Marina Muniz Oliveira Torres

Formação complementar

Participação em eventos

Produções bibliográficas

• OLIVEIRA, M. M. ; Brito, RCF ; OLIVEIRA, L. A. M. ; Reis, AB ; Corrêa-Oliveira, R ; Ruiz, JC ; Resende, DM . New approach to the development of vaccines against Canine Visceral Leishmaniasis (CVL): Bioinformatics tools. In: II International Symposium on Leishmaniasis Vaccines, 2012, Ouro Preto. II International Symposium on Leishmaniasis Vaccines, 2012.

• OLIVEIRA, M. M. ; Resende, DM ; Brito, RCF ; Ruiz, JC ; CARNEIRO, C. M. ; Reis, AB ; BOUILLET, L. E. M. . Imunoinformática para o desenvolvimento de vacina contra o Trypanosoma cruzi: predição de epítopos de células TCD8+ e da localização subcelular de proteínas. In: XXI Seminário de Iniciação Científica da UFOP - Encontro de Saberes, 2013, Ouro Preto. XXI Seminário de Iniciação Científica da UFOP - Encontro de Saberes, 2013.

• ANDRADE, M. M. S. ; OLIVEIRA, M. M. ; Resende, DM ; Brito, RCF ; OLIVEIRA, L. A. M. ; Ruiz, JC ; CARNEIRO, C. M. ; Reis, AB . Desenvolvimento de vacina contra o Trypanosoma cruzi utilizando a bioinformática como ferramenta: predição de epítopos de células TCD4+ e de células B. In: XXI Seminário de Iniciação Científica da UFOP - Encontro de Saberes, 2013, Ouro Preto. XXI Seminário de Iniciação Científica da UFOP - Encontro de Saberes, 2013.

• OLIVEIRA, M. M. ; Brito, RCF ; Reis, AB ; Corrêa-Oliveira, R ; Ruiz, JC ; Resende, DM . PREDIÇÃO DE EPÍTOPOS DE CÉLULAS T CD8+ E DA LOCALIZAÇÃO SUBCELULAR DE PROTEÍNAS NO GENOMA DE LEISHMANIA BRAZILIENSIS PARA O DESENVOLVIMENTO DE VACINA CONTRA A LEISHMANIOSE VISCERAL CANINA. In: XX Seminário de Iniciação Científica da UFOP, 2012, Ouro Preto. XX Seminário de Iniciação Científica da UFOP, 2012.

• ANDRADE, M. M. S. ; OLIVEIRA, M. M. ; Brito, RCF ; Reis, AB ; Corrêa-Oliveira, R ; Ruiz, JC ; OLIVEIRA, L. A. M. ; Resende, DM . VACINOLOGIA REVERSA PARA O DESENVOLVIMENTO DE VACINA CONTRA A LEISHMANIOSE VISCERAL CANINA: PREDIÇÃO DE EPÍTOPOS DE CÉLULAS T CD4+ E DE LINFÓCITOS B NO GENOMA DE L. BRAZILIENSIS. In: XX Seminário de Iniciação Científica da UFOP, 2012, Ouro Preto. XX Seminário de Iniciação Científica da UFOP, 2012.

• Brito, RCF ; OLIVEIRA, M. M. ; Reis, AB ; Corrêa-Oliveira, R ; Ruiz, JC ; Resende, DM . Desenvolvimento de uma nova vacina contra Leishmaniose Visceral Canina (LVC) na era pós genômica: utilização de algoritmos para a descoberta de novos epítopos no genoma de Leishmania infantum. In: III Congresso de Ciências Farmacêuticas de Ouro Preto, 2011, Ouro Preto. Anais do III Congresso de Ciencias Farmaceuticas de Ouro Preto. Ouro Preto, 2011.

• Brito, RCF ; OLIVEIRA, M. M. ; Reis, AB ; Ruiz, JC ; Corrêa-Oliveira, R ; Resende, DM . Development of a new Vaccine Against Canine Visceral Leishmaniasis using Immunoinformatics Tools: Prediction of Epitopes and Subcellular Localization in Leishmania infantum Genome.. In: X- Meeeting (7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology), 2011, Florianópolis. X- Meeeting (7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology), 2011.

