Simone Garcia Macambira

Pós-doutorado

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Projetos de pesquisa

• 2023 - Atual

  Caracterização da lesão no músculo esquelético induzida pelo veneno de Bothrops leucurus: perfil inflamatório, mecanismos de regeneração intrínseca e potencial terapêutico de células mesenquimais que superexpressam IGF1 sobre a musculatura esquelética les, Descrição: O músculo esquelético (ME) em condições basais apresenta pouca atividade regenerativa, mas submetido à injúria desencadeia respostas que favorecem a regeneração celular. O processo de reparo e regeneração do músculo esquelético consiste em várias fases interdependentes: inflamação, degeneração, regeneração, formação de fibrose e remodelamento. A regeneração e o remodelamento muscular compõem um processo que envolve mecanismos imunomodulatórios mediados por citocinas e fatores de crescimento liberados pelas células inflamatórias, células musculares e células tronco residentes do ME (células satélites). Entre as principais miocinas liberadas pelo ME envolvidas no crescimento e regeneração tecidual são o IGF1 e o TGF-1. Especificamente, o IGF1 estimula a síntese proteica, promovendo a ativação, diferenciação e hipertrofia das células musculares, mas também pode contribuir para fibrose. Esse processo inflamatório é basicamente o mesmo que se estabelece em lesões do ME de diferentes etiologias. As manifestações locais decorrentes do envenenamento botrópico são caracterizadas por dor e edema persistentes de instalação precoce, além de hemorragia e mionecrose. Tipicamente, caracteriza-se por apresentar um quadro inflamatório, com particularidades dependo do veneno, e necrose muscular persistente, com regeneração incompleta. Considerando que a neutralização dos efeitos locais é dificilmente obtida pela terapia disponível, é relevante investigar uma terapia eficaz para as lesões induzidas em músculo esquelético. Neste contexto, propõem-se no projeto investigar o potencial terapêutico das células mesenquimais (MSC) sobre a regeneração tecidual. As MSC são células multipotentes facilmente isoladas de diferentes tecidos com capacidade de auto-renovação e potencial de diferenciação. As MSC são reconhecidas pela sua capacidade de mediar a regeneração tecidual por mecanismo imunomodulatório, atribuído à ação parácrina. Assim, a modificação genética das MSC para superexpressão de fatores de crescimento com ação trófica ou imunomoduladora, dentre estes o IGF1, é uma estratégia terapêutica promissora. A capacidade regenerativa das MSC em lesões musculares tem sido investigada em modelo experimental de envenenamento por picada de cobra, porém os resultados ainda são controversos. Neste estudo, será utilizado o modelo de lesão muscular induzido por inoculação do veneno de serpente do gênero Bothrops na pata de camundongos machos C57Bl6 que serão tratados por injeção local de MSC e MSC com super expressão de IGF-1 nas fases aguda e crônica da lesão. Espera-se com este estudo caracterizar a nível imunológico, bioquímico funcional e histológico a lesão de ME induzida por Bothrops leucurus e elucidar o potencial terapêutico das MSC e MSC-IGF1 sobre a lesão de ME.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Simone Garcia Macambira - Coordenador / AZEVEDO, CARINE MACHADO - Integrante / Juliana F. Vasconcelos - Integrante / Cassio Santana meira - Integrante / Milena B. P. Soares - Integrante / CARDIM BARRETO, BRENO - Integrante / Luciana Lyra Casais e Silva - Integrante.

