Elisa Boari de Lima
Possui graduação em Ciência da Computação pela Universidade Federal de Lavras (2008), mestrado em Ciência da Computação pela Universidade Federal de Minas Gerais (2011) e doutorado em Bioinformática pela Universidade Federal de Minas Gerais (2015). Suas áreas de interesse são Mineração de Dados e Computação Natural, com ênfase em suas aplicações em Bioinformática.
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Acadêmico
Formação acadêmica
Doutorado em Bioinformática
2011 - 2015
Universidade Federal de Minas Gerais
Título: Detecção de Subfamílias Proteicas Isofuncionais utilizando Integração de Dados e Agrupamento Espectral
Orientador: Raquel Cardoso de Melo-Minardi
com Coorientador: Wagner Meira Júnior. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Mineração de Dados.
Mestrado em Ciências da Computação
2009 - 2011
Universidade Federal de Minas Gerais
Título: Utilizando Agrupamento com Restrições e Agrupamento Espectral para Integração de Dados de Enzimas,Ano de Obtenção: 2011
Orientador: em Rensselaer Polytechnic Institute ( Mohammed J. Zaki)
com Wagner Meira Junior.Coorientador: Raquel Cardoso de Melo Minardi. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Agrupamento com restrições; Agrupamento de enzimas; Agrupamento espectral; Integração de dados.Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática.
Graduação em Ciência da Computação
2005 - 2008
Universidade Federal de Lavras
Título: Uma Metodologia para Identificação de Módulos Formadores de Sequências de Proteínas Mosaicas do Trypanosoma cruzi a partir do Transcriptoma do Parasito Utilizando a Ferramenta BLAST
Orientador: Thiago de Souza Rodrigues
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais, FAPEMIG, Brasil.
Formação complementar
2013 - 2013
Bioinformática Estrutural e Análises do Proteoma. (Carga horária: 90h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
Idiomas
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende RazoavelmenteLê Pouco.
Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Francês
Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.
Áreas de atuação
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Mineração de Dados.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Probabilidade e Estatística / Subárea: Estatística/Especialidade: Séries Temporais.
Organização de eventos
LIMA, E. B. . XIII Maratona de Programação da SBC/ACM. 2008. (Outro).
Participação em eventos
ISCB-Latin America x-Meeting in Bioinformatics with BSB and SoiBio. Flexibly Constrained Clustering for Imprecise Data Integration and Enzyme Functional Clustering. 2014. (Congresso).
Winter school "Algorithms in Structural Bioinformatics". 2013. (Outra).
International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - x-Meeting. Flexibly Constrained Enzyme Functional Clustering. 2012. (Congresso).
SIAM International Conference on Data Mining. Data Integration via Constrained Clustering: An Application to Enzyme Clustering. 2011. (Congresso).
X-Meeting - International Conference of the AB3C. Enzyme functional clustering with SVD and K-means. 2011. (Congresso).
53a Reunião Anual da Região Brasileira da Sociedade Internacional de Biometria - RBRAS. Análise das Séries de Índices de Preços Pagos e Recebidos por Agricultores do Município de Lavras, MG. 2008. (Congresso).
Escola de Verão do Laboratório Associado de Computação Aplicada - ELAC 2008. 2008. (Outra).
XXI Congresso de Iniciação Científica da UFLA. studo Temporal das Séries Componentes do Índice de Preços Recebidos por Agricultores de Lavras-MG e Região. 2008. (Congresso).
1a Semana Acadêmica da UFLA. 2007. (Outra).
52ª RBRAS e 12º SEAGRO. 2007. (Simpósio).
Encontro Mineiro de Software Livre. 2007. (Encontro).
Encontro Mineiro de Software Livre. 2007. (Encontro).
IV Simpósio Mineiro de Sistemas de Informação. 2007. (Simpósio).
VI Escola Regional de Informática de Minas Gerais. 2007. (Outra).
