Marco Aurélio Takita

Bacharel em Ciências Biológicas pela Universidade de São Paulo (1988), Licenciado em Ciências Biológicas pela Universidade de São Paulo (1988) e Doutor em Ciências Biológicas (Bioquímica) pela Universidade de São Paulo (1996). Atualmente é pesquisador científico VI do Instituto Agronômico de Campinas. Tem experiência na área de Biologia Celular e Molecular, com ênfase em Biologia Molecular de Plantas, Genômica e Genômica Funcional, e Bioinformática, atuando principalmente nos seguintes temas: interação planta-patógenos, caracterização funcional de terpeno sintases, e edição de genomas. Atuou como professor convidado da Faculdade de Tecnologia da UNICAMP, sendo responsável pelo curso Tópicos em Tecnologia para Informação II: Introdução à Bioinformática. É ainda orientador nos cursos de Pós Graduação da UFSCAR (Produção Vegetal e Bioprocessos Associados) e do IAC (Agricultura Tropical e Subtropical). Seu Fator H é 29 (ISI, 14/03/2025), Índice H 36 (Google Scholar, 14/03/2025), índice h 29 (Scopus, 14/03/2025).

Informações coletadas do Lattes em 29/07/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)

1989 - 1996

Universidade de São Paulo
Título: Caracterizacão de mutantes de Saccharomyces cerevisiae resistentes à toxina killer"de Kluyveromyces lactis.
Beatriz Amaral de Castilho. Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: Levedura; Toxina Killer; Quitina.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Microbiologia Aplicada / Especialidade: Microbiologia Industrial e de Fermentação. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos / Especialidade: Genética de Leveduras. Setores de atividade: Produtos e Processos Biotecnológicos.

Graduação em Bacharelado Em Ciências Biológicas

1985 - 1988

Universidade de São Paulo

Graduação em Licenciatura Em Ciências Biológicas

1985 - 1988

Universidade de São Paulo

Pós-doutorado

2002 - 2005

Pós-Doutorado. , Instituto Agronômico de Campinas, IAC, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Agrárias, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Biologia e Fisiologia dos Microorganismos / Especialidade: Bacteriologia.

1999 - 2001

Pós-Doutorado. , Instituto Agronômico de Campinas, IAC, Brasil. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Vegetal / Especialidade: Genética Molecular de Citros. , Grande Área: Ciências Agrárias / Área: Agronomia / Subárea: Fitossanidade / Especialidade: Microbiologia Agrícola.

1996 - 1998

Pós-Doutorado. , The Salk Institute For Biological Studies, S.I.B.S., Estados Unidos. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Botânica / Subárea: Fisiologia Vegetal / Especialidade: Nutrição e Crescimento Vegetal.

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Francês

Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: BIOTECNOLOGIA.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular/Especialidade: Biologia Molecular de Plantas.

Grande área: Ciências Agrárias / Área: Agronomia / Subárea: Fitossanidade/Especialidade: Microbiologia Agrícola.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Biologia e Fisiologia dos Microorganismos/Especialidade: Bacteriologia.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Bioquímica dos Microorganismos/Especialidade: Biologia Celular e Molecular de Leveduras.

Organização de eventos

MATTOS JUNIOR, D. ; CARLOS, E. F. ; SILVA, J. P. ; BOSCARIOL-CAMARGO, R. L. ; AGOSTINI, J. P. ; CARVALHO, S. L. C. ; TOMAZ, J. P. ; PAIVA, P. G. ; COLETTA FILHO, H. D. ; de Souza, A. A. ; GMITTER JR, F. G. ; GARCIA, L. A. P. ; VIEIRA, L. G. E. ; BASSANEZI, R. B. ; NOVELLI, V. M. ; NEVES, C. S. V. J. ; AZEVEDO, F. A. ; ZACCHEO, P. V. C. ; TAKITA, M. A. ; MUNHOS, P. D. ; et.al . International Citrus Congress. 2016. (Congresso).

MACHADO, M. A. ; SOUZA, A. A. ; Ayres, A. J. ; LOCALI-FABRIS, E. C. ; COLETTA FILHO, H. D. ; POMPEU JUNIOR, J. ; FREITAS-ASTUA, J. ; NASCIMENTO, L. M. ; TAKITA, M. A. ; BASTIANEL, M. ; WULFF, N. A. ; MARTINS, P. K. ; BOSCARIOL-CAMARGO, R. L. ; NOVELLI, V. M. . XVIII Conference of the International Organization of Citrus Virologists. 2010. (Congresso).

Participação em eventos

Plant and Animal Genome XXVI. High-Density Linkage Maps for Citrus sunki and Poncirus trifoliata using DArTseq Markers. 2018. (Congresso).

International Plant and Animal Genome XXI. Genomic Analysis of the Upstream Sequences of Limonene Synthase Genes in Sweet Orange. 2013. (Congresso).

International Workshop on Xylella fastidiosa.EST analyses of the tolerant Citrus reticulata in different phases of infection with Xylella fastidiosa. 2007. (Simpósio).

Participação em bancas

Aluno: Raphael Severo da Cunha Antunes de Faria

CAMARGO, L. E.; MONTEIRO-VITORELLO, C. B.;TAKITA, M. A.. Análise in vitro da expressão de genes de resposta a estresse oxidativo e osmótico da bactéria fastidiosa Leifsonia xyli subsp. xyli. 2016. Dissertação (Mestrado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Maiara Curtolo

FIGUEIRA, A. V. O.;TAKITA, MARCO AURELIO; GAZAFFI, R.. Mapeamento de QTL para qualidade de frutos de citros utilizando marcadores DArT-seq. 2016. Dissertação (Mestrado em Ciências (Energia Nuclear na Agricultura)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Filipi Augusto Coelho Rodrigues

Takita, Marco Aurélio; HARAKAVA, R.; Mourão Filho, F. A. A.. Transformação genética de laranjeira doce e de tomateiro Micro-Tom com os genes npr1 e npr3-4 de Citrus sinensis. 2015. Dissertação (Mestrado em Fitotecnia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Paula Maria Moreira Martins

FERREIRA, H.;TAKITA, M. A.; PAGNOCCA, F. C.. Localização sub-celular de proteínas marcadas com GFP em Xanthomonas axonopodis pv. citri por microscopia de fluorescência. 2009. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: José Sérgio de Macedo Soares

SOUZA, A. P.;TAKITA, M. A.; PEREIRA, G. A. G.. Modelagem molecular e caracterizacao espectroscopica de duas proteinas de Xylella fastidiosa potencialmente envolvidas com fitopatogenicidade.. 2007. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Juliana Camargo Martinati

TSAI, S. M.;TAKITA, M. A.; BACCI JUNIOR, M.. Análise filogenética de linhagens de Xylella fastidiosa de diferentes hospedeiros baseada na sequência da região intergênica 16S-23S rDNA.. 2003. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Celular, Molecular e Microbiologia)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Eduardo Fernandes Formighieri

TSAI, S. M.; MONTEIRO-VITORELLO, C. B.;TAKITA, M. A.. Bioinformática e anotação de genes em Xanthomonas axonopodis pv. citri e Xylella fastidiosa: metabolismo de ferro e biossíntese de pequenas moléculas.. 2002. Dissertação (Mestrado em Ciências (Energia Nuclear na Agricultura)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Simone Guidetti-Gonzalez

CARRER, H.MARTINS, N. F.TAKITA, M. A.; GOES, A.; HOTTA, C. T.. Identificação de genes envolvidos na defesa contra patógenos no banco de dados do CitEST e em macroarranjos da interação Citrus sinensis-Guignardia citricarpa. 2009. Tese (Doutorado em Agronomia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Antonio Marcos Saraiva

SOUZA, A. P.; CIANCAGLINI, P.;TAKITA, M. A.; KOBARG, J.; BARBOSA, J. A. R. G.. Caracterização functional e estrutural da nucleotidase SurE de Xylella fastidiosa.. 2009. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Renato Vicentini dos Santos

TEIXEIRA, M. M.; VINCENTZ, M. G. A.; COLOMBO, C. A.; SILVA-FILHO, M. C.;TAKITA, M. A.. Localização subcelular de proteínas de cana-de-açúcar (Saccharum spp.): caracterização in silico e avaliação funcional.. 2008. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Luciana Kauer Rosselli

SOUZA, A. P.; KOBARG, J.;TAKITA, M. A.SOUZA, A. A.; ZERI, A. C.. Caracterização de uma aldo-ceto redutase relacionada à patogenicidade de Xylella fastidiosa.. 2007. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Fernanda Raquel Camilo dos Santos

TAKITA, M. A.; REGITANO NETO, A.; COLOMBO, C. A.. Expressão de proteínas heterólogas envolvidas na degradação de celulose proveniente do bagaço de cana-de-açúcar, visando maior eficiência da produção do etanol. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Agricultura Tropical e Subtropical) - Instituto Agronômico de Campinas.

Aluno: Bruna Medeia de Campos

TAKITA, M. A.; KOBARG, J.; DIAS, S. M. G.. CARACTERIZACAO ESTRUTURAL DAS PROTEINAS HIPTRX E CICLOFILINA E ANALISE DA INTERACAO ENTRE A PROTEINA PTHA DE XANTHOMONAS CITRI E UMA CISTEINA PROTEASE DE CITRUS SINENSIS. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Clelton Aparecido dos Santos

TAKITA, M. A.; KOBARG, J.; DIAS, S. M. G.. Expressão, Purificação e Caracterização Estrutural e Funcional de Proteínas Relacionadas à Patogenicidade de Xylella fastidiosa. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Fernanda Zatti Barreto

Takita, Marco Aurélio; GARCIA, A. A. F.; HOFFMANN, H. P.; Carneiro, M. S.. Caracterização fenotípica e molecular do painel brasileiro de genótipos de cana-de-açúcar. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Produção Vegetal e Bioprocessos Associados) - Universidade Federal de São Carlos.

