Flávio de Oliveira Francisco

Pós-doutorado

Formação complementar

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Áreas de atuação

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Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2019 - Atual

  Utilização e manejo de microbioma em suínos para aumento da eficiência de conversão energética e produção de carne, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Flávio de Oliveira Francisco - Integrante / Alan Trindade Branco - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2015 - Atual

  Variação natural do cromossomo Y e seus efeitos fenotípicos e epigenéticos em espécies de Drosophila, Descrição: Durante muito tempo acreditou-se que o cromossomo Y de D. melanogaster não apresentava nenhuma função além de ser responsável pela fertilidade masculina. Além disso, acreditava se que o Y não apresentava nenhuma variação. A descoberta de que o cromossomo Y é composto por regiões que desempenham um importante papel regulador sobre genes autossômicos e ligados ao X foi surpreendente. Entretanto, por ser um fenômeno em incipiente processo de entendimento, ainda existem lacunas sobre a extensão da variação natural do cromossomo Y e seus efeitos fenotípicos e epigenéticos em espécies de Drosophila. Com o intuito de preencher essa lacuna, nossos objetivos foram: (i) testar a hipótese de que interações epistáticas entre o cromossomo Y e o resto do genoma estão envolvidas na quebra de barreiras reprodutivas entre as três espécies do clado D. simulans; (ii) verificar se há variação intrapopulacional na supressão do desvio da razão sexual causada por supressores localizados no cromossomo Y de D. simulans e; (iii) verificar se há variação intrapopulacional suficiente nas sequências do cromossomo Y para causar variação no fenótipo da variegação do efeito de posição em Drosophila melanogaster. Nossos resultados mostraram que existe uma grande variação intrapopulacional no cromossomo Y tanto em D. simulans quanto em D. melanogaster. Cópias do gene ribossômico 5.8S, que não existe no Y de D. simulans, mostraram variação em D. melanogaster. Além disso, apesar de nossas amostras terem apresentado homogeneidade nos elementos transponíveis (TE) estudados, acreditamos que o alto polimorfismo intrapopulacional é resultado de uma dinâmica evolutiva única do cromossomo Y, cuja variação estaria presente nos DNAs satélite ou em outros TEs. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Flávio de Oliveira Francisco - Coordenador / LEMOS, BERNARDO - Integrante / Lourdes Alexandra Valdez - Integrante.

• 2014 - 2016

  A influência do cromossomo Y na quebra de barreiras reprodutivas entre espécies do clado Drosophila simulans, Descrição: O cromossomo Y de Drosophila melanogaster é heterocromático; constituído por enormes blocos de regiões de microssatélites, elementos transponíveis e várias cópias de genes para RNA ribossômico; compreende 41 milhões de pares de bases (cerca de 20% do genoma haploide do macho), mas apresenta somente 13 genes codificadores de proteínas (menos de 0,2% do total de genes do genoma). Embora esses genes apresentem baixíssima diversidade nucleotídica, o cromossomo Y está associado a variações em diferentes traços fenotípicos, principalmente por causa da regulação da expressão de centenas de genes autossômicos e ligados ao X. Essa associação ao polimorfismo fenotípico é possível graças às variações no tipo, quantidade e distribuição de DNA repetitivo do cromossomo Y. Outras espécies de Drosophila também apresentam um cromossomo Y heterocromático e rico em DNA repetitivo, mas seus conteúdos gênicos são bem diferentes. Devido ao fato do cromossomo Y ser necessário para a fertilidade masculina e de poder divergir rapidamente, espera-se que ele possua um papel importante na esterilidade de híbridos interespecíficos. O clado D. simulans, formado pelas espécies irmãs D. simulans, D. mauritiana e D. sechellia, é um modelo apropriado para esse tipo de estudo, pois os cruzamentos interespecíficos geram machos estéreis e fêmeas férteis. Entretanto, machos de D. simulans introgredidos com o Y de D. sechellia são férteis, o que torna interessante verificar se interações epistáticas entre o cromossomo Y e o resto do genoma estão envolvidas na quebra de barreiras reprodutivas entre espécies do clado D. simulans.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Flávio de Oliveira Francisco - Coordenador / LEMOS, BERNARDO - Integrante.

