Marcos Daniel Mendes Padilha

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Participação em eventos

Produções bibliográficas

• PADILHA, Marcos Daniel Mendes ; MELO, FRANCISCO TIAGO DE VASCONCELOS ; LAURENTINO, ROGÉRIO VALOIS ; MONTEIRO, JACQUELINE CORTINHAS ; SILVA, ANDREA NAZARÉ MONTEIRO RANGEL DA ; MATOS, FABIOLA SANTOS DA SILVA ; VIANA, VITÓRIA BEATRIZ DE JESUS ; ALMEIDA, JOÃO LUKAS NUNES ; GONÇALVES, JANETE SILVANA SOUZA ; FEITOSA, ROSIMAR NERIS MARTINS . Hepatocarcinoma in HBV infection is controlled by the use of entecavir, interferon and tenofovir: viral suppression and restoration of hepatic decompensation. Revista Eletrônica Acervo Científico , v. 47, p. e16415, 2024.

• PADILHA, MARCOS DANIEL MENDES. ; MELO, FRANCISCO TIAGO DE VASCONCELOS. ; LAURENTINO, ROGÉRIO VALOIS. ; SILVA, ANDREA NAZARÉ MONTEIRO RANGEL DA SILVA. ; FEITOSA, ROSIMAR NERIS MARTINS. . DYSREGULATION IN THE MICROBIOTA BY HBV AND HCV INFECTION INDUCES AN ALTERED CYTOKINE PROFILE IN THE PATHOBIOME OF INFECTION. Brazilian Journal of Infectious Diseases , v. 29, p. 1-10, 2024.

• ALMEIDA, JOÃO LUKAS NUNES ; PADILHA, Marcos Daniel Mendes ; MONTEIRO, JACQUELINE CORTINHAS ; SILVA, ANDRÉA NAZARÉ MONTEIRO RANGEL DA ; LAURENTINO, ROGÉRIO VALOIS ; LIMA, ALINE CECY ROCHA DE ; COSTA, GREICE DE LEMOS CARDOSO ; PEREIRA, KEISE ADRIELLE SANTOS ; SOUSA, RENATA SANTOS DE ; FEITOSA, ROSIMAR NERIS MARTINS . Coinfecção pela Covid-19 e HIV: Depleção do sistema imunológico e características clínicas em pacientes acometidos. REVISTA ELETRÔNICA ACERVO EM SAÚDE , v. 24, p. e15579, 2024.

• Padilha, Marcos Daniel Mendes ; PEREIRA, KEISE ADRIELLE SANTOS ; ROSA, ALEXANDRE AUGUSTO BENTABERRY ; LAURENTINO, ROGÉRIO VALOIS ; MONTEIRO, JACQUELINE CORTINHAS ; FEITOSA, ROSIMAR NERIS MARTINS . A expressão diferencial de microRNAs virais modula a patogenicidade da infecção. REVISTA ELETRÔNICA ACERVO EM SAÚDE , v. 23, p. e12056, 2023.

• PADILHA, M. D. M. ; VIANA, V. B. J. ; BALCAZAR, OSCAR DAVID ALBITO ; BALCAZAR, A. F. A. ; ALBITO, G. A. A. ; COSTA, A. J. M. ; BALCAZAR, M. C. A. ; FEITOSA, R. N. M. . Perfil de citocinas na patogênese da infecção do vírus Linfotrópico de células T humanas HTLV-1. Brazilian Journal of Health Review , v. 5, p. 12294-12311, 2022.

• MENDES PADILHA, MARCOS DANIEL ; NERIS MARTINS FEITOSA, ROSIMAR . DESREGULAÇÃO DE microRNAs EM PROCESSOS PATOLÓGICOS DO CÂNCER. RECIMA21 - Revista Científica Multidisciplinar - ISSN 2675-6218 , v. 3, p. e3122492, 2022.

• PADILHA, Marcos Daniel Mendes ; RAMOS, SÉRGIO AUGUSTO ANTUNES ; DUARTE, ALICE CARTERS ; SOUSA, RAISSA MELO DE ; BALCAZAR, OSCAR DAVID ALBITO ; MACHADO, CAMILA LORENA RODRIGUES ; PIMENTEL, CLEBSON PANTOJA ; HIRAI, KELLY EMI ; COSTA, GLEYCIANE MACHADO DA ; Holanda, Gustavo Moraes . Imunomodulação de células cancerosas por imunoterapias CAR-T, mAbs, CTLA-4 e neoantígenos direcionados. REVISTA ELETRÔNICA ACERVO EM SAÚDE , v. 15, p. e9959, 2022.

• PADILHA, M. D. M. ; Costa, Ludmilla Ferreira ; LUNA, F. C. F. ; AMORIM, M. T. ; PIMENTEL, C. P. ; FRANCO NETO, W. F. ; FERREIRA, J. F. L. ; HOLANDA, G. M. . Inibidores de Ebna1 como alvos para terapias associadas a oncogênese do herpesvírus humano 4 / Ebna1 inhibitors as targets for therapies associated with oncogenesis of human herpesvirus 4. Brazilian Journal of Health Review , v. 4, p. 20685-20703, 2021.

• Padilha, Marcos Daniel Mendes ; Holanda, Gustavo Moraes . POSSÍVEIS ALVOS PARA TERAPIAS DIRECIONADAS ANTI-HTLV. In: Rossano Sartori Dal Molin & Anderson Nunes Lopes. (Org.). POSSÍVEIS ALVOS PARA TERAPIAS DIRECIONADAS ANTI-HTLV. 1ed.Guarujá: Científica, 2021, v. 1, p. 118-128.

• Padilha, Marcos Daniel Mendes ; Holanda, Gustavo Moraes . FISIOPATOGENIA, IMUNOPATOGÊNESE, ONCOGENICIDADE E MUTAÇÕES POR HTLV-1/2. In: Rossano Sartori Dal Molin & Anderson Nunes Lopes. (Org.). INFECTOLOGIA BASES EPIDEMIOLÓGICAS E CLÍNICAS. 1ed.Guarujá: Científica Digital, 2021, v. 1, p. 129-139.

• PADILHA, M. D. M. ; Costa, Ludmilla Ferreira . microRNAs E SUAS APLICAÇÕES COMO POSSÍVEIS ALVOS TERAPÊUTICOS PARA TERAPIA GÊNICA. In: Edson da Silva. (Org.). Conhecimentos e Desenvolvimento de Pesquisas nas Ciências da Saúde 4. 4ed.Ponta Grossa: ATENA, 2020, v. 4, p. 1-325.

• PADILHA, M. D. M. ; Costa, Ludmilla Ferreira . ASPECTOS MOLECULARES DA IMUNOTERAPIA E EFICÁCIA IMUNOMODULADORA DOS CHECKPOINTS COMO TERAPIAS ANTI-CÂNCER. In: Rossano Sartori Dal Molin. (Org.). https://www.editoracientifica.org/books/isbn/978-65-87196-49-7. 1ed.Belo Horizonte: Belo Horizonte, 2020, v. 3, p. 1-722.