Aluno: Kelly Aparecida Fernandes de Campos

Takita, Marco ACOLETTA FILHO, H. D.; KUPPER, K. C.;CRISTOFANI-YALY, M.. MAPEAMENTO DE QTLs ASSOCIADOS À RESISTÊNCIA A MANCHA MARROM DE ALTERNÁRIA. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Produção Vegetal e Bioprocessos Associados) - Universidade Federal de São Carlos.

Aluno: Daniel Bedo Assumpção Castro

Takita, Marco Aurélio; GARBOGGINI, F. F.; MERZER, V. M.. Análise metagenômica da microbiota de ambiente de mina de cobre. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Eloá Carolina Nava Cardoso Palma

de Souza, A. A.; CAMOLESI JUNIOR, L.;CARVALHO, M. A. G.TAKITA, M. A.. BIODUNET: UM SISTEMA WEB OPEN SOURCE PARA MANIPULAÇÃO DE CLONAGEM EM PLASMÍDEOS 3D. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em TECNOLOGIA) - Universidade Estadual de Campinas.

TAKITA, M. A.; DE LAURENTIZ, J. S.; VALENTINI, S. R. T.. Exame de Qualificação ? Nível de Mestrado, da aluna Yasmim Cristina Rodrigues da Silva. 2016. Instituto Agronômico de Campinas.

Carneiro, M. S.;Takita, M. A.; MARIANO, E. D.; MEDEIROS, A. H.. Exame de Qualificação ? Nível de Mestrado, do aluno Lucas Smith Pimenta. 2016.

GOLDMAN, M. H. S.; FIGUEIRA, A. V. O.;Takita, M. A.. Exame de Qualificação ? Nível de Doutorado, da aluna Larissa Mara de Andrade. 2014. Universidade de São Paulo.

TAKITA, M. A.. Exame de qualificação de Doutorado do aluno Guilherme Augusto Peres Silv. 2014. Instituto Agronômico de Campinas.

BERTOLINI, M. C.; Henrique-Silva, F.;TAKITA, M. A.. Qualificação de Mestrado de Stela Virgilio: Produção na forma recombinante de fatores de transcrição de Neurospora crassa que regulam o metabolismo de glicogênio e o ciclo celular. 2012. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

HARAKAVA, R.;TAKITA, M. A.; GONÇALVES, M. C.. Banca de qualificação de Mestrado: Caracterização de miRNAs e siRNAs de citros. 2011. Instituto Biológico.

TAKITA, M. A.; SOUZA, A. P.; Da Silva, A. M.. Banca Examinadora da Análise Prévia de Trabalho de Mestrado "Mecanismos envolvidos com a sobrevivência de Xylella fastidiosa em condições de estresse e efeito de N-Acetil-L-cisteína em seu biofilme".. 2009. Universidade Estadual de Campinas.

TAKITA, M. A.SOUZA, A. A.; ZERI, A. C. M.; KOBARG, J.; SOUZA, A. P.. Caracterização de uma aldo-ceto redutase relacionada à patogenicidade de Xylella fastidiosa. 2007. Universidade Estadual de Campinas.

TAKITA, M. A.; PEREIRA, G. A. G.; SOUZA, A. P.. Expressão e purificação de uma dimetiladenosina transferase e uma proteína dse secreção do tipo II de Xylella fastidiosa. 2006. Universidade Estadual de Campinas.

Orientou

Heitor Vicente Rosa

Nova tecnologia para combate ao HLB; Início: 2025; Dissertação (Mestrado em Agricultura Tropical e Subtropical) - Instituto Agronômico de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Júlia Tonetto Rocco

Entendendo a atividade de terpeno sintases; Início: 2025; Dissertação (Mestrado em Produção Vegetal e Bioprocessos Associados) - Universidade Federal de São Carlos; (Orientador);

Natália Roberta Ferro Rodrigues

Estudo de duas P450 na patogenicidade da Alternaria alternata patótipo tangerina; Início: 2023; Dissertação (Mestrado profissional em Agricultura Tropical e Subtropical) - Instituto Agronômico de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Ana Beatriz Paes Forner

Produção de plantas editadas de citros para fator de transcrição envolvido na resposta de HLB; Início: 2024; Iniciação científica (Graduando em Biomedicina) - Centro Universitário Herminio Ometto de Araras, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Thiago Fiori Rosa

Persistência em Xanthomonas citri subsp; citri induzida por diferentes estresses; Início: 2023; Iniciação científica (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Paulo Victor Maciel Nascimento

CLONAGEM E EXPRESSÃO HETERÓLOGA DO GENE CODIFICADOR DA PROTEÍNA PROMOTORA DE FLORESCIMENTO; Início: 2023; Iniciação científica (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Natalia Cristina Soares

CLONAGEM E EXPRESSÃO HETERÓLOGA DO GENE CODIFICADOR DA PROTEÍNA PROMOTORA DE FLORESCIMENTO; 2021; Dissertação (Mestrado em Produção Vegetal e Bioprocessos Associados) - Universidade Federal de São Carlos, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Francisco Inacio Paiva Ferreira

Análise metagenômica da microbiota fúngica e bacteriana do intestino médio de Diatraea saccharalis; ; 2020; Dissertação (Mestrado em Produção Vegetal e Bioprocessos Associados) - Universidade Federal de São Carlos, ; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Mariana Massoco Tarallo

Avaliação de resposta de Alternaria alternata a extratos de citros; 2018; Dissertação (Mestrado em Agricultura Tropical e Subtropical) - Instituto Agronômico de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Maria Julia Franco da Cunha

Obtenção de mutantes de Xylella fastidiosa usando tecnologia CRISPR; 2018; Dissertação (Mestrado em Agricultura Tropical e Subtropical) - Instituto Agronômico de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Amanda de Carvalho Bernardi

Edição de genomas em Citros; 2017; Dissertação (Mestrado em Produção Vegetal e Bioprocessos Associados) - Universidade Federal de São Carlos, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Vanessa Santos Moura

Caracterização bioquímica e funcional de toxina killer produzida por Saccharomyces cerevisiae; 2017; Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Marco Aurelio Takita;

Cesar Augusto Nascimento

Caracterização funcional de terpeno sintases de citros; 2016; Dissertação (Mestrado em Agricultura Tropical e Sub Tropical) - Instituto Agronômico de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Nicholas Vinicius Silva

Caracterização de Citrus limonia Osbeck através de genômica comparativa; 2016; Dissertação (Mestrado em Agricultura Tropical e Subtropical) - Instituto Agronômico de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Eloá Carolina Nava Cardoso Palma

BIODONUT: UM SISTEMA WEB OPEN SOURCE PARA MANIPULAÇÃO DE CLONAGEM EM PLASMÍDEOS 3D; 2012; Dissertação (Mestrado em TECNOLOGIA) - Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Marco Aurelio Takita;

Lígia Segatto Muranaka

Mecanismos envolvidos com a sobrevivência de Xylella fastidiosa em condiçoes de estresse e efeito de N-Acetil-L-cisteína em seu biofilme; 2010; Dissertação (Mestrado em Biologia Vegetal) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Marco Aurelio Takita;

Diogo M

Magalhães; ANÁLISE FILOGENÉTICA DE RLK-LRRs EM CITROS E ENVOLVIMENTO DO RECEPTOR DE EF-Tu NO RECONHECIMENTO DE Xylella fastidiosa; 2012; Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Marco Aurelio Takita;

Victória Sebastiani Prado

Análise funcional de um fator de transcrição na patogenicidade de Alternaria alternata; 2021; Iniciação Científica - Instituto Agronômico de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Victória Sebastiani Prado

Avaliação de uma P450 na patogenicidade de Alternaria alternata patótipo tangerina; 2020; Iniciação Científica - Instituto Agronômico de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Laís Augusto Dezoti

Análise molecular de mutantes de Xylella fastidiosa 9a5c obtidos por edição de genomas; 2019; Iniciação Científica - Instituto Agronômico de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Nathan Henrique da Silva Costa

Obtenção de transformantes de Citrus sinensis através de edição de genomas; 2019; Iniciação Científica - Instituto Agronômico de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Nathan Henrique da Silva Costa

Construção de um novo vetor para edição de genomas em plantas; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Centro Universitário Herminio Ometto de Araras, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Thiago Antonio de Lima

Seleção de genes de referência para estudos de expressão gênica por RT-qPCR no patossistema MPC/Phyllosticta citricarpa; 2017; Iniciação Científica - Instituto Agronômico de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Alexandre Seiji Maekawa

Otimização de parâmetros para edição de genomas de citros; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Thiago Antonio de Lima

Seleção de genes de referência para estudos de expressão gênica por RT-qPCR no patossistema MPC/Phyllosticta citricarpa; ; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Centro Universitário Herminio Ometto de Araras, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Isabella Penteado Picirillo Voso

Avaliação de genes na tolerância de Xathomonas citri subsp; citri a terpenos; ; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Cristiane Sayuri Aoki Heredia

