Katia Carneiro de Paula

Pós-doutorado

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• SOUZA, VIVIANE DE OLIVEIRA E ; TABOADA, TIAGO BASTOS ; DOS SANTOS RAMALHO, BRUNA ; PIRES, GREICE NASCIMENTO ; DA COSTA, THAYSE PINHEIRO ; EL-CHEIKH, MARCIA CURY ; CARNEIRO, KATIA ; MARTINEZ, ANA MARIA BLANCO . Valproic acid ameliorates morpho-dysfunctional effects triggered by Ischiatic nerve crush injury-induced by compression model in mice: Nerve regeneration and immune-modulatory pathway. BRAIN RESEARCH BULLETIN , v. 220, p. 111140, 2025.

• DA SILVA, JULIANA CRISTINA TOBAR ; NOGUEIRA, MARIÂNGELA RANGEL ALVES ; DA SILVA, YARA MARTINS ; NOGUEIRA, FÁBIO CÉSAR SOUSA ; CANEDO, NATHALIE HENRIQUES SILVA ; CARNEIRO, KATIA ; DE ABREU PEREIRA, DENISE . Label-free proteomic analysis of Duchenne and Becker muscular dystrophy showed decreased sarcomere proteins and increased ubiquitination-related proteins. Scientific Reports , v. 15, p. 1, 2025.

• MENEZES, ALINE ; MARTINS, YARA ; NOGUEIRA, FÁBIO ; DE ABREU PEREIRA, DENISE ; CARNEIRO, KATIA . Profiling the Secretome of Glioblastoma Cells Under Histone Deacetylase Inhibition Using Mass Spectrometry. BIO-PROTOCOL , v. 15, p. 1, 2025.

• DE OLIVEIRA E SILVA GUERRERO, ADRIANA ; DA SILVA, TALITA NASCIMENTO ; CARDOSO, STEPHANI ARAUJO ; DA SILVA, FLAVIA FERNANDES FERREIRA ; DE CARVALHO PATRICIO, BEATRIZ FERREIRA ; GONÇALVES, RAQUEL PIRES ; WEISSMULLER, GILBERTO ; EL-CHEIKH, MARCIA CURY ; CARNEIRO, KATIA ; BARRADAS, THAÍS NOGUEIRA . Chitosan-based films filled with nanoencapsulated essential oil: Physical-chemical characterization and enhanced wound healing activity. INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES , v. 2, p. 129049, 2024.

• MENEZES, ALINE ; JULIÃO, GLAUCIA ; MARIATH, FERNANDA ; FERREIRA, ANA LUIZA ; OLIVEIRA-NUNES, MARIA CECILIA ; GALLUCCI, LARA ; EVARISTO, JOSEPH ALBERT MEDEIROS ; NOGUEIRA, FÁBIO CÉSAR SOUSA ; PEREIRA, DENISE DE ABREU ; CARNEIRO, KATIA . Epigenetic mechanisms Histone Deacetylase dependent regulate the Glioblastoma angiogenic matrisome and disrupt endothelial cell behavior in vitro. MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS , v. 1, p. 100722, 2024.

• GALLUCCI FIGORELLE, LARA ; GALVÃO, PETERSON TIAGO ; DE LIMA, FELIPE MATHEUS RIBEIRO ; MARIMON, PATRICIA ; PENTAGNA, NATHALIA ; MILITO, CRISTIANE ; SCHAFFEL, RONY ; CARNEIRO, KATIA . Mantle Cell Lymphoma Under the Scope of Personalized Medicine: Perspective and Directions. Clinical Lymphoma Myeloma & Leukemia , v. 1, p. 1, 2024.

• OUEDRAOGO, SIDZIGUI ; GROSJEAN, MATHILDE ; BRIGAUD, ISABELLE ; CARNEIRO, KATIA ; LUCHNIKOV, VALERIY ; MATHIEU, NOËLLE ; GARRIC, XAVIER ; NOTTELET, BENJAMIN ; ANSELME, KARINE ; PIEUCHOT, LAURENT ; PONCHE, ARNAUD . Fabrication and characterization of thin self-rolling film for anti-inflammatory drug delivery. COLLOIDS AND SURFACES B-BIOINTERFACES , v. 241, p. 114039, 2024.

• FERREIRA, ANA LUIZA ; MENEZES, ALINE ; SANDIM, VANESSA ; QUEIROZ MONTEIRO, ROBSON DE ; NOGUEIRA, FÁBIO CÉSAR SOUSA ; EVARISTO, JOSEPH ALBERT MEDEIROS ; ABREU PEREIRA, DENISE DE ; CARNEIRO, KATIA . Histone deacetylase inhibition disrupts the molecular signature of the glioblastoma secretome related to extracellular vesicle-associated proteins and targets RAB7a and RAB14 in vitro. BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS , v. 736, p. 150847, 2024.

• LEONEL, AMANDA V. ; ALISSON-SILVA, FREDERICO ; SANTOS, RONAN C. M. ; SILVA-AGUIAR, RODRIGO P. ; GOMES, JULIA C. ; LONGO, GABRIEL M. C. ; FARIA, BRUNA M. ; SIQUEIRA, MARIANA S. ; PEREIRA, MIRIA G. ; VASCONCELOS-DOS-SANTOS, ANDREIA ; CHIARINI, LUCIANA B. ; SLAWSON, CHAD ; CARUSO-NEVES, CELSO ; ROMÃO, LUCIANA ; TRAVASSOS, LEONARDO H. ; CARNEIRO, KATIA ; TODESCHINI, ADRIANE R. ; DIAS, WAGNER B. . Inhibition of O-GlcNAcylation Reduces Cell Viability and Autophagy and Increases Sensitivity to Chemotherapeutic Temozolomide in Glioblastoma. Cancers , v. 15, p. 4740, 2023.

• DE LIMA, FELIPE MATHEUS RIBEIRO ; ABRAHÃO, ISABELLA ; PENTAGNA, NATHALIA ; CARNEIRO, KATIA . Gradual specialization of phagocytic ameboid cells may have impaired regenerative capacities in metazoan lineages. DEVELOPMENTAL DYNAMICS , v. 1, p. 1-5, 2022.

• OLIVEIRA-NUNES, MARIA CECÍLIA ; JULIAO, G. H. ; MENEZES, ALINE ; MARIATH, FERNANDA ; HANOVER, J. ; EVARISTO, J. A. M. ; NOGUEIRA, F. C. S. ; BARBOSA, W. D. ; PEREIRA, D. A. ; CARNEIRO K . O‑GlcNAcylation protein disruption by Thiamet G promotes changes on the GBM U87‑MG cells secretome molecular signature.. Clinical Proteomics , v. 18, p. 1-15, 2021.

• DA COSTA, THAYSE PINHEIRO ; EL-CHEIKH, MARCIA CURY ; CARNEIRO, KATIA . Epigenetic Therapy as a Putative Molecular Target to Modulate B Cell Biology and Behavior in the Context of Immunological Disorders. Journal of Immunology Research , v. 2020, p. 1-19, 2020.

• PENTAGNA, NATHALIA ; PINHEIRO DA COSTA, THAYSE ; SOARES DOS SANTOS, FELLIPE ; MARTINS DE ALMEIDA, FERNANDA ; BLANCO MARTINEZ, ANA MARIA ; ABREU, JOSÉ GARCIA ; LEVIN, MICHAEL ; CARNEIRO, KATIA . Epigenetic control of myeloid cells behavior by Histone Deacetylase Activity (HDAC) during tissue and organ regeneration in Xenopus laevis. DEVELOPMENTAL AND COMPARATIVE IMMUNOLOGY , v. 1, p. 103840, 2020.

• CABANEL, MARIANA ; DA COSTA, THAYSE PINHEIRO ; EL-CHEIKH, MARCIA CURY ; CARNEIRO, KATIA . The epigenome as a putative target for skin repair: the HDAC inhibitor Trichostatin A modulates myeloid progenitor plasticity and behavior and improves wound healing. Journal of Translational Medicine , v. 17, p. 247, 2019.

• MENEZES, ALINE ; DOS REIS, GUSTAVO HENRIQUE ; OLIVEIRA-NUNES, MARIA CECÍLIA ; MARIATH, FERNANDA ; CABANEL, MARIANA ; PONTES, BRUNO ; GONÇALVES CASTRO, NEWTON ; DE BRITO, JOSÉ MARQUES ; CARNEIRO, KATIA . Live Cell Imaging Supports a Key Role for Histone Deacetylase as a Molecular Target during Glioblastoma Malignancy Downgrade through Tumor Competence Modulation. JOURNAL OF ONCOLOGY , v. 2019, p. 1-16, 2019.

• NEGREIROS, E. ; HERSZTERG, S. ; HWA, K. ; CÂMARA, A. ; DIAS, W. B. ; CARNEIRO, K. ; BIER, E. ; TODESCHINI, A. ; ARAUJO, H. . N-linked glycosylation restricts the function of short gastrulation to bind and shuttle BMPs. DEVELOPMENT , v. 00, p. dev.167338, 2018.

• Leite, F. ; CARNEIRO K ; BRITO, J. M. ; Cabanel, M. ; XAVIER, J. ; PAIVA, L. ; SYN, W. ; HENDERSON, N. C. ; El-Cheikh, M.C. . Galectin-3, histone deacetylases, and Hedgehog signaling: Possible convergent targets in schistosomiasis-induced liver fibrosis. PLoS Neglected Tropical Diseases (Online) , v. 11, p. e0005137, 2017.

• NUNES, M. C. ; KAHN, S. A. ; BARBEITAS, A. L. ; QUERIDO, W. ; VENTURA, G. ; Brito J ; SPHOR, T. ; DUBOIS, L. G. ; CAMPANATI, L. ; LIMA, F. ; MOURA-NETO, V. ; CARNEIRO K . The availability of the embryonic TGF-β protein Nodal is dynamically regulated during glioblastoma multiforme tumorigenesis. Cancer Cell International (Online) , v. 16, p. 1-10, 2016.

• CARNEIRO K ; Brito JM ; ROSSI, M. I. . Development by 3D approaches and 4D imaging: to the knowledge frontier and beyond. Birth Defects Research. Part C: Embryo Today Reviews , v. 00, p. 00, 2015.

• Cabanel, M. ; Branda, C. ; Brito J ; Leite, F. ; NUNES, M. C. ; Cabral-Piccin, M.P. ; Lopes, M. ; El-Cheikh, M.C. ; CARNEIRO K . Epigenetic Control of Macrophage Shape Transition towards an Atypical Elongated Phenotype by Histone Deacetylase Activity. Plos One , v. 10, p. e0132984, 2015.

