, JORGE L. C. - Integrante / Jessé Pereira de Oliveira - Integrante / EVERTON ALMEIDA DE FREITAS - Integrante.

• 2018 - Atual

  Theoretical and experimental bases for the development of biosensors based on nanomaterials and lectins for detection of tumor cells, Descrição: Brazil is home of world's largest biodiversity asset with more than 20% of the world's total species. It is fundamental that Brazil intensifies researches aiming for a better use of your biodiversity, mainly because its biodiversity occupies an important place in the national economy [1]. Bioprospecting, isolating, characterizing and applying purified compounds from the Brazilian flora is an enormous challenge that adds value to biodiversity and contributes to the socio-economic development of the country. Among the components in nature, lectins enclose a group of proteins of nonimmune origin, widely distributed in nature, with very high biotechnological potential due to their property of deciphering, in a specific and reversible way, the cellular glycocode [2]. Some lectins are commercially available for isolation and detection of glycocans, some of which can indicate diseases such as cancer when aberrantly expressed [3,4,]. A way to diagnose such diseases is to monitor changes in glycosylations patterns [5]. Lectins have been used to detect and characterize tumor cell biomarkers using tools such as ELISA and lectin array. However, such techniques exhibit disadvantages such as low sensitivity and need for labeling during the assay [6,7]. Surface chemistry is a new field of science that has brought numerous important applications for lectins [8,9]. These molecules when functionalized in different nanomaterials offer the facility to design cost-effective sensors for desired applications and specifications (sensitivity and selectivity) [10, 11, 12]. With progress in materials science and nanotechnology, lectins were integrated into several biosensor projects providing a diagnostic tool for diseases with low levels of biomarkers, that could detect cancer in the tumor initial stage [13]. Currently, initial diagnosis of brain cancer (glioma) is extremely difficult and this is one of the reasons for treatment failure. Developing a biosensor to detect early stages of tumor emergence will greatly contribute to patients survival. However, the low number of lectins available in the market is a limiting factor for the development of sensors for the various existing diseases. In this sense, this project aims to bioprospect new lectins of Brazilian flora, chemically and structurally characterize, evaluate the interaction of new lectins, and others already discovered, with different types of glycans and nanomaterials and develop a biosensor capable of detecting glioma. 1. http://www.mma.gov.br/mma-em-numeros/biodiversidade-flora [Accessed 28 Feb. 2018]. 2. André, S, et.al. 2015. Lectins: Getting Familiar with Translators of the Sugar Code. Molecules, 20:12, p.1788-. 3. Santos, A, et al. 2014 Lectins: Function, structure, biological properties and potential applications. Cur Top Pep Prot Res., 15, p. 41-. 4. Dan, X, et.al. 2015. Development and Applications of Lectins as Biological Tools in Biomedical Research. Med. Res Reviews, 36:2, p.221-. 5. Paleček, E, et al. 2015. Electrochemistry of Nonconjugated Proteins and Glycoproteins. Toward Sensors for Biomedicine and Glycomics. Chem Rev, 115:5, p.2045-. 6. Svarovsky, S et al. 2014. Cancer glycan biomarkers and their detection ? past, present and future. Anal. Methods, 6:12, p.3918-. 7. Katrlík, J, et.al. 2010. Glycan and lectin microarrays for glycomics and medicinal applications. Med. Res Rev, 30:2, p. 394-. 8. Ling, X, et.al. 2015. The renaissance of black phosphorus. PNAS, 112:15, p.4523-. 9. Novoselov, K 2004. Electric Field Effect in Atomically Thin Carbon Films. Science, 306(5696), p.666-. 10. Coulibaly, F. et al. 2014. Concanavalin A?Polysaccharides binding affinity analysis using a quartz crystal microbalance. Bios Bioelect, 59, p.404-. 11. Bezerra, R, et.al. 2017. Design of a lipase-nano particle biocatalysts and its use in the kinetic resolution of medicament precursors. Biochem E. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (5) . , Integrantes: Wandemberg Paiva Ferreira - Integrante / Gil de Aquino Farias - Integrante / Raimundo Nogueira Costa Filho - Integrante / João Milton Pereira Júnior - Integrante / Jeanlex Soares de Sousa - Integrante / Andrey Chaves - Integrante / François Maria Leopold Peeters - Integrante / Benildo Sousa Cavada - Coordenador / Kyria Santiago do Nascimento - Integrante / Pierre Basílio Almeida Fechine - Integrante / Manfred Radmacher - Integrante / SELMA. E. Mazzetto - Integrante / Els Van Damme - Integrante / Giuseppe A. Mele - Integrante.

