Sérgio Vale Aguiar Campos

possui graduação em Ciência da Computação pela Universidade Federal de Minas Gerais (1986), mestrado em Ciências da Computação pela Universidade Federal de Minas Gerais (1990), mestrado em Ciência da Computação - Carnegie Mellon University (1992) e doutorado em Ciência da Computação - Carnegie Mellon University (1996). Atualmente é professor associado da Universidade Federal de Minas Gerais. Tem experiência na área de Ciência da Computação, atuando principalmente nos seguintes temas: symbolic model checking, verificacao formal, sistemas de tempo real, algoritmos simbolicos. Atua também em pesquisa na área de Bioinformática, trabalhando com sistemas de gerência de dados biológicos, ou Laboratory Information Management Systems.

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Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Ciência da Computação

1990 - 1996

Carnegie Mellon University
Título: A Quantitative Approach to the Formal Verification of Real-Time Systems
Orientador: Edmund M Clarke

Mestrado em Ciência da Computação

1990 - 1992

Carnegie Mellon University
Título: Mestrado sem dissertação,Ano de Obtenção: 1992
Orientador: Idem acima
Grande área: Ciências Exatas e da Terra

Mestrado em Ciências da Computação

1987 - 1990

Universidade Federal de Minas Gerais
Título: Um Algoritmo para Exclusão Mútua e sua Implementação,Ano de Obtenção: 1990
Orientador: Osvaldo Sérgio Farhat de Carvalho

Graduação em Ciência da Computação

1983 - 1986

Universidade Federal de Minas Gerais

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Pós-doutorado

2019

Pós-Doutorado. , Massachusetts Institute of Technology, MIT, Estados Unidos. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

1996 - 1997

Pós-Doutorado. , Carnegie Mellon University, CMU, Estados Unidos. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra

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Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

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Áreas de atuação

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação/Especialidade: Linguagem Formais e Autômatos.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática/Especialidade: Armazenamento e Análise de Dados Biológicos.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação.

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Organização de eventos

Campos, Sérgio . Brazilian Symposium on Bioinformatics. 2015. (Congresso).

Campos, Sérgio V.A. ; OLIVEIRA, G. . Brazilian Symposium on Bioinformatics. 2014. (Congresso).

OLIVEIRA, G. ; Campos, Sérgio . Meeting of the International Society for Computational Biology, Latin America. 2014. (Congresso).

OLIVEIRA, G. ; Campos, Sérgio . 10th International Conference of the AB3C, Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional. 2014. (Congresso).

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Participação em bancas

Aluno: Gabriel A Novillo

FERNANDEZ, L. B.;Campos, Sérgio. Definición de um patrón de diseo de um Cuadro de Mando Integral aplicado a Gobiernos Urbanos. 2016. Dissertação (Mestrado em Ciência da computação) - Universidad Nacional de San Luis.

Aluno: Handressa Pereira Fêu

GRANJEIRO, J. M.; FARIACAMPOS, Alessandra C;FLATSCHART, A. F.Campos, Sérgio. Desenvolvimento de Fluxos de Trabalho (Workflows) para Implementação de Boas Práticas de Laboratórios (BPL). 2015. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia.

Aluno: Raghid El Yafouri

KLIEB, L.;Campos, Sérgio. Electronic Medical Records Adoption and Use Understanding the Barriers and the Levels of Adoption for Physicians in the USA. 2015. Tese (Doutorado em Doctorate in Business Administration) - Grenoble Ecole de Management.

CAMPOS, S. V. A.; SIMAO, A. S.; MACHADO, P. D. L.. Presidência da Comissão de Avaliação para Promoção para Professor Titular. 2019. Universidade Federal de Pernambuco.

