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Possui Bacharelado em Ciencias Biologicas pela Universidade Estadual de Campinas (1990), mestrado em Biotecnologia pela Universidade de São Paulo (1994) e doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia), também pela Universidade de São Paulo (1999). Fez pós-doutoramento no Instituto de Ciências Biomédicas - USP, Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Instituto de Tecnologia da California (Pasadena, USA) e na Universidade de Cambridge (Cambridge, Inglaterra), todos na área de Estrutura e Função de Proteínas. Atualmente é professora do Departamento de Microbiologia na Universidade de São Paulo, em São Paulo. Sua área de atuação envolve principalmente a caracterização estrutural e funcional de proteínas transportadoras e o papel destas nos mecanismos de virulência, patogênese e resistência à drogas. Também trabalha com a caracterização estrutural e engenharia de proteínas de interesse biotecnológico, incluindo proteínas de membrana envolvidas com a exclusão de drogas. É Vice-presidente da Agência Cosmos de Co-working e Inovação da Universidade de São Paulo, envolvida em projetos de formação de pesquisadores em Inovação e empreendedorismo na área da saúde. É bolsista produtividade do CNPq - nível 2. Website: http://www.balangroup.org/research/
Informações coletadas do Lattes em 23/06/2020
Acadêmico
Formação acadêmica
Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia)
1995 - 1999
Universidade de São Paulo
Título: Construção de um Sistema Suicida para Leveduras Baseado na Degradação do Material Genético Visando Biossegurança
Orientador: Ana Clara Guerrini Schenberg
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: leveduras; biossegurança X OGMs; nuclease de Serratia marcescens; biologia molecular; single cell protein SCP.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Biotecnologia. Setores de atividade: Produtos e Processos Biotecnológicos.
Mestrado em Biotecnologia
1991 - 1994
Universidade de São Paulo
Título: Isolamento e Caracterização de Novos Fagos de Streptomyces,Ano de Obtenção: 1994
Orientador: Gabriel Padilla
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: streptomyces; fagos; caracterização; termo-indução.Grande área: Ciências BiológicasSetores de atividade: Produtos e Processos Biotecnológicos.
Graduação em Bacharelado Em Ciencias Biologicas
1987 - 1990
Universidade Estadual de Campinas
Título: Caracterização molecular de diferentes espécies de Xanthomonas
Orientador: Yoko Bomura Rosato
Pós-doutorado
2007 - 2009
Pós-Doutorado. , Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, LNLS, Brasil. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia.
2008 - 2008
Pós-Doutorado. , Universidade de Cambridge, UC, Grã-Bretanha. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
2006 - 2006
Pós-Doutorado. , California Institute of Technology, CALTECH, Estados Unidos.
2005 - 2006
Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Estudos e Pesquisas Aquáticas, FUNDESPA, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas
2002 - 2004
Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos / Especialidade: Biologia Molecular e Estrutural.
1999 - 2001
Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos / Especialidade: Biotecnologia.
Formação complementar
2019 - 2019
Structural and Biophysical methods for biological macromolecules in solutio. (Carga horária: 54h). , European Molecular Biology Organization, EMBO, Grã-Bretanha.
2013 - 2014
Colaboração. (Carga horária: 320h). , Membrane Protein Laboratory - Diamond Light Source, MPL, Grã-Bretanha.
2012 - 2012
Colaboração. (Carga horária: 480h). , Membrane Protein Laboratory - Diamond Light Source, MPL, Grã-Bretanha.
2011 - 2011
Expression, Purification, Crystallization and Stru. (Carga horária: 48h). , Unidad de Biofisica (CSIC-UPV/EHU), BACB, Espanha.
2010 - 2010
Higher European Research Course for Users of Large. (Carga horária: 120h). , Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, LNLS, Brasil.
2010 - 2010
Rapid Data Collection and Structure Solving at the. (Carga horária: 48h). , Brookhaven National Laboratory, BNL, Estados Unidos.
2009 - 2009
Fundamentos para operação de Sistema Operacional L. (Carga horária: 20h). , Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, LNLS, Brasil.
2009 - 2009
3rd EMBO Course on High Throughput Protein and Cry. (Carga horária: 81h). , European Molecular Biology Organization, EMBO/EMBL, Alemanha.
2006 - 2006
Structure And Function Of Large Molecular Assembli. (Carga horária: 90h). , International Union Of Biochemistry And Molecular Biology, IUBMB, Inglaterra.
2005 - 2005
Extensão universitária em Estrutura de Proteínas. (Carga horária: 40h). , Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, CNPEM, Brasil.
2005 - 2005
Extensão universitária em Curso de Validação de Modelos Em Cristalografia. (Carga horária: 12h). , Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, EMBRAPA, Brasil.
2005 - 2005
Principles Of Gene Regulation In Bacteria. (Carga horária: 80h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2004 - 2004
Extensão universitária em Bioinformática Aplicada à Proteômica. (Carga horária: 80h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
2004 - 2004
Curso Avançado de Cristalização de Proteínas. (Carga horária: 12h). , Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, CNPEM, Brasil.
2003 - 2003
Recombinant Proteins In Escherichia Coli And Bacil. (Carga horária: 20h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2002 - 2002
Cristalografia de Proteínas Módulo II. (Carga horária: 40h). , Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, CNPEM, Brasil.
2002 - 2002
Ressonância Magnética Nuclear Aplicada à Proteínas. (Carga horária: 32h). , Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, CNPEM, Brasil.
2002 - 2002
Separação e Purificação de Proteínas. (Carga horária: 40h). , Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, CNPEM, Brasil.
2001 - 2001
Extensão universitária em Identificação de Transgênicos Em Alimentos. , Associação Nacional de Biossegurança, ANBIO, Brasil.
2001 - 2001
Cristalografia de Proteínas Módulo I. (Carga horária: 24h). , Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, CNPEM, Brasil.
2001 - 2001
Dicroísmo Circular. (Carga horária: 24h). , Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, CNPEM, Brasil.
2000 - 2000
Extensão universitária em Sistema de Qualidade Bpl. , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.
2000 - 2000
Ressonância Magnética Nuclear Aplicada à Proteínas. (Carga horária: 20h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.
1999 - 1999
Extensão universitária em Ensaio Cometa Teste de Genotoxicidade. (Carga horária: 8h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.
1999 - 1999
Cristalografia de Proteínas Módulo II. (Carga horária: 20h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.
1999 - 1999
Preparatório implantação de credenc. de Lab. clin.. (Carga horária: 20h). , Sociedade Brasileira de Análises Clínicas, SBAC, Brasil.
1998 - 1998
Resposta Celular ao Stress. (Carga horária: 60h). , Universidade de São Paulo-IPT-I.Butantã, USP-IPT-I.BUT, Brasil.
1992 - 1992
Extensão universitária em Biologia Molecular Aplicada Ao Diagnóstico. (Carga horária: 8h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.
1992 - 1992
Aspéctos Genéticos e Moleculares da Estrutura e Fu. (Carga horária: 80h). , Sociedade Brasileira de Microbiologia, SBM, Brasil.
1992 - 1992
Actinomycetes in industry and environment. (Carga horária: 56h). , Fundação Tropical de Pesquisas e Tecnologia André Tosello, FTPAT, Brasil.
1991 - 1991
Bacteriófago T7 e aplicação na construção de vetor. (Carga horária: 112h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Idiomas
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Bem, Fala Pouco, Lê Bem, Escreve Pouco.
Italiano
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.
Francês
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Pouco.
Áreas de atuação
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos/Especialidade: Biologia Molecular e Estrutural.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Microbiologia Aplicada.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Proteinas de Membrana.
Organização de eventos
Balan, Andrea ; HYVONEN, M.J. . Biophysical methods for the studies of proteins. 2017. (Outro).
Balan, Andrea ; HYVONEN, M.J. . From cloning to protein analysis - methods and strategies. 2016. (Outro).
Balan, A. ; MORAES, I. ; GARRAT, R. . Structure and Function of Membrane Proteins - A Practical Course. 2012. (Outro).
Participação em eventos
HACKMED. 2020. (Simpósio).
EMERGE ICB.Platshow - Plataforma de desenvolvimento de peptídeos. 2019. (Outra).
29a. Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Microbiologia. Role of ABC transporters dedicated to sulfur assimilation in Xanthomonas citri in the virulence and pathogenesis. 2017. (Congresso).
I Workshop in Microbial Molecular Biology.Expressão e purificação de dos genes Rv2563/64 de M. tuberculosis. 2017. (Simpósio).
XL Annual Meeting Chilean Biochemistry and Mol Biol Society. Structural and functional analysis of transporters for sulfur in Xanthomonas citri. 2017. (Congresso).
V LATIN AMERICAN PROTEIN SOCIETY MEETING. Functional and structural characterization of sulfate pathway in Mycobacterium tuberculosis. 2016. (Congresso).
Workshop Beyond Zika - A Tripartite Initiative - USP/I. Butantan/I. Pasteur.Zika - a tripartite initiative. 2016. (Simpósio).
44th Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology (SBBq). FUNCTION AND RELEVANCE OF THE SULFATE BINDING PROTEIN (SBP) IN XANTHOMONAS CITRI SP. CITRI. 2015. (Congresso).
Mechanisms of Membrane Transport. The PstSABC system in Xanthomonas citri ? functional and structural aspects. 2015. (Congresso).
XanthoMeeting 201 5.The PstSABC system in Xanthomonas citri ? functional and structural aspects. 2015. (Simpósio).
Alfred Benzon Symposium 0 Membrane Proteins: Structure, function and dynamics. Expression and purification of drug exporters from Mycobacterium tuberculosis. 2013. (Congresso).
9th Joint Meeting of International Cytokine Society. A mycobacterium leprae HSP65 as a candidate to mitigating lupus aggravation in mice. 2011. (Congresso).
13a. International Conference on the Crystallization of Biological Micromolecules. Crystallization of Membrane Proteins. 2010. (Congresso).
XXXIX Annual Meeting of SBBq. Expression, purification and characterization of periplasmic-binding proteins from Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2010. (Congresso).
19a Reunião da Associação Brasileira de Cristalografia. A estrutura cristalográfica da SsuA mostra como alcanosulfonatos entram na célula. 2009. (Congresso).
