Kátia Carneiro de Paula

Pós-doutorado

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em eventos

Participação em bancas

Comissão julgadora das bancas

Orientou

Foi orientado por

Produções bibliográficas

• OLIVEIRA-NUNES, MARIA CECÍLIA ; JULIAO, G. H. ; MENEZES, ALINE ; MARIATH, FERNANDA ; HANOVER, J. ; EVARISTO, J. A. M. ; NOGUEIRA, F. C. S. ; BARBOSA, W. D. ; PEREIRA, D. A. ; CARNEIRO K . OGlcNAcylation protein disruption by Thiamet G promotes changes on the GBM U87MG cells secretome molecular signature.. Clinical Proteomics , v. 18, p. 1-15, 2021.

• DA COSTA, THAYSE PINHEIRO ; EL-CHEIKH, MARCIA CURY ; CARNEIRO, KATIA . Epigenetic Therapy as a Putative Molecular Target to Modulate B Cell Biology and Behavior in the Context of Immunological Disorders. Journal of Immunology Research , v. 2020, p. 1-19, 2020.

• PENTAGNA, NATHALIA ; PINHEIRO DA COSTA, THAYSE ; SOARES DOS SANTOS, FELLIPE ; MARTINS DE ALMEIDA, FERNANDA ; BLANCO MARTINEZ, ANA MARIA ; ABREU, JOSÉ GARCIA ; LEVIN, MICHAEL ; CARNEIRO, KATIA . Epigenetic control of myeloid cells behavior by Histone Deacetylase Activity (HDAC) during tissue and organ regeneration in Xenopus laevis. DEVELOPMENTAL AND COMPARATIVE IMMUNOLOGY , v. 1, p. 103840, 2020.

• CABANEL, MARIANA ; DA COSTA, THAYSE PINHEIRO ; EL-CHEIKH, MARCIA CURY ; CARNEIRO, KATIA . The epigenome as a putative target for skin repair: the HDAC inhibitor Trichostatin A modulates myeloid progenitor plasticity and behavior and improves wound healing. Journal of Translational Medicine , v. 17, p. 247, 2019.

• MENEZES, ALINE ; DOS REIS, GUSTAVO HENRIQUE ; OLIVEIRA-NUNES, MARIA CECÍLIA ; MARIATH, FERNANDA ; CABANEL, MARIANA ; PONTES, BRUNO ; GONÇALVES CASTRO, NEWTON ; DE BRITO, JOSÉ MARQUES ; CARNEIRO, KATIA . Live Cell Imaging Supports a Key Role for Histone Deacetylase as a Molecular Target during Glioblastoma Malignancy Downgrade through Tumor Competence Modulation. JOURNAL OF ONCOLOGY , v. 2019, p. 1-16, 2019.

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• NUNES, M. C. ; LIMA, F. ; DUBOIS, L. G. ; KAHN, S. A. ; CAMPANATI, L. ; MOURA NETO, V. ; Carneiro, K . The availability of the embryonic TGF- protein Nodal is dynamically regulated during glioblastoma multiform tumorigenesis through an endocytic pathway.. In: SDB 75th Annual Meeting - ISD 19th International Conference, 2016, Boston. SDB 75th Annual Meeting - ISD 19th International Conference, 2016.

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• REIS, G. H. ; Brito J ; Carneiro, K . The embryonic microenvironment drives the recapitulation of developmental events in Glioblastoma cells through epigenetic mechanisms Histone Deacetylase (HDAC)- dependent mechanisms.. In: XIX Congresso Internacional da Sociedade Brasileira de Biologia Celular, 2016, São Paulo. XIX Congresso Internacional da Sociedade Brasileira de Biologia Celular, 2018.

• CAMARA, A. ; NEGREIROS, E. ; ARAUJO, H. ; CARNEIRO K ; TODESCHINI, A. . Glycosylation processes regulate BMP pathway during Drosophila melanogaster development.. In: 16th SBBC Meeting, 2012, Rio de Janeiro. 16 th SBBC Meeting, 2012.

• NUNES, M. C. ; LIMA, F. ; CARNEIRO K ; MOURA NETO, V. . The subcellular distribution of the asymmetric protein Nodal in glial cells plays a key role during development and physiopathology of the central nervous system.. In: 16th SBBC Meeting, 2012, Rio de Janeiro. 16 th SBBC Meeting, 2012.

• MARQUES, C. ; NEGREIROS, E. ; ARAUJO, H. ; CARNEIRO K . HDAC activity is necessary for the morphogenesis of polarized tissues. In: 16th SBBC Meeting, 2012, Rio de Janeiro. 16th SBBC Anual Meeting, 2012.