• Padilha, Marcos Daniel Mendes ; Holanda, Gustavo Moraes ; Costa, Ludmilla Ferreira . ANÁLISE BIBLIOGRÁFICA DE microRNAs ENVOLVIDOS POR INFECÇÕES POR ARBOVIROSES DA FAMÍLIA FLAVIVIRIDAE. In: Edson da Dilva. (Org.). Tópicos Multidisciplinares em Ciências Biológicas 3. 3ed.Ponta Grossa: Atena Editora, 2020, v. 3, p. 28-30.

• MDM Padilha ; SANTOS, L. C. C. P. ; CORREA, L. C. ; MATOS, F. S. D. S. ; Feitosa, R. N. M . INCIDENCE OF HEPATITIS B VIRUS (HBV) AND HEPATITIS C VIRUS (HCV) CASES IN PARÁ NORTHERN BRAZIL. In: Congresso Regional em Saúde Pública, 2024, Vitória. INCIDENCE OF HEPATITIS B VIRUS (HBV) AND HEPATITIS C VIRUS (HCV) CASES IN PARÁ NORTHERN BRAZIL, 2024.

• PADILHA, M. D. M. . FISIOPATOGENIA, QUADRO ONCOGÊNICO E SÍNDROMES PATOLÓGICAS RELACIONADAS AO HTLV-1/2. In: II Jornada Científica Lidipa, 2019, Belém-Pa. II Jornada Científica Lidipa, 2019.

• PADILHA, Marcos Daniel Mendes ; SANTOS, LUCIANA CRISTINA COELHO PANTOJA ; FEITOSA, ROSIMAR NERIS MARTINS . NOTIFICAÇÃO DE CASOS DA FEBRE DE CHIKUNGUNYA NO ESTADO DO PARÁ E IMPLICAÇÕES NOS ÚLTIMOS ANOS PARA A SAÚDE PÚBLICA. In: IV Congresso Brasileiro de Saúde Pública, 2024. Anais do IV Congresso Brasileiro de Saúde Pública, 2024. v. 5.

• PADILHA, M. D. M. ; HOLANDA, G. M. ; Costa, Ludmilla Ferreira . ANÁLISE BIBLIOGRÁFICA DA COVID-19 UMA EMERGÊNCIA DE SAÚDE PÚBLICA. In: IV CONGRESSO NACIONAL DE URGÊNCIA E EMERGÊNCIA, 2020, Belém. IV CONGRESSO NACIONAL DE URGÊNCIA E EMERGÊNCIA, 2020.

• PADILHA, M. D. M. ; Costa, Ludmilla Ferreira . ANÁLISE BIBLIOGRÁFICA DO FENÓTIPO MUTANTE E PERFIL CLÍNICO DA SÍNDROME KLINEFELTER. In: IV CONGRESSO NACIONAL DE URGÊNCIA E EMERGÊNCIA, 2020, Belém. IV CONGRESSO NACIONAL DE URGÊNCIA E EMERGÊNCIA, 2020.

• PADILHA, M. D. M. ; HOLANDA, G. M. . ANÁLISE BIBLIOGRÁFICA DAS PROTEÍNAS NÃO ESTRUTURAIS DO ZIKV E SUA RESPECTIVA MUTAÇÃO EM NS1 RELACIONADA A PATOGENICIDADE EM MICROCEFALIA E DESORDENS NEUROLÓGICAS COMO GUILLAIN-BARRÉ. In: I Congresso Paraense de Saúde Mental Urgência e Emergência, 2019, Belém. I Congresso Paraense de Saúde Mental Urgência e Emergência, 2019.

• PADILHA, M. D. M. ; HOLANDA, G. M. . ONCOGÊNESE POR EPSTEIN-BARR ASSOCIADA AO QUADRO AGUDO DE PACIENTES INFECTADOS: REVISÃO DE LITERATURA. In: I Congresso Paraense de Saúde Mental Urgência e Emergência, 2019, Belém. I Congresso Paraense de Saúde Mental Urgência e Emergência, 2019.

• PADILHA, M. D. M. ; HOLANDA, G. M. . CARACTERIZAÇÃO DA IMUNOPATOGÊNESE E ONCOGENICIDADE POR HTLV1/2 EM PACIENTES IMUNOCOMPROMETIDOS: UMA METANÁLISE. In: I Congresso Nacional de Doenças Crônicas e Infectocontagiosas, 2019, Belém-Pa. I Congresso Nacional de Doenças Crônicas e Infectocontagiosas, 2019.

• PADILHA, M. D. M. ; HOLANDA, G. M. . microRNAs ENVOLVIDOS NA IMUNOSSUPRESSÃO, REPLICAÇÃO,ONCOGENICIDADE E PATOGÊNESE DE KSHV DE LINHAGENS CELULARES LECS/BECS E POSSÍVEIS ALTERNATIVAS DE TERAPIA GÊNICA: REVISÃO SISTEMÁTICA. In: I congresso Nacional de Doenças Crônicas e Infectocontagiosas, 2019, Belém-Pa. I congresso Nacional de Doenças Crônicas e Infectocontagiosas, 2019.

• PADILHA, M. D. M. ; FREITAS, A. B. ; HOLANDA, G. M. . ANÁLISE BIBLIOGRÁFICA DE microRNAs ENVOLVIDOS POR INFECÇÕES POR ARBOVIROSES DA FAMÍLIA FLAVIVIRIDAE. In: II SDIPA - Simpósio de Doenças Infecto Parasitárias na Amazônia, 2018, BELÉM. II SDIPA - Simpósio de Doenças Infecto Parasitárias na Amazônia, 2018.

• RAMOS, S. A. A. ; PADILHA, M. D. M. ; MOREIRA, R. M. ; VALE, J. K. L. ; ALENCAR, N. A. N. . Predição In Silico do Loop Catalítico da Diidroorotato Desidrogenase de Leishmania major. In: SEMANA DO QUÍMICO UFPA 2017, 2017, Belém. SEMANA DO QUÍMICO UFPA 2017, 2017.