Transformação genética da cianobactéria Aphanocapsa sp; ; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Bruna Perez Russo

Otimização de expressão de terpeno sintases em Escherichia coli; ; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Isabella Penteado Picirillo Voso

Xanthomonas citri subsp; citri apresenta mecanismo genético de defesa contra limoneno?; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Cristiane Sayuri Aoki Heredia

Produção de biomassa de microalga para utilização como plataforma de biossíntese de terpenos de citros; ; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Ana Carolina Piva de Oliveira

Construção de vetor para expressão de limoneno sintase em cianobactéria; ; 2013; Iniciação Científica; (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Isabella Penteado Picirillo Voso

Análise de atividade de terpeno sintases de citros; 2013; Iniciação Científica; (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Fernanda Yoshiko Yanai

Purificação de DNA de alta qualidade para sequenciamento de genoma de Citrus e gêneros correlatos; 2011; Iniciação Científica; (Graduando em Engenharia Biotecnológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Lívia Pilatti Mendes da Silva

Isolamento e caracterização de linhagem bacteriana capaz de biotransformar limoneno; 2011; Iniciação Científica; (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Thaís Regina Tritapepe Sakamoto

Identificação e clonagem de genes codificando terpeno sintases em genomas de citros; ; 2011; Iniciação Científica; (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Mariana Massoco Tarallo

Varredura de biblioteca genômica bacteriana visando identificação de genes de interesse biotecnológico; 2011; Iniciação Científica; (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Stela Virgilio

Análise de um sistema de restrição-modificação da bactéria Xylella fastidiosa; 2010; Iniciação Científica; (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal de São Carlos, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Gabriela Massaro Barreiros

Caracterização de atividade de terpeno sintase visando produção em sistemas heterólogos; 2010; Iniciação Científica; (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Lívia Pilatti Mendes da Silva

Clonagem e expressao de genes codificando P450 de citros: envolvimento na sintese de terpenoides; 2010; Iniciação Científica; (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Alvaro Missiato

Clonagem e expressão heteróloga de terpeno sintases de citros; 2008; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Centro Universitário Herminio Ometto de Araras, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Mariana da Silva Caldeira

Clonagem e expressão de duas terpeno sintases de citros; 2007; Iniciação Científica; (Graduando em Agronomia) - Universidade Federal de São Carlos, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marco Aurelio Takita;

Produções bibliográficas

PRADO, GUILHERME SOUZA ; ROCHA, DHIÔVANNA CORRÊIA ; SANTOS, LUCAS NASCIMENTO DOS ; CONTILIANI, DANYEL FERNANDES ; NOBILE, PAULA MACEDO ; MARTINATI-SCHENK, JULIANA CAMARGO ; PADILHA, LILIAN ; MALUF, MIRIAN PEREZ ; LUBINI, GREICE ; PEREIRA, TIAGO CAMPOS ; MONTEIRO-VITORELLO, CLAUDIA BARROS ; CRESTE, SILVANA ; BOSCARIOL-CAMARGO, RAQUEL LUCIANA ; Takita, Marco Aurélio ; CRISTOFANI-YALY, MARIÂNGELA ; SOUZA, ALESSANDRA ALVES DE . CRISPR technology towards genome editing of the perennial and semi-perennial crops citrus, coffee and sugarcane. Frontiers in Plant Science , v. 14, p. 1, 2024.
MARTINS, PAULA MARIA MOREIRA ; GRANATO, LAÍS MOREIRA ; MORGAN, TÚLIO ; NALIN, JULIA LOPES ; Takita, Marco Aurélio ; ALFENAS-ZERBINI, POLIANE ; DE SOUZA, ALESSANDRA ALVES . Analysis of CRISPR-Cas loci distribution in and its possible control by the quorum sensing system. FEMS Microbiology Letters , v. 1, p. fnae005, 2024.
PICCHI, SIMONE C. ; REBELATTO, DANIELE ; MARTINS, PAULA M.M. ; BLUMER, SILVIA ; MESQUITA, GEISA L. ; HIPPLER, FRANZ W. R. ; MATTOS JR, DIRCEU ; BOARETTO, RODRIGO M. ; MACHADO, MARCO A. ; Takita, Marco A. ; COLETTA'FILHO, HELVÉCIO D. ; DE SOUZA, ALESSANDRA A. . N -acetylcysteine absorption and its potential dual effect improve fitness and fruit yield in Xylella fastidiosa infected plants. PEST MANAGEMENT SCIENCE , v. 80, p. 4137-4809, 2024.
DE LIMA, LUIZ FELIPE FRANCO ; CARVALHO, ISIS GABRIELA BARBOSA ; DE SOUZA-NETO, REINALDO RODRIGUES ; DOS SANTOS, LARISSA DA SILVA ; NASCIMENTO, CESAR AUGUSTO ; TAKITA, MARCO AURELIO ; TÁVORA, FABIANO TOUZDJIAN PINHEIRO KOHLRAUSCH ; MEHTA, ANGELA ; DE SOUZA, ALESSANDRA ALVES . Antisense oligonucleotide as a new technology application for CsLOB1 gene silencing aiming citrus canker resistance. Phytopathology , v. NA, p. 1, 2024.
BISPO, RAFAELA LETICIA BRITO ; CECCATO-ANTONINI, SANDRA REGINA ; TOSTA, CHRISTIANN DAVIS ; FONTANETTI, ANASTÁCIA ; PRADO, VICTORIA SEBASTIANI ; TAKITA, MARCO AURELIO ; ROSA-MAGRI, MÁRCIA MARIA . Sugarcane molasses as substrate to soil yeasts: Indole-3-acetic acid production and maize initial growth promotion. BIOCATALYSIS AND AGRICULTURAL BIOTECHNOLOGY , v. 47, p. 102618, 2023.
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SOUZA, A. A. ; TAKITA, M. A. ; COLETTA FILHO, H. D. ; CALDANA, C. ; OBENSK, P. ; SMOLKA, M. S. ; NOVELLO, C. J. ; MACHADO, M. A. . Análise proteômica da Xylella fastidiosa sob condições de adesão em superfície abiótica.. In: XXXV Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2002, Recife. Fitopatologia Brasileira - Suplemento. Recife: Sociedade Brasileira de Fitopatologia, 2002. v. 27. p. S70-S70.
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CALDANA, C. ; SOUZA, A. A. ; COLETTA FILHO, H. D. ; TAKITA, M. A. ; OBLESSUC, P. R. ; SMOLKA, M. S. ; NOVELLO, C. J. ; MACHADO, M. A. . Identificação de proteínas diferencialmente expressas em Xylella fastidiosa em condições de adesão.. In: XXXV Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2002, Recife. Fitopatologia Brasileira - Suplemento. Brasilia: Sociedade Brasileira de Fitopatologia, 2002. v. 27. p. S217-S217.
ASTUA-MONGE, G. ; TARGON, M. L. P. N. ; TAKITA, M. A. ; DO AMARAL, A. M. ; MACHADO, M. A. . Identification and characterization of resistance genes analogs expressed in citrus plants under different growth conditions.. In: XXXV Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2002, Recife. Fitopatologia Brasileira. Brasilia: Sociedade Brasileira de Fitopatologia, 2002. v. 27. p. S180-S180.
LOCALI, E. C. ; SOUZA, A. A. ; TARGON, M. L. P. N. ; TAKITA, M. A. ; FREITAS-ASTUA, J. ; RODRIGUES, V. ; MACHADO, M. A. . Seqüenciamento de regiões genômicas associadas ao vírus da leprose dos citros.. In: XXXV Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2002, Recife. Fitopatologia Brasileira - Suplemento. Brasilia: Sociedade Brasileira de Fitopatologia, 2002. v. 27. p. S216-S216.
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COLETTA FILHO, H. D. ; TARGON, M. L. P. N. ; TAKITA, M. A. ; NEGRI, J. D. ; POMPEU JUNIOR, J. ; MACHADO, M. A. ; DO AMARAL, A. M. ; MULLER, G. W. . First Report of the Causal Agent of Huanglongbing (?Candidatus Liberibacter asiaticus?) in Brazil.. Plant Disease , Estados Unidos, v. 88, n.12, p. 1382-1382, 2004.
SOUZA, A. A. ; TAKITA, M. A. ; KURAMAE-IZIOKA, E. E. ; CALDANA, C. ; YANAI, G. M. ; MUTO, N. H. ; OLIVEIRA, R. C. ; COLETTA FILHO, H. D. ; NUNES, L. R. ; MACHADO, M. A. . Avaliação da expressão diferencial de genes de Xylella fastidiosa por ?microarray?.. Fitopatologia Brasileira , Brasilia, v. 26, n.Suplemento, p. 296-297, 2001.
TAKITA, M. A. ; CASTILHO, B. A. . HSP150 is involved in the maintenance of cell wall integrity. Yeast , Inglaterra, v. 11, p. S340-S340, 1995.
TAKITA, M.A. . Ediçao Gênica Aplicada à Fitopatologia. 2021. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
TAKITA, M. A. . A Pesquisa nas Diferentes Áreas da Genética: Um outro olhar sobre Biofilme de Xylella fastidiosa. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
TAKITA, M. A. . Os desafios da bioinformática no IAC e uma proposta de INCT. 2013. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
TAKITA, M. A. . Functional Genomics of Xylella fastidiosa. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
TAKITA, M. A. ; COLETTA FILHO, H. D. ; RODRIGUES, C. M. ; CASERTA, R. ; SILVA, M. S. ; MURANAKA, L. S. ; OLIVATO J.C. ; CARRER, G. M. ; MACHADO, M. A. ; SOUZA, A. A. . Biofilmes bacterianos e patogenicidade de Xylella fastidiosa. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
TAKITA, M. A. . Introdução à Bioinformática. 2008. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
TAKITA, M. A. . EST analyses of the tolerant Citrus reticulata in different phases of infection with Xylella fastidiosa. 2007. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

Outras produções

Takita, M. A. . Avaliação de projeto de pesquisa binacional (EUA-Israel). 2010.