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• ARAUJO, H. ; CARNEIRO K ; FONTENELE, M. ; NEGREIROS, E. ; BIER, E. . Delayed effect of a maternal BMP on stablishment of the embryonic dorsal-ventral axis.. In: 65th Annual Meeting of Society for Developmental Biology, 2006, Ann Arbor. 65th Annual Meeting, 2006. v. 295. p. 286-286.

• CARNEIRO K ; FONTENELE, M. ; NEGREIROS, E. ; BIER, E. ; ARAUJO, H. . Maternal short gastrulation (sog) and decapentaplegic (dpp) contribute to pattern the Drosophila dorsal-ventral axis by delayed induction. In: 2nd International Meeting of the Latin American Society of Developmental Biology, 2005, Guarujá. 2nd International Meeting of the Latin American Society of Developmental Biology, 2005.

• CARNEIRO K ; FONTENELE, M. ; LOPES, E. S. S. ; NEGREIROS, E. ; BIER, E. ; ARAUJO, H. . BMP Signaling and Embryonic Dorsal-Ventral Patterning: From Mother to Embryo. In: 2nd International Meeting of the Latin American Society of Developmental Biology, 2005, Guarujá. 2nd International Meeting of the Latin American Society of Developmental Biology, 2005.

• CARNEIRO K ; FONTENELE, M. ; NEGREIROS, E. ; BIER, E. ; ARAUJO, H. . Short Gastrulation (Sog) Produced by Follicle Cells during Drosophila Oogenesis functions through Delayed Induction to Pattern the Early Embryo. In: 2nd International Symposium on Developmental Genetics in the Post-Genome Era, 2003, Angra dos Reis. 2nd International Symposium on Developmental Genetics in the Post-Genome Era, 2003.

• RIBEIRO, CS ; CARNEIRO K ; ROSS, C. A. ; ENGELENDER, S . The a-synuclein interacting protein synphilin-1 is localized to presynaptic terminals in the brain. In: XXXIª Reunião Anual da SBBq, 2002, Caxambu. XXXIª Reunião Anual da SBBq Programas e Resumos, 2002. p. 203.

• BATISTA, CM ; CARNEIRO K ; OTERO, R. M. . Evidências Ultraestruturais da Expressão Diferencial de Isoformas da Óxido Nítrico Sintase Neuronal em Células do Colículo Superior de Ratos Normais e Enucleados. In: XVI Reunião Anual da Federação de Sociedades de Biologia Experimental - FeSBE, 2001, Caxambu, 2001.

• RIBEIRO, CS ; CARNEIRO K ; LEÃO, S. ; ROSS, C. A. ; MENEZES, JR ; ENGELENDER, S . The Alpha-Synuclein Interacting Protein Synphilin-1 is Localized to Presynaptic Terminals in the Brain. In: Society for Neuroscience 31st Annual Meeting, 2001, San Diego, 2001.

• BATISTA, CM ; CARNEIRO K ; NAVARRETE, R. E. B. ; CAVALCANTE, L. A. ; OTERO, R. M. . Estudos Bioquímicos e Ultraestruturais dos Neurônios Nitridérgicos do Colículo Superior de Ratos Normais e Enucleados. In: XV Reunião Anual da Federação de Sociedades de Biologia Experimental - FeSBE, 2000, Caxambu, 2000.

• OTERO, R. M. ; BATISTA, CM ; CARNEIRO K ; CAVALCANTE, LA . Retinal Innervation of Nitric Oxide Synthase Containig Neurons in the Rat Superior Colliculus. In: Society for Neuroscience 30 Annual Meeting, 2000, New Orleans, 2000.

• PEREIRA, I. H. ; MOTA, M. S. ; CARNEIRO K ; BATISTA, CM ; OTERO, R. M. . Estudo da Expressão da Enzima Óxido Nítrico Sintase Endotelial em Células do Colículo Superior de Ratos. In: XV Reunião Anual da Federação de Sociedades de Biologia Experimental - FeSBE, 2000, Caxambu, 2000.

• BATISTA, CM ; CARNEIRO K ; CAVALCANTE, LA ; Mendez-Otero R . Distribuição Ultraestrutural da Sintase do Óxido Nítrico em Células do Colículo Superior de Rato. In: XIV Reunião Anual da Federação de Sociedades de Biologia Experimental - FeSBE, 1999, Caxambu, 1999.

• BATISTA, C. M. C. ; CARNEIRO K ; CAVALCANTE, L. A. ; MENDEZOETRO, R. . Two Different Methods to Detect Ultrastructural Distribution of Nitric Oxide Synthase in the Rat Superior Colliculus. In: VII Congresso Iberoamericano de Biologia Celular, 1998, Montivideo, 1998.

