Mathias Coelho Batista

Mestre em Biotecnologia de Recursos Naturais e Bacharel em Biotecnologia pela Universidade Federal do Ceará. Desenvolveu pesquisa de mestrado voltada para análise de dados NGS e estruturas 3D de anticorpos na empresa Fiocruz - Ceará, no Grupo de Pesquisa em Engenharia de Proteínas e Soluções para a Saúde - GEPeSS. Tem experiência no campo de Cultivo in vitro de Tecidos Vegetais, Genética Molecular de Microrganismos, Biologia Molecular e Bioinformática (Desenvolvimento de plataformas e algoritmos para análises genômicas, proteômicas e transcriptômicas).

Informações coletadas do Lattes em 11/08/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em andamento em Biotecnologia de Recursos Naturais

2023 - Atual

Universidade Federal do Ceará
Título: Desenvolvimento de Algoritmo Genético para humanizar mAbs e realçar a afinidade com antígeno
Marcos Roberto Lourenzoni.

Mestrado em Biotecnologia de Recursos Naturais

2020 - 2023

Universidade Federal do Ceará
Título: Desenvolvimento de uma ferramenta para análise de dados de sequenciamento NGS de bibliotecas de scFvs selecionados por Phage Display, Ano de Obtenção: 2023
Orientador: Marcos Roberto Lourenzoni
Bolsista do(a): Fundação Cearense de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico, FUNCAP, Brasil. Palavras-chave: Sequenciamento NGS; Phage Display; CD20; Anticorpo; Ferramenta computacional.Grande área: Ciências Biológicas

Graduação em Biotecnologia

2014 - 2019

Universidade Federal do Ceará
Título: Desenvolvimento de uma plataforma web para análise de Ligações de Hidrogênio em sistemas proteína-água
Orientador: Marcos Roberto Lourenzoni

Formação complementar

2023 - 2023

Deep Learning. (Carga horária: 6h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2023 - 2023

Análise de Dados. (Carga horária: 6h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2023 - 2023

Algoritmos e Modelos de Programação para Big Data. (Carga horária: 6h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2021 - 2021

PREDIÇÃO DE ESTRUTURAS DE PROTEÍNAS. (Carga horária: 10h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2021 - 2021

MÉTODOS DE DOCKING RECEPTOR-LIGANTE E VIRTUAL SCREENING. (Carga horária: 10h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2021 - 2021

DINÂMICA MOLECULAR BÁSICA. (Carga horária: 10h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2020 - 2021

Introdução a Machine Learning para Certificação HCIA-AI V3.0. (Carga horária: 16h). , Universidade Federal do Ceará, UFC, Brasil.

2020 - 2020

Curso Boas Práticas na Pesquisa. (Carga horária: 16h). , Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil.

2020 - 2020

Identifying Gene Regulatory Networks from Gene Expression Data. (Carga horária: 40h). , Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil.

2018 - 2018

Análise estrutural e funcional de dados NGS. (Carga horária: 6h). , Universidade Federal de Pernambuco, UFPE, Brasil.

2018 - 2018

Integração de Dados e Biologia de Sistemas. (Carga horária: 6h). , Universidade Federal de Pernambuco, UFPE, Brasil.

2017 - 2017

Biossegurança de Organismos Geneticamente Modificados. (Carga horária: 4h). , Universidade Federal do Ceará, UFC, Brasil.

2017 - 2017

Machine Learning, uma introdução prática com Python. (Carga horária: 6h). , Universidade Federal do Ceará, UFC, Brasil.

2014 - 2014

Minicurso de Cultura de Tecidos Vegetais. (Carga horária: 20h). , Universidade Federal do Ceará, UFC, Brasil.

2014 - 2014

Tecnologias de Manipulação do DNA para a Produção. (Carga horária: 4h). , Universidade Federal do Ceará, UFC, Brasil.

2014 - 2014

Biomateriais para Aplicações Médicas. (Carga horária: 4h). , Universidade Federal do Ceará, UFC, Brasil.

