Pedro Henrique Oliveira Borges

Possui graduação em Química com Atribuições Tecnológicas pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Mestrado em Química Medicinal pela Universidade de Coimbra (UC) em Portugal e Doutorado em Química pela UFRJ, com experiência em diversas áreas da química, principalmente em Química Medicinal, com foco principalmente em síntese de moléculas bioativas e modelagem por abordagens computacionais. Durante a Iniciação Científica trabalhou em projetos de sínteses e caracterizações de compostos de coordenação de cobalto como proposta de nova pró-droga anti-tumoral. Trabalhou como estagiário na Universidade Federal do Rio de Janeiro no Laboratório de Análise Ambiental e Mineral (LAM), desenvolvendo e utilizando métodos analíticos para análises de metais pesados em águas de produção, minérios e amostras de reatores de microalgas. Estágios laboratoriais na Universidade de Coimbra em laboratório de química computacional, trabalhando com modelagem e docking molecular e em laboratório de farmacognosia, trabalhando com identificação, extração e purificação de compostos naturais. Dissertação de mestrado sobre screening de compostos bioativos de plantas medicinais com auxílio de ferramentas in silico, como previsão de bioatividades e docking molecular, e avaliação de bioatividades por ensaios enzimáticos in vitro. Trabalhou em projeto de pesquisa na área de Química Ambiental na COPPE, analisando amostras de sedimentos, água e biota marinha para determinação de metais pesados. No doutorado, associado ao projeto "Programa Estratégico Emergencial de Prevenção e Combate a Surtos, Endemias, Epidemias e Pandemias", trabalhou com o desenvolvimento e síntese de novos antivirais gerados por Inteligência Artificial contra o SARS-CoV-2, tendo realizado Doutorado Sanduíche no Reino Unido, por um período de 6 meses, através de colaboração com a Diamond Light Source, trabalhando com produção e purificação de proteínas e cristalografia de Raios-X para detecção de novos inibidores da protease principal (Mpro) do vírus SARS-CoV-2 e outras proteases virais

Informações coletadas do Lattes em 02/11/2024

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Química

2020 - 2024

Universidade Federal do Rio de Janeiro
Título: Novos inibidores de Mpro de SARS-CoV-2 planejados por IA generativa: Caracterização estrutural do modo de ligação, design e síntese
Orientador: em Diamond Light Source ( Martin Walsh)
com Sabrina Baptista Ferreira. Coorientador: Floriano Paes Silva Júnior. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: coronavírus; desenho de fármacos baseado na estrutura; proteases virais; antivirais; cristalografia de proteínas.Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências da Saúde / Área: Farmácia / Subárea: Química Farmacêutica Medicinal. Setores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico.

Mestrado em Mestrado em Química Medicinal

2016 - 2018

Universidade de Coimbra
Título: Inibição da alfa-glucosidase por flavonóides do Cymbopogon citratus: estudos in silico e in vitro, Ano de Obtenção: 2018
Orientador: Artur Manuel Bordalo Machado Figueirinha
Coorientador: Maria Manuel Cruz Silva. Palavras-chave: alfa-glucosidase; cymbopogon citratus; flavonóides.Grande área: Ciências da SaúdeGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Química Orgânica / Especialidade: Química dos Produtos Naturais. Grande Área: Ciências da Saúde / Área: Farmácia / Subárea: Química Farmacêutica Medicinal. Setores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico.

Graduação em Química com Atribuições Tecnológicas

2009 - 2015

Universidade Federal do Rio de Janeiro
Título: Análise de sais de cozinha e alguns alimentos fontes de Magnésio por Espectrofotometria de Absorção Atômica com fonte contínua de Xenônio
Orientador: João Alfredo Medeiros

Formação complementar

2024 - 2024

Drug Discovery Mission - DMPK. (Carga horária: 40h). , Wellcome Centre for Anti-Infectives Research, WCAIR, Escócia.