• 2021 - Atual

  IDENTIFICAÇÃO DE GENES DIFERENCIALMENTE EXPRESSOS EM PACIENTES COM SEPSE E A CORRELAÇÃO COM O PERFIL INFLAMATÓRIO: ANÁLISE IN SILICO DE POTENCIAIS BIOMARCADORES, Descrição: A sepse é um problema de saúde pública mundial e representa a principal causa de morbidade e mortalidade no mundo, em unidades de terapia intensiva não destinadas a pacientes cardiopatas. Apesar de toda a dedicação para uma investigação mais minuciosa para um diagnóstico e prognóstico rápido e preciso, nas últimas décadas continua sendo um desafio considerável e crescente aos cuidados de saúde. Neste contexto de desenvolvimento de ferramentas de diagnóstico rápidas, acessíveis e adequadas para melhorar a identificação, prevenção e tratamento da sepse, destaca-se o uso dos genes diferencialmente expressos como potenciais biomarcadores no diagnóstico e prognóstico da sepse. Portanto, o objetivo dessa pesquisa foi estudar o perfil de expressão dos genes e sua correlação com as vias intracelulares moduladas por citocinas e fatores de crescimento associadas à progressão e severidade da sepse. Foi feita uma pesquisa nos bancos de dados do NCBI e GEO e, posteriormente, selecionados três conjuntos de dados de sequenciamento, o GSE12624, GSE131761 e GSE69063. Serão escolhidos os genes diferencialmente expressos que possuíam um p-valor <0,05 e cuja expressão apresentar Fold Change (FC) menor que -1,1 ou maior que +1,1. Os genes serão analisados segundo o programa de enriquecimento de vias Enrichr para verificar se a expressão gênica dos indivíduos é consistente com a doença estudada. Será construída uma rede de interações entre os genes através do programa String. Através do diagrama de Venn serão identificados os genes em comum aos três estudos , estes genes serão analisados no String para construção de uma rede de interações entre os genes. Os genes serão avaliados quanto à sensibilidade e especificidade com base na intensidade de sinal de cada amostra através da ferramenta estatística SPSS 20.0. A análise in silico de genes como potenciais biomarcadores da sepse, rastreando os genes diferencialmente expressos permitirá uma associação destas moléculas à maior suscetibilidade à sepse e maior grau de severidade, bem como analisar a correlação dos GDE com a resposta inflamatória desta doença. Desta forma, este estudo contribuirá para o desenvolvimento futuro de uma ferramenta de diagnóstico e prognóstico para reduzir a morbimortalidade decorrente da sepse, atenuando o comprometimento funcional e estrutural de diversos órgãos, evitando a perda da qualidade de vida do paciente e diminuindo os custos com internações e aposentadorias precoces.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Simone Garcia Macambira - Coordenador / Lara Sousa Cruz de Oliveira - Integrante / Jaqueline França Costa - Integrante / Cláudio Firmino Dantas - Integrante.

• 2021 - Atual

  Avaliação da estrutura e função cardiovascular em pacientes com choque séptico através do Doppler vascular e Speckle tracking echocardiography e a correlação com os níveis séricos de mediadores inflamatórios., Descrição: A sepse é um importante problema de saúde pública e a principal causa de morbidade e mortalidade em unidades de terapia intensiva (UTIs) não cardiológicas, com elevadas taxas de letalidade, em torno de 50% , configurando-se um desafio para a equipe de saúde uma vez que seu reconhecimento precoce e instituição de tratamento adequados são fundamentais para um desfecho clínico satisfatório. Estudos têm demonstrado um aumento da incidência de sepse em UTI em todo o mundo e estima-se cerca de 17 milhões de casos anualmente [3]. Só nos Estados Unidos, o diagnóstico de sepse aumentou de 415 mil em 2003 para mais de 700 mil casos reportados em 2007, representando um incremento de 9,3 bilhões em 4 anos para custear o tratamento. O quadro da sepse é caracterizado por uma intensa vasodilatação periférica e, consequente redução da resistência vascular sistêmica e por alteração na atividade miocárdica quer seja por aumento do débito para compensar a redução da resistência vascular sistêmica ou por lesão direta ao miocárdio. Convencionou-se a utilização do score SOFA- Sequencial Organ Failure Assessment ? na identificação da síndrome. O sistema imunológico também exerce um papel fundamental no desenvolvimento do choque séptico. Moléculas inflamatórias sistêmicas atuam exacerbando o processo inflamatório e desencadeando uma cascata de citocinas de perfil Th1, orquestrada principalmente por TNF alfa e IL1 beta e IL8 que promovem alterações significativas na permeabilidade vascular colaborando com alterações na resistência vascular sistêmica. Para se compensar de maneira adequada a hemodinâmica é necessária uma monitorização que forneça parâmetros para que o profissional de saúde oferte, ao paciente, fluido ou substâncias vasopressoras. Os métodos mais utilizados são o cateter de Swan Ganz e o ecocardiograma transtorácico. O cateter de Swan Ganz é um método caro, invasivo e não inócuo. O ecocardiograma transtorácico é um exame difícil que exige aprendizagem maior e obtenção da imagem pode se tornar inviável por questões posicionais e anatômicas em UTI. Este projeto propõem avaliar a sensibilidade e a acurácia do uso do Doppler vascular, os níveis séricos de moléculas inflamatórias por ELISA e tensão cardíaca (cardiac strain) por Speckle tracking echocardiography na identificação precoce do choque séptico. É importante ressaltar que a utilização destes métodos não invasivos e de baixo custo poderão significar um avanço na terapêutica de pacientes críticos a risco e otimização do uso de fluidos já que poder-se-á ter uma inferência direta na identificação da redução da resistência vascular sistêmica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Simone Garcia Macambira - Coordenador / Cláudio Firmino Dantas - Integrante / Maurício Campos - Integrante.

