Matheus Palhares Viana

I am currently Research Staff Member at IBM Research Brazil in the group Visual Analytics and Insights. From 2012 to 2016 I was a Postdoc in the Developmental and Cell Biology Department at the University of California Irvine, working with Dr. Susanne Rafelski. I received my BS in Physics at the Federal University of São Carlos (Brazil) and my MS and PhD in Computational Physics from the University of São Paulo (Brazil) under supervision of Dr. Luciano da Fontoura Costa. The title of my PhD thesis was Modelling Geographical Biological Networks. My interests are broad and cover a lot of inter-disciplinary areas. In the last year I have been mostly working with Spatial Networks. During my PhD, my main project was the study of mitochondrial network morphology by applying novel 3D image processing and visualization techniques . I also developed works on urban networks, in which we tried to understand how cities evolve over time.

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Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Física

2007 - 2011

Universidade de São Paulo
Título: Caracterização e Modelagem de Redes Biológicas
Luciano da Fontoura Costa. Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Palavras-chave: Análise de Imagem; Complex Networks; Estruturas Biológicas Ramificadas; Mecânica Estatística; Quantitative Methods; Visialização 3D.

Mestrado em Física

2005 - 2006

Universidade de São Paulo
Título: Estudos das Redes Complexas e Aplicações Biológicas,Ano de Obtenção: 2007
Luciano da Fontoura Costa.Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Redes Complexas; Mecânica Estatística; Visialização 3D.Grande área: Ciências Exatas e da Terra

Graduação em Bacharelado Em Física

2001 - 2004

Universidade Federal de São Carlos
Orientador: Luciano da Fountoura Costa
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.

Pós-doutorado

2012

Pós-Doutorado. , University of California Irvine, UCI, Estados Unidos. , Bolsista do(a): UCI, UCI, Estados Unidos. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra, Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Processamento de Imagens. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Morfologia / Subárea: Citologia e Biologia Celular.

2011 - 2012

Pós-Doutorado. , Instituto de Física de São Carlos, IFSC, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra, Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Processamento Gráfico (Graphics).

Formação complementar

2011 - 2011

Extensão universitária em Estágio. (Carga horária: 480h). , University of Strathclyde, STRATH, Escócia.

2010 - 2010

Extensão universitária em Estágio. (Carga horária: 120h). , University of Cambridge, CAM, Inglaterra.

2009 - 2009

Extensão universitária em Estágio. (Carga horária: 40h). , University of California San Francisco, UCSF, Estados Unidos.

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física Geral/Especialidade: Instrumentação Específica de Uso Geral em Física.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física Geral/Especialidade: Métodos Matemáticos da Física.

Organização de eventos

VIANA, M. P. ; et. al . XII Workshop da Pós Graduação do IFSC. 2008. (Outro).