• MARCOS DANIEL MENDES PADILHA ; Rosimar Neris Martins Feitosa ; Marcos Daniel Mendes Padilha . A DESREGULAÇÃO NA PROTEÍNA TOX PELA INFECÇÃO DO HBV MODULA A PATOGÊNICIDADE DA INFECÇÃO. 2025. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• MARCOS DANIEL MENDES PADILHA ; Rosimar Neris Martins Feitosa ; Marcos Daniel Mendes Padilha . microRNAs NA INFECÇÃO DO HBV PODEM SER ALVOS ÚTEIS COMO BIOMARCADORES PREDITIVOS. 2025. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• MARCOS DANIEL MENDES PADILHA ; Padilha, Marcos Daniel Mendes . BIOMARCADORES TNF-α E IL-2 ESTÃO ASSOCIADOS AO HEPATOCARCINOMA NA INFECÇÃO DO HBV. 2025. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• MARCOS DANIEL MENDES PADILHA ; Rosimar Neris Martins Feitosa ; Padilha, Marcos Daniel Mendes . O PERFIL DE METILAÇÃO É ALTERADO PELA EPIGENÉTICA DO HCV DURANTE A PATOGÊNESE DA INFECÇÃO. 2025. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• MARCOS DANIEL MENDES PADILHA ; Padilha, Marcos Daniel Mendes . A PROTEÍNA HBx DIRECIONA A PATOGÊNESE DO HEPATOCARCINOMA ASSOCIADO AO HBV. 2025. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• MDM Padilha ; SANTOS, L. C. C. P. ; MATOS, FABIOLA SANTOS DA SILVA ; CORREA, L. C. ; Feitosa, R. N. M . INCIDENCE OF HEPATITIS B VIRUS (HBV) AND HEPATITIS C VIRUS (HCV) CASES IN PARÁ NORTHERN BRAZIL. 2024. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Marcos Daniel Mendes Padilha ; SANTOS, L. C. C. P. ; Feitosa, R. N. M . NOTIFICAÇÃO DE CASOS DA FEBRE DE CHIKUNGUNYA NO ESTADO DO PARÁ E IMPLICAÇÕES NOS ÚLTIMOS ANOS PARA A SAÚDE PÚBLICA. 2024. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Marcos Daniel Mendes Padilha ; SANTOS, L. C. C. P. ; Feitosa, R. N. M . INCIDÊNCIA DA INFECÇÃO PELO VÍRUS VARICELA-ZOSTER NA REGIÃO NORTE DO BRASIL. 2024. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Marcos Daniel Mendes Padilha ; SANTOS, L. C. C. P. ; Feitosa, R. N. M . PERFIL DE CASOS DE INFECÇÃO POR Treponema Pallidum EM POPULAÇÕES NA REGIÃO NORTE DO BRASIL. 2024. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Marcos Daniel Mendes Padilha ; SANTOS, L. C. C. P. ; CORREA, L. C. ; Feitosa, R. N. M . INCIDÊNCIA DE CASOS DE INFECÇÃO PELO VÍRUS ZIKA NO ESTADO DO PARÁ E REGIÃO NORTE DO BRASIL. 2024. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Marcos Daniel Mendes Padilha ; ANGELIM, C. C. ; Feitosa, R. N. M . INCIDÊNCIA DE CASOS DE HEPATITES EM GESTANTES INFECTADAS NO ESTADO DO PARÁ, REGIÃO NORTE DO BRASIL. 2024. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• CORREA, L. C. ; MATOS, F. S. D. S. ; SOUSA, R. S. ; SANTOS, S. M. ; MDM Padilha ; Monteiro, J. C ; Vallinoto, A. C. R ; Feitosa, R. N. M . Coinfecção por HIV em indivíduos infectados pelo vírus da hepatite C (HCV) em Belém do Pará. 2024. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• MATOS, F. S. D. S. ; CORREA, L. C. ; SOUSA, R. S. ; SANTOS, S. M. ; MDM Padilha ; COSTA, G. L. C. ; SILVA, A. N. M. R. ; Feitosa, R. N. M . PREVALÊNCIA DE INFECÇÃO PELO HIV EM PESSOAS COM HEPATITE B, ATENDIDAS EM CENTROS DE REFERÊNCIA, EM BELÉM-PA. 2024. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SANTOS, S. M. ; CORREA, L. C. ; MATOS, F. S. D. S. ; SOUSA, R. S. ; MDM Padilha ; CONDE, S. R. S. S. ; Vallinoto, A. C. R ; Feitosa, R. N. M . Prevalência de infecções sexualmente transmissíveis (IST) em portadores do vírus da hepatite B (HBV) ou vírus da hepatite C (HCV) em Belém do Pará. 2024. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• MDM Padilha ; PEREIRA, L. M. S. ; CONDE, S. R. S. S. ; QUEIROZ, M. A. F. ; SILVA, A. N. M. R. ; COSTA, G. L. C. ; VALLINOTO, I. M. V. C. ; Vallinoto, A. C. R ; FEITOSA, R. N. M. . FREQUÊNCIA DO POLIMORFISMO TNF-α (rs1799964) EM INDIVÍDUOS INFECTADOS COM O VÍRUS DA HEPATITE B (HBV) E VÍRUS DA HEPATITE C (HCV). 2024. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• PADILHA, M. D. M. ; Costa, Ludmilla Ferreira ; CARVALHO, L. S. S. ; HOLLES, G. S. ; COSTA, M. N. R. F. . ELABORAÇÃO DE TEATRO DE FANTOCHES PARA AÇÃO DE EDUCAÇÃO AMBIENTAL EM COMUNIDADE RIBEIRINHA. PARÁ. 2019. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• Padilha, MDM ; Silva, S. R. S ; Monteiro, J. C ; SANTOS, L. C. C. P. ; Feitosa, R. N. M . IMMUNOLOGICAL AND VIROLOGICAL BIOMARKERS IN HEPATITIS B VIRUS (HBV) AND HEPATITIS C VIRUS (HCV) CO-INFECTION 2024 (Artigo).

• Padilha, MDM ; MELO, F. T. V. ; Silva, S. R. S ; SANTOS, L. C. C. P. ; Feitosa, R. N. M . OVEREXPRESSION OF VIRAL miRNAs IN HTLV-1, HBV AND HCV INFECTION LEADS TO IMMUNOPATHOGENESIS IN THE DEVELOPMENT OF CANCER 2024 (Artigo).

• MENDES PADILHA, MARCOS DANIEL ; GRAÇAS, D. A. D. . Obtenção de genomas bacterianos a partir de dados metagenômicos da usina hidrelétrica de Tucuruí 2023 (Dissertação de Mestrado).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2025 - Atual

