Ariane Machado Lima

2021

Livre-docência. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Título: Reconhecimento de Padrões em Bioinformática e Informática Médica, Ano de obtenção: 2021.

2007 - 2009

Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra, Grande Área: Ciências da Saúde / Área: Medicina / Subárea: Psiquiatria.

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática.

PEREIRA, C. A. B. ; ARMELIN, H. A. ; CESAR JR., R. M. ; REIS, E. M. R. ; MACHADO-LIMA, A. ; Nakano, F. ; OLIVEIRA, G. C. ; SANTOS, R. M. Z. ; SOUZA, O. N. ; BRANDAO, M. M. ; DURHAM, A.M. ; MENOSSI, M. ; BARRERA, J. ; FALCAO, P. R. K. . X-meeting 2007 - terceira reunião da Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional. 2007. (Congresso).

Congresso Iberoamericano de Reconhecimento de Padrões. 2010. (Congresso).

I Escola Brasileira de Bioinformática.RNAs não codificantes em transtornos neuropsiquiátricos e envelhecimento cerebral. 2008. (Outra).

III Brazilian Symposium on Bioinformatics. 2008. (Simpósio).

IX Simpósio Nacional de Biologia Molecular Aplicada à Medicina. 2008. (Simpósio).

Bayesianismo: Fundamentos e Aplicações. 2007. (Oficina).

VII CTOC - Consórcio Brasileiro de Pesquisas sobre Transtorno Obsessivo-Compulsivo.Bioinformática em Psiquiatria. 2007. (Encontro).

X-meeting. TERP: TElomerase RNA Predictor. 2007. (Congresso).

X-meeting. Molecular Markers Identified by Statistical Methods Using Serial Analysis of Gene Expression and Public Microarray Data. 2007. (Congresso).

Intelligent Systems for Molecular Biology. Telomerase RNA searching using an Infernal-based pipeline. 2006. (Congresso).

II International Conference on Bioinformatics and Computational Biology. RNA Modeling with Stochastic Context Free Grammars. 2004. (Congresso).

II International Conference on Bioinformatics and Computational Biology. Plasmodium vivax: towards a global study of virulence in natural infections. 2004. (Congresso).

II International Conference on Bioinformatics and Computational Biology. Splice site prediction using grammar inference. 2004. (Congresso).

I International Conference on Bioinformatics and Computational Biology. A Framework for Generation of Sequence Classifiers. 2003. (Congresso).

6th Brazilian School of Probability.Laboratory for automatic generation of classifiers for sequences. 2002. (Outra).

MACHADO-LIMA, A.; NAKAMURA, R.; MARTINS JR., D. C.. Técnicas de normalização de características geométricas e uso de características de textura no auxílio ao diagnóstico do transtorno do espectro autista baseado em imagens faciais. 2024. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

RAMOS, A. F.; ALENCAR, A. P.;MACHADO-LIMA, A.ANDRIOLI, L. P.. "Análise da intensidade de fluorescência do mRNA de um embrião durante o alongamento da transcrição. 2023. Dissertação (Mestrado em MODELAGEM DE SISTEMAS COMPLEXOS) - Universidade de São Paulo.

MACHADO-LIMA, A.; GALHARDO, R. S.; GUIMARAES, A. M. S.; ALVES, J. M. P.. Análise do pangenoma de Clostridium scindens. 2023. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro) - Universidade de São Paulo.

VIBRANOVSKI, M. D.;MACHADO-LIMA, A.; MARTINS, C.; CARVALHO, A. B.. Desenho de sondas oligopaint de cópia única e repetitiva para o estudo de cromossomos neo-sexuais em Drosophila miranda. 2023. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

VIBRANOVSKI, M. D.;MACHADO-LIMA, A.; LOURENCO, M. B.; KOERICH, L. B.. Pipeline OligoY para desenho de sondas oligopaint do cromossomo Y incluindo sequências repetitivas. 2022. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

HONORIO, K. M.; ALMEIDA, F. N.; SALINAS, R. K.;MACHADO-LIMA, A.. Aplicação de ontologias em estudos de química medicinal computacional e relações entre estrutura química e atividade biológica. 2020. Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade de São Paulo.

PARABONI, I.;MACHADO-LIMA, A.; FERREIRA, F. F.; CARVALHO, A. M. B. R.. Reconhecimento de traços de personalidade com base em textos. 2018. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

MACHADO-LIMA, A.; MARTINS JR., D. C.; SALVINI, R. L.; PARABONI, I.. Caracterização de etnias, sexos e faixas etárias em imagens faciais.. 2018. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

FANTINATO, M.; GOUVEA, M. A.; AZEVEDO, L. G.;MACHADO-LIMA, A.. Aplicação de algoritmos genéticos em mineração de processos não estruturados. 2018. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

DIGIAMPIETRI, L.A.MACHADO-LIMA, A.; FUJITA, A.; OIKAWA, M. K.. Uma nova abordagem para identificação da provável origem de genes exclusivos de bactérias. 2018. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

MACHADO-LIMA, A.; TAHIRA, A. C.; CERRI, R.. Métodos de validação tradicional e temporal aplicados à avaliação de classificadores de RNAs codificantes e não codificantes. 2018. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

MACHADO-LIMA, A.; MONTEIRO, C. B. M.; HIRATA, R. Jr; OLIVEIRA, L. L. G.. Classificação de imagens faciais para o auxílio ao diagnóstico do transtorno do espectro autista. 2018. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

OLIVEIRA, P. R.; FRANCA, F. O.; FERREIRA, F. F.;MACHADO-LIMA, A.. Técnicas de transferência de aprendizagem aplicadas a modelos QSAR para regressão. 2018. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

DOMINGUES, D. S.; PEREIRA, L. F. P.;MACHADO-LIMA, A.. Análise Bioinformática de RNAs não codificantes no genoma de Coffea canephora. 2018. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Bioinformática) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná.

