Cristiane de Santis Alves

Pós-doutorado

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• SHIBURAH, MARK E. ; DE OLIVEIRA, BEATRIZ CRISTINA D. ; BISETEGN, HABTYE ; DE OLIVEIRA, LEILANE S. ; PASSOS, ARTHUR O. ; SILVA, DÉBORA A. ; ASSIS, LUIZ HENRIQUE C. ; ALVES, CRISTIANE S. ; ERNST, EVAN ; MENA-BARRETO, RUBEM ; BATISTA, MARCOS M. ; SOEIRO, MARIA DE NAZARÉ C. ; MENOZZI, BENEDITO D. ; LANGONI, HELIO ; AOKI, JULIANA I. ; COELHO, ADRIANO C. ; MIRANDA JUNIOR, ADALBERTO S. ; MACHADO, CARLOS RENATO ; CANO, MARIA ISABEL N. . The absence of the Leishmania major telomerase TERT component links telomeres and cell homeostasis with infectivity. INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES , v. 323, p. 147036, 2025.

• BERUBE, BENJAMIN ; ERNST, EVAN ; CAHN, JONATHAN ; ROCHE, BENJAMIN ; DE SANTIS ALVES, CRISTIANE ; LYNN, JASON ; SCHEBEN, ARMIN ; GRIMANELLI, DANIEL ; SIEPEL, ADAM ; ROSS-IBARRA, JEFFREY ; KERMICLE, JERRY ; MARTIENSSEN, ROBERT A. . Teosinte Pollen Drive guides maize diversification and domestication by RNAi. NATURE , v. 1, p. 1, 2024.

• DE OLIVEIRA, BEATRIZ CRISTINA DIAS ; SHIBURAH, MARK EWUSI ; ASSIS, LUIZ HENRIQUE CASTRO ; FONTES, VERONICA SILVA ; BISETEGN, HABTYE ; DE OLIVEIRA PASSOS, ARTHUR ; DE OLIVEIRA, LEILANE S. ; DE SANTIS ALVES, CRISTIANE ; ERNST, EVAN ; MARTIENSSEN, ROB ; GALLO-FRANCISCO, PEDRO HENRIQUE ; GIORGIO, SELMA ; BATISTA, MARCOS MEUSER ; DE NAZARÉ CORREIA SOEIRO, MARIA ; MENNA-BARRETO, RUBEM FIGUEIREDO SADOK ; AOKI, JULIANA IDE ; COELHO, ADRIANO CAPPELLAZZO ; CANO, MARIA ISABEL NOGUEIRA . Leishmania major telomerase RNA knockout: From altered cell proliferation to decreased parasite infectivity. INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES , v. 1, p. 135150, 2024.

• HERRIDGE, ROWAN P. ; DOLATA, JAKUB ; MIGLIORI, VALENTINA ; DE SANTIS ALVES, CRISTIANE ; BORGES, FILIPE ; SCHORN, ANDREA J. ; VAN EX, FRÉDÉRIC ; LIN, ANN ; BAJCZYK, MATEUSZ ; PARENT, JEAN-SEBASTIEN ; LEONARDI, TOMMASO ; HENDRICK, ALAN ; KOUZARIDES, TONY ; MARTIENSSEN, ROBERT A. . Pseudouridine guides germline small RNA transport and epigenetic inheritance. NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY (ONLINE) , v. 1, p. 1, 2024.

• CAHN, JONATHAN ; REGULSKI, MICHAEL ; LYNN, JASON ; ERNST, EVAN ; DE SANTIS ALVES, CRISTIANE ; RAMAKRISHNAN, SRIVIDYA ; CHOUGULE, KAPEEL ; WEI, SHARON ; LU, ZHENYUAN ; XU, XIAOSA ; RAMU, UMAMAHESWARI ; DRENKOW, JORG ; KRAMER, MELISSA ; SEETHARAM, ARUN ; HUFFORD, MATTHEW B. ; MCCOMBIE, W. RICHARD ; WARE, DOREEN ; JACKSON, DAVID ; SCHATZ, MICHAEL C. ; GINGERAS, THOMAS R. ; et.al . MaizeCODE reveals bi-directionally expressed enhancers that harbor molecular signatures of maize domestication. Nature Communications , v. 15, p. 10854, 2024.

