Marcelo Zoccoler

graduation at Engenharia Elétrica from Universidade Estadual de Campinas (2010), master's at Modèles, Images et Instruments en Médecine et Biol from Université Joseph Fourier - Grenoble I (2011), master's at Electric Engineering from Universidade Estadual de Campinas (2014) and doctorate at Engineering from Universidade Estadual de Campinas (2019). , acting on the following subjects: biophysics, electroporation, myocytes, fluorescent dye, membrane repair and microtubule associated proteins.

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Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Doutorado em Engenharia Elétrica

2014 - 2019

Universidade Estadual de Campinas
Título: Estudo do Dano e Recuperação de Cardiomiócitos Isolados Causado por Campo Elétrico
Pedro Xavier de Oliveira. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Eletroporação; cardiomiócitos; Separação Cega de Fontes; Fluorescência; Exocitose; Cálcio. Grande área: Engenharias

Mestrado em Engenharia Elétrica

2012 - 2014

Universidade Estadual de Campinas
Título: Estudo Espaço-temporal da Concentração de Cálcio Citosólico de Miócitos Cardíacos Isolados Expostos a Campos Elétricos de Alta Intensidade,Ano de Obtenção: 2014
Pedro Xavier de Oliveira.Bolsista do(a): Fundo de Apoio ao Ensino, à Pesquisa e à Extensão, FAEPEX, Brasil. Palavras-chave: cardiomiócitos; desfibrilação; campo elétrico; Cálcio; Fluorescência.Grande área: Engenharias

Mestrado em Modèles, Images et Instruments en Médecine et Biol

2010 - 2011

Université Joseph Fourier - Grenoble I
Título: Microtubule associated proteins modify the mechanical properties of single microtubules,Ano de Obtenção: 2011
Orientador: Jean-Louis Martiel
Palavras-chave: Mechanical Properties; Microtubule; Microtubule Associated Proteins.Grande área: EngenhariasSetores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico.

Graduação em Engenharia Elétrica

2005 - 2010

Universidade Estadual de Campinas

Ensino Médio (2º grau)

2002 - 2005

Colégio Reino de Educação Básica

Formação complementar

2016 - 2016

Statistics in Medicine (online course). , Stanford University, STANFORD, Estados Unidos.

2013 - 2013

Writing in the Sciences (online course). , Stanford University, STANFORD, Estados Unidos.

Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Francês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Participação em eventos

XLIV Congresso Anual da SBBf. 2019. (Congresso).

Unicamp de Portas Abertas (UPA). Introducing the Biomedical Engineering Area for High School students. 2018. (Feira).

CSAP - Ciclo de Seminários de Alunos e Professores do Departamento de Engenharia Biomédica.Software para análise do sinal de fluorescência próximo à borda da membrana. 2017. (Seminário).

Workshop sobre Microscopia de Luz. 2017. (Oficina).

CSAP - Ciclo de Seminários de Alunos e Professores do Departamento de Engenharia Biomédica.Recuperação de cardiomiócitos à eletroporação. 2016. (Seminário).

Unicamp de Portas Abertas (UPA). Introducing the Biomedical Engineering Area for High School students. 2016. (Feira).

XXV Brazilian Congress on Biomedical Engineering. Software para monitoramento de encurtamento celular por detecção de borda. 2016. (Congresso).

III Workshop on Cellular Electrophysiology.Canais de Na+ dependentes de voltagem. 2015. (Oficina).

Unicamp de Portas Abertas (UPA). Introducing the Biomedical Engineering Area for High School students. 2015. (Feira).

Workshop How to Write for and Get Published in Scientific Journals. 2015. (Oficina).

World Congress on Medical Physics & Biomedical Engineering. Microfluorimetry System Instrumentation for Ca2+-Associated Fluorescence Imaging of Cardiomyocytes in Response to High Electric Fields. 2015. (Congresso).

CSAP - Ciclo de Seminários de Alunos e Professores do Departamento de Engenharia Biomédica (UNICAMP).Análise de Imagens de Fluorescência Associada a Ca2+ de Miócitos Cardíacos Através de ROIs Automaticamente Geradas por Detecção Morfológica de Borda. 2014. (Seminário).

XXIV Brazilian Congress on Biomedical Engineering (CBEB). 2014. (Congresso).

CSAP - Ciclo de Seminários de Alunos e Professores do Departamento de Engenharia Biomédica (UNICAMP).Estudo Espaço-temporal da [Ca2+] Citosólico de Miócitos Cardíacos Isolados Expostos a Campos Elétricos de Alta Intensidade. 2013. (Seminário).

4 Workshop Leica em Microscopia Widefield e Confocal. 2012. (Oficina).

SEMICOM. 2010. (Encontro).

Produções bibliográficas

  • ZOCCOLER, M. ; OLIVEIRA, P. X. . METROID: an automated method for robust quantification of subcellular fluorescence events at low SNR. BMC BIOINFORMATICS , v. 21, p. 1-26, 2020.

