Marcela Maria de Souza

Possui graduação em Ciências Biológicas modalidade licenciatura (2007) e bacharel (2008) pela Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias de Jaboticabal- Unesp. Mestre em Genética Evolutiva e Biologia Molecular pela Universidade Federal de São Carlos (2012) e Doutora em Ciências, Área de Concentração em Biologia Molecular também pela Universidade Federal de São Carlos (2016). Realizou parte do seu Doutorado no instituto Max Planck em Münster, Alemanha. Possui pós-doutorado na Embrapa Pecuária Sudeste sob orientação da Dra Luciana Correia de Almeida Regitano e atualmente realiza seu segundo pós-doutorado na Iowa State University sob orientação do Dr James Koltes. Possui experiência na área de Reprodução, Genética Molecular, Genômica Funcional, Biologia de Sistemas, Epigenética e Bioinformática, com ênfase nos seguintes temas: expressão diferencial, expressão alelo-específica e redes de co-expressão utilizando dados de sequenciamento de RNA (RNA-Seq) alem de análise de regiões diferencialmente metiladas do DNA.

Informações coletadas do Lattes em 30/01/2026

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em PPG Genética Evolutiva e Biologia Molecular

2012 - 2016

Universidade Federal de São Carlos
Título: Avaliação da expressão alélica no transcriptoma de músculo de animais Nelore com ênfase em genes associados à maciez de carne
Orientador: Luciana A. C. Regitano
Coorientador: Adhemar Zerlotini Neto. Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Palavras-chave: expressão alélica; bovinos.

Mestrado em Genética e Evolução

2009 - 2012

Universidade Federal de São Carlos
Título: Avaliação dos efeitos de polimorfismos e da origem parental do alelo de genes candidatos sobre a maciez da carne e a deposição de gordura em bovinos da raça Nelore,Ano de Obtenção: 2012
Luciana Correia de Almeida Regitano.Coorientador: Simone Cristina Méo Niciura. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos / Especialidade: Genética Molecular aplicada ao Melhoramento Animal.

Aperfeiçoamento em Treinamento Técnico

2009 - 2009

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho
Título: Estudo da diferenciação in vitro de células-tronco embrionárias murinas (MESC) transfectadas pelo gene do hormônio do crescimento bovino (BGH) e produção de animais quiméras. Ano de finalização: 2009
Orientador: Joaquim Mansano Garcia
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.

Graduação em Ciências Biológicas - Bacharel

2008 - 2010

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho
Título: Efeitos da utilização de knockout? serum replacement (KSR) e meios condicionados por celulas-tronco na substituição do soro fetal bovino (SFB) durante o cultivo in vitro de embriões bovinos
Orientador: Joaquim Mansano Garcia
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.

Graduação em Ciências Biológicas

2004 - 2007

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

Pós-doutorado

2018

Pós-Doutorado. , Iowa State University, IASTATE, Estados Unidos. , Grande área: Ciências Agrárias

2017 - 2018

Pós-Doutorado. , Embrapa Pecuária Sudeste, EMBRAPA, Brasil. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Animal.

Formação complementar

2013 - 2013

Introdução à Bioinformática. (Carga horária: 30h). , Embrapa Informática Agropecuária, CNPTIA, Brasil.

2013 - 2013

Análise de dados de RNA-Seq utilizando o Galaxy. (Carga horária: 16h). , Embrapa Informática Agropecuária, CNPTIA, Brasil.

2010 - 2010

Inferência Bayesiana em Genética Quantitativa. (Carga horária: 40h). , Universidade de São Paulo - Campus Pirassununga, FZEA, Brasil.

2010 - 2010

Redação Científica. (Carga horária: 24h). , Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, ESALQ, Brasil.

2010 - 2010

Estruturação de artigo publicação internacional. (Carga horária: 8h). , Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, ESALQ, Brasil.