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Orientou

Alexandre Alphonso

Bioconceitos, Conceptual Design for Software para Softwares Médicos; Início: 2019; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais; (Orientador);

Ana Beatriz Delavia Thomasi

Um Sistema de Gestão de Dados de Qualidade do Leita; Início: 2017; Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais; (Orientador);

Mário Luiz Rodrigues Oliveira

Um Sistema de Tradução Simulink-SMV para Verificação de Modelos; Início: 2017; Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais; (Orientador);

Habib Asseis Neto

Análise de Dados de Experimentos de Proteômica; Início: 2017; Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais; (Orientador);

Herbert Rausch

Verificação Probabilística de Sistemas de Transporte de Íons; Início: 2017; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais; (Orientador);

Gabriel Domingo Vilallonga

Probabilistic Verification of Ion Transport Systems; Início: 2015; Tese (Doutorado em Ciência da computação) - Universidad Nacional de San Luis; (Orientador);

Juliana Silva Nunes

Otimização Bayesiana e Extreme Gradient Boosting Aplicados à Predição de Função de Proteína; 2019; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais,; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Paulo Henrique Batista

Desenvolvimento de uma Estrutura para Responsabilidade após-o-fato em um S-RES Adaptável; 2017; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais,; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Demian Bueno

BDDBlast, A Memory and Time Efficient Architecture for Pairwise Alignments; 2017; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais,; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Eduardo Ferreira Liboredo

Mineração de Dados Aplicada à dados Médicos; 2015; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais,; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Fernando Braz

Verificação Probabilística de Modelos para Modelagem e Análise de Interações de Toxinas com Sistemas de Transporte Transmembrânico de Íons; 2013; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Herbert Rausch Fernandes

BioBI, uma Ferramenta para Mineração de Dados em Bioinformática; 2012; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais,; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Alexandre Simões de Melo

SIGLa: Um LIMS baseado em workflows adaptáveis com suporte a múltiplos laboratórios; 2010; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais,; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Pedro de Carvalho Gomes

Abstrações semiautomáticas na verificação de modelos simétricos; 2010; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

João Ferreira D' Araújo e Oliveira

Super Nós em sistemas P2P de distribuição de mídia ao vivo; 2010; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Daniel Rezende Silveira

Síndrome-Fortuna:Uma abordagem viável para a geração de números pseudoaleatórios no linux; 2010; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais,; Coorientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Cristiano Santos Botelho

Definição de Visões em um LIMS Orientado a Fluxo de Trabalho para Gerenciamento de Dados e Processos Laboratoriais; 2010; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Mirlaine Aparecida Crepalde

ANÁLISE DO COMPORTAMENTO DE CANAIS IÔNICOS UTILIZANDO MODEL CHECKING SIMBÓLICO; 2009; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais,; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Daniel Oliveira Nascimento

Monitoração Avançada de Redes de Computadores de Grande Escala; 2007; Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação) - Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação - ICEx - UFMG,; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

João de Abreu e Tôrres

PCT - Uma Ferramenta para Anotação de Proteínas Utilizando Bases Secundárias; 2006; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais,; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Alex Borges Vieira

Sistema Gerador de Apresentações para Ensino a Distância; 2004; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais,; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Hugo Valentim barros

Um Algoritmo Distribuído para Verificação de Modelos com Fronteiras; 2004; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais,; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Alberto Rubens Beckler

Verificação Formal de Protocolos para Sistemas de Tempo Real Tolerantes a Falhas; 2003; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais,; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Guilherme Rocha Ribeiro

DEVICE ANYWHERE: Acesso Otimizado a Recursos em Sistemas Distribuídos; 2003; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais,; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Judson Santos Santiago

Particionamento Simbólico de Programas; 2003; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais,; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Lamarque Vieira Souza

Técnicas de Compartilhamento de Recursos no Ambiente Metasys; 2003; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais,; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Andre Luiz do Vale Soares

Verificação Formal em Aplicações de Reconhecimento de Ondas Eletrocardiográficas; 2002; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais,; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Tanara Lauschner

Verificação Formal e Análise de Protocolos de Roteamento de Redes Móveis Ad Hoc; 2002; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais,; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Eliseu Cesar Miguel

Overlay Construction Strategies for Peer-to-peer Live STreaming Systems; 2017; Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Bruno Ferreira

Análise Formal de Redes Veiculares com Verificação de Modelos Probabilística; 2016; Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

João Ferreira D' Araújo e Oliveira

Perdas de Pacotes em Redes P2P de Live Streaming; 2015; Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Alex Borges Vieira

Transmissão de Mídia Contínua ao Vivo em P2P: Modelagem, Caracterização e Implementação de Mecanismos de Resiliência a Ataques; 2010; Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais,; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Wesley Dias Maciel

Um Modelo para Descobertas Baseadas em Literatura Biológica - Uma Avaliação usando Patentes como Literatura de Referência; 2009; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Ruiter Braga Caldas