Takita, M. A. . Acompanhamento de Projeto da Rede Proteôma. 2006.

PALMA, E. C. N. C. ; BOMBONATO, M. E. ; PAIVA, W. R. ; TAKITA, M. A. ; CARVALHO, M. A. G. . BIODUNET: UM SISTEMA WEB OPEN SOURCE PARA MANIPULAÇÃO DE CLONAGEM EM PLASMÍDEOS 3D. 2013.

BOMBONATO, M. E. ; TAKITA, M. A. . Minerva, sistema para organizar e acompanhar projetos de pesquisa. 2012.

SOUZA, A. A. ; MURANAKA, L. S. ; TAKITA, M. A. ; COLETTA FILHO, H. D. ; MACHADO, M. A. . Composto de aminoácido de cisteína (ou seus análogos) usado na desetruturação de biofilmes microbianos quando do tratamento ou prevenção de doenças geradas por bactérias fitopatógenas que acometem plantas de interesse agrícola.. 2011.

Takita, M. A. . Elaboração de parecer sobre projeto de pesquisa - Rede Proteôma. 2009.

TAKITA, M. A. . Segurança dos transgênicos. 2012. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

TAKITA, M. A. . Curso intensivo para anotação de genes do genoma café. 2005. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

Projetos de pesquisa

2022 - Atual

Comunidades sintéticas da microbiota da rizosfera de citros visando benefícios ao desenvolvimento da planta e resistência a estresses, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Helvecio Della Coletta Filho em 03/01/2023., Descrição: O principal objetivo desta proposta é estabelecer comunidades bacterianas da rizosfera de plantas cítricas, com base no conhecimento prévio de nosso grupo de pesquisa (DOI 10.1038/s41467-018-07343-2), bem como caracterizá-las como indutoras do crescimento nas plantas em viveiro e efeito antagônico em patógenos de interesse no sistema de produção de citros e ao estresse hídrico.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (4) . , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Integrante / Helvécio Della Coletta Filho - Coordenador / Sérgio Alves de Carvalho - Integrante / raquel luciana boscariol-camargo - Integrante / Mariangela Cristofani-Yaly - Integrante / Dirceu de Mattos Júnior - Integrante / Alessandra Alves de Souza - Integrante / Carolina Sardinha Francisco - Integrante / Jaderson Silveira Leite Armanhi - Integrante / Juliana Erika de Carvalho Teixeira Yassitepe - Integrante / Paulo Arruda - Integrante / Rafael Correa de Souza - Integrante.
2022 - Atual

Tratamento celular na fermentação etanólica: um estudo do efeito de estratégias convencionais e não-convencionais sobre Limosilactobacillus fermentum, parâmetros fermentativos, autólise celular, viabilidade e expressão de genes de Saccharomyces cerevisiae, Descrição: O presente projeto se propõe a fazer um estudo mais aprofundado sobre as estratégias convencionais de tratamento celular, como o uso de ácido sulfúrico e dióxido de cloro, e avaliar estratégias não-convencionais com potencial de emprego industrial, tais como ácido clorídrico, adição de etanol ao ácido sulfúrico e quitosana, um biopolímero extraído de resíduos de camarão. O foco do trabalho será avaliar a eficiência de cada tratamento sobre a bactéria Limosilactobacillus fermentum, uma das principais bactérias contaminantes do processo fermentativo, e sobre a levedura do processo, Saccharomyces cerevisiae (linhagem industrial PE-2), analisando as alterações morfológicas de ambos os microrganismos, ocorrência de autólise celular bacteriana, expressão de genes da levedura e os parâmetros fermentativos. Espera-se com esse trabalho ter um perfil de ação dos tratamentos convencionais e avaliar novas estratégias que possam ser indicadas para o processo industrial, visando maior eficiência, menor custo, menor impacto ambiental com menor emprego de substâncias potencialmente tóxicas ao ambiente e ao operador.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Integrante / Sandra Regina Ceccato-Antonini - Coordenador.
2021 - Atual

Plataforma IAC de Biotecnologias, Descrição: Projeto para atuação da ICTESP na execução de projetos de pesquisa visando o desenvolvimento tecnológico junto a empresas privadas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Coordenador / Valdenice M. Novelli - Integrante / Mariangela Cristofani-Yali - Integrante / Alessandra Alves de Souza - Integrante / Helvecio Della Coletta Filho - Integrante / BOSCARIOL-CAMARGO, RAQUEL L. - Integrante / Rodrigo Rocha Latado - Integrante.
2017 - Atual

INCT 2014: de genômica comparativa e funcional e melhoramento assistido de citros, Descrição: O projeto submetido ao Edital 016/2014 dos INCT representa a continuidade e expansão do programa do INCT Citros, com os principais grupos de pesquisa que trabalham com citros no Brasil, focalizando os temas relacionados ao melhoramento genético e genoma comparativo e funcional de citros e seus patógenos. Essa nova proposta do INCT Citros mantém a estrutura de três plataformas, otimizando-as e procurando integrá-Ias, com foco no desenvolvimento de novos conhecimentos e tecnologia ao setor citrícola. Plataforma de genômica comparativa, com foco nos estudos de genoma comparativo de mais genótipos de citros, conclusão dos genomas de importantes patógenos, além de ampliar a base de dados sobre miRNA e processos com regulação epigénetica. O entendimento das relações citros e seus patógenos, a prospecção de genes e promotores, a diversidade genômica do grupo citros (plataforma de SNPs) e a regulação de processos genéticos, são aspectos mais relevantes nessa plataforma. Plataforma de genômica funcional reúne projetos específicos em todos os patossistemas com objetivo de ampliar os conhecimentos potencialmente aplicáveis nas fases seguintes do programa. Todas as propostas têm focos específicos derivados dos conhecimentos gerados no INCT anterior. Plataforma melhoramento assistido é a plataforma mais tecnológica do INCT Citros e representa a interface avançada do melhoramento na qual muitas das informações geradas previamente (marcadores, mapas, genes, promotores), assim como material genético (híbridos de cruzamento controlado e eventos de transformação genética já obtidos) estão sendo validados em condições de campo, permitindo uma razoável aproximação da estratégia de melhoramento assistido por marcadores. O programa conta com a participação das principais equipes de pesquisadores no Brasil que atuam em pesquisa e desenvolvimento em citricultura.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Integrante / Helvécio Della Coletta Filho - Integrante / Mariangela Cristofani-Yaly - Integrante / MARCOS A MACHADO - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 4
2016 - 2020

Interação Xylella fastidiosa-inseto vetor-planta hospedeira e abordagens para o controle da clorose variegada dos citros e cancro cítrico., Descrição: A clorose variegada dos citros (CVC) causada pela bactéria Xylella fastidiosa subsp. pauca é uma das doenças mais preocupantes da citricultura brasileira, acarretando danos econômicos na ordem de 100 milhões de dólares por ano com erradicação de plantas doentes, replantio e controle químico dos vetores. A CVC é um problema principalmente brasileiro, pois outros países da América do Sul ou Central onde a doença já foi descrita a atividade citrícola não tem a dimensão da citricultura brasileira. Dessa forma cabe à pesquisa no Brasil estudar e propor alternativas para o controle e/ou manejo mais eficiente, sustentável e com menores custos de produção. Nestes 15 anos do sequenciamento do genoma da X. fastidiosa causadora da CVC, muitos conhecimentos básicos sobre a bactéria foram gerados, posicionando-a entre os dez fitopatógenos bacterianos mais importantes do mundo. Porém, poucos desses estudos focalizaram a interação entre os componentes desse patossistema, bactéria-planta-vetor. Este projeto visa integrar os trabalhos com X. fastidiosa para ampliar e associar as informações sobre os mecanismos genéticos que contribuem para a eficiência adaptativa dessa bactéria, a relação entre sua colonização no hospedeiro e expressão da doença, a interação molecular com o inseto vetor e as respostas genéticas da planta que podem ser usadas, a médio e longo prazo, para controlar de forma mais sustentável e com menor custo de produção os danos causados pela CVC. Ainda, além da X. fastidiosa, o projeto propõe ampliar os estudos com Xanthomonas citri subsp. citri, causadora do Cancro Cítrico, um outro problema fitossanitário que vem tomando proporções cada vez maiores nos pomares paulistas, devido às mudanças recentes de legislação em relação ao controle dessa doença. Assim, devido às similaridades entre os dois fitopatógenos e hospedeiro em comum, algumas abordagens de estudo e estratégias de controle serão usadas para os fitopatógenos X. fastidiosa e X. citri.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Integrante / Camila Caldana - Integrante / Mônica A Cotta - Integrante / Alessandra Alves de Souza - Coordenador / Helvecio Della Coletta Filho - Integrante / Marcos Antonio Machado - Integrante / João Roberto Spotti Lopes - Integrante.
2016 - Atual