2009 - 2009

V Curso de inverno de Genética. (Carga horária: 44h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2008 - 2008

Genética molecular aplicada ao melhoramento animal. (Carga horária: 44h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2007 - 2007

Terapia Celular: "Células-tronco". (Carga horária: 30h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2005 - 2005

Biologia e Manejo de Répteis e Anfíbios. (Carga horária: 37h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2004 - 2004

Conservação Ambiental. (Carga horária: 8h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2004 - 2004

bioinformática: análise funcional de genes. (Carga horária: 8h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Animal.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Epigenética.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos/Especialidade: Genética Molecular aplicada ao Melhoramento Animal.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Biologia de Sistemas.

Participação em eventos

Spetses Summer School: Chromatin and Systems Biology. Allelic- and parental-specific expression of the KCNJ11 gene in cattle. 2013. (Congresso).

56° Congresso Brasileiro de Genética. Associação de um SNP no gene DDEF1 com área de olho de lombo em bovinos da raça Canchim.. 2010. (Congresso).

II Simposio de Biologia Molecular Aplicada a Produção Animal. 2009. (Simpósio).

XXII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Tecnologia de Embriões. Efeitos da substituição do soro fetal bovino (SFB) pela albumina sérica bovina (BSA) e knockout? serum replacement (KSR) na produção in vitro de embriões bovinos: resultados preliminares.. 2008. (Congresso).

V Jornada Anual Biológica. 2006. (Seminário).

I CEBIO - I Colóquio sobre Educação do Curso de Ciências Biológicas. 2005. (Outra).

IV Jornada Anual Biológica da Unesp. 2005. (Seminário).

III Jornada Anual Biológica da Unesp. 2004. (Seminário).

XXIX SECITAP - Semana de Ciência e Tecnologia Agropecuária. 2004. (Seminário).

XXX SECITAP - Semana de Ciência e Tecnologia Agropecuária. 2004. (Seminário).

Produções bibliográficas

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  • de Souza, Marcela M. ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; GEISTLINGER, LUDWIG ; TIZIOTO, POLYANA C. ; TAYLOR, JEREMY F. ; ROCHA, MARINA I. P. ; DINIZ, WELLISON J. S. ; COUTINHO, LUIZ L. ; REGITANO, LUCIANA C. A. . A comprehensive manually-curated compendium of bovine transcription factors. Scientific Reports , v. 8, p. 13747, 2018.

  • DINIZ, WELLISON J.S. ; ROSA, KAMILA O. ; COUTINHO, LUIZ L. ; TIZIOTO, POLYANA C. ; DE OLIVEIRA, PRISCILA S.N. ; de Souza, Marcela M. ; CHAVES, AMÁLIA S. ; LANNA, DANTE P.D. ; MOURÃO, GERSON B. ; REGITANO, LUCIANA C.A. . KCNJ11 gene expression is associated to feed consumption and growth traits in Nelore beef cattle. Agri Gene , v. 9, p. 1-4, 2018.

  • SOMAVILLA, ADRIANA L. ; REGITANO, LUCIANA C. A. ; ROSA, GUILHERME J. M. ; MOKRY, FABIANA B. ; MUDADU, MAURICIO A. ; TIZIOTO, POLYANA C. ; OLIVEIRA, PRISCILA S. N. ; SOUZA, MARCELA M. ; COUTINHO, LUIZ L. ; MUNARI, DANÍSIO P. . Genome-Enabled Prediction of Breeding Values for Feedlot Average Daily Weight Gain in Nelore Cattle. G3-Genes Genomes Genetics , v. 7, p. g3.117.041442, 2017.

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  • TIZIOTO, P. C. ; COUTINHO, L. L. ; DECKER, J. E. ; SCHNABEL, R. D. ; ROSA, K. O. ; Oliveira, Clara S. ; SOUZA, M. M. ; MOURAO, G. B. ; TULLIO, R. R. ; CHAVES, A. S. ; LANNA, D. P. ; ZERLOTINI NETO, A. ; MUDADU, M. ; TAYLOR, J. F. ; REGITANO, L. C. A. . Transcriptional Networks Influencing Residual Feed Intake in Nelore Beef Cattle. In: Plant & Animal Genome XXIII, 2015, San Diego. Plant & Animal Genome XXIII, 2015.