Modelagem, Verificação Formal e Codificação de Sistemas Reativos Autônomos; 2009; Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais,; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Maurício de Alvarenga Mudado

Uso da Base de Dados Secundária KOG como Ferramenta para Caracterização de Expressão Gênica e Mineração de Dados em Projetos Transcriptoma; 2007; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Doutorado em Bioinformática - ICB - UFMG, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Marcus Vinicius de Melo Rocha

Estratégias Híbridas para Transmissão de Mídia Contínua Interativa com Compartilhamento de Fluxo; 2007; Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computaçã) - Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação - ICEx - UFMG,; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Umberto da Souza Costa

Um Verificador de Modelos Explícito-Simbólico; 2005; Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Mark Alan Song

UML - Cafe, Uma Metodologia para Projeto e Verificação de Sistemas Transacionais; 2004; 130 f; Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais,; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Marcos P Oliveira

Tolerância a Falhas através de Escalonamento em um Sistema Multiprocessado; 2004; 183 f; Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais,; Coorientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

Autran Macedo

Solução Exata de Problemas de Escalonamento Determinísticos por meio de Verificação Simbólica de Modelos; 2002; 104 f; Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais,; Orientador: Sergio Vale Aguiar Campos;

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Foi orientado por

Osvaldo Sérgio Farhat de Carvalho

Um Algoritmo para Exclusão Mútua e sua Implementação; 1990; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Osvaldo Sergio Farhat de Carvalho;

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Produções bibliográficas

  • NETO, HABIB ASSEISS ; TAVARES, WANESSA L.F. ; RIBEIRO, DANIELA C.S.Z. ; ALVES, RONNIE C.O. ; FONSECA, LEORGES M. ; Campos, Sérgio V.A. . On the utilization of deep and ensemble learning to detect milk adulteration. BioData Mining , v. 12, p. 1-13, 2019.

  • VILALLONGA, GABRIEL D. ; DE ALMEIDA, ANTÔNIO-CARLOS G. ; RIBEIRO, KELISON T. ; CAMPOS, SERGIO V. A. ; RODRIGUES, ANTÔNIO M. . Hypothesized diprotomeric enzyme complex supported by stochastic modelling of palytoxin-induced Na/K pump channels. Royal Society Open Science , v. 5, p. 172155, 2018.

  • MAGALHÃES, MARCOS JORGE ; MARTINS, LEONARDO FRANCO ; SENRA, RENATO LIMA ; DOS SANTOS, THAÍS FERREIRA ; OKANO, DENISE SILVA ; PEREIRA, PAULO ROBERTO GOMES ; FARIA-CAMPOS, ALESSANDRA ; CAMPOS, SÉRGIO VALE AGUIAR ; GUIMARÃES, JOSÉ DOMINGOS ; BARACAT-PEREIRA, MARIA CRISTINA . Differential abundances of four forms of BSP1 in the seminal plasma of Bos taurus indicus bulls with different patterns of semen freezability. Theriogenology , v. 16, p. 102, 2016.

  • GAMES, PATRÍCIA DIAS ; DASILVA, ELÓI QUINTAS GONÇALVES ; BARBOSA, MEIRE DE OLIVEIRA ; ALMEIDA-SOUZA, HEBRÉIA OLIVEIRA ; FONTES, PATRÍCIA PEREIRA ; DEMAGALHÃES-JR, MARCOS JORGE ; PEREIRA, PAULO ROBERTO GOMES ; PRATES, MAURA VIANNA ; FRANCO, GLORIA REGINA ; FARIA-CAMPOS, ALESSANDRA ; CAMPOS, SÉRGIO VALE AGUIAR ; BARACAT-PEREIRA, MARIA CRISTINA . Computer aided identification of a Hevein-like antimicrobial peptide of bell pepper leaves for biotechnological use. BMC GENOMICS , v. 17, p. 1-13, 2016.

  • FARIACAMPOS, Alessandra C ; Hanke, Lucas A. ; BATISTA, P. ; Vinicius Garcia ; CAMPOS, S. V. A. . An innovative electronic health records system for rare and complex diseases. BMC Bioinformatics , v. 16, p. S4, 2015.