• DE OLIVEIRA, BEATRIZ C. D. ; SHIBURAH, MARK E. ; PAIVA, STEPHANY C. ; VIEIRA, MARINA R. ; MOREA, EDNA GICELA O. ; DA SILVA, MARCELO SANTOS ; ALVES, Cristiane de Santis ; SEGATTO, MARCELA ; GUTIERREZ-RODRIGUES, FERNANDA ; BORGES, JÚLIO C. ; CALADO, RODRIGO T. ; CANO, MARIA ISABEL N. . Possible Involvement of Hsp90 in the Regulation of Telomere Length and Telomerase Activity During the Leishmania amazonensis Developmental Cycle and Population Proliferation. FRONTIERS IN CELL AND DEVELOPMENTAL BIOLOGY , v. 9, p. 713415, 2021.

• ALVES, CRISTIANE S. ; NOGUEIRA, FABIO T. S. . Plant Small RNA World Growing Bigger: tRNA-Derived Fragments, Longstanding Players in Regulatory Processes. FRONTIERS IN MOLECULAR BIOSCIENCES , v. 8, p. 638911, 2021.

• MOREA, EDNA GICELA ORTIZ ; VASCONCELOS, ELTON JOSE ROSAS ; ALVES, Cristiane de Santis ; GIORGIO, SELMA ; MYLER, PETER J. ; LANGONI, HELIO ; AZZALIN, CLAUS MARIA ; CANO, MARIA ISABEL NOGUEIRA . Exploring TERRA during Leishmania major developmental cycle and continuous in vitro passages. INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES , v. 174, p. 573-586, 2021.

• ALVES, CRISTIANE S. ; Vicentini, Renato ; DUARTE, GUSTAVO T. ; PINOTI, VITOR F. ; VINCENTZ, MICHEL ; NOGUEIRA, FABIO T. S. . Genome-wide identification and characterization of tRNA-derived RNA fragments in land plants. Plant Molecular Biology , v. 93, p. 35-48, 2016.

• Domingues, Douglas S ; Cruz, Guilherme MQ ; Metcalfe, Cushla J ; Nogueira, Fabio TS ; Vicentini, Renato ; ALVES, Cristiane de Santis ; Van Sluys, Marie-Anne . Analysis of plant LTR-retrotransposons at the fine-scale family level reveals individual molecular patterns. BMC GENOMICS , v. 13, p. 137, 2012.

• ALVES, CRISTIANE S. . An Overview of the Epigenetic Landscape of the Male Germline. Epigenetics in Plants of Agronomic Importance: Fundamentals and Applications. 2ed.: Springer International Publishing, 2019, v. , p. 355-380.

• Gady, Antoine L. F. ; ALVES, CRISTIANE S. ; NOGUEIRA, FABIO T. S. . Epigenetics in Plant Reproductive Development: An Overview from Flowers to Seeds. In: Nikolaus Rajewsky; Stefan Jurga; Jan Barciszewski. (Org.). RNA Technologies. 1ed.: Springer International Publishing, 2017, v. 3, p. 329-357.

• ALVES, Cristiane de Santis ; Nogueira, Fabio TS . Fragmentos derivados de tRNA (tRFs e tiRNAs). In: Tiago Campos Pereira. (Org.). Introdução ao universo dos non-coding RNA.. 1ed.: , 2017, v. 1, p. 148-153.

• PEREIRA, T. C. ; ALVES, Cristiane de Santis ; SILVA, G. F. F. E. ; ORTIZ-MOREA, F. A. ; NOGUEIRA, F. T. S. . Mecanismos de ação de microRNAs. In: Tiago Campos Pereira. (Org.). Introdução ao mundo dos microRNAs. 1ed.: CUBO, 2015, v. , p. 1-13.