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  • SOUZA, M. M. ; VENERONI, G. B. ; MEIRELLES, S. L. ; ALENCAR, M. M. ; REGITANO, L. C. A. . Associação de um SNP no gene DDEF1 com área de olho de lombo em bovinos da raça Canchim.. In: 56° Congresso Brasileiro de Genética, 2010, Guarujá - SP. Anais do 56° Congresso Brasileiro de Genética, 2010.

  • Oliveira, C. S. ; SARAIVA, N. Z. ; SOUZA, M. M. ; TETZNER, T. A. D. ; LIMA, M. R. ; VANTINI, R. ; Garcia, J. M. . Supplementation of histone deacetylase inhibitor trichostatin A on in vitro culture of bovine embryos.. In: International Symposium of Animal Biology of Reproduction, 2010, Águas de Sao Pedro. Animal Reproduction. Belo Horizonte: CBRA, 2010. v. 7. p. 218-218.

  • Oliveira, C. S. ; SARAIVA, N. Z. ; SOUZA, M. M. ; Garcia, J. M. . Efeitos da tricostatina-A nos níveis de acetilação de histonas em CTE em diferenciação. In: 55º Congresso Brasileiro de Genética, 2009, Aguas de Lindoia. Resumos do 55º Congresso Brasileiro de Genética. Ribeirão Preto, 2009. p. 5-5.

  • SOUZA, M. M. ; SARAIVA, N. Z. ; Oliveira, C. S. ; Garcia, J. M. . Efeitos da substituição do soro fetal bovino (SFB) pela albumina sérica bovina (BSA) e knockout? serum replacement (KSR) na produção in vitro de embriões bovinos: resultados preliminares.. In: XXII Reunuão Anual da Sociedade Brasileira de Tecnologia de Embriões., 2008, Guarujá. Acta Scientiae Veterinarie, 2008. v. 36. p. 552-552.

  • SARAIVA, N. Z. ; Oliveira, C. S. ; TETZNER, T. A. D. ; SOUZA, M. M. ; VANTINI, R. ; Garcia, J. M. . Enucleação química induzida pela demecolcina em oócitos bovinos pré-ativados. In: XXII Reunuão Anual da Sociedade Brasileira de Tecnologia de Embriões., 2008, Guarujá - SP. Acta Scientiae Veterinarie, 2008. v. 36. p. 570-570.

  • Oliveira, C. S. ; SARAIVA, N. Z. ; TETZNER, T. A. D. ; SOUZA, M. M. ; VANTINI, R. ; Romão, L. F. ; Garcia, J. M. . Efeitos da tricostatina A, um agente modificador epigenético, na diferenciação in vitro de células-tonco embrionarias murinas em neurônios.. In: XXII Reunuão Anual da Sociedade Brasileira de Tecnologia de Embriões., 2008, Guarujá - SP. Acta Scientiae Veterinarie, 2008. v. 36. p. 474-474.

  • Oliveira, C. S. ; SARAIVA, N. Z. ; TETZNER, T. A. D. ; SOUZA, M. M. ; VANTINI, R. ; Garcia, J. M. . Effects of Trichostatin A, an Epigenetic Modifier Agent, on Murine Embryonic Stem Cells Differentiation in Neurons.. In: 8th Transgenic Technology Meeting TT, 2008, Toronto. Proceedings of TT2008, 2008. p. 72-72.

  • de Souza, Marcela M. ; de SOUZA, M. M. ; TIZIOTO, P. C. ; IBELLI, A. M. G. ; GASPARIN, G. ; ROCHA, M. I. P. ; BRESSANI, F. A. ; MALAGO JUNIOR, W. ; DINIZ, W. J. S. ; OLIVEIRA, P. S. N. ; LIMA, A. O. ; MUDADU, M. A. ; BARIONI JUNIOR, W. ; COUTINHO, L. L. ; REGITANO, L. C. A. . Allele- and parent-of-origin-specific effects on expression of the KCNJ11 gene: A candidate for meat tenderness in cattle. Genetics and Molecular Research , 2016.