BERNARDES, J. L.;MACHADO-LIMA, A.; BOSCARIOLI, C.; SILVA, L. A.. Segmentação automática de expressões faciais gramaticais com multilayer perceptrons e misturas de especialistas. 2018. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

MACHADO-LIMA, A.; LAURETTO, M. S.; ROZANTE, L. C. S.; CASTRO JUNIOR, A. A.. Analisador sintático de Earley para gramáticas livres de contexto adaptativas e sua aplicação na caracterização de famílias de RNAs com pseudonós. 2018. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

DIGIAMPIETRI, L.A.MACHADO, Ariane L; FUJITA, A.; OIKAWA, M.. Reconstrução filogenética de procariotos com base em famílias de genes homólogos. 2017. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

NUNES, F. L. S.Machado-Lima, Ariane; NAKAMURA, R.; FERREIRA, D. J.. Segmentação semiautomática de conjuntos completos de imagens do ventrículo esquerdo. 2017. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

MACHADO-LIMA, A.DIGIAMPIETRI, L.A.; TORRES, T. T.. Predição computacional de sítios de ligação de fatores de transcrição baseada em gramáticas regulares estocásticas. 2017. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

FAVERO, P. B.; GAZZIRO, M. A.;MACHADO-LIMA, A.. Estudo comparativo entre algoritmos de árvores de decisão baseados em ensembles de classificadores aplicados a Big Data. 2017. Dissertação (Mestrado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC.

MENA-CHALCO, J. P.;MACHADO-LIMA, A.DIGIAMPIETRI, L.A.. Análise de tendências em redes sociais acadêmicas. 2015. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

MACHADO-LIMA, A.; PEDRINI, H.;DIGIAMPIETRI, L.A.; HASHIMOTO, R. F.. Geração de caricaturas para representação de emoções usando processamento de imagens faciasi e grafos And-Or. 2015. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

HONORIO, K. M.; LORENA, A. C.;MACHADO-LIMA, A.. Emprego de técnicas de análise exploratória de dados utilizados em Química Medicinal. 2013. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

MACHADO-LIMA, A.; REIS, E. M. R.;DIGIAMPIETRI, L.A.. SIMTar: uma ferramenta para predição de SNPs interferindo em sítios alvos de microRNAs. 2013. Dissertação (Mestrado em Interunidades em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

BISCARO, H. H.; JOSE NETO, J.;MACHADO-LIMA, A.. Inferência de Gramáticas Estocásticas para Reconhecimento de Padrões em Imagens Utilizando Quadtrees. 2013. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

SILVA, A. M.; ALMEIDA JR, N.; GALHARDO, R. S.;MACHADO-LIMA, A.. ANÁLISE COMPARATIVA E FUNCIONAL DE PRÓFAGOS IDENTIFICADOS EM PSEUDOMONAS AERUGINOSA. 2024. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

NISHIJIMA, M.;Machado-Lima, Ariane; SARTI, F. M.; OSORIO, F. S.; MARCACINI, R. M.. Aprendizado de Máquina para Previsão de Sucesso Financeiro de Filme Multimídia. 2023. Tese (Doutorado em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo.

GALANTE, P. A. F.;Machado-Lima, Ariane; ACHATZ, M. I. W.; SILVA, I. T.. Genes colocalizados: estudo de mútua regulação de biogênese entre genes codificadores e não codificadores. 2022. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

JOSE NETO, J.; RAMOS, M. V. M.; PARIENTE, C. A. B.;MACHADO-LIMA, A.; ROCHA, R. L. A.. Um método adaptativo para análise sintática do Português Brasileiro. 2022. Tese (Doutorado em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo.

NETO, J. J.; SILVA, P. S. M.; VEGA, I. S.;Machado-Lima, Ariane; PISTORI, H.. Concepção e modelagem de sistemas de software adaptativos. 2022. Tese (Doutorado em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo.

NUNES, F. L. S.; BRANDAO, A. A. F.;MACHADO-LIMA, A.; HANNS, D. K.; RAPOSO, A. B.. Uma abordagem para visualização tridimensional interativa de dados temporais baseada em atenção visual e aprendizado de máquina. 2020. Tese (Doutorado em Engenharia Mineral) - Universidade de São Paulo.

BRENTANI, H. P.; FACHEL, A. A.;MACHADO-LIMA, A.; VALLADA FILHO, H. P.. Estudo de componentes de vulnerabilidade genética no transtorno do espectro autista. 2019. Tese (Doutorado em Psiquiatria) - Universidade de São Paulo.

MACHADO-LIMA, A.NUNES, F. L. S.; MASCHIETTO, M.; SILVA, I. T.; GIORDANO, R.. Incorporação de evidências biológicas para a identificação de SNPs interferindo em sítios alvos de miRNAs. 2018. Tese (Doutorado em Programa Interunidades em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

VERJOVSKI-ALMEIDA, S.; VASQUES, L. R.; PASSETTI, F.;MACHADO-LIMA, A.; LOPES, F. M.. Caracterização in silico e análise de expressão de RNAs não codificadores longos no genoma de eucariotos. 2013. Tese (Doutorado em Programa Interunidades em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

SOUZA, S. J.; MALNIC, B.;MACHADO-LIMA, A.BRENTANI, H.; PAPPAS GJ Jr. Explorando a Complexidade do Transcriptoma Humano. 2013. Tese (Doutorado em Programa Interunidades em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

SOUZA, S. J.; OLIVEIRA, C. C.;MACHADO-LIMA, A.; NETO, E. D.;DURHAM, A.M.. Estudo da poliadenilação alternativa: Efeito dos polimorfismos nos elementos em cis no RNA e de transcritos em antissenso. 2012. Tese (Doutorado em Programa Interunidades em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

MACHADO-LIMA, A.CARRARO, D. M.; NETO, E. D.; VERJOVSKI-ALMEIDA, S.;BRENTANI, H. P.. Busca de marcadores moleculares tecido-associados em regiões transcritas não caracterizadas do genoma huma. 2009. Tese (Doutorado em Oncologia) - Hospital A. C. Camargo.

