Sergio Vale Aguiar Campos

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Produções bibliográficas

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• QUADROS DE AZEVEDO, DANIELA ; VINÍCIUS VIERA NÓIA, JOÃO ; RIBEIRO, YASMIM CARLA M. ; ALVES DOS REIS, RAPHAEL ; RIBEIRO, PAULO HENRIQUE OTONI ; ALMEIDA MOURA, GUSTAVO ; MENDES, PAMELA ; BARBOSA DE SOUZA, ANA BEATRIZ ; CARPINI MERMEJO, SOFIA ; SERAFIM, MATEUS SÁ MAGALHÃES ; FERNANDES, THAÍS HELENA MACIEL ; O'DONOGHUE, ANTHONY J. ; CAMPOS, ALESSANDRA C. FARIA AGUIAR ; CAMPOS, SÉRGIO VALE AGUIAR ; GONÇALVES MALTAROLLO, VINÍCIUS ; OLIVEIRA CASTILHO, RACHEL . Development of an Antiviral Medicinal Plant and Natural Product Database (avMpNp Database) from Biodiversity. CHEMISTRY & BIODIVERSITY , v. 21, p. 1, 2024.

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• FARIACAMPOS, Alessandra C ; PROSDOCIMI, F ; TORRES, João A ; PEIXOTO, F C ; CAMPOS, S. V. A. ; FRANCO, Glória R ; ORTEGA, José M . Comparison of sequence sets of s. mansoni to d. melanogaster and c. elegans and development of tools for selection of s. mansoni clones for full length sequencing. In: Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2002, Caxambu, 2002.

• LIMA, J. ; RIBEIRO, DANIELA C.S.Z. ; NETO, HABIB ASSEISS ; Campos, Sérgio V.A. ; LEITE, M. ; FORTINI, M. ; CARVALHO, B. ; ALMEIDA, M. V. ; FONSECA, LEORGES M. . Detection of cheese whey illegally added to milk using machine learning methods associated with Fourier Transform Infrared. JOURNAL OF DAIRY SCIENCE , 2022.

• CAMPOS, S. V. A. . Applications of Formal Methods in Industry. 2020. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CAMPOS, S. V. A. . Formal Verification, Model Checking. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CAMPOS, S. V. A. . Formal Verification, Model Checking. 2019. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• VAL, C. ; SIMOES, A. ; FARIACAMPOS, Alessandra C ; CAMPOS, S. V. A. . SIGLa - A Dynamic System to Integrate Laboratory Data Based on Workflow Definition. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CAMPOS, S. V. A. . The Priority Inversion Problem and Real-Time Symbolici Model Cheking. EUA: Carnegie Mellon University, 1993 (Relatório Técnico).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2020 - Atual

  MEDCON, Telemedicina Plena Através do Registro e Acompanhamento de Dados Médicos Específicos de COVID-19 e Outras Doenças, Projeto certificado pela empresa Hospital da Baleia em 13/08/2020., Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Enio Mazzieiro - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1

• 2019 - Atual

  BioConcepts: Conceptual Design for Biomedical Applications, Lessons from Software Design, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Daniel Jackson - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.Número de orientações: 1

• 2018 - Atual

  Modelagem, Análise e Avaliação Formal de Sistemas Aeronáuticos, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1

• 2017 - 2020

  Projeto e Avaliação de Sistemas de Aeronaves Remotamente Pilotadas, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2 / Número de orientações: 1

• 2013 - 2019

  ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - 2018

  SIGPC ? Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

• 2012 - Atual

  NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

• 2012 - Atual

  FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

• 2011 - 2018

  FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

• 2011 - 2018

  FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

• 2008 - 2019

  TVPP: A Research Oriented P2P Live Streaming System, Descrição: Um projeto de desenvolvimento e pesquisa na transmissão de vídeo ao vivo utilizando tecnologias P2P.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alex Borges - Integrante / Marcus Vinicius Rocha - Integrante / italo cunha - Integrante., Número de produções C, T & A: 3

• 2008 - 2013

  SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar ?O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni?, ?Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis?, ?Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico? dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa., Número de produções C, T & A: 19

• 1998 - Atual

  Verificação Automática de Sistemas de Complexidade Industrial, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / EDMUND CLARKE - Integrante / O Grumberg - Integrante / Mark Alan Song - Integrante / David Deharbe - Integrante / Hugo Barros - Integrante / Rodrigo Richard Gomes - Integrante / Coelho Jr O - Integrante / Gomes, Pedro - Integrante., Número de produções C, T & A: 3

Projetos de desenvolvimento

• 2013 - Atual

  ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

• 2013 - Atual

  FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados. . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

• 2012 - Atual

  NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz. . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