  • SOUZA, M. M. ; VENERONI, G. B. ; MEIRELLES, S. L. ; ALENCAR, M. M. ; REGITANO, L. C. A. . Associação de um SNP no gene DDEF1 com área de olho de lombo em bovinos da raça Canchim.. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • SOUZA, M. M. ; SARAIVA, N. Z. ; Oliveira, C. S. ; Garcia, J. M. . Efeitos da substituição do soro fetal bovino (SFB) pela albumina sérica bovina (BSA) e knockout? serum replacement (KSR) na produção in vitro de embriões bovinos: resultados preliminares.. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Outras produções

SOUZA, M. M. ; IBELLI, A. M. G. ; MEIRELLES, S. L. . Fundamentos e aplicações das técnicas de genética molecular. 2010. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

Projetos de pesquisa

  • 2015 - Atual

    Variações no perfil de metilação genômica relacionadas à maciez da carne e à eficiência alimentar em bovinos da raça Nelore, Descrição: Os mecanismos epigenéticos, como a metilação do DNA, alteram o fenótipo sem modificar o genótipo, por meio do controle da expressão gênica. A metilação do DNA é caracterizada pela deposição de um grupo metil em uma citosina adjacente a uma guanina (CpG), que em promotores gênicos leva à diminuição da expressão gênica. Devido à participação da metilação do DNA em processos fisiológicos, o presente projeto pretende definir o padrão de metilação de tecidos muscular e hepático em bovinos e identificar modificações da metilação que possam estar relacionadas às variações de fenótipos de interesse para a produção animal, como maciez da carne e eficiência alimentar.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcela Maria de Souza - Integrante / Priscila Silva Neubern Oliveira - Integrante / Flávia Aline Bressani - Integrante / Luiz Lehmann Coutinho - Integrante / Simone Cristina Méo Niciura - Coordenador / Adhemar Zerlotini Neto - Integrante / Polyana Cristine Tizioto - Integrante / Luciana Correia de Almeida Regitano - Integrante / Marina Ibelli Rocha - Integrante / Andressa Oliveira de Lima - Integrante / Wellison Jarles da Silva Diniz - Integrante / Mauricio Mudadu - Integrante.

  • 2015 - Atual

    Mecanismos de regulação gênica relacionados à eficiência alimentar em bovinos da raça Nelore, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Luciana Correia de Almeida Regitano em 31/08/2015., Descrição: O Brasil apresenta o maior rebanho comercial de bovinos do mundo, contando com aproximadamente 208 milhões de cabeças. O rebanho brasileiro é constituído principalmente por raças zebuínas, sendo a raça Nelore a que apresenta maior expressão como produtora de carne, com índices de desempenho econômicos notáveis. A eficiência alimentar é uma característica produtiva importante de mensuração onerosa e tardia, e apesar de apresentar herdabilidade moderada, não vem sendo contemplada nos programas de avaliação genética do Brasil. A seleção para animais mais eficientes poderá contribuir para reduções de área de pasto e produção de poluentes, com maior rentabilidade para o produtor. Novas metodologias para sequenciamento, genotipagem e análise de expressão gênica têm contribuído para o conhecimento das bases genéticas da variação e para a seleção precoce de bovinos. Um projeto anterior intitulado Estratégias genéticas para produção de carne bovina de qualidade produziu 796 novilhos, descendentes de 34 touros selecionados para amostrar a diversidade da raça Nelore, os quais foram fenotipados para eficiência alimentar e submetidos à genotipagem através do Illumina BovineHD chip (770K). Esse projeto permitiu identificar regiões genômicas e genes associados à eficiência alimentar. O presente projeto tem por objetivo alcançar melhor compreensão dos mecanismos genéticos envolvidos na variação de caracteres quantitativos apontados pela análise de associação. Para tanto, propõe-se complementar as análises de associação genômica e expandir as análises de expressão de transcritos com a identificação de mecanismos regulatórios, microRNAs e regiões promotoras, de tecidos de bovinos da raça Nelore extremos para eficiência alimentar.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcela Maria de Souza - Integrante / Priscila Silva Neubern Oliveira - Integrante / Luiz Lehmann Coutinho - Integrante / Mauricio A Mudado - Integrante / Polyana Cristine Tizioto - Integrante / Luciana Correia de Almeida Regitano - Coordenador / Andressa Oliveira de Lima - Integrante / Wellison Jarles da Silva Diniz - Integrante.

