Patrícia Rufino Oliveira
Possui graduação em Bacharelado em Ciências de Computação pela Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho (1994), mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional pela Universidade de São Paulo (1997) e doutorado em Ciências da Computação e Matemática Computacional pela Universidade de São Paulo (2004), com período sanduíche na Aalto University, Finlândia. Atualmente é professora associada da Escola de Artes, Ciências e Humanidades da Universidade de São Paulo (EACH/USP). Tem experiência na área de Ciência da Computação, com ênfase em Inteligência Artificial, atuando principalmente nos seguintes temas: aprendizado de máquina, IA explicável, visão computacional e descoberta de medicamentos. Desde junho de 2024, coordena o Programa de Pós-Graduação em Sistemas de Informação da EACH/USP.
Informações coletadas do Lattes em 30/10/2025
Acadêmico
Formação acadêmica
Doutorado em Ciências da Computação e Matemática Computacional
2000 - 2004
Universidade de São Paulo
Título: Métodos auto-organizáveis para segmentação de imagens
Orientador: em Aalto University School of Science and Technology ( Aapo Hivärinen)
com , Ano de obtenção: 2004. Roseli Aparecida Francelin Romero. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Inteligência Artificial; Processamento de Imagens; Extração de Características; Redução de Ruído; Redes Neurais Artificiais; Aprendizado Bayesiano. Grande área: Ciências Exatas e da TerraSetores de atividade: Neurociências; Informática.
Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional
1995 - 1997
Universidade de São Paulo
Título: Redes Neurais Artificiais para Extração de Características
, Ano de Obtenção: 1997.Roseli Aparecida Francelin Romero.Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: Redes Neurais; Extração de Características; Compressão de Dados.Grande área: Ciências Exatas e da TerraSetores de atividade: Neurociências; Informática.
Graduação em Bacharelado em Ciências de Computação
1990 - 1994
Pós-doutorado
2021
Livre-docência. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Título: Técnicas de Inteligência Artificial para Suporte ao Processo de Descoberta de Medicamentos, Ano de obtenção: 2021.
2019 - 2020
Pós-Doutorado. , New Jersey Institute of Technology, NJIT, Estados Unidos. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Idiomas
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Alemão
Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Pouco, Escreve Pouco.
Áreas de atuação
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Inteligência Artificial.
Participação em eventos
15th IEEE International Conference on Semantic Computing. OntoQSAR: an Ontology for Interpreting Chemical and Biological Data in Quantitative Structure-Activity Relationship Studies. 2020. (Congresso).
15th International Conference on Information Technology - New Generations. Applying Transfer Learning to QSAR Regression Models. 2018. (Congresso).
X Congresso Brasileiro de Inteligência Computacional (CBIC 2011). A Parallel PCA Neural Network Approach for Feature Extraction. 2011. (Congresso).
III Workshop-Escola de Computação e Informação Quântica. 2010. (Oficina).
The International Joint Conference IBERAMIA/SBIA/SBRN. 2006. (Congresso).
European Summer School on ICA - from Theory to Applications. 2003. (Oficina).
I Escola Brasileira de Inteligência Artificial e Bioinformática.I Escola Brasileira de Inteligência Artificial e Bioinformática. 2001. (Oficina).
VI Escola Regional de Informática, São Paulo.VI Escola Regional de Informática, São Paulo. 2001. (Oficina).
Iberamia / Sbia 2000. Iberamia/Sbia 2000. 2000. (Congresso).
VIth Brazilian Symposium on Neural Networks.VIth Brazilian Symposium on Neural Networks. 2000. (Simpósio).
V Escola Regional de Informática.V Escola Regional de Informática. 1997. (Oficina).
II Workshop on Cybernetic Vision.II Workshop on Cybernetic Vision. 1996. (Oficina).
Seminário de Métodos Estatísticos Aplicados às Ciências Humanas.Seminário de Métodos Estatísticos Aplicados às Ciências Humanas. 1996. (Seminário).
XII Brazilain Symposium on Artificial Intelligence.XII Brazilain Symposium on Artificial Intelligence. 1996. (Simpósio).
XI Simpósio Brasileiro de Banco de Dados.XI Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. 1996. (Simpósio).
X Simpósio Brasileiro de Engenharia de Software.X Simpósio Brasileiro de Engenharia de Software. 1996. (Simpósio).