• CORDEIRO, I. R. ; LOPES, D. V. ; ABREU, J. G. ; CARNEIRO, K. ; ROSSI, M. I. D. ; BRITO, J. M. . Chick embryo xenograft model reveals a novel perineural niche for human adipose-derived stromal cells. Biology Open , v. 1, p. 1, 2015.

• CARNEIRO K ; Donnet C ; Rejtar T ; KARGER, B. ; Barisone G ; Diaz E ; Kartagere S ; Lemire J ; Levin, M . Histone deacetylase activity is necessary for left-right patterning during vertebrate development. BMC DEVELOPMENTAL BIOLOGY , v. 11, p. 29, 2011.

• TSENG, K. ; CARNEIRO K ; Lemire J ; Levin, M . HDAC Activity Is Required during Xenopus Tail Regeneration. PLoS One , v. 6, p. e26382, 2011.

• AW, S. ; Koster, J ; Pearson, W ; Nicols, C ; Nian-Quing, S ; CARNEIRO K ; Levin, M . The ATP-sensitive K+-channel (KATP) controls early left-right patterning in Xenopus and chick embryos. DEVELOPMENTAL BIOLOGY , v. 346, p. 39-53, 2010.

• FONTENELE, M. ; CARNEIRO K ; Agrellos, R ; Oliveira, D ; Oliveira-Silva, A ; VIEIRA, V. ; NEGREIROS, E. ; Machado, E ; ARAUJO, H. . The Ca2+-dependent protease Calpain A regulates Cactus/IκB levels during Drosophila development in response to maternal Dpp signals. MECHANISMS OF DEVELOPMENT , v. 126, p. 737-751, 2009.

• GIRALDI-GUIMARAES, A. ; BATISTA, C. M. C. ; CARNEIRO K ; TENORIO, F. ; CAVALCANTE, L. A. ; Mendez-Otero R . A critical survey on nitric oxide synthase expression and nitric oxide function in the retinotectal system. Brain Research Reviews , v. 56, p. 403-426, 2007.

• CARNEIRO K ; FONTENELE, M. ; NEGREIROS, E. ; LOPES, E. S. S. ; BIER, E. ; ARAUJO, H. . Graded maternal short gastrulation protein contributes to embryonic dorsal-ventral patterning by delayed induction. DEVELOPMENTAL BIOLOGY , v. 296, p. 203-218, 2006.

• BATISTA, C. M. C. ; CARNEIRO K ; NAVARRETE, R. E. B. ; MOTA, M. S. ; CAVALCANTE, L. A. ; OTERO, R. M. . · Nitrergic dendrites in the superficial layers of the rat superior colliculus: retinal afferents and alternatively spliced isoforms in normal and deafferented animals. Journal of Neuroscience Research, v. 71, p. 455-461, 2003.

• RIBEIRO, CS ; CARNEIRO K ; ROSS, CA ; MENEZES, JR ; ENGELENDER, S . Synphilin-1is developmentally localized to synaptic terminals and its association with synaptic vesicles is modulated by alpha-synuclein. The Journal of Biological Chemistry , v. 277, p. 23927-23933, 2002.

• BATISTA, CM ; CARNEIRO K ; CAVALCANTE, LA ; Mendez-Otero R . Subcellular localization of neuronal nitric oxide synthase in the superficial gray layer of the rat superior colliculus. Neuroscience Research , Japão, v. 41, n.1, p. 67-70, 2001.

• CARNEIRO, K. . Formação de cientistas sob a perspectiva do profissional. Primeira Evolução, 01 abr. 2024.

• Carneiro, K . Epigenética: herança além dos genes. Revista Ciência Hoje.

• CARNEIRO K ; VALLE T, Z. ; MA,, G. L. B. C. T. R. M. R. M. ; CALABRESE, KS ; COSTA, S. C. G. . Identification of Leishmania (L.) amazonensis antigen associated to infection in a BCG-based vaccine in experimental murine leishmaniasis. In: Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2002, Caxambu. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, 2002. v. 44. p. 133.

• PENTAGNA, N. ; ABREU, J. G. ; Levin, M ; Carneiro, K . Histone Deacetylase-mediated inflammatory response by myeloid cells and its impact at the tadpole tail regeneration. In: XIX Congresso da Sociedade Brasileira de Biologia Celular, 2018, São Paulo. XIX Congresso da Sociedade Brasileira de Biologia Celular, 2018.

• PINHEIRO, T. ; CURY, M. ; Carneiro, K . THE EFFECT OF HISTONE DEACETYLASE ACTIVITY ON THE MOBILIZATION OF INFLAMMATORY CELLS IN MYOCARDIAL INFARCTION.. In: XIX Congresso da Sociedade Brasileira de Biologia Celular, 2018, São Paulo. XIX Congresso da Sociedade Brasileira de Biologia Celular, 2018.

• MARIATH, F. ; MENEZES, A. C. ; BARBOSA, W. D. ; ABREU, D. ; ZINGALE, L. ; Carneiro, K . THE BLOCKADE OF CHROMATIN REMODELING CHANGES THE PROFILE OF THE SECRETOME OF GLIOBLASTOMA IN VITRO?. In: XIX Congresso da Sociedade Brasileira de Biologia Celular, 2018, São Paulo. XIX Congresso da Sociedade Brasileira de Biologia Celular, 2018.

• NUNES, M. C. ; LIMA, F. ; DUBOIS, L. G. ; KAHN, S. A. ; CAMPANATI, L. ; MOURA NETO, V. ; Carneiro, K . The availability of the embryonic TGF-ß protein Nodal is dynamically regulated during glioblastoma multiform tumorigenesis through an endocytic pathway.. In: SDB 75th Annual Meeting - ISD 19th International Conference, 2016, Boston. SDB 75th Annual Meeting - ISD 19th International Conference, 2016.

• NUNES, M. C. ; BARBOSA, W. D. ; Carneiro, K . The impact of metabolic intermediates on crosstalk between glycosilation and acetylation of histones in Glioblastoma. In: SDB 75th Annual Meeting - ISD 19th International Conference, 2016, Boston. SDB 75th Annual Meeting - ISD 19th International Conference, 2016.

• REIS, G. H. ; Brito J ; Carneiro, K . The embryonic microenvironment drives the recapitulation of developmental events in Glioblastoma cells through epigenetic mechanisms Histone Deacetylase (HDAC)- dependent mechanisms.. In: XIX Congresso Internacional da Sociedade Brasileira de Biologia Celular, 2016, São Paulo. XIX Congresso Internacional da Sociedade Brasileira de Biologia Celular, 2018.

• CAMARA, A. ; NEGREIROS, E. ; ARAUJO, H. ; CARNEIRO K ; TODESCHINI, A. . Glycosylation processes regulate BMP pathway during Drosophila melanogaster development.. In: 16th SBBC Meeting, 2012, Rio de Janeiro. 16 th SBBC Meeting, 2012.

• NUNES, M. C. ; LIMA, F. ; CARNEIRO K ; MOURA NETO, V. . The subcellular distribution of the asymmetric protein Nodal in glial cells plays a key role during development and physiopathology of the central nervous system.. In: 16th SBBC Meeting, 2012, Rio de Janeiro. 16 th SBBC Meeting, 2012.

• MARQUES, C. ; NEGREIROS, E. ; ARAUJO, H. ; CARNEIRO K . HDAC activity is necessary for the morphogenesis of polarized tissues. In: 16th SBBC Meeting, 2012, Rio de Janeiro. 16th SBBC Anual Meeting, 2012.

• CARNEIRO K ; ARAUJO, H. . A multiplex in situ approach to define the precise contribution of the maternal BMP pathway in dorsal-ventral patterning of the early Drosophila embryo.. In: First Pan American Congress in Developmental Biology/3rd Interanational Meetinf of the Latin American Society of Developmetal Biology, 2007, Cancun. Developmental Biology, 2007. v. 0. p. 000-0000.

• ARAUJO, H. ; Silva, A. de O ; Agrellos, R ; FONTENELE, M. ; CARNEIRO K ; BIER, E. . Signal Independent degradation of Cactus by the Ca2+-dependent protease Calpain A is regulated by maternal Dpp.. In: First Pan American Congress in Developmental Biology, 2007, Cancun, Mexico. Developmental Biology, 2007. v. 00. p. 00-00.

• ARAUJO, H. ; CARNEIRO K ; FONTENELE, M. ; NEGREIROS, E. ; BIER, E. . Delayed effect of a maternal BMP on stablishment of the embryonic dorsal-ventral axis.. In: 65th Annual Meeting of Society for Developmental Biology, 2006, Ann Arbor. 65th Annual Meeting, 2006. v. 295. p. 286-286.

• CARNEIRO K ; FONTENELE, M. ; NEGREIROS, E. ; BIER, E. ; ARAUJO, H. . Maternal short gastrulation (sog) and decapentaplegic (dpp) contribute to pattern the Drosophila dorsal-ventral axis by delayed induction. In: 2nd International Meeting of the Latin American Society of Developmental Biology, 2005, Guarujá. 2nd International Meeting of the Latin American Society of Developmental Biology, 2005.

• CARNEIRO K ; FONTENELE, M. ; LOPES, E. S. S. ; NEGREIROS, E. ; BIER, E. ; ARAUJO, H. . BMP Signaling and Embryonic Dorsal-Ventral Patterning: From Mother to Embryo. In: 2nd International Meeting of the Latin American Society of Developmental Biology, 2005, Guarujá. 2nd International Meeting of the Latin American Society of Developmental Biology, 2005.

• CARNEIRO K ; FONTENELE, M. ; NEGREIROS, E. ; BIER, E. ; ARAUJO, H. . Short Gastrulation (Sog) Produced by Follicle Cells during Drosophila Oogenesis functions through Delayed Induction to Pattern the Early Embryo. In: 2nd International Symposium on Developmental Genetics in the Post-Genome Era, 2003, Angra dos Reis. 2nd International Symposium on Developmental Genetics in the Post-Genome Era, 2003.

• RIBEIRO, CS ; CARNEIRO K ; ROSS, C. A. ; ENGELENDER, S . The a-synuclein interacting protein synphilin-1 is localized to presynaptic terminals in the brain. In: XXXIª Reunião Anual da SBBq, 2002, Caxambu. XXXIª Reunião Anual da SBBq Programas e Resumos, 2002. p. 203.