VII Encontro Mineiro de Estatística.Um Modelo de Previsão para Índices de Leite e Derivados no Brasil. 2007. (Encontro).
VII SECICOM - Semana da Ciência da Computação. 2007. (Simpósio).
XX Congresso de Iniciação Científica da UFLA. Análise da Série de Índices de Preço de Leite e Derivados no Brasil. 2007. (Congresso).
Produções bibliográficas
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BOARI DE LIMA, ELISA ; MEIRA, WAGNER ; MELO-MINARDI, RAQUEL CARDOSO DE . Isofunctional Protein Subfamily Detection Using Data Integration and Spectral Clustering. PLOS Computational Biology (Online) , v. 12, p. e1005001, 2016.
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SILVEIRA, SABRINA A ; FASSIO, ALEXANDRE V ; GONÇALVES-ALMEIDA, VALDETE M ; DE LIMA, ELISA B ; BARCELOS, YUSSIF T ; ABURJAILE, FLÁVIA F ; RODRIGUES, LAERTE M ; MEIRA JR, WAGNER ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL C . VERMONT: Visualizing mutations and their effects on protein physicochemical and topological property conservation. BMC Proceedings , v. 8, p. S4, 2014.
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LIMA, E. B. ; MELO-MINARDI, R. C. ; MEIRA JR., W. ; ZAKI, M. J. . Data Integration via Constrained Clustering: An Application to Enzyme Clustering. In: SIAM International Conference on Data Mining, 2011, Mesa, Arizona. 2011 SIAM International Conference on Data Mining, 2011. p. 83-94.
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LIMA, E. B. ; PAPPA, G. L. ; ALMEIDA, J. M. ; GONÇALVES, M. A. ; MEIRA JR., W. . Tuning Genetic Programming Parameters with Factorial Designs. In: IEEE Congress on Evolutionary Computation (CEC), 2010, Barcelona. Proc. of the IEEE Congress on Evolutionary Computation (CEC), 2010. p. 4457-4464.
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LIMA, E. B. ; MELO-MINARDI, R. C. ; MEIRA JR., W. . Fleixlby Constrained Clustering for Imprecise Data Integration and Enzyme Functional Clustering. In: ISCB-Latin America x-Meeting in Bioinformatics wih BSB and SoiBio, 2014, Belo Horizonte. ISCB-Latin America x-Meeting in Bioinformatics wih BSB and SoiBio, 2014.
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SILVEIRA, S. A. ; FASSIO, A. V. ; GONCALVES-ALMEIDA, V. M. ; LIMA, E. B. ; BARCELOS, Y. T. ; ABURJAILE, F. F. ; RODRIGUES, L. M. ; MEIRA JR., W. ; MELO-MINARDI, R. C. . VERMONT: Visualizing mutations and their effects on protein physicochemical and topological property conservation. In: IEEE Symposium on Biological Data Visualization, 2013, Atlanta. Proceedins of the 3rd IEEE Symposium on Biological Data Visualization, 2013.
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LIMA, E. B. ; MELO-MINARDI, R. C. ; MEIRA JR., W. . Flexibly Constrained Enzyme Functional Clustering. In: International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2012, Campinas. International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2012.
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LIMA, E. B. ; SANTOS, M. A. ; MELO-MINARDI, R. C. ; MEIRA JR., W. . Enzyme functional clustering with SVD and K-means. In: X-Meeting - International Conference of the AB3C, 2011, Florianópolis, SC. X-Meeting 2011 - 7th International Conference of the AB3C, 2011.
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LIMA, E. B. ; SAFADI, T. ; GONCALVES, L. R. . Análise das Séries de Índices de Preços Pagos e Recebidos por Agricultores do Município de Lavras, MG. In: 53a Reunião Anual da Região Brasileira da Sociedade Internacional de Biometria - RBRAS, 2008, Lavras, MG. 53a Reunião Anual da RBRAS. Lavras, MG: Editora UFLA, 2008. p. 57-57.