II Simpósio Brasileiro de Redes Neurais.II Simpósio Brasileiro de Redes Neurais. 1995. (Simpósio).
I Workshop de Dissertações em Andamento / Dissertações Concluídas.I Workshop de Dissertações em Andamento / Dissertações Concluídas. 1995. (Oficina).
VIII Simpósio Brasileiro de Computação Gráfica e Processamemto de Imagens.VIII Simpósio Brasileiro de Computação Gráfica e Processamemto de Imagens. 1995. (Simpósio).
Participação em bancas
DELGADO, K. V.; RIBEIRO, Carlos H. C.; FERREIRA, Fernando. F.;OLIVEIRA, PATRÍCIA R.. Planejamento probabilístico sensível a risco com ILAO* e função utilidade exponencial. 2018. Dissertação (Mestrado em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.
NAKAGAWA, E. Y.; SENGER, H.;OLIVEIRA, PATRÍCIA R.. FlexPersuade - Explorando uma abordagem flexível em softwares de persuasão: um estudo de caso com players de música. 2016. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.
NUNES, F. L. S.;OLIVEIRA, PATRICIA R.; TORI, R.; COSTA, R. M. E. M.. Um modelo de avaliação da percepção de tridimensionalidade para sistemas de realidade virtual estereoscópicos. 2016. Dissertação (Mestrado em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.
ESTRELLA, J. C.;OLIVEIRA, PATRÍCIA R.; BATISTA, D. M.. Vehicular Ad Hoc Network Detecção de Congestionamento em VANET Utilizando a Abordagem com Sistemas Fuzzy para Prover Estratégia Adaptativa a Disseminação de Dados em Diferentes Densidades de Rede. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.
PARABONI, IOLIVEIRA, PATRÍCIA R.; ROMAN, N. T.. Detecção de viés ideológico em textos usando modelos neurais e atributos psicolinguísticos. 2020. Exame de qualificação (Mestrando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.
PARABONI, I; REZENDE, S. O.;OLIVEIRA, PATRÍCIA R.. Atribuição autoral de textos digitais. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.
LIMA, CLODOALDO A. M.; DELGADO, Karina. V.;OLIVEIRA, PATRICIA R.. Métodos de segmentação da iris para imagens capturadas em ambiente não controlado visando reconhecimento biométrico: um estudo comparativo. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.
PARABONI, I; PARDO, T. A. S.;OLIVEIRA, PATRÍCIA R.. Reescrita sentencial baseada em traços de personalidade. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.
FANTINATO, M.; AZEVEDO, L. G.;OLIVEIRA, PATRÍCIA R.. Aplicação de computação evolutiva em mineração de processos. 2016.
NUNES, F. L. S.; TORI, R.;OLIVEIRA, PATRÍCIA R.. Um modelo de avaliação da percepção de tridimensionalidade para sistemas de Realidade Virtual com estereoscopia. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.
PERES, S. M.;OLIVEIRA, PATRÍCIA R.; FELTRIM, V. D.. A influência do contexto de discurso na segmentação automática das fases do gesto com aprendizado de máquina supervisionado. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.
CORDEIRO, D. A.;OLIVEIRA, PATRÍCIA R.; ENDO, A. T.. Análise do consumo de energia de técnicas usadas em computation offloading em aplicativo Android de código aberto. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, P. R.PARABONI, I. Recuperação de dados históricos para atendimento das recomendações do Acordo de Basiléia II. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.
