Élisson Nogueira Lopes

I am a postdoctoral researcher at the Van Andel Institute (2022), and I am committed to advancing scientific understanding through research. I received my PhD in Bioinformatics from the Universidade Federal de Minas Gerais (2022). My PhD studies focused on the development and application of computational methods to solve biological problems. Also, I have a Master's degree in Bioinformatics from the Universidade Federal de Minas Gerais (2018) and a Bachelor's degree in Biotechnology from the Faculdade Ciencias da Vida (2015), which gave me a strong foundation in the life sciences. I am a reviewer of Wikipathways (2018), which is an open-access pathway resource for the scientific community. I have a background in virology, systems biology, and genomic surveillance. Currently, my work focus on studying cancer epigenetics by developing new methods for analyzing genomic and transcriptomic data, using programming languages such as R, SQL, Perl, HTML, CSS, and Matlab. I am passionate about combining my knowledge of bioinformatics with my interest in life sciences to help shed light on the mysteries of the world.

Informações coletadas do Lattes em 17/10/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Bioinformática

2018 - 2022

Universidade Federal de Minas Gerais
Título: Analise de processos biológicos relacionados a expressão do vírus da Febre amarela em primatas
Marta Giovanetti. Coorientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Virus; Biologia Sistemica; Bioinformática.Grande área: Ciências BiológicasSetores de atividade: Atividades de atenção à saúde humana.

Mestrado em Bioinformática

2016 - 2018

Universidade Federal de Minas Gerais
Título: Construção da via de interação do vírus Ebola com o hospedeiro e estimativa da origem dos genes e processos
, Ano de Obtenção: 2018.José Miguel Ortega.Coorientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

Graduação em Biotecnologia

2012 - 2015

FACULDADES CIENCIAS DA VIDA

Ensino Médio (2º grau)

2008 - 2010

Eponina Soares dos Santos

Pós-doutorado

2022

Pós-Doutorado. , Van Andel Research Institute, VARI, Estados Unidos. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências da Saúde / Área: Medicina / Subárea: Clínica Médica / Especialidade: Neurologia.

Formação complementar

2018 - 2018

Network analysis and visualization with Cytoscape and STRING. (Carga horária: 2h). , Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, AB3C, Brasil.

2016 - 2016

RSG Brazil - 1st Student Council Symposium. (Carga horária: 6h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.

2014 - 2014

Vinho e Saúde. (Carga horária: 4h). , Faculdades Ciências da Vida, FCV, Brasil.

2013 - 2013

Metanucleases Sintéticas: Na luta contra o Câncer. (Carga horária: 3h). , Faculdades Ciências da Vida, FCV, Brasil.

2013 - 2013

Atualidades em cancer: Análises moleculares. (Carga horária: 4h). , Faculdades Ciências da Vida, FCV, Brasil.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Bioinformática.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Biologia de sistemas.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Virologia.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Evolução de processos biológicos.

Participação em eventos

Natal Bioinformatics Forum. Means of response to virus database: MRV-db. 2019. (Congresso).

III Simposio Norte e Nordeste de Bioinformática.Construção da Via de Interação do Virus Ebola com o Hospedeiro e Estimativa da origem dos Genes e processos. 2018. (Simpósio).

Simpósio Satélite da Rede Nacional de Biologia Computacional RENABIC.Construção da via de Interação do vírus Ebola com o hospedeiro e estimativa da origem dos genes e processos. 2018. (Simpósio).

X-Meeting. A tool to investigate the mosaic ancestrality of protein sequeces. 2018. (Congresso).

X-Meeting. How the Ebola infection happens and since when?. 2017. (Congresso).

X-Meeting. Evolutionary origin of the proteins involved in the entry of and defense to the Ebola virus in the host cell. 2016. (Congresso).

Congresso Regional da Saúde. Estudo da Estabilidade do corante Índigo Carmim em condições de degradação forçada. 2015. (Congresso).

Congresso Regional da Saúde. Degradação de Contaminantes Emergentes por Fotocatálise Heterogenea. 2014. (Congresso).

Congresso Regional da Saúde. 2013. (Congresso).

Participação em bancas

Aluno: Laura Cardoso Corrêa Dias

REIS, J. G. A. C.; STANCIOLI, E. F. B.;LOPES, ELISSON N. Avaliação de padrões peptidicos imunodominantes do vírus da Hepatite C restritos ao HLA do TIPO I. 2024. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Gradução em Linguística/UFMG) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Produções bibliográficas