• BATISTA, CM ; CARNEIRO K ; OTERO, R. M. . Evidências Ultraestruturais da Expressão Diferencial de Isoformas da Óxido Nítrico Sintase Neuronal em Células do Colículo Superior de Ratos Normais e Enucleados. In: XVI Reunião Anual da Federação de Sociedades de Biologia Experimental - FeSBE, 2001, Caxambu, 2001.

• RIBEIRO, CS ; CARNEIRO K ; LEÃO, S. ; ROSS, C. A. ; MENEZES, JR ; ENGELENDER, S . The Alpha-Synuclein Interacting Protein Synphilin-1 is Localized to Presynaptic Terminals in the Brain. In: Society for Neuroscience 31st Annual Meeting, 2001, San Diego, 2001.

• BATISTA, CM ; CARNEIRO K ; NAVARRETE, R. E. B. ; CAVALCANTE, L. A. ; OTERO, R. M. . Estudos Bioquímicos e Ultraestruturais dos Neurônios Nitridérgicos do Colículo Superior de Ratos Normais e Enucleados. In: XV Reunião Anual da Federação de Sociedades de Biologia Experimental - FeSBE, 2000, Caxambu, 2000.

• OTERO, R. M. ; BATISTA, CM ; CARNEIRO K ; CAVALCANTE, LA . Retinal Innervation of Nitric Oxide Synthase Containig Neurons in the Rat Superior Colliculus. In: Society for Neuroscience 30 Annual Meeting, 2000, New Orleans, 2000.

• PEREIRA, I. H. ; MOTA, M. S. ; CARNEIRO K ; BATISTA, CM ; OTERO, R. M. . Estudo da Expressão da Enzima Óxido Nítrico Sintase Endotelial em Células do Colículo Superior de Ratos. In: XV Reunião Anual da Federação de Sociedades de Biologia Experimental - FeSBE, 2000, Caxambu, 2000.

• BATISTA, CM ; CARNEIRO K ; CAVALCANTE, LA ; Mendez-Otero R . Distribuição Ultraestrutural da Sintase do Óxido Nítrico em Células do Colículo Superior de Rato. In: XIV Reunião Anual da Federação de Sociedades de Biologia Experimental - FeSBE, 1999, Caxambu, 1999.

• BATISTA, C. M. C. ; CARNEIRO K ; CAVALCANTE, L. A. ; MENDEZOETRO, R. . Two Different Methods to Detect Ultrastructural Distribution of Nitric Oxide Synthase in the Rat Superior Colliculus. In: VII Congresso Iberoamericano de Biologia Celular, 1998, Montivideo, 1998.

• NUNES, M. C. ; BARBEITAS, A. L. ; Cabanel, M. ; BARBOSA, W. D. ; CARNEIRO K . Epigenetic modifications on histones. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• NUNES, M. C. ; KAHN, S. A. ; Lima F ; MOURA NETO, V. ; CARNEIRO K . The Subcellular Distribution of the Asymmetric Protein Nodal in Glial Cells Plays a Key Role During Development and Physiopathology of the Central Nervous System. 2013. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• NUNES, M. C. ; Lima F ; MOURA NETO, V. ; CARNEIRO K . The subcellular distribution of the asymmetric protein Nodal in glial cells plays a key role during development and physiopathology of the central nervous system. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• CARNEIRO K ; Levin, M . Epigetic Regulation of Nodal expression by early serotonin signaling during Xenopus left right patterning. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CARNEIRO K . O estabelecimento do eixo dorso-ventral em Drosophila melanogaster: o segredo da ação dos gnes maternais. 2005. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

• LIMA, F. M. R. ; ORTIZ, N. D. ; GUEDES, J. ; PIMENTEL, C. D. ; NOGUEIRA, F. C. S. ; CARNEIRO, K. . HDAC Activity Inhibition Alters Histone H4 Acetylation Dynamics Coupled to HDAC Expression and Lipid Mediator 12(S)HETE Biogenesis in Xenopus laevis Tail Regeneration. Amsterdã: Elsevier, 2024 (Preprint).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2025 - Atual

  Caracterização multi-ômica de terapia epigenética e sua aplicação em medicina regenerativa, Descrição: A compreensão detalhada dos mecanismos de reparo tecidual pode levar a grandes avanços em estratégias translacionais para a medicina regenerativa, podendo beneficiar portadores de doenças crônica não transmissíveis (DCNTs), como o Diabetes Mellitus. Dentre as fases do reparo tecidual, a inflamação desempenha um papel protetor e sua cinética deve ser finamente regulada no tempo e no espaço para que a fase resolutiva possa se instalar e trazer o sistema de volta à homeostasia com restauração da forma e da função. Neste cenário, nosso grupo tem contribuído para a caracterização dos mecanismos epigenéticos envolvidos na regulação da resposta inflamatória com ênfase no estudo do controle epigenético do fenótipo e da função de monócitos e macrófagos durante o reparo tecidual. Demonstramos previamente que o tratamento tópico de lesões cutâneas com inibidores farmacológicos da atividade da enzima remodeladora da cromatina Histona Desacetilase (iHDAC) aumentou a qualidade do reparo tecidual por regeneração e diminui o tempo para o fechamento de lesões cutâneas. Neste projeto, propomos caracterizar o mecanismo de ação dessa terapia epigenética e in vitro e in vivo através de abordagens multi-ômicas e prospectar sua aplicação em medicina regenerativa como foco no controle da expressão gênica de miRNAs. Propomos caracterizar os miRNAs do cluster 467 através de transcriptômica para os mRNAs alvo, proteômica e metabolômica para melhor entender seu mecanismo de ação. Uma vez identificados e caracterizados os prinicpais alvos in vitro, utilizaremos modelos in vivo para prospectar seu putativo papel no contexto da medicina regenerativa e aplicações terapêuticas para DCNTs, como o Diabetes Melitus. Como principais resultados esperamos promover a geração de conhecimento científico em área de fronteira de medicina regenerativa acoplado à formação de recursos humanos e à transferência de conhecimento e de tecnologia para a sociedade. Edital Cientista do Nosso Estado (CNE) - 2025. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / Thais Barradas - Integrante / Adriana de Olikveira e Silva - Integrante / Luiza Chrysóstomo - Integrante., Financiador(es): FAPERJ - Bolsa.

• 2025 - Atual

  Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia da GLIA (iGLIA): as células gliais como alvo no diagnós$co e terapia de doenças crônicas e emergentes, Descrição: As doenças neurológicas e neurodegenera6vas geram grande impacto social esobrecarregam o sistema público de saúde, quadro agravado pelo envelhecimentopopulacional. Essas doenças são grandes desafios para a Medicina, pelas limitações detratamento, diagnós6co tardio, e limitada compreensão de mecanismos. Em comum,são caracterizadas por um quadro inflamatório, que envolve rea?vidade e disfunçõesdas células gliais. Nas úl6mas duas décadas, essas células protagonizaram umamudança de paradigma nas Neurociências, emergindo como componentes a6vos nofuncionamento e doenças do sistema nervoso (SN) e representando importantes alvoscelulares, diagnós?cos e terapêu?cos. Apesar da relevância, o papel da Glia nasdoenças do SN ainda é negligenciado.O INCT da Glia (iGLIA) visa gerar conhecimento que impacte polí?cas de saúde pública,produtos/abordagens terapêu?cas e novas tecnologias para o tratamento/diagnós6code doenças prevalentes do século XXI, tendo como alvo as células gliais. Visamoses6mular a formação de recursos humanos e inovação na Saúde, o6mizando o uso dosrecursos do SUS e melhorando a qualidade de vida da população brasileira.A rede, de vanguarda na América do Sul, será formada por uma equipe mul6disciplinarcom 49 pesquisadores nacionais, sendo 25 líderes de pesquisa, e 34 estrangeiros, 33Pós-doutores; lotados em 14 ins?tuições públicas e privadas, 13 unidades hospitalares,em 7 UFs do País, e 29 ins?tuições estrangeiras.A proposta contará com uma abordagem translacional de fronteira com ensaios pré-clínicos, modelos vertebrados e invertebrados, ensaios in vitro, tecido cerebral humanopost-mortem e amostras de pacientes; além de ensaios clínicos, desenvolvimento demétodos diagnós6cos e novas terapias.O projeto é dividido em cinco eixos: Glia e tumores do SN; Glia, doençasneurodegenera?vas e envelhecimento; Glia e doenças neurológicas; Glia e doençasautoimunes e infecciosas; e Novas Terapias com foco na Glia.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Integrante / Flavia Gomes - Coordenador / Vivaldo Moura Neto - Integrante / ESPER CAVALHEIRO - Integrante / GERLY BRITO - Integrante / ANDREA TRENTIN - Integrante / JULIA CLARK - Integrante / VICTOR DIÓGENES - Integrante / MONICA ROBERTO GADELHA - Integrante.

• 2024 - Atual

  Caracterização multi-ômica de terapia epigenética acoplada a sistemas nano estruturados de entrega de fármacos para aplicação em medicina regenerativa, Descrição: O reparo tecidual pode ser considerado um dos processos biológicos mais complexos observados nos seres vivos e compreensão detalhada de sua regulação, pode levar a grandes avanços na elaboração de estratégias translacionais para a medicina regenerativa, podendo beneficiar portadores de doenças crônica não transmissíveis (DCNTs), como o Diabetes Mellitus. Dentre as fases do reparo tecidual, a inflamação tem sido um alvo de intensos estudos pois se por um lado ela desempenha um papel protetor e indispensável para o reparo tecidual, por outro, sua cinética deve ser finamente regulada no tempo e no espaço para que a fase resolutiva possa se instalar e trazer o sistema de volta à homeostasia com restauração da forma e da função. Neste cenário, nosso grupo tem contribuído para a caracterização dos mecanismos epigenéticos envolvidos na regulação da resposta inflamatória com ênfase no estudo do controle epigenético do fenótipo e da função de monócitos durante o reparo tecidual. Utilizando modelos animais de alta e baixa capacidade regenerativa, como anfíbios anuros e camundongos respectivamente, demonstramos que o tratamento tópico de lesões com inibidores farmacológicos da atividade da enzima remodeladora da cromatina Histona Desacetilase (iHDAC) aumentou a qualidade do reparo tecidual por regeneração e diminui o tempo para o fechamento das lesões. Neste projeto, propomos desenvolver, testar e caracterizar, utilizando metologias ômicas, a eficácia de um sistema nano estruturado para a entrega de terapia epigenética à base de filmes enriquecidos com nanoemulsões para liberação tópica de iHDACs, visando o tratamento de feridas crônicas e promoção da regeneração de tecidos in vivo. Como principais resultados esperamos promover a geração de conhecimento científico em área de fronteira de medicina regenerativa acoplado à formação de recursos humanos e à transferência de conhecimento e de tecnologia para a sociedade. Financiamento: FAPERJ n 13/2023- Auxílio básico à pesquisa (APQ1) (2024-2026). , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / Thais Barradas - Integrante / Felipe Matheus Ribeiro de Lima - Integrante / Karla Roberta Moreira - Integrante / Katia Carneiro - Integrante / Adriana de Olikveira e Silva - Integrante / Luiza Chrysóstomo - Integrante / Ana Luisa de França e Silva - Integrante., Financiador(es): FAPERJ - Auxílio financeiro.