  FERRAMENTAS DE BIOINFORMÁTICA E CIÊNCIAS ÔMICAS, Descrição: Uma riqueza sem precedentes de dados biológicos foi gerada pelo projeto genoma humano e projetos de sequenciamento em outros organismos. A enorme demanda por análise e interpretação desses dados está sendo gerenciada pela ciência em evolução da bioinformática. Bioinformática é definida como a aplicação de ferramentas de computação e análise para a captura e interpretação de dados biológicos. É um campo interdisciplinar que reúne ciência da computação, matemática, física e biologia. A bioinformática é essencial para o gerenciamento de dados na biologia e medicina modernas. As principais ferramentas de bioinformática estão sendo usadas para interpretar dados biológicos e para aprofundar a compreensão de doenças. As potenciais aplicações clínicas desses dados na descoberta e desenvolvimento de medicamentos também são discutidas (Bayat, 2002). Na descoberta de fármacos, as contribuições da biologia computacional incluem a caracterização dos mecanismos moleculares de ligação de ligantes, a identificação de sítios de ligação/ativos e o refinamento da estrutura das posições de ligação do ligante-alvo. A maioria dessas abordagens indica que os sítios de ligação/ativos na proteína alvo devem ser bem determinados. Resíduos específicos desses sítios de ligação podem ser usados; para guiar a modificação e a otimização do composto líder inicial e gerar novas interações ligante-proteína alvo. Em alguns casos, o envolvimento do sítio ativo é inadequado para explorar a atividade patológica. Mutações distantes do sítio ativo, transições conformacionais, resistência a fármacos e níveis de expressão também são conhecidos por induzir patologias. A biologia computacional, especialmente a simulação biomacromolecular, é um método poderoso para revelar o mecanismo molecular da proteína alvo e fornecer novas perspectivas para o design de fármacos (Zhang et al., 2022). A disponibilidade de vastos e diversos conjuntos de dados públicos permite que pesquisadores computacionais abrangendo cientistas da computação, cientistas de dados, bioinformatas, estatísticos e outros pesquisadores quantitativos que trabalham no domínio de big data analisem conjuntos de dados complexos que exigem habilidades interdisciplinares em ciência da computação e biologia. Aproveitar esses conjuntos de dados para gerar novos conhecimentos e desenvolver abordagens inovadoras para abordar questões biológicas complexas capacita os pesquisadores computacionais a assumir papéis mais independentes e de liderança nas ciências biológicas modernas. Isso permite ainda que os pesquisadores computacionais agreguem tamanhos de amostra maiores, concedendo-lhes o poder estatístico necessário para gerar novos resultados com maior confiabilidade (Deshpandle et al., 2024). À medida que a modelagem estatística evoluiu, maior cuidado foi tomado para isolar medições empíricas que permitem a separação de associações causais de coincidentes. Analistas também trabalharam para comparar sistematicamente modelos causais concorrentes. A análise de causalidade é um paradigma dentro da estatística e do teste de hipóteses dedicado a essas preocupações. Seus métodos foram empregados na biomedicina para determinar relações causais entre medicamentos e efeitos colaterais perigosos, vincular variação genética e fenótipo e separar relações regulatórias genéticas da coocorrência de eventos moleculares (Yao et al., 2009). Desse modo, o objetivo desse projeto de pesquisa é investigar ferramentas de bioinformáticas com algorítmos mais robustos para a predição de dados biológicos, genômicos, proteômicos ou transcriptômicos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcos Daniel Mendes Padilha - Coordenador / Rosimar Neris Martins Feitosa - Integrante / Simone Regina Souza da Silva Conde - Integrante / Francisco Tiago de Vasconcelos Melo - Integrante., Financiador(es): Universidade Federal do Pará - Outra.

• 2025 - Atual

  RESPOSTA CRUZADA DE LINFÓCITOS T NA INFECÇÃO POR HBV, Descrição: Linfócitos T (células T) são divididos em dois subgrupos funcionalmente diferentes: as células T auxiliares CD4+ (Th) e os linfócitos T citotóxicos CD8+ (CTL). A ativação adequada das células T CD4 e CD8 para proliferação, expansão clonal e função efetora é crucial para a eliminação eficiente da infecção por patógenos. A falha em fazê-lo pode levar à exaustão das células T. Após a ativação por células apresentadoras de antígenos, as células T passam por reprogramação metabólica que suporta funções efetoras. Todos os organismos multicelulares estão em uma "corrida armamentista" contra patógenos infecciosos, que incluem bactérias patogênicas, vírus, fungos e parasitas. As defesas primárias contra patógenos infecciosos são as barreiras físicas e químicas da pele e da mucosa, que separam os ambientes externo e interno. A violação dessas barreiras permite que patógenos entrem no corpo, exigindo a ativação do sistema imunológico para eliminar a infecção. O sistema imunológico é um sistema de defesa do hospedeiro que compreende muitas estruturas e processos biológicos dentro de um organismo que defende contra infecções estranhas, bem como células danificadas e transformadas. A capacidade do sistema imunológico de agir de forma otimizada depende de sua capacidade de distinguir o estranho do próprio e de reagir ao não próprio. Em organismos superiores, o sistema imunológico é classificado em sistema imunológico inato e adaptativo. O sistema imunológico inato é rapidamente engajado de maneira inespecífica em patógenos estranhos ou próprios danificados por meio do reconhecimento de padrões moleculares associados a patógenos (PAMP) ou padrões moleculares associados a danos (DAMP). Em contraste com o sistema imunológico inato, o sistema imunológico adaptativo é ativado por um período de tempo mais longo e está associado à ativação controlada de linfócitos T e B (células T e B), com imensa especificidade em relação aos seus alvos e memória imunológica (Wik; Skalhegg, 2022). Os linfócitos T CD8+ são de importância crucial na depuração do HBV. Além disso, é difícil obter depuração viral persistente e conversão sorológica do antígeno de superfície da hepatite B (HBsAg) em pacientes infectados com HBV, o que pode estar associado à deficiência da imunidade adaptativa específica do HBV (Xie et al., 2022). Dados recentes mostram que essas células T exauridas hiperexpressam a molécula de morte programada 1 (PD-1) e que o bloqueio do envolvimento de PD-1 com seu ligante (PD-L1) leva a um aumento das funções antivirais dessas células T. A caracterização dos defeitos funcionais de células T específicas de vírus em pacientes com infecção crônica pelo vírus da hepatite B (HBV), uma condição que afeta 350 milhões de pessoas em todo o mundo, ainda é amplamente incompleta e frequentemente baseada em uma dicotomia simplificada entre pacientes que controlam a infecção aguda e indivíduos com cronicidade estabelecida. Embora esteja bem documentado que os pacientes que conseguem resolver a infecção pelo HBV expressam uma resposta de células T específica para o VHB vigorosa e funcionalmente eficiente, o grau de comprometimento das células T específicas para o HBV que afetam os pacientes cronicamente infectados foi até agora apenas parcialmente analisado com pequenos grupos de pacientes usando um conjunto limitado de epítopos restritos ao HLA-A2 bem caracterizados ou focando principalmente nas respostas restritas ao HLA classe II direcionadas aos antígenos estruturais do HBV (Boni et al., 2007). Desse modo, o objetivo desse projeto de pesquisa é analisar a resposta cruzada de linfócitos T na infecção pelo HBV.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcos Daniel Mendes Padilha - Coordenador / Rosimar Neris Martins Feitosa - Integrante / Simone Regina Souza da Silva Conde - Integrante / Francisco Tiago de Vasconcelos Melo - Integrante., Financiador(es): Universidade Federal do Pará - Outra.