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LIMA, E. B. ; SAFADI, T. ; GONCALVES, L. R. . Estudo Temporal dos Componentes do Índice de Preços Recebidos por Agricultores de Lavras-MG e Região. In: XXI Congresso de Iniciação Científica da UFLA, 2008, Lavras. XXI Congresso de Iniciação Científica da UFLA, 2008.
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LIMA, E. B. ; GONCALVES, L. R. ; SAFADI, T. . Um Modelo de Previsão para Índices de Leite e Derivados no Brasil. In: VII Encontro Mineiro de Estatística, 2007, Lavras, MG. VII Encontro Mineiro de Estatística:. Lavras, MG: Editora UFLA, 2007. p. 70-70.
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LIMA, E. B. ; SAFADI, T. ; GONCALVES, L. R. . Análise da Série de Índices de Preço de Leite e Derivados no Brasil. In: XX Congresso de Iniciação Científica da UFLA, 2007, Lavras. XX Congresso de Iniciação Científica da UFLA, 2007.
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LIMA, E. B. . Agrupamento Funcional de Enzimas Mediante Integração de Dados por Meio de Restrições. 2013. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
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LIMA, E. B. ; SAFADI, T. ; GONCALVES, L. R. . Análise das Séries de Índices de Preços Pagos e Recebidos por Agricultores do Município de Lavras, MG. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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LIMA, E. B. ; SAFADI, T. ; GONCALVES, L. R. . Estudo Temporal dos Componentes do Índice de Preços Recebidos por Agricultores de Lavras-MG e Região. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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LIMA, E. B. ; GONCALVES, L. R. ; SAFADI, T. . Um Modelo de Previsão para Índices de Leite e Derivados no Brasil. 2007. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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LIMA, E. B. ; SAFADI, T. ; GONCALVES, L. R. . Análise da Série de Índices de Preço de Leite e Derivados no Brasil. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
Projetos de pesquisa
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2008 - 2008
Identificação de Padrões em Mosaicos de Proteínas do Trypanosoma cruzi, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Elisa Boari de Lima - Integrante / Thiago de Souza Rodrigues - Coordenador / André de Souza Gomes - Integrante.
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2007 - 2008
Sazonalidade nos Índices de Preços Setoriais Agrícolas do Município de Lavras, MG, Descrição: Na revisão sobre preços de produtos agrícolas e alimentícios observa-se um certo concenso sobre a existência de sazonalidade. Porém, são poucos os estudos sobre a questão das variações sazonais das séries de índices de preços agrícolas pagos e recebidos pelos produtores rurais. O conhecimento das variações sazonais dos preços agrícolas é de grande importância principalmente tendo em vista os movimentos de oferta e demanda. O índice de preços agrícolas para o município de Lavras, MG, e região, por exemplo, é calculado pelo Departamento de Administração e Economia - DAE - da Universidade Federal de Lavras - UFLA -, desde o ano de 1994. No entanto, ainda não existem estudos sobre as flutuações sazonais presentes nessa série e nos seus componentes. Dessa forma, este estudo tem por objetivo identificar e analisar os fatores sazonais dos preços agrícolas pagos (IPR - Índice de Preços Recebidos) e recebidos (IPP - Índice de Preços Pagos) pelos produtores rurais do município de Lavras e região. O presente estudo tem como objetivo principal avaliar o eventual comportamento sazonal dos índices de preços agrícolas e dos itens que o compõe no município de Lavras, MG. Além desse objetivo principal, os seguintes objetivos mais específicos são perseguidos: a) Testar e identificar as componentes sazonais presentes nas séries de índices de preços agrícolas (IPR e IPP). b) Testar e identificar as componentes sazonais de cada uma das séries de preços que compõem os índices de preços agrícolas (IPP e IPR). c) Obter as séries índices de preços agrícolas (IPP e IPR) dessazonalizadas de forma direta e indireta a partir dos itens de preços que as compõem. d) Comparar os dois procedimentos de dessazonalização das séries índices de preços agrícolas (IPP e IPR) de forma direta e indireta. e) Avaliar o efeito dos fatores sazonais dos preços dos itens que compõem o índice de preços agrícolas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Elisa Boari de Lima - Integrante / Thelma Sáfadi - Coordenador / Pedro Luiz Costa Carvalho - Integrante / Hiron Pereira Farias - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro.
