Giulia Magri Ribeiro

Mestre em Ciências pelo Departamento de Zoologia da Universidade de São Paulo, com estágio internacional no Smith College (Massachusetts). Experiência como técnico de laboratório com cultivo de microrganismos e biologia molecular. Atualmente com doutorado em andamento no Departamento de Zoologia da Universidade de São Paulo, com estágio internacional no Real Jardín Botánico, CSIC (Madrid). A minha atual área de investigação é a Ecologia e Evolução de amebas tecadas vivendo em condições de stress. Combinamos uma estratégia de exploração de comunidades de Arcellinida no ambiente utilizando metodologias de metabarcoding e experimentos de laboratório simulando ambientes com baixo teor de oxigênio e contaminados por arsênio, utilizando técnicas de biologia molecular como PCR quantitativo em tempo real e sequenciamento de próxima geração. Experiência em atividades de gestão da Universidade, como representação discente (2019-2020) e Gestão financeira (2019-2022). Experiência como membro de comissão organizadora de cursos para o público de graduação (CVZoo, 2017-2022).

Informações coletadas do Lattes em 11/11/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em andamento em Zoologia - IB/USP

2019 - Atual

Universidade de São Paulo
Título: Avaliação do impacto das condições ambientais na taxonomia e diversidade funcional de tecamebas
Daniel José Galafasse Lahr. Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.

Mestrado em Ciências

2016 - 2018

Universidade de São Paulo
Título: Sequenciamento e anotação do transcriptoma da ameba tecada Arcella intermedia: Descrição de vias e descobertas de genes
Orientador: em Smith College ( Laura Katz)
com , Ano de Obtenção: 2018.Daniel José Galafasse Lahr.Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Palavras-chave: Teca ameba; Transcriptoma; Transferências Laterais de Genes; Metabolismo anaeróbio.Grande área: Ciências Biológicas

Especialização em Gestão ambiental - Ecogestão

2020 - 2021

Universidade Paulista
Título: sem monografia

Graduação em Ciências Biológicas

2012 - 2017

Universidade de São Paulo
Título: Tudo está em todo lugar? Explorando a Dinâmica populacional em microorganismos eucariontes
Orientador: Prof.Dr. Daniel José Galafasse Lahr
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

Curso técnico/profissionalizante em Informática

2009 - 2010

Etec Lauro Gomes

Ensino Médio (2º grau)

2008 - 2010

Etec Lauro Gomes

Formação complementar

2021 - 2021

Introdução à Ciência da Computação com Python. (Carga horária: 80h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2020 - 2020

Biology Meets Programming: Bioinformatics for Beginners. (Carga horária: 20h). , University of California San Diego, UC SAN DIEGO, Estados Unidos.

2020 - 2020

Python Data Structures. (Carga horária: 20h). , University of Michigan, UMICH, Estados Unidos.

2020 - 2020

A LINGUAGEM NA ELABORAÇÃO DE MATERIAIS PARA A EDUCAÇÃO A DISTÂNCIA. (Carga horária: 30h). , Universidade Cruzeiro do Sul, UNICSUL, Brasil.

2020 - 2020

R Programming. (Carga horária: 60h). , Johns Hopkins University, JHU, Estados Unidos.

2020 - 2020

Programming for Everybody (Getting Started with Python). (Carga horária: 20h). , University of Michigan, UMICH, Estados Unidos.

2019 - 2019

Basic principles of genome assembly, annotation & phylogenomics. (Carga horária: 4h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2009 - 2009

Web-designer & Computação Gráfica. (Carga horária: 100h). , ETEC Lauro Gomes, ETE, Brasil.

Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

Bandeira representando o idioma Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Francês

Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Ecologia.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Ecologia / Subárea: Ecologia experimental.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Protistologia.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Biologia Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Evolução molecular.

Organização de eventos

RIBEIRO, G. M. . Curso de Verão de Zoologia. 2021. (Outro).

RIBEIRO, G. M. . Curso de verão de zoologia. 2020. (Outro).

