Júlia Bizatto

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Projetos de pesquisa

• 2019 - Atual

  Avaliação da suplementação com Lactobacillus plantarum 299v em parâmetros comumente avaliados para se determinar a severidade da sepse, Descrição: A sepse é uma infecção causada por micro-organismos (bactérias, fungos, parasitas e vírus) que acessam a corrente sanguínea, desencadeando a síndrome da resposta inflamatória sistêmica (SIRS - Systemic Inflammatory Response Syndrome). Apesar dos esforços no controle da sepse, ainda não há tratamento adequado para diminuir a mortalidade dos pacientes com essa patologia. A suplementação com probiótico de Lactobacillus plantarum 299 possui efeitos benéficos em diversas patologias. Portanto, este trabalho tem como objetivo avaliar as consequências da suplementação com L. plantarum 299v no processo de sepse. Os animais serão divididos em 2 grupos principais: grupo controle que não receberá a suplementação com probiótico e o grupo tratado que receberá a suplementação com probiótico. A sepse será induzida através da perfuração do ceco e após o grupo tratado receberá 1 mL/dia (1010 UFC) e 1 mL/dia (1012 UFC) por 5 dias de probiótico. Após o tratamento, serão avaliados: pressão arterial média, frequência cardíaca, reatividade vascular, atividade enzimática da Mieloperoxidase, funcionamento renal e verificação da liberação de lactato, enzima óxido nítrico sintase induzida (NOS-2) histopatologia do pulmão e rim e determinação das citocinas inflamatória IL-6 e TNF-α.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Júlia Bizatto - Integrante / Geisson Marcos Nardi - Coordenador / Glecierle Rodrigues - Integrante.

• 2013 - 2014

  Avaliação da utilização de dados de encalhes de cetáceos como um estimador da diversidade do grupo em águas adjacentes, Descrição: A diversidade está relacionada com a riqueza de espécies de uma determinada área, onde do número total de espécies, uma pequena parte se refere a indivíduos abundantes ou dominantes, e uma grande parte trata-se de indivíduos raros. Vários índices são utilizados para medir a diversidade e riqueza em um ambiente, entre eles estão os índices de Shannon, Simpson, Rarefação. Jackknife (1 e 2), Chao (1 e 2) e Bootstrap. O ambiente marinho possui grande diversidade de espécies, porém o ambiente é limitado e um pequeno percentual de animais que morre ao largo da costa acaba encalhando. Então busca-se avaliar se os dados de encalhes fornecem informação de diversidade e riqueza de ambientes marinhos adjacentes à tais ocorrências. O estudo compreendeu os estados de Espírito Santo, Rio de Janeiro, São Paulo, Paraná, Santa Catarina e Rio Grande do Sul. As informações para tal estudo foram extraídas dos dados atualizados do SIMMAM, no período de 1980 à 2012. A amostra foi analisada como um todo e depois separada nas quatro áreas de estudo, com os modelos de análise individual based e sample based e foram construídas curvas de rarefação a fim de comparar as avistagens e os encalhes. Os encalhes forneceram 40 espécies e as avistagens 29 espécies. O maior número de espécies em encalhes foi na área 4 (27 espécies) e de avistagens na área 3 (27 espécies). Para a amostra toda não foi válido utilizar os dados de encalhes para estimar a riqueza do ambiente marinho adjacente. Porém com as áreas separadas, a maior parte das curvas mostrou que é possível utilizar dados de encalhes para estimar a riqueza do ambiente marinho. Apesar dos entraves, os encalhes são uma fonte eficiente para estimar a riqueza do ambiente marinho adjacente, uma vez que apresentou maior riqueza do que as avistagens em áreas próximas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Júlia Bizatto - Integrante / Dr. Andre Silva Barreto - Coordenador.

• 2012 - 2015

  Clonagem e expressão de lípases e celulases prospectadas a partir de dados metagenômicos de oceano profundo, Descrição: Enzimas são catalisadores que apresentam grande aplicação no setor industrial. Entre os principais agentes empregados neste setor podem ser descritas as enzimas celulases e as lípases/esterases. As celulases e lípases se destacam na indústria têxtil, de detergentes, alimentos, síntese orgânica e biocombustível. Para tanto, é necessário que sejam, muitas vezes, ativas sob condições extremas (temperatura, pH, etc.). Assim, a prospecção de enzimas mais adaptadas é constante e de grande relevância socioeconômica. Devido às características extremas do ambiente onde vivem, bactérias marinhas de profundidade podem representar um excelente reservatório de enzimas com características diferenciadas. Neste contexto, o presente projeto visa clonar e expressar genes ativos de celulases e lípases bacterianas, prospectados a partir de dados de metagenômica de sedimento e água marinha profunda do Oceano Atlântico-Sul. Será adotada a estratégia de triagem de dados de metagenômica, no qual todo o DNA presente em uma amostra será sequenciado (Next Generation Sequencing). Para tanto, amostras (sedimento/água marinha) de profundida do Oceano Atlântico-Sul foram coletadas em embarques oceanográficos (NOc. Antares - Marinha Brasileira e NOc. Akademik Ioffe ? Instituto Shirshov de Oceanologia da Rússia). A partir de duas amostras de água (filtro Sterivex) e três de sedimento o DNA ambiental será isolado com kits comerciais (Mobio e Qiagen). O mesmo será sequenciado (1 Gb) na EMBRAPA Meio Ambiente. Posteriormente, as sequencias de DNA serão triadas por ferramentas de bioinformática (CLC genomics Workbench, Blastx, etc.) quanto à presença de genes de celulases (beta-glucosidase, endoglucanase, exoglucanase) e lípases/esterases. A amostra que apresentar superior quantidade/diversidade de sequências alvo será selecionada para nova etapa de sequenciamento - 12-16 Gigabases (Macrogen).. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Júlia Bizatto - Integrante / Dr. Andre Oliveira de Souza Lima - Coordenador / Dra. Angelica Cavalett - Integrante / Jessica Pedrini - Integrante / Fernando Dini Andreote - Integrante / Marcus Adonai Castro da Silva - Integrante / Francisco Carlos Deschamps - Integrante / Luismar Marques Porto - Integrante / Fábio L. Soares Júnior - Integrante.