Utilização da tecnologia CRISPR para obtenção de resistência a doenças em Citros., Descrição: O Instituto Agronômico de Campinas tem atuado fortemente na área de genômica de citros. Muito disso deveu-se a diferentes projetos onde foram realizados diversos trabalhos de sequenciamento de DNA, iniciando-se com ESTs e terminando com diferentes genomas de citros, dentro do programa Institutos Nacionais de Ciência e Tecnologia (INCTs) do CNPq/FAPESP. Com isto formou-se um enorme base de dados tanto de genomas quanto de transcriptomas de citros e Poncirus trifoliata, espécie relacionada a citros. As sequências dos genomas de Citrus clementina e Citrus sinensis foram recentemente publicadas como resultado do INCT Citros, sendo uma importante fonte para execução de novos projetos de genômica funcional aplicada à agricultura. Uma das tecnologias mais inovadoras que possibilitam este tipo de estudo é a edição de genomas. A utilização de CRISPR/CAS9 para este fim tem sido reportada desde 2013, incluindo plantas, possibilitando a criação de mutantes para genes específicos. Até o presente momento, existe um único trabalho no qual esta tecnologia foi usada para gerar plantas mutantes de citros. Entretanto, a aplicação desta tecnologia poderia ser explorada para levar estudos de citros no Brasil a um outro patamar e gerar novas variedades. Assim, este projeto tem como foco o estabelecimento desta tecnologia para estudos funcionais de citros no Brasil, além de gerar plantas mutantes resistentes a doenças, usando limoneno sintase e genes de resistência como modelos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Coordenador / Márcia Ortiz Mayo Marques - Integrante / Francisco de Assis Alves Mourão Filho - Integrante / Cristofani-Yaly, Mariângela - Integrante / Machado, Marcos Antonio - Integrante / Alessandra Alves de Souza - Integrante / PICCHI, SIMONE CRISTINA - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa., Número de produções C, T & A: 1
2015 - 2020

Produção de toxina killer por Sporobolomyces koalae (ACBL-77) e Saccharomyces cerevisiae (ACB-K1) como mecanismo de ação contra patógenos de pós-colheita, Descrição: De modo a entender como as toxinas killer produzidas por Sporobolomyces koalae (ACBL-77) ou por Saccharomyces cerevisiae (ACB-K1) poderiam agir sobre células da levedura sensível (S. cerevisiae NCYC 1006) e sobre os fitopatógenos Penicillium digitatum e Geotrichum citri-aurantii, as toxinas extracelulares, presentes nos sobrenadantes das respectivas leveduras, serão purificadas e suas atividades antagônicas testadas. A toxina killer purificada a partir de S. koalae será caracterizada e a sua massa molecular será estimada de acordo com os dados de SDS-PAGE. As condições ótimas para produção de toxina killer, assim como, a identificação do gene que a codifica serão avaliados. A identificação do tipo de toxina Killer de S. cerevisiae (ACB-K1) será realizada através de amplificação por PCR, utilizando primers específicos de tipos de proteínas Killer conhecidas e produzidas por S. cerevisiae (K1, K2 e K28) e, posteriormente, será realizado o sequenciamento. Caso não dê amplificação será realizada a caracterização da toxina killer do ACB-K1 seguindo as mesmas etapas descritas para o isolado ACBL-77.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Integrante / Marcos Antonio Machado - Integrante / João Martins Pizauro Junior - Integrante / Katia Cristina Kupper - Coordenador / Luriany Pompeo Ferraz - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2015 - 2017

Moléculas antioxidante e bactericida em plantas cítricas infetadas por Xylella fastidiosa e Ca. Liberibacter asiaticus: efeito no patógeno, hospedeiro e na aquisição, Descrição: O manejo atual dos patossistemas huanglongbing (HLB), causado por Candidatus Liberibacter asiaticus (Las), e Clorose Variegada dos Citros (CVC) cujo agente causal é a Xylella fastidiosa - Xf, esta alicerçado nos princípios básicos de exclusão através de material de propagação sadio, de erradicação de plantas infectadas e de proteção através do controle dos insetos vetores. Muito embora seja tecnicamente suportado, devido às necessidades de erradicações frequentes de plantas doentes e de pulverizações cada vez mais periódicas com inseticidas para controle de vetores, a sustentabilidade econômica e ambiental desses métodos de controle vem sendo questionada. A despeito de todo o esforço que vem sendo feito por parte do setor (produtores, técnicos e pesquisadores) ambas as doenças vem aumentando no parque citrícola brasileiro, principalmente o HLB. Um fato agravante é que dada as características de transmissibilidade destas doenças (CVC e HLB), pequenos e médios produtores vem sendo forçados a desistirem da citricultura, migrando para outras culturas de menor uso intensivo de mão de obra ou arrendando suas terras. A consequência social deste processo é preocupante. Desse modo, é extremamente importante a adoção de métodos mais sustentáveis no manejo dessas doenças, principalmente HLB, considerando não só os custos financeiros como os custos ambientais no uso intensivo de inseticidas. O nosso grupo de pesquisa tem avaliado moléculas alternativas no manejo de doenças bacterinas em citros, entre elas análogos de aminoácidos rotineiramente utilizados em doenças bacterianas em mamíferos. Resultados do uso do N-acetil cisteina (NAC), um análogo de cisteína, para controle da CVC realizados em condições controladas pelo nosso grupo de pesquisa mostraram-se muito satisfatórios. Além de afetar negativamente a capacidade de formação de biofilme e multiplicação de X. fastidiosa, efeitos positivos às plantas doentes foram evidentes regredindo as cloroses foliares associadas a CVC, supostamente em virtude das características antioxidantes do NAC. Isso sugere que essa molécula poderá ter efeito às planta com HLB, restabelecendo alguns processo fisiológicos desestabilizados pela presença de Las, além da própria ação bactericida desta molécula. O HLB afeta todas as variedades cítricas cuja patologia esta associadas a acumulo de amido e partição deficitária de carboidratos das folhas (fonte) para as raízes e frutos (drenos) provavelmente pela não funcionalidade do floema nas plantas infectadas pela bactéria Ca. Liberibacter. Espera-se com este projeto abrir novas perspectivas para o manejo desta doenças bacterianas em citros, principalmente HLB, não só pela ação bactericida destas moléculas mas também por propiciarem ao hospedeiro melhores condições fisiológicas em resposta à infecção.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Integrante / Alessandra Alves de Souza - Integrante / Helvecio Della Coletta Filho - Coordenador / Marcos Antonio Machado - Integrante / João Roberto Spotti Lopes - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2015 - Atual

Avaliação de efetores na interação de Phyllosticta citricarpa e laranja doce (Citrus sinensis (L.) Osb.), Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Carolina Munari Rodrigues em 05/08/2015., Descrição: Esse projeto tem o objetivo de estudar as interações entre o fungo Phyllosticta citricarpa, causador da Mancha Preta dos Citros, e laranja doce (Citrus sinensis (L.) Osb.).Considerando a importância da doença para a citricultura e as atuais possibilidades de abordagem molecular na interação planta-fungo, o presente trabalho propõe o estudo do transcriptoma de laranja Pera (suscetível a MPC) e de P. citricarpa. Esse trabalho visa investigar as respostas de patógeno e hospedeiro ao mesmo tempo, na mesma amostra, no momento da infecção e ao longo da colonização através da técnica Dual RNA-seq. Além disso, esse trabalho propõe a identificação e caracterização dos efetores desse fungo, que são proteínas capazes de burlar a resposta de defesa das plantas resultando assim na doença. O entendimento das alterações na expressão gênica de ambos os organismo simultaneamente é uma abordagem nova e muito interessante, visto que, é possível avaliar as mudanças ao mesmo tempo em que o patógeno ataca e a planta tenta se defender. Além disso, esse trabalho nos permitirá identificar e caracterizar efetores que provavelmente são utilizados pelo fungo para causar a doença. Acredita-se que com os resultados obtidos a partir deste projeto, grande quantidade de informação coordenada será obtida sobre a MPC, possibilitando um entendimento maior e chegando a possíveis estratégias mais efetivas para o controle dessa doença.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Integrante / Carolina Munari Rodrigues - Coordenador / Machado, Marcos A - Integrante / Ronaldo Dálio - Integrante / Michèle C. Breton - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2014 - 2016