RIBEIRO, G. M. . Curso de Verão de Zoologia. 2018. (Outro).

RIBEIRO, G. M. . Curso de Verão de Zoologia. 2017. (Outro).

LAHR, D. J. G. ; Enrique LARA ; HOFSTATTER, P. G. ; RIBEIRO, G. M. ; PORFIRIO-SOUSA, A. L. ; P. JUNIOR, S. . 8th International Symposium on Testate Amoebae (ISTA8). 2016. (Congresso).

Participação em eventos

XIV Simpósio Brasileiro de Microbiologia Aplicada / VI Encontro Latinoamericano de Microbiologia Aplicada. As aparências enganam: Identificação de tecamebas para estudos de comunidades biológicas.. 2022. (Congresso).

Biodiversity Genomics 2021. Arsenic resistance in testate amoebae. 2020. (Congresso).

XXXVI REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE PROTOZOOLOGIA. A comparative study demonstrates vertical inheritance and maintenance of arsenic resistance metabolism in eukaryotes. 2020. (Congresso).

International symposium on Testate amoebae.Experiments of arsenic resistance in Arcella intermedia. 2019. (Simpósio).

VIII European Congress of Protistology- ISOP Joint meeting. Detection of potential low-oxygen adaptations in free-living testate amoeba using a transcriptomic approach.. 2019. (Congresso).

15th International Congress of Protistology. Gene expression profile during growth of the testate amoeba Arcella intermedia. 2017. (Congresso).

8th International Symposium on Testate Amoebae (ISTA8). Competitive exclusion in testate amoebae. 2016. (Congresso).

Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP.Experimentos de Exclusão Competitiva em Protistas. 2015. (Simpósio).

Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP.Everything is everywhere? Exploring the population dynamics in eukaryotic microorganisms. 2014. (Simpósio).

Participação em bancas

Aluno: Yemna Gomes da Silva

RIBEIRO, GIULIA M.. Amebas testáceas (Amorphea, Amoebozoa, Cercozoa) como bioindicadores: uma revisão cienciométrica. 2021 - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro.

Produções bibliográficas

  • RIBEIRO, GIULIA M. ; LAHR, DANIEL J.G. . A comparative study indicates vertical inheritance and horizontal gene transfer of arsenic resistance-related genes in eukaryotes. MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION , v. 173, p. 107479, 2022.

  • GONZÁLEZ-MIGUÉNS, RUBÉN ; TODOROV, MILCHO ; BLANDENIER, QUENTIN ; DUCKERT, CLÉMENT ; PORFIRIO-SOUSA, ALFREDO L. ; RIBEIRO, GIULIA M. ; RAMOS, DIANA ; LAHR, DANIEL J.G. ; BUCKLEY, DAVID ; LARA, ENRIQUE . Deconstructing Difflugia: The tangled evolution of lobose testate amoebae shells (Amoebozoa: Arcellinida) illustrates the importance of convergent evolution in protist phylogeny. MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION , v. 175, p. 107557, 2022.

  • TENG, YUAN-CHI ; PORFÍRIO-SOUSA, ALFREDO LEONARDO ; RIBEIRO, GIULIA MAGRI ; AREND, MARCELA CORSO ; DA SILVA MEIRELLES, LINDOLFO ; CHEN, ELIZABETH SUCHI ; ROSA, DANIELA SANTORO ; HAN, SANG WON . Analyses of the pericyte transcriptome in ischemic skeletal muscles. Stem Cell Research & Therapy , v. 12, p. 183, 2021.

  • RIBEIRO, GIULIA M. ; PORFÍRIO'SOUSA, ALFREDO L. ; MAURER'ALCALÁ, XYRUS X. ; KATZ, LAURA A. ; LAHR, DANIEL J.G. . De novo Sequencing, Assembly, and Annotation of the Transcriptome for the Free-Living Testate Amoeba Arcella intermedia. JOURNAL OF EUKARYOTIC MICROBIOLOGY , v. 67, p. 383-392, 2020.