• 2016 - Atual

  NÚCLEO DE EXCELÊNCIA EM BIOQUÍMICA, BIOLOGIA ESTRUTURAL E MOLECULAR E SIMULAÇÃO MOLECULAR DE PROTEÍNAS (NATIVAS E RECOMBINANTES) DE ESPÉCIES VEGETAIS DO CARIRI COM POTENCIAL INFLAMATÓRIO, Descrição: A presente proposta, Núcleo de excelência em bioquímica, biologia estrutural e molecular e simulação molecular de proteínas (nativas e recombinantes) de espécies vegetais do Cariri com potencial inflamatório, tem a peculiaridade de lançar desafios em interfaces (bioquímica, farmacologia e a física, passando por recursos de informática específicos) que abrem novas fronteiras e geram novos desafios. O Ceará tem uma longa tradição no estudo de biomoléculas advindas da sua biodiversidade, quer no isolamento dessas moléculas, quer no estudo farmacológico das mesmas. Por outro lado, o Ceará possui uma massa crítica reconhecida nacional e internacionalmente, fundamentada num dos melhores Programas de Pós- graduação na área de Física no Norte/Nordeste do Brasil. Desta forma, esta proposta se destina tanto a avançar numa interação consolidada como em aprofundar novas fronteiras do conhecimento. Por um lado, esse projeto visa prospectar e aprofundar o estudo de moléculas biologicamente ativas de recursos naturais de nossa flora, em especial de espécies nativas e endêmicas do Cariri. Neste cenário, o presente estudo irá focar em um grupo específico de proteínas, as lectinas, definidas como moléculas que possuem pelo menos um domínio de ligação específica e reversível a carboidratos, característica que permite uma grande variabilidade de aplicações biológicas. Desta forma, pretende-se, a partir do desenvolvimento desta proposta, detectar, isolar, purificar e caracterizar (físico química e estruturalmente) novas lectinas de espécies nativas da região do Cariri e produzir algumas delas na forma recombinante a partir de seus respectivos genes, avaliar os efeitos destas lectinas sobre os aspectos fisiopatológicos da inflamação. Assim, algumas das lectinas purificadas serão testadas em processos inflamatórios, em nocicepção inerente a inflamação e em disfunção endotelial induzidas por processos inflamatórios. Além disto, algumas destas moléculas serão selecionadas, levando-se em conta seus potenciais de atividades relacionadas à inflamação, e destinadas a estudos estruturais utilizando ferramentas teóricas e experimentais para investigar fatores que influenciem a ligação das lectinas à seus ligantes específicos. Isso será realizado atravésde simulações, modelagens moleculares e cálculo ab initio de química quântica para determinar os potenciais de interação entre lectinas e alguns de seus ligantes específicos,. A interação de átomos quimicamente ligados é usualmente representada por molas virtuais e ângulos entre ligações, que variam no tempo e representam vibrações moleculares e torções das ligações. Também serão utilizados, em algumas situações, métodos de dinâmica molecular para determinar os fatores que contribuem para a ligação proteína-ligante (lectina-glicoconjugado). Os resultados serão comparados a dados experimentais de atividades de cada proteína. Sempre que possível, ou necessário, abordagens de simulações moleculares entre lectinas e ligantes serão utilizadas. Por outro lado, a proposta pretende nuclear um novo grupo na região sul do Estado do Ceará, favorecendo a interiorização de uma forma interdisciplinar da pesquisa científica, envolvendo professores lotados também em Instituição de Ensino Superior no interior, como a Universidade Federal do Cariri. Toda essa proposta está, implicitamente, fundamentada em uma forte política de formação de recursos humanos através dos Programas de Pós-graduação que envolvem os pesquisadores da mesma.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (6) / Doutorado: (14) . , Integrantes: Wandemberg Paiva Ferreira - Integrante / Gil de Aquino Farias - Integrante / Jenalex Sousa Soares - Integrante / Benildo Sousa Cavada - Coordenador / Ana Maria Sampaio Asseury - Integrante / Kyria Santiago do Nascimento - Integrante / Alana de Freitas Pires - Integrante / Ricardo Luiz Lange Ness - Integrante / Silvério de Paiva Freitas Junior - Integrante / Francisco Nascimento Pereira Junior - Integrante / Mario Rogerio Lima Mota - Integrante / Jorge Luis Almeida Correia - Integrante.