2021 - 2021

Química de Heterocíclicos. (Carga horária: 60h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2016 - 2016

Medicinal Chemistry: The Molecular Basis for Drug Discovery. (Carga horária: 20h). , Davidson College, D.C, Estados Unidos.

2015 - 2015

Curso de Farmacologia Geral. (Carga horária: 20h). , Instituto Politécnico de Ensino a Distância, iPED, Brasil.

2013 - 2013

Iniciação ao Estudo dos Explosivos. (Carga horária: 10h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2013 - 2013

Química Forense Aplicada à Investigação Criminal. (Carga horária: 10h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

Bandeira representando o idioma Francês

Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Pouco, Escreve Pouco.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências da Saúde / Área: Farmácia / Subárea: Química Farmacêutica Medicinal.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Química Inorgânica/Especialidade: Química Bio-Inorgânica.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Química Analítica.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Química Orgânica.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Química Orgânica/Especialidade: Síntese Orgânica.

Organização de eventos

BORGES, P. H. O. . XVII Encontro Regional da Sociedade Brasileira de Química. 2022. (Congresso).

Participação em eventos

46ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química (RASBQ). Structure-based design of new gamma-carboline chloromethyl amides as Inhibitors of SARS-CoV-2 Mpro enzyme. 2023. (Congresso).

4th International Symposium on Pharmacology and Medicinal Chemistry. 2023. (Simpósio).

11ª Semana de Integração Acadêmica da UFRJ. 2022. (Encontro).

18th Brazilian Meeting on Organic Synthesis (18th BMOS). AI-based Molecular Design and Synthesis of New Peptidomimetic Inhibitors of SARS-CoV-2 Mpro enzyme. 2022. (Congresso).

18th Brazilian Meeting on Organic Synthesis (18th BMOS). AI-based Molecular Design and Synthesis of New Peptidomimetic Inhibitors of SARS-CoV-2 Mpro enzyme. 2022. (Congresso).

I Encontro Anual da PGQu.Design Molecular baseado em I.A. e Síntese de Novos Inibidores Peptidomiméticos da enzima Mpro do SARS-CoV-2. 2022. (Encontro).

XLII Jornada Giulio Massarani de Iniciação Científica, Tecnológica, Artística e Cultural. 2021. (Encontro).

1st Drug R&D PhD Symposium. 2018. (Simpósio).

Encontro Científico do Núcleo dos Estudantes de Química (NEQ/AAC).Comissão científica. 2018. (Encontro).

World Health Summit Regional Meeting. 2018. (Congresso).

XXXIV Jornada Giulio Massarani de Iniciação Científica, Tecnológica, Artística e Cultural.Avaliação do Efeito de Substituintes sobre o Potencial de Redução de Complexos de Cobalto (III) com Ligantes N,O doadores. 2012. (Outra).

34ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química. Emprego de Ligantes Tridentados Contendo Substituintes Bromo na Obtenção de Complexos de Cobalto(III) Candidatos a Novos Antitumorais. 2011. (Congresso).

34ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química. Síntese, Caracterização e estudos biológicos de complexo de Co(III) como possível metalofármaco antitumoral. 2011. (Congresso).

34ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química. Emprego de Ligantes Tridentados Contendo Substituintes Bromo na Obtenção de Complexos de Cobalto(III) Candidatos a Novos Antitumorais. 2011. (Congresso).

34ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química. Síntese, Caracterização e estudos biológicos de complexo de Co(III) como possível metalofármaco antitumoral. 2011. (Congresso).

XXXIII Jornada Giulio Massarani de Iniciação Científica, Tecnológica, Artística e Cultural.Síntese e caracterização de complexos de cobalto (III) como candidatos à nova pró-droga antitumoral. 2011. (Outra).

Participação em bancas

BORGES, P. H. O.. 11ª Semana de Integração Acadêmica da UFRJ. 2022. Universidade Federal do Rio de Janeiro.