  • HOFSTATTER, PAULO G. ; RIBEIRO, GIULIA M. ; PORFÍRIO'SOUSA, ALFREDO L. ; LAHR, DANIEL J. G. . The Sexual Ancestor of all Eukaryotes: A Defense of the -Meiosis Toolkit-. BIOESSAYS , v. 42, p. 2000037, 2020.

  • LAHR, DANIEL J.G. ; KOSAKYAN, ANUSH ; LARA, ENRIQUE ; MITCHELL, EDWARD A.D. ; MORAIS, LUANA ; PORFIRIO-SOUSA, ALFREDO L. ; RIBEIRO, GIULIA M. ; TICE, ALEXANDER K. ; PÁNEK, TOMÁ? ; KANG, SEUNGHO ; BROWN, MATTHEW W. . Phylogenomics and Morphological Reconstruction of Arcellinida Testate Amoebae Highlight Diversity of Microbial Eukaryotes in the Neoproterozoic. CURRENT BIOLOGY , v. 29, p. 991-1001.e3, 2019.

  • RIBEIRO, GIULIA M. ; PRADO, PAULO INÁCIO ; COUTINHO, RENATO MENDES ; RILLO, MARINA COSTA ; PEREIRA JUNIOR, SAMUEL ; PORFIRIO-SOUSA, ALFREDO L. ; LAHR, DANIEL J. G. . Growth Rate Modulation Enables Coexistence in a Competitive Exclusion Scenario Between Microbial Eukaryotes. ACTA PROTOZOOLOGICA , v. 58, p. 217-233, 2019.

  • LAHR, DANIEL J. G. ; LARA, ENRIQUE ; HOFSTATTER, PAULO G. ; RIBEIRO, GIULIA M. ; PORFÍRIO-SOUSA, ALFREDO L. ; JUNIOR, SAMUEL P. . Meeting Report: 8th International Symposium on Testate Amoebae, Ilhabela, São Paulo, Brazil, 12-14 September 2016. JOURNAL OF EUKARYOTIC MICROBIOLOGY , v. 64, p. 555-557, 2016.

  • PORFÍRIO-SOUSA, ALFREDO L. ; RIBEIRO, GIULIA M. ; LAHR, DANIEL J.G. . Morphometric and genetic analysis of Arcella intermedia and Arcella intermedia laevis (Amoebozoa, Arcellinida) illuminate phenotypic plasticity in microbial eukaryotes. EUROPEAN JOURNAL OF PROTISTOLOGY , v. 58, p. 187-194, 2016.

  • FERES, J. C. ; PORFIRIO-SOUSA, A. L. ; RIBEIRO, G. M. ; ROCHA, G. M. ; José Mauro STERZA ; G.SOUZA, M. B. ; SOARES, C. E. A. ; LAHR, D. J. G. . Morphological and Morphometric Description of a Novel Shelled Amoeba Arcella gandalfi sp. nov. (Amoebozoa: Arcellinida) from Brazilian Continental Waters. Acta Protozoologica (Druk) , v. 55, p. 221-229, 2016.

  • RIBEIRO, G. M. ; LAHR, D. J. G. . Tudo está em todo lugar? Explorando a Dinâmica populacional em microorganismos eucariontes. In: Simpósio Internacional de Iniciação científica da USP, 2014, São Paulo. Anais do SIICUSP, 2014.