• 2013 - 2017

  Nano-materials in 2D, Descrição: The project deals with two-dimensional (mesoscopic and atomic) materials and consists essentially of two main parts: - Strongly correlated classical systems: patchy particles in 2D - Graphene nanostructures Both subjects are currently very timely. They also provide different physics and require different methodology (e.g. classical mechanics versus quantum mechanics). The present project focuses on the following two areas: - Pure and natural sciences - Nanotechnology and new materials. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (4) . , Integrantes: Wandemberg Paiva Ferreira - Coordenador / Francois M Peeters - Integrante / Gil de Aquino Farias - Integrante / João Milton Pereira Júnior - Integrante / Jeanlex Soares de Sousa - Integrante / Andrey Chaves - Integrante / Felipe de Freitas Munarin - Integrante.

• 2013 - 2017

  Estudo de sistemas coloidais do tipo, Descrição: O objetivo central desta nova etapa de trabalho é o estudo de sistemas bi-dimensionais (2D) de partículas coloidais carregadas do tipo patchy (PCCP). Partícula do tipo patchy é a denominação geral dada a uma nova classe de partículas coloidais com interação anisotrópica devido a sítios atrativos (ou repulsivos) que são localizados, em princípio, de forma ordenada, ou seja, em posições que geram geometrias precisas, sobre a superfície da partícula. Modelos físicos de sistemas do tipo patchy são de grande interesse científico graças à sintetização dessas novas partículas coloidais, não necessariamente carregadas. O caso específico em que as partículas decoradas são carregadas (PCCP) é de particular interessante científico, visto que muitas proteínas biológicas são estruturas que apresentam características similares do ponto de vista da interação entre seus constituintes. A anisotropia na interação, sob certas condições, gera um número limitado de ligações (valências), que está associado ao número de sítios ativos na superfície das partículas. Essas características são determinantes para as propriedades físicas do sistema. A variação no número de sítios ativos, o tamanho desses sítios, bem como sua localização sobre a partícula geram efeitos em fenômenos físicos como auto-organização e processos dinâmicos. Neste projeto, estudaremos através de simulação computacional e métodos analíticos processos de auto-organização, com especial atenção à estabilidade termodinâmica das estruturas obtidas, inicialmente em função da extensão e intensidade da anisotropia na superfície das PCCP. Consideraremos partículas esféricas decoradas com sítios ativos carregados localizados não somente de forma ordenada, mas também aleatória, sobre a partícula. Atenção especial será dada às propriedades dinâmicas, destacando o estudo do processo de difusão. Vale ressaltar que, pelo conhecimento do proponente, sistemas com PCCP não foram ainda estudados de acordo com a proposta aqui a. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Wandemberg Paiva Ferreira - Coordenador / Jorge Luiz Bezerra Araújo - Integrante / Felipe de Freitas Munarin - Integrante / Jorge Luiz Coelho Domingos - Integrante.

• 2013 - 2015

  Auto-organização de partículas do tipo ?patchy? para aplicações em nanotecnologia, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (4) . , Integrantes: Wandemberg Paiva Ferreira - Coordenador / Farias, G A - Integrante / Felipe de Freitas Munarin - Integrante.

