Alan Péricles Rodrigues Lorenzetti

Formação complementar

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Áreas de atuação

Participação em eventos

Comissão julgadora das bancas

Foi orientado por

Produções bibliográficas

• LIMA, LÍDIA DOS PASSOS ; PEREIRA, JULIANA BIAR ; FLORES, ANTHONY JHOAO FASABI ; LORENZETTI, ALAN PÉRICLES RODRIGUES ; BOECHAT, ANA LAURA ; PEREDA, MARIA CLAUDIA ; GUALTIERI, SOPHIA ; DO PRADO, DANIELE FERREIRA ; ROCHA, DIEGO ; CESETI, LUCAS DE MORAES ; BALDINI, REGINA LÚCIA ; FARAH, CHUCK S. ; KOIDE, TIE ; BENEDETTI, CELSO EDUARDO ; ALVAREZ-MARTINEZ, CRISTINA E. . An Extracytoplasmic Function Sigma Factor Required for Full Virulence in Xanthomonas citri pv. citri. JOURNAL OF BACTERIOLOGY , v. 204, p. 1, 2022.

• DE ARAÚJO, HUGO L. ; MARTINS, BIANCA P. ; VICENTE, ALEXANDRE M. ; LORENZETTI, ALAN P. R. ; KOIDE, TIE ; MARQUES, MARILIS V. . Cold Regulation of Genes Encoding Ion Transport Systems in the Oligotrophic Bacterium Caulobacter crescentus. MICROBIOLOGY SPECTRUM , v. 9, p. e00710-21, 2021.

• IBRAHIM, AMR GALAL ABD EL-RAHEEM ; VÊNCIO, RICARDO Z. N. ; LORENZETTI, ALAN P. R. ; KOIDE, TIE . Halobacterium salinarum and Haloferax volcanii Comparative Transcriptomics Reveals Conserved Transcriptional Processing Sites. Genes , v. 12, p. 1018, 2021.

• LÓPEZ GARCÍA DE LOMANA, ADRIÁN ; KUSEBAUCH, ULRIKE ; RAMAN, ARJUN V. ; PAN, MIN ; TURKARSLAN, SERDAR ; LORENZETTI, ALAN P. R. ; MORITZ, ROBERT L. ; BALIGA, NITIN S. . Selective Translation of Low Abundance and Upregulated Transcripts in. mSystems , v. 5, p. e00329-20, 2020.

• SILVA, LARISSA G. ; LORENZETTI, A. P. R. ; RIBEIRO, RODOLFO A. ; ALVES, I. R. ; LEADEN, LAURA ; GALHARDO, R. S. ; Koide, T. ; MARQUES, MARILIS V. . OxyR and the hydrogen peroxide stress response in Caulobacter crescentus. GENE , v. 700, p. 70-84, 2019.

• DE ALMEIDA, JOÃO PAULO PEREIRA ; VÊNCIO, RICARDO Z. N. ; LORENZETTI, ALAN P. R. ; CATEN, FELIPE TEN- ; GOMES-FILHO, JOSÉ VICENTE ; KOIDE, TIE . The Primary Antisense Transcriptome of Halobacterium salinarum NRC-1. Genes , v. 10, p. 280, 2019.

• LEADEN, LAURA ; SILVA, LARISSA G. ; RIBEIRO, RODOLFO A. ; DOS SANTOS, NAARA M. ; LORENZETTI, ALAN P. R. ; ALEGRIA, THIAGO G. P. ; SCHULZ, MARIANE L. ; MEDEIROS, MARISA H. G. ; KOIDE, TIE ; MARQUES, MARILIS V. . Iron Deficiency Generates Oxidative Stress and Activation of the SOS Response in Caulobacter crescentus. Frontiers in Microbiology , v. 9, p. 2014, 2018.

• TEN-CATEN, FELIPE ; VÊNCIO, RICARDO Z. N. ; LORENZETTI, ALAN PÉRICLES R. ; ZARAMELA, LÍVIA SOARES ; SANTANA, ANA CAROLINA ; KOIDE, TIE . Internal RNAs overlapping coding sequences can drive the production of alternative proteins in archaea. RNA Biology , p. 1-14, 2018.