• 2025 - Atual

  INTERATOMA HUMANO E DE AGENTES BIOLÓGICOS INFECCIOSOS, Descrição: Interações proteína-proteína (IPP) são essenciais para a função biológica. Avanços recentes na análise coevolutiva e na predição de estrutura proteica baseada em Aprendizado Profundo (DL) permitiram a identificação abrangente de IPP em proteomas bacterianos e de leveduras, mas essas abordagens têm tido sucesso limitado até o momento para o proteoma humano mais complexo. Características como: 1) aprimorando os sinais coevolutivos com alinhamentos de sequências múltiplas 7 vezes mais profundos, coletados de 30 petabytes de dados genômicos não montados, e 2) desenvolvendo uma nova rede DL treinada em conjuntos de dados aumentados de interações domínio-domínio de 200 milhões de estruturas proteicas previstas. Esses avanços nos permitem rastrear sistematicamente 200 milhões de pares de proteínas humanas e prever 18.316 IPPs com uma precisão esperada de 90, entre as quais 5.578 são novas previsões. Modelos 3D desses IPPs previstos quase triplicam o número de IPPs humanos com informações estruturais precisas, fornecendo inúmeros insights sobre a função das proteínas e os mecanismos de doenças humanas (Zhang et al., 2024). Um objetivo central da biologia celular é descrever os processos moleculares que impulsionam a função celular. Embora sejam codificados genomicamente, são executados pelo proteoma. O proteoma pode ser visto como constelações de módulos proteicos interagentes, organizados em redes de transdução de sinais, máquinas moleculares e organelas. No entanto, nosso conhecimento da arquitetura do proteoma é fragmentário, assim como nossa concepção de como a interconectividade proteica é influenciada pela variação genética e celular. Dada essa perspectiva, os desafios restantes dizem respeito ao mapeamento global das interações de proteínas humanas dentro de um único tipo de célula em um contexto fisiológico e à compreensão de como a arquitetura da rede depende da variação genética e fisiológica. Esses desafios refletem 1) a miríade de genes, isoformas e estados de modificação codificados pelo genoma humano; 2) a baixa abundância de muitas proteínas, o que limita a detecção; 3) as muitas interações transitórias que complicam o mapeamento da rede de sinalização; e 4) a prevalência de proteínas de membrana, que frequentemente requerem métodos especializados para purificação (Huttlin et al., 2015). O corpo humano abriga uma vasta e diversa comunidade de microrganismos, coletivamente chamados de microbioma. Começando com os micróbios encontrados no ambiente fetal, esses organismos influenciam significativamente o desenvolvimento dos tecidos e órgãos humanos desde a primeira infância, desempenhando um papel crucial na formação e regulação do sistema imunológico. Em crianças, o microbioma oral é estabelecido principalmente por meio da transmissão vertical de micróbios orais da saliva materna, embora possa ocorrer colonização limitada de outros cuidadores. O microbioma materno é essencial para o treinamento do sistema imunológico no início da vida, introduzindo diversos sinais microbianos. Na idade adulta, os micróbios podem sobrecarregar o hospedeiro humano com doenças sistêmicas ou fornecer proteção contra infecções, contribuindo para a saúde geral. Há um debate em andamento sobre se os patógenos colonizam inicialmente a boca antes de migrarem para os tecidos sistêmicos, ou se eles primeiro infectam os locais sistêmicos e posteriormente chegam à boca, ou mais provavelmente, infectam seu hospedeiro por meio de múltiplas rotas. A aquisição e o estabelecimento de uma microbiota saudável são cruciais para uma relação simbiótica hospedeiro-microbiota. A exposição a vírus, bactérias e outros, pode ter efeitos duradouros na saúde geral, sendo necessário estratégias que possam compreender o interatoma hospedeiro-patógeno em humanos (Murray et al. 2024). O objetivo desse projeto é identificar/analisar as vias de interação hospedeiro patógeno.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcos Daniel Mendes Padilha - Coordenador / Rosimar Neris Martins Feitosa - Integrante / Simone Regina Souza da Silva Conde - Integrante / Francisco Tiago de Vasconcelos Melo - Integrante., Financiador(es): Universidade Federal do Pará - Outra.

• 2025 - Atual

  BIOMARCADORES DE HCV, Descrição: Biomarcadores relacionados ao fígado foram desenvolvidos e validados principalmente em pacientes com hepatite C crônica para a predição de fibrose hepática ou cirrose, que é uma via final de lesão hepática crônica. Eles são não invasivos, rastreáveis; e fáceis de usar. Os biomarcadores fornecem implicações relacionadas à triagem, diagnóstico, tratamento e prognóstico da hepatite crônica. Para a melhoria do desempenho e da cobertura, painéis de biomarcadores, biomarcadores de imagem e até mesmo biomarcadores genéticos foram desenvolvidos. Com o avanço da genômica e proteômica, uma predição mais precoce e precisa é esperada em um futuro próximo. Nesta revisão, vários painéis de biomarcadores para a estimativa do grau de fibrose na hepatite C crônica, biomarcadores para a triagem e diagnóstico da hepatite C, biomarcadores para o tratamento da hepatite C, biomarcadores para a predição de complicações relacionadas à hepatite C crônica e perspectivas futuras serão resumidos.Biomarcador é definido como uma característica que é objetivamente medida e avaliada como um indicador de processos biológicos normais, processos patogênicos ou respostas farmacológicas/farmacodinâmicas a uma intervenção terapêutica. O desfecho clínico foi definido como uma característica ou variável que reflete como um paciente se sente, funciona ou sobrevive. E desfechos substitutos foram definidos como um subconjunto de biomarcadores destinados a substituir um desfecho clínico que deve prever benefícios ou danos clínicos ou a ausência de ambos. A infecção pelo vírus da hepatite C (HCV) é uma das principais causas de doença hepática crônica e o número estimado de pessoas infectadas é de cerca de 160 milhões em todo o mundo. Embora o impacto da infecção pelo HCV seja variável, essas pessoas infectadas podem, em última análise, progredir para cirrose hepática (LC) e/ou carcinoma hepatocelular (HCC).O atendimento clínico para pacientes com doença hepática relacionada ao HCV avançou consideravelmente nas últimas duas décadas. Até 2011, a combinação de interferon peguilado (PegIFN); e ribavirina era o tratamento aprovado para hepatite C crônica (CHC). Com este regime, as taxas de resposta virológica sustentada (RVS) variam, dependendo dos genótipos virais e fatores do hospedeiro. Após a primeira geração, antivirais de ação direta (DAAs) foram aprovados em 2011, vários novos DAAs, incluindo sofosbuvir, simeprevivir e daclatasvir são licenciados e muitos outros medicamentos orais devem ser aprovados nos próximos anos. Com a rápida melhoria da terapêutica, os resultados da infecção pelo HCV podem ser prevenidos e, finalmente, podem oferecer o potencial de uma cura para mais pacientes do que era possível anteriormente. Como consequência, o cenário de biomarcadores na infecção pelo HCV evoluirá substancialmente no futuro próximo (Park; Bang; Kim, 2015). O câncer de fígado é o sexto câncer mais comum e a terceira causa de morte relacionada ao câncer. O carcinoma hepatocelular (CHC) representa mais de 90 dos cânceres primários de fígado e sua incidência está aumentando em todo o mundo, sendo um grande problema de saúde global. A infecção crônica pelo vírus da hepatite C (HCV) é uma das principais causas de doença hepática, cirrose e carcinoma hepatocelular (HCC) em pacientes alcoólatras. A infecção crônica pelo HCV é fator de risco independentes e significativos para o desenvolvimento de doença hepática em estágio terminal e progressão para HCC, que agem sinergicamente para acelerar a lesão hepática. Assim, observa-se que pacientes infectados pelo HCV apresentam ocorrência mais rápida e frequente de fibrose e cirrose (Macia et al., 2017). Logo, o objetivo desse projeto de pesquisa foi investigar nos bancos de dados e na literatura, biomarcadores de resposta inflamatória na infecção crônica e aguda ocasionada pelo HCV.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcos Daniel Mendes Padilha - Coordenador / Rosimar Neris Martins Feitosa - Integrante / Simone Regina Souza da Silva Conde - Integrante / Francisco Tiago de Vasconcelos Melo - Integrante., Financiador(es): Universidade Federal do Pará - Outra.

