Fábio Fabris

Possui bacharelado em Ciência da Computação pela Universidade Federal do Espírito Santo (2010), mestrado em Informática pela Universidade Federal do Espírito Santo (2012) e doutorado em Ciência da Computação pela University of Kent (2017, Inglaterra). Trabalhou ao longo da graduação e mestrado no NINFA, Núcleo de Inferência em Algoritmos, como bolsista e pesquisador contratado. Durante esse período atuou em vários projetos relacionados à mineração de dados e data science com empresas multinacionais (EDP, Petrobrás). Na EDP (Energias de Portugal), atuou em um projeto de identificação de fraudadores de energia elétrica e seleção de amostras para estimativa de perdas não-técnicas usando técnicas de mineração de dados. Este projeto rendeu várias publicações acadêmicas em revistas científicas e anais de conferências. Além disso, um software foi desenvolvido para auxiliar os técnicos da EDP. Na Petrobrás atuou como pesquisador líder em um projeto de predição de falhas mecânicas em motobombas submersas usando dados vibracionais. Esse projeto também rendeu diversas publicações científicas e um software capaz de predizer defeitos nos equipamentos usando técnicas de mineração de dados. A aplicação dessas técnicas tem o potencial de reduzir o custo operacional da empresa em milhões de reais. No seu doutorado abordou o uso de técnicas avançadas de mineração de dados para identificar genes potencialmente envolvidos com o envelhecimento em humanos explorando a grande massa de dados genômicos e proteômicos existente publicamente em portais na internet. Essa pesquisa interdisciplinar teve êxito em identificar genes potencialmente envolvidos com o envelhecimento e rendeu diversas publicações de alto impacto. Atualmente atua como post-doc na universidade de Kent, Reino Unido, pesquisando a aplicabilidade de mineração de dados (algoritmos de classificação) para predição de aspectos do envelhecimento em humanos, continuando em parte a pesquisa desenvolvida durando o doutorado. O projeto de post-doc envolve uma colaboração com a universidades de Liverpool, onde um segundo post-doc e doutor em biologia molecular, valida os resultados dos algoritmos de mineração de dados. Esse trabalho interdisciplinar tem o potencial de auxiliar os biólogos a entender o misterioso processo de envelhecimento.

Informações coletadas do Lattes em 05/09/2022

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Ciência da Computação

2013 - 2017

University of Kent
Título: NEW PROBABILISTIC GRAPHICAL MODELS AND META-LEARNING APPROACHES FOR HIERARCHICAL CLASSIFICATION, WITH APPLICATIONS IN BIOINFORMATICS AND AGEING
Orientador: Alex A. Freitas
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Classificação Hierárquica; Modelos Gráficos Probabilísticos; Envelhecimento; Mineração de Dados; Bioinformática.Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Biotecnologia / Subárea: Bioinformática.

Mestrado em Mestrado em Informática

2010 - 2012

Universidade Federal do Espírito Santo
Título: A novel cooperative algorithm for clustering large databases using sampling,Ano de Obtenção: 2012
Flávio Miguel Varejão.Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Heurísticas; Otimização; Agrupamento.Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Heurísticas. Setores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico; Atividades dos serviços de tecnologia da informação.

Graduação em Ciência da Computação

2005 - 2010

Universidade Federal do Espírito Santo
Título: An implementation of a coevolutionary Differential Evolution algorithm in C and C-CUDA for solving contrained optimization problem
Orientador: Renato Antonio Krohling

Pós-doutorado

2017

Pós-Doutorado. , University of Kent, U. KENT, Inglaterra. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Mineração de Dados. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Envelhecimento.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Mineração de Dados.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Agrupamento.

