Andressa Monteiro Venturini

Pós-doutorado

Formação complementar

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Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• BERRIOS, LOUIS ; BOGAR, GLADE D. ; BOGAR, LAURA M. ; VENTURINI, ANDRESSA M. ; WILLING, CLAIRE E. ; DEL RIO, ANASTACIA ; ANSELL, T. BERTIE ; ZEMAITIS, KEVIN ; VELICKOVIC, MARIJA ; VELICKOVIC, DUSAN ; PELLITIER, PETER T. ; YEAM, JAY ; HUTCHINSON, CHELSEA ; BLOODSWORTH, KENT ; LIPTON, MARY S. ; PEAY, KABIR G. . Ectomycorrhizal fungi alter soil food webs and the functional potential of bacterial communities. mSystems , v. 9, p. e00369, 2024.

• BERRIOS, LOUIS ; VENTURINI, ANDRESSA M ; ANSELL, TILLSON BERTIE ; TOK, ESTHER ; JOHNSON, WILLIAM ; WILLING, CLAIRE E ; PEAY, KABIR G . Co-inoculations of bacteria and mycorrhizal fungi often drive additive plant growth responses. Isme Communications , v. 4, p. 1, 2024.

• GONTIJO, JÚLIA B. ; PAULA, FABIANA S. ; BIELUCZYK, WANDERLEI ; FRANÇA, ALINE G. ; NAVROSKI, DEISI ; MANDRO, JÉSSICA A. ; VENTURINI, ANDRESSA M. ; ASSELTA, FERNANDA O. ; MENDES, LUCAS W. ; MOURA, JOSÉ M. S. ; MOREIRA, MARCELO Z. ; NÜSSLEIN, KLAUS ; BOHANNAN, BRENDAN J. M. ; BODELIER, PAUL L. E. ; RODRIGUES, JORGE L. MAZZA ; TSAI, SIU M. . Methane-cycling microbial communities from Amazon floodplains and upland forests respond differently to simulated climate change scenarios. Environmental Microbiome , v. 19, p. 1, 2024.

• DA CRUZ ALBINO, RAYANE ; BRIMBLE, MARK ALLEN ; ZDENEK, CHRISTINA ; VANDENBROECK, KATRIEN ; MASUD, SARAH ; ZHANG, XUAN ; COSENTINO, MEL ; GUPTA, ANKITA ; ABDUL-GHANI, RASHAD ; GERARDUZZI, CASIMIRO ; JACKSON, PAMELA ; OOMEN, REBEKAH ; SERVAIS, BRAM ; MANJUNATHA, AKSHATHA ; BULTHUIS, NICK ; ROMERO-MOLINA, CARMEN ; TENG, DEQUN ; KOSANIC, ALEKSANDRA ; DE ANGELI DUTRA, DANIELA ; VENTURINI, A. M. ; et.al . Preventing bad behavior in academia. SCIENCE , v. 385, p. 22-24, 2024.

• OBREGON ALVAREZ, DASIEL ; FONSECA DE SOUZA, LEANDRO ; MENDES, LUCAS WILLIAM ; DE MORAES, MOACIR TUZZIN ; TOSI, MICAELA ; VENTURINI, ANDRESSA MONTEIRO ; MEYER, KYLE M. ; BARBOSA DE CAMARGO, PLÍNIO ; BOHANNAN, BRENDAN J. M. ; MAZZA RODRIGUES, JORGE L. ; DUNFIELD, KARI E. ; TSAI, SIU MUI . Shifts in functional traits and interactions patterns of soil methane-cycling communities following forest-to-pasture conversion in the Amazon Basin. MOLECULAR ECOLOGY , v. 32, p. 3257-3275, 2023.