• 2013 - 2014

  Filogeografia continental da abelha sem ferrão Tetragonisca angustula, Descrição: A abelha sem ferrão Tetragonisca angustula (Latreille, 1811) apresenta-se como um bom modelo para entender como eventos geológicos e paleoclimáticos de magnitude continental influenciaram os padrões evolutivos intraespecíficos. É uma das espécies de abelha sem ferrão mais amplamente distribuída na região neotropical, sendo encontrada desde o estado de Veracruz, no México, até o estado brasileiro do Rio Grande do Sul. É uma abelha de hábitos generalistas, e encontrada em praticamente todos os biomas tropicais, incluindo a caatinga e a Amazônia. É uma espécie aparentemente homogênea com relação à morfologia, embora faltem estudos que englobem amostras de toda a distribuição. Análises do DNA mitocondrial mostraram que o comportamento filopátrico das rainhas dessa espécie acarreta numa alta estruturação genética populacional. Sabendo-se que essa espécie possui dispersão limitada e estruturação populacional, nossa hipótese é de que diferentes populações amostradas dentro dessa extensa distribuição geográfica não são um grupo genético homogêneo, podendo inclusive, serem constituídas por mais de uma espécie. O objetivo geral desse projeto é examinar a estrutura filogeográfica de T. angustula através da utilização de sequências de DNA mitocondrial e nuclear.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Flávio de Oliveira Francisco - Coordenador / Maria Cristina Arias - Integrante.

• 2008 - 2012

  Estrutura e diversidade genética de populações insulares e continentais de abelhas da Mata Atlântica, Descrição: Durante muito tempo as ilhas vêm sendo fundamentais para pesquisa em ecologia e biologia evolutiva. Esses estudos tornaram possível a elaboração de importantes teorias nesses campos e que puderam ser extrapoladas para diversos outros ambientes. O aumento dos desmatamentos e da fragmentação de habitats tem levado ao isolamento dos organismos em ?ilhas? dentro do continente. A perda de diversidade em fragmentos é uma situação preocupante. Populações restritas a ilhas ou fragmentos possuem maior probabilidade de extinção. As abelhas possuem um papel fundamental nos ecossistemas e por isso a extinção de uma população terá impacto nos outros níveis tróficos. Em virtude disso, o objetivo desse trabalho foi testar a hipótese de que populações das abelhas Tetragonisca angustula e Bombus morio de ilhas com mais de 100 ha localizados nos estados de Santa Catarina (SC), Paraná (PR), São Paulo (SP) e Rio de Janeiro (RJ), e populações continentais em áreas próximas a remanescentes de Mata Atlântica nos estados de Minas Gerais (MG), PR, RJ, SC e SP possuem baixa diversidade genética e, por isso, estariam mais propensas à extinção. Nossos resultados mostraram que a espécie T. angustula apresenta alta filopatria de rainhas e baixa diversidade genética mitocondrial. Por outro lado, os microssatélites mostraram menor estruturação e alta/moderada diversidade genética, indicando que os machos são o sexo dispersor. Para a espécie B. morio, a diversidade genética observada para ambos os marcadores foi alta, com exceção de duas populações. As fêmeas também apresentaram maior estruturação populacional, enquanto que para os machos essa estruturação praticamente não existiu. Portanto, as populações das espécies T. angustula e B. morio não apresentam inclinação à extinção. A sobrevivência em ambientes urbanos e a grande capacidade de migração dos machos parecem ser fatores fundamentais para isso. Além disso, essas características parecem ser as responsáveis pelo não isolamento genético entre. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Flávio de Oliveira Francisco - Integrante / Maria Cristina Arias - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 17