• 2005 - 2008

  SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

• 2004 - 2006

  Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

• 2001 - 2005

  Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

• 2013 - Atual

  FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados. . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

• 2012 - Atual

  NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz. . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

• 2005 - 2008

  SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

• 2004 - 2006

  Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

• 2001 - 2005

  Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

• 2013 - Atual

  FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados. . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

• 2012 - Atual

  NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz. . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

• 2005 - 2008

  SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

• 2004 - 2006

  Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

• 2001 - 2005

  Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

• 2013 - Atual

  FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

• 2013 - Atual

  ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2012 - Atual

  NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

• 2005 - 2008

  SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

• 2004 - 2006

  Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

• 2001 - 2005

  Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

• 2013 - Atual

  SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

• 2012 - Atual

  NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

• 2005 - 2008

  SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

• 2004 - 2006

  Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

• 2001 - 2005

  Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

• 2013 - Atual

  SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

• 2012 - Atual

  NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

• 2005 - 2008

  SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

• 2004 - 2006

  Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

• 2001 - 2005

  Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

• 2013 - Atual

  FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

• 2013 - Atual

  ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2012 - Atual

  NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

• 2005 - 2008

  SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

• 2004 - 2006

  Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

• 2001 - 2005

  Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

• 2013 - Atual

  ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

• 2012 - Atual

  NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

• 2005 - 2008

  SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

• 2004 - 2006

  Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

• 2001 - 2005

  Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

• 2013 - Atual

  FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

• 2012 - Atual

  NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

• 2005 - 2008

  SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

• 2004 - 2006

  Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

• 2001 - 2005

  Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

• 2013 - Atual

  FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

• 2013 - Atual

  ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2012 - Atual

  NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

• 2005 - 2008

  SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

• 2004 - 2006

  Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

• 2001 - 2005

  Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

• 2013 - Atual

  FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

• 2013 - Atual

  ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante.Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2012 - Atual

  NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

• 2005 - 2008

  SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

• 2004 - 2006

  Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante.Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

• 2001 - 2005

  Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante.Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

• 2013 - Atual

  FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

• 2013 - Atual

  ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2012 - Atual

  NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

• 2005 - 2008

  SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

• 2004 - 2006

  Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

• 2001 - 2005

  Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

• 2013 - Atual

  ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

• 2012 - Atual

  NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

• 2005 - 2008

  SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

• 2004 - 2006

  Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

• 2001 - 2005

  Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

• 2013 - Atual

  SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

• 2013 - Atual

  ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2012 - Atual

  NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

• 2011 - Atual

  FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

• 2005 - 2008

  SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

• 2004 - 2006

  Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

• 2001 - 2005

  Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - 2018

  SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

• 2013 - 2018

  ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

• 2012 - Atual

  NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

• 2011 - 2018

  FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

• 2011 - 2018

  FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

• 2005 - 2008

  SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

• 2004 - 2006

  Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

• 2001 - 2005

  Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - 2018

  SIGPC Sistema Integrado de Gerência de Dados de Pesquisa Clínica, Descrição: O Hospital das Clínicas da UFMG possui um Centro de Pesquisas Clínicas, ou CPC, que centraliza pesquisas clínicas feitas no hospital, seja por iniciativa de professores da UFMG, ou por pedidos externos ao hospital. Cada pesquisa passa por diversas etapas. Em primeiro lugar há uma demanda regulatória, necessária para a implantação da pesquisa. Nesta etapa são necessárias diversas aprovações de diversos órgãos do hospital para que a pesquisa se inicie. Após esta etapa escolhem-se os pacientes que participarão da pesquisa, que devem consentir com a pesquisa. O tratamento destes pacientes é então acompanhado e registrado. Após o término da pesquisa os resultados devem ser analisados e relatados ao pesquisador responsável. Durante este processo há também uma demanda financeira, onde cada etapa deve ser informada ao setor financeiro para contabilidade de custos. O CPC executa diversas pesquisas simultaneamente, e precisa gerenciar os pacientes e os requisitos de cada pesquisa de forma independente. Contudo as características da pesquisa clínica fazem com que cada pesquisa seja diferente das outras, o que torna o gerenciamento destes dados um problema complexo. A seleção dos pacientes que participarão da pesquisa pode ser difícil por causa das características específicas de cada pesquisa. A demanda regulatória para implantação das pesquisas é uma outra característica que dificulta o trabalho do CPC uma vez que o número de documentos, aprovações, consentimentos entre outros pode ser grande e difícil de obter. Além disto, cada pesquisa potencialmente registra seus resultados de forma diferente, seja através de relatórios customizados, seja através de programas de computador especializados no registro dos dados. A consequência destes fatos é que o trabalho do CPC torna-se menos eficiente do que poderia ser, e a implantação e acompanhamento das pesquisas mais lento e propenso a erros. O uso de ferramentas computacionais para auxiliar neste gerenciamento é comum em algumas instituições. Entretanto, o CPC atualmente não possui uma ferramenta computacional completa para apoiar este trabalho utilizando diversos programas não integrados e planilhas eletrônicas neste processo. Uma ferramenta com este propósito permitirá ao CPC aumentar sua eficiência, reduzindo os tempos para implantação e acompanhamento das pesquisas. Este projeto propõe o desenvolvimento de uma ferramenta com esta finalidade, o SIGPC, usando como base de um LIMS, ou Laboratory Information Management System, para gerenciar as atividades de pesquisa do CPC. Os LIMS são sistemas de gerência de dados laboratoriais que se adaptam com facilidade às especificidades da pesquisa clínica. Em particular propõe-se o uso de um LIMS flexível voltado a workflows ou fluxos de trabalho, que possui grande flexibilidade, permitindo a implantação de novas pesquisas e protocolos de forma rápida e eficiente.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Ricardo Correa - Integrante / Antônio L P Ribeiro - Integrante.