  • FARIACAMPOS, Alessandra C ; BALOTTIN, L. ; ZUIN, G. ; Vinicius Garcia ; BATISTA, P. ; GRANJEIRO, J. M. ; CAMPOS, S. V. A. . FluxCTTX: A LIMS-based tool for management and analysis of cytotoxicity assays data. BMC Bioinformatics , v. 16, p. S8, 2015.

  • Hanke, Lucas A. ; BOTELHO, C. ; BRAZ, F. A. F. ; BATISTA, P. ; FLATSCHART, A. F. ; NODA, R. ; CARNEIRO, A. ; FARIACAMPOS, Alessandra C ; Campos, Sérgio V.A. . FluxTransgenics: a flexible LIMS-based tool for management of plant transformation experimental data. Plant Methods , v. 10, p. 2, 2014.

  • CAMPOS, S. V. A. ; VIEIRA, Alex Borges ; Almeida, Rafael Barra ; ALMEIDA, Jussara M. ; Almeida, Jussara M. . SimplyRep: A simple and effective reputation system to fight pollution in P2P live streaming. Computer Networks (1999) , v. 57, p. 1019-1036, 2013.

  • BRAZ, F. A. F. ; CRUZ, J. S. ; FARIACAMPOS, Alessandra C ; Campos, Sérgio V.A. . Probabilistic Model Checking Analysis of Palytoxin Effects on Cell Energy Reactions of the Na+/K+-ATPase. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (Print) , v. 10, p. 1530-1541, 2013.

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  • CREPALDE, M. A. ; FARIACAMPOS, Alessandra C ; Campos, Sérgio V.A. . Modeling and analysis of cell membrane systems with probabilistic model checking. BMC Genomics , v. 12, p. S14, 2011.

  • MACIEL, W. D. ; FARIACAMPOS, Alessandra C ; GONCALVES, M. A. ; Campos, Sérgio V.A. . Can the vector space model be used to identify biological entity activities?. BMC Genomics , v. 12, p. S1, 2011.

  • FARIACAMPOS, Alessandra C ; RAUSCH-FERNANDES, H. ; VAL, C. ; THORUN, P. ; ABREU, V. ; BATISTA, P. ; MENDONCA, P. ; ALVES, V. ; RODRIGUES, M. ; PIMENTA, A. ; FRANCO, Glória R ; CAMPOS, S. V. A. . PRODIS: a proteomics data management system with support to experiment tracking. BMC Genomics , v. 12, p. S15, 2011.

  • CAMPOS, S. V. A. ; Lana-Peixoto, Marco A. ; Talim, Lívia Edwiges ; Faria-Campos, Alessandra C. ; Rocha, Cristiane F. ; Hanke, Lucas A. ; Talim, Natália ; Batista, Paulo Henrique ; Araujo, Carolina R. ; Kleinpaul, Rodrigo . NMO-DBr: the Brazilian Neuromyelitis Optica Database System. Arquivos de Neuro-Psiquiatria (Impresso) , v. 69, p. 687-692, 2011.

  • SIMOES, A. ; FARIACAMPOS, Alessandra C ; DELAAT, D. M. ; ABREU, V. ; CAMPOS, S. V. A. . SIGLa: an adaptable LIMS for multiple laboratories. BMC Genomics , v. 11, p. 8, 2010.

  • GOMES, R. R. ; CAMPOS, S. V. A. ; PENA, S. D. . PEDEXPERT: a computer program for the application of Bayesian networks to human paternity testing. Genetics and Molecular Research , v. 8, p. 273-283, 2009.

  • BARBOSA, Daniela V C ; FERNANDES, G. ; PROSDOCIMI, F ; Pena I ; Santana-Santos L ; Coelho Jr O ; SILVA, A. B. ; MUDADO, M. ; NATALE, D. ; FARIACAMPOS, Alessandra C ; CAMPOS, S. V. A. ; ORTEGA, José M . A procedure to recruit members to enlarge protein family databases--the building of UECOG (UniRef-Enriched COG Database) as a model. Genetics and Molecular Research , v. 7, p. 910-924, 2008.

  • FARIACAMPOS, Alessandra C ; GOMES, R. R. ; MORATELLI, F. ; ROLLA, A. ; FRANCO, Glória R ; CAMPOS, S. V. A. . BNDb - BIomolecules Nucleus Database: An Integrated Proteomics and Transcriptomics Database. Genetics and Molecular Research , v. 6, p. 937-945, 2007.