• NUNES, M. C. ; BARBEITAS, A. L. ; Cabanel, M. ; BARBOSA, W. D. ; CARNEIRO K . Epigenetic modifications on histones. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• NUNES, M. C. ; KAHN, S. A. ; Lima F ; MOURA NETO, V. ; CARNEIRO K . The Subcellular Distribution of the Asymmetric Protein Nodal in Glial Cells Plays a Key Role During Development and Physiopathology of the Central Nervous System. 2013. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• NUNES, M. C. ; Lima F ; MOURA NETO, V. ; CARNEIRO K . The subcellular distribution of the asymmetric protein Nodal in glial cells plays a key role during development and physiopathology of the central nervous system. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• CARNEIRO K ; Levin, M . Epigetic Regulation of Nodal expression by early serotonin signaling during Xenopus left right patterning. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CARNEIRO K . O estabelecimento do eixo dorso-ventral em Drosophila melanogaster: o segredo da ação dos gnes maternais. 2005. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2020 - Atual

  The B3lab: Biointerfaces, Biominerals, Biomaterials., Descrição: Essa colaboração é desenvolvida com o Biointerfaces-Biomaterials Group, Institut de Science des Matériaux de Mulhouse (IS2M), CNRS UMR7361, Mulhouse e Bioceramics Group, Institut de Recherche sur les Céramiques (IRCER), CNRS UMR 7315 University of Limoges, Limoges, através da Dra. Karine Anselme. Nesse projeto estamos investigando as principais modificações epigenéticas promovidas por substratos com diferentes características físicas, como topologia e dureza. Buscamos compreender a longo prazo como tecidos biológicos de diferentes características físicas interagem com as células tumorais e interferem na sua biologia.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Integrante / Marcia Cury El-Cheikh - Integrante / Aline Cristina de Menezes - Integrante / Marcos Farina de Souza - Integrante / Karine Anselme - Coordenador / tahyse pinheiro da costa - Integrante / Felipe Matheus Ribeiro de Lima - Integrante / Isabella Abraão - Integrante.

• 2020 - Atual

  Projeto de Apoio Emergencial ao Programa de Pós-graduação em Anatomia Patológica da Faculdade de Medicina da UFRJ durante a pandemia COVID-19, Descrição: Durante o período de pandemia da COVID19 nosso Programa de Pós-graduação (PPG) interrompeu brevemente suas atividades para as adequações necessárias às normas de segurança sanitária. Em paralelo a isso, as regras para implementação de atividades remotas foram debatidas e divulgadas pela Pró-reitoria de Pós-graduação e Pesquisa da UFRJ (PR2), normatizando as atividade de ensino remoto. Após consulta ao corpo social de nosso PPG, identificamos que a maioria dos alunos desejava participar de atividades remotas, como disciplinas e seminários, o que levou à abertura de turmas de disciplinas obrigatórias e eletivas. Também fomos capazes de retomar as atividades de pesquisa relacionadas à dissertações e teses de nosso PPG, culminando na defesa de duas dissertações e três teses. Já temos mais duas dissertações e uma tese qualificadas para as defesas, que estão agendadas para o mês de Dezembro. Assim, destacamos no presente projeto os trabalhos em desenvolvimento em nosso PPG que mantiveram suas atividades de pesquisa ativas durante o período de pandemia e que necessitam de aporte e financiamento para sua continuidade. Esses trabalhos têm como foco a identificação de novos bio-marcadores para doenças crônicas que não possuem, atualmente, marcadores confiáveis para aplicações diagnósticas, prognósticas e/ou terapêuticas. A partir da expertise de nossa equipe propomos identificar e caracterizar, em estudos pré-clínicos e anatomopatológicos, novos bio-marcadores para doenças crônicas de fundo inflamatório, atuando em 3 eixos principais, a saber: 1. Bio-marcadores para uso prognóstico 2. Bio-marcadores para uso terapêutico e 3. Bio-marcadores para uso diagnóstico. Com a presente proposta visamos contribuir para a caracterização de novas estratégias que possam, a médio e a longo prazo, melhorar o diagnóstico, prognóstico e terapêutica de doenças crônicas que, até o presente momento, representam um relevante desafio para o manejo de pacientes e de condutas terapêuticas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (10) / Doutorado: (10) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / Ana Maria Blanco Martinez - Integrante / Nathalie Canedo - Integrante / Fernanda de Almeida Maia - Integrante / Cristiane Bedran Milito - Integrante., Financiador(es): FAPERJ - Auxílio financeiro.