Estudo funcional de genes associados à defesa de plantas a fitopatógenos: foco no controle de Xylella fastidiosa, agente causal da Clorose Variegada dos Citros, Descrição: A citricultura brasileira responde por um faturamento anual da ordem de 1,5 bilhão de dólares, com exportação de suco concentrado e subprodutos da laranja (pectina, óleo, ração). Entretanto, fatores como a presença de pragas e doenças agrícolas impedem que a produtividade brasileira seja maior. Dentre essas doenças, a clorose variegada dos citros (CVC), causada pela bactéria Xylella fastidiosa, merece destaque por causar danos de aproximadamente 100 milhões de dólares ao ano ao agronegócio da citricultura. Todas as variedades de laranja doce são afetadas pela doença diminuindo fortemente a produção de suco concentrado, principal produto de exportação relacionado ao citros. Sabe-se que programas de melhoramento genético vegetal visando à obtenção de plantas resistentes são de fundamental importância, mas ainda representam um desafio à medida que a citricultura se expande apoiada em baixíssima variabilidade genética e na impossibilidade de acompanhar o avanço das pragas e doenças na mesma proporção do crescimento da cultura. A necessidade de ampliação das bases genéticas atuais dos citros impulsiona à continuidade de programas de melhoramento apoiados em ferramentas de biotecnologia, dessa maneira, a utilização de genes com características desejadas de outros organismos poderia auxiliar no surgimento de novas características no organismo transformado, como por exemplo, resistência a patógenos. Essa característica pode ser adquirida utilizando genes de plantas resistentes. Embora os patógenos apresentem distintas estratégias para infecção, na maioria das vezes os hospedeiros conseguem resistir, devido principalmente ao sistema de imunidade inata. O grande número de receptores presentes na superfície das células vegetais permite que as plantas reconheçam padrões moleculares associados aos patógenos (PAMPs) e desencadeiem as diferentes respostas adaptativas de defesa. Receptor-like kinases (RLKs) constitui uma grande família de proteínas transmembranas capaz de atuar em distintos processos celulares, incluindo o reconhecimento de patógenos nas interações planta- micróbio. O receptor de EF-Tu (EFR) identificado em membros de Brassicaceae representa uma RLK com domínio extracelular de repetições ricas em leucina (RLK-LRR) que é capaz de reconhecer estruturas conservadas (epítopo elf18) da proteína EF-Tu de um grupo de bactérias patogênicas e assim desencadear as respostas de imunidade inata. A transferência deste sistema de reconhecimento (receptor AtEFR) para espécies de plantas cultivadas suscetíveis ao ataque de bactérias que expressem esta PAMP (Ef-Tu), como é o caso da X. fastidiosa, é um dos objetivos dessa proposta e possibilita que a planta passe a apresentar resposta de defesa mais efetiva a infecção. Embora as espécies de citros sejam uma das frutíferas mais consumidas no mundo e apresentem suscetibilidade a um elevado número de patógenos, nenhuma análise filogenética envolvendo os membros de RLKs foi feita, apesar da disponibilidade de genomas completos sequenciados e da importância destacada destas proteínas na defesa contra patógenos. Assim, este trabalho também tem como objetivo fazer a reconstrução filogenética dos receptores RLK- LRRs nos genomas disponíveis de C. clementina e C. sinensis visando aumentar o entendimento destas proteínas e sua relação com os mecanismos de defesa da planta contra patógenos. Por fim, devido à identificação prévia por transcritoma de genes possivelmente associados à resistência de C. reticulata a X. fastidiosa, torna-se necessário a validação da função desses genes, desta forma, a ideia da proposta é também transformar C. sinensis com genes promissores estudados previamente em plantas modelo.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Integrante / Alessandra Alves de Souza - Coordenador / Raquel Caserta - Integrante / Helvecio Della Coletta Filho - Integrante / Diogo M. Magalhães - Integrante / LINO PEREIRA, WILLIAN EDUARDO - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2014 - 2016

Aplicação biotecnológica de uma proteína de Ca. Liberibacter asiaticus no bloqueio do processo de aquisição pelo psilideo visando controle do HLB, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Integrante / Alessandra Alves de Souza - Coordenador / Helvecio Della Coletta Filho - Integrante / Marcos Antonio Machado - Integrante / João Roberto Spotti Lopes - Integrante., Financiador(es): BASF - Matriz São Paulo - Auxílio financeiro.
2013 - 2016

Efeito do N-acetil-cisteína em Xanthomonas citri subsp. citri: um potencial antimicrobiano para o manejo do cancro cítrico, Descrição: O cancro cítrico está entre as principais doenças que representam uma grande ameaça à citricultura nacional. É causado pela bactéria Gram-negativa Xanthomonas citri subsp. citri (Xcc). Não existem métodos de controle eficientes para este patógeno, logo o procedimento padrão para a eliminação da doença em talhões comerciais é a erradicação do material contaminado e o controle por meio de pulverizações cúpricas. O uso contínuo do cobre pode levar a agravos como: 1. Obtenção de bactérias resistentes, resultado de um processo adaptativo do patógeno ao uso constante desse composto; 2. Elevação no custo de produção e 3. Impacto ambiental negativo, uma vez que o cobre é um metal pesado prejudicial ao meio ambiente. Além destes, não se conhece muito bem o efeito deletério do excesso de cobre sobre a planta. Uma das principais estratégias de resistência de bactérias a compostos antimicrobianos é a formação de biofilme. Xcc desenvolve um biofilme característico nas superfícies das folhas que é fundamental para a sobrevivência epífita, uma vez que permite uma maior resistência a fatores ambientais como estresse por UV e seca. A capacidade das bactérias fitopatogênicas para formar e desagregar do biofilme pode igualmente ter implicações consideráveis para a sua sobrevivência na superfície das folhas e dentro de plantas hospedeiras, se espalhando por toda a planta e completando o ciclo da doença. O N-acetil-cisteina (NAC) é um análogo de cisteína que possui propriedades anti-bacterianas e mostra-se eficiente em desestruturar o biofilme em uma ampla gama de bactérias Gram-negativas e Gram-positivas. Nesse contexto, verificamos, em trabalho anterior com Xylella fastidiosa (agente causal da CVC) (Universal 471448/2011-7), a ação do NAC como um composto antimicrobiano eficiente que interfere na agregação, na produção de exopolissacarideos (EPS), diminuindo a população da bactéria na planta e causando remissão de sintomas em plantas afetadas pela CVC. Devido aos resultados promissores em X. fastidiosa/CVC, o uso do NAC na agricultura foi submetido ao pedido de patente pelo INPI e PCT (INPI 018110011623 e PCT: BR/2012/000003 data de depósito INPI 31/03/2011 PCT: 9/1/2012). Devido a esses resultados, iniciamos os trabalhos com Xcc e resultados preliminares mostraram que o NAC diminui a produção de EPS e a motilidade em Xcc, sendo ambos considerados fatores de virulência para esta bactéria. Desta forma, pretende-se com esse projeto dar continuidade aos estudos in vitro e iniciar estudos in planta com o NAC para avaliar o efeito deste composto em Xcc e no desenvolvimento do cancro cítrico. Um possível efeito sinergístico do NAC com o cobre visando um manejo mais sustentável da doença será também abordado.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Integrante / Alessandra Alves de Souza - Coordenador / Simone Cristina Picchi - Integrante / Helvecio Della Coletta Filho - Integrante / Marcos Antonio Machado - Integrante / TOMAZ, JUAREZ PIRES - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2011 - 2013

Caracterização funcional de terpeno sintases de laranja doce com foco em produção de biocombustíveis, Descrição: O Brasil é um dos maiores produtores de biocombustíveis dos mundo. Desde a implementação do PróAlcool, em 1975 há grande investimento no desenvolvimento de etanol para utilização em motores automotivos. Mais recentemente, temos importantes estudos sendo desenvolvidos em biodiesel. Tanto o etanol quanto o biodiesel apresentam importante papel na redução dos efeitos danosos da utilização de combustííveis fósseis no mundo. Terpenos apresentam grande potencial para utilização como combustíveis, como comentado por Bohlmann e Keeling (2008), ?pesquisa em químicos de terpenóides de planta e plantas que produzem terpenóides podem também prover novas direções para biocombustíveis de hidrocarbono, como complemento ao desenvolvimento mais avançado de biodiesel e etanol?. Assim, este projeto tem como objetivo central a obtenção e caracterização de terpenos através clonagem e expressão de terpeno sintases putativas de laranja doce em sistema heterólogo, visando a produção de biomateriais com especial foco em biocombustível.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Coordenador / Alessandra Alves de Souza - Integrante / Marcos Antônio Machado - Integrante / Márcia Ortiz Mayo Marques - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2009 - 2016

Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Genômica para o Melhoramento de Citros., Descrição: Estima-se que mais de 60 % dos custos de produção de citros no Brasil estejam relacionados ao controle fitossanitários de pragas e doenças. Entre as doenças destacam-se a clorose variegada dos citros, a leprose, a pinta preta, a mancha de alternaria, a morte súbita, o cancro cítrico, a gomose, a tristeza e, mais recentemente, o huanglongbing (greening). O esgotamento do modelo de convivência ou de controle químico de vetores de doenças com seus altos custos financeiros e ambientais têm destacado a importância dos trabalhos de melhoramento genético, como estratégia abrangente e duradoura de controle de doenças. O Centro de Citricultura Sylvio Moreira do Instituto Agronômico de Campinas e a Embrapa atuam há vários anos no melhoramento de citros, desenvolvendo trabalhos de produção e avaliação de novos materiais genéticos incorporando ferramentas de biotecnologia para acelerar ganhos genéticos. Como um dos Institutos do Milênio do CNPq/MCT (2002-2005) o Centro de Citricultura desenvolveu extenso banco de dados de genoma expresso de citros (CitEST), integrando melhoramento genético, genoma comparativo e funcional de citros e alguns de seus patógenos. Além de gerar o maior banco de dados de genoma de citros no mundo, esse projeto ampliou sobremaneira o número de novos híbridos de citros em avaliação de campo, além de marcadores moleculares para mapeamento genético e descobru novos genes potencialmente associados a resistência a doenças. O INCT de Genômica para o Melhoramento de Citros representa a continuidade do programa do Instituto do Milênio, não só agregando as principais equipes que trabalham com citros no Brasil, mas focalizando os temas relacionados ao melhoramento genético e genoma funcional do grupo citros, procurando integrar três plataformas: Plataforma de Informação Genômica, onde o foco se concentrando nos estudos de genoma comparativo e funcional permitindo a ampliação da base de informações, incluindo genoma completo associado ao Consórcio Internacional d. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (5) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (4) . , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Integrante / Alessandra Alves de Souza - Integrante / Helvécio Della Coletta Filho - Integrante / Marcos Antônio Machado - Coordenador / Elliot W. Kitajima - Integrante / Ricardo Harakava - Integrante / Eliane Cristina Locali-Fabris - Integrante / Francisco de Assis Alves Mourão Filho - Integrante / Frederick G. Gmitter Jr - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2007 - 2010