Prêmios
2013
BioVis 2013 - Data Contest Biology Experts Pick, IEEE Computer Society.
2010
5 Melhores Trabalhos da Semana de Seminários do Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação, Departamento de Ciência da Computação da Universidade Federal de Minas Gerais.
2008
Aluna Destaque da turma de 2008/2 do curso de Bacharelado em Ciência da Computação da Universidade Federal de Lavras - UFLA, Sociedade Brasileira de Computação.
Histórico profissional
Experiência profissional
2011 - Atual
Universidade Federal de Minas GeraisVínculo: Aluna de Doutorado, Enquadramento Funcional: Bolsista CAPES, Regime: Dedicação exclusiva.
2009 - 2011
Universidade Federal de Minas GeraisVínculo: Aluna de Mestrado, Enquadramento Funcional: Bolsista CAPES, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
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03/2009
Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação.,Linhas de pesquisa
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03/2010 - 07/2010
Estágios , Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação.,Estágio realizado, Estágio em Docência na disciplina de graduação Algoritmos e Estruturas de Dados II.
2008 - 2008
Universidade Federal de LavrasVínculo: Livre, Enquadramento Funcional: Aluna de Iniciação Científica Voluntária, Carga horária: 20
Outras informações:
Iniciação Científica no Departamento de Ciência da Computação da Universidade Federal de Lavras Área: Bioinformática
2007 - 2008
Universidade Federal de LavrasVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Aluna de Iniciação Científica, Carga horária: 20
Outras informações:
Iniciação Científica no Departamento de Ciências Exatas na Universidade Federal de Lavras Área: Estatística - Sub-área: Séries Temporais. Bolsista FAPEMIG
Atividades
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05/2008 - 12/2008
Direção e administração, Departamento de Ciência da Computação, Ninho Digital - Núcleo de Estudos em Tecnologia da Informação.,Cargo ou função, Diretora Financeira.
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06/2008 - 07/2008
Serviços técnicos especializados , Comissão Permanente de Processo Seletivo, .,Serviço realizado, Membro da Banca de Aplicação das Provas do 2o Processo Seletivo - Vestibular de 2008 da UFLA.
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11/2007 - 12/2007
Serviços técnicos especializados , Comissão Permanente de Processo Seletivo, .,Serviço realizado, Membro da Banca de Aplicação das Provas no 1o Processo Seletivo de 2008 da UFLA.
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06/2007 - 07/2007
Serviços técnicos especializados , Comissão Permanente de Processo Seletivo, .,Serviço realizado, Membro da Banca de Aplicação das Provas no 2o Processo Seletivo de 2007 da UFLA.
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11/2006 - 12/2006
Serviços técnicos especializados , Comissão Permanente de Processo Seletivo, .,Serviço realizado, Membro Participante da Banca de Aplicação das Provas no 1o Processo Seletivo de 2007 e da 2a Etapa do Processo Seletivo de Avaliação Seriada da UFLA.
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06/2006 - 07/2006
Serviços técnicos especializados , Comissão Permanente de Processo Seletivo, .,Serviço realizado, Membro da Banca de Aplicação das Provas no 2o Processo Seletivo de 2006 da UFLA.
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11/2005 - 12/2005
Serviços técnicos especializados , Comissão Permanente de Processo Seletivo, .,Serviço realizado, Membro da Banca de Aplicação das Provas no 1o Processo Seletivo de 2006 da UFLA.
2010 - 2010
Rensselaer Polytechnic InstituteVínculo: Pesquisador Visitante, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 40
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