Christian Baudet

Possui graduação em Engenharia de Computação pela Universidade Estadual de Campinas (2003), mestrado em Ciência da Computação pela Universidade Estadual de Campinas (2006) e doutorado em Ciência da Computação pela Universidade Estadual de Campinas (2010). No período de Janeiro 2010 a Abril 2015 trabalhou em um pós-doutorado na equipe Inria ERABLE localizada no Laboratório de Biométrie et Biologie Évolutive (CNRS UMR 5558 - LBBE - Université Claude Bernard Lyon I) em Lyon, França. De Maio 2015 a Setembro 2019 atuou no desenvolvimento de software (bioinformática) aplicado ao tratamento de pacientes com câncer no Centre Léon Bérard, Lyon, França. Em Outubro de 2019, integrou a equipe do Departamento de Medicina Genômica do hospital Rigshospitalet em Copenhage, Dinamarca.

Informações coletadas do Lattes em 12/12/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Ciência da Computação

2006 - 2010

Universidade Estadual de Campinas
Título: Enumeração de traces e Identificação de breakpoints: Estudo de aspectos da evolução
Zanoni Dias. Palavras-chave: Bioinformática; Bioinformatics; Biologia Molecular Computacional; Computational Molecular Biology; Rearranjo de Genomas; Genome rearrangement. Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação / Especialidade: Biologia Molecular Computacional.

Mestrado em Ciência da Computação

2004 - 2006

Universidade Estadual de Campinas
Título: Uma abordagem para detecção e remoção de artefatos em seqüências ESTs,Ano de Obtenção: 2006
Zanoni Dias.Palavras-chave: Biologia Molecular Computacional; Projeto EST; Trimagem de seqüências; Clusterização de seqüências.Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação / Especialidade: Biologia Molecular Computacional.

Graduação em Engenharia de Computação

1999 - 2003

Universidade Estadual de Campinas

Pós-doutorado

2014 - 2015

Pós-Doutorado. , Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique - Siège, INRIA, França. , Bolsista do(a): Institut national de recherche en informatique et en automatique, INRIA, França. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra, Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação / Especialidade: Biologia Molecular Computacional. , Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação.

2013 - 2014

Pós-Doutorado. , Institut national de recherche en informatique et en automatique, INRIA, França. , Bolsista do(a): Institut national de recherche en informatique et en automatique, INRIA, França. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra, Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação. , Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação / Especialidade: Biologia Molecular Computacional.

2011 - 2013

Pós-Doutorado. , UMR CNRS 5558 Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive, LBBE, França. , Bolsista do(a): Centre national de la recherche scientifique, CNRS, França. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra, Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação. , Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação / Especialidade: Biologia Molecular Computacional.

Formação complementar

2014 - 2014

ADDICTION. (Carga horária: 40h). , Centre de Recherche INRIA Grenoble - Rhône-Alpes, INRIA-GRENOBLE, França.

2012 - 2012

Enumeration Algorithms & Exact Methods (Enumex). (Carga horária: 40h). , Bertinoro international Center for informatics, BICI, Itália.

2011 - 2011

Graph Theory, Algorithms and Applications. (Carga horária: 40h). , International School on Mathematics "Guido Stampacchia", ISMGS, Itália.

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Francês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação/Especialidade: Bioinformática.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação/Especialidade: Biologia Molecular Computacional.

Participação em eventos

Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM 2013). 2013. (Congresso).

Metabolic Pathway Analysis 2013. 2013. (Encontro).

Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM 2012). 2012. (Congresso).

Seminário do Laboratório Nacional de Computação Científica.Detecting genomic rearrangement breakpoints. 2012. (Seminário).

The Future of Phylogenetic Networks. 2012. (Oficina).

14th International Conference on Research in Computational Biology. Partial enumeration of traces of solutions for the problem of sorting by signed reversals. 2010. (Congresso).

9th European Conference on Computational Biology. Cassis: detection of genomic rearrangement breakpoints. 2010. (Congresso).

Conference Track on Bioinformatics and Computational Systems Biology (ACM SAC BIO'2010).An Improved Algorithm to Enumerate All Traces that Sorts a Signed Permutation by Reversals. 2010. (Simpósio).

International Symposium of Biocomputing (ACM ISB'2010).Chronological Order of Reversal Events on Rickettsia Genus. 2010. (Simpósio).