  • 2014 - Atual

    Regulação de isoformas alternativas em diferentes tecidos bovinos., Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Polyana Cristine Tizioto em 31/08/2015., Descrição: O surgimento de plataformas de sequenciamento de próxima geração impactou a capacidade de caracterizar genomas, epigenomas e transcriptomas. Particularmente, a metodologia de sequenciamento de RNA (RNA-seq) possibilita a investigação aprofundada de transcriptomas, propiciando uma análise mais sensível de perfis de expressão gênica, imprescindíveis para a compreensão de processos biológicos que contribuem para a variação fenotípica. Entretanto, além de estudos de expressão gênica diferencial, dados de RNA-seq podem ser explorados para outras finalidades. É possível utilizá-los, por exemplo, para elucidar o conjunto de isoformas presentes em um determinado transcriptoma. Essas isoformas podem ser resultantes de processamentos alternativos de RNA mensageiros (mRNA) precursores e contribuem para a complexidade fenotípica observada em mamíferos. O setor pecuário tem papel substancial na economia nacional e internacional, estando as cadeias produtivas de carne e leite entre as principais atividades econômicas desenvolvidas em diversos países tais como Brasil e Estados Unidos. O conhecimento dos mecanismos regulatórios de isoformas alternativas em tecidos bovinos auxiliaria na compreensão de processos biológicos relacionados a doenças e características complexas de extremo interesse para a pecuária. Entretanto, apesar da extrema importância econômica para a agropecuária, o conhecimento destes mecanismos em espécies bovinas ainda é incipiente. Assim, este projeto propõe acessar a extensão das diferenças na expressão de isoformas de mRNA, além de caracterizar e validar a complexidade de mecanismos de splicing alternativo em diferentes tecidos bovinos utilizando dados mRNA-seq e qPCR. O conhecimento do perfil de expressão de isoformas é de interesse biológico fundamental devido à sua relevância direta para a função proteica. A especificação da diversidade de isoformas em diferentes tecidos proveria percepções do significado funcional do splicing tecido-específico, contribuindo significativamente para melhor entendimento de suas funções biológicas nesta espécie. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcela Maria de Souza - Integrante / Luciana C. de Almeida Regitano - Integrante / Priscila Silva Neubern Oliveira - Integrante / Flávia Aline Bressani - Integrante / Luiz Lehmann Coutinho - Integrante / Simone Cristina Méo Niciura - Integrante / Adhemar Zerlotini Neto - Integrante / TIZIOTO, POLYANA CRISTINE - Coordenador / Gerson B. Mourão - Integrante / Patricia Tholon - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    BASES MOLECULARES DA QUALIDADE DA CARNE EM BOVINOS DA RAÇA NELORE - Temático Fapesp, Descrição: O Brasil é um dos principais produtores e exportadores mundiais de carne bovina e sua vantagem competitiva deve-se principalmente ao custo de produção do bovino brasileiro, que é um dos mais baixos do mundo. Para ampliar sua importância no mercado, é necessário adequar sua produção de carne aos padrões estabelecidos pelos importadores. Entre os quesitos de qualidade, a maciez, quantidade e tipo de gordura intramuscular podem influenciar as características sensoriais e o valor nutricional da carne bovina. A seleção para qualidade da carne não tem sido efetiva em programas de melhoramento de gado de corte no Brasil. Metodologias para sequenciamento, genotipagem e análise de expressão do genoma em larga escala têm contribuído para o conhecimento das bases genéticas da variação e para a seleção precoce de bovinos. Um projeto anterior intitulado "Estratégias genéticas para produção de carne bovina de qualidade" produziu 796 novilhos, descendentes de 34 touros selecionados para amostrar a diversidade da raça Nelore, os quais foram avaliados para eficiência alimentar e qualidade da carne, bem como submetidos à análise de associação genômica com um painel de SNPs (Illumina BovineHD chip). Esse projeto permitiu identificar regiões genômicas associadas a características de produção e qualidade de carne. O presente projeto tem por objetivo alcançar melhor compreensão dos mecanismos genéticos envolvidos na variação de caracteres quantitativos apontados pela análise de associação. Para tanto, propõe-se complementar as análises de associação genômica para incluir novos fenótipos, expandir as análises do genoma funcional (RNA, microRNA e proteínas), avaliar o significado de CNVs e capacitar recursos humanos nas áreas de bioinformática e genômica. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcela Maria de Souza - Integrante / Polyana C. Tizioto - Integrante / Regitano, Luciana Correia de Almeida - Coordenador / Luiz Lehmann Coutinho - Integrante / Adhemar Zerlotini Neto - Integrante / Wellison Jarles da Silva Diniz - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2012 - 2016