  • DE FREITAS, JOSÉ AMÉRICO NABUCO LEVA FERREIRA ; DOS SANTOS COSTA LEOMIL, FERNANDA ; ZOCCOLER, MARCELO ; ANTONELI, PRISCILA CORREIA ; DE OLIVEIRA, PEDRO XAVIER . Cardiomyocyte lethality by multidirectional stimuli. MEDICAL & BIOLOGICAL ENGINEERING & COMPUTING , v. 1, p. 1, 2018.

  • PRADO, LUIZA'N.'S. ; GOULART, JAIR'T. ; ZOCCOLER, MARCELO ; OLIVEIRA, PEDRO'X. . Ventricular myocyte injury by high-intensity electric field: Effect ofpulse duration. General physiology and biophysics , v. 35, p. 121-130, 2016.

  • PORTRAN, D. ; ZOCCOLER, M. ; GAILLARD, J. ; STOPPIN-MELLET, V. ; NEUMANN, E. ; ARNAL, I. ; MARTIEL, J. L. ; VANTARD, M. . MAP65/Ase1 promote microtubule flexibility. Molecular Biology of the Cell (Cessou em 2007. Cont. ISSN 1939-4586 Molecular Biology of the Cell (Online)) , v. 24, p. 1964-1973, 2013.

  • ZOCCOLER, M. ; OLIVEIRA, P. X. . Software para monitoramento de encurtamento celular por detecção de borda. In: XXV Brazilian Congress on Biomedical Engineering, 2016, Foz do Iguaçu. Anais do XXV CBEB 2016. Foz do Iguaçu, 2016. p. 1231-1234.

  • ZOCCOLER, M. ; OLIVEIRA, P. X. . Microfluorimetry System Instrumentation for Ca2+-Associated Fluorescence Imaging of Cardiomyocytes in Response to High Electric Fields. In: World Congress on Medical Physics & Biomedical Engineering, 2015, Toronto. IFMBE Proceedings. Cham: Springer, 2015. v. 51. p. 1309-1312.

  • ZOCCOLER, M. ; OLIVEIRA, P. X. . Microfluorimetry System Instrumentation for Ca2+-Associated Fluorescence Imaging of Cardiomyocytes in Response to High Electric Fields. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Outras produções

GOULART, JAIR'T. ; ZOCCOLER, MARCELO . Minicurso: Métodos de registro e quantificação do transporte de Ca2+ intracelular. 2020. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

ZOCCOLER, MARCELO . Workshop de Análise de Imagens com ImageJ. 2019. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

Projetos de pesquisa

  • 2016 - Atual

    Modelagem matemática multi-escala do sistema neuromuscular para o estudo da influência da Esclerose Lateral Amiotrófica no controle da força muscular (UNIVERSAL/CNPq 2016 - Proc. no. 409302/2016-3 | FAEPEX - Proc. nos. 1483/14 e 3286/16), Descrição: A modelagem matemática e a simulação computacional têm sido utilizadas para estudar o funcionamento do sistema neuromuscular humano e têm auxiliado no entendimento dos mecanismos neurofisiológicos e biomecânicos por trás do controle do movimento. A vantagem desta abordagem é que, por meio de modelos matemáticos multi-escala, pode-se estudar como mecanismos que operam em um nível celular e/ou molecular podem influenciar os comportamentos motores observados em escalas macroscópicas, como por exemplo, a geração da força muscular e do eletromiograma. Poucos estudos têm utilizado esta abordagem (baseada em Neurociência Computacional) para investigar como o funcionamento do sistema neuromuscular é alterado quando este está sujeito a patologias neurodegenerativas. Especificamente, no caso da esclerose lateral amiotrófica (ELA) existem modelos matemáticos de neurônios motores individuais que representam as características dinâmicas de células individuais obtidas de modelos animais da ELA. No entanto, não é de nosso conhecimento nenhum modelo que tenha investigado como as características de neurônios motores individuais com dinâmicas tipicamente encontradas em modelos animais da ELA influenciam o controle da força de um dado músculo ou grupo muscular. Neste sentido, este projeto tem por objetivo desenvolver um modelo matemático multi-escala e biologicamente plausível do sistema neuromuscular que permita avaliar como alterações neuromotoras típicas da ELA irão influenciar a geração da força e do eletromiograma muscular. Com isso pretende-se entender de um ponto de vista teórico/conceitual quais mecanismos desta patologia neurodegenerativa têm maior influência no controle motor humano. O modelo será desenvolvido em plataformas de software livre e ficará disponível gratuitamente na internet para que outros grupos possam simulá-lo e aperfeiçoá-lo, tornando-se assim a primeira plataforma de simulação do sistema neuromuscular para estudo da influência de uma patologia neurodegenerativa no controle motor.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcelo Zoccoler - Coordenador / André Fabio Kohn - Integrante / Renato Naville Watanabe - Integrante / Francesco Negro - Integrante / Débora Elisa da Costa Matoso - Integrante / Ali Salim Faraj Silva - Integrante / Heitor Sanchez Fernandes - Integrante / Ricardo Gonçalves Molinari - Integrante / Felipe Costa Garcia - Integrante / Leonardo Abdala Elias - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Desenvolvimento da UNICAMP - Auxílio financeiro.

