Fabio Marcio Squina

Possui graduação em Farmácia e Bioquímica pela Faculdade de Ciências Farmacêuticas da Universidade de São Paulo (1998), Mestrado em Ciência de Alimentos pela Faculdade de Engenharia de Alimentos da UNICAMP (2001) e Doutorado em Biologia Celular e Molecular pela Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da USP (2005). Realizou dois pós-doutorados, primeiro (2005 - 2007) no Departamento de Bioquímica da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto e, em sequencia (2007-2008), no Departamento de Microbiology and Molecular Genetics da Oklahoma State University. Durante o período de 2008 a 2017, foi pesquisador líder no Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais. Desde 2010 é professor (orientador) de pós-graduação no Instituto de Biologia da UNICAMP. Desde 2017 é professor na Universidade de Sorocaba (UNISO), onde está vinculado aos Programas de Processos Tecnológicos e Ambientais e Ciências Farmacêuticas. Atuou como coordenador em 14 projetos de pesquisa financiados pelo CNPq e FAPESP. Coordenou um projeto FINEP de Inovação Industrial envolvendo dezenas de profissionais multinacionais. Bolsista de produtividade CNPq desde 2012. É revisor frequente de projetos de fomento CNPq e FAPESP, bem como para agências internacionais como Austrian Science Fund (FWF), Research Grants Council (RGC) of Hong Kong, National Agency for Research and Development (ANID) do Chile e National Research Agency (ANR) da França. Participou como palestrante e na organização de eventos científicos internacionais e nacionais em sua área. Tem experiência na área de Biologia Molecular e Bioquímica, com ênfase em Enzimologia e Genética de Microrganismos. Seus interesses científicos combinam biologia sintética, ciências ômicas e abordagens de high-throughput screening visando o desenvolvimento de enzimas e soluções biotecnológicas para a conversão de biomassa lignocelulósica e plásticos fósseis em bioprodutos.

Informações coletadas do Lattes em 03/09/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Biologia Celular e Molecular

2001 - 2005

Universidade de São Paulo
Título: Produção sistemática de reagentes para mutagênese sítio-específica em Leishmania ssp. A ruptura de genes localizados na extremidade de cromossomos
Prof. Dr. Luiz Ricardo Orsini Tosi. Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Parasitologia / Subárea: Protozoologia de Parasitos. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Morfologia / Subárea: Biologia Celular.

Mestrado em Ciência de Alimentos

1999 - 2001

Universidade Estadual de Campinas
Título: Estudos com Carotenóides de Leveduras do Gênero Rhodotorula: Desenvolvimento de Método Analítico, Influência de Inibidores e Cultivo em meio Alternativo a Basa de Caldo de Cana-de-Açúcar, Ano de Obtenção: 2001
Profa. Dra. Adriana Zerlotti Mercadante.Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica.

Especialização em Análises Clínicas e Toxicológicas

1997 - 1998

Universidade de São Paulo
Título: Especialização em Análises Clínicas e Toxicológicas

Graduação em Farmácia Bioquímica

1994 - 1998

Universidade de São Paulo
Título: Seleção de compostos oriundos de plantas com capacidade de alterar o crescimento apical e/ou ramificação de Neurospora crassa (Trabalho de Iniciação Científica)
Orientador: Profa. Dra. Suraia Said
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.

Pós-doutorado

2007 - 2008

Pós-Doutorado. , Oklahoma State University, OSU, Estados Unidos. , Bolsista do(a): U. S. Department of Energy, DOE, Estados Unidos. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Enzimologia. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica.

2005 - 2007

Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.

Formação complementar

2015 - 2015

Microbial Genomics and Metagenomics. (Carga horária: 40h). , DOE Joint Genome Institute, JGI, Estados Unidos.

2014 - 2014

Hiseq 2500 System, cBot and Truseq stranded RNA. (Carga horária: 20h). , Illumina, ILLUMINA, Brasil.

2014 - 2014

MiSeq System and Nextera Library Prep.. (Carga horária: 20h). , Illumina, ILLUMINA, Brasil.

2012 - 2012

Microbial Genomics and Metagenomics. (Carga horária: 40h). , DOE Joint Genome Institute, JGI, Estados Unidos.

2012 - 2012

São Paulo School of Advance Science on e-Science f. (Carga horária: 40h). , Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, CNPEM, Brasil.

2006 - 2006

Elaboração de Plano de Negócios. (Carga horária: 16h). , Incubadora de Empresas de Base Tecnológica, SUPERA, Brasil.

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Compreende Razoavelmente, Lê Pouco.

Francês

Compreende Razoavelmente, Lê Pouco.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Enzimologia.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Morfologia / Subárea: Biologia Celular.

Organização de eventos

SQUINA F. M. . Joint FAPESP - BBSRC Collaborative Project Meeting. 2019. (Outro).

SQUINA F. M. . Second Generation Bioethanol 2016. 2016. (Congresso).

SQUINA F. M. . Joint FAPESP - BBSRC Collaborative Project Meeting in Integrated Biorefinery Approaches for Manufacture of Advanced Biofuels. 2016. (Outro).

SQUINA F. M. . I Workshop on Application of Next Generation Sequencing. 2015. (Outro).

SQUINA F. M. . Second Generation Bioethanol 2015. 2015. (Outro).

SQUINA F. M. . Second Generation Bioethanol 2014. 2014. (Congresso).

SQUINA F. M. . 2nd Bioenergy Science and Technology Conference. 2014. (Congresso).

SQUINA F. M. . CNPEM-UK Meeting on Biocatalyst Discovery and Synthetic Biology. 2014. (Outro).

SQUINA F. M. . Second Generation Bioethanol: Enzymatic Hydrolysis 2013. 2013. (Congresso).

SQUINA F. M. . Second Generation Bioethanol: Enzymatic Hydrolysis 2012. 2012. (Congresso).

SQUINA F. M. . Second Generation Bioethanol: Enzymatic Hydrolysis 2011. 2011. (Congresso).

SQUINA F. M. ; TOLEDO, J. S. ; IZIDORO, T. C. ; SOUSA, J. F. ; VALENTE, V. ; RULER, R. . I Curso de Verão em Biologia Celular e Molecular. 2004. (Outro).

SQUINA F. M. ; TOLEDO, J. S. ; IZIDORO, T. C. ; SOUSA, J. F. ; VALENTE, V. ; RULER, R. . II Sessão de Pôster em Biologia Celular e Molecular. 2004. (Outro).

SQUINA F. M. . III Simpósio Latino Americano de Ciência de Alimentos. 1999. (Congresso).

Participação em eventos

III Workshop de Bioenergia.Development of Biocatalytic systems for production of value-added chemicals from renewable feedstocks. 2019. (Oficina).

Joint FAPESP - BBSRC Collaborative Project Meeting.From Renewable feedstock to value-added products based on discovery-based omics of natural lignocellulolytic systems. 2019. (Simpósio).

Workshop Frontiers of Science - FAPESP and Max Planck.From Renewable feedstock to value-added products based on discovery-based omics of natural lignocellulolytic systems. 2018. (Oficina).

2o Encontro Nacionals de Química Biotecnológica e Agroindustrial.Ampliando o conhecimento de atividades enzimáticas lignoceluloliticas através de estratégias omicas. 2017. (Encontro).

III Escola de Biofísica Molecular: uma visão interdisciplinar do sistema biológico.Expanding the Knowledge of Auxiliary Mechanisms Based on Omics Approaches. 2017. (Simpósio).

II Workbiotec - Workshop da pós graduação em Biotecnologia.Desenvolvimento de enzimas envolvidas na conversão de Biomassa Lignocelulósica. 2016. (Simpósio).

67ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira para o Progresso da Ciência. Targeted Enzyme Discovery Based on Omics Mining of Natural Lignocellulolytic Systems. 2015. (Congresso).

Congresso Brasileiro de Genética. Genética Molecular e Biotecnologia Aplicada na Conversão da Biomassa Vegetal em Bioprodutos. 2015. (Congresso).

Encontro de Biociências e Tecnologia - BITEC.Metagenomica e conversão de Biomassa. 2015. (Encontro).

Workshop sobre o estado da arte da Tecnologia de Produção de Etanol. 2015. (Oficina).

Workshop - Using systems and synthetic Biology to Tailor Plant cell walls for a better future.Omics Approaches on Lignocellulolytic Natural Systems. 2015. (Simpósio).

2nd Brazilian BioEnergy Science and Tecnology Conference. Omics-based approaches for biocatalyst discovery in lignocellulose-to-bioproduct applications. 2014. (Congresso).

62nd ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics. Metaproteogenomic approaches for target discovery of glycoside hydrolases and auxiliary activities in the digestome of lower termite Coptotermes gestroi. 2014. (Congresso).

Evento Comite Cientifico Empresa Natura.Como podemos utilizar a Biotechnologia Moderna para acelerar a Inovação. 2014. (Encontro).

III Congresso Brasileiro de Recursos Genéticos. Estratégias Meta-prote-Genômicas para Prospecção de Enzimas com Aplicação Biotecnológica. 2014. (Congresso).

XI Seminário Brasileiro de Tecnologia Enzimática (ENZITEC 2014).Desenvolvimento de Abordagens "Omicas" para a Descoberta de Biocatalisadores para Conversão da Biomassa Vegetal. 2014. (Seminário).

XXII Congreso Latinoamericano de Microbiologia. From Biomass-to-Bioproduct Application using Discovery-based Omics approaches. 2014. (Congresso).

Gordon Conference on Cellulosomes, Cellulases & Other Carbohydrate Modifying Enzymes. Metaproteogenomics Strategies for Enzyme Discovery in Biomass-to-Bioproducts aplications. 2013. (Congresso).

Manchester?Brazil Industrial Biotechnology and Bioenergy meeting.Omics approaches to biocatalysts discovery in biomass-to-bioproducts applicaons. 2013. (Encontro).

USP Conference on Synthetic Biology for Biomass and Biofuels Production.USP Conference on Synthetic Biology for Biomass and Biofuels Production. 2013. (Simpósio).

XLII Annual Meeting of Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Metaproteogenomics Strategies for Enzyme Discovery in Biomass-to-Bioproducts aplications. 2013. (Congresso).

14th International Symposium on Microbial Ecology, ISME14,. Deciphering the microbial community and the lignocellulolytic digestome of lower termite Coptotermes gestroi.. 2012. (Congresso).

NWO-FAPESP-CNPq Joint Workshop for developing research collaborations on the Bio-based Economy.Chemicals and fuels from raw materials: disclosure by biotechnology. 2012. (Encontro).

Workshop BIOEN de Pesquisa.Library generation for biomass-conversion enzymes from soil metagenome. 2012. (Encontro).

1st Brazilian BioEnergy Science and Technology Conference. The Lignocellulolytic Metagenome of Sugarcane Bagasse- Degrading Soil. 2011. (Congresso).

26o. Congresso Brasileiro de Microbiologia. Expressão Heteróloga de Celulases em Fungo Filamentoso. 2011. (Congresso).

26th Fungal Genetics Conference at Asilomar. Evaluation of Penicilium Echinulatum secretome through Shotgun Proteomics. 2011. (Congresso).

9 SLACA - Simpósio Latino Americano de Ciência de Alimentos.Aplicação de Ferramentas "Omicas" para prospecção de enzimas biotechnologicas e sua caracterização molecular. 2011. (Simpósio).

Workshop on Synthetic Biology and Robotics. 2011. (Encontro).

XL Annual Meeting of The Brazilian Biochemistry and Molecular Biology Society. Discovery of Biomass Conversion Enzymes from Sugar Cane Soil Metagenome. 2011. (Congresso).

20 Reunião Anual de Usuários do Laboratório Nacional de Luz Sincrotron.Development of a Lybrary for Biomass Conversio Enzymes. 2010. (Encontro).

Bioen Research Workshop.Library generation for biomass-conversion enzymes from soil metagenome. 2010. (Oficina).

BIOEN Workshop on Synthetic Biology. 2010. (Encontro).

Encontro de Pesquisadores do Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol. 2010. (Encontro).

II 4 BIOTEC.Desenvolvimento de enzimas envolvidas na produção de biocombustíveis. 2010. (Simpósio).

I Workshop do Programa de Pós-Graduação em Genética.Abordagens Metagenômicas para busca de enzimas de interesse biotecnológico. 2010. (Encontro).

UK - Brazil Frontier of Science Symposium.Library generation for Biomass-Coversion enzymes from soil metagenome. 2010. (Simpósio).

Congresso Aberto de Estudantes de Biologia. Novos Rumos e Aplicaçações da Biologia Molecular. 2009. (Congresso).

Xth International Fungal Biology Conference. Gene library generation for biomass-conversion enzymes. 2009. (Congresso).

XVII Simpósio Nacional de Bioprocessos. Development of a Library for Biomaas Conversion Enzymes. 2009. (Congresso).

XXIV Fungal Genetics Conference. Identification of genes down regulated in the pregc mutant strain of N. crassa. 2007. (Congresso).

Curso de Inverno da Bioquímica, Departamento de Bioquímica e Imunologia, na Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.Palestra: Regulação da expressão gênica em resposta ao fosfato e ao pH em fungos filamentosos. 2006. (Outra).

