Elisa Karen da Silva Ramos

Formação complementar

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Produções bibliográficas

• SILVA, FELIPE ANDRÉ ; SOUZA, ÉRICA M. S. ; RAMOS, ELISA ; FREITAS, LUCAS ; NERY, MARIANA F. . The molecular evolution of genes previously associated with large sizes reveals possible pathways to cetacean gigantism. Scientific Reports , v. 13, p. 67, 2023.

• BENTLEY, BLAIR P. CARRASCO-VALENZUELA, TOMÁS RAMOS, ELISA K. S. PAWAR, HARVINDER SOUZA ARANTES, LARISSA ALEXANDER, ALANA BANERJEE, SHREYA M. MASTERSON, PATRICK KUHLWILM, MARTIN PIPPEL, MARTIN MOUNTCASTLE, JACQUELYN HAASE, BETTINA ULIANO-SILVA, MARCELA FORMENTI, GIULIO HOWE, KERSTIN CHOW, WILLIAM TRACEY, ALAN SIMS, YING PELAN, SARAH WOOD, JONATHAN YETSKO, KELSEY PERRAULT, JUSTIN R. STEWART, KELLY BENSON, SCOTT R. LEVY, YANIV , et al. TODD, ERICA V. SHAFFER, H. BRADLEY SCOTT, PETER HENEN, BRIAN T. MURPHY, ROBERT W. MOHR, DAVID W. SCOTT, ALAN F. DUFFY, DAVID J. GEMMELL, NEIL J. SUH, ALEXANDER WINKLER, SYLKE THIBAUD-NISSEN, FRANÇOISE NERY, MARIANA F. MARQUES-BONET, TOMAS ANTUNES, AGOSTINHO TIKOCHINSKI, YARON DUTTON, PETER H. FEDRIGO, OLIVIER MYERS, EUGENE W. JARVIS, ERICH D. MAZZONI, CAMILA J. KOMOROSKE, LISA M. ; Divergent sensory and immune gene evolution in sea turtles with contrasting demographic and life histories. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA , v. 120, p. e2201076120, 2023.

• NERY, MARIANA F. ; RENNÓ, MATHIAS ; PICORELLI, AGNELLO ; RAMOS, ELISA . A phylogenetic review of cancer resistance highlights evolutionary solutions to Peto?s Paradox. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY (ONLINE VERSION) , v. 45, p. e20220133, 2022.

• SOUZA, E. M. S. ; FREITAS, L. ; RAMOS, E. K. S. ; Selleghin-Veiga, G ; RIBEIRO, M. C. R. ; SILVA, F. A. ; MARMONTEL, M. ; SANTOS, F. R. ; LAUDISOIT, A. ; VERHEYEN, E. ; DOMNING, D. P. ; NERY, M. F. . The evolutionary history of manatees told by their mitogenomes. Scientific Reports , v. 11, p. 3567-1, 2021.

• RAMOS, ELISA K. S. ; DOS SANTOS, STÉFANIE C. L. ; KUROKI, KEROLYN K. ; BENAVALLI, LETÍCIA ; VANI, GANNABATHULA S. ; COBO, VALTER J. ; HAYASHI, TAKAHISA ; RODRIGUES, EDSON ; SUDA, CECILIA N. K. . Glycoside hydrolases from the tunics of two Antarctic ascidians (Ascidia challengeri and Pyura bouvetensis) and the tropical species Phallusia nigra. Polar Biology , v. 44, p. 857-863, 2021.

• NERY, M. F. ; RAMOS, E. K. S. ; SOUZA, E. M. S. ; Ribeiro, P. G. . Present and Prospects of Research on Neotropical Mammals using genomic approaches. MASTOZOOLOGIA NEOTROPICAL /JOURNAL OF NEOTROPICAL MAMMALOGY , v. 27, p. 1, 2020.

• ANDREANI, MARIA LUIZA ; FREITAS, LUCAS ; RAMOS, ELISA K. S. ; NERY, MARIANA F. . Latitudinal diversity gradient and cetaceans from the perspective of MHC genes. IMMUNOGENETICS , v. 1, p. 1, 2020.

• RAMOS, E. K. S. ; NERY, M. F. ; FREITAS, L. . The role of selection in the evolution of marine turtles mitogenomes. Scientific Reports , v. 10, p. 16953, 2020.