SOUZA, S. J.; SILVA, A. M.; MEYER, D.;CARRARO, D. M.MACHADO-LIMA, A.. Identificação in-silico de genes humanos submetidos à expressão alélica diferencial. 2008. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

PERES, S. M.; CAPOVILLA, F. C.;MACHADO-LIMA, A.DIGIAMPIETRI, L.A.. Framework para reconhecimento automático de língua de sinais com base nos parâmetros descritos em signwriting. 2022. Exame de qualificação (Doutorando em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo.

NISHIJIMA, M.; MARCACINI, R. M.; PIRES, R.;MACHADO-LIMA, A.. Multimodal Machine Learning for Movie Success Prediction. 2022. Exame de qualificação (Doutorando em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo.

ARAUJO, L. V.;MACHADO-LIMA, A.; NISHIJIMA, M.; GONCALVES, A. L. M.. Segurança cibernética: arquitetura dinâmica para identificação e priorização do tratamento de ataques cibernéticos em ambientes com mudança de comportamento no fluxo de dados de rede. 2022. Exame de qualificação (Doutorando em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo.

DIGIAMPIETRI, L.A.MACHADO-LIMA, A.; MORANDINI, M.; VELLOSO, L. M. R.. Avaliação de experiência do usuário em ambientes tridimensionais por meio de reconhecimento facial de emoções. 2021. Exame de qualificação (Doutorando em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo.

MACHADO-LIMA, A.; MOUREIRA-FILHO, C. A.; HOEXTER, M. Q.. Estudo da dosagem gênica na contribuição em fenótipos de transtornos do espectro do autismo. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Psiquiatria) - Universidade de São Paulo.

PEREIRA, C. A. B.; NAKAYA, H.;MACHADO-LIMA, A.. Function Prediction of Transcription Start Site Associated RNAs (TSSaRNAs) in Halobacterium salinarum NRC-1. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

GALANTE, P. A. F.;MACHADO-LIMA, A.; REIS, E. M. R.. Estudo dos Piwi-interacting RNAs (piRNAs) em primatas e roedores. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

DIGIAMPIETRI, L.A.MACHADO-LIMA, A.; SILVA, A. M.. Um arcabouço focado em genômica comparativa de bactérias semelhantes. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Programa Interunidades em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

REIS, E. M. R.; NETO, E. D.;MACHADO-LIMA, A.. Um novo método baseado em expressões regulares para a análise de eventos de splicing alternativo. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

MACHADO-LIMA, A.; HIRATA, R. Jr;SEVERINO, P.. Caracterização de RNA não codificante em Apis mellifera (abelha) e Nasonia Vitripennis (vespa). 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

CARRER, H.;MACHADO-LIMA, A.; VASQUES, L. R.. Caracterização in silico e análise de expressão de transcritos intrônicos não-codificadores expressos no genoma humano. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

SILVA, A. M.; OLIVEIRA, P. S. L.;MACHADO-LIMA, A.. Estudo da poliadenilação alternativa: Efeito dos polimorfismos nos elementos em cis no RNA e de transcritos em antisense. 2009. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

NUNES, F. L. S.; CORREA, C. G.;MACHADO-LIMA, A.. APLICAÇÃO DE PROCESSAMENTO DE IMAGENS E APRENDIZADO DE MÁQUINA NA SEGMENTAÇÃO E CLASSIFICAÇÃO DE CÁRIES EM IMAGENS DE TOMOGRAFIA COMPUTADORIZADA DE FEIXE CÔNICO. 2024. Exame de qualificação (Mestrando em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo.

MORANDINI, M.;MACHADO-LIMA, A.; ROMAN, N. T.. Automatic UX evaluation based on facial emotion recognition. 2023 - Universidade de São Paulo.

ROMAN, N. T.;MACHADO-LIMA, A.; LIMA, C. A. M.. Identificação da Necessidade de Transplante de Células Tronco em Pacientes Portadores da Doença de Crohn: Uma Abordagem de Aprendizado de Máquina. 2023. Exame de qualificação (Mestrando em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo.

PARABONI, I.;MACHADO-LIMA, A.; ROMAN, N. T.. Detecção de risco precoce de transtornos de saúde mental a partir de publicações em redes sociais.. 2023. Exame de qualificação (Mestrando em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo.

PARABONI, I.;MACHADO-LIMA, A.; ROMAN, N. T.. Detecção de risco precoce de transtornos de saúde mental a partir de publicações em redes sociais.. 2023. Exame de qualificação (Mestrando em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo.

RAMOS, A. F.;ANDRIOLI, L. P.Machado-Lima, Ariane. Análise da intensidade de fluorescência do mRNA de um embrião durante a elongação da transcrição. 2022. Exame de qualificação (Mestrando em MODELAGEM DE SISTEMAS COMPLEXOS) - Universidade de São Paulo.