III Curso de Verão em Biologia Celular e Molecular da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.Palestra: Organização do Genoma e Projetos Genoma. 2006. (Outra).

LII Congresso Brasileiro de Genética. O fator de transcrição NUC-1 silencia a expressão de genes que codificam proteínas de resposta ao choque térmico do tipo HSP70 em Neurospora crassa. 2006. (Congresso).

XXXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. A novel preg-controlled gene, involved in the thymidine salvage pathway, was revealed in neurospora crassa using DDRT-PCR. 2006. (Congresso).

II Curso de Verão em Biologia Celula da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.Palestra: Organização do Genoma e Projetos Genoma. 2005. (Outra).

III Sessão de Poster da Área de Biologia Celular e Molecular da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.Produção sistemática de reagentes para integração gênica por transposição in vitro: Ruptura de genes na extremidade de telômeros de Leishmania. 2005. (Encontro).

I Curso de Verão em Biologia Celular e Molecular da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.Palestra: Organização do Genoma e Projetos Genoma. 2004. (Outra).

II Sessão de Poster da Área de Biologia Celular e Molecular da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.The use of transposon technology for systematic gene disruption in Leishmania. 2004. (Encontro).

TriTryp Genomes Meeting. The systematic production of reagents for genome integration by shuttle mutagenesis: Disruption of genes at Leishmania telomeric ends. 2004. (Congresso).

XX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Protozoologia e XXXI Reunião Anual da Pesquisa Básica em Doença de Chagas. In vitro shuttle mutagenesis and functional analysis in Leishmania: gene disruption and complementation of a telomere-located RNA polymerase III. 2004. (Congresso).

XIV Molecular Parasitology Meeting. Systematic production of reagents for gene inactivation in Leishmania. 2003. (Congresso).

XIX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Protozoologia e XXX Reunião Anual da Pesquisa Básica em Doença de Chagas. Systematic disruption of genes at Leishmania chromosome end. 2003. (Congresso).

II Simpósio ?Leishmaniose Tegumentar Americana: Diagnóstico, Tratamento e Controle?. 2002. (Simpósio).

I Sessão de Poster da Área de Biologia Celular e Molecular da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.Nocaute Sistemático de Genes em Leishmania Utilizando Transposição in vitro. 2002. (Encontro).

IV Workshop de Imunologia. 2002. (Oficina).

VII Curso de Verão em Genética da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.Aula teórico e prática: Utilização de Técnica de PCR para Tipagem de Leishmania ssp. 2002. (Outra).

XVIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Protozoologia e XXIX Reunião Anual da Pesquisa Básica em Doença de Chagas. The Use of Transposon for Systematic Disruption of Leishmania Genes. 2002. (Congresso).

III Congress of Pharmaceutical Sciences. Influence of Nicotine and Diphenylamine on the Carotenoid Composition of Rhodotorula glutinis and R. rubra. 2001. (Congresso).

II Congress of Pharmaceutical Sciences. Effects of Natural Phenolic Compounds on the Growing and Morfology of Neurospora crassa. 1999. (Congresso).

III Simpósio Latino Americano de Ciência de Alimentos. 1999. (Simpósio).

I Encontro Farmacêutico de Ribeirão Preto. 1998. (Encontro).

X Simpósio regional de Análises Clínicas. 1998. (Simpósio).

1 Simpósio de Integrado dos Örgãos Estaduais de Saúde e Meio Ambiente. 1997. (Simpósio).

I Congress of Pharmaceutical Sciences. 1997. (Congresso).

X Congresso Paulista de Farmacêuticos e II Seminário Internacional de Farmacêuticos. 1997. (Congresso).

Participação em bancas

Aluno: Fernanda de Campos Moreli

SQUINA F. M.. Caracterização, Imortalização e Avaliação in vitro de um novo bacteriofágo contra Klebsiella pneuminiae. 2020 - Universidade de Sorocaba.

Aluno: ERICA CRISTINA SANTOS SILVA

SQUINA F. M.. ISOLAMENTO, CARACTERIZAÇÃO E ESTABILIZAÇÃO DE BACTERIÓFAGOS LÍTICOS PARA STAPHYLOCOCCUS INTERMEDIUS: APLICAÇÃO VETERINÁRIA NO TRATAMENTO DE PIODERMITES POR PERMEAÇÃO TRANSDÉRMICA. 2020 - Universidade de Sorocaba.

Aluno: Josman Andrey Velasco Mendoza

SQUINA F. M.. Expressão heteróloga, análise bioquímica e avaliação da produção fermentativa de uma enzima exo-arabinanase da família 93. 2018 - Universidade de São Paulo.

Aluno: Roberta Maria Menegaldo Tavarez

SQUINA F. M.. Caracterização de novos fatores de transcrição de Trichoderma reesei envolvidos na degradação de biomassa lignocelullósica. 2017.

Aluno: Gabriela Leila Berto

SQUINA F. M.. Clonagem Expressão e purificação de glicosil hidroláse (GH5 e GH45) provenientes do fungo Gloeophyllum trabeum e o estudo da ação das proteínas como auxiliares na hidrólise de poilssacarídeos. 2016.

Aluno: Giancarlo Suclupe Farro

SQUINA F. M.. Caracterização estrutural e bioquímica das arabinanases de Bacillus licheniformis. 2016.

Aluno: Ana Paula Almeida dos Santos

SQUINA F. M.. Desenvolvimento de um método Analítico para Determinação da atividade de esterases usando material Lignocelulósico como substrato. 2014. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Maria Fernanda Benitiz Eriz

SQUINA F. M.. Atividade Hidrolítica de Extratos Enzimáticos obtidos a partir de Gloeophyllum trabeum associada a substratos celulósicos oxidados. 2014. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Dayelle Samila Pessoti de Oliveira Gonçalvez

SQUINA F. M.. Estudo sobre o modo de ação de enzimas hidrolíticas produzidas por fungos degradadores de madeira sobre substratos com elevado teor de lignina. 2013. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Gustavo Machado Álvarez de Lima

SQUINA F. M.. Estudos estruturais e moleculares da enzimas fosfopantetenil transferase de Xanthomonas albilineans: alvo molecular para o desenvolvimento de novos agroquímicos para a cultura de cana de açúcar. 2013. Dissertação (Mestrado em Ciências Física Aplicada) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Fernanda de Lima Valadares

SQUINA F. M.. Produção e uso de enzimas derivadas do fungo Pleurotus ostearus na hidrólise do bagaço de cana pré-tratado por processo quimiotermomecânico. 2013. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Bárbara Luiza Silva Santiago

SQUINA F. M.. Avaliação do tratamento alcalino do bagaço de malte e seu efeito sobre a bioconversão das fraçoes açucaradas em etanol. 2013. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Fernanda Craveiro Franco

SQUINA F. M.. Clonagem e expressão heteróloga do gene de uma xilanase de Thermoascus aurantiacus em Pichia pastoris. 2011. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Viviane Santos Miranda

SQUINA F. M.. Carotenóides de bactérias extremófilas: produção, caracterização e atividade antioxidante. 2010. Dissertação (Mestrado em Ciência de Alimentos) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Fernanda Mandelli

SQUINA F. M.. Bactéria Termofílica Thermus Filiformis: Produção de Carotenóides e Avaliação da Capacidade Antioxidante. 2010. Dissertação (Mestrado em Ciência de Alimentos) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Caio Vinicius Reis

SQUINA F. M.. Produção heteróloga, caracterização biofísica e estrutural de xilose isomerases visando potenciais aplicações na fermentação de pentoses. 2017 - Universidade de São Paulo.

Aluno: Omar Antônio Uyarte

SQUINA F. M.. Sistemas oxidativos biomiméticos aplicados à hidrólise enzimática de materiais lignocelulósicos. 2016. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: CAIO VINICIUS DOS REIS

SQUINA F. M.. Produção heteróloga, caracterização biofísica e estrutural de xilose isomerases visando potenciais aplicações na fermentação de pentoses. 2016. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Ivana Stankvic

SQUINA F. M.. Dinâmica Molecular de Celulases: Estudos de Reconhecimento de substrato e propriedades conformacionais. 2014. Tese (Doutorado em Instituto de Química) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Isabelle Bezerra Cordeiro

SQUINA F. M.. Estudos Proteômicos revelam um novo papel da FAK na regulação do splicing do mRNA. 2014. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Jorge Lepikson Neto

SQUINA F. M.. Influência da suplementação por falonóides na formação da madeira em Eucalipto.. 2013. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Franciele Colussi

SQUINA F. M.. Caracterização Bioquímica, biofísica e estrutural da Celobiohidrolase I de Trichoderma harzianum envolvida na hidrólise da biomassa lignocelulósica. 2012. Tese (Doutorado em Ciências Física Aplicada) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Marcela Mendes Salazar

SQUINA F. M.. Caracterização do transcriptoma e parede celular de três espécies de Eucalyptus com importância industrial. 2012. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Carla Botelho Machado

SQUINA F. M.. Estratégias Metagenômicas na bioprospecção de glicosil hidrolases para o uso na biorefinaria de biomassa. 2012. Tese (Doutorado em Ciencias - área Química) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Fernanda Barbosa Cupertino

SQUINA F. M.. Caracterização funcional de fatores de transcrição envolvidos na regulação do metabolismo do glicogênio em Neurospora crassa. 2011. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Diane Téo de Moraes

SQUINA F. M.. Produção de Lipopeptídeo Surfactina a partir de uma cepa de Bacillus subtilis com operon Srfa sob controle do promotor Regulado Pgrac. 2010. Tese (Doutorado em Ciência de Alimentos) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Ana Elisa Tognolo Leite

SQUINA F. M.. Caracterização Bioquímica e Biofísica de esterases de Bacillus lichenifromis. 2019 - Universidade de São Paulo.

Aluno: Roberta MAria Menegaldo Tavares

SQUINA F. M.. Caracterização de novos fatores de transcrição de Trichoderma reesei relacionados com a degradação de biomassa lignocelulósica. 2016 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: BRUNO LUAN SOARES PAULA DE MELLO

SQUINA F. M.. Identificação de novas enzimas com potencial na hidrólise de ligações glicosídicas. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Camilia Aoyagui dos Santos

SQUINA F. M.. Bioconversão do Resíduo do Precessamento de Óleo de Palma visando a Produção de Vanilina Natural. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Ciência de Alimentos) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Sulamita de Freitas Franco

SQUINA F. M.. Caracterização de taumatinas do fungo causador da Vassoura de bruxa, Moniliophthora perniciosa. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Marcelo Vizoná Liberato

SQUINA F. M.. Estrutura aberta do anel citoplasmático do canal de potássio de alta condutância ativado por calcio. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Física Aplicada) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Yuri de Abreo Mendonça

SQUINA F. M.. Caracterização de uma Hsp90 de Citrus sinensis potencialmente envolvida no processo infectivo do fitopatógeno Xanthomonas citri. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Fernanda de Campos Moreli

SQUINA F. M.. Isolamento, Caracterização, Imortalização e Avaliação in Vitro de um novo Bacteriófago contra Klebsiella pneumoniae. 2020 - Universidade de Sorocaba.

Aluno: Gonzalo Garcia Delgado

SQUINA F. M.. Caracterização da Flavina Monooxigenase SalC. 2020 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: ERICA CRISTINA SANTOS SILVA

SQUINA F. M.. Isolamento e Caracterização de Bacteriofágos Líticos contra Staphylococcus intermedius para tratamento de piodermites canicas e equinas. 2019 - Universidade de Sorocaba.

Aluno: Roberta Menegaldo Dal?Mas

SQUINA F. M.. Caractarização de novos fatores de transcrição de Trichoderma reesei relacionados com a degradação da biomassa lignocelulósic. 2016.

Aluno: Gabriel Vieira Santello

SQUINA F. M.. Caracterização de terminadores e promotores para otimização do fluxo metabólico de xilose em Saccharomyces cerevisiae linhagem industrial PE-2. 2015 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Gustavo Pagotto Borin

SQUINA F. M.. Estudos genômicos da expressão gênica global do fungo filamentoso Trichoderma reesei crescido em bagaço de cana-de-açúcar. 2014.

Aluno: Thomas Sevillha

SQUINA F. M.. Revisão bibliográfica das diversas aplicações de sequenciamento genético em biotecnologia. 2020 - Universidade de Sorocaba.

SQUINA F. M.. Cargo de Professor Doutor RDIDP junto ao Departamento de Biotecnologia, Escola de Engenharia de Lorena. 2013. Universidade de São Paulo.

BADINO JUNIOR, A. J.; MITCHELL, D.; MILAGRES, A.;SQUINA F. M.; KILIKIAN, B. V.. Concurso para provimento de vaga de professor doutor na Engenharia Química USP. 2010. Universidade de São Paulo.