• NOGUEIRA, F. T. S. ; Alves, Cristiane S ; FERREIRA, PC . RNA activation e outros efeitos mediados por dsRNA. In: Tiago Campos Pereira. (Org.). Introdução à Técnica de Interferência por RNA - RNAi. 1ed.: SOCIEDADE BRASILEIRA DE GENÉTICA, 2013, v. , p. 101-115.

• ALVES, Cristiane de Santis ; RAMOS, O. M. ; KRAMER, MELISSA ; RAMAKRISHNAN, SRIVIDYA ; SONDERVAN, V. M. ; ESHEL, G. ; VARALA, K. ; KOLOKOTRONIS, S-O. ; FRANGOS, S. ; ZUMAJO-CARDONA, C. ; LITTLE, D. P. ; KATARI, M. S. ; CROFT, L. J. ; MCPHERSON, H. ; ROSSETTO, M. ; GOODWIN, S. ; AMBROSE, B. ; STEVENSON, D. W. ; CORUZZI, G. M. ; SCHATZ, M. ; et.al . Living fossils: the Wollemi pine genome and insights into genomic and epigenomic evolution. In: Advances in Genome Biology and Technology (AGBT), 2022, San Diego. AGBT, 2022.

• Morea, EGO ; VASCONCELOS, E. J. R. ; ALVES, Cristiane de Santis ; AZZALIN, C. A. ; MYLER, P. ; CANO, M. I. N. . Expression of Telomeric Repeat-containing RNA (TERRA) at Leishmania spp. chromosome ends. In: EMBO Workshop: Nuclear function and cell fate choice, 2016, Kyllini. EMBO Workshop Nuclear function and cell fate choice, 2016.

• Alves, Cristiane S ; KHODDAMI, V. ; DOTTO, M. ; CAIRNS, B. ; TIMMERMANS, M. ; NOGUEIRA, F. T. S. . Discovering the enigmatic DNMT2 in Arabidopsis thaliana: more than a tRNA cytosine methyltransferase. In: 26th International Conference on Arabidopsis Research, 2015, Paris. 26th International Conference on Arabidopsis Research, 2015.

• Alves, Cristiane S ; Pinoti, FV ; VICENTINI, R. ; NOGUEIRA, F. T. S. . Possible pathways for tRNA-derived small RNAs in plants. In: Keystone Symposia meeting on RNA Silencing, 2013, Whistler. Keystone Symposia meeting on RNA Silencing, 2013.

• ALVES, Cristiane de Santis ; Pinoti, FV ; NOGUEIRA, F. T. S. . Evidences for biogenesis pathway of tRNA-derived fragments (tRFs) in plants. In: MicroRNA 2012 Internacional Symposium, 2012, São Paulo. MicroRNA 2012 Internacional Symposium, 2012.

• ARAÚJO LINHARES, L.S. ; TANIWAKE, S.A. ; ALVES, Cristiane de Santis ; ARAUJO JUNIOR, J. P. . Standardization of random PCR method for ophidian Paramyxovirus whole genome sequencing.. In: XXI Encontro Nacional de Virologia, 2010, Gramado. XXI Encontro Nacional de Virologia, 2010.

• GUILHERME, G. R. B. ; SOUZA, A. V. G. ; PECORARO, D. O. ; SABINO, J. S. ; ALVES, Cristiane de Santis ; LIMA, P. V. ; CONEGLIAN, J. ; DEFFUNE, E. . Controle de Qualidade de Hematócrito de Ponta de Dedo. In: HEMO 2007, 2007, São Paulo. Revista Brasileira de Hematologia e Hemoterapia, 2007. v. 29. p. 275-275.

• Hokama, P. O. M. ; CAPANNACCI, Juliana ; Franco, E. M. ; ALVES, Cristiane de Santis ; Pardini, M. I. M. C. ; SOUZA, M. ; MAUAD, M. A. ; Colturato, V. A. R. . Doença Residual Mínima em Leucemia Mielóide Crônica. In: HEMO 2007, 2007, São Paulo. Revista Brasileira de Hematologia e Hemoterapia, 2007. v. 29. p. 179-180.