• 2004 - 2005

  Análise da diversidade de espécies e caracterização do DNA mitocondrial de abelhas do Parque Ecológico da Cachoeirinha (Iporá, GO), Descrição: As abelhas constituem um grupo de invertebrados de grande importância econômica e ecológica. Tendo o pólen e o néctar como suas principais fontes de energia e proteínas, as abelhas constituem cerca de 40 a 90% dos agentes polinizadores de fanerógamas em diversos ecossistemas, e com isso possuem influência direta na diversidade vegetal. A ação de meleiros e a devastação ambiental vêm causando a diminuição deste grupo de invertebrados e de sua distribuição geográfica, levando a uma evidente preocupação em se estudar a diversidade da apifauna brasileira. No presente trabalho, foi realizado um levantamento da diversidade apícola do Parque Ecológico da Cachoeirinha (Iporá, GO), bem como a análise molecular através do PCR+RFLP do DNA mitocondrial (DNAmt), para o reconhecimento de sua diversidade genética. As coletas foram divididas por estação do ano. Foram realizadas 10 horas de coleta na primavera, 24 horas no verão e 24 horas no outono. No total foram coletadas 945 abelhas. Os resultados mostraram grande diversidade de espécies e predominância de abelhas da tribo Meliponini, principalmente de espécies pertencentes ao gênero Trigona. Predominância de uma espécie, em alguns casos, pode ser explicada por meio de preferência por determinados tipos de flores e horários, porém isso não ocorreu com as abelhas desse gênero. A proximidade entre os ninhos também é um fato relevante, pois algumas abelhas, incluindo Trigona, apresentam comunicação intensa e específica ao encontrarem alimento, assim forrageando em grupo, acabam influenciando no número de indivíduos coletados. Três enzimas de restrição foram utilizadas na análise de fragmentos mitocondriais amplificados via PCR. Grande variabilidade genética foi observada entre o DNAmt entres as seis espécies estudadas, sendo encontrado cinco haplótipos distintos. Os dados apresentados no presente trabalho são importantes para o reconhecimento da situação atual das abelhas do cerrado brasileiro.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Flávio de Oliveira Francisco - Coordenador / Rute Magalhães Brito - Integrante / Leandro Rodrigues Santiago - Integrante / Thiago Mahlmann Vitoriano Lopes Muniz - Integrante / Favízia Freitas de Oliveira - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Universidade Estadual de Goiás - Bolsa., Número de produções C, T & A: 2 / Número de orientações: 3

• 2000 - 2002

  Análise da estrutura populacional de Plebeia remota (Hymenoptera, Apidae, Meliponinae) por estudo de RFLP do DNA mitocondrial e microssatélites, Descrição: Ferramentas moleculares têm sido amplamente utilizadas em estudos de caracterização de populações. Dentre essas ferramentas destaca-se o DNA mitocondrial (DNAmt) e os microssatélites. Em abelhas Apis mellifera esses dois marcadores têm auxiliado no entendimento da dinâmica de populações, caracterização de subespécie, filogeografia e relações filogenéticas. Neste trabalho, nosso objetivo foi caracterizar populações da abelha nativa Plebeia remota com os marcadores moleculares acima citados para uma possível correlação entre suas composições genéticas e biogeografia. Foram estudadas amostras de quatro populações (SP, PRp, PRc e SC) pertencentes a três estados brasileiros: SP, PR e SC. Foi caracterizado o DNAmt de 70 colméias dessa espécie, e pudemos observar a existência de 15 haplótipos distintos. Diferentes métodos estatísticos revelaram isolamento entre as quatro populações estudadas, indicando a ausência de fluxo gênico via fêmea. Com relação ao uso dos microssatélites, sete locos foram selecionados e analisados em 360 indivíduos de 72 colméias. Análises realizadas com cinco indivíduos por colméia mostraram ser menos eficientes do que as realizadas com um indivíduo por colméia, cujo resultado não mostrou diferenciação entre as populações de SP e PRc, e entre PRc e SC. Essa ausência de isolamento pode ser devida ao pequeno número amostral de PRc. As topologias dos fenogramas construídos com base nos dados do DNAmt e dos microssatélites, relacionando as quatro populações estudadas, foram concordantes.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Flávio de Oliveira Francisco - Integrante / Maria Cristina Arias - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 12