• DOS SANTOS, TIAGO BENEDITO ; SOARES, JOÃO D. M. ; LIMA, JONI E. ; SILVA, JULIANA C. ; IVAMOTO, SUZANA T. ; BABA, VIVIANE Y. ; SOUZA, SILVIA G. H. ; LORENZETTI, ALAN P. R. ; PASCHOAL, ALEXANDRE R. ; MEDA, ANDERSON R. ; NISHIYAMA JÚNIOR, MILTON Y. ; DE OLIVEIRA, ÚRSULA C. ; MOKOCHINSKI, JOÃO B. ; GUYOT, ROMAIN ; JUNQUEIRA-DE-AZEVEDO, INÁCIO L. M. ; FIGUEIRA, ANTÔNIO V. O. ; MAZZAFERA, PAULO ; JÚNIOR, OSVALDO R. ; VIEIRA, LUIZ G. E. ; PEREIRA, LUIZ F. P. ; DOMINGUES, DOUGLAS S. . An integrated analysis of mRNA and sRNA transcriptional profiles in Coffea arabica L. roots: insights on nitrogen starvation responses. Functional & Integrative Genomics , v. 1, p. 1-19, 2018.

• PEDRO, DANIEL LONGHI FERNANDES ; LORENZETTI, ALAN PÉRICLES RODRIGUES ; DOMINGUES, DOUGLAS SILVA ; PASCHOAL, ALEXANDRE ROSSI . PlaNC-TE: a comprehensive knowledgebase of non-coding RNAs and transposable elements in plants. Database-The Journal of Biological Databases and Curation , v. 2018, p. bay078, 2018.

• MARCON, H. S. ; COSTA-SILVA, J. ; LORENZETTI, A. P. R. ; MARINO, C. L. ; DOMINGUES, D. S. . Genome-wide analysis of EgEVE_1, a transcriptionally active endogenous viral element associated to small RNAs in Eucalyptus genomes. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY , v. 40, p. 217-225, 2017.

• LORENZETTI, A. P. R. ; de ANTONIO, G. Y. A. ; PASCHOAL, A. R. ; DOMINGUES, D. S. . PlanTE-MIR DB: a database for transposable element-related microRNAs in plant genomes. FUNCTIONAL & INTEGRATIVE GENOMICS , v. 16, p. 235-242, 2016.

• MORYAMA, N. ; LORENZETTI, A. P. R. ; MATSUURA, E. M. ; CORREA, M. L. ; MAISTRO, V. I. A. . Os Jovens e a sexualidade: Assunto tratado com amigos, pais, professores? Respostas de estudantes do ensino fundamental participantes do projeto PIBID/UEL. In: Adriana Regina de Jesus Santos et al.. (Org.). Práticas e Reflexões de Metodologias de Ensino e Pesquisa do Projeto Prodocência da UEL. 1ed.Londrina: Universidade Estadual de Londrina, 2012, v. , p. 9-596.

• RONDINA, A. B. L. ; LESCANO, L. E. A. M. ; ALVES, R. A. ; MATSUURA, E. M. ; LORENZETTI, A. P. R. ; ZANGARO, W. . Influência de fungos micorrízicos arbusculares, da fertilidade do solo e do volume do recipiente de cultivo no crescimento de Brachiaria brizantha (Hochst. ex A. Rich.) Stapf. In: X Congresso de Ecologia, 2011, São Lourenço. Anais do X Congresso de Ecologia, 2011.

• SILVA, D. M. ; NARDY, M. ; LORENCINI JUNIOR, A. ; NISHIO, E. K. ; LOPES, I. ; LORENZETTI, A. P. R. ; CALSAVARA, L. C. ; MAGRI, A. ; IMADA, E. L. . Utilização da Pesquisa-Ação na elaboração coletiva de ferramentas educativas: Estudo de caso do projeto Espaço para Educação Ambiental - EMBRAPA Soja. In: 3 Congresso Nacional de Extensão Universitária, 2009, Londrina. ANAIS DO 3 CONGRESSO NACIONAL DE EXTENSÃO UNIVERSITÁRIA, 2009.

• LORENZETTI, A. P. R. . Investigação da regulação de mRNAs codificadores de transposase e da morfologia de transcritos utilizando a plataforma MinION. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Koide, T. ; LORENZETTI, A. P. R. ; LANFREDI, G. P. ; QUINTANA, M. . Modelos em papel para estudo de estruturas de proteínas em cursos introdutórios de Bioquímica. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SIMOES, S. C. ; LORENZETTI, A. P. R. ; THOME, C. H. ; MASSON, A. P. ; PARREIRAS-E-SILVA, L. T. ; FACA, V. M. ; COSTA-NETO, C. M. ; TEIXEIRA, F. R. . Comparative Proteomic Analysis of the AT1 Receptor Signaling Profile Triggered by Ligands with Different Pharmacological Profiles. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• LORENZETTI, A. P. R. ; KOIDE, TIE . Uso da bioinformática e abordagens integrativas para o estudo de Halobacterium salinarum NRC-1. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• PEDRO, D. L. F. ; LORENZETTI, A. P. R. ; DOMINGUES, DOUGLAS SILVA ; PASCHOAL, A. R. . PlaNC-TE: a comprehensive knowledgebase of non- coding RNAs and transposable elements in plants. 2018. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