• ALVES, Cristiane de Santis ; CAPANNACCI, Juliana ; Hokama, P. O. M. ; Colturato, V. A. R. ; Pardini, M. I. M. C. . Mutation Detection in bcr/abl Gene in Pacients with Chronic Myeloid Leukemia Resistant to Imatinib Mesilat.. In: III Encontro de Pós-Graduação da Faculdade de Medicina de Botucatu - UNESP, 2007, Botucatu. J. Venom. Anim. Toxins Incl. Trop. Dis.., 2007. v. 13. p. 978.

• ALVES, Cristiane de Santis ; MARINO, Celso Luis ; CHAVES, Raul . AVALIAÇÃO DE DIVERSIDADE GENÉTICA EM UMA POPULAÇÃO BASE DE Eucalyptus grandis PARA MELHORAMENTO. In: 52º Congresso Brasileiro de Genética, 2006, Foz do Iguaçu. 52º Congresso Brasileiro de Genética, 2006.

• ALVES, Cristiane de Santis ; MARINO, Celso Luis ; CAMPOS, Henrique Luís Veronezi de ; SANTOS, Alex P ; CHAVES, Raul . A Aplicação de Marcadores Moleculares ma Identificação de Clones de Eucaliptos.. In: 51º Congresso Brasileiro de Genética, 2005, Águas de Lindóia. 51º Congresso Brasileiro de Genética, 2005.

• ALVES, Cristiane de Santis ; BORTOLOTO, Tânia Mara ; MADEIRA, Newton G ; MARINO, Celso Luis . ANALISE DE BULKED SEGREGANT ANALYSIS (BSA) EM MOSQUITOS Aedes aegypti CONTRASTANTES À TOLERÂNCIA AO FRIO.. In: 50º Congresso Brasileiro de Genética, 2004, Florianópolis. 50º Congresso Brasileiro de Genética, 2004.

• ALVES, Cristiane de Santis ; MARINO, Celso Luís ; COSCRATO, Virgínia Elias ; SELIVON, Denise ; PERONDINI, André L. P. . ANÁLISE DAS SEQUÊNCIAS DE NUCLEOTÍDEOS DOS ESPAÇADORES TRANSCRITOS INTERNOS(ITS) EM Anastrepha sp.. In: XV Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2003, Marília. XV Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2003.

• Alves, CS . Pequenos RNAs, elementos de transposição e grandes genomas: Wollemia nobilis, a árvore ?dinossauro? , e seus insights para uma melhor compreensão da regulação genômica e evolução das plantas. 2025. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• Alves, CS . Small RNAs, transposable elements, and big genomes: the dinosaur tree Wollemia nobilis and its insights towards a better understanding of plant genomic regulation and evolution. 2025. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• Alves, Cristiane S . Small RNAs, transposable elements, and big genomes: Wollemia nobilis and its insights towards a better understanding of plant genomic regulation and evolution.. 2021. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Alves, Cristiane S . DNA metiltransferases na Regulação Gênica. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• ALVES, Cristiane de Santis . DNA metiltransferase 2 (DNMT2) em plantas: possível papel no desenvolvimento, resposta a estresses e na geração de pequenos RNAs derivados de tRNA. 2011. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• ALVES, Cristiane de Santis ; Pinoti, FV ; NOGUEIRA, F. T. S. . Evidences for biogenesis pathway of tRNA-derived fragments (tRFs) in plants. 2011. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• CAHN, J. ; REGULSKI, M. ; LYNN, J. ; ERNST, E. ; Alves, Cristiane S ; RAMAKRISHNAN, S. ; CHOUGULE, K. ; WEI, S. ; LU, Z. ; XU, X. ; DRENKOW, J. ; KRAMER, M. ; SEETHARAM, A. ; HUFFORD, M. B. ; MCCOMBIE, W. R. ; WARE, D. ; JACKSON, D. ; SCHATZ, M. ; GINGERAS, T. R. ; MARTIENSSEN, R. A. ; et.al . MaizeCODE reveals bi-directionally expressed enhancers that harbor molecular signatures of maize domestication.. BioRXiv, 2024 (Pre print).