Orientou

Maria Gabriela Ortiz Ladwig

DESENVOLVIMENTO DE PRE-TRATAMENTO POR OZONIZAÇÃO DE PLASTICO PET APLICADO A BIOCONVERSÃO ENZIMÁTICA; Início: 2024; Dissertação (Mestrado profissional em Processos Tecnológicos e Ambientais) - Universidade de Sorocaba, Universidade de Sorocaba; (Orientador);

José Pedro Tsutsumi de Oliveira

Prospecção, expressão, produção, purificação e caracterização de tpazymes; ; Início: 2024; Dissertação (Mestrado profissional em Processos Tecnológicos e Ambientais) - Universidade de Sorocaba; (Orientador);

SANDRA DE CAMARGO LAMEU

DESENVOLVIMENTO DE PROTOCOLOS VISANDO A PRODUÇÃO E PURIFICAÇÃO DE HIDROFOBINAS DE ASPERGILLUS ORYZAE; Início: 2024; Dissertação (Mestrado profissional em Ciências Farmacêuticas) - Universidade de Sorocaba, Universidade de Sorocaba; (Orientador);

Nicole de Alencastro

DESENVOLVIMENTO DE TECNOLOGIAS AO ENFRENTANDO A POLUIÇÃO POR PLÁSTICOS EM SOROCABA: DESENVOLVIMENTO DE MICRORGANISMOS DEGRADADORES DE POLIETILENO; ; Início: 2024; Dissertação (Mestrado profissional em Processos Tecnológicos e Ambientais) - Universidade de Sorocaba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Murilo Antonio Ramos

PROSPECÇÃO, EXPRESSÃO, PRODUÇÃO, PURIFICAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO DE TPAZYMES; Início: 2023; Dissertação (Mestrado profissional em Processos Tecnológicos e Ambientais) - Universidade de Sorocaba, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; (Orientador);

Nathalia Cantuaria

DESENVOLVIMENTO DE PLATAFORMA BIOTECNOLÓGICA PARA BIORECLICLAGEM DE PLÁSTICO PET NA REGIÃO DE SOROCABA; Início: 2024; Tese (Doutorado em Processos Tecnológicos e Ambientais) - Universidade de Sorocaba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Iara Ciancaglini

DESENVOLVIMENTO DE UMA COLEÇÃO DE ENZIMAS TERMOFÍLICAS EXTREMAS ATIVAS NA CONVERSÃO DE PLÁSTICOS PET; Início: 2022; Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Ellen Karen Barreto Roman

Aperfeiçoamento da linhagem de Pseudomonas putida à DESCONSTRUÇÃO DE PLÁSTICOS e produção de Polihidroxialcanoatos; Início: 2022; Tese (Doutorado em Biologia Molecular e Morfofuncional) - Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Robson Tramontina

Início: 2022; Universidade de Sorocaba, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo;

Isabelle Teixeira Mello

Desenvolvimento de enzimas envolvidas na degradação de polietileno; Início: 2024; Iniciação científica (Graduando em Engenharia de Bioprocessos e Biotecnologia) - Universidade de Sorocaba, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; (Orientador);

Tamires Gomes Jordano

Desenvolvimento de Enzimas Ativas em Plásticos; ; Início: 2024; Iniciação científica (Graduando em Engenharia de Bioprocessos e Biotecnologia) - Universidade de Sorocaba, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; (Orientador);

Matheus Henrique Galvão

Prospecção em bancos de dados públicos, clonagem e produção de hidrofobinas recombinantes em a; oryzae; Início: 2024; Iniciação científica (Graduando em Engenharia de Bioprocessos e Biotecnologia) - Universidade de Sorocaba, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; (Orientador);

Felipe de Almeida Rodrigues

Desenvolvimento de um consórcio microbiano termofílico degradador de polietileno; Início: 2024; Iniciação científica (Graduando em Farmácia) - Universidade de Sorocaba, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; (Orientador);

Ana Barbara Nunes

Prospecção, expressão, produção, purificação e caracterização de tpazymes; ; Início: 2023; Iniciação científica (Graduando em Biomedicina) - Universidade de Sorocaba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Ana Luisa Sandano

DESENVOLVIMENTO E CARACTERIZAÇÃO DE UMA PETASE TERMOFÍLICA; Início: 2022; Iniciação científica (Graduando em Engenharia de Bioprocessos e Biotecnologia) - Universidade de Sorocaba, Fundação Dom Aguirre; (Orientador);

Patrícia Lius Melo Alves

PRODUÇÃO DE ENZIMA DESSATURASE DE ÁCIDO GRAXO OMEGA-3; 2023; Dissertação (Mestrado em Processos Tecnológicos e Ambientais) - Universidade de Sorocaba, Fundação Nacional de Desenvolvimento do Ensino Superior Particular; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Claudinéia Moreira de Almeida

Estudos das vias produtivas, atividades comerciais e aplicações de monolignois e compostos derivados; 2021; Dissertação (Mestrado em Processos Tecnológicos e Ambientais) - Universidade de Sorocaba, ; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Ana Carolina Piva de Oliveira

Avaliação dos mecanismos de degradação da biomassa lignocelulósica pelo fungo basidiomiceto Laetiporus sulphureus; 2020; Dissertação (Mestrado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Agnes Cristina Pimentel

Influência de um domínio acessório nas características bioquímicas e estruturais da celulase CelE2; 2019; Dissertação (Mestrado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Camila Cristina Sanchez

Estudos genômicos da expressão gênica global de Aspergillus niger crescido em bagaço e colmo de cana-de-açúcar; 2016; Dissertação (Mestrado em Ciências Farmacêuticas) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Robson Tramontina

Caracterização de enzimas auxiliares (redox) do cupim Coptotermes gestroi que atuam em conjunto com hidrolases glicolíticas; 2016; Dissertação (Mestrado em Ciências Farmacêuticas) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Fernanda Büchli

Bioprospecção de Enzimas Envolvidas na Decomposição do Bagaço de Cana Através de Abordagens Metagenômicas e Metaproteômicas; ; 2014; Dissertação (Mestrado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Livia Brenelli

Conversão Enzimática do Bagaço de Cana de Açúcar em Ácido Ferúlico e xilo-oligossacarídeos; 2013; Dissertação (Mestrado em Ciências Farmacêuticas) - Universidade Estadual de Campinas, ; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Zaira Bruna Hoffmam

ESTUDOS FUNCIONAIS DE HEMICELULASES MICROBIANAS COM POTENCIAL APLICAÇÃO BIOTECNOLÓGICA EM BIORREFINARIAS DE BIOMASSAS HEMICELULÓSICAS; 2013; Dissertação (Mestrado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Fabio Marcio Squina;

João Paulo Cairo

Identificação e caracterização de genes e enzimas para hidrolases glicolíticas no cupim Coptotermes gestroi visando a aplicação na produção do bioetanol de segunda geração; 2012; Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Fabio Marcio Squina;

Márcia Féldreman Nunes Gonzaga

PRODUÇÃO E APLICAÇÃO DE BIOPLÁSTICOS MICROBIANOS A PARTIR DE CEPA: PSEUDOMONAS PUTIDA; 2023; Tese (Doutorado em Processos Tecnológicos e Ambientais) - Universidade de Sorocaba, ; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Nathalia Vilela

Desenvolvimento de uma levedura capaz de converter material lignocelulósico em ácido ferúlico; ; ; 2022; Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Victoria Ramos Sodre de Castro

Development of E; coli-Rhodococcus CRISPR/Cas9 shuttle vector targeting ferulic acid accumulating Rhodococcus jostii RHA1 mutants; 2022; Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Robson Tramontina

NOVAS ESTRATÉGIAS INTEGRATIVAS ATRAVÉS DE UMA ALDOKETO REDUTASE DO CUPIM COPTOTERMES GESTROI PARA SACARIFICAÇÃO, DETOXIFICAÇÃO E FERMENTAÇÃO DE LIGNOCELULOSE VISANDO A PRODUÇÃO DE BIOETANOL; 2021; Tese (Doutorado em Ciências Farmacêuticas) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Mariane Paludetti Zubieta

Melhoramento de cepas de Aspergillus para produção de proteínas alvo através da manipulação de genes envolvidos no processo de unfolded protein response; 2018; Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Fabio Marcio Squina;

Marcelo Ventura Rubio

Compreensão da N-glicosilação nos processos de enovelamento, secreção e parâmetros funcionais/estruturais de proteínas alvo em Aspergillus nidulans; 2018; Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Fabio Marcio Squina;

Lívia Beatriz Brenelli de Paiva

Aplicação de abordagens químicas e biológicas para valorização da lignina; 2017; Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Thiago Augusto Golçalves

Caracterização de Proteínas Secretadas por Neurospora crassa em Resposta ao Cultivo em Material Lignocelulósico; 2017; Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Eduardo Cruz Moraes

Integrando a descoberta de enzimas e a otimização de vias metabólicas para valorização do bagaço; 2017; Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Fabio Marcio Squina;

João Paulo Lourenço Franco Cairo

Investigação de vias de degradação de biomassa lignocelulósica no cupim Coptotermes gestroi complementares a hidrolases glicolíticas visando aplicação na produção de bioprodutos derivados de biomassa lignocelulósica; 2016; Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Fernanda Mandelli

Estudo da Capacidade Antioxidante de Carotenóides e de Carotenóides e de Proteínas da bactéria Hipertermofílica Thermus filiformes; 2014; Tese (Doutorado em Ciência de Alimentos) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Fabio Marcio Squina;

Júnio Cota Silva

Estudos Funcionais e Estruturais de Hidrolases Bacterianas Visando Aplicações em Bioprocessos; 2013; Tese (Doutorado em Ciência de Alimentos) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Fabio Marcio Squina;

THABATA MARIA ALVAREZ

Desenvolvimento de uma Biblioteca De Enzimas a partir de Metagenoma de Solo; 2013; Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Bruno Augusto Dias

CARACTERIZAÇÃO FUNCIONAL E ESTRUTURAL DE UMA β-GLUCANASE GH12 DE Aspergillus terreus; 2013; Tese (Doutorado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Fabio Marcio Squina;

Robson Tramontina

2022; Universidade de Sorocaba, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Fabio Marcio Squina;

Thiago Augusto Gonçalves

2021; Universidade de Sorocaba, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Fabio Marcio Squina;

Geizecler Tomazetto

2020; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Fabio Marcio Squina;

João Paulo Franco Cairo

2020; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Fabio Marcio Squina;

Marcelo Vizoná Liberato

2019; Universidade de Sorocaba, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Fabio Marcio Squina;

Cristiane Akemi Uchima

2015; Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Fabio Marcio Squina;

Thamy Lívia Ribeiro Corrêa

2014; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Fabio Marcio Squina;

Fernanda Mandelli

2014; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Fabio Marcio Squina;

André Ricardo de Lima Damásio

2013; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Fabio Marcio Squina;

Rosana Goldbeck

2013; Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Fabio Marcio Squina;

Larissa Soares da Silva

Isolamento de microrganismos termofilícos capazes de degradar polietileno; 2024; Iniciação Científica; (Graduando em Engenharia de Bioprocessos e Biotecnologia) - Universidade de Sorocaba, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Fabio Marcio Squina;

VIVIANE YOSHIMI EGAWA

Treinamento Técnico: Intensificação de bioprocessos, ampliação da produção de produtos químicos e processamento da lignocellulose; 2021; Iniciação Científica - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Fabio Marcio Squina;

MARIANA VITORIA MACHADO HAILE

Treinamento Técnico: Produção Biocatalítica de fragrância a partir de ácido ferúlico; 2020; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade de Sorocaba, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Camila Santos Woloche

Treinamento técnico: Conversão de lignina a ácido ferúlico; 2020; Iniciação Científica - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Brenda Oliveira Ramires

Montagem e Anotação de Genomas de microorganismos de interesse biotecnológico; 2013; Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Isabela de Oliveira

Bioprospecção por Estratégias de Metagenômica de Enzimas Envolvidas na Conversão de Biomassa Vegetal; 2012; Iniciação Científica - Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Sincrotron, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Flávio Pessanha

Caracterização Bioquimica e Biofísica de b-glucosidases hipertermofílicas; 2011; Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Thiago Augusto Gonçalves

PRODUÇÃO, PURIFICAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO DE HEMICELULASES SUPEREXPRESSAS EM Aspergillus nidulans; 2011; Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Sincrotron; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Fernanda Büchli

Bioprospecção de Enzimas Biotecnológicas através de Estratégias de Metagenômica; 2011; Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Sincrotron; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Anna Paula Cruz Garcia

Desenvolvimento de um processo integrado de pré-tratamento e hidrólise enzimática do bagaço de cana de açúcar; 2011; Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Sincrotron; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Jose Alberto Diogo

Clonagem, Expressão e Caracterização b-glucosidases hipertermofílicas; 2011; Iniciação Científica - Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Sincrotron, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Fabio Marcio Squina;

FABÍOLA MARIA TESTONI

EXPRESSÃO, PURIFICAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO DEENDO-ARABINANASE DE Thermotoga petrophila; 2010; Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Sincrotron; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Cleiton Pinto Braga

Expressão e Caracterização de Feruloil Esterases de Aspergillus clavatus; 2010; Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Fabio Marcio Squina;

THABATA MARIA ALVAREZ

Library generation for biomass-conversion enzymes from soil metagenome; 2010; Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Sincrotron; Orientador: Fabio Marcio Squina;