NUNES, F. L. S.; WASSERMANN, R.; STERN, J. M.; AZEVEDO, R. J.;OLIVEIRA, P.R.. Concurso público para provimento de um cargo de Professor Doutor na área de Ciência da Computação. 2015. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, P.R.; CAMARGO, R. Y.; MARGI, C. B.; UEYAMA, J.; SILVA, V. F.. Concurso Público para provimento de dois cargos de Professor Doutor na área de Redes de Computadores e Sistemas Operacionais. 2013. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, P. R.DIGIAMPIETRI, L. A.; CAMARGO, R. Y.; MARGI, C. B.; CAMARGO, R. Y.. Concurso Público para provimento de dois cargos de Professor Doutor na área Redes de Computadores e Sistemas Operacionais. 2011. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, P. R.; NUNES, F. L. S.; PEDRINI, H.; COSTA, A. H. R.; GEROSA, M. A.. Concurso público para provimento de dois cargos de Professor Doutor na área de Ciência da Computação. 2010. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, P. R.; MARGI, C. B.; CAMARGO, R. Y.; UEYAMA, J.; MADEIRA, E. R. M.. Concurso público para provimento de dois cargos de Professor Doutor na área de Redes de Computadores e Sistemas Operacionais. 2010. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, P. R.PARABONI, I; FERREIRA, C. E.;ROMERO, R. A. F.; LIANG, Zhao. Concurso público para provimento de um cargo de Professor Doutor na área de Inteligência Artificial. 2009. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, P. R.; MARGI, C. B.; CAMARGO, R. Y.; SATO, Líria Matsumoto; MADEIRA, E. R. M.. Concurso público para provimento de um cargo de Professor Doutor na área Arquitetura e Redes de Computadores. 2009. Universidade de São Paulo.
PARABONI, IOLIVEIRA, P. R.; TERADA, R.; CARVALHO, A. M. B. R.; MINGHIM, R.. Concurso público para provimento de dois cargos de Professor Doutor na área de Ciência da Computação. 2009. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, PATRÍCIA R.. Membro do Comitê de Programa de Brazilian Conference on Intelligent Systems. 2020. Sociedade Brasileira de Computação - Porto Alegre.
OLIVEIRA, PATRÍCIA R.. Membro do Comitê de Programa do Encontro Nacional de Inteligência Artificial e Computacional. 2020. Sociedade Brasileira de Computação - Porto Alegre.
OLIVEIRA, PATRÍCIA R.. Membro do Comitê de Programa do Concurso de Teses e Dissertações da SBC (CTDIAC 2020). 2020. Sociedade Brasileira de Computação - Porto Alegre.
OLIVEIRA, PATRÍCIA R.. Membro do Comitê de Programa de Brazilian Conference on Intelligent Systems. 2019. Sociedade Brasileira de Computação - Porto Alegre.
OLIVEIRA, PATRICIA R.. Membro do Comitê de Programa do Encontro Nacional de Inteligência Artificial e Computacional. 2019. Sociedade Brasileira de Computação - Porto Alegre.
OLIVEIRA, PATRICIA R.. Membro do Comitê de Programa do 31o. Concurso de Teses e Dissertações da SBC (CTD). 2018. Sociedade Brasileira de Computação - Porto Alegre.
OLIVEIRA, PATRÍCIA R.. Membro do Comitê de Programa de Brazilian Conference on Intelligent Systems. 2018. Sociedade Brasileira de Computação - Porto Alegre.
OLIVEIRA, PATRÍCIA R.. Membro do Comitê de Programa do Encontro Nacional de Inteligência Artificial e Computacional. 2018. Sociedade Brasileira de Computação - Porto Alegre.
OLIVEIRA, PATRICIA R.. Membro do Comitê de Programa do 30o. Concurso de Teses e Dissertações da SBC (CTD). 2017. Sociedade Brasileira de Computação - Porto Alegre.
OLIVEIRA, PATRICIA R.. Membro do Comitê de Programa de Brazilian Conference on Intelligent Systems. 2017. Sociedade Brasileira de Computação - Porto Alegre.
OLIVEIRA, PATRICIA R.. Membro do Comitê de Programa do Encontro Nacional de Inteligência Artificial e Computacional. 2017. Sociedade Brasileira de Computação - Porto Alegre.
OLIVEIRA, PATRICIA R.. Membro do Comitê de Programa de Brazilian Conference on Intelligent Systems. 2016. Sociedade Brasileira de Computação - Porto Alegre.
OLIVEIRA, PATRICIA R.. Membro do Comitê de Programa do Encontro Nacional de Inteligência Artificial e Computacional. 2016. Sociedade Brasileira de Computação - Porto Alegre.
OLIVEIRA, PATRICIA R.. Membro do Comitê de Programa de Brazilian Conference on Intelligent Systems. 2015. Sociedade Brasileira de Computação - Porto Alegre.
OLIVEIRA, PATRICIA R.. Membro do Comitê de Programa do Encontro Nacional de Inteligência Artificial e Computacional. 2015. Sociedade Brasileira de Computação - Porto Alegre.