    Avaliação da expressão alélica em genes associados à maciez de carne em animais Nelore por meio de análise transcriptômica, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcela Maria de Souza - Coordenador / Luciana C. de Almeida Regitano - Integrante / Simone Cristina Méo Niciura - Integrante / Adhemar Zerlotini Neto - Integrante.

  • 2010 - 2014

    Prospecção de genes candidatos posicionais para características de eficiência alimentar em bovinos da raça Nelore, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Marcela Maria de Souza - Integrante / Polyana C. Tizioto - Integrante / Luciana C. de Almeida Regitano - Integrante / Priscila Silva Neubern Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2010 - 2013

    Identificação de genes candidatos para maciez de carne para prospecção de SNPs em famílias de referência da raça Nelore, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Marcela Maria de Souza - Integrante / Polyana C. Tizioto - Coordenador / Luciana C. de Almeida Regitano - Integrante / Mauricio M. Alencar - Integrante / Priscila Silva Neubern Oliveira - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2009 - 2012

    Comparação do perfil epigenético de genes relacionados à diferenciação neural em tipos celulares obtidos a partir de células tronco embrionárias diferenciadas in vitro e in vivo e de células da massa celular interna de embriões, Descrição: A organização da cromatina das células eucarióticas, coordenada por modificações epigenéticas, permite que apenas uma parte do DNA seja utilizada para expressão de genes em cada tecido, determinando um padrão especifico de expressão gênica em cada tipo celular. No entanto, estudos demonstram que o cultivo celular in vitro pode alterar este padrão através de alterações epigenéticas diferentes das que ocorrem no ambiente in vivo. A diferenciação neuronal a partir de células tronco embrionárias in vitro representa uma possibilidade para o tratamento de doenças neurodegenerativas através da terapia celular, porém avaliações das alterações destes neurônios produzidos in vitro são necessárias. No presente estudo, objetivamos estudar as modificações epigenéticas em alguns dos mais importantes genes responsáveis pela diferenciação neural (Mash1, Sox3, Pax3, Pax6) e neuronal (Neurod, NEGR I, NEF3, Epha4), presentes em tipos celulares neurais diferenciados in vitro e in vivo. Para tanto, células neurais em estádios de maturidade semelhantes terão seus padrões de acetilação e metilação de histonas H3 e H4, em algumas lisinas especificas sabidamente envolvidas na diferenciação neural, estudados e comparados, em grupos diferenciados in vitro a partir de CTE pluripotentes; in vivo a partir de CTE pluripotentes; e in vivo a partir de células da massa celular interna de embriões controle. As células serão selecionadas através de citometria de fluxo, e o conteúdo de cromatina será separado e precipitado juntamente a anticorpos específicos (ChIP). A quantificação dos níveis de modificações epigenéticas será realizada através de PCR em tempo real.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Especialização: (1) Doutorado: (3) . , Integrantes: Marcela Maria de Souza - Integrante / Naiara Zoccal Saraiva - Integrante / Clara Slade Oliveira - Coordenador / Joaquim Mansano Garcia - Integrante / Tatiane Tetzner - Integrante / Roberta Vantini - Integrante.