IV Workshop de Biologia Molecular Estrutural do LNLS-Téc, ferram e des em cristalização de proteínas.Crystallization of proteins. 2009. (Simpósio).
XXXVIII Anual Meeting SBBq. Biochemical and structural characterization of the molybdate transporter ModABC from the pathogenic bacteria Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2009. (Congresso).
Membrane Transport and Communication. ABC Transporters in Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2008. (Congresso).
Reunião da Associação Brasileira de Cristalografia.Structural and spectroscopic analysis of Xanthomonas citri maltose-binding protein. 2007. (Simpósio).
Workshop em Bioinformática Estrutural. 2007. (Simpósio).
Reunião Anual dos Usuários do Laboratório Nacional de Luz Síncrotron. Reunião Anual dos Usuários do Laboratório Nacional de Luz Síncrotron. 2005. (Congresso).
XX International Union of Crystallography. XX International Union of Crystallography. 2005. (Congresso).
XXXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. XXXIV Congresso da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. 2005. (Congresso).
23rd International Specialised Symposium on Yeasts.23rd International Specialised Symposium on Yeasts. 2003. (Simpósio).
Inter American Workshop on the use of Synchroton Radiation: Application to Macromolecules and Biological Systems. Inter American Workshop on the use of Synchroton Radiation: Application to Macromolecules and Biological Systems. 2002. (Congresso).
XXXI Reuinião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. XXXI Reuinião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. 2002. (Congresso).
II Congresso Brasileiro de Biossegurança - II Simpósio Latino Americano de Produtos Transgênicos. II Congresso Brasileiro de Biossegurança - II Simpósio Latino Americano de Produtos Transgênicos. 2001. (Congresso).
III Congresso do Instituto de Ciências Biomédicas. III Congresso do Instituto de Ciências Biomédicas. 2001. (Congresso).
IV Latin American Meeting on Plant Biotechnology. IV Latin American Meeting on Plant Biotechnology. 2001. (Congresso).
XXI Fungal Genetics Conference. XXI Fungal Genetics Conference. 2001. (Congresso).
46o. Congresso Nacional de Genética. 46o. Congresso Nacional de Genética. 2000. (Congresso).
45o. Congresso Nacional de Genética. 45o. Congresso Nacional de Genética. 1999. (Congresso).
45o. Congresso Nacional de Genética. 45o. Congresso Nacional de Genética. 1999. (Congresso).
I Congresso Brasileiro de Biossegurança - I Simpósio Latino Americano de Produtos Transgênicos. I Congresso Brasileiro de Biossegurança - I Simpósio Latino Americano de Produtos Transgênicos. 1999. (Congresso).
XX Congresso Brasileiro de Microbiologia. XX congresso Brasileiro de Microbiologia. 1999. (Congresso).
42o. Congresso Nacional de Genética. 42o. Congresso Nacional de Genética. 1996. (Congresso).
II Congresso do Instituto de Ciências Biomédicas. II Congresso do Instituto de Ciências Biomédicas. 1996. (Congresso).
BIOATIVA - Workshop sobre Microrganismos produtores de Compostos Bioativos.BIOATIVA - Workshop sobre Microrganismos produtores de Compostos Bioativos. 1995. (Outra).
XX Reunião Anual de Genética de Microrganismos. XX Reunião Anual de Genética de Microrganismos. 1995. (Congresso).
XXXIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. XXXIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. 1994. (Congresso).
39o. Congresso Nacional de Genética. 39o. Congresso Nacional de Genética. 1993. (Congresso).
XXII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. XXII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. 1993. (Congresso).
Reunião Anual de Genética de Microrganismos. 18a. Reunião Anual de Genética de Microrganismos. 1992. (Congresso).
. XXXVII Congresso nacional de Genética. 1991. (Congresso).
Participação em bancas
Balan, Andrea; MARAGNO, S.. Estudo funcional e estrutural do cluster PAS ? GGDEF na sinalização c-di-GMP em Leptospira interrogans sorovar Copenhageni. 2020. Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Balan, A.. Análise comparativa do protejam de membrana de promastigotas das cepas PH8 e LV79 de L. amazonenses. 2019. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-graduação em Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro) - Universidade de São Paulo.
Balan, A.; FERREIRA, Rita Café Souza; Piccoli, RAM; Arni V. Desenvolvimento de uma estratégia de inibição de transportadores ABC utilizando anticorpos. 2019. Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Alvarez CÊ; Baldini RL;Balan, A.; MARQUES, M. V.. Estudo do transporte de ferro em Caulobacter crescentus. 2019. Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Lebrun I; Gomez, JGA;Balan, A.. Functional characterisation of a new esterase Est1 isolated from Amazonian dark soil. 2019. Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Balan, Andrea; Junior EP; Lopes LR. Uso de Cromatografia de Bioafinidade na Prospecção de Substâncias Anticâncer em Actinomicetos Marinhos: XIAP e STMN1 como alvos farmacológicos. 2019. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-graduação em Farmacologia) - Universidade de São Paulo.
Balan, AndreaPADILLA, G.; Filho GA; Taketani RG. Exsudatos radiculares como reguladores da colonização da planta por Methylobacterium spp. e Methylorubrum extorques. 2019. Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
MARQUES, M. V.; SPENCER, P. J.;Balan, A.. Estudos estruturais e funcionais da proteína repressora PhoU na sinalização de transporte de fosfato em Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2018. Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Balan, A.; MARQUES, M. V.; Pierri, P. Influência de exsudamos da planta na ecologia de Methylobacterium app. durante a interação com a planta hospedeira. 2018. Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Balan, A.; Dias MVB; Lotufo, L. Estudo estrutural de enzimas relacionadas com a modificação nas posições C3? e C6? da biossíntese de gentamicina. 2018. Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Piccoli RAM; Galhardo RS;Balan, Andrea. Biossíntese de copolímerobiodegradável poli P3HB-co-3HV em Burkholderia sachara. 2018. Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
ALVAREZ, C. E.; MARQUES, M. V.; SILVA, A. M.;Balan, Andrea. Caracterização do papel da proteína CspP de Caulobacter crescentus. 2017. Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Balan, Andrea; SCHECHTMAN, D.; Kowaltowski, AJ. Identificação de inibidores seletivos da ciclofilina D humana com potencial neuroprotetor em terapia para esclerose múltipla. 2017. Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
Balan, A.; ALVAREZ, C. E.; Araújo, W.L.. Estudo de transporte de ferro em Caulobacter crescentus. 2017. Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Balan, Andrea; Magalhães GS; Piazza RMF. Estratégias de clonagem para obtenção da toxina termoestável (ST) produzida por Escherichia coli enterotoxigência. 2016. Dissertação (Mestrado em TOXINOLOGIA) - Instituto Butantan.
Timenetsky J;Balan, A.; Lorenço A; Gregory L. Clonagem, purificação e caracterização de proteínas antagônicas recombinantes obtidas de Mycoplasma agalactiae. 2016. Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Balan, A.; Baldini, RL; SILVA, L. F.. Avaliação de genes para o catabolismo de chilres e seu potencial para geração de bioprodutos. 2015. Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Gales A;BALAN, Andrea; CARVALHAES, C.. Caracterização da presença de ISAba1 a montante do gene oprD-like em isolados clínicos de Acinetobacter baumannii resistentes aos carbapenemems. 2015. Dissertação (Mestrado em Mestrado / Doutorado) - Universidade Federal de São Paulo.
Balan, Andrea. Análise de expressão de genes do sistema de secreção na interação Methylobacterium mesophilicum Sr 1.6/6 com a planta hospedeira. 2015. Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Moreno A; Munhoz J;BALAN, Andrea. Clonagem, purificação e caracterização de proteínas antagônicas recombinantes obtidas de Mycoplasma agalactiae. 2015. Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Balan, Andrea; Galhardo RS. Construção de uma Pseudomonas sp recombinante para a produção de PHA a partir de chilres. 2015. Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Balan, Andrea; Pascon RC; Tahara EB. Mapeamento dos determinantes estruturais da proteína Rtg2p envolvidos na sinalização retagrada e no envelhecimento de Saccharomyces cerevisiae. 2015. Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
BENEDETTI, C. E.; DAMASIO, R. L.;Balan, Andrea. Análise do secretora de Pseudozyma brasilienses e identificação, clonagem, expressão e caracterização de b-xilosidases. 2015. Dissertação (Mestrado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.
BIONDO, Ronaldo; VICENTE, Elisabete Jose;Balan, A.. Avaliação da estabilidade genética conferida pelo lócus parB e força de expressão dos promotores deste sistema. 2014. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
Benedetti, C.E.Balan, A.; TORRES, A.. EXPRESSÃO, PURIFICAÇÃO E ENSAIO DE ATIVIDADE DOS DOMÍNIOS DUF442 E ETHE1 DA PROTEÍNA Blh DE Xylella fastidiosa E Agrobacterium tumefaciens. 2014. Dissertação (Mestrado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.
Balan, A.; Guzzo, C.;PADILLA, G.. Estudos funcionais e estruturais para a Caracterização da via de captação e assimilação de sulfato em Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2013. Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
Murakami, M.T.;Balan, A.; WERNECK, C. C.. Investigações estruturais dos domínios funcionais das miosinas classes VIII e XI presentes em plantas. 2012. Dissertação (Mestrado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.
Balan, A.. Avaliação da atividade imunogênica de duas proteínas preditas de membrana de Leptospira interrogans expressas em Escherichia coli. 2012. Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
Balan, A.Benedetti, C.E.; Netto, L.E.S.. Estudos Estruturais e Funcionais das Enzimas SsuD e SsuE do Sistema de Transporte do Tipo ABC de Alcano Sulfonatos e da Proteína Ligadora Periplasmática Pbp da Bactéria Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2011.
Balan, A.; Winter, C.E.; Gubitoso, M.D.. Desenvolvimento de um algoritmo para identificação e caracterização de cavidades em regiões específicas de estruturas tridimensionais de proteínas. 2011. Dissertação (Mestrado em Ciência da Informação) - Universidade de São Paulo.
Balan, A.Benedetti, C.E.; Azzoni, A.R.. Estudos estruturais e funcionais das enzimas SsuD e SsuE do sistema transportador de alcano sulfonatos e da proteina ligadora periplasmatica PbP do sistema transportador de fosfonato da bacterias Xanthomonas axonopodis pv.citri. 2010. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.