• 2024 - Atual

  Sistemas Nano Estruturados em Medicina Regenerativa, Descrição: Propomos uma startup inovadora para fabricação de filmes poliméricos e nanoemulsões de óleo essencial para uso clínico humano e animal. Com foco na saúde, nossa tecnologia oferece abordagens terapêuticas avançadas para uma recuperação mais rápida. A combinação de materiais poliméricos e nanoemulsões oferece uma solução eficaz para aplicações clínicas. A startup visa revolucionar o setor médico, proporcionando benefícios tangíveis e melhorias significativas na qualidade de vida dos pacientes. Financiamento: CENTELHA RJ/FAPERJ (2025-2026). , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / Adriana de Oliveira e Silva - Integrante / Thais Barradas - Integrante / Luiza Chrysóstomo - Integrante / Thuanne Fonseca Casado Lins - Integrante / Isabela Sebastião Brito dos Santos - Integrante.

• 2024 - Atual

  Linfoma de células do manto: correlações entre dados clínicos e genômicos em uma coorte de pacientes brasileiros, Descrição: O Linfoma de Células do Manto (LCM) é uma neoplasia hematológica maligna que, embora bem descrita morfologicamente, ainda apresenta diversos desafios, principalmente relacionado aos fatores prognósticos, estadiamento da doença e tratamento. Com frequência, pacientes com cursos e desfechos clínicos heterogêneos são inseridos no mesmo grupo prognóstico, comprometendo o planejamento e a abordagem terapêutica do linfoma. Além disso, há uma lacuna de conhecimento acerca dos pacientes brasileiros com LCM, tanto na descrição epidemiológica básica quanto na caracterização genômica associadas aos dados clínicos, visto que o conhecimento científico está baseado em estudos de populações de países desenvolvidos, com população étnica e socioeconomicamente diferente. Tais indivíduos são desconhecidos cientificamente pela equipe médica brasileira, impedindo uma abordagem individualizada de máxima eficiência. Dessa forma, a caracterização clínica e morfológica dos pacientes brasileiros com diagnóstico de LCM é indispensável para uma abordagem integral e completa dessa neoplasia no país, além de poder se tornar uma promissora ferramenta para novas propostas terapêuticas. Por essas razões o Sistema Único de Saúde (SUS) perde em não conseguir realizar um planejamento de saúde pública, desperdiçando recursos humanos e financeiros e ofertando um tratamento ineficiente a esses pacientes. O objetivo revolucionário principal da pesquisa em questão é estabelecer pilares para a abordagem científica do LCM no Brasil, através de técnicas já amplamente utilizadas em outros países. A inovação da proposta está na aplicação de metodologias já validadas (como: coleta de informações clínicas em prontuários, realização de imuno-histoquímica, sequenciamento genético por PCR Tradicional SANGER em amostras biológicas armazenas em blocos de parafina e sequenciamento genético por NGS) em um contexto de saúde pública brasileira, estudando pacientes brasileiros diagnosticados com LCM desde 2010 com o objetivo de (1) Categorizar pela, primeira vez, os pacientes com LCM no Brasil (2) Propor uma estratificação prognostica que leve em conta fatores específicos da população brasileira, isto é, que se adequem às nossas particularidades populacionais (3) Apresentar o cenário do LCM na saúde pública e evidenciar possíveis pontos a serem modificados, como os tipos de tratamento aprovados pelo SUS (4) Validar fatores prognósticos utilizados em países desenvolvidos, como a imuno-histoquímica para P53, demonstrando ou não a efetividade dessa técnica no Brasil e incentivar, caso tenha valor prognóstico, a ampliação do uso desse técnica em todo território nacional (5) Caracterizar o perfil de alterações genômicas em pacientes brasileiros já descritas pela literatura científica, tendo como alvo os genes TP53, NOTCH1 e CDKN2A e correlacionar com fatores prognósticos. Embora tais genes sejam considerados promissores pela literatura internacional para diagnóstico diferencial, nenhum estudo brasileiro cita ou investiga essas alterações genéticas na população brasileira acometida com LCM (6) Elucidar a necessidade de utilização de sequenciamento genético como fator prognóstico dos pacientes ao diagnóstico de LCM e indicar qual é a melhor técnica a ser aplicada no contexto de saúde pública brasileira. O estudo já conta com um banco de dados clínicos composto por 205 pacientes diagnosticados com LCM, advindos de 11 centros parceiros espalhados por diferentes estados brasileiros, como São Paulo, Rio de Janeiro, Distrito Federal, Minas Gerais e Amazonas. Até o momento já realizamos a extração de material genético de 63 pacientes brasileiros para sequenciamento por SANGER e Next Generation Sequencing (NGS). Financiamento: Fundação Maria Emília (2024-2026). , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / Nathalia Pentagna - Integrante / GALLUCCI FIGORELLE, LARA - Integrante / SCHAFFEL, RONY - Integrante., Financiador(es): Fundação Maria Emília - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1

• 2024 - Atual

  Design and effect of topographies with special geometries for setting up in vitro biomimetic processes in cartilage, bone, and tumor cells: proposals for mitigating actions., Descrição: Este projeto envolve grupos do Brasil e França, cuja cooperação teve início há 19 anos. Atualmente o projeto faz parte do acordo de cooperação internacional intitulado International Research Project (IRP): Biointerfaces, Biominerals, Biomaterials. O presente plano de trabalho é parte integral do acordo de cooperação bilateral França-Brasil celebrado entre o Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), a Universite de Haute-Alsace e a Université de Limoges, pelo lado francês, e o Centro Nacional de Pesquisas Físicas (CBPF) e a Universidade Federal do Rio de Janeiro. A parceria entre os grupos franceses e brasileiros visa consolidar a criação de um centro internacional de especialização de alto nível para o desenvolvimento de pesquisas científicas no âmbito das áreas de biointerfaces, biominerais, biomateriais e biocerâmicas com aplicações na medicina regenerativa e na investigação do câncer. Em 2021 os grupos brasileiros e franceses submeteram o projeto de pesquisa internacional intitulado The B3lab: Biointerfaces, Biominerals, Biomaterials, tendo sido contemplado pelo edital CNRS (Centre National de la Recherche Scientifique) com financiamento para os anos de 2021 a 2025. Durante a execução do projeto haverá a colaboração direta, através de intercâmbio de pesquisadores e alunos para o desenvolvimento do sub-projeto "Caracterização proteômica de bio-marcadores tumorais para prospecção de terapia epigenética anti-angiogência em resposta à topografias microestruturadas", colaboração direta entre os grupos dos pesquisadores franceses Dra. Karine Anselme e Dr. Laurent Pieuchot e o grupo da pesquisadora Katia Carneiro de Paula. Financiamento: CNPq n 14/2023- Apoio a Projetos Internacionais de Pesquisa Científica, Tecnológica e de Inovação (2023-2026). , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (4) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Integrante / José Marques Brito - Integrante / Marcia Cury El-Cheikh - Integrante / Marcos Farina de Souza - Coordenador / Karine Anselme - Integrante / Felipe Matheus Ribeiro de Lima - Integrante / Ronaldo José Farias Corrêa do Amaral - Integrante / Vilma de Lima - Integrante / Mariana Moreira Longuinho - Integrante / Adriana de Oliveira e Silva - Integrante / Paula Lopes Cascabulho - Integrante / Euler Araujo dos Santos - Integrante / Amandine Magnaudeix - Integrante / Laurent Pieuchot - Integrante., Financiador(es): Centre National de la Recherche Scientifique - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2023 - Atual

  Caracterização proteômica de bio-marcadores tumorais para prospecção de terapia epigenética anti-angiogência, Descrição: A migração coletiva de células vasculares endoteliais apresenta papel central no desenvolvimento embrionário, angiogênese e tumorigênese. Apesar de o modelo mais difundido em cultura de células seja do tipo confinamento bidimensional, a migração endotelial in vivo é de modo não confinado. Para que seja possível aprofundar os estudos quanto à capacidade migratória, propõe-se um modelo de cultivo de células monocamadas em microestruturas específicas que mimetizam o ambiente de matriz extracelular, permitindo um movimento coletivo específico de padrões de migração periódicos e antiparalelos. Posteriormente, questiona-se em que medida esse tipo de padrão migratório em ambientes não confinados relaciona-se à angiogênese tumoral do Glioblastoma (GBM). O GBM é um glioma tipo IV, com elevados níveis de agressividade e refratário às terapias utilizadas na atualidade. Esse cenário correlaciona-se a uma heterogeneidade no microambiente tumoral e alta capacidade infiltrativa. Sendo tais fatores influenciados pelo comportamento celular de angiogênese em ambiente não confinado, propõe-se uma investigação quanto ao comportamento celular de GBM em microestruturas não confinadas e processamento de imagens e dados. Com isso, buscamos compreender o comportamento da migração e da angiogênese das células tumorais de GBM em ambiente que mimetiza a configuração in vivo. Financiamento: CNPq 4/2021- Bolsas de Produtividade em Pesquisa (2022-2025). , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / Marcella Abranche Gil de Castro - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Bolsa.