• MAGALHÃES, RAFAEL F ; LEMES, PRISCILA ; SANTOS, MARCUS THADEU T ; MOL, RAFAEL M ; RAMOS, ELISA K S ; OSWALD, CAROLINE B ; PEZZUTI, TIAGO L ; SANTOS, FABRÍCIO R ; BRANDÃO, REUBER A ; GARCIA, PAULO C A . Evidence of introgression in endemic frogs from the campo rupestre contradicts the reduced hybridization hypothesis. Biological Journal of the Linnean Society , v. 1, p. 1-1, 2020.

• RAMOS, ELISA KAREN SILVA ; MAGALHÃES, RAFAEL FÉLIX DE ; MARQUES, NÚBIA CARLA SANTOS ; BAÊTA, DÉLIO ; GARCIA, PAULO CHRISTIANO ANCHIETTA ; SANTOS, FABRÍCIO RODRIGUES . Cryptic diversity in Brazilian endemic monkey frogs (Hylidae, Phyllomedusinae, Pithecopus) revealed by multispecies coalescent and integrative approaches. MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION , v. 132, p. 105-116, 2019.

• RAMOS, ELISA KAREN SILVA ; FASSINA, PAOLA VISNARDI ; LEMOS, MICHELLE ANDRADE . A Mother's Gift: consequences of unhealthy diet on offspring metabolism. JOURNAL OF PHYSIOLOGY-LONDON , v. 596, p. 4575-4577, 2018.

• RAMOS, ELISA KAREN SILVA ; DE MAGALHÃES, RAFAEL FÉLIX ; SARI, ELOISA HELENA REIS ; ROSA, AUGUSTO HENRIQUE BATISTA ; GARCIA, PAULO CHRISTIANO ANCHIETTA ; SANTOS, FABRÍCIO RODRIGUES . Population genetics and distribution data reveal conservation concerns to the sky island endemic Pithecopus megacephalus (Anura, Phyllomedusidae). CONSERVATION GENETICS (DORDRECHT. ONLINE) , v. 1, p. 1-12, 2017.

• RAMOS, E. K. S. ; ROSA, A. H. B. ; COBO, V. J. . Influence of the endo-symbiont Leucothoe wuriti (Thomas & Klebba, 2007) (Crustacea, Leucothoidae) on the biomass of Phallusia nigra (Savigny, 1816) (Tunicata, Ascididae), in the northeastern coast of the São Paulo State, Brazil. Revista Biociências (Taubaté) , v. 21, p. 38-43, 2015.

• RAMOS, E. K. S. ; Freitas L. ; NERY, M. F. . How to make a sea turtle: molecular signatures of positive selection in Chelonia mydas genome. In: IX Congresso Brasileiro de Herpetologia, 2019, Campinas. Anais do IX Congresso Brasileiro de Herpetologia, 2019. v. 2. p. 106163.

• RAMOS, E. K. S. ; MAGALHAES, R. F. ; GARCIA, P. C. A. ; SANTOS, F. R. . Phylogeography and evolution of an endemic monkey-frog from eastern Brazilian mountaintops. In: 62º Brazilian International Congress of Genetics, 2016, Caxambu. 62º Congresso Brasileiro de Genética, 2016.

• ROSA, A. H. B. ; RAMOS, E. K. S. ; VOLTOLINI, J. C. . Desvios no padrão de coloração em duas espécies de borboletas frugívoras. In: XIX ENIC - Encontro de Iniciação Científica UNITAU, 2014. Resumos do XVII ENIC - Encontro de Iniciação Científica - UNITAU, 2014.

• RAMOS, E. K. S. ; ROSA, A. H. B. ; SUDA, C. N. K. . Influência do endobionte Leucothoe spinicarpa (Abildgaard, 1789) (Crustacea: Leucothoidae) sobre a biomassa de Phallusia nigra (Savigny, 1816) (Tunicata, Ascididae). In: XI CAEB - Congresso Aberto aos Estudantes de Biologia, 2013, Campinas - SP. Livro de resumos do XI CAEB, 2013.

• RAMOS, E. K. S. ; SUDA, C. N. K. . Purificação parcial e caracterização da endoglucanase da túnica de Phallusia nigra Savigny,1816 (Tunicata: Ascidiacea). In: II Congresso Internacional de Ciência, Tecnologia e Desenvolvimento, 2013, Taubaté. Anais II Congresso Internacional de Ciência, Tecnologia e Desenvolvimento - UNITAU 2014, 2013.