• 2019 - Atual

  O Epigenoma como alvo terapêutico em oncobiologia, Descrição: Glioblastoma (GBM) é o tumor mais agressivo do Sistema Nervoso Central e é altamente refratário às abordagens terapêuticas propostas pela clínica oncológica atualmente. Por essa razão nosso grupo tem se dedicado ao estudo de novas propostas para o manejo dessa malignidade. De forma particular estamos interessados em compreender a importância do Epigenoma dependente da atividade da enzima Histona Desacetilade (HDAC) para o estabelecimento das assinaturas moleculares do secretoma de GBM. De fato, recentemente demonstramos por live cell imaging que a atividade HDAC é necessária para regular a agressividade de GBM. Nossos resultados mostraram que inibidores de HDAC (iHDAC) já está aprovados para uso na clínica humana desempenham um importante papel na diminuição da população tumoral de GBM. Também demonstramos que mecanismos de endocitose são responsáveis por controlar a dinâmica de secreção de proteínas em GBM durante a diferenciação e desdiferenciação de células tronco tumorais de GBM. Assim, demonstramos claramente que a secreção e a estruturação do Epigenoma por mecanismos dependentes de HDAC são essenciais para a biologia de GBM. Tendo em vista iHDACs estão sendo testados em ensaios clínicos, propomos investigar o uso de iHDACs para modular qualitativa e quantitativamente o secretoma de GBM. Para abordar essa questão utilizamos Espectometria de Massas e fomos capazes de identificar proteínas que compõe o repertório de assinaturas moleculares do secretoma de GBM cuja abundância é dependente da atividade HDAC, com especial destaque para o hit de proteínas da Matriz Extra Celular (MEC). Assim, no presente projeto propomos aprofundar nossas análises investigando por metodologias estruturais e funcionais as características da MEC depositada por GBM após a inibição da atividade HDAC. Assim, a médio/longo prazo, esperamos contribuir para avanços na utilização de iHDACs para a clínica de GBM visando novas abordagens terapêuticas para o manejo dessa malignidade.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / Aline Cristina de Menezes - Integrante / Glaucia Henriques Julião - Integrante / Denise de Abreu Pereira - Integrante / Fabio César Sousa Nogueira - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.

• 2019 - Atual

  Consolidação de rede multidisciplinar (Nano Saúde) para o desenvolvimento translacional de nano-produtos para diagnóstico, tratamento de tumores, traumas e doenças degenerativas., Descrição: Através da atuação na rede de pesquisa poderemos contribuir para investigar aspectos relacionados à oncogênese e reparo e regeneração de tecidos. Serão utilizados modelos de cultura de células para testar nanoprodutos biotecnológicos em colaboração com o IMA/UFRJ.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / Marcia Cury El-Cheikh - Integrante / Aline Cristina de Menezes - Integrante / Felipe Matheus Faria - Integrante / Thayse Pinheiro da Costa - Integrante / Thais Barradas - Integrante / Alexandre Rossi - Integrante., Financiador(es): FAPERJ - Auxílio financeiro.

• 2019 - Atual

  Authors Without Borders, Descrição: Nesse projeto, que é coordenado pela profa. Dena Plemmons, Diretora do Programa de Pesquisa em Ética e Educação da Universidade da Califórnia, buscamos elaborar ferramentas investigativas sobre as práticas de atribuição de autoria de trabalhos científicos ao redor do mundo. No Brasil, a equipe conta com a participação de professores e alunos de Pós-graduação que buscam elaborar e aperfeiçoar instrumentos avaliativos dessas práticas e congrega-los a um grande dispositivo que será aplicado em nível mundial. Esperamos compreender de forma mais clara como a cultura e os hábitos sociais influenciam na atribuição de autoria em trabalhos científicos ao redor do mundo.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Integrante / Karina de Albuquerque Rocha - Integrante / Renan Moritz - Integrante / Dena Plemmons - Coordenador., Financiador(es): National Institutes of Health - Auxílio financeiro.

• 2019 - Atual

  Apoio ao Programa de Pós-graduação em Anatomia Patológica da Faculdade de Medicina da UFRJ, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (10) / Mestrado acadêmico: (10) / Doutorado: (10) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / Nathalie Canedo - Integrante / Fernanda de Almeida Maia - Integrante / Cristiane Bedran Milito - Integrante., Financiador(es): FAPERJ - Auxílio financeiro.