• Brito, RCF ; OLIVEIRA, M. M. ; Reis, AB ; Corrêa-Oliveira, R ; Ruiz, JC ; Resende, DM . Vacinologia Reversa Empregada na Identificação de Alvos Vacinais contra a Leishmaniose Visceral Canina (LVC) : Predição de Epítopos de Células B e T e Localização Subcelular de Proteínas.. In: XIX Seminário de Iniciação Científica da UFOP, 2011, Ouro Preto. XIX Seminário de Iniciação Científica da UFOP, 2011.

• Brito, RCF ; OLIVEIRA, M. M. ; Reis, AB ; Corrêa-Oliveira, R ; Ruiz, JC ; Resende, DM . Epitope and Subcellular Localization Prediction in Leishmania infantum Genome: Immunoinformatics for the Development of a Vaccine Against Canine Visceral Leishmaniasis. In: XXVII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology/XXXVIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2011, Foz do Iguaçu- PR. XXVII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology/XXXVIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2011.

• Brito, RCF ; Resende, DM ; OLIVEIRA, M. M. ; Reis, AB ; Ruiz, JC ; Corrêa-Oliveira, R . VACINOLOGIA REVERSA: DESENVOLVIMENTO DE UMA VACINA CONTRA LEISHMANIOSE VISCERAL CANINA (LVC) UTILIZANDO PREDIÇÃO DE EPÍTOPOS IN SILICO COMO FERRAMENTA. In: XVIII Seminário de Iniciação Científica da UFOP, 2010, Ouro Preto. XVIII Seminário de Iniciação Científica da UFOP, 2010.

• Brito, RCF ; OLIVEIRA, M. M. ; Reis, AB ; Corrêa-Oliveira, R ; Ruiz, JC ; Resende, DM . REVERSE VACCINOLOGY: IN SILICO PREDICTION OF EPITOPES AND SUBCELLULAR LOCALIZATION OF PROTEINS IN THE PROTEOME OF LEISHMANIA INFANTUM TO DEVELOP A VACCINE AGAINST CANINE VISCERAL LEISHMANIASIS (CVL). In: 6th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2010, Ouro Preto. 6th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2010.

• OLIVEIRA, M. M. ; Resende, DM ; Brito, RCF ; Ruiz, JC ; Reis, AB ; CARNEIRO, C. M. ; BOUILLET, L. E. M. . XXI Seminário de Iniciação Científica da UFOP - Encontro de Saberes. 2013. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• OLIVEIRA, M. M. ; Brito, RCF ; Reis, AB ; Corrêa-Oliveira, R ; Ruiz, JC ; Resende, DM . XX Seminário de Iniciação Científica da UFOP. 2012. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• OLIVEIRA, M. M. ; Brito, RCF ; OLIVEIRA, L. A. M. ; Reis, AB ; Corrêa-Oliveira, R ; Ruiz, JC ; Resende, DM . New Approach to th Development of Vaccines against Canine Visceral Leishmaniasis (CVL): Bioinformatics Tools. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2012 - 2012