Expressão gênica na síntese de óleos essenciais associada ao desenvolvimento de frutos de tangerinas., Descrição: Terpenos constituem a maior e mais diversa classe de produtos naturais. Estes elementos apresentam grande importância para as plantas que os produzem, principalmente como metabólitos secundários, além de serem bastante utilizados nas indústrias farmacêutica, alimentícia, e cosmética. Sua síntese é feita através de vias bioquímicas que levam à produção de isopentenil difosfato que, juntamente com seu isômero dimetilalil difosfato, são os precursores básicos da síntese dos terpenos. Várias enzimas participam destas vias de biossíntese, além de outras enzimas conhecidas como terpeno sintases. Dentro de um projeto financiado pelo MCT/CNPq do programa Institutos do Milênio (62.0054/01-8), foi produzido o maior banco de seqüências de Citros do mundo. Dentro destas seqüências pode-se identificar vários genes que codificam componentes relacionados à síntese de terpenos em Citros, tanto das vias de biossíntese de isopentenil difosfato quanto diferentes terpeno sintases. Buscando um maior conhecimento destes genes e seus papéis na síntese de terpenos em diferentes espécies de Citros, este projeto visa caracterizar a expressão de diferentes genes que fazem parte deste processo, durante o desenvolvimento dos frutos de ponkan e mexirica do rio, tangerinas mais importantes no contexto nacional.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Coordenador / Alessandra Alves de Souza - Integrante / Fernando Alves de Azevedo - Integrante / Márcia Ortiz Mayo Marques - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2
2005 - 2010

Estudo da bactéria Candidatus Liberibacter spp., agente causal do huanglongbing dos citros: diagnostico, biologia e manejo, Descrição: Projeto temático para estudos da bactéria causadora do huanglongbing (ex-greening).. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Integrante / Alessandra Alves de Souza - Integrante / Helvécio Della Coletta Filho - Integrante / Marcos Antônio Machado - Coordenador / Maria Luisa Penteado Natividade Targon - Integrante / Juliana Freitas-Astua - Integrante / Elliot W. Kitajima - Integrante / Eduardo Fermino Carlos - Integrante / Eliane Cristina Locali-Fabris - Integrante / Silvio A Lopes - Integrante / Nelson Arno Wulff - Integrante / Maria de Fátima G F da Silva - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1
2005 - 2009

Análise de expressão de genes relacionados à síntese de óleos essenciais: Biotecnologia aplicada à qualidade de frutos em citros., Descrição: Bolsa de produtividade. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa., Número de produções C, T & A: 3
2005 - 2009

Características biológicas de Xylella fastidiosa em biofilme: importância dos genes de adesão e adaptação na patogênese, Descrição: Projeto "Jovem Pesquisador" para estudos de biofilme de X. fastidiosa. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Integrante / Alessandra Alves de Souza - Coordenador / Helvécio Della Coletta Filho - Integrante / Marcos Antônio Machado - Integrante / Maria Luisa Penteado Natividade Targon - Integrante / Carolina Munari Rodrigues - Integrante / Raquel Caserta - Integrante / Dagmar Ruth Stach Machado - Integrante / Luis Peroni - Integrante / Jacqueline C. Olivato - Integrante / Maria de Fátima G F da Silva - Integrante / Henrique Ferreira - Integrante / Enilza Maria Espreafico - Integrante / Mônica A Cotta - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 4
2005 - 2008

Bioprospecção do potencial aromático de espécies nativas do bioma Mata Atlântica no estado de São Paulo: ocorrência, taxonomia, caracterização química, genética e fisiológica de populações, Descrição: Este projeto tem por objetivo final oferecer ao setor produtivo, fontes alternativas e/ou novos óleos essenciais e princípios bioativos e subsídios para a conservação e futura exploração sustentável das espécies. Para que este objetivo seja atendido tem por objetivos parciais: a) bioprospecção de espécies nativas da flora aromática do bioma Mata Atlântica do estado de São Paulo, através da avaliação da composição química,olfativa, atividade antimicrobiana e antioxidante dos óleos essenciais; b) identificar taxonomicamente as espécies, observar em campo os ambientes de ocorrência e avaliar a abundância, freqüência e dinâmica demográfica dessas espécies em diferentes populações; c) avaliar a variabilidade genética via marcador molecular e a caracterização citogenética de diferentes populações e identificação das síndromes de polinização e de dispersão; d) estudo da cinética e controle de crescimento e desenvolvimento das espécies.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Integrante / Márcia Ortiz Mayo Marques - Coordenador / Lin Chau Ming - Integrante / João Paulo Feijão Teixeira - Integrante / Carlos Augusto Colombo - Integrante / Roseli Buzanelli Torres - Integrante / Roselaine Facanali - Integrante / Lenita Lima Haber - Integrante / Maria Aparecida Ribeiro Vieira - Integrante / Walter José Siqueira - Integrante / Marta Dias Soares Scott - Integrante / Maria Imaculada Zucchi - Integrante / Vera Maria Quecini - Integrante / Luis Carlos Bernacci - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Natura Inovação e Tecnologia de Produtos - Auxílio financeiro.
2005 - 2007

Mecanismos envolvidos com sobrevivência e morte celular programada em Xylella fastidiosa, Descrição: Projeto concebido para verificar expressão de genes associados à sobrevivência e morte celular programada em Xylella fastidiosa em condições de estresse ambientais.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Integrante / Alessandra Alves de Souza - Coordenador / Helvécio Della Coletta Filho - Integrante / Marcos Antônio Machado - Integrante / Carolina Munari Rodrigues - Integrante / Raquel Caserta - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2
2005 - 2007

Qualidade de frutos em citros: Análise de expressão de genes relacionados à síntese de óleos essenciais, Descrição: Laranja é atualmente uma das principais commodities brasileiras sendo responsável por importante fatia das exportações do país. Um dos pontos primordiais para a obtenção de índices econômicos mais positivos é a qualidade do fruto, onde se considera aspectos como aroma e sabor. Estes fatores relacionam-se diretamente com produção de óleos essenciais, os quais apresentam terpenos como principais componentes. As vias de biossíntese destes compostos são bem conhecidas, bem como algumas terpenos sintases, enzimas que convertem os precursores gerados pelas vias dependente e independente de mevalonato em terpeno. Todavia, estudos da regulação da síntese destes compostos em nível de expressão gênica ainda são poucos e particularmente para citros, praticamente inexistem. No laboratório de biotecnologia do Centro APTA Citros Sylvio Moreira - IAC, foi desenvolvido um amplo projeto de seqüenciamento de ESTs de citros, resultando no maior banco de seqüências de citros do mundo. Neste banco foram identificadas várias seqüências de genes que codificam terpeno sintases. Para melhor conhecermos a relação entre expressão gênica e síntese de terpenos, propõe-se a análise do perfil de expressão de 3 genes que codificam terpeno sintases durante o desenvolvimento do fruto de laranja doce, correlacionando-se com análises da qualidade do óleo essencial.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Coordenador / Alessandra Alves de Souza - Integrante / Márcia Ortiz Mayo Marques - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1
2005 - 2007

Analise da resistencia a compostos antimicrobianos sobre o crescimento e expressao genica em Xylella fastidiosa, Descrição: Projeto Universal para verificar o comportamento de X. fastidiosa apos tratamento com agentes antimicrobianos, notamente cobre e zinco.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Integrante / Alessandra Alves de Souza - Coordenador / Helvécio Della Coletta Filho - Integrante / Marcos Antônio Machado - Integrante / Eridan Orlando Pereira - Integrante / Carolina Munari Rodrigues - Integrante / Jacqueline C. Olivato - Integrante / Enilza Maria Espreafico - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2
2002 - 2007

Etilogia, epidemiologia e controle da morte súbita dos citros, Descrição: Análises de variabilidade genética de isolados de CTV obtidos de plantas com morte súbita dos citros.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Integrante / Alessandra Alves de Souza - Integrante / Helvécio Della Coletta Filho - Integrante / Marcos Antônio Machado - Coordenador / Mariângela Cristofani - Integrante / Maria Luisa Penteado Natividade Targon - Integrante / Juliana Freitas-Astua - Integrante / Gustavo Astua-Monge - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2
2001 - 2006

Integração de melhoramento genético, genoma funcional e comparativo de citros - CitEST (Programa Institutos do Milenio - CNPq), Descrição: Projeto realizado dentro do programa Institutos do Milênio do CNPq/MCT. Com foco no seqüênciamento de DNA de Citros e gêneros correlatos, além de Phytophtora, este projeto proporcionou a criação do maior banco de dados de seqüências de Citros do mundo e deu subsídios para importantes estudos que possibilitarão o desenvolvimento de variedades. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Integrante / Alessandra Alves de Souza - Integrante / Helvécio Della Coletta Filho - Integrante / Marcos Antônio Machado - Coordenador / Alexandre Morais do Amaral - Integrante / Maria Luisa Penteado Natividade Targon - Integrante / Juliana Freitas-Astua - Integrante / Gustavo Astua-Monge - Integrante / Valdenice M. Novelli - Integrante / Sérgio Alves de Carvalho - Integrante / Magnólia Araújo Campos - Integrante / Mariangela Cristofani-Yaly - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 31
2001 - 2005