• 2018 - Atual

  Controle epigenético da resolução da inflamação durante a regeneração de tecidos e órgãos, Descrição: A resposta inflamatória tem sido mostrada como um elemento essencial para a capacidade regenerativa de diferentes animais. Células mielóides,como neutrófilos e monócitos, secretam mediadores pró-resolutivos (SPMs) que são essenciais para a resolução da inflamação e volta do sistema à homeostase. Mais recentemente os papéis das células mielóides durante a regeneração tecidual vêm sendo esclarecidos, sem contudo, explicar se existe uma relação direta entre a resolução da inflamação e a mediação da regeneração. Assim,nesse projeto, buscamos identificar essa relação através da utilização de dois modelos animais de alta e baixa habilidade regenerativa,buscando comparar os principais eventos relacionados à regeneração e à resolução da inflamação. Do ponto de vista mecanístico, investigamos a participação da maquinaria epigenética como principal canalizador das vias de sinalização que culminam em outputs específicos para responder de forma adequada às demandas do organismo após uma injúria, seja ela aguda seja ela cônica. Em nossas abordagens experimentais utilizamos o modelo murino, de baixa habilidade regenerativa, e o anfíbio Xenopus laevis, de alta habilidade regenerativa. Nossos achados têm mostrado que terapias epigenéticas têm o potencial de modular o comportamento das células mielóides e modular o potencial regenerativo de tecidos e órgãos, propondo novas abordagens translacionais para melhor promover o reparo e regeneração de tecidos biológicos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / Michael Levin - Integrante / Mariana Cabanel - Integrante / Nathalia Pentagna - Integrante / Thayse Pinheiro - Integrante., Financiador(es): FAPERJ - Bolsa., Número de produções C, T & A: 3

• 2018 - Atual

  Reparo tecidual: a galectina-3 como biomarcador em modelos pré-clínicos de lesão cutânea e do sistema nervoso, Descrição: O reparo tecidual é um processo que visa neutralizar danos provenientes de agentes tóxicos ou processos inflamatórios decorrentes de traumas ou outras etiologias, e tem como meta restaurar a arquitetura e a função teciduais. A inflamação que acompanha o reparo engloba eventos complexos que podem gerar distúrbios na resolução do processo, com consequente formação de cicatriz e perda da arquitetura e função teciduais, sendo esta a maior causa de morbidade e mortalidade de doenças crônicas. As terapias em uso atualmente não são eficazes para modular de forma adequada o processo inflamatório e promover a transição correta para a fase de resolução da inflamação e consequente reparo tecidual. Portanto, modulando adequadamente o comportamento de células imunocompetentes poderemos propor uma terapêutica inovadora baseada na modulação do comportamento delas dentro das diferentes etapas do reparo tecidual. Propomos neste projeto estudar o papel da galectina-3 na modulação da resposta inflamatória em diferentes modelos de reparo tecidual, uma vez que essa lectina tem sido usada como alvo terapêutico ou biomarcador de diagnóstico ou prognóstico em várias doenças humanas. Nosso grupo apresenta ampla expertise no estudo da galectina-3, tendo revelado seu papel no reparo tecidual após lesões cutâneas e do Sistema Nervoso (SN) através da modulação da resposta inflamatória. Para aprofundar nossos estudos e propor abordagens terapêuticas em consonância com a era pós-genômica, propomos atuar dentro de 3 eixos temáticos principais, que englobam a utilização da galectina-3 como principal readout para estudo da modulação da resposta inflamatória em cenários de lesão aguda, como o reparo cutâneo e do SN após trauma e a malformação cortical causada por lesão durante o desenvolvimento encefálico. Nossos resultados poderão revelar alvos terapêuticos eficazes para diversas patologias, mediante favorecimento do processo resolutivo com subsequente restabelecimento da função tecidual.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Integrante / Marcia Cury El-Cheikh - Integrante / Ana Maria Blanco Martinez - Coordenador / Henrique Marques-Souza - Integrante / Fernanda de Almeida Maia - Integrante / Suelen Adriani Marques - Integrante., Financiador(es): FAPERJ - Auxílio financeiro.

• 2017 - Atual

  Estruturação do epigenoma pela atividade Histona Desacetilase (HDAC) durante a inflamação: busca de bio- marcadores epigenéticos visando aplicações terapêuticas na clínica médica, Descrição: A inflamação é o elemento determinante na fisiopatologia de várias doenças complexas e de difícil tratamento. Embora as drogas anti-inflamatórias (AI) tenham se mostrado relevantes para amenizar os sintomas, nenhuma delas possui efeito curativo e, muitas delas, têm efeitos colaterais bastante indesejados para o paciente. Embora o processo resolutivo tenha sido muito apreciado pelos clínicos, ele não é um processo passivo e sim uma resposta ativa programada e amplamente dependente da função macrofágica e de mediadores anti-inflamatórios para uma evolução satisfatória. Dentro desse cenário, nosso grupo tem demonstrado que inibidores da atividade das enzimas Histona Desacetilase (iHADCs) despontam como importantes alvos terapêuticos para modulação da resposta inflamatória em modelos pré-clínicos. iHDACs atuam inibindo a atividade enzimática de HDACs provocando a hiperacetilação de diferentes proteínas citoplasmáticas e nucleares, principalmente histonas. De fato, diferentes estudos têm atribuído um papel protetor para iHDACs devido ao seu amplo espectro na modulação da resposta imunológica e consequentemente na modulação de outros quadros clínicos com fundo inflamatório como a epilepsia, as lesões cutâneas e a regeneração axonal em lesões de nervos periféricos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Integrante / marcia cury - Integrante / Ana Maria Blanco Martinez - Coordenador / Fernanda de Almeida Maia - Integrante / Suelen Adriani Marques - Integrante / Cristiane Bedran Milito - Integrante / Jorge Marcondes - Integrante.