Produções bibliográficas

FABRIS, FABIO ; DOHERTY, AOIFE ; PALMER, DANIEL ; DE MAGALHÃES, JOÃO PEDRO ; FREITAS, ALEX A ; WREN, JONATHAN . A new approach for interpreting Random Forest models and its application to the biology of ageing. Bioinformatics , v. 34, p. 2449-2456, 2018.
RIZZI, CAROLINE ; JOHNSON, COLIN G. ; FABRIS, FABIO ; VARGAS, PATRICIA A. . A Situation-Aware Fear Learning (SAFEL) model for robots. Neurocomputing (Amsterdam) , v. 221, p. 32-47, 2017.
FABRIS, FABIO ; MAGALHÃES, JOÃO PEDRO DE ; FREITAS, ALEX A. . A review of supervised machine learning applied to ageing research. BIOGERONTOLOGY , v. 18, p. 171-188, 2017.
FABRIS, FABIO ; FREITAS, ALEX A. . New KEGG pathway-based interpretable features for classifying ageing-related mouse proteins. Bioinformatics (Oxford. Print) , v. 32, p. 2988-2995, 2016.
FABRIS, FABIO ; FREITAS, ALEX A. ; TULLET, JENNIFER M. A. . An Extensive Empirical Comparison of Probabilistic Hierarchical Classifiers in Datasets of Ageing-Related Genes. IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics , v. 13, p. 1045-1058, 2016.
FABRIS, FÁBIO ; KROHLING, R. A. ; KROHLING, RENATO A. . A co-evolutionary differential evolution algorithm for solving min max optimization problems implemented on GPU using C-CUDA. Expert Systems with Applications , v. 39, p. 10324-10333, 2012.
WANDEKOKEM, E. D. ; MENDEL, E. ; FABRIS, F. ; OLIVEIRA, M. V. ; BATISTA, R. J ; Varejão, F. M. ; RAUBER, T. W. . Diagnosing multiple faults in oil rig motor pumps using support vector machine classifier ensembles. Integrated Computer-Aided Engineering , v. 18, p. 61-74, 2011.
FABRIS, F. ; Drago, I. ; Varejão, F. M. . A Multi-measure Nearest Neighbor Algorithm for Time Series Classification. Lecture Notes in Computer Science , v. 5290, p. 153, 2008.
FABRIS, F. ; FREITAS, A. A. . Meta-Learning for Hierarchical Classification and Applications in Bioinformatics. In: ICDM 2018, 2018, Istanbul. International Journal of Computer, Electrical, Automation, Control and Information Engineering, 2018. v. 12. p. 535-545.
FABRIS, FABIO ; FREITAS, ALEX A. . A Novel Extended Hierarchical Dependence Network Method Based on Non-hierarchical Predictive Classes and Applications to Ageing-Related Data. In: 2015 IEEE 27th International Conference on Tools with Artificial Intelligence (ICTAI), 2015, Vietri sul Mare. 2015 IEEE 27th International Conference on Tools with Artificial Intelligence (ICTAI), 2015. p. 294.
FABRIS, FABIO ; FREITAS, ALEX A. . An Efficient Algorithm for Hierarchical Classification of Protein and Gene Functions. In: 2014 25th International Workshop on Database and Expert Systems Applications (DEXA), 2014, Munich. 2014 25th International Workshop on Database and Expert Systems Applications, 2014. p. 64.
FABRIS, FABIO ; FREITAS, ALEX A. . Dependency network methods for Hierarchical Multi-label Classification of gene functions. In: 2014 IEEE Symposium on Computational Intelligence and Data Mining (CIDM), 2014, Orlando. 2014 IEEE Symposium on Computational Intelligence and Data Mining (CIDM), 2014. p. 241-248.