Machado-Lima, Ariane; FARIA, R. R. A.; ROMAN, N. T.. Alinhamento de emoções de diálogos em português brasileiro por meio da análise acústica: uma aplicação em psicoterapia. 2022. Exame de qualificação (Mestrando em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo.

Machado-Lima, Ariane; CHAIM, M. L.; SILVA, A. R.. A multilabel algorithm recommendation system based on label correlations. 2022. Exame de qualificação (Mestrando em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo.

RAMOS, A. F.;ANDRIOLI, L. P.MACHADO-LIMA, A.. Análise da intensidade de fluorescência do mRNA de um embrião durante a elongação da transcrição (reapresentação). 2022. Exame de qualificação (Mestrando em MODELAGEM DE SISTEMAS COMPLEXOS) - Universidade de São Paulo.

RAMOS, A. F.;ANDRIOLI, L. P.MACHADO-LIMA, A.. Análise da intensidade de fluorescência do mRNA de um embrião durante a elongação da transcrição. 2022. Exame de qualificação (Mestrando em MODELAGEM DE SISTEMAS COMPLEXOS) - Universidade de São Paulo.

VIBRANOVSKI, M. D.;MACHADO-LIMA, A.; TORRES, T. T.. Evolução da inativação meiótica do cromossomo X em Drosophila. 2021. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

FREIRE, A. S.; FERNANDES, C. G.;MACHADO-LIMA, A.. Técnicas de programação linear inteira aplicadas ao problema de busca de motifs em redes biológicas. 2021. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

LIMA, K. R. P. S.;Machado-Lima, Ariane; CORDEIRO, D. A.. Abordagem de otimização combinatória para o problema de caminhos tropicais em grafos. 2021. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

MACHADO-LIMA, A.; PREDINI, H.;KASHIWABARA, A. Y.. Abordagem computacional para quantificação de similaridade entre sequências emocionais a partir de expressões faciais e sua aplicação na análise de sessões de psicoterapia. 2021. Exame de qualificação (Mestrando em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo.

BRENTANI, H.; MARTINS JR., D. C.;MACHADO-LIMA, A.. Comparação de redes de co-expressão gênica em circuitos neurais relacionados ao Transtorno Obsessivo Compulsivo. 2021. Exame de qualificação (Mestrando em Interunidades em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

PARABONI, I.;Machado-Lima, Ariane; ROMAN, N. T.. Expansão de córpus para detecção de posicionamentos em textos. 2021. Exame de qualificação (Mestrando em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo.

Machado-Lima, Ariane; ARAUJO, L. V.; BISCARO, H. H.. Técnicas de normalização de características geométricas e uso de características de textura no auxílio ao diagnóstico baseado em imagens. 2021. Exame de qualificação (Mestrando em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo.

PARABONI, I.; DELGADO, K. V.;MACHADO-LIMA, A.. Classificação de personalidade a partir de textos segundo a Tipologia de Myers-Briggs. 2020. Exame de qualificação (Mestrando em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo.

MACHADO-LIMA, A.; MONESI, N.; LAURETTO, M. S.. Plataforma computacional de seleção de modelos para predição de sítios de ligação de fatores de transcrição: um estudo de caso em Drosophila melanogaster. 2020. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

NISHIJIMA, M.; BALLINI, R.;Machado-Lima, Ariane. Os efeitos de streaming sobre o mercado de cinema dos Estados Unidos. 2020. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

CORCHS, F. D. F.; ZAMIGNANI, D. R.;MACHADO-LIMA, A.. Métodos de análise computacional na pesquisa de processo em psicoterapia: uma revisão sistemática de escopo. 2020. Exame de qualificação (Mestrando em Neurociências e Comportamento) - Universidade de São Paulo.

NUNES, F. L. S.; ARAUJO, L. V.;MACHADO-LIMA, A.. Classificador para auxílio ao diagnóstico do TEA baseado em rastreamento de trajetória visual. 2019. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

CORDEIRO, D. A.;MACHADO-LIMA, A.; Nakano, F.. Predição de estruturas tridimensionais para moléculas de RNA utilizando teoria do jogos. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

ARAUJO, L. V.; COUTINHO, F. L.;MACHADO-LIMA, A.. Arquitetura para coleta e an ́alise de dados em larga escala relacionado ao sono.. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

SILVA, A. M.; MATIOLI, S. R.;MACHADO-LIMA, A.. Genômica comparativa de Xylella fastidiosa. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

CHAIM, M. L.;Machado-Lima, Ariane; ELER, M. M.. Localização de defeitos baseada em cobertura de controle e de dados: Uma Avaliação com Usuários. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

Machado-Lima, Ariane; CASTRO JUNIOR, A. A.; ROZANTE, L. C. S.. Métodos adaptativos para reconhecimento de padrões sintáticos e sua aplicação na caracterização de RNAs com estrutura secundária. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

PARABONI, I.; CARVALHO, A. M. B. R.;MACHADO-LIMA, A.. Determinação de conteúdo para geração de língua natural baseada em personalidade. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

PERES, S. M.;Machado-Lima, Ariane; BOSCARIOLI, C.. Reconhecimento de padões aplicado a análise de expressões faciais gramaticais da língua brasileira de sinais: uma abordagem usando mistura de especialistas. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

MACHADO-LIMA, A.; SALVINI, R. L.; MARTINS JR., D. C.. Representação de emoções faciais em diferentes etnias, gêneros e faixas etárias. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

WINTER, C. E.; WUNDERLICH, G.;MACHADO-LIMA, A.. Genômica comparativa de tripanossomatídeos portadores de endossimbiontes e sua impĺicação no genoma de Angomonas ambiguus. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Interunidades em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Machado-Lima, Ariane; HIRATA, R. Jr; MONTEIRO, C. B. M.. Classificação de imagens faciais para o auxı́lio ao diagnóstico de Autismo. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

