MARIA CLAUDIA NEGRET LOPEZ

Com formação em Matemática, atualmente é doutoranda em bioinformática da Universidade de São Paulo USP. Integrante do grupo BIOINFO dirigido pelo professor Ronaldo Hashimoto, no Instituto de Matemática e Estatística da USP. Foi iIntegrante do grupo de Biologia Computacional no laboratório LNBIO (Campinas) no CNPEM (Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais) na linha de biologia estrutural em analise de interações de proteínas usando redes neurais convolucionais para grafos (2018-2020). Mestre em Modelagem computacional da Universidade Federal do Rio Grande FURG. Pertencente ao grupo de bioinformática. Especialista Matemática Aplicada Universidad Sergio Arboleda, Colombia. Tem experiencia em docência das matemáticas. Em pesquisa em Biomatemáticas, inferencia bayesiana e interação proteína-proteína, biologia estrutural, docking molecular e redes Neurais.

Informações coletadas do Lattes em 30/08/2022

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em andamento em Bioinformática

2018 - Atual

Universidade de São Paulo
Paulo Sergio Lopes de oliveira-Ronaldo Fumio Hashimaoto. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

Mestrado em Modelagem Computacional

2013 - 2015

Universidade Federal do Rio Grande
Título: Computação Bayesiana Aproximada Monte Carlo Sequencial como ferramenta para a inferência de parâmetros na rede genética circadiana da Arabidopsis thaliana,Ano de Obtenção: 2015
Leonardo Ramos Emmendorfer.Coorientador: Adriano Velasque Werhli. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

Especialização em Matemática Aplicada

2011 - 2012

Universidad Sergio Arboleda
Título: -----
Bolsista do(a): Universidad Sergio Arboleda, USA, Colômbia.

Graduação em Matematicas

2007 - 2011

Universidad Sergio Arboleda
Título: Categorias Tensoriales Estrictas
Orientador: Jesus Hernando Perez Alcazar

Formação complementar

2021 - 2021

Dinâmica Molecular Básica. (Carga horária: 10h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2021 - 2021

Predição de estruturas de proteínas. (Carga horária: 10h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2021 - 2021

Métodos de Docking Receptor-Ligante e Virtual Screening. (Carga horária: 10h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2014 - 2014

C++. (Carga horária: 8h). , Universidade Federal do Rio Grande, FURG, Brasil.

2013 - 2014

Extensão universitária em Portugues para extrangeiros. (Carga horária: 176h). , Universidade Federal do Rio Grande, FURG, Brasil.

2013 - 2013

Extensão universitária em Introdução ao Latex. (Carga horária: 20h). , Universidade Federal do Rio Grande, FURG, Brasil.

2011 - 2011

Inglés. (Carga horária: 160h). , Invest in Bogotá, IB, Colômbia.

2008 - 2008

Estrategias para la enseñanza de la Matemática.. (Carga horária: 420h). , Organización de Estados Americanos, OEA, Estados Unidos.

2005 - 2005

Contradicción, inconsistencias y lógica paraconsis. , Universidad Nacional de Colombia - Bogotá, UNAL/Bogotá, Colômbia.

2000 - 2000

Teoría matemátcia de enfermedades. (Carga horária: 40h). , Universidad del Quindío, UNIQUINDIO, Colômbia.

2000 - 2000

Modelos matemáticos para una sola especie. (Carga horária: 40h). , Universidad del Quindío, UNIQUINDIO, Colômbia.

1999 - 2000

Extensão universitária em Alemán. (Carga horária: 540h). , Universidad Nacional de Colombia - Bogotá, UNAL/Bogotá, Colômbia.

1999 - 1999

Estabilidad y bifurcaciones. (Carga horária: 40h). , Universidad Industrial de Santander, UIS, Colômbia.

1999 - 1999

Modelos Matemáticos en Neurociencias.. (Carga horária: 10h). , Universidad del Quindío, UNIQUINDIO, Colômbia.