Workshop in Bioinformatics and Algorithms (WBA 2010).Enumerating traces of solutions of the problem of sorting by signed reversals. 2010. (Encontro).

5th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology (X-Meeting'2009). An improved algorithm to enumerate all traces that sort a signed permutation by reversals. 2009. (Congresso).

5th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology (X-Meeting'2009). Chronological order of reversal events on Rickettsia genus. 2009. (Congresso).

3rd International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology (X-Meeting'2007). Database Management System for Molecular Biology Applications. 2007. (Congresso).

Brazilian Symposium on Bioinformatics (BSB'2007).New EST trimming procedure applied to SUCEST sequences. 2007. (Simpósio).

14th Annual International Conference On Intelligent Systems For Molecular Biology (ISMB'2006). New EST trimming procedure applied to SUCEST sequences. 2006. (Congresso).

2nd International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology (X-Meeting'2006). Low quality trimming on SUCEST ESTs. 2006. (Congresso).

1st International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology (X-Meeting'2005). Analysis of slipped sequences in ESTs Projects. 2005. (Congresso).

Brazilian Symposium on Bioinformatics (BSB'2005).New EST Trimming Strategy. 2005. (Simpósio).

Produções bibliográficas

2015 DONATI, BEATRICE ; BAUDET, CHRISTIAN ; SINAIMERI, BLERINA ; CRESCENZI, PIERLUIGI ; SAGOT, MARIE-FRANCE . EUCALYPT: efficient tree reconciliation enumerator. Algorithms for Molecular Biology , v. 10, p. 3, 2015.
2015 Baudet, C. ; DONATI, B. ; SINAIMERI, B. ; CRESCENZI, P. ; Gautier, C. ; MATIAS, C. ; SAGOT, M.- F. . Cophylogeny Reconstruction via an Approximate Bayesian Computation. Systematic Biology , v. 64, p. 416-431, 2015.
2012 BAUDET, CHRISTIAN ; Sagot, M.-F. ; DIAS, ZANONI ; SAGOT, MARIE-FRANCE . Sampling Solution Traces for the Problem of Sorting Permutations by Signed Reversals. Algorithms for Molecular Biology , v. 7, p. 18, 2012.

Outras produções

BAUDET, C. ; DONATI, B. ; SINAIMERI, B. ; CRESCENZI, P. ; Gautier, C. ; MATIAS, C. ; SAGOT, MARIE-FRANCE . Coala - CO-evolution Assessment by a Likelihood-free Approach. 2013.

Baudet, C. ; Lemaitre, C. ; DIAS, ZANONI ; Gautier, C. ; Tannier, E. ; SAGOT, MARIE-FRANCE . Cassis: Detection of genomic rearrangement breakpoints. 2010.

TANAKA, E. H. ; JULIATO, M. R. ; BAUDET, C. ; GALVES, M. ; COELHO, T. T. ; ROCHA, H. V. . TFlex. 2004.

BAUDET, CHRISTIAN ; DIAS, ZANONI . Partial Enumeration of Traces of Solutions for the Problem of Sorting by Signed Reversals. 2011.

BAUDET, Christian ; GALVES, M. ; DIAS, Z. . Comparação de métodos para determinação de SNPs com medidas de confiabilidade. 2006.

BAUDET, C. ; DIAS, Z. . New EST trimming strategy. 2005.

BAUDET, C. ; DIAS, Z. . Analysis of slipped sequences in ESTs Projects. 2005.

Histórico profissional

Endereço profissional

Rigshospitalet. , BLEGDAMSVEJ 9, --, 2100 - Copenhage, - Dinamarca, Telefone: (33) 761004204, URL da Homepage:

Experiência profissional

2006 - 2009

Scylla Informática S.A

Vínculo: Funcionário, Enquadramento Funcional: Analista Programador, Carga horária: 40

2015 - 2019

Centre Léon Bérard

Vínculo: Formal labor contract, Enquadramento Funcional: Software Engineer (Bioinformatics), Regime: Dedicação exclusiva.

2019 - Atual

Rigshospitalet

Vínculo: Formal labor contract, Enquadramento Funcional: Software Engineer (Bioinformatics), Carga horária: 37, Regime: Dedicação exclusiva.