• 2015 - Atual

  Estruturação do epigenoma pela atividade HDAC durante os processos de reparo e regeneração: aplicações terapêuticas para o re-estabelecimento da homeostase tecidual, Descrição: O foco do trabalho desenvolvido por nosso grupo de pesquisa está na compreensão da contribuição dos mecanismos de epigênese para a morfogênese e organogênese bem como a perturbação de tais mecanismos contribuiria para a quebra da homeostasia tecidual. Buscamos através de manipulações genéticas, e empregando técnicas de proteômica, biologia molecular, celular e técnicas de imagem em tempo real, estudar o papel dos componentes epigenéticos da cromatina durante a organogênese e manutenção da homeostasia tecidual. Estamos particularmente interessados em abordar esta questão utilizando modelos bem caracterizados por nosso grupo na literatura de desenvolvimento embrionário, regeneração de membros e reparo tecidual. Assim, apesar de elucidarmos diversos aspectos do controle epigenético durante a morfogênese e homeostase teciduais, ainda não compreendemos de forma clara como o epigenoma é remodelado, ao nível subcelular, durante esses processos. Para investigar este aspecto, utilizaremos o modelo de reparo tecidual que envolve a modulação da resposta inflamatória induzida por lesão cutânea e o modelo de regeneração de cauda do anfíbio Xenopus laevis. Resultados gerados por nosso grupo nos permitem concluir 3 aspectos principais que irão fundamentar nosso desenho experimental: 1. Mostramos que a atividade da enzima remodeladora do epigenoma, Histona Desacetilase (HDAC) é necessária para a morfogênese de tecidos epiteliais através da modelagem de padrões de expressão envolvidos diretamente neste evento de morfogênese, como o membro da superfamília TGFbeta, Bone Morphogenetic Proteins 2/4 (BMP2/4); 2. De forma interessante, também mostramos que o knockdown farmacológico da atividade HDAC, em células progenitoras mielóides, gera macrófagos alongados com um perfil misto M1/M2 de secreção de citocinas, quimiocinas e mediadores inflamatórios (Mariana Cabanel, dissertação de mestrado; Cabanel et al, 2015). Concluímos com esse trabalho que o bloqueio da atividade HDAC atua como um potente anti-inflamatório in vitro que favoreceria o reparo tecidual in vivo. 3. Nosso grupo também demonstrou que a atividade HDAC é necessária para a capacidade regenerativa da cauda da larva de Xenopus. O knockdown farmacológico da atividade HDAC foi correlacionada ao estabelecimento incorreto do programa genético necessário para a regeneração. Assim, no presente projeto buscamos caracterizar os mecanismos genéticos e moleculares que integram a atividade HDAC às vias de sinalização celular envolvidas no reparo tecidual e regeneração in vivo. Por essa razão, esse projeto também busca consolidar as bases celulares e moleculares da atividade HDAC buscando aplicações terapêuticas que se mostrem eficazes na resolução de lesões teciduais. Essa estratégia é baseada na utilização de inibidores da atividade HDAC que tem sido amplamente testados em diferentes ensaios pré-clínicos e clínicos no tratamento de leucemias mas que nunca foram testados no contexto do reparo e regeneração.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / marcia cury - Integrante / Mariana Cabanel - Integrante / Nathalia Pentagna - Integrante / Thayse Pinheiro - Integrante / João Gabriel Almeida - Integrante / Samara Dias - Integrante / Michael Levin - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro / Tufts University - Cooperação / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa., Número de produções C, T & A: 5 / Número de orientações: 1