Produções bibliográficas

VILELA, NATHÁLIA ; GORKOVSKIY, ANTON ; HERRERA-MALAVER, BEATRIZ ; Tramontina, Robson ; FRANCO CAIRO, JOÃO PAULO L. ; MANDELLI, FERNANDA ; GONÇALVES, THIAGO ; SODRÉ, VICTORIA ; STEENSELS, JAN ; DAMÁSIO, ANDRÉ ; VERSTREPEN, KEVIN J. ; Squina, Fabio Marcio . From Residues to Clove: Harnessing Novel Phenolic Acid Decarboxylase for 4-Vinyl Guaiacol Production in Industrial Yeast. FOOD AND BIOPRODUCTS PROCESSING , v. x, p. x, 2025.
ANDRADE, VIVIANE BRITO ; Tramontina, Robson ; ALMEIDA, DNANE VIEIRA ; TOMAZETTO, GEIZECLER ; DA SILVA, VIVIAM M. ; GABEL, FRANK ; MARCELLO, YOLANDA M.B. ; SCOTT, ANA LIGIA ; Squina, Fabio Marcio ; GARCIA, WANIUS . Dissection of an Anaerobic Fungal Cellulosomal Endoglucanase: Impact of the Dockerin Module on Activity, Thermostability, and Flexibility. ACS Omega , v. x, p. x, 2025.
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ALMEIDA, DNANE VIEIRA ; CIANCAGLINI, IARA ; SANDANO, ANA LUIZA HERNANDES ; ROMAN, ELLEN K.B. ; ANDRADE, VIVIANE BRITO ; NUNES, ANA BÁRBARA ; Tramontina, Robson ; DA SILVA, VIVIAM MOURA ; GABEL, FRANK ; CORRÊA, THAMY L.R. ; DAMASIO, ANDRÉ ; MUNIZ, JOÃO RENATO CARVALHO ; Squina, Fabio Marcio ; GARCIA, WANIUS . Unveiling the crystal structure of thermostable dienelactone hydrolase exhibiting activity on terephthalate esters. ENZYME AND MICROBIAL TECHNOLOGY , v. 180, p. 110498, 2024.
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Squina, FM . From Renewable feedstock to value-added products based on discovery-based omics of natural lignocellulolytic systems. Joint FAPESP - BBSRC Collaborative Project Meeting.. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
Squina, FM . From Renewable feedstock to value-added products based on discovery-based omics of natural lignocellulolytic systems. Workshop Frontiers of Science - FAPESP and Max Planc.. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
Squina, FM . Expanding the Knowledge of Auxiliary Mechanisms Based on Omics Approaches. III Escola de Biofísica Molecular, IBILCE - UNESP. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
Squina, FM . Ampliando o conhecimento de atividades enzimáticas lignoceluloliticas através de estratégias omicas. 2o Encontro Nacionals de Química Biotecnológica e Agroindustrial, promovido pela FFCLRP-USP.. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
Squina, FM . Desenvolvimento de enzimas envolvidas na conversão de Biomassa Lignocelulósica. II Workbiotec - Workshop da pós graduação em Biotecnologia, IB - UNESP (Botucatu). 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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Squina, Fabio Marcio . Desenvolvimento de Abordagens 'Omicas' para a Descoberta de Biocatalisadores para Conversão da Biomassa Vegetal. ENZITEC.. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
Squina, FM . From Biomass-to-Bioproduct Application using Discovery-based Omics approaches. XXII Congreso Latinoamericano de Microbiología. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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Squina, FM . From biomass-to-bioproduct application using discovery-based omics approaches. CNPEM-UK Meeting on Biocatalyst Discovery and Synthetic Biology. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
Squina, Fabio Marcio . Development of omics-based approaches for biocatalyst discovery in lignocellulose-to-bioproduct applications. USP Conference on Synthetic Biology for Biomass and Biofuels Production. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
Squina, Fabio Marcio . Omics approaches to biocatalysts discovery in biomass-‐to-‐bioproducts applicaons. Manchester - Brazil Industrial Biotechnology and Bioenergy Meeting. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
Squina, Fabio Marcio . Metaproteogenomics Strategies for Enzyme Discovery in Biomass-to-Bioproducts aplications. XLII Reunião da Soc. Brasileira de Bioquímica. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
Squina, Fabio Marcio . Chemicals and fuels from raw materials: disclosure by biotechnology. NWO-FAPESP-CNPq Joint Workshop. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
Squina, Fabio Marcio . Library generation for biomass-conversion enzymes from soil metagenome. Workshop FAPESP/BIOEN de Pesquisa. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
Squina, Fabio Marcio . Aplicação de Ferramentas 'Omicas' para prospecção de enzimas biotechnologicas e sua caracterização molecular. 9 SLACA - Simpósio Latino Americano de Ciência de Alimentos. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
Squina, Fabio Marcio . Expressão Heteróloga de Celulases em Fungo Filamentoso. 26 Congresso Brasileiro de Microbiologia. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
Squina, Fabio Marcio . The Lignocellulolytic Metagenome of Sugarcane Bagasse- Degrading Soil. 1st Brazilian Bioenergy Science and Technology Conference (BBEST). 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
SQUINA F. M. . Desenvolvimento de enzimas Envolvidas na produção de biocombustíveis. II 4BIOTEC. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
Squina, Fabio Marcio . Evaluating filamentous fungi as biological system to produce recombinant enzymes and to assess modulation of gene expression in response to extracellular environment Workshop on Second Generation Bioethanol CTBE - CNPEM. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
SQUINA, F.M. . Library generation for Biomass-Coversion enzymes from soil metagenome - UK - Brazil Frontier of Science Symposium. 2010. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).
Squina, Fabio Marcio . Abordagens Metagenômicas para busca de enzimas de interesse biotecnológico. Workshop do Programa de Pós-Graduação em Genética da FMRP - USP. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
SQUINA F. M. ; PRADE, R. A. . Gene library generation for biomass-conversion enzymes - Xth International Fungal Biology Conference. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
SQUINA F. M. . Novos Rumos e Aplicaçações da Biologia Molecular. Congresso Aberto de Estudantes de Biologia IB - UNICAMP. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
SQUINA F. M. ; LEAL, J. ; GRAS, D. E. ; FREITAS, J. S. ; SILVA, E. M. ; MARTINEZ-ROSSI, N. M. ; ROSSI, A. . New features over the expression of Neurospora crassa genes in response to extracellular phosphate levels and pH. Neurospora 2008 - Asilomar Conference. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
SQUINA F. M. ; AUGUSTO, M. J. ; RUIZ, J. C. ; CRUZ, A. K. ; TOSI, L. R. O. . The systematic production of reagents for genome integration by shuttle mutagenesis: disruption of genes at Leishmania telomeric ends. TriTryp Genomes Meeting. 2004. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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Outras produções

Squina, FM . Comitê Científico de Avaliação de Docentes do Department of Chemistry at the University of Manchester. 2019.

Squina, FM . Comitê Científico em processo do contratação de Docentes na Brussels Bioengineering School of the Université Libre de Bruxelles. 2017.

Squina, FM . Membro do Comitê de Análise de Propostas apresentadas no Programa PIPE. 2016.

Squina, FM . Membro Comitê Científico do do XII ENZITEC. 2016.

SQUINA, FM . Membro do Comitê da avaliação de pôsteres da XLlII Reunião anual da SBBq. 2014.

Squina, F. . Membro do Comitê Local da 2nd Brazilian BioEnergy Science and Technology Conference. 2014.

Squina, Fabio Marcio . Membro do Comitê da avaliação de pôsteres da XLlI Reunião anual da SBBq. 2013.

Squina, Fabio Marcio . Membro do Comitê de Análise de Propostas apresentadas no Programa PIPE. 2013.

Squina, FM . Nova tecnologia obtém produtos químicos finos de resíduos agrícolas. 2020. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

Squina, FM . Tecnologia transforma resíduo agrícola em produto químico de alto valor. 2020. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

Squina, FM . Nova tecnologia transforma resíduos agrícolas em produtos químicos finos. 2020. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

Squina, FM . Projetos internacionais exploram biomassas para produção de biocombustíveis avançados. 2019. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

Squina, FM . FAPESP e BBSRC aplicam R$ 19 milhões em pesquisas sobre biocombustíveis avançados. 2016. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

Squina, FM . SP Pesquisa - Etanol. 2015. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

Squina, FM . Avanços no estudo sobre conversão de biomassa em etanol celulósico. 2013. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

SQUINA F. M. ; SOUSA, J. F. ; RULER, R. ; VALENTE, V. ; PATUSSI, E. V. ; GRAMINHA, M. A. S. ; NASCIMENTO, A. A. C. ; ESPREAFICO, E. M. ; LARSON, M. L. P. ; MONESI, N. ; MARTINEZ-ROSSI, N. M. ; RODRIGUES, V. . Apostila de Tecnologia do DNA Recombinate. 2006. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Revisão e atualização da Apostila de Tecnologia do DNA Recombinate).

SQUINA F. M. ; SOUSA, J. F. ; MODENA, J. L. P. ; TOLEDO, J. S. ; GODOY, L. M. F. ; RULER, R. ; IZIDORO, T. C. ; VALENTE, V. ; CRUZ, A. K. . Princípios e Aplicações das Principais Metodologias em Biologia Celular e Molecular. 2004. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Apostila Didática).

Projetos de pesquisa

2024 - Atual

CNPq UNIVERSAL 4: DESENVOLVIMENTO DE SISTEMAS BIOCATALÍTICOS APLICADOS A DESPOLIMERIZAÇÃO DE PLÁSTICOS DERIVADOS DE PETRÓLEO, Descrição: Materiais plásticos sintéticos derivados de petróleo (PSP), apresentam propriedades excepcionais, incluindo durabilidade, resistência e versatilidade. PSP são compostos inertes e geralmente presentes em produtos de ciclo de vida curto, que após descartados, persistem no ambiente por centenas de anos. Como isso, a humanidade está enfrentando desafios socioeconômicos e ambientais muito sérios, devido ao acúmulo de PSP em ambientes terrestres e marinhos. A estimativa é que caso a produção e gestão desses resíduos seguirem as tendências atuais, teremosdepositados cerca de 12 bilhões de toneladas métricas de plásticos em aterros e no ambiente natural até 2050. Os PSP são destinados à reciclagem química ou física, no entanto, esses processos são insuficientes para conter osproblemas relacionados à poluição. Isto porque, esses processos geram resíduos e resultam em materiais de menorvalor, que (em algum momento) também serão descartados e, desta forma, apenas postergando o problema. Desta forma, existe um círculo de difícil solução relacionado ao intenso uso de PSP no nosso planeta. Estudos recentes demonstraram que processos biotecnológicos são potenciais alternativas ao manejo sustentável de resíduos plásticos. Assim, a pesquisa relacionada à biodegradação de plásticos no enfrentamento ao acúmulo de PSP no planeta oferece uma alternativa sustentável e promissora, aplicando conceitos de bioeconomia e, com isso, promover benefícios econômicos e sociais.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissional: (1) . , Integrantes: Fabio Marcio Squina - Coordenador / André Damasio - Integrante / Robson Tramontina - Integrante / Jean Jacques Bonvent - Integrante / José Martins de Oliveira Junior - Integrante / João Renato Carvalho Muniz - Integrante / Wanius José Garcia da Silva - Integrante.
2023 - Atual

FAPESP - Auxílio à Pesquisa Temático 3: BEYOND: estabelecendo uma fábrica celular fúngica para produção de proteínas recombinantes, Descrição: Os fungos filamentosos são capazes de produzir e secretar uma variedade de enzimas. Fungos do gênero Aspergilus sp. e Trichoderma sp. são as principais células utilizadas para a produção industrial de enzimas. Aspergillus oryzae é reconhecido como GRAS (generally regarded as a safe organism) e tem a capacidade de secretar um alto título de proteínas. Portanto, A. oryzae tem sido usado como uma fábrica microbiana de baixo custo para a produção de proteínas recombinantes e tem potencial para ser engenheirada com o objetivo de otimizar a via e secreção de proteínas. O objetivo geral é estabelecer o fungo filamentoso A. oryzae como uma fábrica microbiana robusta e economicamente viável para a produção de proteínas recombinantes para diferentes aplicações. Para isso, queremos aproveitar o conceito de biologia sintética (aprender, projetar, construir e testar) combinando biologia de sistemas, engenharia genética de fungos, seleção de proteínas recombinantes com aplicações biotecnológicas, bioprocessos e análise técnico-econômica. Para isso, este projeto está dividido em cinco objetivos: (Objetivo 1) Indução da via secretora de A. oryzae utilizando resíduos agroindustriais; (Objetivo 2) Remoção de proteínas secretadas pelo hospedeiro por deleção multiplex de genes alvo; (Objetivo 3) Produção de proteínas recombinantes com aplicações biotecnológicas; (Objetivo 4) Avaliação da produtividade e função de proteínas recombinantes; e (Objetivo 5) Fermentação de cepas fúngicas e análise técnico-econômica. Propomos trabalhar com três grupos de proteínas: (1) monooxigenases líticas de polissacarídeos (LPMOs); (2) Enzimas ativas em plásticos (PAZymes); e (3) proteínas alternativas aplicadas à produção de carnes vegetais e cultivadas. Assumindo que o trabalho integrado de nossa equipe resultará em uma cepa de A. oryzae engenheirada e robusta produzindo altos títulos de diferentes proteínas recombinantes usando um resíduo agroindustrial como indutor, experimentos de transcriptoma, proteoma e metaboloma serão realizados para entender como as cepas recombinantes se adaptam à alta demanda pela via secretora. Esses dados serão usados para construir um genome-scale metabolic model (GEM) para A. oryzae, o que permitirá planejar novas mutações para melhoramento genético da cepa.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Fabio Marcio Squina - Integrante / Rosana Goldbeck Coelho - Integrante / Marcelo Ventura Rubio - Integrante / Sarita Candida Rabelo - Integrante / Uffe Hasbro Mortensen - Integrante / André Ricardo de Lima Damasio - Coordenador.
2023 - Atual