• 2021 - Atual

  IDENTIFICAÇÃO DE microRNA DIFERENCIALMENTE EXPRESSOS EM PACIENTES COM DISFUNÇÃO CARDÍACA DECORRENTE DE SEPSE E A CORRELAÇÃO COM AS VIAS INTRACELULARES DE SINALIZAÇÃO: ANÁLISE IN SILICO DE POTENCIAIS BIOMARCADORES DE PROGNÓSTICO, Descrição: A sepse é uma condição clínica com elevado risco de vida, definida como uma disfunção orgânica decorrente de uma resposta desregulada do hospedeiro à infecção. Esta disfunção orgânica pode levar a incapacidade física e, até mesmo, à morte, sendo a disfunção cardíaca uma das principais complicações destes pacientes. A incidência e a mortalidade da sepse ainda são elevadas apontando a importância do uso de biomarcadores de alta sensibilidade ou especificidade no diagnóstico precoce e no prognóstico da sepse, melhorarando a eficácia da intervenção terapêutica. Nesse cenário os microRNA surgem como candidatos potenciais a biomarcadores. Diante desse contexto, o presente projeto visa estudar o perfil de expressão dos miRNA e sua correlação com as vias intracelulares envolvidas no remodelamento do miocárdio associado à disfunção cardíaca decorrente da sepse através de uma análise in silico. As análises de sequenciamento serão obtidas do repositório público do NCBI (www.nvbi.nlm.nih.gov/geodatasets/), Gene Expression Omnibus (GEO) e ou European Nucleotide Archives (https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/home). A partir deste levantamento serão selecionados os conjuntos de dados de sequenciamento. O ?Arquivo de Leitura das Sequências? (do inglês Sequence Read Archive - SRA) será então enviado para o programa Galaxy (usegalaxy.org). A qualidade da sequência será então avaliada usando os programas FASTQC e Trimmomatic. O alinhamento do genoma será realizado com o uso da ferramenta HISAT2. A montagem e identificação do genoma será realizado com os programas Stringtie e Stringtie Merge. Em seguida os RNA diferencialmente expressos (RDE) serão encontrados utilizando a ferramenta DESeq2. Os miRNA serão filtrados dentro dos RDE do transcriptoma. Serão considerados diferencialmente expressos apenas os miRNA (MDE) com valor de p<0,05 e cuja expressão apresentar Fold Change (FC) menor que -2,0 ou maior que +2,0. Dados clínicos referentes às amostras encontradas na plataforma utilizada na análise serão usados para correlacionar os resultados das análises de expressão com o grau de severidade da doença. Os MDE serão classificados utilizando-se a versão do miRBAse 22, onde estão catalogados miRNA precursores e maduros do genoma humano. Serão utilizados como parâmetros os miRNA classificados nesta ferramenta como de alta confiança, segundo critérios de mapeamento das reads e dados de sequenciamento. O perfil de expressão dos microRNA - Heatmap2 tool será utilizada para visualizar a matriz de expressão dos genes nos diferentes grupos. Serão avaliados a significância de expressão de miRNA, o agrupamento hierárquico, a expressão das sondas pela intensidade do sinal e os componentes principais para o agrupamento das amostras com base na expressão de microRNA. A análise dos genes alvos será após identificação dos MDE High Confidencecom a ferramenta de análise miRWalk 3.0 para verificar os mRNA alvos dos MDE. A construção da rede miRNA-mRNA (GDE-MDE) será no programa Cytoscape v.3.7.2. Os mRNA alvos do MDE serão analisados no programa Enrichr para verificar se a expressão gênica dos indivíduos é consistente com a doença estudada. A ontologia de genes será gerada a partir da expressão dos genes únicos utilizando a ferramenta Webgestalt .O agrupamento da rede será no Cytoscape. Os genes presentes no hub serão utilizados para análise de enriquecimento de vias categorizadas no GSEA e identificadas no KEEG. A análise de sensibilidade e especificidade dos miRNA na rede de genes hubs será SPSS 20.0. da curva ROC . A análise das vias dos miRNA com maior sensibilidade e especificidade será no miRPath. Espera-se contribuir para o desenvolvimento futuro de uma ferramenta de prognóstico para intervenção precoce no paciente com sepse, prevenindo a doença cardíaca e reduzindo a mortalidade.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Simone Garcia Macambira - Coordenador / Jaqueline França Costa - Integrante / Letícia Reis de Oliveira - Integrante / Cláudio Firmino Dantas - Integrante.