BORGES, P. H. O.. 42ª Jornada Giulio Massarani de Iniciação Científica, Tecnologia, Artística e Cultural. 2021. Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Orientou

Ana Beatriz Costa Gonçalves

Design e Síntese de Novos Inibidores Peptidomiméticos baseados em I; A; para Mpro do SARS-CoV-2; Início: 2023; Iniciação científica (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Pedro Miguel de Almeida Roberto

Design e Síntese de Novos Inibidores Peptidomiméticos baseados em I; A; para Mpro do SARS-CoV-2; 2022; Iniciação Científica; (Graduando em Química) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Pedro Henrique Oliveira Borges;

Produções bibliográficas

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  • SARAMAGO, LUIZ CARLOS ; SANTANA, MARCOS V. ; GOMES, BÁRBARA FIGUEIRA ; DANTAS, RAFAEL FERREIRA ; SENGER, MARIO R. ; OLIVEIRA BORGES, PEDRO HENRIQUE ; FERREIRA, VIVIAN NEUZA DOS SANTOS ; DOS SANTOS ROSA, ALICE ; TUCCI, AMANDA RESENDE ; DIAS MIRANDA, MILENE ; LUKACIK, PETRA ; STRAIN-DAMERELL, CLAIRE ; OWEN, C. DAVID ; WALSH, MARTIN AUSTIN ; FERREIRA, SABRINA BAPTISTA ; SILVA-JUNIOR, FLORIANO PAES . AI-Driven Discovery of SARS-CoV-2 Main Protease Fragment-like Inhibitors with Antiviral Activity In Vitro. Journal of Chemical Information and Modeling , v. 63, p. 2866-2880, 2023.

  • BORGES, PEDRO H.O. ; PEDREIRO, SÓNIA ; BAPTISTA, SALETE J. ; GERALDES, CARLOS F.G.C. ; BATISTA, M.T. ; SILVA, MARIA M.C. ; FIGUEIRINHA, ARTUR . Inhibition of α-glucosidase by flavonoids of Cymbopogon citratus (DC) Stapf. JOURNAL OF ETHNOPHARMACOLOGY , v. 280, p. 114470, 2021.

  • Chipoline, Ingrid Cavalcanti ; Borges, Pedro Henrique Oliveira ; FERREIRA, SABRINA BAPTISTA ; Paes Silva Junior, Floriano . Lab-on-a-chip: Efficient Preparation of Bioactive Compounds Using On-chip Flow Synthesis. In: Arpana Parihar; Piyush Pradeep Mehta. (Org.). Lab-on-a-chip Devices for Advanced Biomedicines. 1ed.Londres: Royal Society of Chemistry, 2024, v. 1, p. 342-361.

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  • ROBERTO, P. M. A. ; BORGES, P. H. O. ; SILVA JUNIOR, F. P. ; FERREIRA, S. B. . Design Molecular Baseado em Inteligência Artificial e Síntese de Novos Inibidores Peptidomiméticos da Enzima SARS-CoV-2 Mpro. In: 12ª Semana de Integração Acadêmica da UFRJ, 2023, Rio de Janeiro. 12ª Semana de Integração Acadêmica da UFRJ, 2023.

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  • SILVA, A. P. P. M. ; BORGES, P. H. O. ; SILVA JUNIOR, F. P. ; FERREIRA, S. B. . Synthesis of new pyrido-indoles as potential inhibitors of SARS-CoV-2 Mpro. In: 46ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química, 2023, Águas de Lindóia. 46ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química, 2023.

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  • BORGES, P. H. O. ; SANTANA, M. V. S. ; SARAMAGO, L. C. ; AQUINO, G. A. S. ; OSTA, L. O. ; SILVA JUNIOR, F. P. ; FERREIRA, S. B. . AI-based Molecular Design and Synthesis of New Peptidomimetic Inhibitors of SARS-CoV-2 Mpro enzyme. In: 18th Brazilian Meeting on Organic Synthesis, 2022, Tiradentes. 18th Brazilian Meeting on Organic Synthesis, 2022.