• 2022 - Atual

  Prospecção de biomarcadores para a medicina de precisão em oncobiologia: uma abordagem proteômica, Descrição: As doenças crônico-degenerativas não transmissíveis (DCNTs) compreendem um conjunto de desordens de origem multifatorial e são responsáveis por cerca de 70 de todas as mortes ao redor do mundo, com custos socioeconômicos da magnitude de US$ 7 trilhões entre os anos de 2011 e 2025 (1A, 1). Apesar do diagnóstico precoce aumentar as chances de cura e da qualidade de vida, é possível constatar que a variabilidade genética natural da população altera significativamente as abordagens terapêuticas a serem adotadas. Por essa razão, a busca por parâmetros individualizados, a chamada medicina personalizada e a medicina de precisão têm recebido muita atenção. Além disso, tem crescido a busca pelo aperfeiçoamento de ferramentas diagnósticas para DCNTs, visando a identificação de biomarcadores que possam aumentar a certeza do diagnóstico e, consequentemente, as chances de tratamento e cura. Por essas razões, o presente projeto visa estudar, sob a óptica da Patologia Molecular, com ênfase nas ciências ômicas, a identificação de novos biomarcadores para uma classe de DCNTs que não possuem, atualmente, marcadores confiáveis e de fácil utilização pelos Serviços de Anatomia Patológica (SAP) como, por exemplo, uma classe de neoplasia maligna do Sistema Nervoso Central (SNC). Financiamento: FAPERJ 20/2021- Programa de apoio à projetos de pesquisa e desenvolvimento tecnológico em medicina de precisão (2021-2025). , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / Aline Cristina de Menezes - Integrante / Denise de Abreu Pereira - Integrante / Fabio César Sousa Nogueira - Integrante / Isabella Abraão - Integrante / Ana Luiza Silva Ferreira - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2022 - Atual

  Grupo Brasileiro de Estudos sobre o Linfoma de Células do Mato, Descrição: O Linfoma de Células do Manto (LCM) é uma neoplasia hematológica maligna que, embora bem descrita morfologicamente, ainda apresenta diversos desafios, principalmente relacionado aos fatores prognósticos, estadiamento da doença e tratamento. Infelizmente, não há abordagem terapêutica específica eficaz contra o LCM, sendo utilizadas terapias que apenas prolongam o tempo livre de doença e sobrevida global. Com frequência, pacientes com cursos e desfechos clínicos heterogêneos são inseridos no mesmo grupo prognóstico, comprometendo o planejamento e a abordagem terapêutica do linfoma. Além disso, há uma lacuna de conhecimento acerca dos pacientes brasileiros com LCM, tanto na descrição epidemiológica básica quanto na caracterização genômica associadas aos dados clínicos, visto que o conhecimento científico está baseado em estudos de populações de países desenvolvidos, com população étnica e socioeconomicamente diferente. Tais indivíduos são desconhecidos cientificamente pela equipe médica brasileira, impedindo uma abordagem individualizada de máxima eficiência. Dessa forma, a caracterização clínica e morfológica dos pacientes brasileiros com diagnóstico de LCM é indispensável para uma abordagem integral e completa dessa neoplasia no país, além de poder se tornar uma promissora ferramenta para novas propostas terapêuticas. Por essas razões o Sistema Único de Saúde (SUS) perde em não conseguir realizar um planejamento de saúde pública, desperdiçando recursos humanos e financeiros e ofertando um tratamento ineficiente a esses pacientes. O objetivo revolucionário principal da pesquisa em questão é estabelecer pilares para a abordagem científica do LCM no Brasil, através de técnicas já amplamente utilizadas em outros países. A inovação da proposta está na aplicação de metodologias já validadas (como: coleta de informações clínicas em prontuários, realização de imuno-histoquímica, sequenciamento genético por PCR Tradicional SANGER em amostras biológicas armazenas em blocos de parafina e sequenciamento genético por NGS) em um contexto de saúde pública brasileira, estudando pacientes brasileiros diagnosticados com LCM desde 2010 com o objetivo de (1) Categorizar pela, primeira vez, os pacientes com LCM no Brasil (2) Propor uma estratificação prognostica que leve em conta fatores específicos da população brasileira, isto é, que se adequem às nossas particularidades populacionais (3) Apresentar o cenário do LCM na saúde pública e evidenciar possíveis pontos a serem modificados, como os tipos de tratamento aprovados pelo SUS (4) Validar fatores prognósticos utilizados em países desenvolvidos, como a imuno-histoquímica para P53, demonstrando ou não a efetividade dessa técnica no Brasil e incentivar, caso tenha valor prognóstico, a ampliação do uso desse técnica em todo território nacional (5) Caracterizar o perfil de alterações genômicas em pacientes brasileiros já descritas pela literatura científica, tendo como alvo os genes TP53, NOTCH1 e CDKN2A e correlacionar com fatores prognósticos. Embora tais genes sejam considerados promissores pela literatura internacional para diagnóstico diferencial, nenhum estudo brasileiro cita ou investiga essas alterações genéticas na população brasileira acometida com LCM (6) Elucidar a necessidade de utilização de sequenciamento genético como fator prognóstico dos pacientes ao diagnóstico de LCM e indicar qual é a melhor técnica a ser aplicada no contexto de saúde pública brasileira. O estudo já conta com um banco de dados clínicos composto por 205 pacientes diagnosticados com LCM, advindos de 11 centros parceiros espalhados por diferentes estados brasileiros, como São Paulo, Rio de Janeiro, Distrito Federal, Minas Gerais e Amazonas. Até o momento já realizamos a extração de material genético de 63 pacientes brasileiros para sequenciamento por SANGER e Next Generation Sequencing (NGS).. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Integrante / Nathalia Pentagna - Integrante / Cristiane Bedran Milito - Integrante / GALLUCCI FIGORELLE, LARA - Integrante / GALVÃO, PETERSON TIAGO - Integrante / MARIMON, PATRICIA - Integrante / SCHAFFEL, RONY - Coordenador., Número de produções C, T & A: 1

• 2022 - Atual

  Characterization of the molecular and genetic mechanisms underlying cellular behavior on three-dimensional (3D) environments and their impact on health and disease, Descrição: O presente projeto faz parte do Acordo aprovado no âmbito do Instituto de Ciências Biomédicas (ICB) da UFRJ visando a criação do International Research Project (IRP): Biointerfaces, Biominerals, Biomaterials. Este projeto é parte integral do acordo de cooperação bilateral França-Brasil celebrado entre o Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), a Universite de Haute-Alsace e a Universite de Limoges, pelo lado francês, e o Centro Nacional de Pesquisas Físicas (CBPF) e a Universidade Federal do Rio de Janeiro,pelo lado brasileiro. A parceria entre os grupos franceses e brasileiros remonta a 2005 e visa consolidar a criação de um centro internacional de especialização de alto nível para o desenvolvimento de pesquisas científicas no âmbito das áreas de biointerfaces, biominerais, biomateriais e biocerâmicas com aplicações na medicina regenerativa e na investigação do câncer. Em 2021 os grupos brasileiros e franceses submeteram o projeto de pesquisa internacional intitulado The B3lab : Biointerfaces, Biominerals, Biomaterials, tendo sido contemplado pelo edital CNRS (Centre National de la Recherche Scientifique) com financiamento para os anos de 2021 a 2025. Assim, dentro do escopo deste macro-projeto de pesquisa internacional já aprovado, e com financiamento da FAPERJ (APQ1, Edital Medicina de Precisão) e CNPq (bolsa de Produtividade nível 2), buscamos investigar se superfícies microestruturadas podem se tornar novas ferramentas para controlardeformações no núcleo celular que possam modular a organização da cromatina e a expressão gênica através de mecanismos epigenéticos. Essa estratégia nos permitirá correlacionar morfologias específicas do núcleo celular com o panorama epigenético para melhor compreender como a morfologia celular regula os domínios de hetero e eucromatina buscando caracterizar novas estratégias para manejar diferentes condições patológicas, como a inflamação e neoplasias malignas. Este projeto teve início em 2022 através de financiamento da CAPES, via edital PRINT, e do CNRS com estadia de 3 meses na Universite de Haute-Alsace, Institut de Science des Matériaux de Mulhouse, para Katia Carneiro de Paula.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / Karine Anselme - Integrante / Laurent Pieuchot - Integrante., Financiador(es): Centre National de la Recherche Scientifique - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2021 - Atual

  Núcleo Avançado de Patologia Molecular: identificação de biomarcadores em modelos pré-clínicos e anatomopatológicos para uso na medicina de precisão, Descrição: As doenças crônico-degenerativas não transmissíveis (DCNTs) compreendem um conjunto de desordens de origem multifatorial e são responsáveis por cerca de 70% de todas as mortes ao redor do mundo, com custos socioeconômicos da magnitude de US$ 7 trilhões entre os anos de 2011 e 2025. Apesar do diagnóstico precoce aumentar as chances de cura e a qualidade de vida, a médio e a longo prazo, é possível constatar que a variabilidade genética natural da população altera significativamente as abordagens terapêuticas a serem adotadas. Por essa razão, a busca por parâmetros individualizados, a chamada medicina personalizada, e a medicina de precisão, têm recebido muita atenção. Além disso, tem crescido a busca pelo aperfeiçoamento de ferramentas diagnósticas para DCNTs, visando a identificação de biomarcadores que possam aumentar a certeza do diagnóstico e, consequentemente, as chances de tratamento e cura. Por essas razões, o presente projeto visa estudar, sob a óptica da Patologia Molecular, a identificação de novos biomarcadores para doenças crônico-degenerativas que não possuem, atualmente, marcadores confiáveis. Através de abordagens genômicas e proteômicas buscaremos aplicações diagnósticas, prognósticas e/ou terapêuticas para doenças ainda sem ferramentas eficazes de manejo. A partir da expertise de nossa equipe, e em parceria com o Serviço de Anatomia Patológica do Hospital Universitário Clementino Fraga Filho da Universidade Federal do Rio de Janeiro, propomos identificar e caracterizar, em estudos pré-clínicos e anatomopatológicos, novos biomarcadores para doenças crônico-degenerativas em 3 eixos principais: oncologia, miopatias congênitas e lesões traumáticas do Sistema Nervoso Periférico. Também destacamos o eixo ensino-pesquisa e a forte correlação do projeto com a formação de recursos humanos qualificados nessa área de fronteira. Com a presente proposta visamos contribuir para a caracterização de novas estratégias que possam, a médio e a longo prazo, melhorar o diagnóstico, prognóstico e terapêutica de doenças crônicas-degenerativas que, até o presente momento, representam um relevante desafio para o manejo de pacientes e para condutas terapêuticas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Integrante / Aline Cristina de Menezes - Integrante / Ana Maria Blanco Martinez - Coordenador / Fernanda de Almeida Maia - Integrante / EL-CHEIKH, MARCIA CURY - Integrante / Nathalie Henriques Silva Canedo, - Integrante / Denise de Abreu Pereira - Integrante / Cristiane Bedran Milito - Integrante / tahyse pinheiro da costa - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.