Rivera, ING;BALAN, Andrea; GRAEL, E. T.. Construção de um cassete de expressão da lisozima de Drosophila melanogaster para inserção em múltiplas cópias no genoma de Saccharomyces cerevisia. 2009. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
Esposito E;BALAN, Andrea; Kleiner AAP. Isolamento e caracterização de fungos Agaricus spp e Agaricus brunescens. 2007. Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
BALAN, Andrea; HO, Paulo Lee; KUBRUSLY, Flavia. Análise do perfil de proteínas presente em diferentes etapas dos processos de produção de vacinas para a toxina diftérica e toxina tetânica. 2005. Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Biotecnologia) - Instituto Butantan.
BALAN, Andrea; BARBOSA, Heloísa; ALMEIDA, José Gregório de. Influência das fontes de carbono na produção do complexo Furgamicina por Streptomyces olindensis DAUFPE 5622 e se mutante SolCB20 em processo de fermentação descontínua. 2004. Dissertação (Mestrado em Interunidades Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
BALAN, Andrea; NASCIMENTO, Ana Lucia Tabet Oller Do; MARQUES, Marillis Do Valle;FERREIRA, Rita de Cassia Cafe; MALDONADO, Gabriel Padilla. Síntese do Gene de Interferon-alfa, clonagem e expressão em Escherichia coli. 2003. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
BALAN, Andrea. Clonagem Expressão e Purificação da forma ativa da enzima conversora de endotelina-1 (ECE1). 2003. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Molecular)) - Universidade Federal de São Paulo.
BALAN, Andrea; FERREIRA, Rita Café Souza; QUAGGIO, R. B.; ROSATO, Y. B.; MARQUES, M. V.. Osistema opp de captação de oligopeptídeos de Xanthomonas axonopodis pv Citri. 2002. Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Balan, Andrea; GARRAT, R.; THIEMANN, O. H.; Borges JC; MURAKAMI, M.. Protein protein interactions involved in copper homeostasis, oxidative raging and neurodegenerative disease. 2020. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal de São Carlos.
Balan, Andrea; GARRAT, R.; MURAKAMI, M.; THIEMANN, O. H.. Interações proteína-proteína envolvidas na homeostase do cobre, envelhecimento oxidativo e doenças neurodegenerativas.. 2020. Tese (Doutorado em Química Biológica e Orgânica) - Universidade de São Paulo.
Balan, Andrea; WREINGLER, C.. Analise da catálise da aspartato carbamoiltransferase dentro do metabolismo de aminoácidos do parasita ejetor da malária humana Plasmodium falciparum. 2019. Tese (Doutorado em Biologia da relação patógeno hospedeiro) - Universidade de São Paulo.
Kipnis A; Ulhoa CJ; Andre MCDPB;Balan, A.; Astolfo-Filho S. Caracterização de proteínas envolvidas estocagem de ferro em Mycobacterium abscessos subsp. massiliense. 2018. Tese (Doutorado em Medicina Tropical) - Universidade Federal de Goiás.
Barros, M.H.;BALAN, Andrea; Alcale FSC; Goldman GH; Ronsein GE. Caracterização de linhagens de Saccharomyces cerevisiae deficientes na biossíntese da coenzima Q. 2018. Tese (Doutorado em Doutorado Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
FREIRE, D. M. G.; Queiroz, S.R.S.;Balan, AndreaPADILLA, G.; Gomez, JGA. Clonagem, expressão e avaliação dos genes de produção de AHH em Burkholderia e Pseudomonas. 2018. Tese (Doutorado em Doutorado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Freire, DMG; Queiroz, S.R.S.;Balan, AndreaPADILLA, G.; Gomez, JGA. Expressão heterodoxa de genes rhlA envolvidos na síntese de 3HA, precursor de ramnolipidios. 2018. Tese (Doutorado em Doutorado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Amaral, TATG; Moreno, AM;Balan, Andrea. Identificação de proteínas de membrana de Leptospira. 2018. Tese (Doutorado em Doutorado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Pellizari-Gabriel, V.H.; Araújo, W.L.; Melo, I.S.;Balan, Andrea. A vida microbiana em um vulcão antártico: diversidade e adaptação procariótica na ilha Deception. 2017. Tese (Doutorado em Doutorado Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
Balan, Andrea; SILVA, L. F.; Galhardo RS; Rezende, J.C.; Piccoli, RAM. Clonagem e super expressão dos genes do catabolismo de xilose em Burkholderia sachara e avaliação do seu efeito na repressão catabólica e produção de polihidróxibutirato a partir de açúcares hemicelulósicos. 2017. Tese (Doutorado em Doutorado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Trossini G;Balan, Andrea; SILBER, A. M.. Análise estrutural de enzimas relacionadas com a formação de éteres cíclicos em antibióticos ionóforos. 2017. Tese (Doutorado em Doutorado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Balan, Andrea; SILVA, A. M.; Baldini, RL; Ferro JA; Winck FV. Caracterização do secretora de cepas de Xylella fastidiosa. 2017. Tese (Doutorado em Doutorado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo.
Balan, Andrea; FERREIRA, RITA DE CÁSSIA CAFÉ; Kobarg, J.; SOUZA, A. A.; SOPRANO, A. S.. Estudos estruturais e funcionais sobre o transportador tipo ABC de sulfato em Xanthomonas citri. 2017. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.
Balan, Andrea; BENEDETTI, C. E.; MATIOLLI, C. C.; FERREIRA, H.; MOURAO FILHO, F. A. A.. Análise Funcional de ejetores TAL de Xanthomonas citri e Xanthomonas aurantifolii patotipo C. 2016. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.
Balan, Andrea; Ferreira, HB; Laurino, JP; Laguna, SE; Delamare, APL. Diversidade, clonagem e caracterização de nucleares extracelulares de Aeromoças app. 2016. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de Caxias do Sul.
Dias, M.V.B.; Souza RF;Balan, A.. Determinação das estruturas cristalográficas de epóxido hidrólises de interesse biotecnológico e envolvidas na biossíntese de antibióticos ionóforos policíclicos. 2016. Tese (Doutorado em Doutorado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
Boccardo EM;Balan, A.. Caracterização de genes putativos biossintéticos do antitumoral cosmomicina D. 2016. Tese (Doutorado em Doutorado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Balan, Andrea; BENEDETTI, C. E.; Kobarg, J.; Dias MVB; Melo, PS. Caracterização do perfil de interação da proteína cinges humana NEK3 e sua contextualização funcional. 2016. Tese (Doutorado em Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.
Balan, Andrea; Salinas JR; Baldini, RL; Machini, MT. Desenvolvimento de novos peptídeos antimicrobianos a partir de proteínas dos venenos das serpentes peruanas Bothrops pictus e Bothriopsis oligolepis. 2016. Tese (Doutorado em Doutorado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo.
Balan, Andrea; VIEIRA, M. A. M.; Pessoa Junior, A. Caracterização imunogênica e funcional de duas lipoproteínas preditas de Leptospira interrogais expressas em E. coli. 2016. Tese (Doutorado em Mestrado Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
Dias MVB;PADILLA, G.; VICENTE, C. P.; BENEDETTI, C. E.;Balan, A.. Caracterização funcional e estrutural do sistema de captação de fosfato da bactéria fitopatogênica Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2015. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.
CATHARINO, R. R.; FERNANDES, M. R. N.; HOLLANDA, L. M.; SILVA, V. J. D.;Balan, A.. Inovação no diagnóstico da hanseníase: potencial método não invasivo associado à espectrometria de massas de alta resolução. 2015. Tese (Doutorado em Fisiopatologia Medica) - Universidade Estadual de Campinas.
Aniz, P.A.E.A.;Balan, A.; Dias, M.V.B.; Barros, M.H.; Moreno, A.C.R.. Caracterização estrutural e análises funcionais do transportador de Nitrato/Nitrito do tipo ABC de Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2015. Tese (Doutorado em Doutorado Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
Gomez, JGA; Sato, MIZ;BALAN, Andrea. Potencial biotecnológico de Actinomycetos isolados de sedimento de água da bacia do Rio Tietê. 2015. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
BALAN, Andrea; Terra CF; Lebrun I. Metabolismo de fucose, a-l-fucosidades e fucosiltransferases: caracterização enzimática, mecanismo de catálise e papel fisiológico. 2015. Tese (Doutorado em Pós Graduação Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
Spira B; Baldini, RL;BALAN, Andrea; Galhardo RS; MALDONADO, Gabriel Padilla. Caracterização dos genes phoA, phoA2, phoB, phoU e pstS, membros do regulon PHO de Chromobacterium violaceum. 2014. Tese (Doutorado em Doutorado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
BALAN, AndreaFERREIRA, Rita de Cassia Cafe. Análise do papel dos transportadores ABC de oligopeptídeos, poliaminas, fosfatoinorgânico, glutamato e glutamina na fisiologia e patogênese de bactérias de trato gastro intestinal. 2013. Tese (Doutorado em Ciências (Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro)pgbmp@icb.usp.br) - Universidade de São Paulo.
Balan, A.; Piccoli, RAM; Araújo, H.S.S.; Miranda, A.;Chudzinski-Tavassi, A. M.. Expressão, purificação e estudo estrutural da proteína recombinante Amblyomin-X obtida a partir da glândula salivar do carrapato Amblyoma cajennense. 2012. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Molecular)) - Universidade Federal de São Paulo.
Kobarg, J.;Balan, A.; SCHECHTMAN, D.; Ferreira, CV; Aoyama, H.. Proteínas da família FEZ (Fasciculation and Elongation protein Zeta) como adaptadoras bivalentes do transporte: aspectos funcionais, estruturais e evolutivos. 2011. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.
Micheli, F.F.L.; Brommonschenkel, S.H.;Balan, A.; Silveira, W. D.;Benedetti, C.E.. Identificacao de genes de Citrus sinensis com expressao dependente de proteina PthA de Xanthomonas citri e isomaneto de elementos cis regulatorios ligantes de PthA. 2011. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual de Campinas.
Canduri, F.; Nagem, R.A.P.;Zeri, A.C.M.Balan, A.; Murakami, M.T.. Estudos estruturais e biofisicos da enzima purina nucleosideo fosforilase hexamerica de Bacillus Subtilis. 2011. Tese (Doutorado em Curso de Pós-graduação em genética e biologia molecular) - Universidade Estadual de Campinas.