  • RIBEIRO, GIULIA M. . UM LONGO CAMINHO AO TOPO: TECAMEBAS COMO MODELO DE ESTUDOS EM ECOLOGIA E EVOLUÇÃO. 2022. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • RIBEIRO, GIULIA M. ; LAHR, D. J. G. . A comparative study demonstrates vertical inheritance and maintenance of arsenic resistance metabolism in eukaryotes. 2021. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • RIBEIRO, GIULIA M. ; LAHR, D. J. G. . ISTA 9 3/4. 2021. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • RIBEIRO, GIULIA M. ; LAHR, D. J. G. . Biodiversity Genomics 2021. 2021. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • RIBEIRO, GIULIA M. . O que os genes de uma tecameba nos ensinam sobre resistência ambiental?. 2021. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • RIBEIRO, G. M. ; MAURER-ALCALA, X. X. ; KATZ, L. A. ; LAHR, D. J. G. . Detection of potential low-oxygen adaptations in free-living testate amoeba using a transcriptomic approach.. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • RIBEIRO, G. M. ; MAURER-ALCALA, X. X. ; KATZ, L. A. ; LAHR, DANIEL J. G. . Gene expression profile during growth of the testate amoeba Arcella intermedia.. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • RIBEIRO, G. M. ; PRADO, P. I. ; COUTINHO, R. ; RILLO, M. ; JUNIOR, SAMUEL P. ; PORFÍRIO-SOUSA, ALFREDO L. ; LAHR, D. J. G. . Competitive exclusion in testate amoebae.. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • RIBEIRO, G. M. ; LAHR, D. J. G. . Everything is everywhere? Exploring the population dynamics in eukaryotic microorganisms. 2014. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • RIBEIRO, GIULIA M. . Métodos‌‌ em‌‌ Biologia‌‌ Molecular. 2022. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

  • RIBEIRO, GIULIA M. ; PORFIRIO-SOUSA, A. L. . Diversidade‌‌ biológica‌‌ e‌‌ classificação‌‌ dos‌‌ seres‌‌ vivos. 2022. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

  • RIBEIRO, GIULIA M. . Fundamentos da Biologia Molecular. 2021. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

  • RIBEIRO, GIULIA M. . Aplicações de novas tecnologias de biologia molecular em projetos de Zoologia. 2021. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

  • RIBEIRO, GIULIA M. . Diversidade de eucariontes. 2020. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

  • RIBEIRO, GIULIA M. . Noções de Biologia molecular aplicadas a estudos de biodiversidade e evolução. 2020. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

  • RIBEIRO, G. M. . Curso de Verão de Zoologia. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

  • RIBEIRO, G. M. . Curso de Verão de Zoologia. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

  • RIBEIRO, GIULIA M. ; PORFIRIO-SOUSA, A. L. . Diversidade de Eucariontes. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

  • RIBEIRO, GIULIA M. . Noções de Estatística. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

  • RIBEIRO, GIULIA M. . Práticas e técnicas de biologia molecular aplicadas à Zoologia. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

Projetos de pesquisa

  • 2021 - 2022

    Avaliação da importância do metabolismo fermentativo em lagos eutróficos., Descrição: Águas eutróficas têm seu oxigênio dissolvido periodicamente esgotado resultado do excesso de algas na água e seus processos respiratórios adicionado à decomposição desses organismos. Consequentemente, organismos bentônicos precisam recorrer a vias fermentativas para tolerância à hipóxia. Aqui, investigamos a ligação entre a presença de vias fermentativas em um grupo de (Arcellinida) e tolerância a ambientes eutróficos. Esses organismos são bem conhecidos por terem diferentes níveis de tolerância, o que os torna úteis como bioindicadores de qualidade. Neste trabalho, usaremos o metabarcoding para investigar o efeito da eutrofização em comunidades de Arcellinida em lagoas alcalinas da Península Ibérica Central. Este trabalho foi realizado em colaboração com o grupo do Dr. Enrique Lara no Real Jardín Botanico de Madrid.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Giulia Magri Ribeiro - Integrante / Daniel José Galafasse Lahr - Integrante / Enrique LARA - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

  • 2019 - Atual

    Avaliação do impacto de condições ambientais na diversidade taxonômica e funcional de tecamebas, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Giulia Magri Ribeiro - Integrante / Daniel José Galafasse Lahr - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / CAPES - Centro Anhanguera de Promoção e Educação Social - Bolsa.