• 2020 - 2024

  Projeto de Apoio Emergencial ao Programa de Pós-graduação em Anatomia Patológica da Faculdade de Medicina da UFRJ durante a pandemia COVID-19, Descrição: Durante o período de pandemia da COVID19 nosso Programa de Pós-graduação (PPG) interrompeu brevemente suas atividades para as adequações necessárias às normas de segurança sanitária. Em paralelo a isso, as regras para implementação de atividades remotas foram debatidas e divulgadas pela Pró-reitoria de Pós-graduação e Pesquisa da UFRJ (PR2), normatizando as atividade de ensino remoto. Após consulta ao corpo social de nosso PPG, identificamos que a maioria dos alunos desejava participar de atividades remotas, como disciplinas e seminários, o que levou à abertura de turmas de disciplinas obrigatórias e eletivas. Também fomos capazes de retomar as atividades de pesquisa relacionadas à dissertações e teses de nosso PPG, culminando na defesa de duas dissertações e três teses. Já temos mais duas dissertações e uma tese qualificadas para as defesas, que estão agendadas para o mês de Dezembro. Assim, destacamos no presente projeto os trabalhos em desenvolvimento em nosso PPG que mantiveram suas atividades de pesquisa ativas durante o período de pandemia e que necessitam de aporte e financiamento para sua continuidade. Esses trabalhos têm como foco a identificação de novos bio-marcadores para doenças crônicas que não possuem, atualmente, marcadores confiáveis para aplicações diagnósticas, prognósticas e/ou terapêuticas. A partir da expertise de nossa equipe propomos identificar e caracterizar, em estudos pré-clínicos e anatomopatológicos, novos bio-marcadores para doenças crônicas de fundo inflamatório, atuando em 3 eixos principais, a saber: 1. Bio-marcadores para uso prognóstico 2. Bio-marcadores para uso terapêutico e 3. Bio-marcadores para uso diagnóstico. Com a presente proposta visamos contribuir para a caracterização de novas estratégias que possam, a médio e a longo prazo, melhorar o diagnóstico, prognóstico e terapêutica de doenças crônicas que, até o presente momento, representam um relevante desafio para o manejo de pacientes e de condutas terapêuticas. Financiamento: FAPERJ. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (10) / Doutorado: (10) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / Ana Maria Blanco Martinez - Integrante / Nathalie Canedo - Integrante / Fernanda de Almeida Maia - Integrante / Cristiane Bedran Milito - Integrante., Financiador(es): FAPERJ - Auxílio financeiro.

• 2020 - Atual

  The B3lab: Biointerfaces, Biominerals, Biomaterials., Descrição: Essa colaboração é desenvolvida com o Biointerfaces-Biomaterials Group, Institut de Science des Matériaux de Mulhouse (IS2M), CNRS UMR7361, Mulhouse e Bioceramics Group, Institut de Recherche sur les Céramiques (IRCER), CNRS UMR 7315 University of Limoges, Limoges, através da Dra. Karine Anselme. Nesse projeto estamos investigando as principais modificações epigenéticas promovidas por substratos com diferentes características físicas, como topologia e dureza. Buscamos compreender a longo prazo como tecidos biológicos de diferentes características físicas interagem com as células tumorais e interferem na sua biologia. Em 2022 e 2023 estive em licença sabática para uma missão científica no Institut de Science des Matériaux de Mulhouse (IS2M) que gerou o artigo intitulado "Fabrication and characterization of thin self-rolling film for anti-inflammatory drug delivery", publicado na revista "COLLOIDS AND SURFACES B-BIOINTERFACES". A partir de Outubro de 2024 passei a coordenar localmente as atividades dessa cooperação internacional. Financiamento: CNRS (2021-2025); CNPq (2023-2026). , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Integrante / Marcia Cury El-Cheikh - Integrante / Aline Cristina de Menezes - Integrante / Marcos Farina de Souza - Integrante / Karine Anselme - Coordenador / tahyse pinheiro da costa - Integrante / Felipe Matheus Ribeiro de Lima - Integrante / Isabella Abraão - Integrante.

• 2019 - 2021

  Authors Without Borders, Descrição: Nesse projeto, que é coordenado pela profa. Dena Plemmons, Diretora do Programa de Pesquisa em Ética e Educação da Universidade da Califórnia, buscamos elaborar ferramentas investigativas sobre as práticas de atribuição de autoria de trabalhos científicos ao redor do mundo. No Brasil, a equipe conta com a participação de professores e alunos de Pós-graduação que buscam elaborar e aperfeiçoar instrumentos avaliativos dessas práticas e congrega-los a um grande dispositivo que será aplicado em nível mundial. Esperamos compreender de forma mais clara como a cultura e os hábitos sociais influenciam na atribuição de autoria em trabalhos científicos ao redor do mundo.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Integrante / Karina de Albuquerque Rocha - Integrante / Renan Moritz - Integrante / Dena Plemmons - Coordenador., Financiador(es): National Institutes of Health - Auxílio financeiro.

• 2019 - 2021

  Apoio ao Programa de Pós-graduação em Anatomia Patológica da Faculdade de Medicina da UFRJ, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (10) / Mestrado acadêmico: (10) / Doutorado: (10) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / Nathalie Canedo - Integrante / Fernanda de Almeida Maia - Integrante / Cristiane Bedran Milito - Integrante., Financiador(es): FAPERJ - Auxílio financeiro.

• 2019 - Atual

  Consolidação de rede multidisciplinar (Nano Saúde) para o desenvolvimento translacional de nano-produtos para diagnóstico, tratamento de tumores, traumas e doenças degenerativas., Descrição: Através da atuação na rede de pesquisa poderemos contribuir para investigar aspectos relacionados à oncogênese e reparo e regeneração de tecidos. Serão utilizados modelos de cultura de células para testar nanoprodutos biotecnológicos em colaboração com o IMA/UFRJ.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Integrante / Adriana Oliveira-Silva - Integrante / Marcia Cury El-Cheikh - Integrante / Aline Cristina de Menezes - Integrante / Felipe Matheus Faria - Integrante / Thayse Pinheiro da Costa - Integrante / Thais Barradas - Integrante / Marcos Farina de Souza - Integrante / Alexandre Rossi - Coordenador., Financiador(es): FAPERJ - Auxílio financeiro.

• 2019 - Atual

  O Epigenoma como alvo terapêutico em oncobiologia, Descrição: Glioblastoma (GBM) é o tumor mais agressivo do Sistema Nervoso Central e é altamente refratário às abordagens terapêuticas propostas pela clínica oncológica atualmente. Por essa razão nosso grupo tem se dedicado ao estudo de novas propostas para o manejo dessa malignidade. De forma particular estamos interessados em compreender a importância do Epigenoma dependente da atividade da enzima Histona Desacetilade (HDAC) para o estabelecimento das assinaturas moleculares do secretoma de GBM. De fato, recentemente demonstramos por live cell imaging que a atividade HDAC é necessária para regular a agressividade de GBM. Nossos resultados mostraram que inibidores de HDAC (iHDAC) já está aprovados para uso na clínica humana desempenham um importante papel na diminuição da população tumoral de GBM. Também demonstramos que mecanismos de endocitose são responsáveis por controlar a dinâmica de secreção de proteínas em GBM durante a diferenciação e desdiferenciação de células tronco tumorais de GBM. Assim, demonstramos claramente que a secreção e a estruturação do Epigenoma por mecanismos dependentes de HDAC são essenciais para a biologia de GBM. Tendo em vista iHDACs estão sendo testados em ensaios clínicos, propomos investigar o uso de iHDACs para modular qualitativa e quantitativamente o secretoma de GBM. Para abordar essa questão utilizamos Espectometria de Massas e fomos capazes de identificar proteínas que compõe o repertório de assinaturas moleculares do secretoma de GBM cuja abundância é dependente da atividade HDAC, com especial destaque para o hit de proteínas da Matriz Extra Celular (MEC). Assim, no presente projeto propomos aprofundar nossas análises investigando por metodologias estruturais e funcionais as características da MEC depositada por GBM após a inibição da atividade HDAC. Assim, a médio/longo prazo, esperamos contribuir para avanços na utilização de iHDACs para a clínica de GBM visando novas abordagens terapêuticas para o manejo dessa malignidade.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / Aline Cristina de Menezes - Integrante / Glaucia Henriques Julião - Integrante / Denise de Abreu Pereira - Integrante / Fabio César Sousa Nogueira - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.

• 2018 - 2022

  Controle epigenético da resolução da inflamação durante a regeneração de tecidos e órgãos, Descrição: A resposta inflamatória tem sido mostrada como um elemento essencial para a capacidade regenerativa de diferentes animais. Células mielóides,como neutrófilos e monócitos, secretam mediadores pró-resolutivos (SPMs) que são essenciais para a resolução da inflamação e volta do sistema à homeostase. Mais recentemente os papéis das células mielóides durante a regeneração tecidual vêm sendo esclarecidos, sem contudo, explicar se existe uma relação direta entre a resolução da inflamação e a mediação da regeneração. Assim,nesse projeto, buscamos identificar essa relação através da utilização de dois modelos animais de alta e baixa habilidade regenerativa,buscando comparar os principais eventos relacionados à regeneração e à resolução da inflamação. Do ponto de vista mecanístico, investigamos a participação da maquinaria epigenética como principal canalizador das vias de sinalização que culminam em outputs específicos para responder de forma adequada às demandas do organismo após uma injúria, seja ela aguda seja ela cônica. Em nossas abordagens experimentais utilizamos o modelo murino, de baixa habilidade regenerativa, e o anfíbio Xenopus laevis, de alta habilidade regenerativa. Nossos achados têm mostrado que terapias epigenéticas têm o potencial de modular o comportamento das células mielóides e modular o potencial regenerativo de tecidos e órgãos, propondo novas abordagens translacionais para melhor promover o reparo e regeneração de tecidos biológicos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / Michael Levin - Integrante / Mariana Cabanel - Integrante / Nathalia Pentagna - Integrante / Thayse Pinheiro - Integrante., Financiador(es): FAPERJ - Bolsa., Número de produções C, T & A: 3