Serrano, S.M.T.; TAVASSI, A. M. C.; Teixeira, C.F.P.;Balan, A.. Estudos sobre a função dos domínios não catalíticos do HF3, uma metaloproteinase do veneno de serpente Bothrops jararaca, na sua interação com alvos celulares e plasmáticos. 2010. Tese (Doutorado em Doutorado em Biotecnologia) - Instituto Butantan.
TAVASSI, A. M. C.; SILVA, C. A.;BALAN, Andrea. Estudo sobre função dos domínios não catalíticos de HF3, uma metaloprotease do veneno de serpente Bothrops jararaca, na sua interação com alvos celulares e plasmáticos. 2009. Tese (Doutorado em Doutorado em Biotecnologia) - Instituto Butantan.
Melo, I.S.;BALAN, AndreaPADILLA, G.; Araújo, W.L.; Pellizari-Gabriel, V.H.. Análise de metagenoma e prospecção de genes PKS de amostras de solo da mata Altlântica. 2009. Tese (Doutorado em Doutorado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
BALAN, Andrea; Aoyama, H.; Kobarg, J.. Structural aspects of the distinct biochemical properties of glutaredoxin 1 and glutaredoxin 2 from Saccharomyces cerevisiae. 2008. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.
BALAN, Andrea; Rivera, ING; Nascimento, RJ; Goldman, MHS. Caracterização de linhagens de Aspergillus nidulans. 2007. Tese (Doutorado em Doutorado Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
Waldoman EA; Elias Jr WP;Balan, Andrea. Análise comparativa da biogênese do fagossomo e do autofagossomo em macrfagos humanos após infecção de diferentes espécies do complexo Mycobacterium tuberculosis. 2020. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
GUIMARAES, B.G.; AMBROSIO, A.;Balan, Andrea. Estudo da via de biossíntese da vitamina B1 em Enterococcus faecalis como alvo para desenvolvimento de novos antibióticos MSc. 2020. Exame de qualificação (Doutorando em Química Biológica e Orgânica) - Universidade de São Paulo.
Mayer M;Balan, Andrea. DIVERSIDADE E DISTRIBUIÇÃO DO FILO THAUMARCHAEOTA EM AMBIENTES MARINHOS E TERRESTRES SÃO PAULO 2020. 2020. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
BALAN, Andrea; MARQUES, M. V.; Piccoli, RAM. Melhoramento da eficiência de conversão de xilose e co-substratos em copolímeros híbridos P3HB-co-3HA por Burkholderia sacchari. 2019. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
BATISTA, MILENE TAVARES;Balan, Andrea. Uropathogenic Escherichia coli alfa-hemolysinand CNF1 recombinant toxins generation. 2019. Exame de qualificação (Doutorando em TOXINOLOGIA) - Instituto Butantan.
Andrade MO; Counago RLM;Balan, Andrea. Estudos funcionais do sistema de secreção do tipo VI de Xanthomonas citei: identificação de proteínas decretadas, mecanismos de recrutamento e regulação de sistema. 2019. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.
Balan, Andrea; Galhardo RS; Pierri, P. Analise de genes de transporte do sistema de secreção tipo V e bombas de fluxo da família RND em Methylobacterium mesophilicum SR1 durante a interação com a planta hospedeira. 2018. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Terra CF;Balan, Andrea. Caracterização funcional e avaliação da antigenicidade e imunogenicidade de proteínas recombinantes de Mycoplasma agalactiae. 2018. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Balan, Andrea; VICENTE, Elisabete Jose; SCHECHTMAN, D.. Identificação de inibidores seletivos da Ciclofilina D humana. 2018. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
PINTO, A. S.; MARQUES, M. V.;Balan, Andrea. O regulon Pho e evolução dirigida em Pseudomonas aeruginosa. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Balan, Andrea; Tonelli, RR; Marinho, CRF. Morphologic analysis of the apicoplast formation in Plasmodium falciparum. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Biologia da relação patógeno hospedeiro) - Universidade de São Paulo.
Balan, A.; Dias MVB; THIEMANN, O. H.. Analysis of aspartate carbamoyltransferase within the metabolisms of Plasmodium falciparum and Trypanosoma cruzi. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Biologia da relação patógeno hospedeiro) - Universidade de São Paulo.
Balan, Andrea; LOPES, A. R.; GONCALVES, V. M.. Caracterização cinética e engenharia da proteína asparaginase 3 de Saccharomyces cerevisiae para avaliação do seu uso como biofármaco. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Programa de Pós-Graduação em Tecnologia Bioquímico-Farmacêutica) - Universidade de São Paulo.
Balan, Andrea; Sato, MIZ; Gomez, JGA. Potencial biotecnológico de actinomicetos isolados de sedimento e água de bacia do Rio Tietê. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
BALAN, Andrea; Ferreira Jr, JRS; Pessoa Junior, A. Investigação de transições estruturais e da reatividade sobre peróxidos de TSA1 (Thiol Specific Antioxidant Protein 1) de Saccharomyces cerevisiae. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
Balan, A.; Aparício, R.; Dias, M.V.B.. Caracterização estrutural de enzimas degradadoras de celulose. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.
BALAN, Andrea. Extração e Identificação das proteínas da supérfície de P. aeruginosa. 2002. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Setubal J; Alves J;Balan, Andrea. Genomica comparativa de famílias de sentinas.paraseptinas e evolução de GTPases relacionadas ao remodelamento ou organização de membranas. 2019. Exame de qualificação (Mestrando em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Balan, Andrea; Ruiz RC; HEIGELMANN, M.. Produção e caracterização da protease paralisia de Leptospira interrogais. 2019. Exame de qualificação (Mestrando em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Heinelmann M; Ruiz RC;Balan, A.. Caracerização da proteína paralisia de Leptospira interrogans. 2019. Exame de qualificação (Mestrando em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Guimaraes AMS; GONCALVES, V. M.;Balan, A.. Desenvolvimento de novas estratégias de diagnóstico sorológico para tipagem da infecção prévia pelo vírus dengue. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Balan, Andrea. Caracterização de proteínas de superfície envolvidas com a invasão em bacterias. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Mestrado Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
BALAN, Andrea; DEZOTTI, N. C.; MIRANDA, L. F.. Estudo Micotoxicológico de linhagens de A. nidulans utilizadas no laboratório de genética de fungos filamentosos do ICB-USP. 2001. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Presbiteriana Mackenzie.
Balan, Andrea; Pacheco LG. Prêmio CAPES/NATURA - Campos de Excelência em Pesquisa. 2018. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.
Balan, A.. Programa de Bolsas de Verão - CNPEM. 2011. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais.
Comissão julgadora das bancas
AFFONSO, M.H.T. Isolamento e caracterização de novos fagos de Streptomyces.. 1994. Exame de qualificação (Mestrando em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
Orientou
Utilização de anticorpos para inibição de transportadores ABC; Início: 2020; Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo; (Orientador);
Desenvolvimento de um sistema rápido para a detecção de infecções virais; ; Início: 2020; Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);
Estudos funcionais e estruturais de transportadores Mce de Mycobacterium tuberculosis; Início: 2018; Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);
Caracterização do papel de PstS e PhoX de Xanthomonas citri pv; citri no transporte de fosfato, quimiotaxia, motilidade e formação de biofilme; Início: 2018; Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);
Estudos funcionais e estruturais do regulador de transcrição PhoB em Xanthomonas citri; Início: 2017; Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);
Caracterização Estrutural e Funcional do Transportador do tipo ABC de Glutamina de Mycobacterium tuberculosis; Início: 2015; Tese (Doutorado em Doutorado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);
Caracterização estrutural e funcional do transportador ABC de Mycobacterium tuberculosis Rv; Início: 2015; Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnologia e Innovacion; (Orientador);
Caracterização funcional e estrutural do transportador ABC Rv1747 de Mycobacterium tuberculosis; Início: 2015; Tese (Doutorado em Programa de Pós Grasuação em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas; (Orientador);
Desenvolvimento de uma estratégia de controle de transportadores ABC utilizando anticorpos; Início: 2020; Iniciação científica (Graduando em Iniciação Científica) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);
Caracterização do domínio extracelular da quinasse PknF de Mycobacterium tuberculosis; Início: 2020; Iniciação científica (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade de São Paulo; (Orientador);
Desenvolvimento de uma estratégia de controle de transportadores ABC utilizando anticorpos; 2019; Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Estudos Estruturais e Funcionais da Proteína Repressora PhoU na Sinalização de Transporte de Fosfato em Xanthomonas axonopodis pv; citri; 2018; Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo,; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Estudos funcionais e estruturais para a caracterização da via de captação e assimilação de sulfato em Xanthomonas axonopodis pv; citri; 2013; Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Estudos Estruturais e Funcionais das Enzimas SsuD e SsuE do Sistema de Transporte do Tipo ABC de Alcano Sulfonatos e da Proteína Ligadora Periplasmática Pbp da Bactéria Xanthomonas axonopodis pv; citri; 2011; Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Expressão, Purificação e Análise Estrutural da Proteína Ligadora de Alcanosulfonatos do Sistema de Transporte ABC de Xanthomonas citri; 2008; Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Análise de Sistemas de Transporte Ativo do Tipo ABC em Xanthomonas citri: Produção e Purificação de Proteínas Ligadoras para Análise Funcional; 2006; 145 f; Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo-IPT-I; Butantã, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Andrea Balan Fernandes;
Construção de um sistema de biossegurança estável para leveduras para a redução do conteúdo de ácidos nucléicos e produção de SCP; 2003; 150 f; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Andrea Balan Fernandes;
Caracterização estrutural e funcional do sistema de transporte de sulfatos em Xanthomonas citri; 2017; Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Estudos funcionais da via de captação de fosfato e a caracterização estrutural do sistema transportador tipo ABC de fosfato, nitrato e fosfonato em Xanthomonas axonopodis pv; citri; 2015; Tese (Doutorado em Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas,; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Caracterização Funcional e Estrutural de Enzimas Lipolíticas de um Consórcio Microbiano Degradador de Óleo Diesel; 2015; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Andrea Balan Fernandes;