1999 - 1999

Estructura de fractales y su modelación en el comp. (Carga horária: 40h). , Facultad de Salud de la Universidad Industrial de, UIS, Colômbia.

1998 - 1999

Extensão universitária em Conversación Inglesa. (Carga horária: 120h). , Universidad Nacional de Colombia - Bogotá, UNAL/Bogotá, Colômbia.

1995 - 1997

Extensão universitária em Inglés. (Carga horária: 720h). , Universidad Nacional de Colombia - Bogotá, UNAL/Bogotá, Colômbia.

1993 - 1993

Temas de Historia de las Matemáticas.. (Carga horária: 10h). , Universidad Nacional de Colombia - Bogotá, UNAL/Bogotá, Colômbia.

1993 - 1993

Temas de Filosofía de la Matemática: Los problemas. (Carga horária: 10h). , Universidad Nacional de Colombia - Bogotá, UNAL/Bogotá, Colômbia.

1993 - 1993

El Cálculo de Cavalieri a Cauchy. (Carga horária: 10h). , Universidad Nacional de Colombia - Bogotá, UNAL/Bogotá, Colômbia.

Idiomas

Inglês

Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

Espanhol

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Português

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Francês

Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Matemática / Subárea: Matemática Aplicada.

Grande área: Ciências Humanas / Área: Educação.

Organização de eventos

NEGRET, M. C. . Workshop doprograma interunidades de pós-graduação em bioinformática. 2020. (Outro).

NEGRET, M. C. . Curso de veráo em bioinformática. 2020. (Outro).

Participação em eventos

X Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos.. 2021. (Seminário).

I Semana de Proteômica e Bioquímica de Proteínas (I SPBP). 2020. (Seminário).

I Workshop Online de Bioinformátcia. 2020. (Outra).

Workshop do programa interunidades de pós-graduação em Bioinformática.Redes neurais convolucionais em grafos para estudo das interfases de interação proteína-proteína. 2020. (Outra).

Curso de Veráo em Bioinformática. 2017. (Outra).

13a Mostra de produção universitaria.ESTIMAÇÃO DE PARÂMETROS UTILIZANDO MÉTODOS DE APROXIMAÇÃO BAYESIANA COMPUTACIONAL (ABC). 2014. (Outra).

CONFERÊNCIA SUL EM MODELAGEM COMPUTACIONAL 2014. 2014. (Outra).

III Southern-Summer School on Mathematical Biology. 2014. (Seminário).

II Simposio em computação e automação para Industria Naval, Offshore e subaquatica (NV. 2014. (Simpósio).

IV SEMANA ACADÊMICA INTEGRADA DAS CIÊNCIAS COMPUTACIONAIS. 2014. (Seminário).

Marine Bioinformatics. 2014. (Outra).

Workshop Bioinformática Integração FURG-UFSM. 2014. (Outra).

WWMB2014 ? Winter Workshop on Mathematical Biology. 2014. (Outra).

III Semana Acadêmica Integrada das Ciências Computacionais. 2013. (Seminário).

II Workshop-Escola de Informatica Teorica (WEIT 2013). 2013. (Simpósio).

?How to Enliven the Mathematics Classroom? (James Stewart). 2010. (Outra).

Cuarto encuentro internacional de matemáticas. 2010. (Encontro).

El desarrollo del pensamiento lógico matemático en la educación básica y media.. 2008. (Oficina).

Tercer encuentro internacional de matemáticas. 2008. (Encontro).

XVI Congreso Nacional de Matemáticas. 2007. (Congresso).

Cibernética de lo humano. XVI Convención Nacional Ciencia, tecnología, sociedad y competitividad: prioridad para Colombia. 2006. (Outra).

5th Scott Foresman Conference for Bilingual Schools Literacy Across the curriculum. 2004. (Congresso).

Encuentro Pedagógico 2004 Santillana, Alfaguara, Richmond. 2004. (Encontro).

XIII ELAM (Escuela Latinoamericana de Matemáticas). 2002. (Congresso).