OLIVEIRA, PATRÍCIA R.. Membro do Comitê de Programa de VIII Simpósio Brasileiro de Sistemas de Informação. 2012. Sociedade Brasileira de Computação - Porto Alegre.
OLIVEIRA, PATRÍCIA R.. Membro do Comitê de Programa de XVII Congresso Brasileiro de Automática. 2008. Sociedade Brasileira de Computação - Porto Alegre.
Orientou
Pipeline automatizado para geração de dados de preferência com grandes modelos de linguagem: combinando segurança e informação; Início: 2025; Dissertação (Mestrado profissional em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; (Orientador);
Explicações seletivas em experimentos de Inteligência Artificial; Início: 2024; Dissertação (Mestrado em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; (Orientador);
Análise dos determinantes da desigualdade digital no Brasil antes e após a pandemia; Início: 2024; Dissertação (Mestrado em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; (Coorientador);
Modelos de linguagem para previsão com dados tabulares; Início: 2024; Dissertação (Mestrado em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; (Orientador);
Modelos de linguagem como geradores de dados tabulares; Início: 2024; Dissertação (Mestrado em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; (Orientador);
Predição de séries temporais multivariadas utilizando redes neurais de grafos e técnicas de causalidade; Início: 2023; Dissertação (Mestrado profissional em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; (Orientador);
Ontologias para interpretação de modelos de processamento de língua natural e estudo do discurso político (Título provisório); Início: 2020; Tese (Doutorado em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo; (Orientador);
Construção de modelos de aprendizado profundo com transferência de aprendizado para a descoberta de medicamentos; Início: 2025; Iniciação científica (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; (Orientador);
Construção de um sistema com interface de explicações e sua aplicação na área de descoberta de medicamentos; Início: 2024; Iniciação científica (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Pró-Reitoria de Graduação da Universidade de São Paulo; (Orientador);
Uma abordagem semântica para seleção de conjuntos de dados em experimentos de transferência de aprendizado e sua aplicação na área de descoberta de medicamentos; 2019; Dissertação (Mestrado em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Identificação de genes significativos para o balanço redox de células beta pancreáticas submetidas à progesterona; 2017; Dissertação (Mestrado em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo, ; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Técnicas de transferência de aprendizagem aplicadas a modelos QSAR para regressão; 2015; Dissertação (Mestrado em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo, ; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Aprendizado semi-supervisionado para o tratamento de incerteza na rotulação de dados de Química Medicinal; 2014; Dissertação (Mestrado em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, ; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
LearnInPlanner: uma abordagem de aprendizado supervisionado com redes neurais para solução de problemas de planejamento clássico; 2010; Dissertação (Mestrado em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, ; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Utilização de Rede Neural para Grafos aplicada à análise de sentimentos: uma análise comparativa com transformadores; 2022; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Descoberta de novos medicamentos via técnicas de regressão aplicadas a dados químicos e genômicos; 2021; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Condições socioeconômicas e violência: uma análise de regressão com árvores aleatórias; 2021; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Desenvolvimento de uma ferramenta computacional para extração de fatos de problemas de planejamento clássico; 2016; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Navegação e tomada de decisão por agente autônomo em ambientes desconhecidos utilizando técnicas de aprendizado de máquina; 2015; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Estudo e Avaliação da Abordagem de Aprendizado Deep Learning Aplicada a Reconhecimento de Dígitos Manuscritos; 2012; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Utilização de Redes Neurais em Problemas de Planejamento; 2011; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Incorporação do algoritmo Expectation-Maximization a Modelos de Misturas ICA para segmentação de imagens; 2010; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Segmentação de imagens usando o método Watershed; 2010; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Classificação de Imagens