DIGIAMPIETRI, L.A.MACHADO-LIMA, A.; DELGADO, K. V.. Comparação de genomas de bactérias para identificação de características mais representativas para a classificação filogenética. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

OLIVEIRA, P. R.;MACHADO-LIMA, A.; LIMA, C. A. M.. Aprendizado de dados positivos e não rotulados para o tratamento de incerteza na rotulação de dados de química medicinal. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

ARAUJO, L. V.; PISA, I. T.;MACHADO-LIMA, A.. Análise automática de dados abertos utilizando meta-aprendizado. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

HASHIMOTO, R. F.; SILVA, V. F.;MACHADO-LIMA, A.. Estimação dos Parâmetros de um grafo And-Or para caracterização de emoções faciais. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

MACHADO-LIMA, A.; TEIXEIRA, M. M.; VALENTE, G. T.. ANÁLISE DO TRANSCRIPTOMA DE CANA-DE-AÇÚCAR E DE ALTERAÇÕES METABÓLICAS AO LONGO DO CICLO DE MATURAÇÃO DA PLANTA. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

SILVA JR., W. A.;MACHADO-LIMA, A.; LOPES, F. M.. Infraestrutura computacional para avaliação da similaridade funcional composta entre microRNAs baseada em ontologias. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em Interunidades em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

DURHAM, A.M.; FUJITA, A.;MACHADO-LIMA, A.. Predição de estrutura secundária de sequências de RNA e caracterização de famílias de RNA utilizando modelos de Markov de estados ocultos sensível ao contexto. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

MATIOLI, S. R.; GRUBER, A;MACHADO-LIMA, A.. Caracterização filodinâmica dos virus da Grande Fenda Africana e da Floresta de Zika: diversidade, demografia e migração. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Interunidades em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

CESAR JR., R. M.; JOSE NETO, J.;MACHADO-LIMA, A.. Inferência de Gramáticas Estocásticas para Reconhecimento de Padrões em Imagens Utilizando Quadtrees. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

MACHADO-LIMA, A.; RAMOS, A. F.;KASHIWABARA, A. Y.. ANÁLISE COMPUTACIONAL DE SÍTIOS DE LIGAÇÃO DO FATOR DE TRANSCRIÇÃO SLP-1 EM DROSOPHILA MELANOGASTER. 2023. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

MACHADO-LIMA, A.; PARDONO, E.; MELO, N. K. G.. Estudo comparativo de validações cruzadas para a predição de sítios de ligação de fatores de transcrição. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Faculdade de Ciências da Saúde de São Paulo.

VERAO, G. B.; ALBERTINI, B. C.; PIMENTEL, M. G. C.;MACHADO-LIMA, A.; DIAS, U. M.. Processo seletivo de docentes por tempo determinado para a Fundação Universidade Virtual do Estado de São Pauli ? UNIVESP ? PROCESSO UNIVESP-PRC-2021/00130-V01. 2021. Universidade Virtual do Estado de São Paulo.

TANAKA, H.;MACHADO-LIMA, A.; SIMOES, A. C. Q.. Processo seletivo para Professor Adjunto na área de Engenharia Biomédica, subária Informática Biomédica. 2016. Universidade Federal do ABC.

MACHADO-LIMA, A.. Membro de Comitê de Programa do IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (IEEE BIBM 2023), 5 a 8 de Dezembro de 2023, Istanbul, Turquia. 2023. Universidade de São Paulo.

MACHADO-LIMA, A.; PEREIRA, M. F.; ZILBOVICIUS, M.. Comitê de Acompanhamento Científico - Felipe de Oliveira Franco. 2022. Universidade de São Paulo.

MACHADO-LIMA, A.; ZILBOVICIUS, M.; MORIMOTO, C. H.. Exame de Progresso de Pesquisa de Felipe de Oliveira Franco. 2022. Universidade de São Paulo.

MACHADO-LIMA, A.. Participação em Comitê de Programa - BRACIS 2021 - Brazilian Conference on Intelligent Systems,. 2021. Universidade de São Paulo.

MACHADO-LIMA, A.. Membro do Comitê de Programa do 39 CTIC - Concurso de Trabalhos de Iniciação Científica (CSBC 2020). 2020. Universidade de São Paulo.

GORAB, E.. Predição de RNAs não codificantes e sua aplicação na busca do componente de RNA da telomerase. 2006 - Instituto de Ciencias Biomédicas da USP.

A. M. Durham; JOSE NETO, J.;SILVA, P. J. S.. Laboratório de geração de classificadores de seqüências. 2002. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

VASCONCELOS, A. T. R.; Durnham, A. M.; de Almeida, S. V.; Cruz, A. K.. Predição de RNAs não codificantes e sua aplicação na busca do componente RNA da telomorase. 2006. Tese (Doutorado em Programa Interunidades em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Reconhecimento de padrões de som em sessões de psicoterapia; Início: 2021; Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; (Orientador);

Análise de textos de diálogos para mensuracão de empatia; Início: 2021; Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; (Orientador);

Abordagem computacional para medir a empatia por meio de gestos e posturas corporais de duas pessoas em vídeos e sua aplicação na análise de sessões de psicoterapia; Início: 2021; Tese (Doutorado em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo; (Orientador);

Abordagem computacional para quantificação de similaridade entre sequências emocionais a partir de expressões faciais e sua aplicação na análise de sessões de psicoterapia; Início: 2020; Tese (Doutorado em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Síntese de expressões faciais com diferentes intensidades para representação de emoções; Início: 2019; Tese (Doutorado em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Coorientador);