  • 2009 - 2011

    Avaliação dos efeitos de polimorfismos e da origem parental do alelo de genes candidatos sobre a maciez da carne e a deposição de gordura em bovinos da raça Nelore, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (3) . , Integrantes: Marcela Maria de Souza - Coordenador / Simone C. Méo - Integrante / Adriana M. G. Ibelli - Integrante / Sarah Laguna Meirelles - Integrante / Polyana C. Tizioto - Integrante / Luciana C. de Almeida Regitano - Integrante / Priscila Silva Neubern Oliveira - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Embrapa Pecuária Sudeste - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2008 - 2010

    CARACTERIZAÇÃO DA LINHAGEM H106 DE CÉLULAS TRONCO EMBRIONÁRIAS (mESC) E ESTUDO DOS EFEITOS DA TRICOSTATINA-A NA PRODUÇÃO DE EMBRÕES QUIMÉRICOS E DIFERENCIAÇÃO IN VITRO, Descrição: O estudo dos processos de diferenciação em células tronco embrionárias (ESC) representa uma importante ferramenta para o entendimento das vias moleculares que os regem, apresentando grande aplicação tanto na ciência básica quanto na engenharia de tecidos e medicina regenerativa. No entanto, pouco é conhecido sobre as marcas epigenéticas existentes na cromatina destas células, e de que forma a regulação da expressão gênica ocorre no momento da diferenciação. O presente trabalho tem por objetivo a caracterização da linhagem de células tronco embrionárias H106 e o estudo dos efeitos da droga tricostatina A, um inibidor das enzimas histona deacetilases, sobre a expressão gênica nestas células em estádios iniciais de desenvolvimento. Para tanto, serão conduzidos experimentos de diferenciação in vitro das mESC e análise da expressão gênica por rt-PCR em tempo real e por reações de imunocitoquímica dos genes: Oct3/4, nanog, nestina, βIII-tubulina, desmina, troponina-I e α-fetoproteína (AFP), na ausência e presença da droga. Paralelamente, serão conduzidos experimentos com a produção de embriões quimeras injetados com mESC e cultivados na presença e ausência da droga tricostatina A, avaliando, dessa forma, a colonização das mESC nos embriões receptores. Ainda, será realizada a injeção das mESC, tratadas ou não com tricostatina A, em camundongos imunossuprimidos para avaliar sua pluripotencialidade, antes e após a diferenciação inicial in vitro.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Especialização: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Marcela Maria de Souza - Integrante / Naiara Zoccal Saraiva - Integrante / Clara Slade Oliveira - Integrante / Joaquim Mansano Garcia - Coordenador.

  • 2008 - 2009

    Efeitos da substituição do soro fetal bovino (SFB) pela albumina sérica bovina (BSA) e knockout? serum replacement (KSR) na produção in vitro de embriões bovinos., Descrição: O presente trabalho tem como objetivo avaliar os efeitos da substituição do soro fetal bovino (SFB) por diferentes fontes protéicas no desenvolvimento e qualidade embrionária durante a produção in vitro de embriões bovinos (PIV). Para tanto, serão adicionados ao sistema de PIV à albumina sérica bovina (BSA) e o Knockout Serum Replacement (KSR). No Experimento 1 será comparado a maturação oocitária em meios suplementados com (1) SFB, (2) BSA + ITS, (3) KSR e (4) BSA + KSR. As duas condições de maturação que apresentarem melhores resultados no Experimento 1 serão utilizadas como metodologia de maturação para o Experimento 2, no qual serão avaliadas as seguintes condições de cultivo em meio SOF: BSA + SFB; BSA; BSA + KSR; KSR e KSR + KSR condicionado por células-tronco embrionárias murinas. A qualidade dos embriões produzidos será avaliada e será comparado entre os grupos as taxas de clivagem e produção de blastocistos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcela Maria de Souza - Coordenador / Naiara Zoccal Saraiva - Integrante / Clara Slade Oliveira - Integrante / Joaquim Mansano Garcia - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