IV Escuela de Verano en Ecuaciones Diferenciales y áreas Relacionadas. 1996. (Congresso).

Primer encuentro de Estudiantes de Matemáticas. 1995. (Encontro).

I Coloquio Colombiano de Historia, Filosofía y Pedagogía de las Matemáticas. 1993. (Congresso).

IV Coloquio Internacional de Filosofía e Historia de las Matemáticas. 1993. (Congresso).

Produções bibliográficas

KAWASHIMA, IRINA YURI ; LOPEZ, MARIA CLAUDIA NEGRET ; CUNHA, MARIELTON DOS PASSOS ; HASHIMOTO, RONALDO FUMIO . SARS-CoV-2 host prediction based on virus-host genetic features. Scientific Reports , v. 12, p. 4576, 2022.
KAWASHIMA, IRINA YURI ; LOPEZ, MARIA CLAUDIA NEGRET ; CUNHA, MARIELTON DOS PASSOS ; HASHIMOTO, RONALDO FUMIO . Aprendizagem de máquina Como essa técnica computacional está enfrentando os novos vírus. Ciência hoje, Brasil, 14 jun. 2022.
WERLHI A. ; EMMENDORFER L. ; LOPEZ, MARIA CLAUDIA NEGRET . Estimação de parâmetros utilizando métodos de Aproximação Bayesiana Computacional (ABC). In: 13ª Mostra da Produção Universitária, 2016, Rio Grande. XVI Encontro de Pós Graduação, 2016.
NEGRET, M. C. . Redes Neurais Convolucionais profundas baseadas em grafos para estudo de interfaces de interação proteína-proteína. 2020. (Apresentação de Trabalho/Outra).
NEGRET, M. C. ; WERLHI A. ; EMMENDORFER L. . ESTIMAÇÃO DE PARÂMETROS UTILIZANDO MÉTODOS DE APROXIMAÇÃO BAYESIANA COMPUTACIONAL (ABC). 2014. (Apresentação de Trabalho/Outra).

Prêmios

2018

Bolsa, CAPES.

2013

OEA - GCUB 2013 scholarship, OEA.

Histórico profissional

Endereço profissional

Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Laboratório Nacional de Biociências. , R. Giuseppe Máximo Scolfaro, 10,000, Bosque das Palmeiras, 13083970 - Campinas, SP - Brasil, Telefone: (19) 35121244, URL da Homepage:

Experiência profissional

2018 - Atual

Universidad de La Sabana, U. Sabana

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estudante de doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2015 - 2018

Universidad de La Sabana, U. Sabana

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Docente Catedra, Carga horária: 14

2011 - 2011

Universidad Sergio Arboleda

Vínculo: , Enquadramento Funcional: Docente

Outras informações:
Docente Cálculo

Atividades

01/2010
Pesquisa e desenvolvimento, MUSA.IMA1.,Linhas de pesquisa

2004 - 2012

Liceo Juan Ramón Jiménez

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Docente, Carga horária: 40

Outras informações:
Docente de matemáticas grados 7° a 10° de 2004 a 2009. Chefe da área de matemáticas no ano 2008. Docente de matemáticas grados 9° , 10° y 11°. 2010- 2012

2009 - 2009

Colegio Refous, (--)

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Docente

Outras informações:
Docente de informática, grados 6° a 9°

2001 - 2001

Universidad Del Quindio

Vínculo: Pesquisador, Enquadramento Funcional: Pesquisador

Outras informações:
Integrante de la Escuela de Investigación en Biomatemática - Armenia - Quindío ? Colombia

1996 - 2001

Universidad Antonio Nariño

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Docente

Outras informações:
Monitor Centro de Cómputo Matemáticas. Docente hora cátedra área de Matemáticas.(I, II, III, VI, semestres áreas de economía e ingeniería). Monitor del Centro de Cómputo de Matemáticas. Montaje del Proyecto de Universidad Virtual (Matemáticas) 2001.