2013 - 2014

Mediação Escolar. , Universidade de Fortaleza, UNIFOR, Brasil.

Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Compreende Razoavelmente, Lê Pouco.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Biologia Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biotecnologia / Subárea: Bioinformática.

Participação em eventos

Jornada em Ciência de Dados. 2023. (Outra).

X Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. 2021. (Outra).

I Workshop Online de Bioinformática. 2020. (Oficina).

III Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática. 2018. (Simpósio).

I Reunião Brasileira em Tecnologias Para a Produção e Regulamentação de Biofármacos - TECBIO. 2017. (Outra).

workshop Ciência de dados na pratica com python. 2017. (Oficina).

XII Semana Acadêmica da Computação. 2017. (Outra).

V Semana da Biotecnologia. 2015. (Outra).

IV Semana da Biotecnologia. 2014. (Outra).

Produções bibliográficas

  • AZIZ, SHAHID ; GERMANO, THAIS ANDRADE ; THIERS, KARINE LEITÃO LIMA ; BATISTA, MATHIAS COELHO ; DE SOUZA MIRANDA, RAFAEL ; ARNHOLDT-SCHMITT, BIRGIT ; COSTA, JOSE HELIO . Transcriptome Analyses in a Selected Gene Set Indicate Alternative Oxidase (AOX) and Early Enhanced Fermentation as Critical for Salinity Tolerance in Rice. PLANTS , v. 11, p. 2145, 2022.

  • COSTA, JOSÉ HÉLIO ; ROQUE, ANDRÉ LUIZ MAIA ; AZIZ, SHAHID ; DOS SANTOS, CLESIVAN PEREIRA ; GERMANO, THAIS ANDRADE ; BATISTA, MATHIAS COELHO ; THIERS, KARINE LEITÃO LIMA ; DA CRUZ SARAIVA, KÁTIA DANIELLA ; ARNHOLDT-SCHMITT, BIRGIT . Genome-wide identification of ascorbate-glutathione cycle gene families in soybean (Glycine max) reveals gene duplication events and specificity of gene members linked to development and stress conditions. INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES , v. 187, p. 528-543, 2021.

  • DOS SANTOS, CLESIVAN PEREIRA ; BATISTA, MATHIAS COELHO ; DA CRUZ SARAIVA, KÁTIA DANIELLA ; ROQUE, ANDRÉ LUIZ MAIA ; DE SOUZA MIRANDA, RAFAEL ; ALEXANDRE E SILVA, LORENA MARA ; MOURA, CARLOS FARLEY HERBSTER ; ALVES FILHO, ELENILSON GODOY ; CANUTO, KIRLEY MARQUES ; COSTA, JOSÉ HÉLIO . Transcriptome analysis of acerola fruit ripening: insights into ascorbate, ethylene, respiration, and softening metabolisms. Plant Molecular Biology , v. 101, p. 1-28, 2019.

  • DOS SANTOS, CLESIVAN PEREIRA ; DA CRUZ SARAIVA, KÁTIA DANIELLA ; BATISTA, MATHIAS COELHO ; GERMANO, THAIS ANDRADE ; COSTA, JOSÉ HÉLIO . Identification and evaluation of reference genes for reliable normalization of real-time quantitative PCR data in acerola fruit, leaf, and flower. MOLECULAR BIOLOGY REPORTS , v. 46, p. 1-12, 2019.

  • ROQUE, A. L. M. ; SANTOS, C. P. ; MAIA, R. A. ; BATISTA, M. C. ; GERMANO, T. A. ; COSTA, J. H. ; FREITAS, A. L. P. . PHYLOGENETIC ANALYSIS AND IN SILICO EXPRESSION PROFILE OF THE APX MULTIGENIC FAMILY IN SOYBEAN (GLYCINE MAX) UNDER SALT AND DROUGHT STRESS.. In: 47a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2018, Joinville. 47a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2018.