• 2024 - Atual

  BIOMARCADORES IMUNOLÓGICOS E VIROLÓGICOS NA COINFECÇÂO PELO VIRUS DA HEPATITE B (HBV) E VÍRUS DA HEPATITE C (HCV), Descrição: Biomarcadores imunológicos, como citocinas séricas, quimiocinas, adipocitocinas, formas solúveis de receptores celulares e marcadores de ativação imunológica podem servir como marcadores substitutos para ativação celular e desempenhar um papel importante na função do sistema imunológico. Interações complexas entre células imunes dos sistemas imunes inato e adaptativo são modificadas pela liberação de uma variedade de mediadores celulares que desencadeiam respostas inflamatórias que ajudam a eliminar e destruir antígenos estranhos. Eles desempenham inúmeras funções dentro do nosso sistema imunológico e interagem com tipos de células específicas que correspondem a diferentes estágios da doença. Alterações nos níveis desses biomarcadores, juntamente com alterações na atividade do subconjunto de linfócitos, podem fornecer um valor prognóstico importante, refletindo as condições da doença subjacente (Aziz et al., 2019). A prevalência da coinfecção pelos vírus da hepatite B (HBV) e vírus da hepatite C (HCV) não é incomum em países de áreas epidêmicas porque compartilham rotas comuns de transmissão. Pacientes com coinfecção HBV/HCV apresentam maior risco de doença hepática avançada, cirrose e carcinoma hepatocelular (CHC) do que aqueles commonoinfecção. Esta população também carrega o risco da reativação do DNA do HBV após ação direta do HCVtratamento antiviral. Portanto, entender o vírus interações e aspectos moleculares da coinfecção HBV/HCV são importantes para o tratamento. Pacientes com coinfecção HBV/HCV apresentam grande espectro de perfis virológicos, o que demonstra a complexidade da interação entre os dois vírus. O cenário clínico mais comum entre coinfectados pacientes é a predominância do HCV com altos níveis de RNA do HCV e baixos níveis de DNA do HBV; alguns pacientes experimentam predominância do HBV com altos níveis de DNA do HBV e baixos níveis de RNA do HCV, enquanto outros apresentam fases alternadas de dominância de um vírus sobre o outro. Uma vez que a presença de viremia do VHC pode suprimir o VHB DNA, o status da infecção pelo HBV não pode ser avaliado com DNA do HBV simplesmente devido à persistência de DNA circular covalentemente fechado (cccDNA) nos núcleos de hepatócitos infectados. Embora a biópsia hepática seja o técnica mais precisa para quantificação de cccDNA intra-hepático, sua utilidade é limitada por sua natureza invasiva, o potencial de erro de amostragem e a falta de um ensaio padronizado. Vários biomarcadores não invasivos, incluindo antígeno de superfície da hepatite B (HBsAg), hepatite antígeno relacionado ao núcleo B (HBcrAg) e pré-genômico do HBV RNA (pgRNA do HBV), foram desenvolvidos para refletir o atividade do cccDNA intra-hepático. Evidências crescentes suporta o DNA sérico do HBV correlacionado com o soro HBsAg, HBcrAg e pgRNA de HBV em pacientes sem tratamento antiviral. Esses biomarcadores também servem como marcadores substitutos para refletir a atividade do cccDNA em pacientes com supressão viral e baixo VHB detectável DNA sob terapia com análogos de nucleosídeos/nucleotídeos. No entanto, as evidências acima não revelam as características dos marcadores em pacientes coinfectados VHB/VHC (Tseng et al., 2022). O objetivo desse projeto de pesquisa é investigar a apresentação e as correlações entre biomarcadores do HBV e HCV em pacientes com coinfecção HBV/HCV, através da busca em bases de dados da literatura médica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcos Daniel Mendes Padilha - Coordenador / Rosimar Neris Martins Feitosa - Integrante.

• 2023 - 2023

  O HEPATOCARCINOMA NA INFECÇÃO DO HBV É CONTROLADO PELO USO DE ENTECAVIR, INTERFERON E TENOFOVIR: Supressão viral e restauração da descompensação hepática, Descrição: As epidemias e pandemias virais estimularam o desenvolvimento de agentes antivirais conhecidos e a descoberta de novos agentes antivirais. Cerca de uma centena de medicamentos antivirais mono e combinados já foram aprovados, enquanto milhares estão em desenvolvimento. 7 classes de agentes antivirais: anticorpos neutralizantes, neutralizantes de receptores humanos solúveis recombinantes, sistemas antivirais CRISPR/Cas, interferons, peptídeos antivirais, polímeros de ácidos nucleicos antivirais e pequenas moléculas antivirais. Os interferons e algumas moléculas pequenas, isoladamente ou em combinações, possuem atividade antiviral de amplo espectro, o que pode ser benéfico para o tratamento de infecções virais emergentes e reemergentes (Ianevski et al., 2022). Medicamentos análogos à base de nucleotídeos e nucleosídeos são amplamente utilizados para o tratamento de infecções virais agudas e crônicas. Estas drogas inibem a replicação viral devido a um ou mais mecanismos distintos, modificando a estrutura genética do vírus e reduzindo a capacidade viral em cada ciclo de replicação. O seu sucesso clínico demonstrou forte eficácia contra vários vírus, incluindo o ebolavírus, o vírus da hepatite B e C (HBV/HCV), HIV, MERS, SARS-Cov e o mais recente emergente SARS-Cov2 (Alwad, 2022). A hepatite B crónica (CHB) é um grande fardo para a saúde, com cerca de 400 milhões de pessoas afetadas em todo o mundo, sendo que milhares de pessoas com CHB podem desenvolver complicações, incluindo cirrose, doença hepática descompensada e carcinoma hepatocelular (CHC). A transmissão do vírus da hepatite B (HBV) ocorre por via parenteral e sexual, o HBV liga-se aos receptores de superfície dos hepatócitos hospedeiros e é internalizado através do processo de endocitose, o DNA circular viral parcialmente de fita dupla sofre reparo dentro dos núcleos, com a formação de DNA circular covalentemente fechado (cccDNA). O cccDNA serve como modelo transcricional para a enzima RNA polimerase II hospedeira, os transcritos de RNA resultantes são então transportados para o citoplasma, onde são traduzidos em proteínas do envelope viral, núcleo e polimerase. Existem atualmente duas classes principais de agentes antivirais aprovados para o tratamento da HBC: agentes imunomoduladores (incluindo interferon; convencional e peguilado) e análogos de nucleotídeos/nucleosídeos (ANs) orais. O mecanismo exato pelo qual o interferon exerce o seu efeito antiviral, ativação e modulação de várias vias imunológicas de citocinas que inibem a replicação viral ainda não é totalmente compreendido. Atualmente existem cinco ANs aprovados para o tratamento da HBC, incluindo três análogos de nucleosídeos (lamivudina, telbivudina e entecavir) e dois análogos de nucleotídeos (adefovir e tenofovir). Em contraste com o efeito imunomodulador do interferon, os ANs atualmente disponíveis têm como alvo a polimerase e transcriptase reversa do HBV, que são essenciais para a replicação viral. Os ANs atuam por inibição direta, por meio de ligação competitiva com substratos endógenos ou por incorporação ao DNA viral para atuar como terminadores de cadeia (Fung et al., 2011). Diante do exposto, os objetivos desse projeto de pesquisa são definir mecanismos moleculares neutralizantes pelo uso de interferon, entecavir e tenofovir contra o vírus; avaliar como ocorre o processo de restauração da função hepática; e analisar o perfil de resposta imunológica sobre a patogênese da infecção do HBV através de pesquisa na literatura e em banco dedados.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Especialização: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcos Daniel Mendes Padilha - Coordenador / Rosimar Neris Martins Feitosa - Integrante.

