Simone Cristina Picchi

Pós-doutorado

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Orientou

Produções bibliográficas

• 2019 GRANATO, LAÍS MOREIRA ; PICCHI, Simone Cristina ; ANDRADE, MAXUEL DE OLIVEIRA ; MARTINS, PAULA MARIA MOREIRA ; TAKITA, MARCO AURÉLIO ; Machado, Marcos Antonio ; de Souza, Alessandra Alves . The ecnA antitoxin is not only important in human pathogens: Evidence of its role in the plant pathogen Xanthomonas citri subsp. citri . JOURNAL OF BACTERIOLOGY , v. Jul, p. p. JB.00796-18, 2019.

• 2018 INUI KISHI, ROSANGELA NAOMI ; STACH-MACHADO, DAGMAR ; SINGULANI, JUNYA DE LACORTE ; DOS SANTOS, CLAUDIA TAVARES ; FUSCO-ALMEIDA, ANA MARISA ; CILLI, EDUARDO MAFFUD ; FREITAS-ASTÚA, JULIANA ; PICCHI, Simone Cristina ; Machado, Marcos Antonio . Evaluation of cytotoxicity features of antimicrobial peptides with potential to control bacterial diseases of citrus. PLoS One , v. 13, p. e0203451, 2018.

• 2017 DALIO, RONALDO J. D. ; MAGALHÃES, DIOGO M. ; RODRIGUES, CAROLINA M. ; ARENA, GABRIELLA D. ; OLIVEIRA, TIAGO S. ; SOUZA-NETO, REINALDO R. ; PICCHI, SIMONE C. ; MARTINS, PAULA M. M. ; SANTOS, PAULO J. C. ; MAXIMO, HEROS J. ; PACHECO, INAIARA S. ; DE SOUZA, ALESSANDRA A. ; MACHADO, MARCOS A. . PAMPs, PRRs, effectors and R-genes associated with citrus-pathogen interactions. ANNALS OF BOTANY , v. 119, p. mcw238, 2017.

• 2016 GRANATO, LAÍS MOREIRA ; PICCHI, Simone Cristina ; ANDRADE, MAXUEL DE OLIVEIRA ; TAKITA, MARCO AURÉLIO ; de Souza, Alessandra Alves ; WANG, NIAN ; Machado, Marcos Antonio . The ATP-dependent RNA helicase HrpB plays an important role in motility and biofilm formation in Xanthomonas citri subsp. citri. BMC Microbiology (Online) , v. 16, p. 1-14, 2016.

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2017 - Atual

  N-acetil-cisteína (NAC): uma molécula antioxidante no controle de doenças bacterianas de plantas, Projeto certificado pela empresa CIACAMP em 19/08/2019., Descrição: A proposta é a continuidade das avalições do uso do NAC em campo em plantas com CVC e cancro cítrico, como também em sadias, e assim ao final obter uma proposta nova de manejo mais sustentável e economicamente viável na para a citricultura e ainda com potencial de expansão para outros cultivos de importância econômica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Simone Cristina Picchi - Coordenador / Alessandra Alves de Souza - Integrante / Marco Aurélio Takita - Integrante / Marcos Antonio Machado - Integrante / Francisco Humberto Henrique - Integrante / Helvecio Della coleta filho - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2016 - 2017

  Molécula antioxidante no controle de doenças em plantas: o N-acetil-cisteína, Projeto certificado pela empresa CIACAMP em 28/07/2016., Descrição: Avaliações no campo do NAC como uma molécula antioxidante e controlando o CVC e o Cancro cítrico. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Simone Cristina Picchi - Coordenador / Alessandra Alves de Souza - Integrante / Marco Aurélio Takita - Integrante / Marcos Antonio Machado - Integrante / Helvécio D. Coleta-filho - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2013 - 2016