  • SANTOS, C. P. ; BATISTA, M. C. ; ROCHA, D. M. B. ; ROQUE, A. L. M. ; MAIA, R. A. ; GERMANO, T. A. ; COSTA, J. H. . Dinâmica da expressão de genes envolvidos na biossíntese do ascorbato durante o desenvolvimento de acerola. In: III Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática, 2018, Recife. Anais do III Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática, 2018. p. 135-135.

  • BATISTA, M. C. ; OLIVEIRA, C. P. ; FROTA, R. P. ; MARANHÃO, A. Q. ; BRIGIDO, M. M. ; LOURENZONI, M. R. . Tool development for analysis of scFv NGS data in databases related to 3D structures: Evolution of antibodies in silico. 2021. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • BATISTA, M. C. . Pílulas do Conhecimento - Pitch o qué e como elaborar o seu. 2021. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • BATISTA, M. C. ; SANTOS, C. P. ; CHAGAS, S. K. S. ; OLIVEIRA, A. E. R. ; MAIA, R. A. ; GERMANO, T. A. ; COSTA, J. H. . Montagem e anotação do transcriptoma de folhas, flores e frutos de aceroleira. 2018. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • BATISTA, M. C. ; NASCIMENTO, C. S. ; BARBOSA, B. P. . Blog e Fanpage do PIQD biotec: A utilização de mídias digitais para a divulgação da Biotecnologia. 2017. (Apresentação de Trabalho/Outra).

  • BATISTA, M. C. ; GRANGEIRO, T. B. ; CARVALHO, C. P. S. . Preparação de vetores para clonagem da sequencia codificadora da osmotina de Calotropis procera (CpOsm). 2017. (Apresentação de Trabalho/Outra).

  • BATISTA, M. C. . Trabalhando com Python na Análise de Dados. 2020. .

Projetos de pesquisa

  • 2019 - Atual

    Desenvolvimento de ferramenta computacional para engendrar anticorpos monoclonais e fragmentos para CAR-T cell, Descrição: Projeto vinculado ao edital Geração do conhecimento - Fiocruz; Há uma grande diversidade de medicamentos, de primeira ou segunda linha, usados no tratamento de diversos tipos de câncer, como os anticorpos monoclonais (mAbs). Contudo, ainda há uma demanda significativa por medicamentos para casos que não respondem aos protocolos padrões e que resultam na recidiva da doença. As terapias celulares e gênicas vêm sendo usados nessa perspectiva, envolvendo células autólogas (do próprio paciente) ou células alogeneicas (de doador parente ou não). Recentemente, o FDA aprovou a terapia gênica baseada no uso de linfócitos T transformados, que apresentam um receptor quimérico capaz de reconhecer o alvo tumoral e ativar esse linfócito de forma a obter uma resposta imune efetiva, capaz de inibir e eliminar as células tumorais (técnica conhecida como CAR-T). As duas terapias aprovadas são Kymriah®, da Novartis, e Yescarta®, da Kite Pharma, aprovadas em agosto e outubro de 2017, respectivamente, que se baseiam em um fragmento de anticorpo murino do tipo scFv contra o receptor CD19, expresso em alta concentração em linfócitos B neoplásicos. Outros receptores encontram-se em estudo, boa parte deles baseada em mAbs já utilizados em terapias antitumorais. O desenvolvimento de uma terapia baseada em CAR possui três principais áreas de atuação: destaca-se o desenvolvimento do sistema, que envolve a seleção do fragmento de anticorpo usado como receptor; a escolha dos motivos intracelulares, que ativarão a célula; o desenho da molécula quimérica com os diferentes segmentos. Nesse projeto, anti-CD20 passará por processo de evolução, por Phage Display, usando bibliotecas de fragmentos Fab ou scFvs humanos, que serão selecionados contra um fragmento do CD20. Embora o processo traga bons resultados, um fragmento somente é usado e não corresponde ao CD20 completo, e a proposição de scFvs para uso em CAR fica limitada, não tendo a completude de resposta para o CD20 completo. Para driblar essa dificuldade experimental, propõe-se utilizar resultados dos ciclos de evolução por phage, usando sequenciamento NGS para acessar informações de frequências de resíduos em todas as posições de um scFv. Os dados serão usados num Algoritmo Genético, que incluirá uma Função de Aptidão criada para avaliar a interação scFv-CD20 completo. Espera-se, com essa abordagem, que integra dados experimentais e teóricos, dentro uma estratégia evolutiva, propor scFvs com bons resultados para aplicação em CARs e, consequentemente, um novo produto ou serviço associado.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Mathias Coelho Batista - Coordenador / Marcos Roberto Lourenzoni - Integrante / Cássio Pinheiro Oliveira - Integrante.