• RAMOS, E. K. S. ; BUSTAMANTE, L. A. ; OLIVEIRA, G. D. ; VASQUES, M. C. P. ; ALMEIDA, A. A. S. . Efeito do ácido sulfúrico sobre a germinação de unidades de dispersão de Brachiaria brizantha CV. BRS Piatã. In: XVII ENIC - Encontro de Iniciação Científica - UNITAU, 2012, Taubaté - SP. Resumos do XVII ENIC - Encontro de Iniciação Científica - UNITAU, 2012.

• RAMOS, E. K. S. ; Picorelli, A. ; SILVA, F. A. ; Selleghin-Veiga, G ; NERY, M. F. . Molecular footprints on osmoregulation system associated with new environment colonization in neotropical aquatic mammals. 2022. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• RAMOS, E. K. S. ; Carrasco-Valenzuela, T. ; Mazzoni, C. J. ; Komoroske, L. M. ; NERY, M. F. . Digging for genomic differences in the highly conserved ancient genomes of two sea turtle species. 2021. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• ESTEVAO, L. M. M. ; FREITAS, L. ; RAMOS, E. K. S. ; SOUZA, E. M. S. ; NERY, M. F. . Molecular evolution in dolphin hearing genes: different evolutionary pathways for marine and freshwater echolocation?. 2020. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• ESTEVAO, L. M. M. ; NERY, M. F. ; Freitas L. ; SOUZA, E. M. S. ; RAMOS, E. K. S. . Adaptive evolution of hearing genes in echolocating dolphins. 2020. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• RAMOS, E. K. S. ; FREITAS, L. ; NERY, M. F. . How to make a sea turtle:molecular signatures of positive selection on Chelonia mydas genome. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• RAMOS, E. K. S. ; FREITAS, L. ; NERY, M. F. . How to make a chelonian:molecular signatures of positive selection on turtles from different habitats. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• RAMOS, E. K. S. ; FREITAS, L. ; NERY, M. F. . Mitogenome molecular evolution on sea turtles. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• RIBEIRO, M. C. R. ; SOUZA, E. M. S. ; RAMOS, E. K. S. ; NERY, M. F. . When being obese is healthy: molecular evolution of genes related to metabolism in cetaceans. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• RAMOS, E. K. S. . O papel da genética na preservação da biodiversidade. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• RAMOS, E. K. S. ; MAGALHAES, R. F. ; SANTOS, F. R. . Phylogeography and evolution of an endemic monkey-frog from eastern Brazilian mountaintops.. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• RAMOS, E. K. S. ; SUDA, C. N. K. . Purificação e Caracterização da endoglucanase de Phallusia nigra Savigny. 2013. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

Projetos de pesquisa

• 2020 - Atual

  Genômica comparativa na exploração das assinaturas moleculares de adaptação ao ambiente marinho por tartarugas, Descrição: Usando abordagens de genômica comparativa, exploramos os genomas de tartarugas marinhas, em um contexto filogenético, procurando por características únicas e compartilhadas relacionadas ao sucesso adaptativo do ambiente marinho. Mais especificamente, aplicamos varreduras de todo o genoma para alterações moleculares nas regiões codificadoras de proteínas dos genomas da tartaruga verde (Chelonia mydas) e da tartaruga-de-couro (Dermochelys coriacea). Essas mudanças serão comparadas com genomas de outros quelônios que habitam ambientes distintos (água doce, terrestre e salobra). Nossas análises de varredura do genoma forneceram informações sobre o tipo de processo biológico que tem sido alvo da seleção natural na evolução das tartarugas marinhas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Elisa Karen da Silva Ramos - Coordenador / Mariana Freitas Nery - Integrante / Camila Junqueira Mazzoni - Integrante / Lisa M Komoroske - Integrante / Tomás Carrasco-Valenzuela - Integrante.