FAPESP - Auxílio Regular 2: Desenvolvimento de microrganismos e enzimas termofílicas envolvidas na degradação e reaproveitamento de plásticos fósseis, Descrição: Materiais plásticos derivados de fósseis (PDF), apresentam propriedades excepcionais, incluindo durabilidade, resistência e versatilidade, e estão presentes em praticamente todas as atividades da vida cotidiana. Os PDF são compostos inertes e geralmente são utilizados à produção de mercadorias com ciclo de vida curto. Com isso, como resultado da intensa utilização de PDF em nossa sociedade, a humanidade está enfrentando desafios socioeconômicos e ambientais muito sérios, devido ao descarte e acúmulo de PDF em ambientes terrestres e marinhos. A estimativa é que caso a produção e gestão desses resíduos seguirem as tendências atuais, teremos depositados cerca de 12 bilhões de toneladas métricas de resíduos plásticos em aterros e no ambiente natural até 2050. Processos de reciclagem mecânica e química são importantes, mas são insuficientes para conter os problemas relacionados à poluição por PDF. Isto porque a porcentagem de PDF que é reciclado após o descarte é relativamente baixa, bem como esses processos são dispendiosos e limitados a materiais plásticos com pouca contaminação. Além disso, esses processos geram resíduos e resultam em materiais plásticos com qualidade inferior que (em algum momento) também serão descartados e, desta forma, apenas postergando o problema. Estudos recentes demonstraram que processos biotecnológicos consistem em uma rota factível para o manejo economicamente sustentável de resíduos plásticos. Assim, a pesquisa relacionada à biodegradação de plásticos trás esperança no enfrentamento dos desafios relacionado ao uso intenso de PDF pela humanidade, oferecendo uma alternativa sustentável e promissora, que pode operar à luz de conceitos de bioeconomia e, com isso, promover benefícios econômicos e sociais à sociedade. Porém, ainda existem lacunas científicas para tornar a bioreutilização de PDF uma realidade, não apenas no sentido de descobrir e desenvolver enzimas com propriedades catalíticas superiores, como também relacionado a caracterização de vias bioquímicas catabólicas e o isolamento de microrganismos capazes de promover a bioconversão de PDF. Neste sentido, o presente projeto visa preencher lacunas ao desenvolvimento de processo biotecnológicos visando a bioreutilização de PDF, almejando gerar resultados científicos em três linhas de trabalho: Desenvolvimento de um consórcio microbiano termofílico degradador de polietileno; Isolamento de microrganismos termofilícos capazes de degradar polietileno e; Clonagem, expressão e caracterização de proteínas com atividades enzimáticas termofílicas relacionadas a degradação PDF. A área de bioreutilização de PDF está progredindo rapidamente e novas tecnologias visando solucionar a poluição causada pelos PDF constituem em oportunidades econômicas. Assim, essa proposta de pesquisa tem o potencial de subsidiar não apenas impactos científicos relevantes à área, mas também subsidiar o desenvolvimento de tecnologias de bioconversão com apelo comercial. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Fabio Marcio Squina - Coordenador / José Martins de Oliveira Junior - Integrante / João Renato Carvalho Muniz - Integrante / Wanius José Garcia da Silva - Integrante / André Ricardo de Lima Damasio - Integrante.
2021 - Atual

CNPQ Produtividade 4: Desenvolvimento e Aplicação Biotecnológica de Enzimas Oxidativas do Cupim Coptotermes gestroi, Descrição: O desenvolvimento de tecnologias no contexto de biorefinarias de material lignocelulo#769;sico e#769; a chave para sustentar a transic#807;a#771;o de uma economia baseada em combusti#769;veis fo#769;sseis para uma bioeconomia sustenta#769;vel. Esta mudanc#807;a e#769; importante na#771;o apenas pelos aspectos ambientais relacionados a#768;s mudanc#807;as clima#769;ticas, mas tambe#769;m porque essa ac#807;a#771;o pode estimular a produc#807;a#771;o de empregos e o crescimento econo#770;mico do Brasil. Nesse contexto, os insetos degradadores da madeira, como os cupins, podem ser considerados sistemas biolo#769;gicos modelos para o estudo da conversa#771;o de biomassa vegetal em bioprodutos, bem como, a aplicac#807;a#771;o deste conhecimento apresenta grande potencial para o desenvolvimento de estrate#769;gias no contexto de uma biorefinaria de material lignocelulo#769;sico. Com base na literatura recente, juntamente com estudos do nosso grupo, sabemos que o que se conhece sobre a diversidade das hidrolases glicosi#769;dicas endo#769;genas de cupins e de seus simbiontes, na#771;o e#769; suficiente para explicar a grande capacidade deste inseto na degradac#807;a#771;o da lignoceluloses recalcitrantes. Neste sentido, a literatura, corroborado com resultados do grupo, sugerem que enzimas oxidativas auxiliam na degradac#807;a#771;o do material lignocelulo#769;sico pelo inseto. Neste sentido, um dos objetivos desta proposta de pesquisa e#769; conduzir estudos estruturais comparativos com enzimas do cupim inferior Coptotermes gestroi, entre elas de genes que codificam protei#769;nas, descritas como hipote#769;ticas, as quais conte#769;m um domi#769;nio de ligac#807;a#771;o a quitina (Pfam 03067), recentemente re-classificado como domi#769;nio mono-oxigenase li#769;tica de polissacari#769;deos da fami#769;lia 10 ou LPMO_10. Ale#769;m disso, nosso grupo de pesquisa tambe#769;m esta#769; dedicado no desenvolvimento e intensificac#807;a#771;o de processos no contexto de uma biorrefinaria visando a produc#807;a#771;o de qui#769;micos de alto valor, biocombusti#769;veis e xilooligossarideos. Neste sentido, as enzimas de C. gestroi e outros microrganismos sera#771;o utilizadas para o desenvolvimento de sistemas enzima#769;ticos e microrganismos engenheirados para produc#807;a#771;o de qui#769;micos a partir de material lignocelulo#769;sico.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Fabio Marcio Squina - Coordenador.
2020 - Atual

FAPESP - Programa Equipamentos Multiusuários: Sistema cromatográfico e detectores para análise de açúcares e monolignois de lignocelulose, Descrição: A produção sustentável de químicos finos e biocombustíveis a partir de biomassa lignocelulósica apresenta-se como alternativa à mitigar a emissão de gases de efeito estufa e a dependência de de reservas geológicas de petróleo. Além disso, a transição de uma economia baseada em combustíveis fósseis para uma bioeconomia renovável deve promover a criação de empregos e crescimento econômico. Tecnologias para valorização biotecnológica da lignocelulose são um grande desafio, pois precisam ser competitivos com os processos atuais das refinarias petroquímicas. Neste contexto, um laboratório com infraestrutura aberta para multiusuários, operando para realizar análises de sacarídeos (nativos e oxidados) e derivados de ácidos hidroxibenzóico e hidroxicinâmicos, acelerará o avanço científico de grupos de pesquisa que atuam na área de conversão de lignocelulose em especialidades químicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Fabio Marcio Squina - Coordenador / DAMASIO, ANDRÉ - Integrante.
2019 - 2022

CNPq Universal 3: Estudos bioquímicos e estruturais comparativos com enzimas oxidativas do cupim Coptotermes gestroi visando novas aplicações em biorrefinarias de material lignocelulósico, Descrição: Cupins são insetos sociais que vivem em colônias dividindo o trabalho entre castas. De modo geral, esses insetos são detritívoros e a sua dieta é baseada principalmente em compostos lignocelulósicos. A degradação da celulose e hemiceluloses pela casta operária pode atingir cerca de 75-90% de eficiência, sendo a lignina parcialmente degradada ou modificada. A digestão da lignocelulose ocorre no trato digestivo, através da secreção de enzimas ativas em carboidratos (CAZymes), entre elas, as hidrolases glicosídicas, tais como celulases e hemicelulases. Essas enzimas são secretadas pelo próprio cupim no intestino anterior e médio, e no intestino posterior pelos simbiontes, tais como protozoários e bactérias. Com base na literatura recente, juntamente com estudos do nosso grupo, o que se conhece sobre a diversidade das hidrolases glicosídicas endógenas de cupins e de seus simbiontes, não é suficiente para explicar a competência na degradação da lignoceluloses recalcitrantes deste inseto. A literatura, corroborado com resultados do grupo, sugerem que mecanismos oxidativos devem estar envolvidos, complementando as enzimas hidrolíticas para a degradação do material lignocelulósico. Neste sentido, estudos genômicos não publicados do nosso grupo, revelaram a presença no genoma do cupim inferior Coptotermes gestroi de genes que codificam proteínas, descritas como hipotéticas, as quais contém um domínio de ligação a quitina (Pfam 03067), recentemente re-classificado como domínio ?mono-oxigenase lítica de polissacarídeos da família 10? ou LPMO_10. Esse domínio protéico codifica metalo-enzimas oxidativas chamadas de mono-oxigenases lítica de polissacarídeos (LPMOs), que clivam celulose/hemicelulose por oxidação ao invés de hidrólise. Esta classe de enzima tornou-se recentemente o principal foco das pesquisas acadêmicas e da indústria de enzimas lignocelulolíticas, devido a sua importância biotecnológica, e até o momento caracterizações funcionais foram realizadas somente com enzimas de origem bacteriana. De acordo com o banco de dados do Pfam, o domínio LMPO_10 está presente em mais de 200 sequências ortólogas distribuídas por 44 organismos no reino Metazoa principalmente de organismos do filo Arthropoda e da classe Insecta. Em sua grande maioria, essas proteínas são descritas como hipotéticas ou sem função devido a ausência de caracterizações funcionais e estruturais. Deste modo, esta proposta tem como objetivo investigar o domínio LPMO_10 em cupins e no reino Metazoa e em especial no filo Arthropoda, enfatizando o papel que essas enzimas exercem na fisiologia digestiva de C. gestroi. Para isso, os genes de C. gestroi CGAA10-1 e CGAA10-2, e mais 6 genes ortólogos no reino Metazoa serão submetidos a otimização de códons e sintetização in-vitro para expressão heteróloga em E. coli. As proteínas purificadas serão submetidas a uma caracterização funcional visando correlacionar a sua atividade enzimática com a evolução da especificidade por substratos dessas LMPOs. Além disso, estudos estruturais comparativos serão realizados entre CgAA10-1 ou CgAA10-2 com as AA10 de microrganismos disponíveis no banco do PDB. Assim, espera-se com este estudo contribuir para apresentar um um novo grupo de LPMOs de origem Metazoa, enzimas essas com potencial aplicação biotecnológica, incluindo a suplementação de coquetéis celulolíticos comerciais, uma vez que as LPMOs são descritas por aumentar sacarificação de material lignocelulósico em cerca de 40%.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Fabio Marcio Squina - Coordenador / OLIVEIRA NETO, MARIO - Integrante / GARCIA, WANIUS - Integrante / CAIRO, JOÃO - Integrante / DAMASIO, ANDRÉ - Integrante.
2018 - 2021

CNPQ Produtividade 3: Desenvolvimento de microrganismo para conversão de biomassa lignocelulósica em ácido ferúlico, Descrição: As tecnologias alternativas para geração de energia e compostos químicos, em substituição aos combustíveis fósseis (fontes esgotáveis), são promissoras para o desenvolvimento econômico e mitigação de impactos ambientais relacionados ao aquecimento global. Neste sentido, a utilização da biomassa lignocelulósica apresenta-se em vantagem, este material é constituído de celulose e hemicelulose que podem ser utilizadas para a fermentação de microrganismos e produção de etanol, além da lignina, que pode ser convertida em compostos químicos de alto valor agregado. Este trabalho visa o melhoramento genético de microrganismos lignolíticos visando o desenvolvimento de um processo de conversão de material lignocelulósico em ácido ferúlico. Este composto é precursor de compostos químicos utilizados na indústria, como por exemplo o L-DOPA (L-3,4-dihydroxyphenylalanine) e o álcool coniferílico. O trabalho de pesquisa contempla o estudos "omicos" de sistema enzimáticos e as vias de conversão de lignina de microrganismos, que servirão de base para silenciamento e superexpressão de genes utilizando o sistema CRISPR/Cas9.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Fabio Marcio Squina - Coordenador.
2017 - 2023

