Jessé de Barros Lobato

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em eventos

Produções bibliográficas

• Ribeiro-dos-Santos, Ândrea ; Khayat, André S. ; Silva, Artur ; Alencar, Dayse O. ; BARROS-LOBATO, J. ; Luz, Larissa ; Pinheiro, Daniel G. ; Varuzza, Leonardo ; Assumpção, Monica ; Assumpção, Paulo ; Santos, Sidney ; Zanette, Dalila L. ; Silva, Wilson A. ; Burbano, Rommel ; DARNET, Sylvain . Ultra-Deep Sequencing Reveals the microRNA Expression Pattern of the Human Stomach. Plos One , v. 5, p. e13205, 2010.

• Ribeiro-dos-Santos, Ândrea ; Khayat, André S. ; Silva, Artur ; Alencar, Dayse O. ; BARROS-LOBATO, J. ; Luz, Larissa ; Pinheiro, Daniel G. ; Varuzza, Leonardo ; Assumpção, Monica ; Assumpção, Paulo ; Santos, Sidney ; Zanette, Dalila L. ; Silva Jr, WA ; Burbano, Rommel ; Darnet, Sylvain . Ultra-Deep Sequencing Reveals the microRNA Expression Pattern of the Human Stomach. PLoS One , v. 5, p. e13205, 2010.

• GOMES, L. L. ; FEIO-DOS-SANTOS, A. C. ; CARVALHO, B. M. ; BARROS-LOBATO, J. ; GOMES, J. M. ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, A. K. ; NEVES, A. R. M. ; Oliveira, RCL . Aplicação de Redes Neurais Artificiais na Classificação dos Haplogrupos Ameríndio e Africano a partir da Análise do DNA Mitocondrial. In: VIII Congresso Brasileiro de Redes Neurais, 2007, Florianopólis - SC. VIII Congresso Brasileiro de Redes Neurais, 2007.

• GOMES, L. L. ; OLIVEIRA, D. ; BARROS-LOBATO, J. ; GOMES, J. M. ; SANTOS, S. E. B. ; BURBANO, R. ; ASSUMPCAO, P. ; KHAYAT, A. ; ARAUJO, W. ; PINHEIRO, D. ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, A. K. . Advances in Gastric Cancer Research: MicroRNA-Transcriptomics Approach Using SOLID System. In: 5ht Internacional Conference of the Brazilian Assiciation for Bioinformatics and Computational Biology, 2009, Angra dos Reis. ADVANCES IN GASTRIC CANCER RESEARCH: MICRORNA-TRANSCRIPTOMICS APPROACH USING SOLID SYSTEM., 2009.

• BARROS-LOBATO, J. ; GOMES, L. L. ; GOMES, J. M. ; CERDEIRA, L. ; SILVA, A. ; ARAUJO, W. ; PINHEIRO, D. ; SANTOS, S. E. B. ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, A. K. ; DARNET, S. . Off-Line Analysis of Human MicroRNA Transcriptome Sequences with SOLID System Small RNA Pipeline. In: 5ht Internacional Conference of the Brazilian Assiciation for Bioinformatics and Computational Biology, 2009, Angra dos Reis. OFF-LINE ANALYSIS OF HUMAN MICRORNA TRANSCRIPTOME SEQUENCES WITH SOLID SYSTEM SMALL RNA PIPELINE., 2009.

• BARROS-LOBATO, J. ; GOMES, L. L. ; GOMES, J. M. ; CERDEIRA, L. ; SILVA, A. ; Silva-Jr WA ; PINHEIRO, D. ; SANTOS, S. E. B. ; SANTOS, A. K. C. R. ou Ribeiro-dos-Santos, A.K.C. ; VARUZZA, L. ; DARNET, S. . Off-Line Analysis of Human MicroRNA Transcriptome Sequences with SOLID System Small RNA Pipeline. In: X-Meeting and 5th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2009, Angra dos Reis. OFF-LINE ANALYSIS OF HUMAN MICRORNA TRANSCRIPTOME SEQUENCES WITH SOLID SYSTEM SMALL RNA PIPELINE., 2009. v. 1. p. 19.

• GOMES, L. L. ; ALENCAR, Dayse O. ; BARROS-LOBATO, J. ; GOMES, J. M. ; SANTOS, S. E. B. ; DARNET, S. ; BURBANO, R. ; ASSUMPCAO, P. ; Silva-Jr WA ; PINHEIRO, D. ; SANTOS, A. K. C. R. ou Ribeiro-dos-Santos, A.K.C. . Advances in Gastric Cancer Research: MicroRNA-Transcriptomics Approach Using SOLID System. In: X-Meeting and 5th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2009, Angra dos Reis. Advances in Gastric Cancer Research: MicroRNA-Transcriptomics Approach Using SOLID System, 2009. v. 1. p. 20.