e Geração Automática de Protótipos baseadas em uma variação do Algoritmo K-Médias; 2010; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Sistema de raciocínio baseado em casos para definição de estratégia comercial em processos de concorrência no mercado de tecnologia de informação e comunicação; 2009; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Máquinas de Vetores-Suporte e Manipulação de Dados em Imagens; 2008; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Redes Neurais Artificiais para Análise de Componentes Principais; 2008; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Estudo e Avaliação de Máquinas de Vetores-Suporte; 2008; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Reconhecimento de Padrões em Imagens Digitalizadas: Uma Implementação de um Reconhecedor de Caracteres Alfanuméricos; 2008; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Utilização de Redes Neurais Artificiais para Análise de Dados de Transações em Bolsas de Valores; 2008; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Redes Neurais Artificiais para Compressão de Imagens; 2008; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Seleção de modelos de regressão baseados em Máquinas de Vetores Suporte para descoberta de novos medicamentos; 2020; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Aplicação de ontologias na área de Química Medicinal para descoberta de compostos bioativos candidatos ao tratamento de câncer; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Estudo de algoritmos de treinamento quânticos para redes neurais artificiais; 2013; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Técnicas de Aprendizado de Máquina para Classificação de Consultas em Diretórios de Busca na Web; 2013; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Pró-Reitoria de Pesquisa da Universidade de São Paulo; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Implementação de Técnicas Estatísticas de Agrupamento para Análise Exploratória de Dados; 2010; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, SESu/MEC; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Computação Quântica: Estudo e Simulação do Algoritmo de Shor; 2010; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Pró-Reitoria de Pesquisa da Universidade de São Paulo; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Técnicas de Agrupamento para Descoberta de Similaridades em Documentos Textuais; 2009; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Pró-Reitoria de Pesquisa da Universidade de São Paulo; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Sistemas de Tutoria Inteligente Baseados numa Arquitetura Multi-agentes; 2007; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Pró-Reitoria de Graduação da Universidade de São Paulo; Orientador: Patrícia Rufino Oliveira;
Produções bibliográficas
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DE AZEVEDO, WALTER FILGUEIRA ; QUIROGA, RODRIGO ; VILLARREAL, MARCOS ARIEL ; DA SILVEIRA, NELSON JOSÉ FREITAS ; BITENCOURT'FERREIRA, GABRIELA ; DA SILVA, AMAURI DUARTE ; VEIT'ACOSTA, MARTINA ; OLIVEIRA, PATRICIA RUFINO ; TUTONE, MARCO ; BIZIUKOVA, NADEZHDA ; POROIKOV, VLADIMIR ; TARASOVA, OLGA ; BAUD, STÉPHAINE . SAnDReS 2.0: Development of machine-learning models to explore the scoring function space. JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY , v. 45, p. 2333-2346, 2024.
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OLIVEIRA, P. R. ; VICENTINI, J. F. ; ROMERO, R. A. F. . Combining Fuzzy ART Network Clustering and Sparse Code Shrinkage for Image Segmentation. In: 9th International Conference On Neural Information Processing (ICONIP'2002), 2002, Cingapura. Proceedings of 9th International Conference On Neural Information Processing (ICONIP'2002), 2002. v. 5. p. 2435-2440.
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OLIVEIRA, P. R. ; ROMERO, R. A. F. ; MAZUCHELI, J. ; NONATO, L. G. . Techniques for Image Compression: A Comparative Analysis. In: VIth Brazilian Symposium on Neural Networks, 2000, Rio de Janeiro. Proceedings of VIth Brazilian Symposium on Neural Networks. Los Alamitos: IEEE Computer Society, 2000. v. Vol. I. p. 249-254.
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OLIVEIRA, P. R. ; ROMERO, R. A. F. . A Comparison between PCA Neural Networks and JPEG Standard for Performing Image Compression. In: II Worksop on Cybernetic Vision, 1996, São Carlos. Proceedings of II Worksop on Cybernetic Vision. Los Alamitos: IEEE Computer Society, 1996. p. 112-116.
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OLIVEIRA, P. R. ; ROMERO, R. A. F. ; MAZUCHELI, J. . Uma Comparação entre Análise de Componentes Principais e Redes Neurais Artificiais para Compressão de Imagens. In: Quinta Escola de Modelos de Regressão, 1997, Campos do Jordão. Anais da Quinta Escola de Modelos de Regressão, 1997.