• 2014 - 2017

  Bases moleculares da evolução da morfologia genital, Descrição: O estudo do desenvolvimento e evolução de caracteres morfológicos complexos em animais é uma área que busca compreender como genes envolvidos na padronização de órgãos durante o desenvolvimento são regulados em diferentes espécies de forma a gerar a grande diversidade morfológica observada na natureza, mesmo diante da grande conservação da função estrutural de tais genes. Durante o desenvolvimento embrionário, diversas vias de sinalização e padrões de expressão gênica são coordenados para conferir identidade posicional e proporção aos órgãos em desenvolvimento, especialmente através de moléculas com propriedades de difusão que sinalizam para grupos de células à longa distância. Classicamente os genes decapentaplegic (dpp) e wingless (wg) são descritos como morfógenos de sinalização extracelular relacionados à padronização morfológica de derivados ectodérmicos, como ocorre nos discos imaginais de Drosophila. Os discos imaginais são tecidos larvais que darão origem aos apêndices do adulto como asas, antenas, patas e órgãos genitais. Por serem essencialmente bidimensionais, esses discos constituem um excelente modelo para o estudo dos mecanismos genéticos e celulares envolvidos na padronização de tamanho e forma. Dentro do grupo repleta de Drosophila, estudos sobre evolução e desenvolvimento de padrões morfológicos e sobre mecanismos ecológicos e adaptativos de tais padrões têm empregado a análise morfológica do órgão genital masculino, uma vez que este órgão é importante para processos de estruturação populacional e especiação, sendo considerado como um caráter taxonômico muito importante para diferenciar espécies irmãs no gênero Drosophila. No entanto, tais estudos carecem de uma abordagem mecanística acerca do estabelecimento de padrões de atividade gênica e campos morfogenéticos que originam a diversidade morfológica do órgão genital característica deste grupo. O presente projeto tem, portanto, o objetivo de elucidar as bases genéticas e celulares da diversidade morfológica encontrada no órgão genital masculino do grupo repleta que, assim como em outros discos imaginais, devem estar relacionadas ao estabelecimento de padrões de atividade dos genes dpp e wg durante o desenvolvimento. Propomos uma abordagem que utiliza técnicas de biologia molecular e celular para caracterizar e quantificar os padrões de expressão dos genes dpp e wg.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / Nicolas Frankel - Integrante / Rodrigo Nunes Fonseca - Integrante / Blache Matte-Bitner - Integrante / Helena Araujo - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Cooperação.

• 2013 - 2015

  Integração do sinal de BMP/Dpp e Wnt/Wingless ao epigenoma durante o desenvolvimento animal, Descrição: O foco do trabalho desenvolvido por nosso grupo de pesquisa está centrado na compreensão da contribuição dos mecanismos de epigênese para a morfogênese e organogênese. Buscamos através de manipulações genéticas do embrião, e empregando técnicas de proteômica, biologia molecular, celular e técnicas de imagem em tempo real, estudar o papel dos componentes epigenéticos da cromatina durante a organogênese. Estamos particularmente interessados em abordar esta questão no contexto do desenvolvimento embrionário e regeneração de membros (Carneiro, et al., 2011;Tseng Carneiro et al., 2011). O mapeamento em larga escala dos componentes epigenéticos da cromatina, que regulam de forma dinâmica a atividade gênica, é na atualidade um foco de crescente interesse que reúne esforços de diferentes grupos de pesquisa concretizado no projeto ?Model Organism Encyclopedia of DNA Elements (modENCODE)?. Dentro deste contexto, foi mapeado recentemente o perfil do repertório de modificações epigenéticas encontrado em células de Drosophila em um sistema in vitro. Propomos portanto, ampliar esta rede de informações investigando a dinâmica funcional do epigenoma in vivo através do estudo da atividade da enzima Histona Desacetilase (HDAC) e sua importância sobre a modelagem do perfil de atividade gênica de genes chave para o desenvolvimento embrionário. Em particular, o presente projeto tem como principal meta caracterizar o perfil epigenético de genes envolvidos no estabelecimento da polaridade tecidual que é crucial para a morfogênese de tecidos epiteliais polarizados. Desenhamos este trabalho baseados em um artigo publicado recentemente por nosso grupo onde descrevemos, pela primeira vez na literatura, o envolvimento de mecanismos de epigênese na morfogênese de embriões de vertebrado (Carneiro et al., 2011). Focaremos em duas vias de sinalização que são essenciais para o estabelecimento da polaridade celular e tecidual, envolvidas tanto em eventos de morfogênese e organogênese quanto em processos de transformação celular: BMP/Dpp e Wnt/Wingless. Buscaremos através de um metodologia multidisciplinar de biologia celular aliadas à biologia molecular e proteômica correlacionar a ativação e funcionalidade das vias de sinalização BMP/Dpp e Wnt/Wingless com o estado do epigenoma, estabelecendo uma relação direta entre as modificações epigenéticas encontradas nos loci gênicos que codificam elementos destas duas vias de sinalização. Desta forma, estaremos traçando um primeiro paralelo entre modelagem da cromatina, atividade de vias de sinalização e eventos de morfogênese.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / Carla Marques Barreto - Integrante / Jessica Baptista - Integrante.