Implementação e Avaliação de Classificadores Multirrótulos para Auxílio do Transtorno do Espectro Autista por Reconhecimento de Padrões; Início: 2024; Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; (Orientador);

Estudo e testes de classificadores multirrótulos para auxílio ao diagnóstico de TEA; Início: 2024; Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; (Orientador);

Desenvolvimento de Aplicativo iOS para Auxílio ao Diagnóstico de Transtornos do Espectro Austista por Meio de Captura e Análise de Imagens Faciais; Início: 2024; Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; (Orientador);

Algoritmos de redução de dimensionalidade para classificação multirrótulo; Início: 2024; Iniciação científica (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; (Orientador);

Técnicas de normalização de características geométricas e uso de características de textura no auxílio ao diagnóstico do transtorno do espectro autista baseado em imagens faciais; 2024; Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, ; Orientador: Ariane Machado Lima;

AllianceScan: uma abordagem para identificação de disfluências em português brasileiro aplicada em textos transcritos de áudios de psicoterapia para predizer aliança terapêutica; 2024; Dissertação (Mestrado em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo, ; Coorientador: Ariane Machado Lima;

Comparação de redes de microRNAs placentários de primigestas submetidas a intervenção psicossocial; 2022; Dissertação (Mestrado em Interunidades em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Ariane Machado Lima;

Aquisição de vídeos e processamento de imagens faciais em dispositivos móveis para auxílio ao diagnóstico do Transtorno do Espectro Autista; 2022; Dissertação (Mestrado em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo, ; Coorientador: Ariane Machado Lima;

Análise de dependência entre posições de bases de sequências motivos de fatores de transcrição aplicada à comparação de modelos baseados em Position Weight Matrix e Gramática Regular Estocástica; 2021; Dissertação (Mestrado em Interunidades em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Ariane Machado Lima;

Auxílio ao diagnóstico do Transtorno do Espectro Autista com base em trajetórias provenientes de rastreamento do olhar; 2021; Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, ; Coorientador: Ariane Machado Lima;

Métodos de validação tradicional e temporal aplicados à avaliação de classificadores de RNAs codificantes e não codificantes; 2018; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Ariane Machado Lima;

Caracterização de etnias, sexos e faixas etárias em imagens faciais; ; 2018; Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, ; Orientador: Ariane Machado Lima;

Classificação de imagens faciais para o auxílio ao diagnóstico do transtorno do espectro autista; 2018; Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, ; Orientador: Ariane Machado Lima;

Analisador sintático de Earley para gramáticas livres de contexto adaptativas e sua aplicação na caracterização de famílias de RNAs com pseudonós; 2018; Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, ; Orientador: Ariane Machado Lima;

Síntese de expressões faciais em fotografias para representação de emoções; 2018; Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Ariane Machado Lima;

Predição computacional de sítios de ligação de fatores de transcrição baseada em gramáticas regulares estocásticas; 2017; Dissertação (Mestrado em Interunidades em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Ariane Machado Lima;

Geração de caricaturas para representação de emoções usando processamento de imagens faciais e grafos And-Or; 2015; Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Ariane Machado Lima;

SIMTar: uma ferramenta para predição de SNPs interferindo em sítios alvos de microRNAs; 2013; Dissertação (Mestrado em Interunidades em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Ariane Machado Lima;

Inferência de gramáticas estocásticas para reconhecimento de padrões em imagens utilizando quadtrees; 2013; Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, ; Orientador: Ariane Machado Lima;

Utilização de gramáticas estocásticas para reconhecimento de nódulos em mamogramas e validação de contornos nodulares gerados a partir de técnicas de processamento de imagens; 2023; Tese (Doutorado em Doutorado em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo, ; Coorientador: Ariane Machado Lima;

Incorporação de evidências biológicas para a identificação de SNPs interferindo em sítios alvos de miRNAs; 2018; Tese (Doutorado em Programa Interunidades em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Ariane Machado Lima;

2015; Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Ariane Machado Lima;

Uso de modelos de classificação multirrótulo para identificação de autismo e comorbidades com base em medidas antropométricas faciais; 2023; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

ANÁLISE COMPUTACIONAL DE SÍTIOS DE LIGAÇÃO DO FATOR DE TRANSCRIÇÃO SLP-1 EM DROSOPHILA MELANOGASTER; 2023; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Estudo comparativo de validações cruzadas para a predição de sítios de ligação de fatores de transcrição; 2016; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Faculdade de Ciências da Saúde de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Teste e refatoração de um arcabouço para geração de classificadores de sequências; 2016; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Geração de expressões faciais utilizando grafos AND-OR em jogos psiquiátricos; 2015; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Gramáticas regulares estocásticas na caracterização de sítios de ligação de fatores de transcrição; 2013; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Avaliação de ferramentas de identificação computacional de alvos de miRNAs; 2013; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Implementação de um Framework de Banco de Dados para Apoio ao Projeto e Aplicação de Questionários Complexos em Entrevistas Dinâmicas; 2013; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Comparação de métodos de seleção de características no problema de classificação de RNAs; 2011; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Inserção de conhecimento a priori em modelos de covariância para análise de RNAs; 2009; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

CLASSIFICAÇÃO DE RNAS: MÓDULO DE EXTRAÇÃO DE CARACTERÍSTICAS; 2009; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Um arcabouço para a identificação de características associadas a erros de classificadores; 2009; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Inserção de conhecimento a priori em modelos de covariância para análise de RNAs ? Parte 2; 2009; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Classificação de rnas: expansão do módulo de extração de características; 2009; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Sistema de Instanciação de Questionários Eletrônicos; 2009; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Desenvolvimento de aplicativo para coleta de imagens faciais para o auxílio ao diagnóstico de transtornos do neurodesenvolvimento; 2023; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Comitês de classificadores baseados em dados de rastreamento de olhar em segmentos de vídeos para o auxílio ao diagnóstico do transtorno do espectro autista; 2023; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Universidade de São Paulo (Programa Unificado de Bolsas); Orientador: Ariane Machado Lima;