• BIELUCZYK, WANDERLEI ; ASSELTA, FERNANDA OMETTO ; NAVROSKI, DEISI ; GONTIJO, JÚLIA BRANDÃO ; VENTURINI, ANDRESSA MONTEIRO ; MENDES, LUCAS WILLIAM ; SIMON, CARLA PENHA ; CAMARGO, PLÍNIO BARBOSA DE ; TADINI, AMANDA MARIA ; MARTIN-NETO, LADISLAU ; BENDASSOLLI, JOSÉ ALBERTINO ; RODRIGUES, RICARDO RIBEIRO ; VAN DER PUTTEN, WIM H. ; TSAI, SIU MUI . Linking above and belowground carbon sequestration, soil organic matter properties, and soil health in Brazilian Atlantic Forest restoration. JOURNAL OF ENVIRONMENTAL MANAGEMENT , v. 344, p. 118573, 2023.

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• VENTURINI, A. M. ; DIAS, N. M. S. ; GONTIJO, J. B. ; YOSHIURA, C. A. ; PAULA, F. S. ; MEYER, K. M. ; NAKAMURA, F. M. ; FRANCA, A. G. ; BORGES, C. D. ; BARLOW, JOS ; BERENGUER, ERIKA ; NUSSLEIN, K. ; RODRIGUES, J. L. M. ; BOHANNAN, B. J. M. ; TSAI, S. M. . Increased soil moisture intensifies the impacts of forest-to-pasture conversion on methane emissions and methane-cycling communities in the Eastern Amazon. ENVIRONMENTAL RESEARCH , v. 212, p. 113139, 2022.

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• VENTURINI, ANDRESSA M. ; GONTIJO, JÚLIA B. ; MANDRO, JÉSSICA A. ; PAULA, FABIANA S. ; YOSHIURA, CAIO A. ; DA FRANÇA, ALINE G. ; TSAI, SIU M. . Genome-resolved metagenomics reveals novel archaeal and bacterial genomes from Amazonian forest and pasture soils. Microbial Genomics , v. 8, p. 000853, 2022.

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• GONTIJO, JÚLIA B. ; PAULA, FABIANA S. ; VENTURINI, ANDRESSA M. ; YOSHIURA, CAIO A. ; BORGES, CLOVIS D. ; MOURA, JOSÉ MAURO S. ; BOHANNAN, BRENDAN J.M. ; NÜSSLEIN, KLAUS ; MAZZA RODRIGUES, JORGE L. ; TSAI, SIU M. . Not just a methane source: Amazonian floodplain sediments harbour a high diversity of methanotrophs with different metabolic capabilities. Molecular Ecology , v. 30, p. mec.15912, 2021.

• YOSHIURA, CAIO AUGUSTO ; VENTURINI, ANDRESSA MONTEIRO ; BRAGA, LUCAS PALMA PEREZ ; FRANÇA, ALINE GIOVANA DA ; LYRA, MARIA DO CARMO CATANHO PEREIRA DE ; TSAI, SIU MUI ; RODRIGUES, JORGE LUIZ MAZZA . Responses of Low-Cost Input Combinations on the Microbial Structure of the Maize Rhizosphere for Greenhouse Gas Mitigation and Plant Biomass Production. Frontiers in Plant Science , v. 12, p. 683658, 2021.

• DE CHAVES, MIRIAM GONÇALVES ; VENTURINI, ANDRESSA MONTEIRO ; MERLOTI, LUIS FERNANDO ; BARROS, DAYANE JULIATE ; ROSSETTO, RAFFAELLA ; KURAMAE, EIKO EURYA ; TSAI, SIU MUI ; NAVARRETE, ACACIO APARECIDO . Combined Use of Vinasse and Nitrogen as Fertilizers Affects Nitrification, Ammonification, and Denitrification by Prokaryotes. Frontiers in Soil Science , v. 1, p. 22, 2021.