Caracterização estrutural e análises funcionais do transportador de Nitrato/Nitrito do tipo ABC de Xanthomonas axonopodis pv; citri; 2015; Tese (Doutorado em Doutorado Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Efeitos Fisiológicos Da Expressão Da Proteorrodopsina Na Bactéria Cupriavidus Necator; 2015; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Andrea Balan Fernandes;
Identificação e Desenvolvimento de Novas Moléculas Contra Mycobacterium tuberculosis Baseado na Inibição de Proteínas do Metabolismo de Enxofre Utilizando a Metodologia Baseada em Fragmentos; 2015; Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Estudos estruturais da proteína ModA e do sistema de transporte de molibdato da bactéria Xanthomonas axonopodis pv; citri; 2010; Tese (Doutorado em Doutorado Em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Andrea Balan Fernandes;
Modelagem Molecular das Proteínas captadoras de Molibdato (ModA) e Oligopeptídeos (OppA) de Xanthomonas axonopodis pv; citri; 2009; Tese (Doutorado em Doutorado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Andrea Balan Fernandes;
Análise Molecular e Estrutural da Proteína Ligadora de Maltose (MalE) de Xanthomonas citri (Xac); ; 2009; Tese (Doutorado em Doutorado Em Microbiologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Andrea Balan Fernandes;
2013; Laboratório Nacional de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Andrea Balan Fernandes;
2013; Laboratório Nacional de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Andrea Balan Fernandes;
2011; Laboratório Nacional de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Andrea Balan Fernandes;
2010; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Andrea Balan Fernandes;
Expressão, Purificação e Análise bioquimica de proteinas ligadoras periplasmaticas de Xanthomonas citri; 2004; Monografia; (Aperfeiçoamento/Especialização em Aperfeiçoamento) - Departamento de Microbiologia; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
O sistema de captação de fosfato em Xanthomonas citri - interação entre as proteínas; 2016; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biotecnologia) - Universidade Federal de Alfenas; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Clonagem e Expressão do gene oppA de Xanthomonas axonopodis pv; Citri; 2002; 123 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Microbiologia Industrial) - Pontificia Universidad Javeriana - Bogotá; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Clonagem, Expressão e Purificação da proteína MalE de Xanthomonas axonopodis pv; Citri; 2002; 62 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Microbiologia Industrial) - Pontificia Universidad Javeriana - Bogotá; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Estratégia de inibição de transportadores ABC utilizando anticorpos; 2020; Iniciação Científica; (Graduando em Iniciação Científica) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Desenvolvimento de uma estratégia de controle de transportadores ABC utilizando anticorpos; 2019; Iniciação Científica; (Graduando em Faculdade de Farmácia) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Produção do domínio Rv2563_per de Mycobacterium tuberculosis para estudos funcionais; 2019; Iniciação Científica; (Graduando em Iniciação Científica) - Universidade de São Paulo; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Desenvolvimento de uma estratégia de controle de transportadores ABC utilizando anticorpos; 2019; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Universidade Paulista, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Caracterização estrutural de proteínas transportadoras; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Microbiologia Aplicada) - Pontifícia Universidad Javeriana; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Caracterização estrutural de proteínas da via de captação de sulfato de Mycobacterium tuberculosis; 2016; Iniciação Científica - Universidade de São Paulo; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Interação e cristalização das proteínas periplasmáticas ligadoras de fosfato PstS e PhoX; 2016; Iniciação Científica - Universidade de São Paulo; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Expressão e purificação de transportadores ABC do tipo exportador de Mycobacterium tuberculosis; 2013; Iniciação Científica; (Graduando em Biologia Molecular e Estrutural de Proteínas) - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Estudo de transportadores ABC de Xanthomonas citri expressos durante a infecção de Citrus sinenses; 2012; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual de Campinas, Associação Brasileira de Tecnologia e Luz Sincrotron; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Caracterização estrutural e funcional das proteínas ligadoras de tolueno e nitrato dos Transportadores do tipo ABC presentes em Xanthomonas axonopodis pv; citri durante a fase de infecção na planta; ; 2011; Iniciação Científica; (Graduando em Biologia Molecular e Estrutural de Proteínas) - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Expressão e purificação de transportadores ABC presentes em Xanthomonas axonopodis pv; citri para estudos estruturais; 2010; Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Expresión, purificación y análisis estructurales de proteínas periplasmáticas de la bacteria fitopatógena Xanthomonas axonopodis pv citri; ; 2009; Iniciação Científica; (Graduando em Bolsistas de Verão) - Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, Associação Brasileira de Tecnologia e Luz Sincrotron; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Caracterização de transportadores ABC induzidos durante o processo de infecção em Xanthomonas citri; 2014; Orientação de outra natureza; (Biologia Molecular e Estrutural de Proteínas) - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Associação Brasileira de Tecnologia e Luz Sincrotron; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Determinação do papel funcional da proteína ligadora de fosfato e seu transportador no crescimento e viabilidade de Xanthomonas citri em ensaios in vivo e in vitro; 2012; Orientação de outra natureza; (Bolsista de Verão) - Laboratório Nacional de Biociências, Associação Brasileira de Tecnologia e Luz Sincrotron; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Expressao da TauA e Construcao de um Modelo para o Regulador do Operon tauABC de Xanthomonas axonopodis pv; citri; 2011; Orientação de outra natureza; (Bolsista de Verão) - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Associação Brasileira de Tecnologia e Luz Sincrotron; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Caracterização funcional de mutantes de Xanthomonas axonopodis pv; citri; 2011; Orientação de outra natureza - Laboratório Nacional de Biociências, Associação Brasileira de Tecnologia e Luz Sincrotron; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Expressão e Purificação de Proteínas do Sistema de Transporte Tipo ABC de Xanthomonas citri; 2004; 0 f; Orientação de outra natureza - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Andrea Balan Fernandes;
Foi orientado por
Pós-doutoramento; 2002; 50 f; Orientação de outra natureza - INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOMÉDICAS, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Tania Maria Araujo Domingues Zucchi;
2009; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; João Alexandre Ribeiro Gonçalves Barbosa;
2005; Universidade de São Paulo, Vale; Ana Clara Guerrini Schenberg;
Caracterização de fagos de Streptomyces; 1994; Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Gabriel Padilla;
Produções bibliográficas
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Outras produções
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BALAN, Andrea . Estrutura e Função de Proteínas. 2003 (Aulas) .
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BALAN, Andrea . Fatores que aletram a regulação da expressão gênica em Aspergillus nidulans. 2000 (Seminário) .
BALAN, Andrea . Controle de Microrganismos Manipulados no Ambiente. 2000 (Aulas) .
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BALAN, Andrea . Processos de Metilação em Eucariotos. 1999 (Aulas) .
BALAN, Andrea . Isolamento e Caracterização de Novos fagos de Streptomyces. 1995 (Seminário) .
2020 - Atual
Geração de novos antígenos para vacinas e diagnóstico de SARS-COV-2 e outros, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Luis Carlos de Souza Ferreira em 02/06/2020., Descrição: O SARS-CoV-2 é um vírus de RNA de cadeia positiva, cujo genoma tem aproximadamente 29.7 kb e compartilha 79,5% de identidade de sequência com SARS-CoV.2 Além de 16 proteínas não estruturais codificadas pela poliproteína ORF1ab, o vírus possui 4 proteínas estruturais principais, incluindo a proteína spike (S), proteína nucleocapsídeo (N), proteína membrana (M) e proteína envelope (E).3 Estas proteínas tem sido os maiores alvos para o desenvolvimento de vacinas para o SARS-CoV-2. Por outro lado, a produção das proteínas completas (full length) ou em domínios, pode apresentar muitas dificuldades em relação à expressão, enovelamento e estabilidade nos sistemas heterólogos, principalmente os mais comumente usados como bacterianos e de leveduras. De fato, a produção das proteínas de SARS-CoV-2 e SARS-CoV obtidas até o momento tem se mostrado mais eficiente em células de insetos e células de mamíferos em culturas celulares, o que nem sempre é acessível e oferece uma forma rápida de produção em larga escala. Para contornar o problema da expressão de proteínas heterólogas em sistemas eucarióticos - o que além de ser mais custoso, demanda tempo e infraestrutura apropriada - e os problemas de produção de epítopos sintéticos que nem sempre adquirem a conformação nativa, escolhemos a técnica RAD Display4 para a produção de peptídeos de proteínas virais. Nesse sistema, as sequências de interesse são clonadas no interior do gene radA de Pyrococcus furiosus5 utilizando-se o protocolo independente de ligase (Ligase Independent Cloning, LIC)6 e expressas como proteínas de fusão em células de Escherichia coli. A estabilidade e características bioquímicas da proteína RadA-fusionada facilita sua purificação por protocolo bem estabelecido4, o que gera resultados mais rápidos e menos onerosos. Destacam-se a facilidade de clonagem das sequências de interesse em larga-escala e a produção das proteínas em curto período de tempo (máximo de 40 dias). O projeto visa a produção de vários epítopos em larga escala e testes para desenvolvimento de estratégias vacinais e de diagnóstico.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Andrea Balan Fernandes - Integrante / Luis Carlos de Souza Ferreira - Coordenador / Marcelo de Cássio Barreto de Oliveira - Integrante / Victor Cioffi - Integrante / Stephany Torres - Integrante.