• 1999 - 1999

  Detecção de polimorfismo do genoma mitocondrial entre duas populações de Plebeia remota (Hymenoptera, Apidae, Meliponini), Descrição: Diferenças morfológicas e comportamentais entre populações de Plebeia remota provenientes de Cunha (SP) e Prudentópolis (PR) foram as razões que nos levaram a estudar o DNA mitocondrial (DNAmt) dessa espécie, com o objetivo de detectar uma possível correlação dessa molécula com sua distribuição geográfica e estrutura populacional. Inicialmente, nós caracterizamos o DNAmt, através do mapeamento de sítios de restrição, de uma amostra de Cunha e outra de Prudentópolis. A diferença entre o genoma mitocondrial dessas duas amostras foi mostrado pelos distintos padrões de restrição de cerca de 40% das enzimas utilizadas. O próximo passo foi analisar 40 ninhos de P. remota (11 de Cunha e 29 de Prudentópolis) para determinação de haplótipos a nível populacional, usando somente aquelas enzimas que exibiram padrões de corte distintos no exame inicial. Nós encontramos um total de seis haplótipos, sendo três presentes somente em Cunha e os outros três somente em Prudentópois. Além disso, foi verificado em cada população a predominância de um haplótipo muito frequente (67% e 90% em Cunha e Prudentópolis, respectivamente). Esse resultado indica a ausência de fluxo gênico via rainha entre essas duas populações. Adicionalmente, nossos dados podem ser usados para se determinar a origem geográfica de ninhos de P. remota.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Flávio de Oliveira Francisco - Integrante / Maria Cristina Arias - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 4

• 1997 - 1998

  Análise do DNA mitocondrial (DNAmt) das abelhas do gênero Plebeia, Descrição: As abelhas do gênero Plebeia, cujo centro de origem é a região sul e sudeste do Brasil, são polinizadoras fundamentais de diversos ecossistemas. Como a maioria dos meliponíneos, essas abelhas apresentam inúmeros aspectos de sua biologia e evolução a serem estudados. Ferramentas moleculares poderão adicionar novas informações e ajudar a elucidar problemas ainda não resolvidos. Dentre os marcadores moleculares, o DNA mitocondrial (DNAmt) tem sido amplamente utilizado. Por apresentar herança materna, é especialmente interessante no estudo das abelhas, visto que todos os indivíduos de uma mesma colônia têm genomas mitocondriais idênticos. O polimorfismo de tamanho de fragmentos de restrição (RFLP) de DNAmt tem fornecido uma caracterização e discriminação interespecífica em vários organismos. Em abelhas, estudos moleculares são praticamente restritos ao gênero Apis. Visando adicionar novos dados para a caracterização de abelhas nativas do Brasil, o DNAmt de cinco espécies do gênero Plebeia (P. droryana, P. emerina, P. remota, P. saiqui e P. pugnax) foi extraído e analisado por digestões com 17 enzimas de restrição, das quais quatro não cortaram o genoma mitocondrial de nenhuma das espécies. Foi encontrada uma alta variabilidade interespecífica, sendo que P. droryana foi a espécie que apresentou o maior número de sítios de restrição (23 sítios) e P. remota, o menor (apenas 16). Onze sítios mostraram-se conservados, estando presentes em todas as espécies. Os resultados obtidos permitiram estimar o tamanho total desse genoma em cerca de 18.500 pb e construir mapas de restrição para essas espécies. Vários sítios de restrição foram localizados em genes específicos por meio de PCR-RFLP. Assim, a localização de 13 dos principais genes mitocondriais foi acrescentada aos mapas de restrição. A ordem desses genes mostrou-se igual à de Apis mellifera.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Flávio de Oliveira Francisco - Integrante / Maria Cristina Arias - Coordenador / Daniela Silvestre - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa., Número de produções C, T & A: 13

Prêmios