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• MEYER, KYLE M. ; MORRIS, ANDREW H. ; WEBSTER, KEVIN ; KLEIN, ANN M. ; KROEGER, MARIE E. ; MEREDITH, LAURA K. ; BRÆNDHOLT, ANDREAS ; NAKAMURA, FERNANDA ; VENTURINI, ANDRESSA ; FONSECA DE SOUZA, LEANDRO ; SHEK, KATHERINE L. ; DANIELSON, RACHEL ; VAN HAREN, JOOST ; BARBOSA DE CAMARGO, PLINIO ; TSAI, SIU MUI ; DINI-ANDREOTE, FERNANDO ; DE MAURO, JOSÉ M.S. ; BARLOW, JOS ; BERENGUER, ERIKA ; NÜSSLEIN, KLAUS ; et.al . Belowground changes to community structure alter methane-cycling dynamics in Amazonia. ENVIRONMENT INTERNATIONAL , v. 145, p. 106131, 2020.

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• PAULA, F. S. ; GONTIJO, J. B. ; VENTURINI, A. M. ; ASSELTA, F. O. ; LEMOS, L. N. ; BIELUCZYK, W. ; RODRIGUES, J. L. ; TSAI, S. M. . Integrating Methane and Nitrogen Cycles in Land Use Change Scenarios in the Amazon Rainforest. In: ASM Microbe 2019, 2019, São Francisco. Abstracts of the ASM Microbe 2019, 2019.

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• VENTURINI, A. M. ; YOSHIURA, C. A. ; ARNALDO, M. ; TSAI, S. M. . Detecção quantitativa do filo Verrucomicrobia em solos sob diferentes sistemas de colheita de cana-de-açúcar. In: VI Simpósio Científico dos Pós-Graduandos no CENA, 2013, Piracicaba. Resumos do VI Simpósio Científico dos Pós-Graduandos no CENA, 2013.

• VENTURINI, A. M. ; YOSHIURA, C. A. ; FRANCA, A. G. ; DINIZ, T. R. ; TSAI, S. M. . Quantification of soil bacteria in sugarcane areas under different management regimes and in a native vegetation area. In: VI Simpósio de Microbiologia Aplicada, 2013, Rio Claro. Anais do VI Simpósio de Microbiologia Aplicada, 2013.

• VENTURINI, A. M. ; TSAI, S. M. . Desenho de primers para o gene 16S rRNA de Zymomonas mobilis. In: 19º Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP, 2011, Ribeirão Preto. Resumos do 19º Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP, 2011.

• SAITO, D. ; RODRIGUES, I. S. C. ; VENTURINI, A. M. ; GONÇALVES, R. B. ; HOFLING, J. F. . Molecular cloning and gene expression of the subgingival biofilm metagenome. In: International Association for Dental Research General Session & Exhibition 2010, 2010, Barcelona. International Association for Dental Research General Session & Exhibition 2010, 2010.

• VENTURINI, A. M. ; SAITO, D. . Bioprospecção de genes de resistência à eritromicina e doxiciclina do metagenoma oral. In: 27ª Reunião de Genética de Microrganismos, 2010, Guarujá. 27ª Reunião de Genética de Microrganismos, 2010.

• VENTURINI, A. M. ; SAITO, D. . Bioprospecção de genes de resistência à eritromicina e doxiciclina do metagenoma oral. In: 56º Congresso Brasileiro de Genética, 2010, Guarujá. Anais do Congresso Brasileiro de Genética, 2010.

• VENTURINI, A. M. ; SAITO, D. . Isolamento de genes de resistência à eritromicina e doxiciclina do metagenoma oral. In: XVIII Congresso Interno de Iniciação Científica, 2010, Campinas. Caderno de Resumos do XVIII Congresso Interno de Iniciação Científica da Unicamp, 2010.

• VENTURINI, A. M. ; HOFLING, J. F. ; SAITO, D. . Análise da transferência horizontal de genes de resistência à eritromicina em bactérias. In: XVI Jornada Odontológica de Piracicaba, 2009, Piracicaba. Anais da XVI Jornada Odontológica de Piracicaba, 2009.