Produções bibliográficas

HARWIG, MEGAN C. ; Viana, Matheus P. ; EGNER, JOHN M. ; HARWIG, JASON J. ; WIDLANSKY, MICHAEL E. ; Rafelski, Susanne M. ; HILL, R. BLAKE . Methods for imaging mammalian mitochondrial morphology: A prospective on MitoGraph. ANALYTICAL BIOCHEMISTRY , v. 549, p. 1, 2018.
STRANO, EMANUELE ; Viana, Matheus P. ; SORICHETTA, ALESSANDRO ; TATEM, ANDREW J. . Mapping road network communities for guiding disease surveillance and control strategies. Scientific Reports , v. 8, p. 4744, 2018.
BOLDRINI, JOSÉ L. ; Viana, Matheus P. ; DOS REIS, SÉRGIO F. ; HENNING, BARBARA . A mathematical model for thermoregulation in endotherms including heat transport by blood flow and thermal feedback control mechanisms: changes in coat, metabolic rate, blood fluxes, ventilation and sweating rates. Letters in Biomathematics , v. 5, p. 129-173, 2018.
JAJOO, R. ; JUNG, Y. ; HUH, D. ; VIANA, M. P. ; RAFELSKI, S. M. ; SPRINGER, M. ; PAULSSON, J. . Accurate concentration control of mitochondria and nucleoids. Science (New York, N.Y.) , v. 351, p. 169-172, 2016.
HIGUCHI-SANABRIA, R. ; CHARALEL, J. K. ; VIANA, M. P. ; GARCIA, E. J. ; SING, C. N. ; KOENIGSBERG, A. ; SWAYNE, T. C. ; VEVEA, J. D. ; BOLDOGH, I. R. ; RAFELSKI, S. M. ; PON, L. A. . Mitochondrial anchorage and fusion contribute to mitochondrial inheritance and quality control in the budding yeast, Saccharomyces cerevisiae. Molecular Biology of the Cell (Cessou em 2007. Cont. ISSN 1939-4586 Molecular Biology of the Cell (Online)) , v. 27, p. 1, 2016.
PERRYMAN, MICHAEL S. ; TESSIER, JÉRÉMIE ; WIHER, TIMOTHY ; O?DONOGHUE, HEATHER ; MCCRACKEN, ALISON N. ; KIM, SEONG M. ; NGUYEN, DEAN G. ; SIMITIAN, GRIGOR S. ; Viana, Matheus ; RAFELSKI, SUSANNE ; EDINGER, AIMEE L. ; HANESSIAN, STEPHEN . Effects of stereochemistry, saturation, and hydrocarbon chain length on the ability of synthetic constrained azacyclic sphingolipids to trigger nutrient transporter down-regulation, vacuolation, and cell death. Bioorganic & Medicinal Chemistry (Print) , v. 24, p. 4390-4397, 2016.
KOSER, DAVID E ; THOMPSON, AMELIA J ; FOSTER, SARAH K ; DWIVEDY, ASHA ; PILLAI, EVA K ; SHERIDAN, GRAHAM K ; SVOBODA, HANNO ; Viana, Matheus ; COSTA, LUCIANO DA F ; GUCK, JOCHEN ; HOLT, CHRISTINE E ; FRANZE, KRISTIAN . Mechanosensing is critical for axon growth in the developing brain. NATURE NEUROSCIENCE , v. 19, p. 1592-1598, 2016.
DE ARRUDA, HENRIQUE FERRAZ ; COMIN, CESAR HENRIQUE ; Miazaki, Mauro ; Viana, Matheus Palhares ; DA FONTOURA COSTA, LUCIANO . A framework for analyzing the relationship between geneexpression and morphological, topological, and dynamical patterns inneuronal networks. Journal of Neuroscience Methods , v. 4, p. 150, 2015.
Miazaki, Mauro ; VIANA, MATHEUS P ; YANG, ZHONG ; COMIN, CESAR H ; WANG, YAMING ; DA F COSTA, LUCIANO ; XU, XIAOYIN . Automated high-content morphological analysis of muscle fiber histology. Computers in Biology and Medicine , v. 63, p. 28-35, 2015.
COMIN, CESAR H ; VIANA, MATEUS P ; Antiqueira, Lucas ; COSTA, LUCIANO DA F . Random walks in directed modular networks. Journal of Statistical Mechanics , v. 2014, p. P12003, 2014.
Viana, Matheus P. ; AMANCIO, DIEGO R. ; DA F. COSTA, LUCIANO . On time-varying collaboration networks. Journal of Informatrics , v. 7, p. 371-378, 2013.
ZALTZ AUSTWICK, MARTIN ; O'BRIEN, OLIVER ; STRANO, EMANUELE ; Viana, Matheus . The Structure of Spatial Networks and Communities in Bicycle Sharing Systems. Plos One , v. 8, p. e74685, 2013.