• LORENZETTI, A. P. R. ; ALMEIDA, J. P. P. ; GOMES, C. S. ; Vencio, R. Z. N. ; KOIDE, TIE . Detecting Insertion Sequence activity in Archaea using multiplex long-read DNA sequencing. 2018. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• LORENZETTI, A. P. R. ; Zaramela, L. S. ; ten Caten, F. ; de ALMEIDA, J. P. P. ; GOMES-FILHO, J. V. ; Vencio, R. Z. N. ; Koide, T. . Large-scale survey of LSm-bound transcripts in Halobacterium salinarum NRC-1. 2017. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• LORENZETTI, A. P. R. ; Zaramela, L. S. ; ALMEIDA, J. P. P. ; GOMES-FILHO, J. V. ; Vencio, R. Z. N. ; Koide, T. . Association of Hfq/LSm protein with insertion sequence-derived RNAs is a prevalent phenomenon in prokaryotes. 2017. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• LORENZETTI, A. P. R. ; GOMES-FILHO, J. V. ; Zaramela, L. S. ; ten Caten, F. ; Vencio, R. Z. N. ; Koide, T. . Lsm-bound antisense RNAs play role in Halobacterium salinarum NRC-1 transposition regulation. 2016. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• LORENZETTI, A. P. R. ; de ANTONIO, G. Y. A. ; PASCHOAL, A. R. ; DOMINGUES, D. S. . PlanTE-MIR DB: Um Repositório para microRNAs relacionados a Elementos Transponíveis. 2015. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• DOMINGUES, D. S. ; REIS JR., O. ; SANTOS, T. B. ; SILVA, J. C. ; LORENZETTI, A. P. R. ; SOARES, J. D. M. ; PEREIRA, L. F. P. . Nitrogen-starvation responsive microRNAs in Coffea arabica roots: is this a 3-player game?. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• LORENZETTI, A. P. R. ; DOMINGUES, D. S. ; PASCHOAL, A. R. . Identification of miRNA-related Transposable Elements in Plant Genomes. 2014. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• LORENZETTI, A. P. R. ; IMADA, E. L. ; BARBOSA, A. R. ; SONI NETO, J. ; SOUZA, R. F. ; PASCHOAL, A. R. . Utilização da linguagem de programação Perl para extração automatizada de grandes volumes de metadados biológicos. 2013. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• IMADA, E. L. ; LORENZETTI, A. P. R. ; BARBOSA, A. R. . Uso da Linguagem de Programação Perl para Extração e Análise de Metadados de Arquivos de Saída BLASTN. 2013. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• LORENZETTI, A. P. R. ; MERLIN, G. B. ; SILVA, B. P. ; BASSI, E. A. ; MATSUURA, E. M. ; MORYAMA, N. ; MAISTRO, V. I. A. ; CORREA, M. L. . Dinâmica do semáforo: investigando os conhecimentos prévios acerca do tema sexualidade. 2012. (Apresentação de Trabalho/Outra).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2020 - Atual