• SILVA, A. L. R. ; VENTURINI, A. M. ; CERIALLE, L. M. ; GANDARA, F. B. . Biologia de polinização e influência da alteração de odor floral na frequência dos polinizadores em Senna macranthera (DC. ex Collad.) H.S. Irwin & Barneby. In: 17º Simpósio de Iniciação Científica da USP, 2009, Ribeirão Preto. Resumos do 17º Simpósio de Iniciação Científica da USP, 2009.

• VENTURINI, A. M. ; MARSH, T. L. ; HOFLING, J. F. ; SAITO, D. . Molecular identification of bacteria from dental implants at a pre-Established evolutionary distance. In: I Escola Brasileira de Bioinformática, 2008, Santo André. Proceedings of the First Brazilian School on Bioinformatics, 2008.

• VENTURINI, A. M. ; HOFLING, J. F. ; SAITO, D. . Genômica comparativa de microrganismos: Potenciais aplicações no estudo de patógenos orais. In: XV Jornada Odontológica de Piracicaba, 2008, Piracicaba. Anais da XV Jornada Odontológica de Piracicaba, 2008.

• MOFATTO, L.S. ; RIBEIRO, M.M. ; VENTURINI, A. M. ; SAITO, D. ; LINE, S.R.P. . Desenvolvimento de ferramentas de bioinformática em linguagem de programação Ruby. In: XV Jornada Odontológica de Piracicaba, 2008, Piracicaba. Anais da XV Jornada Odontológica de Piracicaba, 2008.