Projetos de desenvolvimento

  • 2008 - 2009

    Desenvolvimento de Programas para um Sistema de Caracterização de Transdutores Ultra-sônicos, Descrição: Elaboração de programas para o controle de varredura em frequência de um analisador de impedâncias através de uma interface GPIB/USB. Elaboração de programas para mapeamento de campo acústico num tanque de água através da captura e armazenagem de pulsos ultra-sônicos emitidos por um transdutor sob teste, também utilizando a mesma interface.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Marcelo Zoccoler - Integrante / Vera Lucia da Silveira Nantes Button - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

  • 2008 - 2009

    Desenvolvimento de Programas para um Sistema de Caracterização de Transdutores Ultra-sônicos, Descrição: Elaboração de programas para o controle de varredura em frequência de um analisador de impedâncias através de uma interface GPIB/USB. Elaboração de programas para mapeamento de campo acústico num tanque de água através da captura e armazenagem de pulsos ultra-sônicos emitidos por um transdutor sob teste, também utilizando a mesma interface.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Marcelo Zoccoler - Integrante / Vera Lucia da Silveira Nantes Button - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

  • 2008 - 2009

    Desenvolvimento de Programas para um Sistema de Caracterização de Transdutores Ultra-sônicos, Descrição: Elaboração de programas para o controle de varredura em frequência de um analisador de impedâncias através de uma interface GPIB/USB. Elaboração de programas para mapeamento de campo acústico num tanque de água através da captura e armazenagem de pulsos ultra-sônicos emitidos por um transdutor sob teste, também utilizando a mesma interface.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Marcelo Zoccoler - Integrante / Vera Lucia da Silveira Nantes Button - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

  • 2008 - 2009

    Desenvolvimento de Programas para um Sistema de Caracterização de Transdutores Ultra-sônicos, Descrição: Elaboração de programas para o controle de varredura em frequência de um analisador de impedâncias através de uma interface GPIB/USB. Elaboração de programas para mapeamento de campo acústico num tanque de água através da captura e armazenagem de pulsos ultra-sônicos emitidos por um transdutor sob teste, também utilizando a mesma interface.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Marcelo Zoccoler - Integrante / Vera Lucia da Silveira Nantes Button - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

  • 2008 - 2009

    Desenvolvimento de Programas para um Sistema de Caracterização de Transdutores Ultra-sônicos, Descrição: Elaboração de programas para o controle de varredura em frequência de um analisador de impedâncias através de uma interface GPIB/USB. Elaboração de programas para mapeamento de campo acústico num tanque de água através da captura e armazenagem de pulsos ultra-sônicos emitidos por um transdutor sob teste, também utilizando a mesma interface.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Marcelo Zoccoler - Integrante / Vera Lucia da Silveira Nantes Button - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

  • 2008 - 2009

    Desenvolvimento de Programas para um Sistema de Caracterização de Transdutores Ultra-sônicos, Descrição: Elaboração de programas para o controle de varredura em frequência de um analisador de impedâncias através de uma interface GPIB/USB. Elaboração de programas para mapeamento de campo acústico num tanque de água através da captura e armazenagem de pulsos ultra-sônicos emitidos por um transdutor sob teste, também utilizando a mesma interface.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Marcelo Zoccoler - Integrante / Vera Lucia da Silveira Nantes Button - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

  • 2008 - 2009

    Desenvolvimento de Programas para um Sistema de Caracterização de Transdutores Ultra-sônicos, Descrição: Elaboração de programas para o controle de varredura em frequência de um analisador de impedâncias através de uma interface GPIB/USB. Elaboração de programas para mapeamento de campo acústico num tanque de água através da captura e armazenagem de pulsos ultra-sônicos emitidos por um transdutor sob teste, também utilizando a mesma interface.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Marcelo Zoccoler - Integrante / Vera Lucia da Silveira Nantes Button - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

  • 2008 - 2009

    Desenvolvimento de Programas para um Sistema de Caracterização de Transdutores Ultra-sônicos, Descrição: Elaboração de programas para o controle de varredura em frequência de um analisador de impedâncias através de uma interface GPIB/USB. Elaboração de programas para mapeamento de campo acústico num tanque de água através da captura e armazenagem de pulsos ultra-sônicos emitidos por um transdutor sob teste, também utilizando a mesma interface.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Marcelo Zoccoler - Integrante / Vera Lucia da Silveira Nantes Button - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

Histórico profissional

Experiência profissional

2011 - 2011

Commissariat à l?énergie atomique et aux énergies alternatives

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Estagiário / Pesquisador, Carga horária: 35, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

  • 02/2011 - 08/2011

    Estágios , iRTSV/LPCV.,Estágio realizado, Análise de Imagens e Modelagem de Fenômenos Celulares.

2010 - 2010

Daitan Group

Vínculo: Funcionário, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 29

Atividades

  • 01/2010 - 07/2010

    Estágios , Daitan Group.,Estágio realizado, Manutenção do sistema e testes de programas.