• 2023 - Atual

  EXPRESSÃO GÊNICA E POLIMORFISMOS DE BIOMARCADORES IMUNOGENÉTICOS EM INDIVÍDUOS INFECTADOS PELO VÍRUS DA HEPATITE B (HBV) OU PELO VÍRUS DA HEPATITE C (HCV), Descrição: A história da pesquisa moderna sobre hepatite viral (HV) começou no ano de 1963, quando o vencedor do nobel Baruch S. Blumberg (1925-2011) relatou pela primeira vez a descoberta de um novo antígeno chamado antígeno da Austrália (AuAg), nos anos seguintes o AuAg se tornaria o primeiro biomarcador específico de hepatite viral. O HBV é um vírus hepatotrópico, foi detectado pela primeira vez no soro de aborígenes australianos durante a década de 60, o antígeno descoberto naquela época, inicialmente denominado de antígeno da Austrália e atualmente chamado de antígeno de superfície do HBV (HBsAg), foi frequentemente observado em pacientes com leucemia. O HBV (Hepatitis B virus) pertence ao gênero Orthohepadnavirus e à família Hepadnaviridae, a qual faz parte do reino Riboviria, ordem Blubervirales, devido a homologia entre a transcriptase reversa do vírus e a polimerase de RNA dirigida por RNA de vírus de RNA. O HCV (Hepacivirus hominis) pertence à família Flaviviridae e ao gênero Hepacivirus, as partículas virais de HCV são heterogêneas e uma quantidade significativa está associada a lipoproteínas celulares e o genoma do HCV de RNA de cadeia simples (+). Os vírus causadores de hepatite são uma grande ameaça à saúde humana e são causas de morbimortalidade global significativa. São conhecidas cinco espécies virais (A, B, C, D e E), todos hepatotrópicos, associados à síndrome da hepatite viral. No Brasil, de acordo com os dados do Boletim epidemiológico de hepatites virais, no período de 2000 a 2020, foram identificados 82.169 óbitos por causas associadas a hepatites virais, sendo que de 2000 a 2021 foram notificados 264.640 casos confirmados de hepatite B e 279.872 casos de hepatite C, agentes esses associados aos quadros de hepatite crônica. Os portadores de hepatites crônicas têm obstáculos significativos a ultrapassar, como a falta de sensibilização, a vulnerabilidade, conflitos no desenvolvimento de políticas e na implementação de programas. Apesar da implementação de medidas de controle de infecções ao longo das décadas, a erradicação ou redução significativa da doença continuam indefinidas. Nesse contexto, a utilidade clínica de biomarcadores imunogenéticos em relação ao curso da infecção, progressão da doença e resposta aos tratamentos atuais sugere um caminho a seguir. Desse modo, biomarcadores imunogenéticos como a IL-10, o TNF alfa, IL-17 e IL-2 se tornaram alvos de estudos moleculares para compreensão da patogênese do HBV e HCV. Logo, o objetivo desse projeto de pesquisa será caracterizar o perfil e a frequência dos biomarcadores imunogenéticos IL-10, TNF alfa, IL-17 e IL-2 em indivíduos infectados com o HBV ou HCV assintomáticos ou sintomáticos, em Belém do Pará, região Norte do Brasil, buscando correlacionar com os dados clínicos e epidemiológicos estabelecidos. O estudo será realizado no período de dezembro de 2023 a novembro de 2027, no qual serão incluídos indivíduos com diagnóstico confirmado de infecção pelo HBV ou pelo HCV, que responderão um questionário epidemiológico e dos quais serão coletadas amostras de sangue periférico (10 mL) em tubos com EDTA, que serão transportadas ao Laboratório de Virologia da UFPA para a realização da extração de DNA, RNA e os testes de biologia molecular. A quantificação relativa da expressão gênica e a análise dos polimorfismos serão feitas pela técnica de PCR em tempo real. As informações clínico epidemiológicas serão obtidas por meio de consulta aos prontuários dos indivíduos ou em sistemas informatizados, com a devida autorização das instituições e serão organizadas em um banco de dados para posterior realização das análises estatísticas. Espera-se com os resultados deste estudo determinar os biomarcadores imunogenéticos mais expressos e desregulados na patogênese das hepatites (HBV/HCV), bem como chamar a atenção para estratégias de conduta no tratamento desses indivíduos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (3) / Mestrado acadêmico: (5) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Marcos Daniel Mendes Padilha - Integrante / Simone Regina de Souza da Silva Conde - Integrante / Julius Caesar Mendes Soares Monteiro - Integrante / Ronaldo Costa Monteiro - Integrante / José Carlos Pinheiro Maués - Integrante / Rita de Cássia Ferreira de Moraes - Integrante / Heliane Reis Amador - Integrante / Antonio Carlos Rosário Vallinoto - Integrante / Andrea Nazaré Monteiro Rangel da Silva - Integrante / Jacqueline Cortinhas Monteiro - Integrante / Cintia Yolette Urbano Pauxis Aben Athar - Integrante / Greice de Lemos Cardoso Costa - Integrante / Maria Alice Freitas Queiroz - Integrante / Luiz Fernando Almeida Machado - Integrante / Rosimar Neris Martins Feitosa - Coordenador / Sandra Souza Lima - Integrante / Mauro Sérgio Moura de Araújo - Integrante / Renata Santos de Sousa - Integrante / Keise Adrielle Santos Pereira - Integrante / Alesson Adam Fonseca Andrade - Integrante / Carolina Cabral Angelim - Integrante / Letícia Dias Martins - Integrante., Financiador(es): LABVIR/Laboratório de Virologia - Bolsa.