2019 - Atual
Investigando a Patogênese e a Resistência à Drogas em Microrganismos - Caracterização e Controle de Transportadores ABC, Descrição: Transportadores ABC apresentam grande relevância médica e farmacêutica uma vez que são relacionados ao desenvolvimento do fenômeno de múltipla resistência a drogas (MDR) no tratamento do câncer, resistência bacteriana, infectividade e patogênese. Apesar de extensivamente estudados em muitos organismos, existem poucos estudos funcionais ou estruturais sobre estes transportadores em Mycobacterium tuberculosis e Xanthomonas citri pv. citri, duas bactérias patogênicas estudadas pelo nosso grupo. Neste projeto, serão desenvolvidas diferentes abordagens para a determinação de função dessas proteínas nos mecanismos de patogênese e resistência bacteriana, estudos estruturais para compreensão de mecanismos de interação e, formas de inibição dos transportadores. Em trabalhos do grupo, mostramos que proteínas pertencentes ao regulon Pho, de controle dos níveis de fosfato em bactérias, são conservadas em X. citri e induzidas em carência de fosfato. Dentre as mais de 31 proteínas, estão inclusos componentes do transportador de fosfato do tipo ABC, sistema PstSCAB, do regulador negativo PhoU, e do sistema de dois-componentes PhoR/PhoB. Especificamente, ortólogos dessas proteínas tem sido diretamente associados aos processos de infecção e patogênese em diferentes microrganismos. Neste trabalho pretendemos dar continuidade à caracterização funcional/estrutural das proteínas mencionadas, principalmente com ênfase nos estudos dos complexos, interações entre os componentes e mecanismos de ativação de resposta. As proteínas foram avaliadas por métodos de bioinformática e modelagem molecular, e, isoladamente ou em complexos, serão submetidas a ensaios biofísicos e estruturais de espalhamento de raios X de baixo ângulo (SAXS) e cristalização, e adicionalmente, ensaios funcionais a partir da obtenção de linhagens de X. citri portadoras de mutações nos genes de interesse e estudos de infecção em plantas de Citrus sinensis. Em paralelo, temos estudado formas de inibição de transportadores ABC utilizando duas abordagens diferentes: (i) sistema RAD-display para expressão de hélices pertencentes às permeases dos transportadores e bloqueio da interação com as ATPases e proteínas ligadoras, e (ii) inibição de proteínas essenciais utilizando a metodologia de desenvolvimento de fragmentos (Fragment Based Drug Discovery). A caracterização estrutural destes transportadores, bem como a determinação do papel funcional nas referidas bactérias de interesse, será de grande relevância científica e aplicada. . , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (4) / Doutorado: (4) . , Integrantes: Andrea Balan Fernandes - Coordenador / Celso Eduardo benedetti - Integrante / Isabel de Moraes - Integrante / Ana Carolina Ramos Moreno - Integrante / Marko Hyvonen - Integrante / Ana Marcia de Sá Guimaraes - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2018 - Atual
Caracterização funcional e estrutural de transportadores ABC e proteínas associadas de Xanthomonas citri para o entendimento de mecanismos de infecção, patogenicidade e resistência em bactérias, Descrição: Xanthomonas citri é a bactéria responsável pelo cancro cítrico, doença de disseminação mundial que afeta um grande número de variedades de plantas levando a problemas ecônomicos e sociais de grande impacto. O único método de controle é a remoção de árvores ao redor de um foco de infecção, o que contribui para seus efeitos econômicos devastadores, e acentua a necessidade de novas estratégias de controle da infecção. Comparado com outros patógenos que infectam citros, X. citri apresenta mecanismos de infecção e virulência diferenciados como a formação de biofilme, interação com o hospedeiro e sistemas secretórios específicos, os quais incluem além de outros, os Transportadores do tipo ABC (do inglês ATP-Binding Cassete). Transportadores ABC são uma das mais importantes famílias de proteínas que associa a hidrólise do ATP ao transporte de diferentes moléculas através da membrana. Apesar da sua importância em fenômenos como patogênese e virulência bacterianas, pouco se conhece sobre esta família em fitopatógenos e X. citri. Neste trabalho, propomos a caracterização de proteínas do sistema de transporte ABC de fosfato PstBCAS PhoU e sua interação com proteínas do sistema sensor dois-componentes PhoR-PhoB e caracterizar as diferenças estruturais, funcionais e de interação das proteínas periplasmáticas de transportadores ABC relacionados com a assimilação de sulfonatos. Resultados prévios obtidos pelo nosso grupo mostraram que o sistema de captação de fosfato em X. citri, apesar de conservado, apresenta diferenças significativas em termos de regulação e interação das proteínas envolvidas. Por outro lado, em relação à captação de compostos sulfonados, X. citri apresenta três diferentes sistemas em contrapartida com E. coli e outrosmicrorganismos que apresentam apenas um. A deleção de genes destes transportadores envolvidos com o transporte de fosfato, sulfato e sulfonatos afetam significativamente a virulência da bactéria em plantas de Citrus sinensis evidenciando a importância dos mesmos. As proteínas de interesse já são expressas em E. coli a partir de vetores de expressão específicos e uma série de dados preliminares foram produzidos para fundamentar esta proposta. Neste sentido, duas abordagens serão utilizadas para os sistemas de fosfato e sulfonatos, respectivamente: (i) expressão e purificação das proteínas e ensaios espectroscópicos e biofísicos para a avaliação da interação e afinidade por diferentes subtratos/proteínas e, (ii) estrutural, baseada em estudos de modelagem molecular, SAXS e cristalografia. É importante ressaltar que para obtenção dos resultados contamos com a colaboração do Dr. Marko Hyvonen (Depto. de Bioquímica da Universidade de Cambridge), especialista em estudos de interação proteína/proteína e do Dr. Dirk Slotboom (Depto. de Bioquímica da Universidade de Groningen, Holanda), um dos maiores especialistas no estudo de transportadores ABC. Os resultados obtidos serão compilados a outros obtidos previamente para a preparação de manuscritos que serão publicados em revistas de impacto e disseminação científica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (4) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (4) . , Integrantes: Andrea Balan Fernandes - Coordenador / Luis Carlos de Souza Ferreira - Integrante / Isabel de Moraes - Integrante / Ana Carolina Ramos Moreno - Integrante / Marko Hyvonen - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico - Auxílio financeiro.Número de orientações: 9
2016 - 2018
Estudos Funcionais e Estruturais de Transportadores do Tipo ABC de Mycobacterium tuberculosis e Xanthomonas citri, Descrição: Proteínas de membrana são consideradas os novos desafios da Biologia Estrutural dada a sua relevância médica. Mais de 50% dos alvos da indústria farmacêutica envolvem estas proteínas as quais representam cerca de 30% dos genomas de organismos. Com o objetivo de montarmos uma plataforma para a expressão e produção de proteínas de membrana em nosso laboratório, para uso em ensaios funcionais in vitro e estudos estruturais, escolhemos como alvos transportadores do tipo ABC (do inglês, ATP_Binding Cassete), uma das maiores famílias de proteínas integrais de membrana. Transportadores ABC apresentam grande relevância médica e farmacêutica uma vez que são relacionados ao desenvolvimento do fenômeno de múltipla resistência à drogas (MDR) no tratamento do câncer, resistência bacteriana, infectividade e patogênese. Apesar de extensivamente estudados em muitos organismos, existem poucos estudos funcionais ou estruturais sobre estes transportadores em Mycobcaterium tuberculosis e Xanthomonas citri, duas bactérias patogênicas estudadas pelo nosso grupo. Em trabalhos recentes, temos evidenciado a importância de componentes da família ABC na infecção e patogenicidade de X. citri, incluindo a presença de ao menos quatro transportadores relacionados à captação de sulfato (SbpCysUWA) e compostos sulfonados (SsuABCDE). A resolução da estrutura da proteína ligadora de sulfato Sbp na presença de sulfato e ensaios biofísicos confirmaram a sua função e expressão em ensaios in vivo. Em paralelo, em trabalho realizado em colaboração com a Dra Isabel de Moraes do Laboratório de Proteínas de Membrana do Diamond Light Source e OPPF em Oxfordshire, clonamos e realizamos análises de expressão de 17 transportadores do tipo ABC de M. tuberculosis, a maioria envolvida no efluxo de drogas como também na assimilação de moléculas fundamentais para o metabolismo celular. Dada a importância destes transportadores, a ausência de dados funcionais e a experiência do nosso grupo com esta família de proteínas, este projeto visa a caracterização funcional e estrutural dos transportadores de M. tuberculosis envolvidos com o transporte de glutamina (Rv2563/Rv2564), de drogas (Rv1747), e o transportador de sulfato de X. citri (SbpCysUWA). Neste sentido, pretende-se expressar, purificar e produzir os transportadores em complexo ou os componentes isolados para resolução de suas estruturas cristalográficas e realização de estudos funcionais. Ainda, o desenvolvimento deste projeto será de grande importância para a formação de um grupo com experiência na manipulação de proteínas de membrana para estudos funcionais e estruturais, uma das grandes áreas expoentes no estudo de proteínas e carentes no Brasil.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (5) . , Integrantes: Andrea Balan Fernandes - Coordenador / Isabel de Moraes - Integrante / Ana Letícia G. Lusa - Integrante / Louise Bird - Integrante / Dirk Jan Slotboom - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 5
2015 - 2018
Inhibition of the nucleotide binding domains of ABC transporters from Mycobacterium tuberculosis, Descrição: The main focus of our research is in the development of chemical lead molecules for the inhibition of protein-protein interactions. In close collaboration with chemists, we use fragment-based drug discovery methods to identify starting points for chemical elaboration to small molecules that bind and inhibit biologically important interactions with high affinity and specificity. We are in charge of the biochemistry, biophysics and structural biology in these multidiscplinary projects. One of the main technical foci in our work has been protein engineering to develop suitable experimental systems to support the inhibitor development. Particular emphasis has been in establising robust X-ray crystallographic platforms for our targets, to enable continuous structural analysis of new inhibitors to support further development. One of our main targets has been human recombinase RAD51 and during the course of 6-7 years, we have developed nanomolar inhibtors against a binding site that is predicted to be very poorly druggable. We have also been involved in the development of new types of stapled peptides in collaboration with Prof Spring in the Dept of Chemistry. Another major area of research in my group is structure-function analysis of TGF- beta family growth factors. We are interested in understanding how these molecules interact with their receptors and inhibitors, with particular interest in understanding the role of the pro-domains of the growth factors in their regulation.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (3) . , Integrantes: Andrea Balan Fernandes - Coordenador / Marko Hyvonen - Integrante / Andreia Navarro Cerone - Integrante / Lilia Judith Iriarte De La Torre - Integrante / Marcelo de Cássio Barreto de Oliveira - Integrante., Financiador(es): Royal Society - Auxílio financeiro.Número de orientações: 3
2012 - 2018
Caracterização Funcional e Estrutural de Enzimas Lipolíticas de um Consórcio Microbiano Degradador de Óleo Diesel, Descrição: A utilização de micro-organismos para o processamento de materiais naturais é realizada há décadas e vem crescendo com as novas descobertas em termos de métodos de isolamento, caracterização e cultivo destes. Estudos de populações microbianas de diferentes habitats, utilizando sequências conservadas dos genes 16S rRNA e 18S rRNA mostra que a maior parte dos micro-organismos que compõem a biosfera ainda não foi estudada. Esta diversidade populacional e genética vem sendo objeto de estudo em diferentes aspectos, mas principalmente com o objetivo de identificar microrganismos com potencial de biorremediação, farmacêutico e biotecnológico. Uma das estratégias mais empregadas que oferece uma combinação quase ilimitada para encontrar novos genes codificadores de produtos relevantes é a abordagem metagenômica, a partir da qual o DNA genômico de microrganismos presentes em amostras do ambiente é isolado e clonado em vetores específicos para a construção de bibliotecas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Andrea Balan Fernandes - Coordenador / Mariana Rangel Pereira - Integrante / MAESTER, THAÍS CARVALHO - Integrante / LEMOS, ELIANA G. DE MACEDO - Integrante / Marko Hyvonen - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 2 / Número de orientações: 1
2011 - 2018
Modelos biológicos de interação planta-patógeno para o entendimento de mecanismos de patogenicidade e adaptação de fitobactérias, respostas de defesa e desenvolvimento de doença em citros, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Andrea Balan Fernandes - Integrante / Celso Eduardo Benedetti - Coordenador.