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  • OLIVEIRA, A. L. B. ; NAVARRO, L. S. ; BORGES, P. H. O. ; PEREIRA, Marcos D. ; SCARPELLINI, M. . On the Activities of Two Analogs Co(III) and Ni(II) Complexes Against Human Cancer Cells (A549). In: XVI Brazilian Meeting on Inorganic Chemistry / III Latin American Meeting on Biological Inorganic Chemistry, 2012, Florianópolis. XVI Brazilian Meeting on Inorganic Chemistry / III Latin American Meeting on Biological Inorganic Chemistry, 2012. v. único.

  • BORGES, P. H. O. ; MAIA, P. J. S. ; SCARPELLINI, M. . Emprego de Ligante Tridentado Contendo Substituinte Bromo na Obtenção de Complexo de Cobalto(III) Candidato a Novo Antitumoral. In: 34ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química, 2011, Florianópolis. 34ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química, 2011. v. Único.

  • BORGES, P. H. O. ; MAIA, P. J. S. ; HENRICH, T.A. ; SCARPELLINI, M. . Síntese, caracterização e estudos biológicos de complexo de Co(III) como possível metalofármaco antitumoral.. In: 34ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química, 2011, Florianópolis. 34ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química, 2011. v. Único.

  • GONCALVES, A. B. C. ; BORGES, P. H. O. ; ARAUJO, N. F. ; SILVA JUNIOR, F. P. ; FERREIRA, S. B. . Desing molecular Baseado em Inteligência Artificial e Síntese de Novos Inibidores Peptidomiméticos da Enzima SARS-CoV-2 Mpro. 2024. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • GONCALVES, A. B. C. ; BORGES, P. H. O. ; ARAUJO, N. F. ; SILVA JUNIOR, F. P. ; FERREIRA, S. B. . Desing molecular Baseado em Inteligência Artificial e Síntese de Novos Inibidores Peptidomiméticos da Enzima SARS-CoV-2 Mpro. 2024. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • BORGES, P. H. O. ; SILVA, A. P. P. M. ; SARAMAGO, L. C. ; SILVA JUNIOR, F. P. ; FERREIRA, S. B. . Structure-based design of new gamma-carboline chloromethyl amides as Inhibitors of SARS-CoV-2 Mpro enzyme. 2023. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • SILVA, A. P. P. M. ; BORGES, P. H. O. ; SILVA JUNIOR, F. P. ; CHIPOLINE, I. C. ; FERREIRA, S. B. . Synthesis of new pyrido-indoles as potential inhibitors of SARS-CoV-2 Mpro. 2023. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • COSTA, R. O. ; BORGES, P. H. O. ; AQUINO, G. A. S. ; SILVA JUNIOR, F. P. ; FERREIRA, S. B. . Synthesis of New Hybrid 1,2,3-Triazole Compounds in Combating COVID-19. 2023. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • ROBERTO, P. M. A. ; SILVA JUNIOR, F. P. ; BORGES, P. H. O. ; FERREIRA, S. B. . Design Molecular Baseado em Inteligência Artificial e Síntese de Novos Inibidores Peptidomiméticos da Enzima SARS-CoV-2 Mpro. 2023. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • SARAMAGO, L. C. ; SANTANA, M. V. S. ; GOMES, B. ; DANTAS, R. F. ; SENGER, M. R. ; BORGES, P. H. O. ; FERREIRA, S. B. ; FERREIRA, V. ; ROSA, A. ; TUCCI, A. ; MIRANDA, M. ; WALSH, M. ; SILVA JUNIOR, F. P. . AI-Driven Discovery of SARS-CoV-2 Main Protease fragment-like Inhibitors with antiviral activity in vitro. 2022. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • BORGES, P. H. O. ; SANTANA, M. V. S. ; SARAMAGO, L. C. ; AQUINO, G. A. S. ; OSTA, L. O. ; SILVA JUNIOR, F. P. ; FERREIRA, S. B. . AI-based Molecular Design and Synthesis of New Peptidomimetic Inhibitors of SARS-CoV-2 Mpro enzyme. 2022. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • BORGES, P. H. O. ; SANTANA, M. V. S. ; SARAMAGO, L. C. ; AQUINO, G. A. S. ; OSTA, L. O. ; SILVA JUNIOR, F. P. ; FERREIRA, S. B. . AI-based Molecular Design and Synthesis of New Peptidomimetic Inhibitors of SARS-CoV-2 Mpro enzyme. 2022. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • BORGES, P. H. O. ; SCARPELLINI, M. . Avaliação do efeito de substituintes sobre o potencial de redução de complexos de Co(III) com ligantes N,O-Doadores. 2012. (Apresentação de Trabalho/Outra).