• 2013 - 2018

  ELISA: Um equipamento automático para diagnósticos clínicos baseados em ELISA e Bioquímica, Descrição: Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um equipamento totalmente automatizado, de pequeno a médio porte, a ser utilizado por laboratórios de analises clínicas para realização de testes diagnósticos, baseados em bioquímica e na metodologia ELISA. O projeto prevê também o desenvolvimento de um sistema de software de controle do equipamento e gerência dos dados que permita a operação automática e a análise dos dados gerados de forma integrada. Este sistema permitirá não somente a operação do equipamento, mas sua configuração e programação, além do gerenciamento dos dados gerados de forma ampla e integrada. Os dados gerados para análises serão processados pelo sistema, armazenados em banco de dados e disponibilizados através da web tanto para o laboratório quanto para o cliente de forma segura e simplificada. O sistema também integrará o uso de mais de um equipamento para aumentar a eficiência, diminuir o tempo de análise e erros, ou seja, o resultado buscado é a implementação, além do equipamento, de uma solução integrada em automação para laboratórios de análises clínicas de forma a simplificar a rotina laboratorial, além de um sistema de gestão laboratorial que possa ser integrado a rede do Sistema de Saúde local, seja ele privado, municipal, estadual ou federal, fazendo com que o trânsito necessário entre o pedido de exame e a entrega do resultado seja o mais rápido, seguro e transparente.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Denilson Laudares - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  FluxPCM: Um Sistema para Gerência de Dados de Paracoccidioidomicose, Descrição: O projeto propõe o desenvolvimento de um sistema para acompanhamento de pacientes de paracoccidioidomicose e para análise destes dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / enio pietra - Integrante.

• 2012 - Atual

  NMO-DBr, O Banco de Dados Brasileiro de Neuromielite Óptica, Descrição: Um sistema de gerência e análise de dados de pacientes de neuromielite óptica. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Lana-Peixoto, Marco A. - Integrante.

• 2011 - 2018

  FluxTransgenics: Um Sistema para Gerenciamento de Produção de Plantas Transgênicas, Descrição: Este projeto tem como objetivo permitir a automatização do processo experimental de produção de milho e sorgo transgênicos utilizando sistemas integrados de laboratório. Este projeto está em fase de implantação já sendo usado pelo laboratório de Biologia Celular da Embrapa Milho e Sorgo em Sete Lagoas, MG... , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / andrea Carneiro - Integrante / Roberto Noda - Integrante.

• 2011 - 2018

  FluxNGS: Um Sistema para Gestão de Dados de Sequenciamento de Próxima Geração, Projeto certificado pela empresa Fundação Oswaldo Cruz em 16/08/2013., Descrição: O FluxNGS permitirá o gerenciamento de experimentos de next generation sequencing, armazenando informações sobre amostras, montadores utilizados, e resultados. Está sendo desenvolvido em parceria com o CEBio da Fiocruz.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante.

• 2005 - 2008

  SIGLa, Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa. .. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alessandra C FariaCampos - Integrante / Glória R Franco - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Adriano Pimenta - Integrante / Jader S. Cruz - Integrante / andrea Carneiro - Integrante.

• 2004 - 2006

  Neosyst, Um Sistema de Gestão da Micro e Pequena Empresa, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto tem como objetivo prover um sistema completo de gestão de pequenas empresas baseado em software livre. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Banco Interamericano de Desenvolvimento - Auxílio financeiro.

• 2001 - 2005

  Computador Popular, Projeto certificado pela empresa METASYS TECNOLOGIA S/A em 15/08/2013., Descrição: Este projeto prevê o desenvolvimento de um protótipo de computador de baixo custo utilizando software livre como base, e gerando um sistema completo para inclusão digital. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Paulo Neuenschwander Maciel - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

Prêmios