  • 2017 - 2018

    Construção de plataforma para classificação de Oxidase Alternativa, Descrição: Este projeto objetiva a criação de uma plataforma online capaz de classificar as diferentes AOX (Oxidase Alternativa) de acordo com o método desenvolvido por Costa et al., que por sua vez se baseia na conservação de aminoácidos em determinadas posições da sua estrutura primária.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Mathias Coelho Batista - Integrante / Jose Helio Costa - Coordenador / Clesivan Pereira dos Santos - Integrante.

  • 2015 - 2017

    Expressão Heteróloga de uma Proteína Antifúngica do Látex de Calotropis procera em Levedura e Plantas de Tabaco, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Mathias Coelho Batista - Coordenador / Cristina Paiva da Silveira Carvalho - Integrante / Thalles Barbosa Grangeiro - Integrante / Isabel Cristina da Cósta Souza - Integrante.

  • 2014 - 2015

    Avaliação do efeito de quitinases recombinantes sobre o fungo Penicillium herquei., Situação: Desativado; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Mathias Coelho Batista - Integrante / Cristina Paiva da Silveira Carvalho - Coordenador.

  • 2013 - 2014

    Mediação Escolar, Descrição: O projeto visa o estudo da mediação de conflitos com a finalidade de, ampliar o conhecimento dos estudos acerca dessa metodologia e desenvolver projetos nessa área que, parte de estudos, criação de artigos científicos e, pesquisa para desenvolvimento de atividades dentro do projeto. Todas essas ações consistem em um preparatório para desenvolvimento de iniciativas (educativas e divulgadoras da mediação) dentro do ambiente escolar visando a ampliação do número de pessoas beneficiadas com a Mediação de Conflitos para resolução de seus problemas diários dentro da própria instituição.Dessa forma o objetivo principal além de executar um projeto de largo alcance social, permitir também um ambiente de estudo salutar e conveniente a todos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Mathias Coelho Batista - Integrante / Lília Maia de Morais Sales - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

  • 2012 - 2013

    A prevenção no combate ao câncer. Oriente-se para a vida, Descrição: Esse projeto tem como objetivo, fornecer informações a comunidade intra e extra escolar a respeito de determinados tipos de câncer,como são detectados, como é dada a prevenção destes e como são tratados. Além de provocar a conscientização da mesma, através de palestras, com relação a práticas de prevenção contra o câncer que devem ser realizadas diariamente.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Mathias Coelho Batista - Integrante / Lília Maia de Morais Sales - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

Prêmios

2021

Prêmio Jovem Talento Sérgio Arouca, Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos - Bio-Manguinhos.

Histórico profissional

Experiência profissional

2019 - Atual

Fundação Oswaldo Cruz

Vínculo: , Enquadramento Funcional:

2015 - 2016

Universidade Federal do Ceará

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista de Iniciação Científica, Carga horária: 12, Regime: Dedicação exclusiva.

2014 - 2015

Universidade Federal do Ceará

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Voluntário: Iniciação científica, Carga horária: 12

2013 - 2014

Unifor

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Estudante(pesquisador), Carga horária: 6

2012 - 2013

Caic Maria Alves Carioca

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Estudante(pesquisador), Carga horária: 12

2018 - 2019

Fundação Oswaldo Cruz (CE)

Vínculo: Estágio, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 20