  • BORGES, P. H. O. ; SCARPELLINI, M. . Síntese e caracterização de complexos de cobalto (III) como candidatos à nova pró-droga antitumoral. 2011. (Apresentação de Trabalho/Outra).

Projetos de pesquisa

  • 2020 - 2024

    Desenvolvimento de ferramentas para combate à COVID-19: reposicionamento de fármacos, síntese de novos protótipos antivirais e novas ferramentas de diagnóstico, Descrição: Projeto submetido ao Edital n 11/2020 ? Fármacos e Imunologia, do Programa Estratégico Emergencial de Prevenção e Combate a Surtos, Endemias, Epidemias e Pandemias lançado pela CAPES. O projeto contribuirá com a expertise dos químicos teóricos no estudo de reposicionamento de fármacos, dos químicos sintéticos no desenvolvimento de novos protótipos antivirais. No que tange à prevenção a expertise química será usada na busca de sanitizantes e imunossensores.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Pedro Henrique Oliveira Borges - Integrante / Sabrina Baptista Ferreira - Integrante / Floriano Paes Silva Júnior - Integrante / Marco Antônio Chaer do Nascimento - Coordenador / Claudia Moraes de Rezende - Integrante / Magaly Girão Albuquerque - Integrante / Barbara Vasconcellos da Silva - Integrante / Leandro Soter de Mariz e Miranda - Integrante / Raoni Schroeder Borges Gonçalves - Integrante / Bruno Araújo Cautiero Horta - Integrante / Camilo Henrique da Silva Lima - Integrante / Eliane D'Elia - Integrante / Rafael Garrett da Costa - Integrante.

Histórico profissional

Experiência profissional

2020 - 2024

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Aluno bolsista de doutorado, financiado pela CAPES, atuando em projeto de pesquisa e desenvolvimento de novas moléculas bioativas contra o vírus SARS-CoV-2

2012 - 2015

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 20

Outras informações:
Estágio no Laboratório de Análise Ambiental e Mineral (Agosto/2012 a Agosto/2014) na Universidade Federal do Rio de Janeiro, trabalhando com Espectrofotômetro de Absorção Atômica de Fonte Contínua de Alta Resolução (HR-CS AAS), Espectrofotometria de Uv-Visível, Fotometria de Chama, Espectrofotometria ICP-OES e resinas trocadoras de íons para determinação de metais em amostras de águas de produção, minérios e amostras de reatores de cultivo de microalga.

2010 - 2012

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 20

Atividades

  • 09/2020

    Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Química.,Linhas de pesquisa

  • 08/2012 - 08/2014

    Estágios , Instituto de Química.,Estágio realizado, Trabalho na área de Química Analítica, analisando águas de produção, minérios e amostras de reatores de microalgas.

  • 08/2010 - 08/2012

    Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Química.,Linhas de pesquisa

2019 - 2020

Fundação Coordenação de Projetos, Pesquisas e Estudos Tecnológicos

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Químico Colaborador, Carga horária: 40

Outras informações:
Análises diversas de sedimentos, águas e biota marinha por Absorção Atômica, Gerador de Hidretos, Espectrofotometria de UV-Vis, ICP-OES e XRF. Preparo de relatórios e interpretação de resultados. Gestão de estagiários.

2023 - 2023

Diamond Light Source, Diamond

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Aluno Pesquisador, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Doutorado Sanduíche através do Programa CAPES PrInt. Responsabilidades: Produção e purificação de proteínas, cristalografia de raios-X para determinação de estruturas de proteínas, testes de inibição com compostos bioativos.