• 2018 - Atual

  Usando genômica comparativa para entender a evolução convergente de mamíferos: em busca das pegadas moleculares da ocupação do ambiente marinho e fluvial, Descrição: Com o advento dos métodos de sequenciamento massivo e a recente acessibilidade a esses métodos, surgem novas oportunidades de pesquisas que permitirão significativo progresso no nosso conhecimento sobre as bases genômicas da diversidade fenotípica. A disponibilidade de novos genomas também permite que organismos não modelos emerjam como grupos com alto potencial para responder perguntas sobre a natureza do processo evolutivo. Entre esses organismos não-modelo, os mamíferos aquáticos chamam especial atenção pela radical transformação em quase todos seus sistemas durante suas histórias evolutivas e pela notável convergência fenotípica que se pode observar entre as linhagens que de maneira independente colonizaram o ambiente aquático. Nesse contexto, o projeto proposto pretende estudar a evolução molecular das seguintes espécies: Sotalia guianensis e Pontoporia blainvillei, dois golfinhos marinhos; Sotalia fluviatilis e Inia geoffrensis, dois golfinhos fluviais; Trichechus manatus e Trichechus inunguis, dois sirênios, marinho e fluvial respectivamente. Com uma abordagem de genômica comparativa, os genomas dessas espécies serão sequenciados e submetidos à duas principais estratégias de estudo: 1) comparação e análises dos genomas de espécies irmãs que se separaram há relativamente pouco tempo (S. guianensis x S. fluviatilis, T. manatus x T. inunguis) e com um tempo de separação maior (I. geoffrensis x P. blainvillei), com o fim de entender os padrões de variação entre elas e assim responder perguntas relacionadas ao processo de especiação; e 2) comparação entre os genomas de espécies de linhagens independentes que ocupam o mesmo ambiente (marinho ou dulcícola), com o fim de investigar se mecanismos moleculares comuns estão por trás dos fenótipos convergentes.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Elisa Karen da Silva Ramos - Integrante / Mariana Freitas Nery - Coordenador / Juan Pablo Torres-Florez - Integrante / Juan Cristóbal Opazo - Integrante / Andrew Foote - Integrante / Thomas Hrbek - Integrante / Erica Martinha Silva de Souza - Integrante / Bruna Cristina Dias - Integrante / Maria Luiza Andreani - Integrante / Letícia Magpali Moura Estevão - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2015 - Atual

  Dinâmica evolutiva populacional, biogeografia e sistemática dos complexos de espécies Pithecopus megacephalus e Pithecopus rohdei, Descrição: A Mata Atlântica e a Serra do Espinhaço são considerados alguns dos mais importantes centros de endemismos do Brasil. Um melhor entendimento sobre a história evolutiva desses ecossistemas brasileiros pode ser obtido pelo estudo da dinâmica evolutiva de espécies endêmicas desses locais, como por exemplo, Phyllomedusa rohdei (Mertens, 1926), da mata atlântica, e Phyllomedusa megacephala (Miranda-Ribeiro, 1926), da serra do espinhaço. A análise da distribuição da diversidade genética no espaço e no tempo nos permite compreender a dinâmica evolutiva das populações fornecendo indícios que, além de resultarem no levantamento de hipóteses sobre a formação das espécies, podem levar a uma melhor compreensão dos possíveis impactos que mudanças climáticas futuras poderiam causar na diversidade e persistência das populações, possibilitando a elaboração de estratégias mais apropriadas para a conservação.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Elisa Karen da Silva Ramos - Integrante / Rafael Félix Magalhães - Coordenador / Eloisa Helena Reis Sari - Integrante / Paulo Christiano de Anchietta Garcia - Integrante / Fabrício Rodrigues dos Santos - Integrante.

• 2011 - Atual

  Estudos sobre Polissacaridases da túnica de Ascídias Neotropicais, Descrição: Descrição: Ascídias são os únicos animais que produzem celulose. Endoglucanases são enzimas que degradam celulose e são encontradas em organismos que degradam ou sintetizam celulose. A atividade dessa enzima em ascídias não foi ainda relatada na literatura, embora estudos genômicos tenham indicado a ocorrência de genes para essa enzima. O presente projeto tem como objetivo a extração e caracterização da endoglucanase da túnica de ascídias neotropicais. Poderão ser investigadas espécies de ampla ocorrência no litoral paulista, tais como Phallusia nigra e Clavelina oblonga. As condições ótimas de atividade como pH e temperatura, bem como a interferência de íons metálicos na atividade enzimática serão investigadas. A atividade de outras enzimas como xiloglucanase e mananase também serão estudadas. Espera-se que os resultados obtidos contribuam para a elucidação da importância e função da endoglucanase na túnica de ascídias bem como prover informações acerca da estrutura dos polissacarídeos presentes nesse tecido. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Elisa Karen da Silva Ramos - Integrante / cecila nahomi kawagoe suda - Coordenador / Edson Rodrigues - Integrante / Gannabathula Sree Vani - Integrante / Valter José Cobo - Integrante / Kerolyn Kazue Kuroki - Integrante.

Prêmios