FAPESP - Auxílio à Pesquisa Temático 2: Lignin valorization in cellulosic ethanol plants: biocatalytic conversion via ferulic acid to high value chemicals, Descrição: Lignin can be obtained as a by-product of cellulosic ethanol production, and is a potential source of renewable chemicals. Efficient valorisation of lignin is a major unsolved problem in the development of sustainable biorefineries. The proposal brings together expertise in cellulosic ethanol production and in biocatalyst discovery, with expertise in biocatalytic lignin valorisation and biocatalysis for high value chemicals production. The overall aim is to generate new methods for lignin valorisation via intermediate ferulic acid, which has been generated from lignin via bacterial fermentation in previous work. The project will involve the following work packages: 1) Integration between lignin valorization and cellulosic bioethanol production; 2) conversion of lignin to ferulic acid from lignin using synthetic biology; 3) enzymatic conversion of ferulic acid into pharmaceutical L-Dopa; 4) biocatalytic generation of high value fragrance chemicals (coniferyl acetate, isoeugenol) from ferulic acid (supported by cosmetics manufacturer Natura Brasil); 5) bioprocess intensification and scale-up of chemicals production from renewable feedstocks; 6) technical and sustainability impact assessment. Technology developed in the project could be applied to major plant feedstocks used in Brazil (sugarcane) or the UK (wheat).. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Fabio Marcio Squina - Coordenador / Jose G. C. Pradella - Integrante / Carlo Driemeier - Integrante / George Jackson de Moraes Rocha - Integrante / GOLDBECK, ROSANA - Integrante / GARCIA, WANIUS - Integrante / Antonio Bonomi - Integrante / Nicholas Turner - Integrante / Neil Dixon - Integrante / Gary Lye - Integrante / Timothy Bugg - Integrante / DAMASIO, ANDRÉ - Integrante / Anita Jocelyne Marsaioli - Integrante.
2015 - 2019

FAPESP - Auxílio à Pesquisa Temático 1: Recalcitrância da biomassa de cana-de-açúcar: Fundamentos relacionados à formação da parede celular, ao pré-tratamento e à digestão enzimática, aplicados no desenvolvimento de novos modelos de biorrefinarias, Descrição: O presente projeto tem como objetivo gerar conhecimento integrado sobre as origens da recalcitrância da biomassa de cana-de-açúcar. Em função deste conhecimento pretende-se desenhar processos inovadores de conversão de biomassa dentro do conceito contemporâneo das biorrefinarias. A deposição de paredes celulares secundárias será avaliada em função do estágio de maturação das plantas com teores contrastantes de componentes. Serão avaliados o processo de lignificação e a de deposição de hemicelulose. A lignificação será ainda avaliada pelo nível de expressão de genes codificadores de enzimas envolvidas na biossíntese de monolignóis. A digestibilidade direta das amostras geradas será avaliada e avaliação dos dados gerados permitirá direcionar as etapas subsequentes de desenho de bioprocessos destinados à conversão da biomassa da cana em produtos de interesse tecnológico dentro do contexto contemporâneo das biorrefinarias. Está previsto que processos amenos de pré-tratamento baseados na ação deslignificante do sulfito alcalino ou na ação seletiva de ácidos diluídos sobre a hemicelulose possam gerar substratos aptos à bioconversão por xilanases para a preparação de oligossacarídeos e posteriormente por celulases para a produção de hidrolisados fermentescíveis. Estudos de secretômica de fungos degradadores de madeira permitirão buscar novas enzimas hidrolíticas para o tratamento dos substratos gerados. A avaliação econômica e ambiental de processos desenhados com as bases científicas geradas no projeto permitirá ainda verificar os benefícios obtidos com o emprego de plantas selecionadas por apresentar baixa recalcitrância e como a eficiência de cada pré-tratamento pode ser maximizada a partir do emprego destas plantas (AU). , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Fabio Marcio Squina - Integrante / MILAGRES, ADRIANE M. F. - Integrante / FERRAZ, ANDRÉ - Coordenador / Elisson Antonio da Costa Romanel - Integrante / Sergio Almeida Pacca - Integrante / Júlio César dos Santos - Integrante.
2015 - 2018

CNPq Universal 2: Desenvolvimento de um modelo enzimático para desconstrução da parede celular de bagaço de cana de açúcar, Descrição: Este estudo propõe desenvolver um modelo enzimático de desconstrução da parede celular de cana de açúcar em altas temperaturas, visa um melhor entendimento da atuação das enzimas na degradação da biomassa, mapeando sua acessibilidade e definindo quais as enzimas essências e secundárias para esta bioconversão. Este modelo enzimático de desconstrução da parede celular de cana de açúcar pretende responder quais as enzimas necessárias para a degradação da biomassa e servirá não apenas para a biomassa da cana de açúcar, mas também servirá como ponto de partida para estudos de demais substratos lignocelulósicos. Atualmente, frente à grande quantidade de biomassa lignocelulósica disponível para conversão em bioetanol, destaca-se o bagaço de cana, que é um resíduo gerado a partir da produção de etanol de 1ª geração. Para ampliarmos a produção de etanol utilizando esta biomassa, faz-se necessário estabelecer protocolos que agrupem dois pontos de vista importantes: (1) uma mistura enzimática eficiente para degradação de biomassa, sendo os produtos de hidrólise muito bem estudados; e (2) a combinação de hidrólise multi-enzimática e pré-tratamento desta biomassa. Neste contexto, o desenvolvimento de misturas enzimáticas para desestruturação da biomassa de cana de açúcar ganha crescente destaque, bem como, o conhecimento de quais são as enzimas principais e secundárias que atuam sobre a parede celular e suas respectivas proporções tornam-se essenciais. Reduzir os níveis de enzimas não-essenciais e aumentar a proporções relativas das enzimas prioritárias são, portanto, uma potencial estratégia para aumentar as atividades específicas e, assim, diminuir o custo da bioconversão da biomassa vegetal. Pois o que ainda torna o bioetanol de 2ª geração um produto não viável economicamente, é o custo gerado pela aquisição das enzimas necessárias para a degradação da biomassa lignocelulósica. Neste sentido, fazendo o uso de uma coleção de enzimas envolvidas na biodegradação da biomassa, expressas em sistema heterólogo de expressão, pretendemos desenvolver um modelo enzimático para desconstrução da parede celular de cana de açúcar em altas temperaturas, definindo quais as enzimas essências e secundárias para esta bioconversão. Também pretendemos realizar estudos do perfil glicômico das frações da parede celular da biomassa submetida a ação enzimática, para melhor compreender a ação dessas enzimas na degradação da parece celular vegetal. Em face disto, acreditamos que este estudo apresenta um grande potencial para agregar conhecimento no campo do aproveitamento de recursos renováveis, bem como, quanto à geração de inovação tecnológica e de patentes nesta área do conhecimento. Uma vez que, atingindo os objetivos proposto neste projeto, o CTBE oferece possibilidades para ampliação de escala, com o uso de fermentadores e planta piloto.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Fabio Marcio Squina - Coordenador / Rolf A. Prade - Integrante / Thiago A Gonçalves - Integrante / Douglas A A Paixão - Integrante / GOLDBECK, ROSANA - Integrante.
2015 - 2018

CNPq Produtividade 2: Desenvolvimento de um modelo enzimático para desconstrução da parede celular de bagaço de cana de açúcar, Descrição: A biodegradação dos materiais lignocelulósicos tem sido objeto de muitos estudos, pois, além de corresponder a uma etapa fundamental do ciclo do carbono na natureza, apresenta um enorme potencial biotecnológico em diversas áreas, como a produção de biocombustíveis. A conversão de biomassa lignocelulósica em combustíveis renováveis, como o bioetanol, tem sido considerada uma tecnologia promissora para a substituição dos combustíveis fósseis e ampliação da produção de etanol mundial. Um passo essencial na conversão da biomassa lignocelulósica em etanol ou em outros produtos de biorefinaria é a despolimerização de polissacarídeos por via enzimática. No entanto, o alto custo das enzimas necessárias para degradação da parede celular vegetal dificulta a produção do etanol lignocelulósico de forma economicamente viável. Uma abordagem para reduzir o custo das enzimas está no melhoramento de suas atividades específicas, ou seja, aumentar a quantidade de açúcar fermentecível liberada por unidade de proteína. Atualmente, um importante foco de pesquisas é voltado na otimização das enzimas empregadas na biodegradação do material lignocelulósico. Neste contexto, o desenvolvimento de misturas enzimáticas para desestruturação da biomassa de cana de açúcar ganha crescente destaque, bem como, o conhecimento de quais são as enzimas principais e secundárias que atuam sobre a parede celular, além de suas respectivas proporções, tornam-se essenciais. Hoje em dia contamos com muita informação na literatura a respeito de celulases e xilanases, no entanto, pouco se sabe sobre o envolvimento das demais enzimas assessórias necessárias na degradação da biomassa lignocelulósica, bem como a interação das enzimas ligno-hemicelulolíticas com o substrato. Uma potencial estratégia para diminuir o custo da bioconversão da biomassa vegetal é a redução dos níveis de enzimas não-essenciais e o aumento das proporções relativa as enzimas prioritárias. Em face disto, fazendo o uso de uma coleção de enzimas pertencentes ao Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioteanol (CTBE), pretendemos desenvolver um modelo enzimático para desconstrução da parede celular de cana de açúcar (bagaço pré-tratado hidrotermicamente e colmo de cana de açúcar), visando um melhor entendimento da atuação das enzimas na degradação da biomassa, mapeando sua acessibilidade e definindo quais as enzimas essências e secundárias para esta bioconversão. Este modelo enzimático, bem como a nossa estratégia de desconstrução da parede celular de cana de açúcar, deverá não apenas ser útil para um tipo de biomassa, mas também será ponto de partida para estudos de demais substratos lignocelulósicos, como eucalipto, sorgo, gramíneas, etc. Outro foco, que também agrega inovação a este projeto, está voltado para a análise do perfil glicômico das frações geradas na degradação da parede celular de cana de açúcar. Os estudos de glicômica deverão ampliar entendimento do modo de atuação das enzimas envolvidas, e identificar atividades enzimáticas ausentes necessárias para a completa hidrólise do material lignocelulósico.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Fabio Marcio Squina - Coordenador.
2014 - 2016

FAPESP - Auxílio Regular 1: Integrated enzyme discovery and pathway optimisation for bagase valorisation, Descrição: Esta proposta de auxílio FAPPA permitirá o estabelecimento de esforços em colaboração entre pesquisadores do Estado de São Paulo (Centro Nacional de Pesquisa e Energia e Materiais e Instituto de Física de São Carlos da USP) e do Reino Unido (Universidade de Manchester e Warwick) para o desenvolvimento de um projeto de pesquisa na área de biotecnologia aplicada. Nesta proposta de pesquisa pretende-se combinar abordagens metagenômicas para descoberta de biocatalizadores, com princípios de biologia sintética, visando a valoração de materiais agrícolas de baixo custo, como a lignina de bagaço de cana-de- açúcar. Os objetivos desta proposta de pesquisa incluem: i) desenvolver abordagens metagenômicas para descoberta enzimas envolvidas na bioconversão de lignina, ii) avaliar a capacidade de peroxidases bacterianas para o tratamento de lignina de bagaço de cana, iii) integrar vias metabólicas de conversão da lignina em um hospedeiro chassi apropriado utilizando princípios de biologia sintética, iv) avaliar este sistema enzimático em regimes de fermentação em alta densidade, junto com estudos compreensivos de bioprocessos e a otimização do fluxo metabólico. Neste sentido, como resultado das atividades propostas neste projeto FAPPA, pretende-se apresentar uma prova de conceito de bioconversão e valorização da lignina. Além disso, este projeto deve alavancar pesquisas em cooperação entre grupos do Estado de São Paulo e Reino Unido.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Fabio Marcio Squina - Coordenador.
2012 - 2014

CNPQ Produtividade: Desenvolvimento de uma Coleção de Enzimas Envolvidas na Bioconversão da Biomassa Lignocelulósica, Descrição: O foco central desta proposta de pesquisa é consolidar Aspergillus nidulans (linhagem A773) como um modelo rápido e estável para expressão e secreção heteróloga de proteínas recombinantes. Comparando-se com outros sistemas disponíveis para expressão de proteínas heterólogas, em culturas líquidas, os fungos filamentosos apresentam ótima performance, alto rendimento e uma opção pouco onerosa, com relação aos requerimentos nutricionais. Este apelo pelos fungos filamentosos como plataforma para expressão de proteínas recombinantes, também é baseada em sua habilidade natural em secretar grandes quantidades de proteínas para o meio de cultivo. Neste sentido, nosso objetivo é desenvolver uma coleção de linhagens aptas a super-expressar diversas atividades enzimáticas envolvidas na degradação de polissacarídeos da parede celular de plantas. Além de estudar as propriedades funcionais das atividades enzimáticas, com amplas aplicações biotecnológicas, que incluem estratégias para produção de bioetanol, também pretendemos fazer usos de estratégias de biologia molecular para desenvolver linhagens super-expressando concomitantemente duas ou mais atividades enzimáticas sinérgicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Fabio Marcio Squina - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
2011 - 2013