  • 2007 - 2009

    Efeitos da hiperacetilação de histonas na diferenciação de células tronco embrionárias murinas, Descrição: O estudo dos processos de diferenciação em células tronco embrionárias (CTE) representa uma importante ferramenta para o entendimento das vias moleculares que os regem, apresentando grande aplicação tanto na ciência básica quanto na engenharia de tecidos e medicina regenerativa. Pouco é conhecido sobre as marcas epigenéticas existentes na cromatina destas células, e de que forma a regulação da expressão gênica ocorre no momento da diferenciação. O presente trabalho teve como objetivo o estudo dos efeitos da hiperacetilação das histonas causada pela droga tricostatina A (TSA), uma inibidora das enzimas histona desacetilases, sobre a diferenciação destas células em estádios iniciais e avançados. Para tanto, a hiperacetilação induzida pela droga foi estimada por reações de imunocitoquímica para AcLys9H3. Os efeitos anti-proliferativos da TSA foram mensurados pelo teste de TUNEL e contagem de células. Ainda, foram conduzidos experimentos de diferenciação in vitro de CTE e análise da expressão de proteínas características de linhagens celulares diferenciadas por reações de imunocitoquímica (Oct3/4, nestina, âIII tubulina, desmina e troponina I), em cultivos tratados com TSA em diferentes concentrações e em diferentes momentos. Desta forma, foi estimada a população de tipos celulares oriundos dos folhetos embrionários ectodérmico e mesodérmico, como neurônios, e células musculares, quando foi promovida a hiperacetilação das histonas nas CTE, em diferentes momentos da diferenciação celular in vitro. A TSA induziu apoptose em níveis superiores aos do grupo controle, e retardou/inibiu a divisão celular. Promoveu hiperacetilação dose-dependente nos períodos estudados, e estimulou a diferenciação de precursores mesodérmicos (50nM d5) e ectodérmicos (15nMd0-5 e 50nMd5), cardiomiócitos (50nMd5 e 100nMd13) e neurônios (15nMd0-5, 50nMd5, 100nMd5, 100nMd13).. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcela Maria de Souza - Integrante / Naiara Zoccal Saraiva - Integrante / Clara Slade Oliveira - Coordenador / Joaquim Mansano Garcia - Integrante / Roberta Vantini - Integrante.

Histórico profissional

Endereço profissional

  • Universidade Federal de São Carlos. , Rodovia Washington Luiz, 13560-905 - Sao Carlos, SP - Brasil, Telefone: (16) 33518306

Experiência profissional

2009 - 2016

Universidade Federal de São Carlos

Vínculo: Estudante de Mestrado, Enquadramento Funcional: Estudante de Pós-Graduação, Carga horária: 30

2017 - 2018

Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária

Vínculo: Pós-doutorado, Enquadramento Funcional: Pesquisador pós-doutorado

2009 - 2016

Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária

Vínculo: Estágio, Enquadramento Funcional: Estudante de Mestrado e Doutorado, Carga horária: 20, Regime: Dedicação exclusiva.

2005 - 2005

Colégio Américo de Souza

Vínculo: Livre, Enquadramento Funcional: Estágiario

2004 - 2007

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

Vínculo: livre, Enquadramento Funcional: aluno, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

  • 04/2007 - 07/2009

    Estágios , Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias de Jaboticabal, .,Estágio realizado, no Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Reprodução Animal.

2014 - 2015

Max Planck Institute for Molecular Biomedicine - Münster

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estudante, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Desenvolvimento de parte do projeto de doutorado.

2018 - Atual

Iowa State University

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Research Scholar - Pós-doutorado