AGRAWAL, AYUSHI ; BALC', HASAN ; HANSPERS, KRISTINA ; COORT, SUSAN L ; MARTENS, MARVIN ; SLENTER, DENISE N ; EHRHART, FRIEDERIKE ; DIGLES, DANIELA ; WAAGMEESTER, ANDRA ; WASSINK, ISABEL ; ABBASSI-DALOII, TOOBA ; LOPES, ELISSON N ; IYER, AISHWARYA ; ACOSTA, JAVIER MILLÁN ; WILLIGHAGEN, LARS G ; NISHIDA, KOZO ; RIUTTA, ANDERS ; BASARIC, HELENA ; EVELO, CHRIS T ; WILLIGHAGEN, EGON L ; et.al . WikiPathways 2024: next generation pathway database. NUCLEIC ACIDS RESEARCH , v. 1, p. 1-11, 2023.
ALCANTARA, LUIZ CARLOS JUNIOR ; NOGUEIRA, ELISSON ; SHUAB, GABRIEL ; TOSTA, STEPHANE ; FRISTCH, HEGGER ; PIMENTEL, VICTOR ; SOUZA-NETO, JAYME A. ; COUTINHO, LUIZ LEHMANN ; FUKUMASU, HEIDGE ; SAMPAIO, SANDRA COCCUZZO ; ELIAS, MARIA CAROLINA ; KASHIMA, SIMONE ; SLAVOV, SVETOSLAV NANEV ; CICCOZZI, MASSIMO ; CELLA, ELEONORA ; LOURENCO, JOSÉ ; FONSECA, VAGNER ; GIOVANETTI, MARTA . SARS-CoV-2 epidemic in Brazil: how the displacement of variants has driven distinct epidemic waves. VIRUS RESEARCH , v. 315, p. 198785, 2022.
LOPES-RIBEIRO, ÁGATA ; ARAUJO, FRANKLIN PEREIRA ; OLIVEIRA, PATRÍCIA DE MELO ; TEIXEIRA, LORENA DE ALMEIDA ; FERREIRA, GEOVANE MARQUES ; LOURENÇO, ALICE APARECIDA ; DIAS, LAURA CARDOSO CORRÊA ; TEIXEIRA, CAIO WILKER ; RETES, HENRIQUE MORAIS ; LOPES, ÉLISSON NOGUEIRA ; VERSIANI, ALICE FREITAS ; BARBOSA-STANCIOLI, EDEL FIGUEIREDO ; DA FONSECA, FLÁVIO GUIMARÃES ; MARTINS-FILHO, OLINDO ASSIS ; TSUJI, MORIYA ; PERUHYPE-MAGALHÃES, VANESSA ; COELHO-DOS-REIS, JORDANA GRAZZIELA ALVES . In silico and in vitro arboviral MHC class I-restricted-epitope signatures reveal immunodominance and poor overlapping patterns. Frontiers in Immunology , v. 13, p. 1-17, 2022.
LOPES, ELISSON NOGUEIRA ; FONSECA, VAGNER ; FRIAS, DIEGO ; TOSTA, STEPHANE ; SALGADO, ÁLVARO ; ASSUNÇÃO VIALLE, RICARDO ; PAULO EDUARDO, TOSCANO SOARES ; BARRETO, FERNANDA KHOURI ; ARISTON DE AZEVEDO, VASCO ; GUARINO, MICHELE ; ANGELETTI, SILVIA ; CICCOZZI, MASSIMO ; JUNIOR ALCANTARA, LUIZ CARLOS ; GIOVANETTI, MARTA . Betacoronaviruses genome analysis reveals evolution toward specific codons usage: implications for SARS-CoV-2 mitigation strategies. JOURNAL OF MEDICAL VIROLOGY , v. 27, p. jmv.27056, 2021.
GIOVANETTI, MARTA ; ALCANTARA, LUIZ CARLOS JUNIOR ; DOREA, ALFREDO SOUZA ; FERREIRA, QESYA RODRIGUES ; MARQUES, WILLIAN DE ALMEIDA ; JUNIOR FRANCA DE BARROS, JOSE ; ADELINO, TALITA EMILE RIBEIRO ; TOSTA, STEPHANE ; FRITSCH, HEGGER ; IANI, FELIPE CAMPOS DE MELO ; MARES-GUIA, MARIA ANGÉLICA ; SALGADO, ALVARO ; FONSECA, VAGNER ; XAVIER, JOILSON ; LOPES, ELISSON NOGUEIRA ; SOARES, GILSON CARLOS ; CASTRO AMARANTE, MARIA FERNANDA DE ; AZEVEDO, VASCO ; KRUGER, ALÍCIA ; CORREA MATTA, GUSTAVO ; et.al . Promoting Responsible Research and Innovation (RRI) During Brazilian Activities of Genomic and Epidemiological Surveillance of Arboviruses. FRONTIERS IN PUBLIC HEALTH , v. 9, p. 9:69374, 2021.
HANSPERS, KRISTINA ; KUTMON, MARTINA ; COORT, SUSAN L. ; DIGLES, DANIELA ; DUPUIS, LAUREN J. ; EHRHART, FRIEDERIKE ; HU, FINTERLY ; LOPES, ELISSON N. ; MARTENS, MARVIN ; PHAM, NHUNG ; SHIN, WOOSUB ; SLENTER, DENISE N. ; WAAGMEESTER, ANDRA ; WILLIGHAGEN, EGON L. ; WINCKERS, LAURENT A. ; EVELO, CHRIS T. ; PICO, ALEXANDER R. . Ten simple rules for creating reusable pathway models for computational analysis and visualization. PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY (ONLINE) , v. 17, p. e1009226, 2021.