  • FARIACAMPOS, Alessandra C ; MORATELLI, F. ; MENDES, I. K. ; ORTOLANI, P. ; OLIVEIRA, G. ; CAMPOS, S. V. A. ; ORTEGA, José M ; FRANCO, Glória R . Production of Full-length cDNAs by Sequencing and Analysis of Expressed Sequence Tags from Schistosoma mansoni. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz , v. 1, p. In press, 2006.

  • FARIACAMPOS, Alessandra C ; CAMPOS, S. V. A. ; PROSDOCIMI, F ; FRANCO, Glória R ; ORTEGA, José M . Efficient Secondary Database Driven Annotation Using Model Organisms Sequences. In Silico Biology. An International Journal on Computational Molecular Biology , v. 6, p. 34, 2006.

  • COSTA, U. ; CAMPOS, S. V. A. ; VIEIRA, N. ; DEHARBE, D. . Explicit-Symbolic Modelling for Formal Verification. Electronic Notes in Theoretical Computer Science , v. 130, p. 301-321, 2005.

  • CAMPOS, S. V. A. ; GRUMBERG, Orna ; YORAV, Karen ; FADY, Copty . Test Sequence generation and model checking using dynamic transition relations. International Journal on Software Tools for Technology Transfer , Alemanha, v. 6, n.2, p. 174-182, 2004.

  • CAMPOS, S. V. A. ; TEIXEIRA, M. ; MINEA, M. ; KUEHLMANN, A. ; CLARKE, E. . Model Checking Semi-Continuous Time Models Using BDDs. Electronic Notes in Theoretical Computer Science , v. 23, p. 1-13, 2001.

  • CAMPOS, S. V. A. ; CLARKE, E. . The Verus Language: representing time efficiently with BDDs. Theoretical Computer Science , v. 253, p. 95-118, 2001.

  • CAMPOS, S. V. A. ; CLARKE, E. ; GRUMBERG, O. . Selective quantitative analysis and interval model checking: verifyng different facets of a system. Formal Methods In System Design, v. 17, p. 163-192, 2000.

  • CAMPOS, S. V. A. ; HARTONAS-GARMHAUSEN, V. ; CIMATTI, A. ; CLARKE, E. ; GIUNCHIGLIA, F. . Verification of a safety-critical railway interlocking system with real-time constraints. Science Of Computer Programming, v. 36, n.1, p. 53-65, 2000.

  • CAMPOS, S. V. A. ; CLARKE, E. . Analysis And Verification Of Real-Time Systems Using Quantitative Symbolic Algorithms A Ser Publicado Em 1998. SOFTWARE TOOLS FOR TECHNOLOGY TRANSFER JOURNAL, v. 2, n.3, p. 260-269, 1999.

  • CAMPOS, S. V. A. ; CLARKE, E. ; MINEA, M. . Symbolic Techniques For Formally Verifying Industrial Systems. SCIENCE OF COMPUTER PROGRAMMING, v. 29, p. 79-98, 1997.

  • CAMPOS, S. V. A. ; CLARKE, E. ; MARRERO, W. ; MINEA, M. ; HIRAISHI, H. . Temporal Verification Of Real-Time Systems. IEICE TRANSACTIONS ON INFORMATION AND SYSTEMS, v. E78-D, n.7, p. 796-801, 1995.

  • CAMPOS, S. V. A. ; CLARKE, E. ; MARRERO, W. ; MINEA, M. . Verus: A Tool For Quantitative Analysis Of Finite-State Real-Time Systems. ACM SIGPLAN NOTICES, v. 30, n.11, p. 70-78, 1995.

  • CAMPOS, S. V. A. ; CARVALHO, O. . Temis - Um Nucleo Para Desenvolvimento de Programas Paralelos. REVISTA BRASILEIRA DE COMPUTACAO, v. 6, n.1, p. 33-44, 1990.

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Outras produções

Faria-Campos, Alessandra C. ; Lana-Peixoto, Marco A. ; CAMPOS, S. V. A. . NMO-DBr The Neuromielitis Optica Brazilian Database. 2011.

SIMOES, A. ; FARIACAMPOS, Alessandra C ; DELAAT, D. M. ; KELLER, R. ; ABREU, V. ; CAMPOS, S. V. A. . SIGLa - Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios. 2010.