• 2018 - 2022

  Reparo tecidual: a galectina-3 como biomarcador em modelos pré-clínicos de lesão cutânea e do sistema nervoso, Descrição: O reparo tecidual é um processo que visa neutralizar danos provenientes deagentes tóxicos ou processos inflamatórios decorrentes de traumas ou outras etiologias,e tem como meta restaurar a arquitetura e a função teciduais. A inflamação queacompanha o reparo engloba eventos complexos que podem gerar distúrbios naresolução do processo, com consequente formação de cicatriz e perda da arquitetura efunção teciduais, sendo esta a maior causa de morbidade e mortalidade de doençascrônicas. As terapias em uso atualmente não são eficazes para modular de formaadequada o processo inflamatório e promover a transição correta para a fase deresolução da inflamação e consequente reparo tecidual. Portanto, modulandoadequadamente o comportamento de células imunocompetentes poderemos propor umaterapêutica inovadora baseada na modulação do comportamento delas dentro dasdiferentes etapas do reparo tecidual. Propomos neste projeto estudar o papel dagalectina-3 na modulação da resposta inflamatória em diferentes modelos de reparotecidual, uma vez que essa lectina tem sido usada como alvo terapêutico ou biomarcadorde diagnóstico ou prognóstico em várias doenças humanas. Nosso grupo apresentaampla expertise no estudo da galectina-3, tendo revelado seu papel no reparo tecidualapós lesões cutâneas e do Sistema Nervoso (SN) através da modulação da respostainflamatória. Para aprofundar nossos estudos e propor abordagens terapêuticas emconsonância com a era pós-genômica, propomos atuar dentro de 3 eixos temáticosprincipais, que englobam a utilização da galectina-3 como principal readout para estudoda modulação da resposta inflamatória em cenários de lesão aguda, como o reparocutâneo e do SN após trauma e a malformação cortical causada por lesão durante odesenvolvimento encefálico. Nossos resultados poderão revelar alvos terapêuticoseficazes para diversas patologias, mediante favorecimento do processo resolutivo comsubsequente restabelecimento da função tecidual.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Integrante / Marcia Cury El-Cheikh - Integrante / Ana Maria Blanco Martinez - Coordenador / Henrique Marques-Souza - Integrante / Fernanda de Almeida Maia - Integrante / Suelen Adriani Marques - Integrante., Financiador(es): FAPERJ - Auxílio financeiro.

• 2017 - 2023

  Estruturação do epigenoma pela atividade Histona Desacetilase (HDAC) durante a inflamação: busca de bio- marcadores epigenéticos visando aplicações terapêuticas na clínica médica, Descrição: A inflamação é o elemento determinante na fisiopatologia de várias doenças complexas e de difícil tratamento. Embora as drogas anti-inflamatórias (AI) tenham se mostrado relevantes para amenizar os sintomas, nenhuma delas possui efeito curativo e, muitas delas, têm efeitos colaterais bastanteindesejados para o paciente. Embora o processo resolutivo tenha sido muito apreciado pelos clínicos, ele não é um processo passivo e sim uma resposta ativa programada e amplamente dependente da função macrofágica e de mediadores anti-inflamatórios para uma evolução satisfatória. Dentro dessecenário, nosso grupo tem demonstrado que inibidores da atividade das enzimas Histona Desacetilase (iHADCs) despontam como importantes alvos terapêuticos para modulação da resposta inflamatória em modelos pré-clínicos. iHDACs atuam inibindo a atividade enzimática de HDACs provocando ahiperacetilação de diferentes proteínas citoplasmáticas e nucleares, principalmente histonas. De fato, diferentes estudos têm atribuído um papel protetor para iHDACs devido ao seu amplo espectro na modulação da resposta imunológica e consequentemente na modulação de outros quadros clínicoscom fundo inflamatório como a epilepsia, as lesões cutâneas e a regeneração axonal em lesões de nervos periféricos. Financiamento: FAPERJ - SEDIADAS. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Integrante / marcia cury - Integrante / Ana Maria Blanco Martinez - Coordenador / Fernanda de Almeida Maia - Integrante / Suelen Adriani Marques - Integrante / Cristiane Bedran Milito - Integrante / Jorge Marcondes - Integrante.

• 2015 - 2019

  Estruturação do epigenoma pela atividade HDAC durante os processos de reparo e regeneração: aplicações terapêuticas para o re-estabelecimento da homeostase tecidual, Descrição: O foco do trabalho desenvolvido por nosso grupo de pesquisa está na compreensão da contribuição dos mecanismos de epigênese para a morfogênese e organogênese bem como a perturbação de tais mecanismos contribuiria para a quebra da homeostasia tecidual. Buscamos através de manipulações genéticas, e empregando técnicas de proteômica, biologia molecular, celular e técnicas de imagem em tempo real, estudar o papel dos componentes epigenéticos da cromatina durante a organogênese e manutenção da homeostasia tecidual. Estamos particularmente interessados em abordar esta questão utilizando modelos bem caracterizados por nosso grupo na literatura de desenvolvimento embrionário, regeneração de membros e reparo tecidual.Assim, apesar de elucidarmos diversos aspectos do controle epigenético durante a morfogênese e homeostase teciduais, ainda não compreendemos de forma clara como o epigenoma é remodelado, ao nível subcelular, durante esses processos. Para investigar este aspecto, utilizaremos o modelo de reparo tecidual que envolve a modulação da resposta inflamatória induzida por lesão cutânea e o modelo de regeneração de cauda do anfíbio Xenopus laevis. Resultados gerados por nosso grupo nos permitem concluir 3 aspectos principais que irão fundamentar nosso desenho experimental:1. Mostramos que a atividade da enzima remodeladora do epigenoma, Histona Desacetilase (HDAC) é necessária para a morfogênese de tecidos epiteliais através da modelagem de padrões de expressão envolvidos diretamente neste evento de morfogênese, como o membro da superfamília TGFbeta, Bone Morphogenetic Proteins 2/4 (BMP2/4);2. De forma interessante, também mostramos que o knockdown farmacológico da atividade HDAC, em células progenitoras mielóides, gera macrófagos alongados com um perfil misto M1/M2 de secreção de citocinas, quimiocinas e mediadores inflamatórios (Mariana Cabanel, dissertação de mestrado; Cabanel et al, 2015). Concluímos com esse trabalho que o bloqueio da atividade HDAC atua como um potente anti-inflamatório in vitro que favoreceria o reparo tecidual in vivo. 3. Nosso grupo também demonstrou que a atividade HDAC é necessária para a capacidade regenerativa da cauda da larva de Xenopus. O knockdown farmacológico da atividade HDAC foi correlacionada ao estabelecimento incorreto do programa genético necessário para a regeneração. Assim, no presente projeto buscamos caracterizar os mecanismos genéticos e moleculares que integram a atividade HDAC às vias de sinalização celular envolvidas no reparo tecidual e regeneração in vivo. Por essa razão, esse projeto também busca consolidar as bases celulares e moleculares da atividade HDAC buscando aplicações terapêuticas que se mostrem eficazes na resolução de lesões teciduais. Essa estratégia é baseada na utilização de inibidores da atividade HDAC que tem sido amplamente testados em diferentes ensaios pré-clínicos e clínicos no tratamento de leucemias mas que nunca foram testados no contexto do reparo e regeneração.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / marcia cury - Integrante / Mariana Cabanel - Integrante / Nathalia Pentagna - Integrante / Thayse Pinheiro - Integrante / João Gabriel Almeida - Integrante / Samara Dias - Integrante / Michael Levin - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro / Tufts University - Cooperação / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa., Número de produções C, T & A: 6

• 2014 - 2017

  Bases moleculares da evolução da morfologia genital, Descrição: O estudo do desenvolvimento e evolução de caracteres morfológicos complexos em animais é uma área que busca compreender como genes envolvidos na padronização de órgãos durante o desenvolvimento são regulados em diferentes espécies de forma a gerar a grande diversidade morfológica observada na natureza, mesmo diante da grande conservação da função estrutural de tais genes. Durante o desenvolvimento embrionário, diversas vias de sinalização e padrões de expressão gênica são coordenados para conferir identidade posicional e proporção aos órgãos em desenvolvimento, especialmente através de moléculas com propriedades de difusão que sinalizam para grupos de células à longa distância. Classicamente os genes decapentaplegic (dpp) e wingless (wg) são descritos como morfógenos de sinalização extracelular relacionados à padronização morfológica de derivados ectodérmicos, como ocorre nos discos imaginais de Drosophila. Os discos imaginais são tecidos larvais que darão origem aos apêndices do adulto como asas, antenas, patas e órgãos genitais. Por serem essencialmente bidimensionais, esses discos constituem um excelente modelo para o estudo dos mecanismos genéticos e celulares envolvidos na padronização de tamanho e forma. Dentro do grupo repleta de Drosophila, estudos sobre evolução e desenvolvimento de padrões morfológicos e sobre mecanismos ecológicos e adaptativos de tais padrões têm empregado a análise morfológica do órgão genital masculino, uma vez que este órgão é importante para processos de estruturação populacional e especiação, sendo considerado como um caráter taxonômico muito importante para diferenciar espécies irmãs no gênero Drosophila. No entanto, tais estudos carecem de uma abordagem mecanística acerca do estabelecimento de padrões de atividade gênica e campos morfogenéticos que originam a diversidade morfológica do órgão genital característica deste grupo. O presente projeto tem, portanto, o objetivo de elucidar as bases genéticas e celulares da diversidade morfológica encontrada no órgão genital masculino do grupo repleta que, assim como em outros discos imaginais, devem estar relacionadas ao estabelecimento de padrões de atividade dos genes dpp e wg durante o desenvolvimento. Propomos uma abordagem que utiliza técnicas de biologia molecular e celular para caracterizar e quantificar os padrões de expressão dos genes dpp e wg.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / Nicolas Frankel - Integrante / Rodrigo Nunes Fonseca - Integrante / Blache Matte-Bitner - Integrante / Helena Araujo - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Cooperação.