• 2021 - 2023

  OBTENÇÃO DE GENOMAS BACTERIANOS A PARTIR DE DADOS METAGENÔMICOS DA USINA HIDRELÉTRICA DE TUCURUÍ, Descrição: Para Wagg et al. (2021), as composições das comunidades microbianas são altamente dinâmicas, e as mudanças na composição levam a alterações nas funções dos ecossistemas. Zheng et al. (2019) afirmam que bactérias, arquéias e fungos contribuem para decomposição de matéria orgânica, dinâmica do carbono (C) e ciclagem de nutrientes. De acordo com Jiao et al. (2021), algumas espécies de bactérias podem sintetizar antibióticos afetando a competição interespecífica por recursos, como compostos voláteis, para inibir a germinação de esporos fúngicos, crescimento, atividade enzimática e expressão gênica e transformações bioquímicas são realizadas por redes biomoleculares complexas. Bactérias e comunidades microbianas, estão associados a incrustação microbiana e corrosão em sistemas de distribuição de água terrestre, a percepção de bactérias e arquéias como organismos unicelulares autônomos está mudando constantemente à medida que a capacidade de viver em comunidades estruturadas conhecidas como biofilmes é descoberta em espécies que abrangem amplos grupos taxonômicos. Comunidades microbianas são compostas por muitas células microbianas, frequentemente de várias espécies, mantidas dentro de uma comunidade microbiana acopladas a mecanismos fundamentais para a microbiologia, incluindo quorum sensing, transferência horizontal de genes e a secreção de enzimas que degradam material complexo, fazendo com que a sua bioquímica e fisiologia sejam alvos de estudos e pesquisas experimentais. Este projeto tem como finalidade uma compreensão estrutural, genética e metabólica de bactérias na Usina Hidrelétrica de Tucuruí (Região Norte do Brasil), utilizando uma abordagem multi-ômica, genômica e metagenômica com sequenciamento de nova geração para obtenção de genomas dos táxons presentes, determinação das vias metabólicas e atividade microbiana. Para isto,amostras serão coletadas e analisadas nas plataformas de sequenciamento mais eficientes e com as ferramentas de bioinformática mais atuais, para análise metagenômica total (Shotgun) e caracterizar as espécies de bactérias em um sistema hídrico e obter genomas montados por metagenomas, delinear a diversidade biológica, perfil genético, compreender sua ecologia e aspectos bioquímicos. Tucuruí é a segunda maior Usina Hidrelétrica (UHE) brasileira, o lago artificial no município de Tucuruí alterou o ecossistema da região. Muitos microrganismos de vida livre responsáveis pela degradação de biomassa, decomposição de matéria orgânica, ciclos biogeoquímicos e alguns de interesse clínico como no caso de bactérias com genes de resistência a antibióticos (ARGs) estão adaptados para viver no reservatório do lago. Esta pesquisa tem por objetivo a obtenção de genomas bacterianos por dados metagenômicos e identificar o perfil funcional e metabolismos de bactérias no lago. Amostras de água e sedimento foram coletadas no lago da UHE de Tucuruí nas camadas fótica, afótica e sedimentar das estações do montante 1 (M1) e do montante do novo repartimento (MR). Após a filtração em membrana de nitrocelulose as amostras de DNA foram extraídas usando o Ultraclean Microbial kit (Qiagen). O sequenciamento de metagenoma WGS foi realizado na plataforma Ion ProtonTM (Thermo Fisher Scientific). Foi utilizado o Megahit para a montagem de novo, Open Reading Frame (ORFs) foram previstas usando Prodigal e para quantificar a completude foi usado o Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs (BUSCO), os bins foram classificados nos banco de dados do RDP classifier e Blastn. Os filos foram definidos em nível de gênero e espécie onde foi encontrado uma microbiota diversa e extremamente conservada, o perfil funcional dos MAGs (Genomas montados em metagenomas) corroborou com outros estudos de metagenomas de lagos oligotróficos (Widder et al., 2016; Belstrm et al., 2017; Cottier et al., 2018; Dahle et al., 2013; Nakamura et al., 2016). , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Marcos Daniel Mendes Padilha - Integrante / Diego Assis das Graças - Coordenador / Artur Luiz da Costa da Silva - Integrante / Rommel Thiago Jucá Ramos - Integrante / Adriana Ribeiro Carneiro - Integrante / Luís Carlos Guimarães - Integrante., Financiador(es): CNPq - Bolsa.

• 2018 - 2019

  FISIOPATOGENIA, IMUNOPATOGÊNESE, ONCOGENICIDADE E MUTAÇÕES POR HTLV1/2 E POSSÍVEIS ALVOS TERAPÊUTICOS ANTI-HTLV, Descrição: A infecção pelo vírus linfotrópico de células T humanas (HTLV) ocorre há milhares de anos. No entanto, o conhecimento sobre a sua patogênese é recente. Esse vírus é endêmico em várias regiões do mundo. No Brasil encontra-se presente em todos os estados, com prevalências variadas, sendo estimado cerca de 2,5 milhões de infectados. Fatores genéticos e imunológicos do hospedeiro são os principais responsáveis pelas manifestações clínicas associadas, que podem ser divididas em três categorias: neoplásicas, inflamatórias e infecciosas. Destacam-se a mielopatia associada ao HTLV (HAM/TSP) e a leucemia/linfoma de células T do adulto (ATLL) como as primeiras doenças associadas a esse retrovírus. Posteriormente, inúmeras outras doenças têm sido correlacionadas a esse vírus. O vírus lintrofotrópico de células T humano tipo 1 (HTLV-1) foi descrito em 1980 como o primeiro retrovírus humano, isolado de um paciente com linfoma cutâneo de células T.O HTLV-1 é endêmico em várias regiões do mundo, como no sul do Japão, Caribe, África, América do Sul e ilhas da Melanésia. No Brasil, o vírus está presente em todos os estados onde foi pesquisado, com prevalências variadas. Estima-se aproximadamente 2,5 milhões de pessoas infectadas. O HTLV-2 também se encontra presente, sendo significativa a sua prevalência entre populações indígenas brasileiras. Os portadores, em sua maioria, permanecem assintomáticos por toda a vida. Fatores genéticos e imunológicos do hospedeiro são os principais responsáveis pelo aparecimento das doenças associadas (Romanelli et al., 2010). Gessain et al. (1985), demonstraram que pacientes portadores de paraparesia espástica tropical (Tropical Spastic Paraparesis - TSP), na região da Martinica, apresentavam sorologia positiva para HTLV-1 em 68 dos casos, em 1986, uma condição neurológica similar foi descrita no Japão e denominada mielopatia associada ao HTLV-1 (HTLV-I Associated Mielopathy - HAM). Posteriormente, Román e Osame6 (1988) concluíram tratar-se da mesma doença, passando a ser usado o termo mielopatia associada ao HTLV/ paraparesia espástica tropical (HAM/TSP). Desde então, inúmeras outras doenças vêm sendo correlacionadas com a infecção: uveíte, síndrome de Sjögren, dermatite infecciosa, polimiosite, artropatias, tireoidite, polineuropatias, alveolite linfocitária, linfoma cutâneo de células T, estrongiloidíase, escabiose, hanseníase e tuberculose. Mutações de provírus do vírus linfotrópico T humano 1 (HTLV-1), principalmente a falta da região genômica de repetição terminal longa (LTR) 5', foram descritas e associadas à leucemia/linfoma grave de células T do adulto (ATLL), não- mutações pontuais com baixa carga proviral e resultados indeterminados de Western blotting. Até o momento, não foram descritas informações sobre mutações de provírus do HTLV-2 e suas consequências (Campos e Caterino-de-Araújo, 2020). Diante do exposto esse projeto de pesquisa teve como objetivo, investigar mecanismos responsáveis pela imunopatologia, fisiopatogênese, mutações e possíveis alvos que poderiam ser avaliados como futuras terapias para a infecção ou pelo HLTV-1/2. Logo o objetivo da pesquisa foi caracterizar os aspectos fsiopatológicos da infuência imunológica da infecção por HTLV-1/2, investigar os efeitos de microRNAs, inibidores checkpoints e o transplante de células tronco hematopoiéticas e sua viabilidade para pacientes infectados com HTLV-1 por meio de revisão da literatura.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcos Daniel Mendes Padilha - Coordenador / Gustavo Moraes Holanda - Integrante.

Prêmios