  PREDIÇÃO DE EPÍTOPOS DE CÉLULAS T CD8+ E DA LOCALIZAÇÃO SUBCELULAR DE PROTEÍNAS NO GENOMA DE LEISHMANIA BRAZILIENSIS PARA O DESENVOLVIMENTO DE VACINA CONTRA A LEISHMANIOSE VISCERAL CANINA, Descrição: Várias técnicas de predição in silico têm sido desenvolvidas para identificar candidatos a vacinas, principalmente proteínas presentes nos genomas de patógenos com propriedades antigênicas. Para que uma vacina seja eficiente, ela deverá ser capaz de induzir uma forte resposta de células B e T, principalmente linfócitos T CD8+. Dessa forma, o mapeamento de epítopos tem conduzido ao chamado epitopo fishing , o escaneamento de genomas de patógenos para a busca de epítopos potenciais utilizando algoritmos de predição. A vacinologia reversa usa sequências de genomas de interesse, ao invés de células, como material para a identificação de novos antígenos, sendo sua atividade confirmada posteriormente através de experimentos biológicos. Em geral, o objetivo é a identificação de genes que codificam fatores de patogenicidade e proteínas secretadas ou associadas à membrana a partir de algoritmos específicos, identificando assim proteínas acessíveis ao sistema imune e que possam mediar o desenvolvimento de uma resposta imune protetora, diminuindo significativamente o tempo e o custo necessários para encontrar novos alvos para o desenvolvimento de vacinas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Marina Muniz Oliveira Torres - Coordenador / Daniela de Melo Resende - Integrante / Rory Cristiane Fortes de Brito - Integrante / Alexandre Barbosa Reis - Integrante / Jerônimo Conceição Ruiz - Integrante / Rodrigo Corrêa Oliveira - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.

• 2012 - Atual

  Imunoinformática para o desenvolvimento de vacina contra o Trypanosoma cruzi: predição de epítopos de células T CD8+ e da localização subcelular de proteínas, Descrição: Durante o último século, várias abordagens biotecnológicas têm sido empregadas no desenvolvimento de vacinas, tendo como partida a imunização com patógenos atenuados até a formulação de uma vacina segura. Entretanto, esse método convencional requer o cultivo do patógeno e sua dissecção utilizando técnicas bioquímicas, imunológicas e microbiológicas. Embora tenha mostrado sucesso em vários casos, essa abordagem consome muito tempo e é ineficiente para a construção de imunógenos eficazes na proteção contra doenças negligenciáveis. Neste estudo, propomos utilizar a vacinologia reversa para o desenho de uma vacina contra Trypanosoma cruzi a partir da predição de antígenos in silico. Para atingir nossos objetivos, empregaremos a bioinformática como ferramenta de seleção de genes potenciais para uso na elaboração de uma vacina protetora e para uso em diagnóstico. Dessa forma, os seguintes algoritmos foram selecionados para realização das predições: a) netCTL e netMHC para a predição de epítopos de linfócitos T CD8+; b) WOLF PSORT, SigCleave (do pacote EMBOSS) e TargeP para a predição da localização subcelular das proteínas preditas do genoma de T. cruzi. De modo a possibilitar a aplicação desses algoritmos em larga escala, ou seja, em todo o proteoma predito de T. cruzi, será necessário inicialmente obter uma cópia instalada localmente do genoma do parasito, devidamente montado e anotado, para a aplicação de scripts específicos para a extração das informações. Após a obtenção do proteoma predito, os diversos algoritmos de predição que serão utillizados serão instalados nos servidores locais, uma vez que não é possível utilizar a web para fazer análises nessa escala (cerca de 8.000 proteínas). Quando todas as predições estiverem concluídas, todas as informações serão integradas em um banco de dados relacional, com a ajuda de scripts específicos que serão desenvolvidos, e as possíveis proteínas alvo serão identificadas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Marina Muniz Oliveira Torres - Coordenador / Daniela de Melo Resende - Integrante / Rory Cristiane Fortes de Brito - Integrante / Alexandre Barbosa Reis - Integrante / Jerônimo Conceição Ruiz - Integrante / Rodrigo Corrêa Oliveira - Integrante.