  Moléculas sinalizadoras na modulação do transcriptoma, fluxo metabólico e produção de saponinas triterpênicas imunoadjuvantes em Quillaja brasiliensis Mart. (Quillajaceae), Descrição: Quillaja brasiliensis é uma espécie arbórea nativa do sul do Brasil, conhecida popularmente como pau-sabão, que produz saponinas triterpênicas bioativas. Saponinas foliares de Q. brasiliensis apresentam pronunciada atividade adjuvante em vacinas veterinárias experimentais, de forma comparável ao adjuvante comercial Quil-A, obtido de cascas de Quillaja saponaria, uma fonte pouco renovável e sob risco de escassez iminente. Além disso, saponinas de Q. brasiliensis apresentam toxicidade significativamente menor em comparação àquelas de Q. saponaria, característica muito vantajosa no uso de saponinas adjuvantes. Assim como em Q. saponaria, dentre as saponinas de Q. brasiliensis está uma molécula específica, QS-21, aprovada para uso em vacinas humanas contra malária e herpes zoster Culturas celulares de Q. brasiliensis produtoras de saponinas estão disponíveis no laboratório do proponente do RS e seu uso como material experimental facilita sobremaneira avaliações transcriptônicas e metabólicas. Tendo em vista a possibilidade da utilização de Q. brasiliensis para a obtenção sustentável de saponinas com potencial uso comercial e considerando a necessidade de maior conhecimento sobre produção e acúmulo de saponinas bioativas, este projeto propõe-se a caracterizar aspectos metabólicos e transcricionais relacionados à produção de saponinas imunoadjuvantes em culturas celulares de Quillaja brasiliensis. A caracterização incluirá avaliação química, de biossíntese e de respostas transcricionais nos cultivos frente a elicitores metabólicos. Dessa forma, espera-se melhor compreender a regulação de biossíntese de saponinas triterpênicas de alto valor comercial em cultivos celulares de Q. brasiliensis e avaliar sua viabilidade como fonte alternativa e/ou complementar destes produtos naturais e a, longo prazo, dar subsídios à produção biotecnológica em sistemas heterólogos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alan Péricles Rodrigues Lorenzetti - Coordenador / Douglas Silva Domingues - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2016 - 2021

  RNAs não codificantes derivados de sequências de inserção na arqueia halófila Halobacterium salinarum NRC-1, Descrição: Sequências de inserção (IS) são elementos genéticos móveis amplamente distribuídos nos procariontes e que causam grande impacto no genoma que as abrigam. Dependendo da situação, o impacto desses elementos pode ser benéfico ao hospedeiro, promovendo a diversidade genética e a modulação da expressão gênica. Por outro lado, são comuns eventos de mobilização que causam prejuízo, como por exemplo em casos onde a inserção de IS em genes essenciais compromete a viabilidade do organismo. Diversos mecanismos de regulação se encarregam de manter baixos os níveis de transposição, evitando efeitos deletérios. Em bactérias, um dos mecanismos que regulam a taxa de transposição de elementos da família IS200/IS605 atua em nível pós-transcricional, impedindo a tradução de RNAs mensageiros (mRNAs) codificadores de transposases por meio do acoplamento à proteína Hfq e/ou RNAs antisenso (asRNAs). Em arqueias, a proteína LSm, homóloga da Hfq, parece desempenhar função similar, entretanto, a literatura mostra que o conhecimento destes fenômenos ainda é bastante inferior no terceiro domínio da vida em relação ao conhecido para bactérias. Nosso grupo de pesquisa tem estudado diversos aspectos dos RNAs não codificantes (ncRNAs) da arqueia halófila Halobacterium salinarum NRC-1, inclusive no contexto das IS. Analisamos experimentos piloto de sequenciamento de RNAs coimunoprecipitados com LSm em H. salinarum NRC-1 e resultados preliminares indicam que aproximadamente 85% das IS intactas produzem RNAs que apresentam interação com essa proteína. O projeto de doutorado aqui proposto tem como objetivo identificar ncRNAs sense ou antisense derivados de IS, caracterizar sua interação com LSm, identificar possíveis alvos de regulação e por fim elucidar, tanto experimentalmente quanto in silico, sua estrutura secundária em H. salinarum NRC-1. A prevalência, conservação e especificidade da interação entre esses ncRNAs e LSm/Hfq em procariontes será analisada, contribuindo para a compreensão da regulação da transposição em nível pós-transcricional.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alan Péricles Rodrigues Lorenzetti - Integrante / Tie Koide - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

• 2011 - 2012

  PIBID/UEL II: CONSOLIDAÇÃO E AMPLIAÇÃO DAS ATIVIDADES, Descrição: O projeto PIBID 2011 é um projeto de ensino da Universidade Estadual de Londrina, cadastrado na PROGRAD, patrocinado pelo Ministério da Educação, por meio do Programa Institucional de Bolsas de Iniciação à Docência (PIBID) da Capes. Tem como objetivo geral incentivar a formação de professores para a educação básica nas 15 licenciaturas da UEL [Artes, Biologia, C. Sociais, Ed. Fisica, Filosofia, Física, Geografia, Historia, Espanhol, Ingles, Portugues, Matematica, Musica, Pedagogia e Quimica]. O projeto envolve 45 professores do ensino basico, 360 estudantes de graduaçao [bolsistas] e 20 docentes da UEL. O projeto foi aprovado em 2011 e 2012.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (99) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Alan Péricles Rodrigues Lorenzetti - Integrante / Virginia Iara de Andrade Maistro - Integrante / Sérgio de Mello Arruda - Coordenador.

Prêmios