Venturini, G. ; FABRIS, F. ; Varejão, F. M. ; FERRO, R. M. ; LOUREIROS, A. . Otimização Amostral para Obtenção da Matriz de Perdas Não-Técnicas. In: XX SENDI - Seminário Nacional de Distribuição de Energia Elétrica, 2012, Rio de Janeiro. Anais do XX SENDI - Seminário Nacional de Distribuição de Energia Elétrica, 2012.
Venturini, G. ; FABRIS, F. ; LOUREIROS, A. ; Varejão, F. M. ; FERRO, R. M. . A Clustering-Based Approach for Estimating Energy Loss from Non-Metered Installations. In: 4th Asia-Pacific Power and Energy Engineering Conference, 2012, Xangai. Proceedings of the 4th Asia-Pacific Power and Energy Engineering Conference, 2012.
WANDEKOKEM, E. D. ; MENDEL, E. ; FABRIS, F. ; RAUBER, T. W. ; BATISTA, R. J ; Varejão, F. M. . Data-driven Fault Diagnosis of Oil Rig Motor Pumps Using a Novel Multiple Classifier System. In: International Workshop on Systems, Signals and Image Processing, 2010, Rio de Janeiro. Proc. of 17th International Workshop on Systems, Signals and Image Processing, 2010.
DE OLIVEIRA MARCELO, V. ; ESTEFHAN, D. WANDEKOKEM ; MENDEL, EDUARDO ; FABRIS, FABIO ; FLAVIO, M. VAREJAO ; THOMAS, W. RAUBER ; RODRIGO, J. BATISTA . Constructing feature-based ensemble classifiers for real-world machines fault diagnosis. In: IECON 2010 36th Annual Conference of IEEE Industrial Electronics, 2010, Glendale. IECON 2010 - 36th Annual Conference on IEEE Industrial Electronics Society, 2010.
DE OLIVEIRA, MARCELO V. ; WANDEKOKEM, ESTEFHAN D. ; MENDEL, EDUARDO ; FABRIS, FABIO ; VAREJAO, FLAVIO M. ; RAUBER, THOMAS W. ; BATISTA, RODGRIGO . A Comparison of Two Feature-Based Ensemble Methods for Constructing Motor Pump Fault Diagnosis Classifiers. In: 2010 22nd International Conference on Tools with Artificial Intelligence (ICTAI), 2010, Arras. 2010 22nd IEEE International Conference on Tools with Artificial Intelligence, 2010.
FABRIS, F. ; Varejão, F. M. ; Margoto, L. . Novel approaches for detecting frauds in energy consumption. In: DMAI, 2009, Gold Coast. DMAI, 2009.
FABRIS, FÁBIO ; MARGOTO, LETÍCIA ROSETTI ; VAREJAO, FLÁVIO MIGUEL . Novel Approaches for Detecting Frauds in Energy Consumption. In: , 2009, Gold Coast. , 2009.
SANTOS, R. O. ; FABRIS, F. ; COELHO, R. S. ; MARCONDES, C ; MARTINELLO, M . JoinUs: Management of Mobile Social Networks for Pervasive Collaboration. In: Simpósio Brasileiro de Sistemas Colaborativos, 2008, Vila Velha. Simpósio Brasileiro de Sistemas Colaborativos, 2008.
Varejão, F. M. ; FABRIS, F. ; WANDEKOKEM, E. D. . Applying heuristics on the feature selection of fault diagnosis in motor-pumps. In: 9th ICOR - International Conference on Operations Research, 2010, Havana. Proceedings of the 9th ICOR, 2010, 2010.
FABRIS, F. . Overview of Data Mining and Applications to Bioinformatics and Ageing. 2017. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