• VENTURINI, A. M. ; TSAI, S. M. . Unraveling the impacts of land-use change on tropical soil microbial communities. 2021. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• VENTURINI, A. M. ; MANDRO, J. A. ; GONTIJO, J. B. ; TSAI, S. M. . Genome-centric metagenomics revealed novel microbial lineages from Amazonian forest and pasture soils. 2021. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• VENTURINI, A. M. . Conceitos de Estatística aplicados à Ecologia Microbiana. 2020. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• VENTURINI, A. M. . Comandos básicos de R. 2020. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• VENTURINI, A. M. . Análise de metagenomas utilizando o servidor MG-RAST. 2020. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• VENTURINI, A. M. ; MANDRO, J. A. ; GONTIJO, J. B. ; TSAI, S. M. . Soil methane cycle in the forest-to-pasture conversion: novel microbial lineages from a microcosm experiment. 2020. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• VENTURINI, A. M. . Extração de DNA genômico de tecidos foliares. 2020. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• VENTURINI, A. M. . Extração de DNA total do solo. 2020. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• VENTURINI, A. M. . Extração de DNA total do solo. 2020. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• VENTURINI, A. M. . Conceitos de Biossegurança. 2020. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• VENTURINI, A. M. ; DIAS, N. M. S. ; GONTIJO, J. B. ; YOSHIURA, C. A. ; FRANCA, A. G. ; BOHANNAN, B. J. ; TSAI, S. M. . Moisture differently affects methane microbial communities of forest and pasture soils in the Eastern Amazon. 2019. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• VENTURINI, A. M. . Explorando as comunidades microbianas do metano de solos da Amazônia por métodos de Bioinformática e Estatística. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• VENTURINI, A. M. . Conversão floresta-pastagem na Amazônia: impactos sobre as comunidades microbianas do solo. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• VENTURINI, A. M. . Avaliando os impactos da conversão floresta-pastagem na Amazônia sobre as comunidades microbianas do solo através de novas abordagens moleculares. 2018. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• VENTURINI, A. M. ; GONTIJO, J. B. ; YOSHIURA, C. A. ; FRANCA, A. G. ; TSAI, S. M. . Effect of moisture in forest-to-pasture conversion on the microbial methane cycle. 2016. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• VENTURINI, A. M. ; YOSHIURA, C. A. ; FRANCA, A. G. ; TSAI, S. M. . Influência do uso do solo e da rizosfera de cana-de-açúcar sobre comunidades de Bacteria e do filo Verrucomicrobia em mesocosmos. 2014. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• VENTURINI, A. M. ; YOSHIURA, C. A. ; ARNALDO, M. ; TSAI, S. M. . Detecção quantitativa do filo Verrucomicrobia em solos sob diferentes sistemas de colheita de cana-de-açúcar. 2013. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• VENTURINI, A. M. ; YOSHIURA, C. A. ; FRANCA, A. G. ; DINIZ, T. R. ; TSAI, S. M. . Quantification of soil bacteria in sugarcane areas under different management regimes and in a native vegetation area. 2013. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• VENTURINI, A. M. ; TSAI, S. M. . Desenho e validação in silico de primers para o gene 16S rRNA de Zymomonas mobilis. 2013. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• VENTURINI, A. M. ; TSAI, S. M. . Desenho de primers para o gene 16S rRNA de Zymomonas mobilis. 2011. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• VENTURINI, A. M. ; SAITO, D. . Bioprospecção de genes de resistência à eritromicina e doxiciclina do metagenoma oral. 2010. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• VENTURINI, A. M. ; SAITO, D. . Bioprospecção de genes de resistência à eritromicina e doxiciclina do metagenoma oral. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• VENTURINI, A. M. ; SAITO, D. . Isolamento de genes de resistência à eritromicina e doxiciclina do metagenoma oral. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• VENTURINI, A. M. ; HOFLING, J. F. ; SAITO, D. . Análise da transferência horizontal de genes de resistência à eritromicina em bactérias. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• VENTURINI, A. M. ; MARSH, T. L. ; HOFLING, J. F. ; SAITO, D. . Molecular identification of bacteria from dental implants at a pre-established evolutionary distance. 2008. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• VENTURINI, A. M. ; HOFLING, J. F. ; SAITO, D. . Genômica comparativa de microrganismos: Potenciais aplicações no estudo de patógenos orais. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• ALVAREZ, D. O. ; SOUZA, L. F. ; MENDES, L. W. ; MORAES, M. T. ; TOSI, M. ; VENTURINI, A. M. ; MEYER, K. M. ; CAMARGO, P. B. ; BOHANNAN, B. J. M. ; RODRIGUES, J. L. M. ; DUNFIELD, K. E. ; TSAI, S. M. . Metagenomic insight into shifts of methane-cycling communities following pasture conversion in the Amazon basin 2022 (Preprint).

• VENTURINI, ANDRESSA MONTEIRO . Genome-resolved metagenomics reveals novel archaeal and bacterial genomes from Amazonian forest and pasture soils 2022 (KBase narrative).

• GONTIJO, JÚLIA B. ; VENTURINI, ANDRESSA MONTEIRO . Metagenomes from Eastern Brazilian Amazonian floodplains in the wet and dry seasons 2022 (KBase narrative).

• MANDRO, JÉSSICA A. ; VENTURINI, ANDRESSA MONTEIRO . Metagenome-assembled genomes from Amazonian soil microbial consortia 2022 (KBase narrative).

• MEYER, K. M. ; MORRIS, A. H. ; WEBSTER, K. ; KLEIN, A. M. ; KROEGER, M. E. ; MEREDITH, L. K. ; BRÆNDHOLT, A. ; NAKAMURA, F. M. ; VENTURINI, A. M. ; SOUZA, L. F. ; SHEK, K. L. ; DANIELSON, R. ; HAREN, J. V. ; CAMARGO, P. B. ; TSAI, S. M. ; DINI-ANDREOTE, F. ; MAURO, J. M. S. ; NUSSLEIN, K. ; SALESKA, S. ; RODRIGUES, J. L. M. ; et.al . Belowground changes to community structure alter methane-cycling dynamics in Amazonia 2020 (Preprint).