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ANGELO, RAFAELA M. ; IO, ANDREIA K. ; ALMEIDA, MATHEUS P. ; SILVEIRA, RAFAEL G. ; OLIVEIRA, PATRÍCIA R. ; ALCAZAR, JOSE J. P. ; HONORIO, KATHIA M. ; BETTANIN, FERNANDA . OntoQSAR: an Ontology for Interpreting Chemical and Biological Data in Quantitative Structure-Activity Relationship Studies. 2020. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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SIMÕES, RODOLFO DA SILVA ; OLIVEIRA, PATRICIA RUFINO ; HONORIO, KATHIA MARIA ; LIMA, CLODOALDO A. M. . Applying Transfer Learning to QSAR Regression Models. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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OLIVEIRA, PATRICIA RUFINO ; DIGIAMPIETRI, L. A. ; HONDA, Willian Yukio ; PEREIRA, M. C. . A Parallel PCA Neural Network Approach for Feature Extraction. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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OLIVEIRA, PATRICIA RUFINO ; ROMERO, ROSELI A. F. ; NONATO, L. G. ; MAZUCHELI, J. . Techniques for image compression: a comparative analysis. 2000. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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OLIVEIRA, PATRICIA RUFINO ; ROMERO, ROSELI A. F. . A comparision between PCA neural networks and the JPEG standard for performing image compression. 1996. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
Projetos de pesquisa
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2019 - 2020
Uso de Deep Learning no Planejamento de Candidatos a Fármacos, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Patrícia Rufino Oliveira - Integrante / HONORIO, KATHIA M. - Coordenador / ANGELO, RAFAELA M. - Integrante / Gabriel Zarzana Espinoza - Integrante.
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2019 - 2020
Desenvolvimento de ontologias para aperfeiçoamento e interpretação de modelos de regressão aplicados a Estudos de Relações Quantitativas Estrutura- Atividade, Descrição: This research project aims at constructing and applying ontological data to guide the selection of suitable (related) data sets for transfer knowledge from one QSAR model to another. Furthermore, an additional objective refers to use the ontological data to explore the drug-target relations estimated by the constructed QSAR models in order to understand how the modifications on structural characteristics of compounds induce their biological activity. By combining chemical and biological components and their interrelationships in an integrated ontology for QSAR studies, the project will provide a more holistic and standardized knowledge formalization of the drug discovery process. One also expects that such resulting ontological data can be used to guide the selection of source data sets in QSAR transfer learning applications and to interpret predictive results obtained by machine learning methods in medicinal chemistry area.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Patrícia Rufino Oliveira - Coordenador / James Geller - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
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2017 - Atual
Applying transfer learning techniques and ontologies to QSAR regression models, Descrição: To develop a new medicine, investigators must analyze the biological targets of a given disease, discover and develop drug candidates for these targets, performing in parallel, biological laboratory tests to validate the drug effectiveness and side effects. The Quantitative Study of Activity-Structure Relationships (QSAR) involves building regression models that relate a set of descriptors of a chemical compound and its biological activity with respect to one or more targets in the human body. Datasets manipulated by researchers to QSAR analysis are generally characterized by a small number of instances and this makes it more complex to build accurate predictive models. In this context, transfer learning techniques that take information from other QSAR models to the same biological target would be desirable, reducing the effort and cost for generating new chemical compounds descriptors. This project aims at applying two learning transfer methods, based on instances and on parameters, to build QSAR regression models via Support Vectors (SV). In order to implement the transfer learning techniques, a new approach for selecting related chemical datasets, which is based on the integration of different ontologies, will be developed. The regression results obtained by the use of the transfer learning approaches will be compared with those obtained by classical methods regarding the Mean Squared Error (MSE) measure.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Patrícia Rufino Oliveira - Coordenador / HONORIO, KATHIA M. - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / IBM Research Brazil - Auxílio financeiro.