• 2021 - Atual

  IDENTIFICAÇÃO DE MECANISMOS MOLECULARES DESENCADEADOS NA FASE AGUDA ENVOLVIDOS NA CRONIFICAÇÃO DA DOENÇA DE CHAGAS, Descrição: A doença de Chagas é causada pela infecção do protozoário Trypanosoma cruzi. Por muitos anos, foi considerada uma doença tropical, mas devido à migração global, agora também afeta áreas não endêmicas, com mais de 500.000 portadores fora de áreas endêmicas. A fase aguda da doença é em sua maioria assintomática ou com sintomas inespecíficos leves. No entanto, a fase crônica, manifestada em quase 30% dos pacientes, leva à lesão tecidual, tornando a manifestação cardíaca a mais grave e letal. A cardiomiopatia chagásica crônica (CCC) é uma doença debilitante de curso fatal, tentando como única opção terapêutica definitiva para os indivíduos com insuficiência cardíaca severa o transplante cardíaco. Os mecanismos subjacentes à manifestação crônica ainda não são totalmente compreendidos. Assim, este estudo visa identificar os mecanismos moleculares envolvidos na fase aguda que levam à progressão da doença. Métodos: Transcriptomas de infecção aguda e crônica em camundongos serão adquiridos por meio do conjunto de dados GEO (NCBI). Os transcriptomas serão avaliados para genes diferencialmente expressos (DEG). DEGs de diferentes manifestações de doenças serão comparados para identificar processos moleculares únicos e semelhantes às fases aguda e crônica. Ontologias genéticas e análise de enriquecimento de vias serão conduzidas usando DEGs. Uma análise PPI será realizada em DEG e os resultados serão comparados com a interação hospedeiro-patógeno para entender melhor como o protozoário influencia os mecanismos moleculares da doença. Posteriormente, camundongos machos C57Bl6 serão infectados por tripomastigotas do T. cruzi da cepa Colombiana e submetidos a avaliação funcional, imunológica e por ensaios de biologia molecular. A função cardíaca será avaliada por ecocardiografia, eletrocardiografia e ergometria. A análise morfométrica avaliará inflamação e fibrose. A avaliação por ensaio de biologia molecular será por RTqPCR investigando a expressão gênica de citocinas e de moléculas proteicas definidas a partir da análise in silico. Resultados esperados: (i) determinar, através de análise in silico, os mecanismos moleculares desencadeados na fase aguda da doença associados às alterações cardíacas da fase crônica; (ii) validar os dados in silico em modelo experimental da CCC in vivo e (iii) propor alvos terapêuticos para prevenir e tratar a CCC.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Simone Garcia Macambira - Coordenador / Natália Machado Tavares - Integrante / Victor de Barros Serrano Neves - Integrante.