Projetos de pesquisa

2017 - Atual

Data-Driven Discovery of Correlations Between Genes and Ageing-Related Changes, Descrição: Projeto de pesquisa analisando associações entre genes humanos e aspectos do envelhecimento. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Fábio Fabris - Integrante / DOHERTY, AOIFE - Integrante / PALMER, DANIEL - Integrante / DE MAGALHÃES, JOÃO PEDRO - Integrante / Alex A Freitas - Coordenador.
2011 - Atual

RPDBCS Reconhecimento de Padrões de Defeitos em Sistemas de Bombeio Centrífugo Submerso, Descrição: Descrição: Este projeto visa utilizar técnicas de inteligência computacional para a identificação de padrões de defeitos em sistemas de bombeio centrífugo submerso (BCS) durante a fase de teste e aceitação desse sistema. O projeto desenvolverá uma metodologia computacional para analisar dados característicos de vibrações de uma bomba centrífuga submersa, coletados em campo durante a fase de teste e aceitação do equipamento, e inferirá automaticamente se esse equipamento se encontra em condições adequadas para ser colocado em operação.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Fábio Fabris - Integrante / Flávio Miguel Varejão - Coordenador / Alexandre Loureiros - Integrante / Lucas Henrique Sousa Mello - Integrante / João Paulo Coelho - Integrante / Francisco Boldt - Integrante / Philipe Grippa - Integrante / Alexandre Babilone Fonseca - Integrante.
2010 - Atual

Otimização dos Investimentos em Ações para Redução das Perdas Não Técnicas, Descrição: Descrição: O presente projeto tem por objetivo principal desenvolver uma metodologia estatística e computacional para orientar a tomada de decisão a respeito dos investimentos em ações de combate às perdas não técnicas (isto é, perdas de energia ocasionadas por desvios ou medições irregulares) pelas Concessionárias de Distribuição de Energia Elétrica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Fábio Fabris - Integrante / Flávio Miguel Varejão - Coordenador / Gustavo Venturini - Integrante / Estevão Costa - Integrante / Félix L. Zanetti - Integrante / Alexandre Loureiros - Integrante / Marcos Campos - Integrante / Julio Marcos Bortolon Rodrigues - Integrante., Número de produções C, T & A: 2
2007 - 2009

ADD-RPD: Sistema Inteligente para Reconhecimento de Padrões de Defeitos em Motobombas, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Fábio Fabris - Coordenador., Número de produções C, T & A: 5
2007 - 2007

Extensão de ambiente de detecção de perdas comerciais através de análise de características temporais das curvas de consumo e das curvas típicas de grupos de consumidores na ESCELSA., Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Fábio Fabris - Integrante / Flávio Miguel Varejão - Coordenador., Financiador(es): Espírito Santo Centrais Elétricas - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1

Prêmios

2008

Quarto lugar na etapa nacional da Maratona de Programaçao, International Collegiate Programming Contest/Association for Computing Machinery.

2008

Primeiro lugar na fase regional da Maratona de Programação, Internacional Collegiate Programming Contest/Association for Computing Machinery.

2007

Primeiro lugar na fase regional da Maratona de Programação, International Collegiate Programming Contest/Association for Computing Machinery.

2007

Primeiro lugar no TOPCOM 5 (Torneio de Programação de Computadores), Universidade Federal do Espírito Santo.

2006

Primeiro Lugar no TOPCOM 4 (Torneio de Programação de Computadores), Universidade Federal do Espírito Santo.

Histórico profissional

Endereço profissional

University of Kent, School of Computing. , School of Computing, Sala S15, NA, CT27NZ - Canterbury, Kent, - Grã-Bretanha, Telefone: (44) 1227764000

Experiência profissional

2012 - 2012

TOTVS

Vínculo: Prestação de Serviços, Enquadramento Funcional: Prestador de Serviço, Carga horária: 20

Outras informações:
Parte da equipe reponsável pela implementação do middleware da TV-Digital brasileira GINGA, na plataforma embacarada da INTEL.

2008 - 2008

Universidade de Luxemburgo

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 20

Atividades

06/2008 - 12/2008
Estágios , Universidade de Luxemburgo.,Estágio realizado, Estudo de técnicas para organização e comunicação de dados médicos.

2009 - 2012

Universidade Federal do Espírito Santo

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 20

2007 - 2007

Universidade Federal do Espírito Santo

Vínculo: Estagiário, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 20

Atividades

01/2009
Pesquisa e desenvolvimento, Centro Tecnológico, Departamento de Informática.,Linhas de pesquisa

2017 - Atual

University of Kent

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Pesquisador Associado, Carga horária: 80, Regime: Dedicação exclusiva.