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2011 - 2013
Desenvolvimento e Validação de um Esquema de Análise Exploratória para Dados de Química Medicinal, Descrição: Pesquisas relevantes na área de Química Medicinal têm direcionado-se para a descoberta de novas substâncias químicas bioativas, potenciais candidatas a novos medicamentos para doenças consideradas crônicas, como é o caso do diabetes mellitus tipo 2 (DM) e a síndrome metabólica (SM). Entretanto, os dados manipulados pelos pesquisadores que atuam nessa área são inerentemente caracterizados pela alta dimensionalidade e pelo número cada vez maior de amostras a serem analisadas, o que torna complexa a modelagem de fenômenos moleculares que constituem os processos bioquímicos subjacentes. Dessa forma, para que a modelagem e a simulação desses sistemas complexos sejam bem sucedidas, é fundamental combinar-se a memória do computador, para cálculo e armazenamento de dados, e a habilidade humana em reconhecer padrões, resolvendo-se assim, problemas multivariados. A proposta de pesquisa apresentada neste documento compreende uma investigação multidisciplinar cujas principais contribuições incluem o aprimoramento e a integração de técnicas de análise exploratória, gerando uma ferramenta computacional capaz de reduzir o tempo de análise dos dados obtidos a partir de modelos da química medicinal, caracterizados por sua alta dimensionalidade e que possa auxiliar na futura construção de um banco de dados que seja referência na área de propriedades biológicas de drogas e candidatos a fármacos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Patrícia Rufino Oliveira - Coordenador / Káthia Maria Honório - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Prêmios
2021
1o. Melhor trabalho do 29o. Simpósio Internacional de Iniciação Científica e Tecnológica da USP (SIICUSP), EACH/USP - Trabalho: Seleção de modelos de regressão baseados em máquinas de vetores suporte, EACH/USP.
Histórico profissional
Endereço profissional
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Universidade de São Paulo, USP Leste, Escola de Artes, Ciências e Humanidades. , Av. Arlindo Bettio, 1000, Ermelino Matarazzo, 03828001 - São Paulo, SP - Brasil, Telefone: (11) 30911020, URL da Homepage:
Experiência profissional
2021 - Atual
Universidade de São PauloVínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Associado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2006 - 2021
Universidade de São PauloVínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Doutor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
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06/2024
Direção e administração, USP Leste.Cargo ou função, Coordenadora do Programa de Pós-graduação em Sistemas de Informação.
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06/2024
Conselhos, Comissões e Consultoria, USP Leste.Cargo ou função, Membro titular da Comissão de Pós-graduação da Escola de Artes, Ciências e Humanidades..
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01/2011
Ensino, Sistemas de Informação, Nível: Pós-GraduaçãoDisciplinas ministradas, Inteligência Computacional, Metodologia da Pesquisa em Sistemas de Informação, Preparação Pedagógica para Computação
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02/2006
Pesquisa e desenvolvimento, USP Leste.Linhas de pesquisa
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01/2006
Pesquisa e desenvolvimento, USP Leste, Escola de Artes, Ciências e Humanidades.Linhas de pesquisa
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01/2006
Ensino, Sistemas de Informação, Nível: GraduaçãoDisciplinas ministradas, Algoritmos e Estruturas de Dados, Bancos de Dados, Computação Orientada a Objetos, Inteligência Artificial, Projeto Supervisionado ou de Graduação, Resolução de Problemas, Introdução à Computação
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01/2017
Conselhos, Comissões e Consultoria, USP Leste, Escola de Artes, Ciências e Humanidades.Cargo ou função, Membro titular da Comissão de Coordenação do Curso (CoC) de Biotecnologia da EACH/USP.
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01/2015
Conselhos, Comissões e Consultoria, USP Leste, Escola de Artes, Ciências e Humanidades.Cargo ou função, Membro titular da Congregação da EACH/USP - Representante dos Professores Doutores.
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01/2015
Conselhos, Comissões e Consultoria, USP Leste, Escola de Artes, Ciências e Humanidades.Cargo ou função, Coordenadora pró tempore da Comissão de Área de Computação (Comissão assessora da Congregação da EACH/USP)..
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12/2010 - 12/2013
Direção e administração, USP Leste.Cargo ou função, Coordenadora do Curso de Bacharelado em Sistemas de Informação.
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05/2006 - 05/2008
Direção e administração, USP Leste.Cargo ou função, Supervisora de Estágios - Curso de Bacharelado em Sistemas de Informação..
1998 - 1999
Tecnocoop SistemasVínculo: Prestador de Serviços, Enquadramento Funcional: Programador, Carga horária: 40
Atividades
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08/1998 - 11/1999
Serviços técnicos especializados , Petrobrás, Ep Bc.Serviço realizado, programador.
1997 - 1998
Universidade Estadual de MaringáVínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Professor colaborador, Carga horária: 20
Atividades
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03/1997 - 03/1998
Ensino, Ciência da Computação, Nível: GraduaçãoDisciplinas ministradas, Teoria da Computação, Grafos e Análise de Complexidade de Algoritmos
Criando um monitoramento
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