COMIN, CESAR H ; VIANA, MATHEUS P ; COSTA, LUCIANO DA F . The relationship between structure and function in locally observed complex networks. New Journal of Physics , v. 15, p. 013048, 2013.
Viana, Matheus P. ; FOURCASSIÉ, VINCENT ; PERNA, ANDREA ; Costa, Luciano da F. ; JOST, CHRISTIAN . Accessibility in networks: A useful measure for understanding social insect nest architecture. Chaos, Solitons and Fractals , v. 46, p. 38-45, 2013.
Viana, Matheus P. ; STRANO, EMANUELE ; BORDIN, PATRICIA ; BARTHELEMY, MARC . The simplicity of planar networks. Scientific Reports , v. 3, p. 1-6, 2013.
STRANO, EMANUELE ; VIANA, M. P. ; COSTA, L. da F. ; CARDILLO, ALESSIO ; PORTA, SERGIO ; LATORA, VITO . Urban street networks, a comparative analysis of ten European cities. Environment & Planning. B, Planning & Design (Print) , v. 40, p. 1071-1086, 2013.
2012 Viana, Matheus ; Batista, João ; Costa, Luciano . Effective number of accessed nodes in complex networks. Physical Review. E, Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics (Print) , v. 85, p. 036105, 2012.
2012 ZAWADZKI, Krissia ; Feenders, Christoph ; Viana, Matheus P. ; Kaiser, Marcus ; Costa, Luciano da F. . Morphological Homogeneity of Neurons: Searching for Outlier Neuronal Cells. Neuroinformatics (Totowa) , v. 1, p. 1-1, 2012.
2012 da Silva, Renato Aparecido Pimentel ; Viana, Matheus Palhares ; da Fontoura Costa, Luciano . Predicting epidemic outbreak from individual features of the spreaders. Journal of Statistical Mechanics , v. 2012, p. P07005, 2012.
2012 COMIN, CESAR H. ; BATISTA, JOÃO L. B. ; Viana, Matheus P. ; Costa, Luciano da F. ; TRAVENÇOLO, BRUNO A. N. ; Kaiser, Marcus . STRUCTURE AND DYNAMICS: THE TRANSITION FROM NONEQUILIBRIUM TO EQUILIBRIUM IN INTEGRATE-AND-FIRE DYNAMICS. International Journal of Bifurcation and Chaos in Applied Sciences and Engineering , v. 22, p. 1250174, 2012.
2012 Pérez-Reche, F. ; TARASKIN, S. ; OTTEN, W. ; Viana, M. ; Costa, L. ; Gilligan, C. . Prominent Effect of Soil Network Heterogeneity on Microbial Invasion. Physical Review Letters , v. 109, p. 098102, 2012.
2012 RAFELSKI, S. M. ; VIANA, M. P. ; ZHANG, Y. ; CHAN, Y.-H. M. ; THORN, K. S. ; YAM, P. ; FUNG, J. C. ; LI, H. ; COSTA, L. D. F. ; MARSHALL, W. F. . Mitochondrial Network Size Scaling in Budding Yeast. Science (New York, N.Y.: Online) , v. 338, p. 822-824, 2012.
2011 Costa, Luciano Da Fontoura ; Oliveira, Osvaldo ; Travieso, Gonzalo ; Rodrigues, Francisco Aparecido ; Villas Boas, Paulino ; Antiqueira, Lucas ; Viana, Matheus Palhares ; Correa Rocha, Luis . Analyzing and modeling real-world phenomena with complex networks: a survey of applications. Advances in Physics , v. 60, p. 329-412, 2011.
2011 Silva, F.N. ; TravenÃ§olo, B.A.N. ; COSTA, L. da F. ; Viana, M.P. . Investigating relationships within and between category networks in Wikipedia. Journal of Informatrics , v. 5, p. 431-438, 2011.
Viana, Matheus Palhares ; DA FONTOURA COSTA, LUCIANO . Fast long-range connections in transportation networks. Physics Letters. A (Print) , v. 375, p. 1626-1629, 2011.

Histórico profissional

Endereço profissional

IBM Research Brazil, IBM Research Brazil. , Rua Joaquim Maciel Filho, Jardim Londrina, 05638080 - São Paulo, SP - Brasil, Telefone: (11) 21323122, URL da Homepage:

Experiência profissional

2016 - Atual

IBM Research Brazil (SP)

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.