• HERRIDGE, R. P. ; DOLATA, J. ; MIGLIORI, V. ; ALVES, Cristiane de Santis ; BORGES, F. ; EX, F. V. ; LIN, A. ; BAJCZYK, M. ; LEONARDI, T. ; HENDRICK, A. ; SCHORN, A. J. ; KOUZARIDES, T. ; MARTIENSSEN, R. A. . Pseudouridine guides germline small RNA transport and epigenetic inheritance. BioRXiv, 2023 (Pre print).

• BERUBE, B. ; ERNST, E. ; CAHN, J. ; ROCHE, B. ; ALVES, Cristiane de Santis ; LYNN, J. ; SCHEBEN, A. ; SIEPEL, A. ; ROSS-IBARRA, J. ; KERMICLE, J. ; MARTIENSSEN, R. A. . Teosinte Pollen Drive guides maize domestication and evolution by RNAi.. BioRXiv, 2023 (Pre print).

• ALVES, CRISTIANE S. ; STEVENSON, D. W. ; RAMAKRISHNAN, S. ; COELHO, L. A. ; KRAMER, M. ; GOODWIN, S. ; RAMOS, O. M. ; ESHEL, G. ; SONDERVAN, V. M. ; FRANGOS, S. ; ZUMAJO-CARDONA, C. ; JENIKE, K. ; OU, S. ; WANG, X. ; LEE, Y. P. ; LOKE, S. ; ROSSETTO, M. ; MCPHERSON, H. ; NIGRIS, S. ; MOSCHIN, S. ; et.al . The genome of the Wollemi pine, a critically endangered ?living fossil? unchanged since the Cretaceous, reveals extensive ancient transposon activity. Cold Spring Harbor: BioRXiv, 2023 (Pre print).

• Alves, Cristiane S . Telômeros: as extremidades que regulam a vida 2017 (Divulgação Científica).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2021 - Atual

  NSF- New York Plant Genomics Consortium - Living Fossils, Descrição: The term living fossil was coined by Darwin in the Origin of Species where he wrote: ...and in fresh water we find some of the most anomalous forms now known in the world as the Ornithorhynchus and Lepidosiren which, like fossils, connect to certain extant orders at present widely sundered in the natural scale. These anomalous forms may be called living fossils; they have endured to the present day from having inhabited a confined area and from having been exposed to less varied and therefore less severe, competition. The gymnosperm living fossils - the earliest of which appeared in the Devonian - have survived an incredibly diverse and changing combination of environmental conditions, including mass extinctions. Thus, these gymnosperm species fit a more modern definition of a living fossil as an ancient species that has not radiated to produce any new species and has remained relatively unchanged over an enormous course of time. Currently, there are four extant gymnosperm lineages [5,6], three of which contain both living fossils and radiated lineages: Cycadales + Ginkgoales; Conifers I (Pinales); Conifers II (Araucariales + Cupressales); and Gnetales. However, the precise phylogenetic relationships of these gymnosperm clades have been the focus of intense debate, particularly the Gnetales. An NSF-funded Gymnosperm Tree of Life (ToL) project used a select set of genes to classify the gymnosperms, while our NSF-funded PGRP Project on seed plant genomes used 22,833 orthologs. Unfortunately, the phylogenetic placement of the Gnetales is inconsistently reconstructed across these various trees. Our proposed study on gymnosperm genomes should fill this important knowledge gap in the evolution of seed plants, and put this important evolutionary question to rest.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Cristiane de Santis Alves - Integrante / Rob Martienssen - Coordenador.

• 2018 - Atual

  Pollen small RNA, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Cristiane de Santis Alves - Coordenador / Rob Martienssen - Integrante.