2009 - 2015
Estudos estruturais e funcionais de transportadores ABC em Microrganismos Patogênicos ? Aspectos sobre infectividade, virulência e resistência, Descrição: Transportadores ABC representam uma das maiores famílias protéicas estruturalmente formadas por uma proteína ligadora resposeavel pela afinidade e especificidade (em procariotos), dois componentes de membrana que formam o poro de passagem e dois componentes citoplasmáticos que fornecem energia ao transporte. Como tal estão envolvidos em diferentes funções nas células de todos os tipos de organismos. Em bactérias são responsáveis por mecanismos de resistência, patogênese, formação de biofilmes, transporte e nutrição e reparo de DNA. Em eucariotos são os principais alvos da indústria farmacêutica uma vez que são responsáveis pelo fenômeno de múltipla resistência à drogas (MDR) no tratamento de tumores. Xanthomonas axonopodis pv. citri (X. axonopodis) é uma bactéria fitopatogênica de grande interesse porque é responsável pelo cancro cítrico, doença que afeta plantas no Brasil e no mundo levando à perdas econômicas significativas. O estudo do genoma desta bactéria revelou que 4% deste codifica proteínas desta família. Neste sentido, nosso grupo tem trabalhado com estas proteínas funcional e estruturalmente, visando identificar transportadores que sejam importantes para o crescimento, infectividade e patogênese, de forma a identificarmos alvos para o desenvolvimento de drogas e inibidores de crescimento. Estudos de proteoma da X. axonopodis revelaram que cerca de 28 transportadores do tipo importador e 14 exportadores de drogas são ativados durante a infecção em plantas de citros. Neste projeto visamos a caracterização funcional e estrutural de proteínas envolvidas com os transportes de molibdato, maltose, fosfato, putrescina, ferro, sulfato e alcanosulfonatos. As proteínas dos transportadores e associadas aos transportes são expressas e produzidas em larga escala para ensaios espectroscópicos e calorimétricos, caracterização de ligantes, cristalização e difração de cristais, resolução das estruturas por cristalografia e ensaios in vivo utilizando mutantes de X. axonopo. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Andrea Balan Fernandes - Coordenador / Vanessa Pegos - Integrante / Cristiane Tambascia Pereira - Integrante / Aline S. Pinto - Integrante / Celso Eduardo Benedetti - Integrante / Dirk Jan Slotboom - Integrante / Pamela de Oliveira Pena - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 11 / Número de orientações: 5
2009 - 2011
Caracterização estrutural de proteínas periplasmáticas de X. axonopodis pv. citri e X. campestris pv. campestris, Descrição: Sistemas de transporte ABC são proteínas extremamente importantes em todos os organismos uma vez que desempenham diferentes funções relacionadas ao transporte de moléculas incluindo o fenômeno de resistência à drogas em células cancerígenas. Em bactérias gram negativas tais sistemas são constituídos por três proteínas: uma periplasmática ligadora que é responsável pela afinidade e especificidade do sistema, duas proteínas de membrana que formam o poro de passagem e duas proteínas associadas à membrana responsáveis hidrólise de ATP e liberação de energia para que o transporte ocorra. Os genomas de Xanthomonas axonopodis pv. citri (Xac) e Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc), bactérias patogênicas de grande interesse econômico, apresentam 4% dos genes dedicados à codificação de proteínas desta família, o que ressalta a importância da mesma. Apesar desta importância, muito pouco se conhece sobre tais transportadores e seu papel na fisiologia das bactérias, bem como se existe relação dos mesmos com os mecanismos de infecção e patogênese. Nosso grupo tem se dedicado ao estudo funcional e estrutural de 6 proteínas ligadoras de X. axonopodis, e os resultados tem demonstrado que estas proteínas apresentam características distintas de outros ortólogos. Neste sentido, este projeto pretende dar continuidade aos estudos já iniciados aumentando o número de alvos e incluindo ortólogos de X. campestris para que possam ser realizadas comparações entre os sistemas. Também é objetivo deste trabalho, usar a formação e conhecimento na área de Biologia Estrutural de Proteínas do grupo para o desenvolvimento de um Laboratório de Pesquisas em Biologia Estrutural e Funcional no Instituto de Ciências Biomédicas da USP, ainda carente deste perfil.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Andrea Balan Fernandes - Coordenador / Vanessa Pegos - Integrante.
2007 - 2009
Caracterização Estrutural das Proteínas Ligadoras de Maltose e Alcanosulfonatos de Xanthomonas citri, Descrição: O projeto se baseia na caracterização bioquímica e estrutural das proteínas ligadoras de Maltose (Male) e alcanosulfonatos (SsuA2) do sistema de transporte ABC de X. citri. As proteínas são caracterizadas por ensaios espectroscópicos de CD e fluorimetria, modelagem molecular, interação com ligantes específicos por experimentos de ITC e thermal shift. Também é objetivo do trabalho resolver as estruturas tri-dimensionais destas proteínas por cristalografia.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Andrea Balan Fernandes - Coordenador / Joao Alexandre Barbosa - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
2007 - 2008
Molecular dynamics simulations of the ModA and ModB proteins for structural analysis of the molybdate transport system from Xanthomonas axonopodis pv. citri, Descrição: ATP-binding cassette (ABC) transporters couple ATP hydrolysis to the uptake and efflux of solutes across the cell membrane in bacteria and eukaryotic cells. In eukaryotic cells this system is associated to the phenomena of multiple drug resistance and in bacteria these transporters are important virulence factors because they play roles in nutrient uptake and in secretion of toxins and antimicrobial agents. The specific transport of a essential nutrient such as molybdate in gram-negative bacteria occurs via a specific ABC transport system and involves a periplasmic molybdate-binding protein (ModA), that is responsible for the specificity and affinity of the transport; a permease protein that constitutes the translocation pathway across the membrane (ModB) and an ATPase protein (ModC) that interacts with the permease at its the cytoplasmic surface to supply the energy for the active transport. In order to characterize the interactions between the periplasmic and cytoplasmic components with the membrane protein, the complete system of molybdate transport from the phytopatogenic bacteria Xanthomonas citri, is being characterized. The crystal structure of the X. citri ModA was solved by X-ray crystallography at 1.7 and site-directed mutagenesis is being carried out to assess the importance of some key residues involved in the structure maintenance, ion binding and interaction. Additionally, the recombinant Xac ModC protein is been expressed in E. coli cells in order to solve its 3D structure. In this project we expect to perform the molecular dynamics (MD) simulations of (i) the ModA protein in the presence and absence of molybdate and (ii) the periplasmic interface between ModA and ModB proteins. The final characterization of the transport process involving these proteins will help a better understanding of the molybdate transport mechanism in Xanthomonas and can be useful for the future development of strategies of bacterial control using transport inhibitors.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Andrea Balan Fernandes - Integrante / Carolina Santacruz Perez - Integrante / Joao Alexandre Barbosa - Integrante / Erick Lindahl - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
2006 - 2010
Estudos estruturais e funcionais da proteína ligadora de molibdato (ModA) e demais componentes do sistema de transporte de molibdato tipo ABC de Xanthomonas axonopodis pv. citri, Descrição: A análise estrutural de proteínas é fundamental para estudo funcional de genes envolvidos em diferentes etapas do metabolismo microbiano, podendo contribuir para o desenvolvimento de estratégias de controle de espécies bacterianas de interesse médico ou agrícola. Os sistemas de transporte ativo de nutrientes são essenciais para a sobrevivência de qualquer célula, e dependem de proteínas associadas à membrana citoplasmática. Em bactérias, o sistema de transporte ABC (ATP-Binding Cassete) precisa de um componente solúvel responsável pelo reconhecimento e ligação do substrato a ser translocado para o interior da célula. O presente projeto tem como ponto de partida, a caracterização estrutural da proteína ModA de Xanthomonas axonopodis pv. citri (Xac), componente solúvel do sistema de transporte de molibdato (MoO4). O elemento molibdênio é fundamental para a maioria das bactérias porque é incorporado aos cofatores molibdopterinas, presentes em enzimas envolvidas nas reações de óxido-redução de importantes ciclos metabólicos. O sistema de transporte ABC de molibdato em Xac também conta com a presença de mais duas proteínas: ModB (a proteína que forma o canal de passagem através da membrana) e ModC (uma ATPase que interage com ModB no lado citoplasmático da membrana e libera energia para o transporte). Em Xac, muito pouco se conhece sobre o funcionamento dos sistemas de transporte de oxiânions, e é especificamente desconhecido, o mecanismo de interação entre a proteína periplasmática, a proteína ATPase e o componente de membrana. Este trabalho busca propor/identificar as estruturas do sistema de transporte ABC de molibdato em Xac e as possíveis regiões de interação entre os mesmos, através da resolução das estruturas cristalográficas das proteínas ModA e ModC e da modelagem molecular do complexo ModA-ModB-ModC. O projeto também prevê, a obtenção de proteínas ModA mutadas em aminoácidos específicos e a posterior análise da importância dos mesmos na ligação com o substrato. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Andrea Balan Fernandes - Coordenador / Carolina Santacruz Perez - Integrante / Joao Alexandre Barbosa - Integrante / Vanessa Pegos - Integrante.