• GONTIJO, J. B. ; VENTURINI, A. M. ; YOSHIURA, C. A. ; BORGES, C. D. ; MAURO, J. M. S. ; BOHANNAN, B. J. ; NUSSLEIN, K. ; RODRIGUES, J. L. M. ; PAULA, F. S. ; TSAI, S. M. . Seasonal dynamics of methane cycling microbial communities in Amazonian floodplain sediments 2020 (Preprint).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2021 - Atual

  Critical microbial processes in the Amazon: responses to land-use changes and forest recovery, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Andressa Monteiro Venturini - Coordenador.

• 2020 - Atual

  Avaliação taxonômica e funcional da comunidade microbiana envolvida na ciclagem do metano em solos da Amazônia Brasileira, Descrição: Esta proposta, integrada ao projeto colaborativo ''Dimensões US-Biota-São Paulo: Integrando as dimensões da biodiversidade microbiana ao longo da mudança de uso da terra em florestas tropicais'', tem como objetivo estudar as bactérias e arquéias envolvidas no consumo e emissão de metano em solos sob diferentes usos da terra na Amazônia Brasileira em comparação com a floresta natural. Iremos investigar diversas capacidades metabólicas por meio da modelagem in silico e da integração funcional de dados ômicos. A avaliação das frações funcionais das comunidades será mediada pela análise da marcação com isótopos estáveis (Stable Isotope Probing - SIP) e também pelo isolamento de organismos envolvidos no ciclo do metano. Com base em ambos os recursos, o DNA marcado e os isolados servirão para a reconstrução metabólica, gerando um conjunto de dados inovador sobre os genes ativos presentes em solos sob diferentes usos. A integração desses dados com outras dimensões da biodiversidade na Amazônia pode levar a um modelo, cujo potencial preditivo será validado contra um conjunto de taxas de crescimento determinadas experimentalmente e dados fenotípicos. Além disso, a integração de evidências a partir de dados proteômicos, fenômicos, fisiológicos e de modelagem metabólica nos permitirá revelar possíveis interferências das alterações dependentes de metano na expressão gênica na rede metabólica geral do ciclo do metano. Este estudo trará uma plataforma valiosa para futuras pesquisas sobre os estados funcionais microbianos para os processos de consumo e emissão de metano.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Andressa Monteiro Venturini - Integrante / Siu Mui Tsai - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 5

• 2017 - Atual

  Comunidades microbianas do solo na conversão floresta-pastagem: uma abordagem multi-ômica, Descrição: Em pesquisa anterior, desenvolvida no âmbito do projeto FAPESP 2015/13546-7, nós observamos que os solos de floresta e de pastagem têm diferentes potenciais de sequestro e emissão de metano, intensificados pela umidade do solo. Essas descobertas reforçam a necessidade de uma compreensão mais profunda dos parâmetros ambientais que modulam o ciclo microbiano do metano em solos tropicais. Entretanto, ainda pouco se sabe sobre o perfil taxonômico e funcional dos microrganismos que respondem aos principais fatores que determinam o fluxo de metano em solos: umidade e temperatura. Portanto, nessa proposta de estágio, proponho a utilização de uma abordagem multi-ômica (sequenciamento de amplicon, metagenômica e metatranscritômica) para caracterizar as comunidades microbianas que respondem às mudanças no uso da terra, umidade e temperatura em solos da Floresta Nacional do Tapajós e seus adjacentes, no Estado do Pará, na Amazônia Oriental. Esse objetivo será alcançado através da: (1) análise de bioinformática e estatística dos conjuntos de dados metagenômicos e metatranscritômicos previamente obtidos e (2) um experimento de microcosmos para determinar o efeito da seca, cheia e aumento da temperatura sobre a abundância e o perfil taxonômico e funcional das comunidades microbianas em solos submetidos à conversão floresta-pastagem. Esse projeto é uma colaboração entre o Laboratório de Biologia Celular e Molecular da Universidade de São Paulo (Brasil) e o Instituto de Ecologia e Evolução da Universidade de Oregon (Estados Unidos), sob a supervisão conjunta da Profa. Dra. Siu Mui Tsai e o Prof. Dr. Brendan J. M. Bohannan.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Andressa Monteiro Venturini - Integrante / Siu Mui Tsai - Coordenador / Brendan James Marc Bohannan - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 10