• 2013 - 2015

  Integração do sinal de BMP/Dpp e Wnt/Wingless ao epigenoma durante o desenvolvimento animal, Descrição: O foco do trabalho desenvolvido por nosso grupo de pesquisa está centrado na compreensão da contribuição dos mecanismos de epigênese para a morfogênese e organogênese. Buscamos através de manipulações genéticas do embrião, e empregando técnicas de proteômica, biologia molecular, celular e técnicas de imagem em tempo real, estudar o papel dos componentes epigenéticos da cromatina durante a organogênese. Estamos particularmente interessados em abordar esta questão no contexto do desenvolvimento embrionário e regeneração de membros (Carneiro, et al., 2011;Tseng Carneiro et al., 2011). O mapeamento em larga escala dos componentes epigenéticos da cromatina, que regulam de forma dinâmica a atividade gênica, é na atualidade um foco de crescente interesse que reúne esforços de diferentes grupos de pesquisa concretizado no projeto ?Model Organism Encyclopedia of DNA Elements (modENCODE)?. Dentro deste contexto, foi mapeado recentemente o perfil do repertório de modificações epigenéticas encontrado em células de Drosophila em um sistema in vitro. Propomos portanto, ampliar esta rede de informações investigando a dinâmica funcional do epigenoma in vivo através do estudo da atividade da enzima Histona Desacetilase (HDAC) e sua importância sobre a modelagem do perfil de atividade gênica de genes chave para o desenvolvimento embrionário. Em particular, o presente projeto tem como principal meta caracterizar o perfil epigenético de genes envolvidos no estabelecimento da polaridade tecidual que é crucial para a morfogênese de tecidos epiteliais polarizados. Desenhamos este trabalho baseados em um artigo publicado recentemente por nosso grupo onde descrevemos, pela primeira vez na literatura, o envolvimento de mecanismos de epigênese na morfogênese de embriões de vertebrado (Carneiro et al., 2011). Focaremos em duas vias de sinalização que são essenciais para o estabelecimento da polaridade celular e tecidual, envolvidas tanto em eventos de morfogênese e organogênese quanto em processos de transformação celular: BMP/Dpp e Wnt/Wingless. Buscaremos através de um metodologia multidisciplinar de biologia celular aliadas à biologia molecular e proteômica correlacionar a ativação e funcionalidade das vias de sinalização BMP/Dpp e Wnt/Wingless com o estado do epigenoma, estabelecendo uma relação direta entre as modificações epigenéticas encontradas nos loci gênicos que codificam elementos destas duas vias de sinalização. Desta forma, estaremos traçando um primeiro paralelo entre modelagem da cromatina, atividade de vias de sinalização e eventos de morfogênese.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / Carla Marques Barreto - Integrante / Jessica Baptista - Integrante.

• 2013 - Atual

  Controle epigenético do desenvolvimento de Glioblastoma, Descrição: Glioblastoma é o tumor mais agressivo do Sistema Nervoso Central com um baixo prognóstico após ressecção cirúrgica. Sua complexa biologia e genética contribuem para suas características de malignidade juntamente com a existência de populações de células tronco tumorais que conferem resistência a esse tipo tumoral. Dentro desse contexto temos abordado o papel da estruturação do Epigenoma para sua biologia e complexidade acoplando estratégias inter e multidisciplinares. Em conjunto com ferramentas clássicas de biologia molecular e celular, utilizamos técnicas avançadas de video microscopia em tempo real, xenoenxerto e proteômica para melhor compreender o impacto dos mecanismos epigenéticos para a biologia e comportamento desse tumor.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / Maria Cecilia Nunes - Integrante / Ana Luiza Barbeitas - Integrante / Aline Cristina de Menezes - Integrante / Gustavo Henrique Reis - Integrante / Fernanda Mariath - Integrante / John Hanover - Integrante., Financiador(es): CAPES - Centro Anhanguera de Promoção e Educação Social - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação do Câncer Ary Frausino - Auxílio financeiro / National Institutes of Health - Cooperação / Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 5

• 2012 - 2015

  As bases celulares e moleculares para entender as doenças relacionadas ao desenvolvimento embrionário, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (5) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Integrante / Fabio Mendes - Integrante / Jose Brito - Integrante / José Garcia Abreu - Coordenador / Flavia Gomes - Integrante / Roberto Lent - Integrante / Vivaldo Moura Neto - Integrante / Joyce Stipursky - Integrante.

• 2010 - Atual

  Estudo da atividade de Histonas Deacetilases (HDAcs) durante a regeneração, Descrição: Os processos que envolvem a regeneração em nível global de órgãos ou membros amputados têm sido amplamente estudados com o modelo de reneração da cauda de Xenopus laevis. Este modelo é extremamente interessante uma vez que existe uma janela do desenvolviemento deste animal, na qual a cauda do girino pode ser completamente regenerada ,a partir de uma estrutura chamada broto regenerativo após amputação. A incrível capacidade regenerativa deste modelo tem sido explorada para a maior compreensão dos mecanismos moleculares que regulam o padrão de expressão gênica necessário para reconstruir o órgão amputado. Dentro deste contexto, estamos interessados em compreender como os marcadores epigenéticos que caracterizam os fenótipos altamente diferenciados das células, antes da amputação da cauda, são apagados para que as células do broto regenerativo re-adquiram a habilidade de proliferar levando à completa regeneração da estrutura da cauda. Em particular, buscamos compreender a importância da atividade HDAC para aquisição de marcadores epigenéticos compatíveis com proliferação e diferenciação no modelo de reneração da cauda de Xenopus.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Integrante / Michael Levin - Coordenador / Kelly Tseng - Integrante., Financiador(es): Pew Charitable Trust - Auxílio financeiro / National Institute Of Health - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2011

  Caracterização do estado epigenético de genes envolvidos na padronização axial embrionária, Descrição: Nosso grupo vem mapeando, ao longo dos últimos dois anos, a importância da atividade das enzimas Histona Desacetilase (HDAC) em diferentes contextos, como regeneração de membros e em etapas iniciais do desenvolvimento embrionário, onde o genoma zigótico ainda se encontra sob silêncio transcricional. Mais especificamente, nosso interesse está centrado na compreensão dos mecanismos que coordenam o estabelecimento do perfil epigenético de genes envolvidos na morfogênese e organogênese. Em trabalho publicado recentemente, demonstramos que a atividade HDAC é necessária para modular os níveis de acetilação e metilação do gene membro da superfamília TGF-beta, Nodal. O bloqueio da atividade HDAC em embriões jovens de vertebrado levou a um aumento da acetilação de histonas H3 e H4 no enhancer de Nodal, que foi correlacionado à geração de más formações congênitas. Apesar de elucidarmos diversos aspectos do controle do estabelecimento do perfil epigenético de genes essenciais para o desenvolvimento embrionário e oraganogênese, ainda não compreendemos de forma clara como a atividade HDAC é alocada em populações diferenciadas de células ao longo do desenvolvimento embrionário, principalmente em etapas que precedem a morfogênese. Este aspecto é crucial para que padrões de atividade gênica sejam estabelecidos de forma correta evitando assim defeitos congênitos graves. Para investigar este aspecto, bem como a importância da atividade HDAC neste processo, propomos uma abordagem interdisciplinar empregando técnicas de manipulação genética, biologia molecular e bioquímica aliadas à aquisição de imagens em tempo real, por microscopia confocal, da dinâmica que molda o estabelecimento de assinaturas epigenéticas durante as etapas inicias do desenvolvimento embrionário.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.

Projetos de desenvolvimento

• 2024 - Atual

  Nano Naturals - Laboratory Science, Descrição: A alta ineficiência dos mecanismos de reparo tecidual é uma notável característica observada nos seres humanos, que alcança seu ápice e apresenta repercussões extremamente relevantes pois está associada às doenças crônicas não transmissíveis (DCNTs). Dentre elas, o Diabetes Mellitus se destaca, afetando cerca de 537 milhões de pessoas em todo o mundo, sendo o Brasil o 5 país mais acometido, com aproximadamente 16,8 milhões de doentes. Trazemos a proposta de um sistema nano estruturado para a entrega da terapia epigenética à base de inibidores da atividade Histona Desacetilase (HDAC), as nanoemulsões (NE) óleo/água. Elas constituem uma excelente abordagem de encapsulamento deste tipo de fármaco para sua administração tópica ou transdérmica. Como as NE são conhecidas por serem altamente fluidas, propomos utilizar filmes bioadesivos para controlar a liberação do fármaco sobre a lesão. Para isso escolhemos um filme polimérico orgânico à base de Quitosana (CS) como plataforma para a liberação sustentada do fármaco. CS apresenta características importantes como flexibilidade, biocompatibilidade, biodegradação e tem sido amplamente utilizado como biomaterial durante o reparo tecidual devido a sua semelhança estrutural com a matriz extracelular. A utilização de filmes com nanoemulsões tem sido estudada para a aplicação em estratégias de reparo tecidual para proteger fisicamente as lesões, mas ainda não existe uma formulação elaborada para entrega de terapia epigenética .. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / BARRADAS, THAÍS NOGUEIRA - Integrante / Karla Roberta Moreira - Integrante / Adriana de Olikveira e Silva - Integrante / Luiza Chrysóstomo - Integrante / Thuanne Fonseca Casado Lins - Integrante., Financiador(es): FAPERJ - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2

• 2024 - Atual

  Nano Naturals - Laboratory Science, Descrição: A alta ineficiência dos mecanismos de reparo tecidual é uma notável característica observada nos seres humanos, que alcança seu ápice e apresenta repercussões extremamente relevantes pois está associada às doenças crônicas não transmissíveis (DCNTs). Dentre elas, o Diabetes Mellitus se destaca, afetando cerca de 537 milhões de pessoas em todo o mundo, sendo o Brasil o 5 país mais acometido, com aproximadamente 16,8 milhões de doentes. Trazemos a proposta de um sistema nano estruturado para a entrega da terapia epigenética à base de inibidores da atividade Histona Desacetilase (HDAC), as nanoemulsões (NE) óleo/água. Elas constituem uma excelente abordagem de encapsulamento deste tipo de fármaco para sua administração tópica ou transdérmica. Como as NE são conhecidas por serem altamente fluidas, propomos utilizar filmes bioadesivos para controlar a liberação do fármaco sobre a lesão. Para isso escolhemos um filme polimérico orgânico à base de Quitosana (CS) como plataforma para a liberação sustentada do fármaco. CS apresenta características importantes como flexibilidade, biocompatibilidade, biodegradação e tem sido amplamente utilizado como biomaterial durante o reparo tecidual devido a sua semelhança estrutural com a matriz extracelular. A utilização de filmes com nanoemulsões tem sido estudada para a aplicação em estratégias de reparo tecidual para proteger fisicamente as lesões, mas ainda não existe uma formulação elaborada para entrega de terapia epigenética .. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / BARRADAS, THAÍS NOGUEIRA - Integrante / Karla Roberta Moreira - Integrante / Adriana de Olikveira e Silva - Integrante / Luiza Chrysóstomo - Integrante / Thuanne Fonseca Casado Lins - Integrante., Financiador(es): FAPERJ - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2

Prêmios