ADELINO, TALITA ÉMILE RIBEIRO ; GIOVANETTI, MARTA ; FONSECA, VAGNER ; XAVIER, JOILSON ; DE ABREU, ÁLVARO SALGADO ; DO NASCIMENTO, VALDINETE ALVES ; DEMARCHI, LUIZ HENRIQUE FERRAZ ; OLIVEIRA, MARLUCE APARECIDA ASSUNÇÃO ; DA SILVA, VINÍCIUS LEMES ; DE MELLO, ARABELA LEAL E. SILVA ; CUNHA, GABRIEL MURICY ; SANTOS, ROSELENE HANS ; DE OLIVEIRA, ELAINE CRISTINA ; JÚNIOR, JORGE ANTÔNIO CHAMON ; DE MELO IANI, FELIPE CAMPOS ; DE FILIPPIS, ANA MARIA BISPO ; DE ABREU, ANDRÉ LUIZ ; DE JESUS, RONALDO ; DE ALBUQUERQUE, CARLOS FREDERICO CAMPELO ; E.N.LOPES ; et.al . Field and classroom initiatives for portable sequence-based monitoring of dengue virus in Brazil. Nature Communications , v. 12, p. 2296, 2021.
MARTENS, MARVIN ; AMMAR, AMMAR ; RIUTTA, ANDERS ; WAAGMEESTER, ANDRA ; SLENTER, DENISE N ; HANSPERS, KRISTINA ; A. MILLER, RYAN ; DIGLES, DANIELA ; LOPES, ELISSON N ; EHRHART, FRIEDERIKE ; DUPUIS, LAUREN J ; WINCKERS, LAURENT A ; COORT, SUSAN L ; WILLIGHAGEN, EGON L ; EVELO, CHRIS T ; PICO, ALEXANDER R ; KUTMON, MARTINA . WikiPathways: connecting communities. NUCLEIC ACIDS RESEARCH , v. 49, p. D613-D621, 2020.
RIBEIRO, A. L. ; ARAUJO, F. P. ; VERSIANI, A. F. ; ELISSON NOGUEIRA LOPES ; MELO, P. ; TEIXEIRA, L. A. ; LOURENCO, A. A. ; CAMPOS, C. C. ; STANCIOLI, E. F. B. ; FONSECA, F. G. ; MARTINS-FILHO, O. A. ; PERUHYPE-MAGALHAES, V. ; REIS, J. G. A. C. . OVERLAPPING HLA-A2-RESTRICTED PEPTIDES FROM ARBOVIRUSES TRIGGERS AN IMPAIRED ANTI-VIRAL CD8+T CELL RESPONSE. 2020. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
RIBEIRO, A. L. ; ARAUJO, F. P. ; LOPES, ELISSON N ; REIS, J. G. A. C. . ASSINATURA DE PEPTÍDEOS DO VÍRUS VACINAL ANTIAMARÍLICO RESTRITOS A UM ÚNICO MHC CLASSE-I INDICA MÁ SOBREPOSIÇÃO DE RESPOSTA CD8 + ANTIVIRAL COM OUTROS ARBOVIRUS. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
LOPES, ELISSON N ; SAKAMOTO, T. . A tool to investigate the mosaic ancestrality of protein sequences. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
LOPES, ELISSON N ; ORSINE, L. A. ; SOUZA, I. D. ; SAKAMOTO, T. ; DALMOLIN, R. J. S. ; Ortega J M . How the Ebola infection happens and since when?. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
ELISSON NOGUEIRA LOPES ; SAKAMOTO, T. ; Ortega J M . Evolutionary origin of the proteins involved in the entry of and defense to the Ebola virus in the host cell. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
E.N.LOPES ; Pires E. . Estudo Interdisciplinar da Esquistossomose mansônica e das parasitoses intestinais em crianças do município de Capim Branco/MG. 2015. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).
E.N.LOPES ; F.V. ANDRADE . Degradação de Contaminantes Emergentes por Fotocatálise Heterogenea. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
E.N.LOPES . Aplicação da Bioinformática. 2017. .

Prêmios

2016

Destaque Acadêmico do Curso de Biotecnologia, Faculdade Ciências da Vida.

2015

Desempenho Acadêmico Guimarães Rosa, Faculdade Ciências da Vida.

2015

Melhor Trabalho Científico, Faculdade Ciências da Vida.

2014

Premio Melhor Trabalho Cientifico, Faculdade Ciências da Vida.

Histórico profissional

Endereço profissional

Van Andel Research Institute. , Bostwick Ave, Downtown, 49503 - Grand Rapids, - Estados Unidos, Telefone: (1) 6163490614, URL da Homepage:

Experiência profissional

2021 - 2022

FACULDADES CIENCIAS DA VIDA

Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor de Bioinformática, Carga horária: 6

Outras informações:
Atuação como professor de Bioinformática para o curso de Biotecnologia