FARIACAMPOS, Alessandra C ; RAUSCH-FERNANDES, H. ; VAL, C. ; THORUN, P. ; ABREU, V. ; BATISTA, P. ; PIMENTA, A. ; FRANCO, Glória R ; CAMPOS, S. V. A. . Prodis - Proteomics Data Integrated System. 2009.

FARIACAMPOS, Alessandra C ; RAUSCH-FERNANDES, H. ; CAMPOS, S. V. A. . BNDb - Biomolecules Network Database. 2006.

CAMPOS, S. V. A. ; MACIEL, P. N. . Neosyst - Sistema de Gerência de Negócios para Pequena Empresa. 2005.

CAMPOS, S. V. A. . Metasys. 2002.

CAMPOS, S. V. A. ; CLARKE, E. . O Sistema de Verificação de Modelos Simbólico (Symbolic Model Checker) Verus. 1997.

CAMPOS, S. V. A. ; FARIACAMPOS, Alessandra C ; VILELA NETO, O. . NanoTrack - Sistema de Gerenciamento de Dados de Nanoestruturas com Plugins Inteligentes. 2013.

CAMPOS, S. V. A. ; FARIACAMPOS, Alessandra C ; FLATSCHART, A. F. ; CARNEIRO, A. ; NODA, R. . FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas. 2012.

Campos, Sérgio V.A. ; FARIACAMPOS, Alessandra C ; PIETRA, E. . FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose. 2012.

CAMPOS, S. V. A. ; FARIACAMPOS, Alessandra C ; Lana-Peixoto, Marco A. . NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica. 2012.

CAMPOS, S. V. A. ; MACIEL, P. N. ; CAMPOS, I. M. . Metasys, Software para Inclusão Digital. 2005.

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Projetos de pesquisa

  • 2013 - Atual

    ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    SIGPC ? Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

  • 2012 - Atual

    FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

  • 2012 - Atual

    NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

  • 2011 - Atual

    FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante., Número de orientações: 1

  • 2011 - Atual

    FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

  • 2008 - 2013

    SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar ?O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni?, ?Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis?, ?Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico? dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa., Número de produções C, T & A: 13 / Número de orientações: 6

  • 2008 - Atual

    TVPP: A Research Oriented P2P Live Streaming System, Descrição: Um projeto de desenvolvimento e pesquisa na transmissão de vídeo ao vivo utilizando tecnologias P2P.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alex Borges - Integrante / Marcus Vinicius Rocha - Integrante / italo cunha - Integrante., Número de produções C, T & A: 2 / Número de orientações: 1

  • 1998 - Atual

    Verificação Automática de Sistemas de Complexidade Industrial, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / EDMUND CLARKE - Integrante / O Grumberg - Integrante / Mark Alan Song - Integrante / David Deharbe - Integrante / Hugo Barros - Integrante / Rodrigo Richard Gomes - Integrante / Coelho Jr O - Integrante / Gomes, Pedro - Integrante., Número de produções C, T & A: 3

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Projetos de desenvolvimento

  • 2013 - Atual

    ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

  • 2013 - Atual

    FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados. . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

  • 2012 - Atual

    NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz. . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

  • 2005 - 2008

    SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

  • 2004 - 2006

    Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

  • 2001 - 2005

    Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

  • 2013 - Atual

    FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados. . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

  • 2012 - Atual

    NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz. . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

  • 2005 - 2008

    SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

  • 2004 - 2006

    Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

  • 2001 - 2005

    Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

  • 2013 - Atual

    FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados. . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

  • 2012 - Atual

    NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz. . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