• 2012 - 2015

  Sistemas de baixa dimensionalidade: auto-organização, propriedades dinâmicas e de transporte, Descrição: O presente projeto de pesquisa consiste no estudo da auto-organização e modelagem de processos dinâmicos em sistemas de baixa dimensionalidade utilizando-se técnicas de Física computacional e da Matéria Condensada. As investigações a serem realizadas se enquadram nas linhas de pesquisa que constituem, hoje, a fronteira do conhecimento em sistemas de baixa dimensionalidade, com ênfase em Física Teórica e Computacional. A abordagem das pesquisas encontra aplicação em diferentes áreas científico-tecnológicas, desde o estudo de processos de auto-organização em sistemas coloidais ao estudo de transporte de carga em estruturas de carbono (grafeno), passando pelas propriedades eletrônicas e ópticas de sistemas eletrônicos do tipo disposistivos eletrônicos semicondutores (MOSFETs), dispositivos de memória não-volátil e células fotovoltáicas baseadas em nanoestruturas, que estão intimamente associados à nanotecnologia. Para cada uma dessas aplicações, expomos abaixo uma descrição detalhada da metodologia adotada nas pesquisas a serem desenvolvidas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (4) . , Integrantes: Wandemberg Paiva Ferreira - Integrante / Felipe de Freitas Munarin - Integrante / João Milton Pereira Júnior - Integrante / Jeanlex Soares de Sousa - Integrante / Farias, G A - Integrante / Raimundo Nogueira da Costa Filho - Coordenador / Andrey Chaves - Integrante.

• 2010 - 2013

  Caracterização de sistemas coloidais em estruturas de mono-, bi- e multicamadas, Descrição: (Projeto de bolsa de pesquisa/CNPq) O objetivo central desta nova etapa de trabalho é a caracterização das fases estruturais de sistemas bidimensionais (2D) de partículas coloidais, mono- e bi-dispersos, sujeitos a interações coulombiana blindada (tipo Debye-Hückel) e/ou magnética dipolar, em duas configurações específicas: 1) no primeiro caso, o sistema será submetido a um potencial de confinamento parabólico perpendicular ao plano (centrado em z=0), de modo que um grau de liberdade extra nesta direção, é introduzido. Em baixa densidade, o potencial de confinamento é suficiente para que o sistema se auto-organize em uma configuração puramente 2D. Para valores suficientes de densidade, a repulsão entre as partículas coloidais é suficiente para gerar estruturas multicamadas. Um dos objetivos aqui é caracterizar as estruturas de equilíbrio desse sistema quasi-2D em função da densidade e outros parâmetros, como por exemplo, o parâmetro de blindagem do potencial de interação Debye-Hückel e a intensidade relativa entre as interações elétricas e magnéticas (quando for o caso de partículas coloidais carregadas e com momento de dipolo magnético intrínseco). 2) No segundo caso, não há o potencial de confinamento externo, de modo que as partículas são assumidas se auto-organizar em um arranjo de bicamadas. Ou seja, as partículas estão restritas a se posicionar em planos paralelos. A estrutura cristalina resultante em cada plano será estudada em função da densidade e separação entre camadas, além de parâmetros anteriormente citados. Além do diagrama de fase em temperatura zero, as vibrações de rede dos sistemas serão analisadas através do espectro dos modos normais de vibração. Pretende-se ainda estudar o comportamento das fases estruturais em função da temperatura, caracterizando assim a transição sólido-líquido, de acordo com o critério de Lindemann. Especificamente, os estudos propostos serão realizados via procedimentos de simulação atomística clássica (Monte. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Wandemberg Paiva Ferreira - Coordenador / Igor Rochaid Oliveira Ramos - Integrante.

• 2010 - 2012

  Auto-organização, propriedades eletrônicas e processos dinâmicos em sistemas de baixa dimensionalidade, Descrição: (Projeto de cooperação bilateral Brasil-Bélgica (CNPq-FWO)) Sistemas compostos por um grande número de agentes interatuantes apresentam comportamento complexo o qual pode atualmente ser abordado, em muitos aspectos, de maneira bastante precisa através de métodos de física teórica e computacional. Grande parte do complexo comportamento do sistema é conseqüência da correlação entre seus muitos componentes, fato que gera propriedades físicas não-triviais. O grande avanço na capacidade dos computadores observado na última década promoveu também avanços em softwares, motivando físicos teóricos a estudar problemas fundamentais complexos que surgiram na pesquisa de ponta em física experimental. Do lado experimental, observa-se também um grande avanço na produção e desenvolvimento de materiais compósitos auto-organizados, de diferentes tamanhos e formas, com dimensões nas escalas micro- e nano-métrica. Esses diferentes sistemas físicos são objetos de intensa atividade científica devido suas novas e marcantes caracterísitcas, com grande potencial de aplicabilidade em diversos campos, que vão desde ciência físicas básica, passando por aplicações em ciências de materiais, biotecnologia e até medicina. É interessante também notar que uma visão bastante geral de pesquisas recentes revela muitos aspectos comuns em sistemas aparentemente não-correlacionados, de modo a motivar um grande esforço científico no entendimento, tanto do ponto de vista fundamental, quanto de aplicação, de tais sistemas. Outro aspecto relevante é a análise de processos dinâmicos que englobam um grande número de agentes interatuantes, ou ainda fenômenos de transporte através de substratos reticulados regulares ou desordenados. Estes são apectos importantes de sistemas de muitos corpos, onde, somente com uma descrição minunciosa de sua topologia, unidades elementares e interações microscópicas, é possível elucidar as diversas e intrincadas nuances de seus comportamentos globais. Exemplos típicos destes. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (4) Doutorado: (6) . , Integrantes: Wandemberg Paiva Ferreira - Integrante / Gil de Aquino Farias - Coordenador / Felipe de Freitas Munarin - Integrante / Jenalex Sousa Soares - Integrante / João Milton Pereira Júnior - Integrante / Nilson Sena de Almeida - Integrante., Financiador(es): Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen - Cooperação / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2009 - 2013