• GOMES, J. M. ; BARROS-LOBATO, J. ; BARATA, L. O. S. ; CARVALHO, B. M. ; GOMES, L. L. ; SANTOS, S. E. B. ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, A. K. ; FEIO-DOS-SANTOS, A. C. . Desenvolvimento de uma Ferramenta Computacional para Análise de Seqüências da Região Hipervariável do MTDNA. In: 53 Congresso Brasileiro de Genética, 2007, Águas de Lindóia - SP. 53ª Congresso Brasileiro de Genética, 2007.

• GOMES, L. L. ; FEIO-DOS-SANTOS, A. C. ; CARVALHO, B. M. ; BARROS-LOBATO, J. ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, A. K. ; Oliveira, RCL . Uso de Redes Neurais Artificiais no Reconhecimento de Perfil Genético Humano com Base na Variabilidade Genômica do DNA Mitocondrial. In: 1 Congresso Brasileiro de Genética Forense, 2007, Belém - PA. 1 Congresso Brasileiro de Genética Forense, 2007.

• FRANCEZ ; BARROS-LOBATO, J. ; PALHA ; SANTOS, S. E. B. ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, A. K. ; RODRIGUES . Banco Integrado de Perfis Genéticos de Vestígios Criminais da Região Norte do Brasil. In: XIX Congresso Nacional de Criminalística, 2007, Salvador - BA. XiX Congresso Nacional de Criminalística, 2007.

• BARROS-LOBATO, J. ; GOMES, J. M. ; GOMES, L. L. ; NEVES, A. R. M. ; FEIO-DOS-SANTOS, A. C. ; SANTOS, S. E. B. ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, A. K. ; CARVALHO, B. M. . LGHMitDataBase: Sistema integrado de Informações Biológicas. In: 52 Congresso nacional de Genética, 2006, Foz do Iguaçu - PR. 52ª Congresso Brasileiro de Genética, 2006.

• FEIO-DOS-SANTOS, A. C. ; CARVALHO, B. M. ; BARROS-LOBATO, J. ; GOMES, J. M. ; BARATA, L. O. S. ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, A. K. . LGHM-DataBase: Integreted System of Biological Information. In: 1st International Conference of the AB3C, 2005, Caxambú-MG. 1st International Conference of the AB3C, 2005.

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2009 - 2013

  PROCAD - COOPERAÇÃO ACADÊMICA ENTRE AS IES UFPA E USP PARA O DESENVOLVIMENTO E ESTABELECIMENTO DE UMA REDE DE BIOINFORMÁTICA PARA A ANÁLISE GENÔMICA E PROTEÔMICA DO CÂNCER GÁSTRICO (CG), Descrição: A decisão da construção deste projeto de colaboração acadêmica ocorreu como conseqüência do desenvolvimento de um projeto maior que envolve o sequenciamento do genoma expresso (cDNA) do câncer gástrico. Este projeto só foi possível em função de um importante investimento do Governo do Estado do Pará e do BNDES, na implementação do Parque de Ciência e Tecnologia Guamá (PCT-Guamá http://www.pctguama.pa.gov.br). O PCT Guamá é o primeiro parque tecnológico da Amazônia e sua instalação em Belém é estratégica no desenvolvimento regional com bases sustentáveis. Este empreendimento demandará o fortalecimento do capital social e humano dentro das áreas vocacionais estabelecidas que são: (i) tecnologias e sistemas de informação e comunicação, (ii) energia e (iii) biotecnologia. O desenvolvimento do presente projeto estabelecerá competência na área de Bioinformática, com o auxílio do grupo da USP, uma das primeiras IES do país responsáveis pelo desenvolvimento e competência na área de Bioinformática conseqüência do desenvolvimento do primeiro projeto genoma do Brasil, o Xylella fastidiosa. Desta forma, pretendemos avaliar e aferir os benefícios da criação de um mecanismo integrativo que pode compartilhar competências, tecnologias e infra-estruturas apresentadas visando o fortalecimento e consolidação de áreas de fronteira em Programas de Pós-Graduação da Universidade Federal do Pará (UFPA) e da Universidade de São Paulo, Campus de Ribeirão Preto (USP-RP). O projeto integrará iniciativas locais e/ou nacionais nas áreas da oncologia, genômica, transcriptômica, proteômica e bioinformática; junto com o grupo de Ribeirão Preto, para formação de recursos humanos qualificados, transferência de tecnologias e compartilhamento da infra-estrutura de pesquisa no desenvolvimento e avanço de especialidades chaves para o aproveitamento dos resultados obtidos durante a análise do câncer gástrico na população da região norte brasileira. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (7) / Doutorado: (5) . , Integrantes: Jessé de Barros Lobato - Integrante / Jeferson Martins Gomes - Integrante / Sidney Emanuel Batista dos Santos - Integrante / Andrea Kely Campos Ribeiro dos Santos - Coordenador / João Farias Guerreiro - Integrante / Wilson A Silva Jr - Integrante / Sylvain Darnet - Integrante / Rommel Burbano - Integrante / Paulo Assumpção - Integrante / André Khayat - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2008