  N-acetil-cisteína (NAC): uma molécula com potencial antimicrobiano para o manejo do cancro cítrico, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Alessandra Alves de Souza em 16/03/2015., Descrição: O cancro cítrico está entre as principais doenças que representam uma grande ameaça ao cultivo em larga escala de laranja. É causado pela bactéria gram-negativa Xanthomonas citri subsp. citri (Xcc). Não existem métodos de controle eficientes para este patógeno, logo o procedimento padrão para a eliminação da doença em talhões comerciais é a erradicação do material contaminado e o controle por meio de pulverizações cúpricas, que são comprovadamente ineficientes. X. citri desenvolve um biofilme característico em superfícies bióticas e abióticas e apresenta também outro papel importante, participando na sobrevivência epífita no desenvolvimento prévio da doença. A capacidade das bactérias fitopatogênicas para formar e desagregar do biofilme podem igualmente ter implicações consideráveis para a sua sobrevivência na superfície das folhas e dentro de plantas hospedeiras, se espalhando por toda a planta e completando o ciclo da doença. O NAC é um agente mucolítico que possui propriedades anti-bacterianas e também a capacidade de desestruturar o biofilme em uma gama de bactérias. Em contrapartida, o uso de cúpricos são rotineiramente utilizados como uma medida de controle padrão para o cancro cítrico. Nesse contexto, verificamos, em trabalho anterior, a ação do NAC como um composto antimicrobiano para a bactéria X.citri, como também observamos que o NAC interfere na agregação, na produção de EPS e na motilidade da bactéria. Investigamos ainda a possibilidade do uso associado de NAC e cobre como compostos antimicrobianos, bem como a compatibilidade de ambos. Os melhores resultados para o controle da bactéria foi determinado com o uso associado de NAC e cobre, no qual se dá por meio da aplicação de cobre 48 horas após a aplicação do NAC. Essa interação resultou em morte total da bactéria, como também a possibilidade de usar uma solução de cobre 10 vezes menos concentrada, do que a atualmente recomendada, contribuindo por minimizar o custo de controle da doença e amenizar os efeitos negativos da resistência desse fitopatógeno a compostos cúpricos, haja vista que seu controle pode ser feito com que possuem modo de ação diferentes, causando a morte da bactéria por diferentes vias. No geral, esses dados indicam que a NAC tem propriedades anti-bacterianas contra a X. citri e o seu uso associado com cobre pode ser uma nova estratégia, mais sustentável, de controle para o cancro cítrico. As etapas seguintes visam à ação conjunta destes compostos para a X citri em plantas em experimentos de casa-de-vegetação (mais próxima às condições de campo), uma vez que experimentos em condições de campo com X. citri são proibidos no Estado de São Paulo.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Simone Cristina Picchi - Integrante / Alessandra Alves de Souza - Coordenador / Marco Aurélio Takita - Integrante / Marcos A. Machado - Integrante / Helvécio D. Coleta-filho - Integrante.

• 2010 - 2012

  Análise funcional de genes de Xanthomonas axonopodis pv.citri (Xac) envolvidos na formação de biofilme e sua relação com resistência a compostos antimicrobianos e patogenicidade, Descrição: O trabalho será buscar em uma biblioteca de mutantes aleatórios, através de ensaios in vitro e in vivo, clones que apresentam expressão diferenciada para a formação de biofilme; caracterizar esses genes de Xac, relacionar o papel do biofilme na aptidão epífita e desenvolvimento do cancro, como também avaliar a sobrevivência de mutantes deficientes na formação de biofilme a compostos antimicrobianos Na etapa seguinte, será estudado a interação molecular entre o patógeno Xanthomonas axonopodis pv. citri e citros, através da expressão gênica global por meio de microarranjos de cDNA.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Simone Cristina Picchi - Integrante / Alessandra Alves de Souza - Coordenador / Marcos Antonio Machado - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2008 - 2010

  PROSPECÇÃO, ANÁLISE E EXPRESSÃO DE GENES DE IMPORTÂNCIA NA BIORREMEDIAÇÃO EM BIBLIOTECAS METAGENÔMICAS., Descrição: A equipe do Laboratório de Bioquímica de Microrganismos e Plantas da FCAV - UNESP construiu algumas bibliotecas metagenômicas em vetores fosmídeos totalizando 20000 clones. Estas bibliotecas vêm sendo usadas para construção de microarranjos de DNA, e estes, serão hibridizados com sondas marcadas com corantes fluorescentes, específicos para identificação de genes de importância biotecnológica, incluindo genes envolvidos na biossíntese de compostos antioxidantes como superóxido dismutase, catalase, glutationa redutase e glutationa-s-transferase. A sub-clonagem dos fosmídeos selecionados permitirá o isolamento, seqüenciamento e expressão dos genes de interesse que poderão contribuir para a busca de bioprodutos e inovações biotecnológicas.Pretende-se neste projeto acessar a diversidade genômica destas bibliotecas fazendo prospecção de genes de interesse biotecnológico utilizando a técnica de microarranjos de DNA.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (2) . , Integrantes: Simone Cristina Picchi - Integrante / Eliana Gertrudes de Macedo Lemos - Coordenador / Mauricio Rocha Dimitrov - Integrante / Douglas Antonio Alvaredo Paixão - Integrante / Campanharo João Carlos - Integrante / Lucia Maria Carareto Alves - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2007 - 2009

  CONSTRUÇÃO DE BIBLIOTECA METAGENOMICA DE UM CONSÓRCIO BACTERIANO DEGRADADOR DE ÓLEO DIESEL E BIOPROSPECÇÃO DE GENES RELACIONADOS A PROCESSOS DE DEGRADAÇÃO DE HIDROCARBONETOS., Descrição: O estudo destes microrganismos capazes de crescerem em meio a hidrocarbonetos consiste na utilização dos mesmos na recuperação de ambientes contaminados por compostos oleosos. No Laboratório de Bioquímica de Microrganismos e Plantas, foi feito a construção de uma biblioteca metagenômica em vetores fosmideos de um consorcio bacteriano que apresenta grande eficiência na degradação de compostos oleosos como o óleo diesel. O objetivo será realizar uma seleção de genes compotencial biotecnológico na área de biorremediação de áreas contaminadas com hidrocarbonetos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Simone Cristina Picchi - Integrante / Eliana Gertrudes de Macedo Lemos - Coordenador / Mauricio Rocha Dimitrov - Integrante / Douglas Antonio Alvaredo Paixão - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2007 - 2009