  Programa Núcleo de Excelência em "Processos dinâmicos e fenômenos de transporte em sistemas complexos", Descrição: Processos dinâmicos que englobam um grande número de agentes inter-atuantes, relacionando-se através de uma rede hierárquica, ou fenômenos de transporte através de substratos reticulados regulares ou desordenados são exemplos importantes de sistemas complexos, onde somente uma descrição minuciosa da sua topologia, unidades elementares e interações microscópicas pode elucidar as diversas e intrincadas nuances de seus comportamentos globais. Exemplos típicos destes sistemas ocorrendo em escalas espaciais substancialmente diferentes e em diversas áreas do conhecimento incluem o transporte de elétrons em nanoestruturas [1], a propagação de informações em redes sociais [2], o escoamento de óleo, água e gás em campos petrolíferos [3-5] e o transporte de partículas (aerossóis) na rede pulmonar. Sabe-se hoje que a existência de comportamentos emergentes em sistemas complexos reais, tais como auto-organização, criticalidade, e invariância de escala está freqüentemente associada à relação intrínseca entre a topologia e a fenomenologia do problema. Além disto, fica claro que o aumento da quantidade de informação científica deve caminhar conjuntamente com o desenvolvimento de ferramentas de análises sistêmicas que sejam capazes de evidenciar a origem dos mecanismos que regulam as propriedades globais dos sistemas complexos, sejam eles em escala microscópica ou macroscópica.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (5) Doutorado: (10) . , Integrantes: Wandemberg Paiva Ferreira - Integrante / Felipe de Freitas Munarin - Integrante / Jenalex Sousa Soares - Integrante / André Auto Moreira - Integrante / João Milton Pereira Júnior - Integrante / Ascânio Dias de Araújo - Integrante / Eric Josef Ribeiro Parteli - Integrante / José Soares de Andrade Júnior - Coordenador., Financiador(es): Fundação Cearense de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2009 - 2011

  Estabilidade, propriedades dinâmicas e transição sólido- líquido em sistemas clássicos de bi-camadas coloidais, Descrição: Um aglomerado de partículas interagindo fortemente pode apresentar uma fase de cristalização, dependendo dos valores de densidade e temperatura. Esta condição geral é observada em sistemas de natureza bastante distinta, de modo que o estudo das propriedades dessa fase estrutural é de interesse fundamental. O fenômeno de cristalização em um gás de elétrons foi previsto por E. P. Wigner, em 1934. Evidência experimental de tal previsão ocorreu somente em 1979, em um sistema bi-dimensional de elétrons em superfície de hélio líquido [2]. A estrutura cristalina observada é usualmente denominada de cristal de Wigner. Atualmente, o fenômeno de cristalização de Wigner é observado em diversos sistemas não- eletrônicos, e o termo cristal de Wigner é também usado em um sentido amplo para aglomerados de partículas com forte interação. Exemplos podem ser encontrados em sistemas bastante diferentes tais como: dispersões coloidais, plasmas complexos, sistemas biológicos, aglomerados atômicos e moleculares e esferas metálicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Wandemberg Paiva Ferreira - Coordenador / Igor Rochaid Oliveira Ramos - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.