• 2014 - Atual

  Capacidade de resiliência de comunidades microbianas avaliada por metagenômica e metatranscriptômica em solos da Amazônia, Descrição: A Bacia Amazônica abriga as maiores florestas tropicais do planeta, que tem sido transformadas em áreas destinadas à agropecuária em decorrência do crescimento da demanda mundial por alimentos. A mudança de uso do solo altera as suas características físicas, químicas e biológicas originais. Consequentemente, os microrganismos do solo, que participam de processos essenciais para todos os ecossistemas terrestres, respondem de diferentes maneiras a essas mudanças, de forma a alterar a sua diversidade taxonômica e funcional. O uso antrópico do solo é considerado como uma das principais fontes emissoras dos gases do efeito estufa para a atmosfera e, assim, o estudo dos seus efeitos sobre os grupos microbianos que atuam dentro dos ciclos desses gases é de grande importância. Dentre esses, destaca-se o ciclo biogeoquímico do metano, considerado diretamente relacionado aos atributos da comunidade microbiana do solo. Diferentes fatores ambientais afetam os grupos de microrganismos produtores e consumidores de metano, com estudos que indicam a forte influência da umidade sobre os mesmos. Contudo, os efeitos da mudança do uso do solo e da umidade em solos sob diferentes usos sobre a diversidade microbiana taxonômica e funcional foram pouco explorados na literatura, especialmente em solos tropicais. Nesse contexto, o uso conjunto de técnicas moleculares a partir do DNA e RNA total do solo pode trazer novos dados a respeito desses impactos sobre a mesma. Portanto, o objetivo do projeto de pesquisa é determinar o efeito da mudança do uso do solo e da umidade em solos sob diferentes usos sobre a sua microbiota, com ênfase no ciclo do metano, pelo sequenciamento em larga escala e PCR quantitativo em tempo-real de amostras de DNA e RNA total de solo de áreas de floresta primária, floresta secundária e pastagem no Estado do Pará, na Amazônia Oriental.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Andressa Monteiro Venturini - Integrante / Siu Mui Tsai - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa., Número de produções C, T & A: 29

• 2012 - Atual

  Detecção, quantificação e sequenciamento dos genes 16S rRNA e pmoA do filo Verrucomicrobia em solos sob cultivo de cana-de-açúcar, Descrição: O filo Verrucomicrobia é um grupo de microrganismos gram-negativos recentemente adicionados ao Domínio Bacteria. Os organismos do filo Verrucomicrobia foram inicialmente observados em ambientes aquáticos, mas, atualmente, já foram encontrados nos mais diversos ambientes. No solo, os organismos do filo Verrucomicrobia representam de 1 a 10% de todo o gene 16S rRNA bacteriano presente, e estudos recentes indicam que o filo é dominante em muitas comunidades microbianas. Além disso, recentemente, foram descobertos organismos metanotróficos pertencentes ao filo, detectados pelo gene pmoA, responsável pela conversão do gás do efeito estufa metano em metanol. O Brasil é considerado o maior produtor mundial de cana-de-açúcar, que apresenta grande importância social e econômica, relacionada principalmente à produção de açúcar e álcool. A conversão de um sistema natural para agrícola altera a biomassa microbiana do solo e, além disso, o manejo da colheita da cana pode influenciar, entre outros fatores, nos atributos físicos, químicos e biológicos do solo. O filo Verrucomicrobia é afetado por características ambientais que mudam de acordo com o tempo e profundidade do solo. Além disso, diversos estudos revelaram que a abundância e a estrutura das comunidades de Verrucomicrobia podem ser afetadas pelo desmatamento e mudança de uso do solo. O projeto tem como objetivo principal detectar, quantificar e sequenciar os genes 16S rRNA e pmoA de Verrucomicrobia através de métodos moleculares independentes de cultivo em amostras de solos sob cultivo de cana-de-açúcar crua e queimada por meio de um estudo comparativo com experimentos de mesocosmos estabelecidos em casa-de-vegetação.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Andressa Monteiro Venturini - Integrante / Siu Mui Tsai - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa., Número de produções C, T & A: 19