  CT/Amazônia/CNPq - Criação de um Sistema Integrado de Informações Biológicas - LGHMData Base - FASE I: Estruturação, desenvolvimento e manutenção do Banco de Dados, Descrição: Atualmente, inúmeros laboratórios, que originaram e trabalham com grandes quantidades de informações biológicas (especialmente seqüências genômicas e microssatélites), necessitam analisar e adequar este volume de dados, às necessidades apresentadas na atualidade, principalmente no que diz respeito às tomadas de decisões mais eficazes para interpretação dessas informações. Somado a este fato, o Poder da Informação está baseado na redução de custos e aumento de qualidade e competitividade. Isso significa na prática a aplicação de três conceitos fundamentais: a) Modelagem: os dados devem ser estudados quanto ao seu formato, origem, meio, natureza e formação, assim como, no seu relacionamento com outros dados; b) Dados Resguardados: os dados deverão apresentar os requisitos básicos de integridade, segurança e documentação; c) Dados Disponibilizados: Os dados deverão permitir o acesso, a atualização, a avaliação e análise, a consolidação, tabulação e a simulação de informações. Em vista disso, o Brasil apesar de ser um dos países que mais investe em pesquisas genômicas e conseqüentemente apresenta um dos maiores números de projetos genoma no mundo, ainda não investiu no armazenamento e normatização em relação aos dados gerados nas diferentes regiões do país. Desta forma, o presente projeto pretende eqüalizar os diferentes resultados, principalmente em relação aos dados de seqüenciamento, disponibilizando-os em um banco de dados nacional, contendo ainda, dados já publicados, retirados da literatura. A criação de um banco de dados requer além dos princípios básicos de programação, modelagem e criação de algorítimos, sua intrínseca relação com os conhecimentos de biologia, na busca da melhor análise e da melhor interpretação das informações, sendo um campo de pesquisa híbrido, necessitando de profissionais da área de informática e biólogos/biomédicos. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jessé de Barros Lobato - Integrante / Luiz Otavio da Silva Barata - Integrante / Jeferson Martins Gomes - Integrante / Ana Cecília Feio dos Santos - Integrante / Sidney Emanuel Batista dos Santos - Integrante / Andrea Kely Campos Ribeiro dos Santos - Integrante / Bruno Maia Carvalho - Coordenador.

• 2006 - 2008

  CT/Amazônia/CNPq - Criação de um sistema integrado de informações Biológicas - LGHMData base - FASE II: Desenvolvimento de uma ferramenta para Manipulação, Gerenciamento e Análise das informações vinculadas ao Banco de dados e publicação on-line, Descrição: O Brasil apesar de ser um dos países que mais investe em pesquisas genômicas e conseqüentemente apresenta um dos maiores números de projetos genoma no mundo, ainda não investiu no armazenamento e normatização em relação aos dados gerados nas diferentes regiões do país. Desta forma, o presente projeto pretende eqüalizar os diferentes resultados, principalmente em relação aos dados de seqüenciamento, disponibilizando-os em um banco de dados nacional, contendo ainda, dados já publicados, retirados da literatura.A criação de um banco de dados requer além dos princípios básicos de programação, modelagem e criação de algorítimos, sua intrínseca relação com os conhecimentos de biologia, na busca da melhor análise e da melhor interpretação das informações, sendo um campo de pesquisa híbrido, necessitando de profissionais da área de informática e biólogos/biomédicos.Além da função de integração e armazenamento das informações biológicas (seqüências de DNA, Microssatélites e SNPs) serão desenvolvidos softwares específicos para a manipulação e análise dos dados, assim como o desenvolvimento da ferramenta web, tendo como suporte as linguagens de programação Perl/CGI e PHP.- FASE II (presente projeto). Neste projeto, serão criados os algoritmos para manipulação dos dados de seqüências de DNA, Microssatélites, SNPs e todo qualquer tipo de suporte ao banco de dados. Após a integração do Banco de dados e dos algoritmos, será realizada a modelagem da web site que disponibilizará o LGHM Data Base. Para permitir ao usuário trabalhar os dados biológicos, o presente projeto ainda desenvolverá ferramentas computacionais, as quais irão integrar diferentes softwares normalmente empregados para este tipo de análise (NETMAT, NETWORK, MEGA, DNAsp, ARLEQUIM). O suporte de manutenção e gerenciamento da web site do LGHM DataBase será realizado durante as fases finais e posteriomente ao projeto. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Jessé de Barros Lobato - Integrante / Luiz Otavio da Silva Barata - Integrante / Jeferson Martins Gomes - Integrante / Ana Cecília Feio dos Santos - Coordenador / Sidney Emanuel Batista dos Santos - Integrante / Andrea Kely Campos Ribeiro dos Santos - Integrante / Bruno Maia Carvalho - Integrante / Mauro de Meira Leite - Integrante.