• 2013 - Atual

  Controle epigenético do desenvolvimento de Glioblastoma, Descrição: Glioblastoma é o tumor mais agressivo do Sistema Nervoso Central com um baixo prognóstico após ressecção cirúrgica. Sua complexa biologia e genética contribuem para suas características de malignidade juntamente com a existência de populações de células tronco tumorais que conferem resistência a esse tipo tumoral. Dentro desse contexto temos abordado o papel da estruturação do Epigenoma para sua biologia e complexidade acoplando estratégias inter e multidisciplinares. Em conjunto com ferramentas clássicas de biologia molecular e celular, utilizamos técnicas avançadas de video microscopia em tempo real, xenoenxerto e proteômica para melhor compreender o impacto dos mecanismos epigenéticos para a biologia e comportamento desse tumor.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador / Maria Cecilia Nunes - Integrante / Ana Luiza Barbeitas - Integrante / Aline Cristina de Menezes - Integrante / Gustavo Henrique Reis - Integrante / Fernanda Mariath - Integrante / John Hanover - Integrante., Financiador(es): CAPES - Centro Anhanguera de Promoção e Educação Social - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro / Fundação do Câncer Ary Frausino - Auxílio financeiro / National Institutes of Health - Cooperação., Número de produções C, T & A: 5

• 2012 - 2015

  As bases celulares e moleculares para entender as doenças relacionadas ao desenvolvimento embrionário, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (5) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Integrante / Fabio Mendes - Integrante / Jose Brito - Integrante / José Garcia Abreu - Coordenador / Flavia Gomes - Integrante / Roberto Lent - Integrante / Vivaldo Moura Neto - Integrante / Joyce Stipursky - Integrante.

• 2010 - Atual

  Estudo da atividade de Histonas Deacetilases (HDAcs) durante a regeneração, Descrição: Os processos que envolvem a regeneração em nível global de órgãos ou membros amputados têm sido amplamente estudados com o modelo de reneração da cauda de Xenopus laevis. Este modelo é extremamente interessante uma vez que existe uma janela do desenvolviemento deste animal, na qual a cauda do girino pode ser completamente regenerada ,a partir de uma estrutura chamada broto regenerativo após amputação. A incrível capacidade regenerativa deste modelo tem sido explorada para a maior compreensão dos mecanismos moleculares que regulam o padrão de expressão gênica necessário para reconstruir o órgão amputado. Dentro deste contexto, estamos interessados em compreender como os marcadores epigenéticos que caracterizam os fenótipos altamente diferenciados das células, antes da amputação da cauda, são apagados para que as células do broto regenerativo re-adquiram a habilidade de proliferar levando à completa regeneração da estrutura da cauda. Em particular, buscamos compreender a importância da atividade HDAC para aquisição de marcadores epigenéticos compatíveis com proliferação e diferenciação no modelo de reneração da cauda de Xenopus.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Integrante / Michael Levin - Coordenador / Kelly Tseng - Integrante., Financiador(es): Pew Charitable Trust - Auxílio financeiro / National Institute Of Health - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2011

  Caracterização do estado epigenético de genes envolvidos na padronização axial embrionária, Descrição: Nosso grupo vem mapeando, ao longo dos últimos dois anos, a importância da atividade das enzimas Histona Desacetilase (HDAC) em diferentes contextos, como regeneração de membros e em etapas iniciais do desenvolvimento embrionário, onde o genoma zigótico ainda se encontra sob silêncio transcricional. Mais especificamente, nosso interesse está centrado na compreensão dos mecanismos que coordenam o estabelecimento do perfil epigenético de genes envolvidos na morfogênese e organogênese. Em trabalho publicado recentemente, demonstramos que a atividade HDAC é necessária para modular os níveis de acetilação e metilação do gene membro da superfamília TGF-beta, Nodal. O bloqueio da atividade HDAC em embriões jovens de vertebrado levou a um aumento da acetilação de histonas H3 e H4 no enhancer de Nodal, que foi correlacionado à geração de más formações congênitas. Apesar de elucidarmos diversos aspectos do controle do estabelecimento do perfil epigenético de genes essenciais para o desenvolvimento embrionário e oraganogênese, ainda não compreendemos de forma clara como a atividade HDAC é alocada em populações diferenciadas de células ao longo do desenvolvimento embrionário, principalmente em etapas que precedem a morfogênese. Este aspecto é crucial para que padrões de atividade gênica sejam estabelecidos de forma correta evitando assim defeitos congênitos graves. Para investigar este aspecto, bem como a importância da atividade HDAC neste processo, propomos uma abordagem interdisciplinar empregando técnicas de manipulação genética, biologia molecular e bioquímica aliadas à aquisição de imagens em tempo real, por microscopia confocal, da dinâmica que molda o estabelecimento de assinaturas epigenéticas durante as etapas inicias do desenvolvimento embrionário.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Katia Carneiro de Paula - Coordenador., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.

Prêmios