• 2011 - 2012

  Desenho e validação de primers para o gene 16S rRNA de Zymomonas mobilis, Descrição: Zymomonas mobilis é uma bactéria fermentadora obrigatória, pertencente ao filo Proteobacteria, que utiliza frutose, glicose e sacarose como fontes de carbono através da via Entner-Doudoroff. É a única bactéria anaeróbia conhecida que utiliza essa rota. Z. mobilis produz etanol e outros produtos químicos de valor, como sorbitol e levana. É também pesquisada na área médica, pois apresenta efeito antagônico sobre bactérias, fungos e protozoários. A Reação em Cadeia de Polimerase (PCR) é uma técnica que possibilita a amplificação de DNA in vitro. Os primers utilizados na PCR são pequenos fragmentos de DNA de fita simples, desenhados através de programas específicos, que definem a sequência a ser amplificada. O projeto teve como objetivo desenhar primers específicos para o gene 16S rRNA de Zymomonas mobilis a partir de sequências disponíveis em bancos de dados públicos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Andressa Monteiro Venturini - Integrante / Siu Mui Tsai - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa., Número de produções C, T & A: 6

• 2009 - 2010

  Isolamento de genes de resistência à eritromicina e doxiciclina do metagenoma oral, Descrição: A emergência de novas linhagens resistentes de bactérias evidencia a importância de linhas de pesquisa que propiciem o desenvolvimento de estratégias de controle de sua disseminação e auxilie na formulação de novos antimicrobianos. A metagenômica, que consiste na análise integrada de genomas microbianos de ambientes complexos, permite um novo enfoque na identificação de biomoléculas de interesse agro-industrial, médico-odontológico e farmacêutico. Nesse contexto, a expressão heteróloga de genes de bibliotecas metagenômicas constitui uma ferramenta importante na detecção de novos genes de resistência a antibióticos. O projeto buscou a caracterização de novos determinantes de resistência à eritromicina e doxiciclina do biofilme dentário, através da clonagem aleatória de DNA metagenômico, sequenciamento gênico, análise comparativa de sequências, e caracterização funcional e estrutural de sequências protéicas preditas in silico. Os resultados desta pesquisa poderão contribuir para um maior conhecimento dos genes de resistência à eritromicina e doxiciclina, para o entendimento de seus mecanismos de ação, e para o desenvolvimento de estratégias específicas de combate a microrganismos resistentes.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Andressa Monteiro Venturini - Integrante / Daniel Saito - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa., Número de produções C, T & A: 10

• 2008 - 2009

  Análise de transferência horizontal de genes de resistência à eritromicina, Descrição: A transferência horizontal de genes é definida como a troca de material genético entre genomas de espécies não relacionadas. É um importante mecanismo de variabilidade, e destaca-se seu papel na resistência bacteriana aos antibióticos, um dos principais problemas atuais para a saúde pública. A eritromicina é um antibiótico do grupo dos macrolídeos que inibe a síntese protéica pela ação direta na subunidade maior do ribossomo procarioto. O projeto teve como objetivo identificar possíveis evidências de transferência horizontal do gene metilase de resistência à eritromicina (erm) em bactérias através da análise in silico de sequências disponíveis em bancos de dados públicos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Andressa Monteiro Venturini - Integrante / Daniel Saito - Coordenador., Número de produções C, T & A: 10

Prêmios