• 2005 - Atual

  MCT/CNPq (Milênio) Ancestralidade Genômica e Identidade Nacional - Implicações Biomédicas e Forenses, Descrição: Estudos de Genética de Populações, baseados principalmente na análise do DNA mitocondrial (mtDNA) têm produzido uma grande quantidade de informações biológicas. Estes dados, em geral, compostos de seqüências nucleotidicas das regiões hipervariáveis (HVS-I e HVS-II) e SNPs. Essas informações encontram-se atualmente distribuídas em diferentes bancos de dados em todo o mundo e web sites não integrados. Com o objetivo inicial de armazenar estas seqüências nos laboratórios que constituem a rede e integrá-las em nível nacional, o presente projeto desenvolverá um banco de dados. Adicionalmente, pretendemos selecionar uma amostra de universitários brasileiro de diferentes Estados, de diferentes regiões do país e de diferentes cursos de graduação (questão das profissões diferencidas - Medicina, Direito, etc...), para serem analisadas por meio de marcadores de ancestralidade. No trabalho relacionado com a Diabetes, propomos analisadas por meio de marcadores de ancestralidade. No trabalho investigar, em populações indígenas da Amazônia: (i) fatores de risco ambiental ao diabettes não dependente de insulina e (ii) genes de suscetibilidade ao diabetes 2 por meio de estudos moleculares. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (30) / Especialização: (10) / Mestrado acadêmico: (20) / Doutorado: (10) . , Integrantes: Jessé de Barros Lobato - Integrante / Ana Cecília Feio dos Santos - Integrante / Sidney Emanuel Batista dos Santos - Integrante / Andrea Kely Campos Ribeiro dos Santos - Coordenador / Bruno Maia Carvalho - Integrante / Greice de Lemos Cardoso - Integrante / João Farias Guerreiro - Integrante / Ney Pereira Carneiro dos Santos - Integrante / Teresinha de Jesus Brabo Ferreira Palha - Integrante / Elzemar Martins Ribeiro Rodrigues - Integrante / FRANCISCO MAURO SALZANO - Integrante / Dayse Oliveira de Alencar - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Ministério da Ciência, Tecnologia, Inovações e Comunicações - Auxílio financeiro.

• 2004 - Atual

  FINEP Implantação de um Laboratório de Referência em Genética Forense para toda Região Norte, na UFPA (LGFORENSE), Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Andrea Kely Campos Ribeiro dos Santos em 31/07/2012., Descrição: Este projeto foi elaborado com a finalidade maior de implantar na UFPA, um Laboratório de Referência em Genética Forense para atender toda a região Norte do país, de forma que possa servir de base para a formação adequada de recursos humanos, para o desenvolvimento de pesquisa básica e de tecnologia apropriada para as análises forenses de DNA e para prestar colaboração científica e técnica que permita a implantação de outros laboratórios de genética forense de DNA em todos os Estados da região. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (30) / Mestrado acadêmico: (5) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Jessé de Barros Lobato - Integrante / Luiz Otavio da Silva Barata - Integrante / Jeferson Martins Gomes - Integrante / Ana Cecília Feio dos Santos - Integrante / Sidney Emanuel Batista dos Santos - Integrante / Andrea Kely Campos Ribeiro dos Santos - Coordenador / Bruno Maia Carvalho - Integrante / Anderson Nonato do Rosário Marinho - Integrante / Greice de Lemos Cardoso - Integrante / João Farias Guerreiro - Integrante / Natalle do Socorro da Costa Freitas - Integrante / Ney Pereira Carneiro dos Santos - Integrante / Teresinha de Jesus Brabo Ferreira Palha - Integrante / Elzemar Martins Ribeiro Rodrigues - Integrante / FRANCISCO MAURO SALZANO - Integrante / Flavio Ricardo Leal da Silva - Integrante / Luis Antonio Ferreira da Silva - Integrante / Marcus Uchôa Rezende Santana - Integrante.