  • 2016 - 2018

    Sequenciamento e anotação do transcriptoma da ameba tecada Arcella intermedia: Descrição de vias e descobertas de genes., Descrição: Utilizaremos uma adaptação do protocolo descrito em Picelli 2014, para sequenciamento de mRNA de uma única célula. Em cada uma das fases de crescimento, retiraremos 3 indivíduos, separadamente e os submeteremos à reações de sequenciamento de mRNA. Construiremos um perfil de expressão gênica de cada indivíduo, identificando qual gene se trata, e quantificando a abundância de um determinado transcrito.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Giulia Magri Ribeiro - Integrante / Daniel José Galafasse Lahr - Coordenador., Número de produções C, T & A: 1

  • 2015 - 2015

    Experimentos de exclusão competitiva em protistas, Descrição: Investigamos o princípio de exclusão competitiva em protistas. Para isso, desenvolvemos um método eficiente para medir curvas de crescimento de arcelinídeos e baseado neste método investigamos o princípio de exclusão competitiva.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Giulia Magri Ribeiro - Integrante / Daniel José Galafasse Lahr - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

  • 2013 - 2014

    Tudo está em todo lugar? Explorando a dinâmica populacional em microorganismos eucariontes., Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Giulia Magri Ribeiro - Coordenador / Daniel José Galafasse Lahr - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

Prêmios

2021

Best poster prize International symposium on Testate amoebae, International Society of Testate amoebae.

2017

Best presentation International Symposium of Testate Amoebae, International Society of Testate amoebae.

Histórico profissional

Endereço profissional

  • Universidade de São Paulo, Instituto de Biociências. , Rua do Matão, Butantã, 05508090 - São Paulo, SP - Brasil, Telefone: (11) 26773264

Experiência profissional

2021 - 2022

Real Jardin Botánico de Madrid

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pesquisador visitante, Carga horária: 40

Outras informações:
Exploração da diversidade de amebas tecadas em ambientes eutróficos, através de técnicas de sequenciamento de DNA ambiental em larga escala (metabarcoding); Experimentos em laboratório com cultivos de células e sequenciamento de RNA mensageiro (transcriptomas). Análise bioinformática de dados de genoma e transcriptoma, usando Python, EMBOSS, SAMTOOlS, Phylofisher, SQL. Elaboraração de artigos e relatórios cientı́ficos.

2019 - Atual

Universidade de São Paulo

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Doutoranda, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2020 - 2020

Universidade de São Paulo

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Auxiliar de classe de Biologia Molecular, Carga horária: 8

Outras informações:
Auxiliar de classe da disciplina de Biologia Molecular

2016 - 2018

Universidade de São Paulo

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Mestrado Acadêmico, Carga horária: 30, Regime: Dedicação exclusiva.

2017 - 2017

Universidade de São Paulo

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Auxiliar de classe, Carga horária: 8

Outras informações:
Auxiliar de Classe das disciplinas de Diversidade biológica e Filogenia e de Biologia Celular

2017 - 2017

Universidade de São Paulo

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Técnico de Laboratório, Carga horária: 40

Outras informações:
Isolamento e cultivo de amebas tecadas, extração de DNA e RNA e preparação de amostras para sequenciamento de nova geração.

2012 - 2015

Universidade de São Paulo

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Iniciação científica, Carga horária: 20

Outras informações:
Isolamento e cultivo de amebas tecadas, extração de DNA, amplificaçção de genes, clonagem em plasmı́deos e sequenciamento Sanger; Participação e apresentação em congressos nacionais e internacionais; Elaboraração de artigos e relatórios cientı́ficos.

Atividades

  • 01/2019

    Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Biociências.,Linhas de pesquisa

2017 - 2017

Smith College

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pesquisador visitante, Carga horária: 40

Outras informações:
Bioinformática, processamento e análise de dados de sequenciamento de nova geração, identificação de genes, análise filogenética. Ferramentas: IQTREE, Python, EMBOSS, SAMTOOlS, Phylofisher, SQL, BLAST2GO, Geneious.