Agronomical and environmental genome, Descrição: Programa FAPESP envolvendo múltiplos laboratórios do Estado de São Paulo, visando o seqüenciamento de genomas de diferentes organismos de importância agronômica ou ambiental.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Integrante / Marcos Antônio Machado - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2
2001 - 2005

Análise genômica e funcional da patogenicidade de Xanthomonas axonopodis pv. citri em laranja doce (Citrus sinensis L. Osb.), Descrição: Envolvendo a participação de pesquisadores de diferentes Instituições do Estado de São Paulo, como o Centro Apta Citros Sylvio Moreira - IAC, Instituto Biológico, UEM e Fundecitrus, o presente projeto de pesquisa propôs, através de três subprojetos, avaliar a resistência varietal ao cancro cítrico de germoplasma de interesse comercial de citros; desenvolver sistema de avaliação rápida de teste de patogenicidade da bactéria em condições ambientais controladas; e, desenvolver sistema de transformação genética para introdução de resistência horizontal à bactéria. No primeiro subprojeto, a avaliação de resistência ou tolerância à bactéria Xanthomonas axonopodis pv. citri, causadora da Cancrose A, de ocorrência crescente nos pomares cítricos do Estado, seria realizada a campo em área experimental da Universidade Estadual de Maringá - UEM. Em pomar instalado em espaçamento 7,0 x 3,5m, tendo o limoeiro 'Cravo' como porta-enxerto, estarão sendo avaliadas 113 variedades de laranjeiras doces, tangerineiras e híbridos, pertencentes ao Banco Ativo de Germoplasma do Centro de Citricultura Sylvio Moreira - IAC. O segundo subprojeto deverá executado em condições de casa-de-vegetação do IB em Campinas, com controle de umidade e temperatura, onde serão realizados testes de inoculação dos mesmos clones e variedades avaliados em campo e de outros materiais do BAG Citros do CAPTACSM-IAC. Para o desenvolvimento do terceiro subprojeto, os trabalhos de indução de resistência à Xanthomonas axonopodis pv. citri via transformação genética serão realizados no Laboratório de Biotecnologia do CAPTACSM - IAC. Após clonagem, gene de resistência NPR1 de Arabidopsis thaliana ou, alternativamente, genes de resistência de citros, serão introduzidos, via Agrobacterium tumefaciens e/ou biolística, linhagem GV3101 em explantes obtidos de ramos de adultos das variedades em estudo.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Integrante / Marcos Antônio Machado - Integrante / Alexandre Morais do Amaral - Integrante / Gustavo Astua-Monge - Integrante / Sérgio Alves de Carvalho - Coordenador / Jorgino Pompeu Júnior - Integrante / Dirceu de Mattos Júnior - Integrante / José Orlando de Figueiredo - Integrante / Renato Bassanesi - Integrante / Pedro Namekata - Integrante / Willian Mario Carvalho Nunes - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2
2001 - 2005

Desenvolvimento de sistemas de super-expressão de genes de resistência a Xanthomonas axonopodis pv. citri em espécies e variedades de citros, Descrição: Projeto de pós-doc atrelado ao Temático intitulado "Avaliação de resistência varietal e produção de variedades de citros potencialmente tolerantes à Xanthomonas axonopodis pv citri".. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 2
1999 - 2002

Expressed genes of Xylella fastidiosa at slow and fast growing conditions, Descrição: Avaliar os genes diferencialemte expressos em xylella fastidiosa em condição de crescimento primário e após sucessivas repicagens.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Integrante / Alessandra Alves de Souza - Integrante / Helvécio Della Coletta Filho - Integrante / Marcos Antônio Machado - Coordenador / Eiko E. Kuramae-Izioka - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 3
1999 - 2002

Genoma da bactéria Xanthomonas axonopodis pv. citri, Descrição: Projeto de seqüenciamento do genoma completo de Xanthomonas axonopodis pav citri, agente causal do cancro cítrico.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Integrante / Marcos Antônio Machado - Coordenador / Alexandre Morais do Amaral - Integrante / Eliane Cristina Locali - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 5
1998 - 2000

Genoma da bactéria Xylella fastidiosa, Descrição: Projeto de seqüenciamento do genoma completo de Xylella fastidiosa, bactéria causadora da Clorose variegada dos Citros.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marco Aurelio Takita - Integrante / Alessandra Alves de Souza - Integrante / Helvécio Della Coletta Filho - Integrante / Marcos Antônio Machado - Coordenador / Eliane Cristina Localli - Integrante / Mariangela Cristofani-Yaly - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 3

Prêmios

2017

I Scientific Day - Top 5 (Amanda de Carvalho Bernardi - aluna de Mestrado), Monsanto.

2010

Prêmio Natura Campus de Inovação Tecnológica 2010, Natura Inovação e Tecnologia de Produtos.

2000

Mérito Científico e Tecnológico, Governo do Estado de São Paulo.

Histórico profissional

Endereço profissional

Instituto Agronômico de Campinas, Centro Av. de Pesquisa Tecnológica do Agronegócio de Citros Sylvio Moreira, Laboratorio de Biotecnologia de Citros. , Rodovia Anhanguera Km 158, Cascalho, 13490970 - Cordeirópolis, SP - Brasil - Caixa-postal: 04, Telefone: (19) 35461399, Ramal: 303, Fax: (19) 35461399

Experiência profissional

2013 - Atual

Universidade Federal de São Carlos

Vínculo: Professor, Enquadramento Funcional: Professor permanente de Pós-Graduação, Carga horária: 2

Outras informações:
Vinculado ao curso de Pós-Graduação em Produção Vegetal e Bioprocessos Associados.

Atividades

11/2013
Ensino, Produção Vegetal e Bioprocessos Associados, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Introdução à Bioinformática

2014 - Atual

Instituto Agronômico de Campinas

Vínculo: Professor, Enquadramento Funcional: Professor permanente de Pós-Graduação, Carga horária: 2

Outras informações:
Professor vinculado ao curso de Pós-Graduação em Agricultura Tropical e Subtropical.

2005 - Atual

Instituto Agronômico de Campinas

Vínculo: , Enquadramento Funcional: Pesquisador Científico VI, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

1999 - 2005

Instituto Agronômico de Campinas

Vínculo: Pós Doutorando, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

01/2014
Ensino, Agricultura Tropical e Subtropical, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Introdução à Bioinformática
09/2011
Direção e administração, Centro Av. de Pesquisa Tecnológica do Agronegócio de Citros Sylvio Moreira.,Cargo ou função, Diretor de Núcleo de Pesquisa e Desenvolvimento.
02/2010
Conselhos, Comissões e Consultoria, Centro Av. de Pesquisa Tecnológica do Agronegócio de Citros Sylvio Moreira.,Cargo ou função, Membro suplente da Comissão Técnica de Biossegurança da Secretaría de Agricultura e Abastecimento do Estado de São Paulo.
11/2006
Conselhos, Comissões e Consultoria, Centro Av. de Pesquisa Tecnológica do Agronegócio de Citros Sylvio Moreira.,Cargo ou função, Presidente da Comissão Interna de Biossegurança do Instituto Agronômico de Campinas.
03/2005
Pesquisa e desenvolvimento, Centro de Pesquisa e Desenvolvimento de Recursos Genéticos Vegetais.,Linhas de pesquisa
08/2005 - 08/2005
Treinamentos ministrados , Centro de Pesquisa e Desenvolvimento de Recursos Genéticos Vegetais.,Treinamentos ministrados, Partipação como instrutor do
07/2005 - 07/2005
Outras atividades técnico-científicas , Centro de Pesquisa e Desenvolvimento de Recursos Genéticos Vegetais, Centro de Pesquisa e Desenvolvimento de Recursos Genéticos Vegetais.,Atividade realizada, Aula intitulada "Bioinformatica" na disciplina AMG006 Biologia Molecular Aplicada ao Melhoramento, na Área de concentração: Melhoramento Genético Vegetal do Curso de Pós-Graduação em Agricultura Tropical e Subtropical MESTRADO do Instituto Agronômico.
03/2005 - 03/2005
Outras atividades técnico-científicas , Centro de Pesquisa e Desenvolvimento de Recursos Genéticos Vegetais, Centro de Pesquisa e Desenvolvimento de Recursos Genéticos Vegetais.,Atividade realizada, Aula ministrada no curso Marcadores Moleculares no Melhoramento Genético de Plantas da Pos-Graduaçao em Genetica da UNICAMP.
06/1999 - 02/2005
Pesquisa e desenvolvimento, Centro Av. de Pesquisa Tecnológica do Agronegócio de Citros Sylvio Moreira.,Linhas de pesquisa

2012 - Atual

Universidade Estadual de Campinas

Vínculo: Professor convidado, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 2

Atividades

02/2012
Ensino, TECNOLOGIA, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Tópicos em Tecnologia II - Introdução à Bioinformática

Propriedade Intelectual

Patentes (1)

Tipo	Título	Data depósito
INVENTOR	Composto de aminoácido de cisteína (ou seus análogos) usado na desestruturação de biofilmes microbianos quando do tratamento ou prevenção de doenças geradas por bactérias fitopatógenas que acometem plantas de interesse agrícola	31/03/2011