• 2012 - 2014

  Prospecção de celulases a partir de dados de metagenômica de água marinha profunda do Atlântico Sul, Descrição: Celulases compõem um grupo de enzimas amplamente exploradas na indústria (têxtil, alimentos, biocombustível, etc.). Para tanto, é necessário que sejam, muitas vezes, ativas sob condições extremas (temperatura, pH, etc.). Assim, a prospecção de enzimas mais adaptadas é constante e de grande relevância socioeconômica. Devido as características extremas do ambiente onde vivem, bactérias marinhas de profundidade podem representar um excelente reservatório de enzimas com características diferenciadas. Neste contexto, o presente projeto visa bioprospectar genes ativos de celulases bacteriana, a partir de dados de metagenômica de água marinha profunda ? Elevação do Rio Grande (Oceano Atlântico Sul). Será adotada a estratégia de triagem de dados de metagenômica, no qual todo o DNA presente em uma amostra é sequenciado (Next Generation Sequencing). Portanto, tem-se disponível, para seleção das celulases, tanto os genes codificados pelos organismos cultiváveis como não cultiváveis em laboratório. Esta moderna abordagem tem proporcionado descoberta de novas moléculas com aplicação biotecnológica. A partir de um filtro (Steripack 10) onde foi processada água marinha (40L, 2000m profundidade), o DNA será extraído (Sterivex? DNA Isolation Kit) e sequenciado (1 Gigabases) na Empresa Macrogen (Coréia do Sul). Posteriormente, a sequencia de DNA será triada por ferramentas de bioinformática (CLC genomics e PFAM) quanto a presença de genes de celulases (beta-glucosidase, endoglucanase, exoglucanase). Os genes (2-4 genes/enzima) completos identificados serão amplificados e traduzidos in vitro para avaliação de sua atividade sobre substratos fluorogênicos (metilumbeliferil ligado à açúcares). Espera-se que a combinação da eficiência da metagenômica, em gerar informação, somada a biodiversidade peculiar do ambiente marinho extremo, permitam a identificação de celulases de grande relevância tecnológica. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Júlia Bizatto - Integrante / Dr. Andre Oliveira de Souza Lima - Coordenador / Dra. Angelica Cavalett - Integrante / Jessica Pedrini - Integrante / Fernando Dini Andreote - Integrante.

• 2012 - 2013

  Clonagem e expressão heteróloga de lipases codificadas pela bactéria marinha de profundidade Bacillus stratosphericus LAMA 585, Descrição: Enzimas são catalisadores que apresentam grande aplicação no setor industrial. Entre os principais agentes empregados, as lipases se destacam na indústria de detergentes, alimentos, síntese orgânica e transesterificação de biodiesel. Devido à heterogeneidade das condições de uso destas enzimas, lipases com características diferenciadas de atividade (especificidade, estabilidade, etc) são de relevância biotecnológica. Neste contexto, o objetivo deste trabalho foi clonar e expressar genes de lipases ativas de Bacillus stratosphericus LAMA585 em Escherichia coli. A linhagem de Bacillus em questão foi isolada a partir de amostras de sedimento marinho de profundidade (5.000m profundidade) é já selecionada devido à capacidade de produzir lipases. Devido ao fato de proceder de um ambiente extremo, espera-se que este organismo possa produzir ljpases com características diferenciadas. Com o genoma do Bacillus stratosphericus LAMA585 já sequenciado, foram desenhados os primers e realizada a amplificação do DNA em 64°C com DNA diluído 1:5. A clonagem foi realizada em 3 etapas: 1- ligação; 2 - transformação e 3 - recuperação de clones, utilizando células quimiocompetentes (DH5α). Através desse estudo, foi possível verificar que o organismo Bacillus stratosphericus foi capaz de fornecer uma lipase funcional ao ser clonada em Escherichia coli.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Júlia Bizatto - Integrante / Dr. Andre Oliveira de Souza Lima - Coordenador / Dra. Angelica Cavalett - Integrante / Jessica Pedrini - Integrante.