CNPq Universal 1: O Estabelecimento de Aspergillus nidulans como modelo para Expressão Proteínas Recombinantes, Descrição: O aproveitamento de recursos renováveis trata-se de uma área estratégica do conhecimento. Atualmente estudos nesta linha se apresentam como uma grande oportunidade para inovação e desenvolvimento tecnológico para o nosso País, haja vista não somente a intensa pressão política, econômica e ambiental no sentido do desenvolvimento de tecnologias ?verdes? (limpas) e sustentáveis, com também as milhões de toneladas de resíduos ligninocelulósicos produzidas anualmente advindos de agroindústrias. Atualmente através da biotecnologia, podemos propor rotas tecnológicas para agregar valor a esses resíduos, que irão deixar de ser um problema ambiental para se tornarão matérias-primas para indústrias de alimentos, farmacêuticas e para produção biocombustíveis. Tradicionalmente o bagaço de cana é queimado nas usinas para produção de eletricidade, mas as usinas ainda possuem um excedente de pelo menos cerca de 10% da biomassa que não é utilizado. Desta maneira, fica evidente que o aproveitamento destes resíduos para a geração de produtos com maior valor agregado é uma necessidade nacional. A dificuldade em converter do bagaço de cana-de-açúcar e outros materiais lignocelulósicos em biocombustíveis, insumos químicos e outros compostos biologicamente ativos começa pela à morfologia da parede celular das plantas superiores. A parede celular é uma estrutura complexa composta por polissacarídeos, principalmente cellulose e hemicelulose, que correspondem a 70-75% de sua massa seca, além de proteínas, compostos fenólicos e sais minerais. Além disso, a bioconversão de material lignocelulósico demanda um grande número de atividades enzimáticas. Enquanto a hidrólise enzimática da celulose envolve a ação sinergística de pelo menos 3 enzimas, endoglucanase, exoglucanase ou celobiohidrolase, e b-glucosidase, o segundo componente em maior abundância na parede cellular de plantas, a hemicelulose, demanda um número muito maior de enzimas. As hemiceluloses são classificadas de acordo com o açúcar. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Fabio Marcio Squina - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2010 - 2011

FAPESP Auxílio Pesquisa Professor Visitante: Biologia de Sistemas das Interações Microbianas na Decomposição do Bagaço de cana, Descrição: O foco deste projeto é esmiuçar a metamicrobiota de solo envolvida na degradação da biomassa de cana de açúcar, com o objetivo de este conhecimento dos sistemas biológicos de metamicrobiota para o desenvolvimento de coquetéis enzimáticos para degradação da biomassa vegetal.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Fabio Marcio Squina - Coordenador / Rolf Alexander Prade - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
2009 - 2014

FAPESP Programa Jovens Pesquisadores em Centros Emergentes: Library Generation For Biomass-Conversion Enzymes From Soil Metagenome, Descrição: The gradual shift from petroleum to renewable biomass resources is generally seen as an important contribution to the development of a sustainable industrial society and the effective management of green house emissions. Lignocellulosic materials, such as agricultural and forestry residues, are an abundant and low-cost source of stored energy in the biosphere. Nowadays, biomass conversion into feedstock sugars has moved towards the forefront of the biofuel industry. However, the saccharification of plant biomass is a complicated and lengthy process, mainly due to the inherent recalcitrance and the complex heterogeneity of the polymers comprising plant cell walls. Lignocellulosic biomass must go through an intensive pretreatment step, after which enzymes are used to break down the polysaccharides biomass into simple sugar suitable for fermentation and ethanol production. Likewise, enzymatic conversion of cellulose and hemicellulose into simple sugar is also a demanding task, where a consortium of enzymes is needed for complete saccharification of these polysaccharides. Aiming at the entire exploitation of the plant cell wall polysaccharides, as an environmentally renewable energy source, an extensive repertoire of hydrolytic enzymes would play a major role for biofuel production. The objective of this proposal is the generation of a toolkit of lignocellulolytic enzymes with a wide range of biotechnological applications, including their use as players for the development of strategies for second generation ethanol production. The prospection of these enzymes will be done from soil metagenome, which contemplates a pioneering strategy towards the prospection of biomass conversion enzymes from microorganisms not conventionally cultivable. Additionally, this study may intensively contribute to the development of the field of bioenergy by improving techniques in rapid detection of hydrolysis using capillary electrophoresis and implementing heterologous gene expression in f. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (4) / Doutorado: (5) . , Integrantes: Fabio Marcio Squina - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2007 - 2008

Pos-Doutorado 2: Gene Library Generation for Biomass-Conversion Enzymes, Descrição: Enzymatic degradation of biomass is a complicated and lengthy process, taking a multitude of microbes and enzymes years to accomplish in the natural environment. As biomass conversion to feedstock sugars continues to move towards the fore-front of the biofuels industry, an overriding barrier is the inherent recalcitrance of biomass. Much of this resistance to degradation is intrinsic to the complex heterogeneity in the polymers comprising plant cell walls. The objective of this project is to provide cloned genes for heterologous expression system, such as bacteria, yeast, and filamentous fungi, of variety of enzyme activities needed to hydrolyzed native and variably pretreated biomass.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Fabio Marcio Squina - Integrante / Rolf A. Prade - Coordenador., Financiador(es): U. S. Department of Energy - Auxílio financeiro.
2005 - 2007

Pos-Doutorado 1: Regulação da expressão gênica no fungo Neurospora crassa em resposta ao nível de fosfato e ao pH ambiente sob controle do gene nuc-1, Descrição: O controle da expressão gênica em resposta ao estresse celular é essencial para adaptabilidade e sobrevivência de qualquer organismo. Apesar do progresso no entendimento dos mecanismos adaptativos em fungos, desencadeados por alterações na concentração de fosfato e no pH ambiente, estes processos ainda não foram completamente esclarecidos. Assim, este projeto tem como objetivo o entendimento de alguns aspectos da regulação da expressão gênica em N. crassa, envolvidos no sistema de controle dos níveis de fosfato inorgânico (Pi) e do pH, a partir da identificação de genes diferencialmente expressos. Como estratégia, serão criadas bibliotecas subtrativas de cDNA utilizando a linhagem selvagem e o mutante RIP (repeat-induced point mutantion) do gene nuc-1. A avaliação do nível de expressão de genes na linhagem selvagem em diferentes condições de cultivo, como por exemplo em pH ácido ou alcalino e em concentrações de fosfato limitante ou suficiente, permitirá a caracterização das vias metabólicas envolvidas neste sistema adaptativo sob controle do gene nuc-1. Facilitado pelo projeto genoma (http://www.fgsc.net), estes experimentos, além de ampliar o nosso conhecimento dos processos ativados ou reprimidos nestes circuitos regulatórios, apresentarão novos alvos para nocaute gênico e posterior análise funcional dos mutantes, que pode ser feita, por exemplo, através da analise estrutural de enzimas secretadas ou pela avaliação da expressão de proteínas de choque térmico. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Fabio Marcio Squina - Integrante / Antonio Rossi - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação de Apoio ao Ensino, Pesquisa e Assistência do HCFMRP - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 7
2001 - 2005

Doutorado: Nocaute sistemático de genes em Leishmania spp: utilização do sistema mariner Mos1 de transposição in vitro, Descrição: O recente seqüenciamento do genoma de vários organismos vem deslocando o enfoque da pesquisa genômica para estudos de função e localização celular de genes desconhecidos. As estratégias tradicionais que permitem entender a função e a correlação entre genes, utilizando a informação contida na seqüência genômica, são limitadas e laboriosas. A proposta deste projeto foi utilizar do sistema mariner Mos1 de transposição in vitro, como fonte de reagentes para uma estratégia de nocaute gênico sistemático do genoma de Leishmania major. Tais reagentes são fragmentos lineares de DNA que contêm uma marca de seleção flanqueada pelas regiões 5?e 3? de genes do parasita. Por recombinação homóloga no genoma, estes fragmentos irão mediar a obtenção de mutantes, que são ferramentas valiosas na dissecção genética que qualquer organismo.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Fabio Marcio Squina - Integrante / Luiz Ricardo Orsini Tosi - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 29
1999 - 2001

Mestrado: Produção de Carotenóides por Linhagens de Levedura, Descrição: Os carotenóides compõem um grupo de pigmentos naturais amplamente distribuídos na natureza com grande diversidade de estruturas e funções. O interesse pelos carotenóides tem aumentado consideravelmente nos últimos anos pela evidência dos seus já conhecidos benefícios à saúde humana, por suas propriedades antimutagênicas, anticarcinogênicas e também atividade imunomodulatória. O fato de muitos animais com importância econômica conterem carotenóides e os requererem como nutrientes, faz destes pigmentos industrialmente importantes como componentes de rações para aves e para peixes e crustáceos. As principais fontes industriais de carotenóides são a síntese química e a extração a partir de plantas. Porém, são poucos os carotenóides que possuem métodos economicamente eficientes de produção e existe uma potencial demanda para carotenóides como licopeno, luteína, zeaxantina, cantaxantina, astaxantina, rodoxantina e toruleno. Os processos biotecnológicos apresentam-se como uma alternativa em potencial para obtenção destes pigmentos, sendo que, este tipo de fonte natural pode suprir uma proporção significativa dos pigmentos usados industrialmente como corantes ou como nutrientes. O objetivo deste projeto será determinar a composição de carotenóides de diferentes linhagens de Rhodotorula e avaliar a influência de diversos parâmetros de cultivo visando um aumento na produção desses pigmentos .. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Fabio Marcio Squina - Integrante / Adriana Z. Mercadante - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 8
1997 - 1998

Iniciação Científica: Seleção de compostos oriundos de plantas com capacidade de alterar o crescimento apical e/ou a ramificação de Neurospora crassa, Descrição: Os fungos crescem pela ponta de sua estrutura vegetativa dominante, as hifas. Este processo é característico do Reino Fungi, mas os mecanismos que o regulam são pouco conhecidos apesar de sua grande importância. Diversas funções estão correlacionadas ao crescimento apical, como: a secreção de substâncias e absorção de nutrientes, a morfogênese, o reconhecimento do meio externo, a reprodução e o crescimento da hifa. Uma classe de substâncias de grande interesse neste estudo são os compostos fenólicos de origem vegetal, tal como o ácido cinâmico, ácido caféico, ácido ferúlico e o álcool coniferil. Todos estes compostos na planta tem uma origem biossintética comum através da via do ácido chiquímico. Este projeto tem por objetivo estudar aspectos do crescimento apical e da ramificação do fungo filamentoso Neurospora crassa, visando um melhor entendimento deste processo, o que permitiria o desenvolvimento de estratégias mais eficazes para controlar o crescimento de fungos quando indesejáveis, como no caso de fitopatogenicidades. Neste projeto, compostos considerados inibidores do crescimento, como os composto fenólicos de origem vegetal ou outros, foram testados quanto sua capacidade de alterar a morfologia e ou inibir germinação e crescimento vegetativo de Neurospora crassa, quando suplementados ao meio de cultivo. Os objetivos deste projeto foram: 1) Investigar as alterações morfológicas e o crescimento que o ácido cinâmico, ácido caféico, ácido ferúlico e o álcool coniferil induzem se usadas separadamente ou juntas. 2) Tentar isolar mutantes resistentes aos compostos em estudo. 3) Investigar o efeito destes compostos sobre a morfologia e o crescimento de mutantes morfológicos de N. crassa como ipa. cot-1, scr e crisp. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Fabio Marcio Squina - Integrante / Suraia Said - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 3

Projetos de desenvolvimento

2013 - Atual

ENCOMENDA TRANSVERSAL DE PROJETO DE PESQUISA PAISS : Desenvolvimento de plataforma tecnológica multifuncional visando obtenção de energia e nutrientes da biomassa vegetal, Descrição: ENCOMENDA TRANSVERSAL DE PROJETO DE PESQUISA - PAISS, envolvendo a participação de mais 20 profissionais do CTBE e da Elly Lilly, incluido pesquisadores e técnicos de desenvolvimento especializado e pessoal administrativo. http://www.jusbrasil.com.br/diarios/58963474/dou-secao-3-11-09-2013-pg-13. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Fabio Marcio Squina - Coordenador., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.
2013 - Atual

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2013 - Atual

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2013 - Atual

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2013 - Atual

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2013 - Atual

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2013 - Atual

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2013 - Atual

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2013 - Atual

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2013 - 2017

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2013 - 2017

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2013 - 2017

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2013 - 2017

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2013 - 2017

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2013 - 2017

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2013 - 2017

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2013 - 2017

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2013 - 2017

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2013 - 2017

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2013 - 2017

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Prêmios

2025

Voto de Congratulações por Avanços Científicos, Câmara Municipal de Sorocaba.

2021

BBEST AWARD (primeiro lugar, categoria doutorado) à aluna Nathália Vilela, BBEST 2020-21.

2020

DESTAQUE DO ANO NO ARTIGO CIENTÍFICO DO IB, Instituto de Biologia da UNICAMP.

2019

Artigo da The Journal of Biological Chemistry selecionado para compor edição especial da revista apresentando os melhores artigos da América Latina na revista entre 2016 e 2019, Em homenagem a Reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular..

2019

Prêmio melhor poster para o aluno Victoria Sodré no Congresso Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular.

2016

Prêmio Prêmio Professor Arikerne Sucupira para o aluno Robson Tramontina de melhor trabalho VI Encontro da Escola Brasileira de Química Verde, Associação Brasileira de Química.

2016

Menção Honrosa - Melhor Trabalho apresentado no Encontro de Biociências da UNICAMP., ograma de Pós graduação em Biociências e tecnologia de produtos bioativos (BTPB-IB-UNICAMP).