  CONSTRUÇÃO DE BIBLIOTECA METAGENÔMICA E PROSPECÇÃO DE GENES PARA A SÍNTESE DE POLIHIDROXALCANOATOS., Descrição: Historicamente, estudos sobre a diversidade microbiana e descoberta de metabólitos secundários têm se apoiado na suposição de que o cultivo revela a maioria dos microrganismos da amostra. Por este processo simplista, os microrganismos do solo têm sido estudados e explorados intensivamente. Pesquisas realizadas nos últimos 15 anos têm mostrado que a verdadeira extensão da diversidade microbiana é ainda desconhecida e que os organismos cultivados representam apenas uma fração pequena (não mais que 1%) da diversidade de espécies em comunidades microbianas. Recentes progressos em ecologia microbiana molecular vêm evidenciando a existência de muitos novos tipos de microrganismos no solo os quais suplantam aqueles poucos revelados pelo cultivo em laboratório. Esta percepção vem proporcionando a base científica para o desenvolvimento de novas abordagens de acesso ao potencial metabólico dos microrganismos do solo sem a necessidade de cultivá-los. Metagenômica, denominação coletiva dos genomas da microbiota total encontrada na natureza, vem se constituindo numa das abordagens mais interessantes para acesso da diversidade total da microflora do solo, permitindo, inclusive, o exame da genômica funcional de seus membros mesmo na ausência de cultivo. Produtos derivados do metabolismo secundário microbiano têm sido utilizados para fins médicos, industriais e agrícolas. A maioria desses metabólitos secundários, em uso hoje, é obtida a partir de microrganismos habitantes do solo. Como objetivo o projeto visa identificar e avaliar a diversidade de organismos produtores polihidroxialcanoatos, um tipo de macromoléculas que possuem propriedades materiais similares a de alguns plásticos petroquímicos. A origem microbiana dessas macromoléculas faz delas produtos naturais, certamente muitos organismos possuem a habilidade de degradá-las, isso as torna biodegradáveis e recicláveis, fazendo com que a variedade das aplicações deste polímero seja muito grande.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Simone Cristina Picchi - Integrante / Eliana Gertrudes de Macedo Lemos - Integrante / Mauricio Rocha Dimitrov - Coordenador / Douglas Antonio Alvaredo Paixão - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

• 2006 - 2009

  CORRRELAÇÃO ENTRE O SISTEMA DE SECREÇÃO Tat E AS GLICANAS PERIPLASMÁTICAS OSMORREGULADAS (OPGs) INTERAGINDO NA PATONENICIDADE DA BACTÉRIA Xylella fastidiosa, Descrição: Glicanas periplasmáticas osmorreguladas são importantes componentes do envelope celular das bactérias Gram-negativas. Seu papel biológico não foi totalmente esclarecido, mas tem se demonstrado uma função fundamental na organização geral do envelope celular e atuação na adaptação a alterações osmóticas do meio. A síntese das glicanas, em Xylella fastidiosa, é controlada por dois genes denominados ophH e opgD. Com estudos de expressão heterólogas desses genes pode-se comprovar a funcionalidade dos mesmos. No sistema de síntese das glicanas de Escherichia coli, como também em X. fastidiosa, a OpgD apresenta um peptídio sinal reconhecido pelo sistema de secreção Tat. Em estudos de patogenicidade, mutantes para síntese de glicanas, perdem a virulência. Desta forma, os objetivos deste projeto são: 1) analisar a viabilidade dos mutantes de X. fastidosaopgH- em videira; 2) verificar se as OPGs estão envolvidas na interação patógeno/hospedeiro e 3) propor um sistema homólogo, para constatar a efetividade do sistema de transporte Tat sob a proteína OpgD e sua implicação na síntese das OPGs.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Simone Cristina Picchi - Integrante / Carmen Ödberg-Ferragut - Integrante / Eliana Gertrudes de Macedo Lemos - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2000 - 2001

  AEG - Agronomical and Enviromental Genomes, Descrição: Sequenciamento de microorganismos relacionados com doenças agricolas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (5) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Simone Cristina Picchi - Coordenador / Manoel Victor Franco Lemos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 1999 - 2000

  Sugar Est Genome Project, Descrição: Sequenciamento da cana de açucar.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Simone Cristina Picchi - Coordenador / Manoel Victor Franco Lemos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

Prêmios