• 2011 - Atual

  DNA metiltransferase 2 (DNMT2) em plantas: possível papel no desenvolvimento, resposta a estresses e na geração de pequenos RNAs derivados de tRNA, Descrição: A metilação do DNA está relacionada à regulação gênica, memória celular, silenciamento de elementos transponíveis, imprinting genômico e repressão de falsos elementos provenientes de sequências duplicadas. Os padrões de metilação são estabelecidos, mantidos e traduzidos em estados funcionais apropriados da maquinaria de metilação do DNA, o que inclui uma família classificada em três grupos de enzimas do tipo metiltransferases: DNMT1, DNMT3 e DNMT2. A DNA metiltransferase 2 (DNMT2) foi identificada na busca de novos candidatos à uma segunda DNA metiltransferase. Esta enzima não possui função biológica definida, porém, é capaz de metilar tanto DNA quanto RNA, em especial RNA transportadores (tRNAs). A DNMT2 está localizada tanto no núcleo quanto no citoplasma em células humanas, sendo capaz de migrar do núcleo para o citoplasma em situações de estresse. É no citoplasma que a enzima irá metilar o tRNA, possivelmente para protegê-lo contra clivagens em situação de estresse. Quando estas clivagens ocorrem de forma específica, pequenos fragmentos de RNA são gerados, fato observado em diversas espécies, incluindo espécies vegetais. Aparentemente, estes fragmentos de RNA fazem parte de uma nova via de interferência por RNA. Esta nova classe de pequenos RNAs aparenta estar relacionada a resposta à diferentes tipos de estresses. Contudo, seu papel biológico ainda não foi revelado. O objetivo deste trabalho é identificar as interações entre a DNMT2 e os fragmentos de RNA derivados de tRNA e suas possíveis funções biológicas em plantas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Cristiane de Santis Alves - Integrante / Fábio Tebaldi Silveira Nogueira - Coordenador.

• 2009 - 2010

  Comparação entre dois alvos para diagnóstico molecular de Leishmaniose Visceral Canina., Descrição: De uma forma geral, o diagnóstico da LVC vem se apresentando como um problema para os serviços de saúde pública. A problemática deve-se a variedade de sinais clínicos semelhantes às observadas em outras doenças infecciosas, a alterações histopatológicas inespecíficas e a inexistência de um teste diagnóstico 100% específico e sensível. No Brasil, o diagnóstico laboratorial da doença canina é semelhante ao realizado na doença humana, podendo ser baseado no exame parasitológico ou sorológico. Métodos de diagnóstico, como o a PCR (reação em cadeia da polimerase), constituem uma nova perspectiva para o diagnóstico da leishmaniose visceral, pois podem chegar a 94% de sensibilidade. Contudo, seus resultados dependem de diversas variáveis envolvidas, entre elas podemos destacar o tipo de amostra, alvo do DNA utilizado para amplificação, método de extração do DNA e a procedência do animal. Muitos estudos foram realizados com sucesso no Velho Mundo e com diversas espécies do parasito pela PCR, contudo pouco se sabe sobre o diagnóstico molecular de Leishmaniose Visceral em cães. A comparação entre dois alvos distintos para a PCR, o kDNA e a região ITS-1, se faz necessária, a fim de identificar o melhor alvo diagnóstico para a doença em cães, já que no Brasil, poucos estudos foram realizados e há a possibilidade de existirem outros protozoários que possam reagir cruzadamente com a Leishmania. Assim, o presente trabalho tem por objetivo comparar a PCR dirigida contra o kDNA com aquela dirigida contra a região cromossômica ITS com finalidade diagnóstica em estudo retrospectivo com amostras de DNA de cães de diferentes localidades no Brasil.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Cristiane de Santis Alves - Integrante / João Pessoa Araújo Júnior - Coordenador / Paulo Eduardo Martins Ribolla - Integrante., Financiador(es): Fundação do Institutode Biociências - Auxílio financeiro.

Projetos de desenvolvimento

• 2024 - 2025

  Desenvolvimento de tecnologias críticas para viabilizar o uso de siRNAs sintéticos em proteção de cultivos., Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Cristiane de Santis Alves - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1

Prêmios