  • 2005 - 2008

    SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

  • 2004 - 2006

    Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

  • 2001 - 2005

    Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

  • 2013 - Atual

    FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

  • 2013 - Atual

    ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2012 - Atual

    NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

  • 2005 - 2008

    SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

  • 2004 - 2006

    Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

  • 2001 - 2005

    Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

  • 2013 - Atual

    SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

  • 2012 - Atual

    NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

  • 2005 - 2008

    SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

  • 2004 - 2006

    Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

  • 2001 - 2005

    Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

  • 2013 - Atual

    SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

  • 2012 - Atual

    NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

  • 2005 - 2008

    SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

  • 2004 - 2006

    Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

  • 2001 - 2005

    Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

  • 2013 - Atual

    FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

  • 2013 - Atual

    ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2012 - Atual

    NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

  • 2005 - 2008

    SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

  • 2004 - 2006

    Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

  • 2001 - 2005

    Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

  • 2013 - Atual

    ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

  • 2012 - Atual

    NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

  • 2005 - 2008

    SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

  • 2004 - 2006

    Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

  • 2001 - 2005

    Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

  • 2013 - Atual

    FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

  • 2012 - Atual

    NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

  • 2005 - 2008

    SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

  • 2004 - 2006

    Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

  • 2001 - 2005

    Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

  • 2013 - Atual

    FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

  • 2013 - Atual

    ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2012 - Atual

    NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

  • 2005 - 2008

    SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

  • 2004 - 2006

    Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

  • 2001 - 2005

    Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

  • 2013 - Atual

    FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

  • 2013 - Atual

    ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante.Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2012 - Atual

    NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

  • 2005 - 2008

    SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

  • 2004 - 2006

    Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante.Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

  • 2001 - 2005

    Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante.Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

  • 2013 - Atual

    FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

  • 2013 - Atual

    ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2012 - Atual

    NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

  • 2005 - 2008

    SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

  • 2004 - 2006

    Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

  • 2001 - 2005

    Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

  • 2013 - Atual

    ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

  • 2012 - Atual

    NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

  • 2005 - 2008

    SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

  • 2004 - 2006

    Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

  • 2001 - 2005

    Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

  • 2013 - Atual

    SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

  • 2013 - Atual

    ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2012 - Atual

    NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

  • 2011 - Atual

    FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

  • 2005 - 2008

    SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

  • 2004 - 2006

    Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

  • 2001 - 2005

    Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

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Prêmios

2014

Best Oral Presentation, Brazilian Symposium in Bioinformatics.

2011

Menção Honrosa, WPerformance, X Workshop em Desempenho de Sistemas Computacionais e de Comunicação.

2008

Best Oral Presentation Award, 3rd place, Brazilian Society for Bioinformatics and Computational Biology.

2005

Melhor Artigo da Conferência WPERFORMANCE, Workshop em Desempenho de Sistemas Computacionais e de Comunicação.

2004

Prêmio Telemar de Inclusão Digital - Segundo Lugar Universidades, Instituto Telemar.

2001

Destaque SUCESU 2001 de Informática e Telecomunicações de Minas Gerais, SUCESU.

2001

Tecnologia da Informação - Escolhido entre os 100 mais influentes, Info Exame.

2001

Melhores de Hoje, Informática, Jornal Hoje em Dia.

1994

Prêmio de Melhor Artigo Técnico e Apresentação, Intel Design Technology Conference.

1990

Segundo Lugar no Concurso de Tese e Dissertações, Sociedade Brasileira de Computação.

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Universidade Federal de Minas Gerais, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação. , Av. Antônio Carlos, 6627, Pampulha, 31270-010 - Belo Horizonte, MG - Brasil, Telefone: (31) 34995860, Fax: (31) 34995858, URL da Homepage:

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Experiência profissional

2013 - Atual

Sociedade Brasileira de Computação - Porto Alegre

Vínculo: Coordenação da CE BioComp, Enquadramento Funcional: Coordenador

Outras informações:
Coordenação da Comissão Especial de Biologia Computacional da Sociedade Brasileira de Computação

2016 - Atual

Universidade Federal de Minas Gerais

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor titular, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2006 - 2015

Universidade Federal de Minas Gerais

Vínculo: , Enquadramento Funcional: Professor Associado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

1998 - 2006

Universidade Federal de Minas Gerais

Vínculo: , Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

  • 05/2005

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação - ICEx - UFMG, .,Cargo ou função, Membro Titular do Colegiado do PPGCC.

  • 03/2005

    Direção e administração, Doutorado em Bioinformática - ICB - UFMG, .,Cargo ou função, Coordenador de Curso.

  • 03/2005

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Doutorado em Bioinformática - ICB - UFMG, .,Cargo ou função, Membro Titular do Colegiado.

  • 08/1998

    Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação.,Linhas de pesquisa

  • 08/1998

    Ensino, Ciências da Computação, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Sistemas Operacionais, TECC: Verificação Automática

  • 08/1998

    Ensino, Ciência da Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Sistemas Operacionais, Sistemas de Tempo-Real