• 2012 - Atual

  Desenvolvimento de vacina contra o Trypanosoma cruzi utilizando a bioinformática como ferramenta: predição de epítopos de células T CD4+ e de células B, Descrição: Durante o último século, várias abordagens biotecnológicas têm sido empregadas no desenvolvimento de vacinas, tendo como partida a imunização com patógenos atenuados até a formulação de uma vacina segura. Entretanto, esse método convencional requer o cultivo do patógeno e sua dissecção utilizando técnicas bioquímicas, imunológicas e microbiológicas. Embora tenha mostrado sucesso em vários casos, essa abordagem consome muito tempo e é ineficiente para a construção de imunógenos eficazes na proteção contra doenças negligenciáveis. Neste estudo, propomos utilizar a vacinologia reversa para o desenho de uma vacina contra Trypanosoma cruzi a partir da predição de antígenos in silico. Para atingir nossos objetivos, empregaremos a bioinformática como ferramenta de seleção de genes potenciais para uso na elaboração de uma vacina protetora e para uso em diagnóstico. Dessa forma, os seguintes algoritmos foram selecionados para realização das predições: a) NetMHCII para a predição de epítopos de linfócitos T CD4+; b) BepiPred e BCPreds para a predição de epítopos de células B. De modo a possibilitar a aplicação desses algoritmos em larga escala, ou seja, em todo o proteoma predito de T. cruzi, será necessário inicialmente obter uma cópia instalada localmente do genoma do parasito, devidamente montado e anotado, para a aplicação de scripts específicos para a extração das informações. Após a obtenção do proteoma predito, os diversos algoritmos de predição que serão utillizados serão instalados nos servidores locais, uma vez que não é possível utilizar a web para fazer análises nessa escala (cerca de 8.000 proteínas). Quando todas as predições estiverem concluídas, todas as informações serão integradas em um banco de dados relacional, com a ajuda de scripts específicos que serão desenvolvidos, e as possíveis proteínas alvo serão identificadas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marina Muniz Oliveira Torres - Integrante / Daniela de Melo Resende - Coordenador / Rory Cristiane Fortes de Brito - Integrante / Alexandre Barbosa Reis - Integrante / Jerônimo Conceição Ruiz - Integrante / Marina Mol Sena Andrade - Integrante / Laser Antônio Machado Oliveira - Integrante.

• 2011 - 2012

  VACINOLOGIA REVERSA PARA O DESENHO DE UMA NOVA VACINA CONTRA LEISHMANIOSE VISCERAL CANINA (LVC) A PARTIR DA PREDIÇÃO DE ANTÍGENOS IN SILICO, Descrição: Devido à grande importância da leishmaniose visceral na Saúde Pública, e à ineficiência das atuais medidas de controle, e tendo em vista a importância dos cães na manutenção do ciclo urbano da Leishmania infantum no nosso meio, uma vacina eficaz contra a leishmaniose visceral canina (LVC) seria uma importante ferramenta no combate à doença e na diminuição de casos humanos. Durante o último século, vários métodos têm sido empregados para o desenvolvimento de vacinas, tendo como partida a imunização com patógenos atenuados até a formulação de uma vacina segura. Entretanto, esse método convencional requer o cultivo do patógeno e sua dissecção utilizando métodos bioquímicos, imunológicos e microbiológicos. Embora tenha mostrado sucesso em vários casos, esse método consome muito tempo e é ineficaz para o combate de muitos patógenos que causam doença ao homem. Neste estudo, propomos utilizar a vacinologia reversa para o desenho de uma vacina contra LVC a partir da predição de antígenos in silico. Para atingir nossos objetivos, procederemos à seleção de genes potenciais para uso na elaboração de uma vacina protetora utilizando a bioinformática como ferramenta. Considerando a imunogenicidade da vacina LBSap, desenvolvida a partir de Leishmania braziliensis pelo nosso grupo, e a verificação de proteção cruzada dessa formulação com L. infantum, pretendemos utilizar o genoma de L. braziliensis para procurar genes alvo candidatos à vacina contra leishmaniose visceral canina. Dessa forma, serão utilizados algoritmos para a predição computacional de epítopos de células T CD4+ e B, importantes para a indução de proteção após imunização. Após a obtenção destes dados, as perspectivas do trabalho são a clonagem dos genes selecionados e a sua expressão em sistema heterólogo, para a produção de proteínas recombinantes que serão testadas quanto à sua capacidade de induzir reativação in vitro de células do sistema imune, com secreção de citocinas importantes na indução de proteção contra. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Marina Muniz Oliveira Torres - Coordenador / Daniela de Melo Resende - Integrante / Rory Cristiane Fortes de Brito - Integrante / Alexandre Barbosa Reis - Integrante / Jerônimo Conceição Ruiz - Integrante / Rodrigo Corrêa Oliveira - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.