2016

Seleção para apresentação oral de trabalho do Doutorando João Paulo Franco Cairo no 36th Symposium on Biotechnology for Fuels and Chemicals, Society for Industrial Microbiology and Biotechnology - USA.

2016

Seleção para apresentação oral de trabalho da Doutoranda Lívia B. Brenelli de Paivano 36th Symposium on Biotechnology for Fuels and Chemicals, ociety for Industrial Microbiology and Biotechnology - USA..

2014

Seleção para apresentação oral de trabalho do Doutorando João Paulo Franco Cairo no 34th Symposium on Biotechnology for Fuels and Chemicals, Society for Industrial Microbiology and Biotechnology.

2014

Melhor Tese de Doutorado 2014 para a aluna Thabata Maria Alvarez do Programa de Pós-Graduacao de Biologia Funcional e Molecular, Instituto de Biologia da UNICAMP.

2014

Seleção para apresentação oral de trabalho e subsídio financeiro para participação da Doutoranda Lívia B. Brenelli de Paiva no 2nd Brazil-Danish Workshop for Biorefineries, University of Copenhegen - Denmark.

2014

Seleção para apresentação oral de trabalho e subsídio financeiro para participação do Doutorando João Paulo Franco Cairo no 2nd Brazil-Danish Workshop for Biorefineries, University of Copenhegen - Denmark.

2013

Seleção para apresentação oral de trabalho do pós doutorando André Damásio na Gordon Conference on Cellulosomes, Cellulases & Other Carbohydrate Modifying Enzymes., Gordon Conference.

2012

Premio Auxílio-viagem para a Doutoranda Thabata Maria Alvarez participar do14th International Symposium on Microbial Ecology, Copenhagen na Dinamarca, International Society for Microbial Ecology.

2012

Seleção para apresentação oral de trabalho do Doutorando João Paulo Franco Cairo no 14th International Symposium on Microbial Ecology, ISME14., International Society for Microbial Ecology.

2011

Prêmio Pós-Graduação para Thabata Maria Alvarez de melhor trabalho Workshop do programa de Biologia Funcional e Molecular (BFM), Biologia Funcional e Molecular (BFM)- UNICAMP.

2004

Prêmio ZIGMAN BRENER, Sociedade Brasileira de Protozoologia.

2004

Selecionado pelo comitê científico do TriTryp Genomes Meeting com o prêmio de subsídio financeiro para participação no TRITRYP Genomes Meeting 2004 em Seattle EUA, Seattle Biomedical Research Institute.

Histórico profissional

Endereço profissional

Universidade de Sorocaba, Reitoria, Pró-Reitoria de Pós-Graduação e Pesquisa. , Rodovia Raposo Tavares - km 92,5, Cidade Universitária, 18023000 - Sorocaba, SP - Brasil, Telefone: (15) 21017187, URL da Homepage:

Experiência profissional

2022 - Atual

Universidade de Sorocaba

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto II - RM, Carga horária: 40

Outras informações:
Docente Permanente dos Programas de Pós Graduação em Processos Tecnológicos e Ambientais e Ciências Farmacêuticas.

2017 - 2021

Universidade de Sorocaba

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto I - RG, Carga horária: 40

Outras informações:
Docente Permanente do Programa de Pós Graduação em Processos Tecnológicos e Ambientais

Atividades

06/2021
Conselhos, Comissões e Consultoria, Pró-Reitoria de Pós-Graduação, Pesquisa, Extensão e Inovação.,Cargo ou função, Presidente da Comissão Interna de Biossegurança (CIBio/ UNISO).
01/2020
Direção e administração, Pró-Reitoria de Pós-Graduação, Pesquisa, Extensão e Inovação.,Cargo ou função, Pesquisador Líder do Laboratório de Ciências Moleculares da UNISO.
03/2019
Ensino, Processos Tecnológicos e Ambientais, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Delineamento Experimental
08/2018
Ensino, Farmácia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Fundamentos de Bioquímica
03/2018
Conselhos, Comissões e Consultoria, Reitoria, Centro de Ciências Biológicas e da Saúde.,Cargo ou função, Membro do Núcleo Docente Estruturante (NDE) do curso de Farmácia.
02/2018
Ensino, Farmácia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioquímica Metabólica
02/2018
Ensino, Biomedicina, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Microbiologia
08/2017
Ensino, Processos Tecnológicos e Ambientais, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Estudo dirigido em Processos Tecnológicos
03/2017
Pesquisa e desenvolvimento, Reitoria, Pró-Reitoria de Pós-Graduação e Pesquisa.,Linhas de pesquisa
08/2017 - 12/2017
Ensino, Agronomia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Biologia Celular Aplicada

2024 - Atual

Universidade Estadual de Campinas

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Orientação em Pós-graduação, Carga horária: 1

Outras informações:
Professor (orientador) Colaborador do Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular e Morfofuncional.

2019 - Atual

Universidade Estadual de Campinas

Vínculo: Pesquisador Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador Colaborador Instituto de Biologia, Carga horária: 1

2017 - 2023

Universidade Estadual de Campinas

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Orientação em Pós-graduação, Carga horária: 1

Outras informações:
Professor (orientador) Colaborador do Programa de Pós-graduação em Biociências e Tecnologia de Produtos Bioativos

2017 - 2023

Universidade Estadual de Campinas

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Orientação em Pós-graduação, Carga horária: 1

Outras informações:
Professor (orientador) Colaborador do Programa de Pós-graduação em Biologia Funcional e Molecular

2017 - 2019

Universidade Estadual de Campinas

Vínculo: Pesquisador Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador Colaborador DEPRO / FEQ, Carga horária: 2

2011 - 2017

Universidade Estadual de Campinas

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Orientação em Pós-graduaçao

Outras informações:
Professor (Orientador) do Quadro Permanente do Programa de Pós-graduação em Biociências e Tecnologia de Produtos Bioativos

2010 - 2017

Universidade Estadual de Campinas

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Orientação em Pós-graduaçao

Outras informações:
Professor (Orientador) do Quadro Permanente do Programa de Pós-graduação em Biologia Funcional e Molecular

1999 - 2001

Universidade Estadual de Campinas

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Mestrando, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

11/2020
Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Biologia.,Linhas de pesquisa
03/2013 - 12/2021
Ensino, Biologia Funcional e Molecular, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, NB-325 Tópicos em Enzimologia e Biotecnologia
03/2013 - 12/2021
Ensino, Ciências Farmacêuticas, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, PD037 ? Enzimologia: Cinética Enzimática e Desenvolvimento de Novos Fármacos
10/2010 - 10/2010
Ensino, Odontologia, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Ministrou a palestra: Aplicação de Ferramentas ômicas para prospecção de enzimas biotecnológicas
06/2010 - 06/2010
Ensino, Biologia Celular e Estrutural, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Ministrou a palestra: Desenvolvimento de Enzimas Envolvidas na Produção de Biocombustíveis
07/2009 - 07/2009
Ensino, Biologia Funcional e Molecular, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Ministrou a palestra: Desenvolvimento de Enzimas Envolvidas na Produção de Biocombustíveis
03/1999 - 02/2001
Pesquisa e desenvolvimento, Faculdade de Engenharia de Alimentos.,Linhas de pesquisa
08/2000 - 12/2000
Ensino, Faculdade de Engenharia de Alimentos, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Programa PAE; Microbiologia de Alimentos;
06/1999 - 12/2000
Ensino, Faculdade de Engenharia de Alimentos, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Programa PAE; Química dos componentes dos alimentos

2008 - 2017

Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais

Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Pesquisador Lider, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

01/2015 - 12/2016
Direção e administração, Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol.,Cargo ou função, Pesquisador Lider Instalação Aberta: Laboratório de Alto Desempenho em Sequenciamento e Robótica.
10/2014 - 12/2016
Direção e administração, Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol.,Cargo ou função, Coordenador do Laboratório de Biotecnologia Molecular (LBM/ CTBE).
09/2008 - 12/2016
Pesquisa e desenvolvimento, Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol.,Linhas de pesquisa
01/2011 - 12/2015
Conselhos, Comissões e Consultoria, Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol.,Cargo ou função, Membro Comissão Interna de Biossegurança;.
02/2014 - 12/2014
Direção e administração, Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol.,Cargo ou função, Coordenador de Instalação de Sequenciamento de Alto Desempenho.
03/2012 - 12/2014
Direção e administração, Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol.,Cargo ou função, Coordenador da Instalação de High-throughput screening.
01/2011 - 12/2014
Conselhos, Comissões e Consultoria, Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol.,Cargo ou função, Comissão de Insumos e Rejeitos químicos.
03/2010 - 12/2010
Conselhos, Comissões e Consultoria, Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol.,Cargo ou função, Presidente Comissão Interna de Biossegurança.

2007 - 2008

Oklahoma State University

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Post Doctoral Fellow, Regime: Dedicação exclusiva.

2005 - 2007

Universidade de São Paulo

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pos-Doutor, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Pós-doutorado no Departamento de Bioquímica e Imunologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto.

2001 - 2005

Universidade de São Paulo

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Doutorando, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Doutorando em Biologia Celular e Molecular na Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto

1997 - 1998

Universidade de São Paulo

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista de Iniciação Científica FAPESP, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Estágio de Iniciação Científica na Disciplina de Enzimologia Industrial. Faculdade de Ciência Farmacêuticas de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.

1994 - 1998

Universidade de São Paulo

Vínculo: aluno de graduação, Enquadramento Funcional: Graduando, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Graduação em Farmácia Bioquímica. Faculdade de Ciência Farmacêuticas de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.

1997 - 1997

Universidade de São Paulo

Vínculo: voluntário, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 40

Outras informações:
Estágio de Iniciação em Farmácia de Dispensação e Manipulação. Farmácia Ensino da da Faculdade de Ciência Farmacêuticas de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.

Atividades

09/2013 - 09/2013
Ensino, Bioquímica, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Ministrou a palestra: Development of Omics-based Approaches for Biocatalist Discovery in Lignocellulose-to-Bioproduct applicatios, junto a Disciplina de Seminários Gerais do Departamento de Bioquímica, programa de pós-graduação do Instituto de Química
10/2012 - 10/2012
Ensino, Bioquímica, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Ministrou a palestra: Estratégias MetaProteoGenômicas para Prospecção de Enzimas com Aplicação Biotecnológica, junto a disciplina de Seminários de Bioquímica II do Departamento de Bioquimica e Imunologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto
10/2009 - 10/2009
Ensino, Biotecnologia, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Ministrou a palestra: Desenvolvimento de uma Biblioteca de Enzimas Envolvidas na Conversão da Biomassa Vegetal, junto a disciplina de seminários em Biotecnologia do programa de pós-graduação interunidades da USP
10/2005 - 05/2007
Pesquisa e desenvolvimento, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto.,Linhas de pesquisa
06/2006 - 06/2006
Ensino, Genética de Fungos, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Palestra Proferida: A construção de bibliotecas subtrativas de cDNA para análise da expressâo diferencial da genes. Colaboração na disciplina do Programa de Genética da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto
10/2005 - 10/2005
Ensino, Tópicos em Bioquímica Contemporânea, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Palestra Proferida: Interferindo em Processos Biológicos; A Produção de Organismos Mutantes. Colaboração na disciplina do Programa de Bioquímica da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto
03/2004 - 03/2004
Ensino, Técnicas Básicas de Imunologia, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Palestra ministrada: O Papel de Mutantes como Ferramenta no Estudo de Processos Biológicos. Colaboração na disciplina do Programa de pós-graduação em Imunologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto
02/2003 - 05/2003
Ensino, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Genética Molecular e Tecnologia de DNA Recombinante; (Programa PAE)
03/2002 - 11/2002
Ensino, Tópicos Avançados em Microbiologia e Parasitologia, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Palestra Proferida: Custos e Benefícios de Altas Taxas de Mutação em Bactérias em Disciplina de Seminários do Programa de Biologia Celular e Molecular. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Palestra Proferida: Organismos Modelos como Ferramenta para o Estudo de Doenças Genéticas Humanas. Colaboração na Disciplina de Seminários do Programa de Biologia Celular e Molecular. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto
01/1997 - 09/1998
Pesquisa e desenvolvimento, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Ciências Farmacêuticas.,Linhas de pesquisa

1998 - 1998

Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Estagiário Laboratório Clínico, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

07/1998 - 12/1998
Estágios , Laboratórios de Análises Clínicas.,Estágio realizado, Estágio Curricular em Laboratório Clínico.

2009 - Atual

(FAPESP) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Revisor de projeto de fomento

Outras informações:
Revisor frequente de projetos de pesquisa e de solicações de bolsas

2013 - 2016

(FAPESP) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Membro de comitê assessor do programa PIPE

Outras informações:
Grupo de pesquisadores reunidos em períodos esporádicos para avaliação conjunta de projetos de inovação tecnológica propostos por empresas do setor privado

Propriedade Intelectual

Patentes (2)

Tipo	Título	Data depósito
INVENTOR	Enzima bifuncional utilizada na degradação de biomassa para produção de xilose em uma única operação	15/07/2013
INVENTOR	Processo de producao de compostos fenólicos e sistema enzimatico	18/01/2012