• 2020 - Atual

  ANÁLISE IN SILICO DE MICRORNAS E A CORRELAÇÃO COM VIAS INTRACELULARES ASSOCIADAS AO DESENVOLVIMENTO E CICATRIZAÇÃO DE ÚLCERAS CUTÂNEAS: UMA PROJEÇÃO ÀS ÚLCERAS FALCÊMICAS, Descrição: Introdução: A anemia falciforme é uma doença hematológica crônica, hereditária e autossômica recessiva. No Brasil, a anemia falciforme é um problema social e de saúde pública. As úlceras falciformes estão entre as complicações mais graves da anemia falciforme (AF). Até recentemente, as estratégias de tratamento para úlceras falciformes limitavam-se ao preparo do leito da ferida, remoção do tecido necrótico e controle da infecção. A investigação de biomarcadores para avaliar o grau de cicatrização da úlcera surge como uma terapia interessante para o controle do quadro. Objetivo: Analisar in sílico o perfil de expressão dos miRNA e sua correlação com as vias intracelulares associadas ao desenvolvimento e processo de cicatrização das úlceras cutâneas, para posterior projeção às úlceras falcêmicas.. Metodologia: Dados públicos de transcriptomas, código de acesso GEO de GSE121996 serão analisados. As amostras serão examinadas por meio de ferramentas de bioinformática por meio da plataforma Galaxy. Posteriormente, será realizada uma filtragem com base na razão entre o nível de expressão ?fold-change? e o p-valor ajustado < 0,05, a fim de identificar os microRNAs diferencialmente expressos (MDE). Os MDE serão classificados utilizando a versão do 22 miRBAse, onde estão catalogados miRNAs precursores e maduros do genoma murino. Serão utilizados como parâmetro os miRNAs classificados nesta ferramenta como de alta confiança (high confidence), segundo critérios de mapeamento das reads e dados de sequenciamento. Após identificação dos MDE high confidence, será utilizada a ferramenta de análise miRWalk 3.0 (http://mirwalk.umm.uni-heidelberg.de/) para verificar os mRNA alvos dos MDE. Será construída uma rede de interações entre GDE e MDE através do programa Cytoscape v.3.7.2. Os GDE serão analisados segundo o programa de enriquecimento de vias categorizada, Webgestalt (disponível em: http://www.webgestalt.org/) para identificar e verificar as vias metabólicas que estão com a expressão gênica aumentada ou diminuída nas comparações. A ontologia de genes será gerada a partir da expressão dos genes únicos utilizando a ferramenta Enrichr (disponível em: https://maayanlab.cloud/Enrichr/).. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Simone Garcia Macambira - Coordenador / Vitor Antônio Fortuna - Integrante / Rafael Souza de Almeida - Integrante.

• 2007 - 2009

  Cardiomioplastia celular pelo transplante de células tronco da medula óssea ou cardíacas no tratamento da cardiomiopatia chagásica crônica, Descrição: Investigação do potencial terapêutico das células-tronco cardíacas na cardiopatia chagásica crônica experimental, comparando ao tratamento com células mononucleares de medula óssea... , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Simone Garcia Macambira - Integrante / Milena Botelho Pereira Soares - Coordenador / Ricardo Ribeiro dos Santos - Integrante / Juliana Fraga Vascolos Senra - Integrante.

• 2007 - Atual

  Efeitos da administração de G-CSF e/ou Eritropoietina no tratamento doenfisema pulmonar, Descrição: baseado em dados da literatura que apontam o efeito regenerador do G-CSF em tecidos lesionados e da Eritropoietina sobre a angiogênese tecidual, decidimos avaliar o efeitos da administração deses dois fármacos mo modelo experimental de enfisema pulmonar induzido em camundongo C57Bl6 por administração intra-traqueal de elastase porcina. O modelo seráavaliado por ergometria com análise do cosnumo de oxigênio e produção de dióxido de carbono e, também será investigado o desenvolvimento de cor pulmonae por ecocardiografia e eletrocardiografia.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Simone Garcia Macambira - Coordenador / Milena Botelho Pereira Soares - Integrante / Ricardo Ribeiro dos Santos - Integrante.

Prêmios