Reconhecimento de padrões na identificação de grupos de risco de dengue no Brasil; 2022; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Programa de Educação Tutorial - Sistemas de Informação - USP; Orientador: Ariane Machado Lima;

Comparação prática e teórica entre técnicas de caracterização de estruturas secundárias de RNAs e o arcabouço GrammarLab; 2021; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Classificação multiclasse de transtornos psiquiátricos baseada em medidas antropométricas faciais; 2021; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Ariane Machado Lima;

ANÁLISE COMPUTACIONAL DE SÍTIOS DE LIGAÇÃO DO FATOR DE TRANSCRIÇÃO SLP-1 BASEADA EM POSITION WEIGHT MATRIX EM DROSOPHILA MELANOGASTER; 2021; Iniciação Científica - Universidade de São Paulo, Universidade de São Paulo (Programa Unificado de Bolsas); Orientador: Ariane Machado Lima;

Auxílio ao diagnóstico de transtornos psiquiátricos com ênfase no Transtorno do Espectro Autista; 2021; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Universidade de São Paulo (Programa Unificado de Bolsas); Orientador: Ariane Machado Lima;

Sistema inteligente de classificação de transtornos psiquiátricos baseada em medidas antropométricas faciais; 2020; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Pró-Reitoria de Pesquisa da Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Sistema de armazenamento e recuperação de dados de pesquisa para o diagnóstico precoce de autismo; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Modelagem e Implementação de um Banco de Dados de Bioinformática Para Identificação de SNPs Interferindo em Sítios Alvos de MicroRNAs; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Implementação e avaliação de métodos de seleção de características em classificadores de RNAs baseados em Random Forests; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Universidade de São Paulo (Programa Ensinar Com Pesquisa); Orientador: Ariane Machado Lima;

Identificação de subconjuntos de microRNAs com grande intersecção de genes alvos; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Ariane Machado Lima;

Utilização de gramáticas para geração de imagens de face em serious games; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Ariane Machado Lima;

Análise comparativa de ferramentas computacionais de predição de alvos de microRNAs; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Programa de Educação Tutorial - Sistemas de Informação - USP; Orientador: Ariane Machado Lima;

UTILIZAÇÃO DE FERRAMENTAS DE BIOINFORMÁTICA PARA A IDENTIFICAÇÃO DE GENES REGULADORES NA REGIÃO ANTERIOR DO EMBRIÃO DE DROSOPHILA; 2011; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Universidade de São Paulo (Programa Ensinar Com Pesquisa); Orientador: Ariane Machado Lima;

Identificação de regiões regulatórias do genoma humano potencialmente envolvidas em câncer; 2010; Iniciação Científica - Instituto Nacional de Câncer, Ministério da Saúde; Orientador: Ariane Machado Lima;

Identificação computacional de alvos de miRNAs; 2010; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Universidade de São Paulo (Programa Ensinar Com Pesquisa); Orientador: Ariane Machado Lima;

BENCHMARKING DE CLASSIFICADORES DE SEQUÊNCIAS DE RNAS; 2010; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Universidade de São Paulo (Programa Ensinar Com Pesquisa); Orientador: Ariane Machado Lima;

Busca de sítios de ligação de microRNAs diferencialmente expressos em câncer de cabeça e pescoço em regiões promotoras de genes humanos; 2010; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Busca de sítios de ligação de microRNAs diferencialmente expressos em câncer de cabeça e pescoço em regiões promotoras de genes humanos - Parte 2; 2010; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Ariane Machado Lima;

Supervisão no Programa de Aperfeiçoamento de Ensino - disciplina ACH2024 - Algoritmos e Estruturas de Dados II; 2023; Orientação de outra natureza; (Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Pró-Reitoria de Pós-Graduação da Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Supervisão no Programa de Aperfeiçoamento de Ensino - disciplina ACH2002 - Introdução a Análise de Algoritmos; 2022; Orientação de outra natureza; (Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Pró-Reitoria de Pós-Graduação da Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Supervisão no Programa de Aperfeiçoamento de Ensino - disciplina ACH2043 - Introdução a Teoria da Computação; 2022; Orientação de outra natureza; (Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Pró-Reitoria de Pós-Graduação da Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Monitoria na disciplina ACH2024 - Algoritmos e Estruturas de Dados II; 2021; Orientação de outra natureza; (Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Monitoria na disciplina ACH2043 - Introdução a Teoria da Computação; 2021; Orientação de outra natureza; (Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Pró-Reitoria de Graduação da Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Supervisão no Programa de Aperfeiçoamento de Ensino - disciplina ACH2023 - Algoritmos e Estruturas de Dados I; 2021; Orientação de outra natureza; (Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Pró-Reitoria de Pós-Graduação da Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Monitoria na disciplina ACH2043 - Introdução a Teoria da Computação; 2020; Orientação de outra natureza; (Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Supervisão no Programa de Aperfeiçoamento de Ensino - disciplina ACH2024 - Algoritmos e Estruturas de Dados II; 2018; Orientação de outra natureza; (Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Pró-Reitoria de Pós-Graduação da Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Supervisão no Programa de Aperfeiçoamento de Ensino - disciplina ACH2024 - Algoritmos e Estruturas de Dados II; 2017; Orientação de outra natureza; (Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Pró-Reitoria de Pós-Graduação da Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Supervisão no Programa de Aperfeiçoamento de Ensino - disciplina ACH2024 - Algoritmos e Estruturas de Dados II; 2017; Orientação de outra natureza; (Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Pró-Reitoria de Pós-Graduação da Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Supervisão no Programa de Aperfeiçoamento de Ensino - disciplina ACH2024 - Algoritmos e Estruturas de Dados II; 2016; Orientação de outra natureza; (Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Pró-Reitoria de Pós-Graduação da Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Monitoria na disciplina ACH2043 - Introdução a Teoria da Computação; 2012; Orientação de outra natureza; (Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, Pró-Reitoria de Graduação da Universidade de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

