Erica Teixeira Prates

Formação complementar

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Participação em eventos

Produções bibliográficas

• 2013 PRATES, ÉRICA T. ; STANKOVIC, IVANA ; SILVEIRA, RODRIGO L. ; LIBERATO, MARCELO V. ; HENRIQUE-SILVA, FLÁVIO ; PEREIRA, NEI ; POLIKARPOV, IGOR ; SKAF, MUNIR S. . X-ray Structure and Molecular Dynamics Simulations of Endoglucanase 3 from Trichoderma harzianum: Structural Organization and Substrate Recognition by Endoglucanases That Lack Cellulose Binding Module. Plos One , v. 8, p. e59069, 2013.

• 2011 PRATES, É. T. ; Souza, P. C. T. ; Pickholz, M. ; SKAF, M. S. . CHARMM-based parameterization of neutral articaine A widely used local anesthetic. International Journal of Quantum Chemistry , v. 111, p. 1339-1345, 2011.

• 2011 BLEICHER, LUCAS ; POLIKARPOV, IGOR ; GOMES, THIAGO C. F. ; SILVEIRA, RODRIGO L. ; MARTIÌ'NEZ, LEANDRO ; NASCIMENTO, ALESSANDRO S. ; Prates, Erica T. ; ROJAS, ADRIANA L. ; GOLUBEV, ALEXANDER ; SKAF, MUNIR S. . Molecular Basis of the Thermostability and Thermophilicity of Laminarinases: X-ray Structure of the Hyperthermostable Laminarinase from. The Journal of Physical Chemistry. B (1997 : Online) , v. 115, p. 7940-7949, 2011.

• PRATES, É. T. ; Pickholz, M. ; SKAF, M. S. . Articaine self association and interaction with membrane: a theoretical study of local anesthesia. In: The 4th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry, 2008, Ipojuca - PE. Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry, 2008.

• PRATES, É. T. ; SKAF, M. S. . Dinâmica Molecular de Biomoléculas em Soluções Aquosas. In: XV Jornadas de Jóvenes Investigadores, 2007, Assunção. Trabajos Completos, 2007.

• PRATES, É. T. ; SKAF, M. S. . Simulation Studies on Saccharides, Amino Acids and Peptides Aqueous Solutions: Structural and Dynamical Properties. In: XIV Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 2007, Poços de Caldas. XIV Simpósio Brasileiro de Química Teórica - Resumos, 2007.

• SONODA, M. T. ; PRATES, É. T. ; SKAF, M. S. . Water Dynamics in Carbohydrate Solutions. In: XIV Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 2007, Poços de Caldas. XIV Simpósio Brasileiro de Química Teórica - Resumos, 2007.

• PRATES, É. T. ; Pickholz, M. ; SKAF, M. S. . Dinâmica molecular de articaína em membranas POPC. In: I Workshop temático - Novas formulações farmacêuticas de anestésicos locais de ação prolongada, 2009, Campinas. Novas formulações farmacêuticas de anestésicos locais de ação prolongada - Caderno de Resumos, 2009.

• Melo, D. C. ; PRATES, É. T. ; Sabadini, E. ; SKAF, M. S. . Análise de propriedades dinâmicas e estruturais do óxido de polietileno de diferentes comprimentos em solução aquosa. In: IV Escola de Modelagem Molecular de Sistemas Biológicos, 2008, Petrópolis - MG. IV Escola de modelagem molecular de sistemas biológicos, 2008.

• PRATES, É. T. ; SKAF, M. S. . Diámica Molecular de Biomoléculas en Soluciones Acuosas. In: XV Jornadas de Jóvenes Investigadores, 2007, Assunção. Caderno de Resumos, 2007.

• PRATES, É. T. ; SKAF, M. S. . Dinâmica Molecular de Biomolécula em Soluções Aquosas. In: XIV Congresso Interno de Iniciação Científica da UNICAMP, 2006, Campinas. Caderno de Resumos do XIV Congresso Interno de Iniciação Científica da UNICAMP, 2006.

• Prates, Erica T. ; STANKOVIC, I. ; SILVEIRA, R. L. ; LIBERATO, M. V. ; POLIKARPOV, I. ; SKAF, M. S. . Molecular Dynamics SImulations of Oligossaccharide Interactions with Endoglucanases that Lack the Cellulose Binding Domain. 2012. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

• Prates, Erica T. ; SKAF, M. S. . Hyperthermophilic of Laminarinases Studied via HIgh Temperature Molecular Dynamics Simulations. 2011. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• Prates, Erica T. ; GOMES, T. C. F. ; HADDAD, J. J. C. ; SILVEIRA, R. L. ; SKAF, M. S. . Molecular Dynamics Study of the Hyperthermophilic Laminarinase from Rodothermus marinus. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• PRATES, É. T. ; Pickholz, M. ; SKAF, M. S. . Dinâmica molecular de articaína em membranas POPC. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• PRATES, É. T. ; Pickholz, M. ; SKAF, M. S. . Dinâmica molecular de articaína neutra em membranas POPC. 2008. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• Prates, Erica T. ; Pickholz, M. ; SKAF, M. S. . Articaine Self-Association and Interaction with Membrane: a Theoretical Study of Local Anesthesia. 2008. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• PRATES, É. T. ; SKAF, M. S. . Dinámica Molecular de Biomoléculas en Soluciones Acuosas. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• PRATES, É. T. ; SKAF, M. S. . Simulation Studies on Saccharides, Amino Acids and Peptides Aqueous Solutions: Structural and Dynamical Properties. 2007. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• PRATES, É. T. ; SKAF, M. S. . Dinâmica Molecular de Biomoléculas em Solução Aquosa. 2006. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Projetos de pesquisa

• 2009 - Atual

  Dinâmica Molecular de Hidrolases para Sacarificação de Celulose e Proteínas Correlatas, Descrição: A biomassa lignocelulósica proveniente do bagaço da cana-de-açúcar e de outras matérias-primas, é um material altamente promissor para a geração de biocombustíveis renováveis e ambientalmente positivos. A melhor opção para a conversão dessa biomassa em açúcares solúveis fermentáveis a etanol, em termos de rendimento e de vantagens ambientais, é a catálise enzimática. Mas esta é também a etapa mais cara do processo de obtenção de etanol de segunda geração devido à baixa eficiência e alto custo dos coquetéis enzimáticos atualmente disponíveis para este fim. Para tornar estes processos mais eficientes e economicamente viáveis, é preciso aprofundar nossa compreensão dos mecanismos de hidrólise celulolítica. Grande investimento em pesquisa tem sido empregado neste fim e, como parte disto, este trabalho consiste em um conjunto de pesquisas desenvolvidas na área de simulação computacional via dinâmica molecular de três enzimas celulolíticas: 1) Laminarinase de Rodhothermus marinus; 2) Endoglucanase 3 de Trichoderma harzianum e 3) β-glicosidase de Aspergillus niger. De modo geral, estes estudos visaram investigar a relação entre o arranjo estrutural e propriedades mensuráveis em laboratório interessantes na avaliação da performance destes biocatalisadores, como afinidade pelo substrato e estabilidade térmica. Como parte do Projeto Temático BioEn, financiado pela FAPESP (Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo), estes estudos computacionais foram realizados em estreita colaboração com grupos de biofísicos estruturais e biólogos moleculares, sendo as três enzimas selecionadas em conjunto. . , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Érica Teixeira Prates - Integrante / Munir Salomão Skaf - Coordenador.

Prêmios