BD-PROTOC - Módulo de Instanciação de Meta-Questionários; 2010; Orientação de outra natureza; (Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Ariane Machado Lima;

Gramaticas estoc[asticas livres de contexto em Plasmodium; 2007; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Hernando Antonio del Portillo Obando;

Caracterização fenotípica, genética e neurobiológica do transtorno obsessivo-compulsivo e suas implicações para o tratamento; 2009; Universidade de São Paulo, ; Helena Paula Brentani;

MACHADO-LIMA, A. ; SOUZA, T. L. D. E. ; ARANA, G. ; BONJORNI, T. . Carreira Acadêmica: o papel e a rotina de uma mulher no ambiente de ensino e pesquisa - Episódio 3 da Série de Podcast 'Fala, GRACE!'. 2021.

MACHADO-LIMA, A. . 16th Brazilian Symposium on Bioinformatics (BSB 2023). 2023. (Membro de Comitê de Program).

MACHADO-LIMA, A. . 11th Brazilian Conference on Intelligent Systems (BRACIS 2022). 2022. (Membro de Comitê de Program).

MACHADO-LIMA, A. . 10th Brazilian Conference on Intelligent Systems (BRACIS 2021). 2021. (Membro de Comitê de Program).

MACHADO-LIMA, A. . 39º Concurso de Trabalhos de Iniciação Científica da Sociedade Brasileira de Computação (CTIC 2020). 2020. (Membro de Comitê de Program).

MACHADO-LIMA, A. . XII Workshop de Tecnologia Adaptativa (WTA 2018). 2018. (Membro de Comitê de Program).

MACHADO-LIMA, A. . Bioinformática no Estudo de RNAs não Codificantes e microRNAs. 2015. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

Machado-Lima, Ariane . Bioinformática no Estudo de RNAs não Codificantes e microRNAs. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

MACHADO-LIMA, A. . Bioinformática no Estudo de RNA não Codificantes e microRNAs. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

MACHADO-LIMA, A. . Alinhamentos e Busca de Similaridade. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

MACHADO-LIMA, A. . Alinhamentos e Busca de Similaridade. 2011. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

MACHADO-LIMA, A. . Alinhamento e Busca de Similaridade. 2010. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

MACHADO-LIMA, A. . Alinhamento e Busca de Similaridade. 2009. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

MACHADO-LIMA, A. . Alinhamento e Busca de Similaridade. 2008. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

MACHADO-LIMA, A. . Alinhamento e Blast. 2007. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

MACHADO-LIMA, A. . Introdução a Biologia Molecular. 2007. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

SIMOES, A. C. ; MACHADO-LIMA, A. ; CARRER, H. . Introdução à Bioinformática. 2007. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

FALCAO, P. R. K. ; BARRERA, J. ; MACHADO-LIMA, A. . Proceedings do X-meeting 2007 - terceira reunião da Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional. 2007. (Editoração/Anais).

MACHADO-LIMA, A. . 3rd X-Meeting. 2007. (Membro de Comitê de Program).

MACHADO-LIMA, A. . Introdução à Programação Perl. 2006. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

MACHADO-LIMA, A. . 1st X-Meeting. 2005. (Membro de Comitê de Program).

MACHADO-LIMA, A. . Cursos de Java 1, 2 e 3. 2002. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

MACHADO-LIMA, A. . Cursos de Java 1, 2 e 3. 2001. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

MACHADO-LIMA, A. . Cursos de Java 1, 2 e 3. 2001. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

MACHADO-LIMA, A. . Access básico. 2001. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

MACHADO-LIMA, A. . Access avançado. 2001. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

MACHADO-LIMA, A. . Java II. 2001. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Material didático).

MACHADO-LIMA, A. . Java III. 2001. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Material didático).

MACHADO-LIMA, A. ; COLOMBO, J, . Java I - Uma Introdução à Linguagem. 2001. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Material didático).

MACHADO-LIMA, A. . Word e Excel. 1998. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

2018

Menção honrosa do Prêmio Mercosul de Ciência e Tecnologia 2017 (pesquisador sênior), com o trabalho "Classificação multiclasse de transtornos psiquiátricos baseada em medidas antropométricas faciais", Reunião Especializada em Ciência e Tecnologia do Mercosul (RECyT),.

2010

Melhor pôster da VII Jornada de Iniciação Científica, com o título "Desenvolvimento de uma metodologia de Bioinformática para busca de riboswitches de tiamina pirofosfato no genoma humano"., Instituto Nacional do Câncer.

2009

Melhor pôster de transcriptômica e proteômica, entitulado "The Development of a Bioinformatics Methodology to Search for Riboswitches in the Human Transcriptome", Associação de Bioinformática e Biologia Computacional.

2009

Menção Honrosa ao Pôster "Desenvolvimento de uma metodologia de bioinformática para a busca de eventos de riboswitch de TPP no transcriptoma humano" na VI Jornada de Iniciação Científica, Instituto Nacional do Câncer (INCA).