2005 - 2006
Melhoramento Genético de Microrganismos Visando a Biorremediação de Efluentes de Metais Pesados, Descrição: MELHORAMENTO GENÉTICO DE MICRORGANISMOS VISANDO A BIORREMEDIAÇÃO DE EFLUENTES DE METAIS PESADOS Coordenação: Ana Clara Guerrini Schenberg NAP-Biotecnologia Universidade de São Paulo Companhia Vale do Rio Doce BIOSSEGURANÇA EM RELAÇÃO AOS MICRORGANISMOS GENETICAMENTE MODIFICADOS Andrea Balan Ana Clara Guerrini Schenberg 1. Resumo Em trabalhos anteriores do nosso laboratório, foi criado um sistema suicida para microrganismos do tipo OGM (Organismos Geneticamente Modificados), que garante a biossegurança, uma vez que evita a disseminação do OGM na natureza por meio da destruição do material genético do próprio OGM. Nestes trabalhos, a ação de uma nuclease, cuja produção pela célula é controlada pela concentração de glicose presente no meio de cultura, é responsável pela destruição do DNA e RNA celulares. Este sistema, também desenvolvido para bactérias, se mostrou efetivo na contenção do OGM após o exercício de sua função. Neste trabalho, serão desenvolvidos sistemas suicidas para todas as linhagens recombinantes produzidas ao longo do presente projeto, que se destinarem aos processos de biorremediação de ambientes contaminados com diferentes metais.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Andrea Balan Fernandes - Integrante / Ana Clara G Schenberg - Coordenador / Andreia Nunes Gouveia - Integrante / Elisabete Jose Vicente - Integrante / Léa Denise Barco - Integrante., Financiador(es): Companhia Vale do Rio Doce - Bolsa.
2005 - 2006
Biossegurança em Relação aos Microrganismos Geneticamente Modificados, Descrição: BIOSSEGURANÇA EM RELAÇÃO AOS MICRORGANISMOS GENETICAMENTE MODIFICADOS Andrea Balan Ana Clara Guerrini Schenberg 1. Resumo Em trabalhos anteriores do nosso laboratório, foi criado um sistema suicida para microrganismos do tipo OGM (Organismos Geneticamente Modificados), que garante a biossegurança, uma vez que evita a disseminação do OGM na natureza por meio da destruição do material genético do próprio OGM. Nestes trabalhos, a ação de uma nuclease, cuja produção pela célula é controlada pela concentração de glicose presente no meio de cultura, é responsável pela destruição do DNA e RNA celulares. Este sistema, também desenvolvido para bactérias, se mostrou efetivo na contenção do OGM após o exercício de sua função. Neste trabalho, serão desenvolvidos sistemas suicidas para todas as linhagens recombinantes produzidas ao longo do presente projeto, que se destinarem aos processos de biorremediação de ambientes contaminados com diferentes metais.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (4) . , Integrantes: Andrea Balan Fernandes - Coordenador / Ana Clara G Schenberg - Integrante., Financiador(es): Companhia Vale do Rio Doce - Remuneração.
2004 - 2006
Análise Funcional e Estrutural de Proteínas Ligadoras do Sistema de Transporte ABC de Xanthomonas citri, Descrição: Análise Funcional e Estrutural de Proteínas Ligadoras do Sistema de Transporte ABC de Xanthomonas citri A Citricultura é de fundamentental importância para a economia brasileira e é a segunda atividade economicamente importante no Estado de São Paulo. Esta economia representa 400.000 empregos diretos e envolve 4 bilhões de dólares por ano em transações financeiras, dos quais 1.5 bilhões, em exportações. Exitem duas principais doenças que afetam os citrus: a clorose variegada dos citrus (CVC), causada pela bactéria Xylella fastidiosa, e o cancro cítrico, causada pela bactéria Xanthomonas citri. Esta última é um gênero bacteriano que ataca não apenas citros, mas arroz, feijão, uvas e algodão (Chen et al., 1994). Há cerca de dois anos, quando os genomas das Xanthomonas citri e Xanthomonas campestris foram inteiramente sequenciados pelo consórcio ONSA, foi possível identificar que 4% destes é representado por genes da família de proteínas denominada "ABC de transporte" (de ATP Binding Cassete). Transportadores do tipo "ABC" são sistemas de transporte celular extremamente importantes nos processos de importação e exportação de substâncias através da membrana, mas também são associados à outras funções como regulação da transcrição e tradução, reparo de DNA, resistência à drogas, patogenicidade e resposta imunológica (Dassa, 2000). Esses sistemas apresentam uma organização estrutural e funcional comum formada por três tipos de componentes protéicos. Duas proteínas integradas à membrana (permeases), duas proteínas de membrana periféricas que ligam e hidrolizam ATP, e uma proteína periplasmática (ou lipoproteína) ligadora de substrato. Esta proteína ligadora é responsável pela especificidade e afinidade do sistema, uma vez que promove a captação e a entrada na célula de uma série de compostos, como peptídeos, açúcares, íons, metais, etc (Higgins, 2001). Curiosamente, apesar de ambas as bactérias apresentarem cerca de 90% de homologia de sequências, os mecanismos de inf. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Andrea Balan Fernandes - Coordenador / Cristiane Santos Souza - Integrante / Carolina Santacruz Perez - Integrante / Alexandre Moutran - Integrante / Luis Carlos de Souza Ferreira - Integrante / Carlos H Ramos - Integrante / Goran Neshich - Integrante.
2001 - 2005
Estudo dos Transportadores ABC em Diferentes Espécies de Xanthomonas, Descrição: O projeto consiste na identificação de genes que compõem o sistema de transporte ABC de Xanthomonas axonopodis pv. Citri e obtenção de mutantes por deleção com a finalidade de se estudar a função dos mesmos na bactéria. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Andrea Balan Fernandes - Integrante / Cristiane Santos Souza - Integrante / Elisa E. Oshiro - Integrante / Luís Carlos Souza Ferreira - Integrante / Carolina Santacruz Perez - Integrante / Rita de Cassia Cafe Ferreira - Coordenador / Alexandre Moutran - Integrante / Roberto Nepomuceno - Integrante / Milene Tavares - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2 / Número de orientações: 1
2001 - 2005
Rede de Biologia Molecular e Estrutural de Proteínas - FAPESP, Descrição: A Rede Molecular de Biologia Estrutural é um projeto que envolve 15 grupos de pesquisa no Estado de São Paulo, financiado pela FAPESP , e que tem como objetivo, capacitar pesquisadores na área de Biologia Estrutural e Química de Proteínas. Este projeto têm colaboração do Laboratório Nacional de Luz Síncroton, em Campinas O trabalho consiste na clonagem, expressão e purificação de proteínas de natureza microbiana para, em seguida, usando técnicas como Cristalografia, Ressonância Nuclear Magnética e Dicroísmo Circular, resolver as estruturas tri-dimensionais destas. Quatro proteínas foram escolhidas: proteína Ligadora de Oligopeptídeos de (OppA) Xanthomonas axonopodis pv Citri, as proteínas do Vírus do Papiloma Humano E6 e E7 e a região globular da fibra curta do Adenovírus. Todas estas proteínas apresentam-se como temas de estudo de outros projetos em andamento no nosso laboratório ou em laboratórios do ICB-2 (USP) portanto, a resolução da estrutura destas proteínas trará, sem dúvida, uma série de informações relevantes para a função e mecanismos de atuação de cada uma.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Andrea Balan Fernandes - Integrante / Cristiane Santos Souza - Integrante / Luís Carlos Souza Ferreira - Coordenador / Carolina Santacruz Perez - Integrante / Joao Alexandre Barbosa - Integrante / Marcelo Bilbancos - Integrante / Fabiano Tofoli de Araújo - Integrante / Eduardo Hiroshi Nakamatsu - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 7 / Número de orientações: 2
2001 - 2004
Desenvolvimento de Estratégias Vacinais para HPV-16, Descrição: O projeto caracteriza-se pelo desenvolvimento de novas estratégias vacinais baseadas nas proteínas oncogênicas do vírus do papiloma Humano HPV-16, E6 e E7. Após a clonagem e expressão destas proteínas, análises estruturais são realizadas no intuito de melhorar as respostas antigênicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Andrea Balan Fernandes - Integrante / Luís Carlos Souza Ferreira - Coordenador / Márcio O. Lasaro - Integrante / Marcelo Bilbancos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1
1999 - 2001
Estudo de Fatores que Alteram o padrão de Metilação em Aspergillus nidulans, Descrição: O projeto baseou-se no estudo de mutantes que produziam um fator capaz de alterar a expressão gênicae a recombinação em Aspergillus nidulans.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Andrea Balan Fernandes - Coordenador / Tânia Maria Araújo Domingues Zucchi - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 8
Prêmios
2014
Menção Honrosa pelo trabalho Phosphate regulated proteins from Xanthomonas citri: a proteomic view, Departamento de Microbiologia.
2009
Prêmio de melhor poster na 19a Reunião da Associação de Crsitalografia, International Union of Crystallography.
2005
Menção Honrosa na V Reunião Científica do Departamento de Microbiologia - USP, Instituto de Ciencias Biomédicas II - Sociedade Brasileira de Microbiologia.
2004
Menção Honrosa no 12o. Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP, Pró-Reitoria de Pesquisa da USP.
2004
Menção Honrosa na IV Reunião Científica do Instituto de Ciências Biomédicas, Departamento de Microbiologia - Universidade de São Paulo.
2002
Prêmio Governador do Estado, SEDAI- Serviço Estadual de Assistência aos Inventores.
1999
Seleção para o Prêmio Jovem Geneticista 1999, Sociedade Brasileira de Genética.
Histórico profissional
Endereço profissional
Universidade de São Paulo, Instituto de Ciências Biomédicas. , Avenida Professor Lineu Prestes, 1374 ICB2, sala 154, Butantã, 05508000 - São Paulo, SP - Brasil, Telefone: (11) 30917754, Fax: (11) 30917420, URL da Homepage:
Experiência profissional
2014 - Atual
Universidade de São PauloVínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Doutor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2005 - 2006
Universidade de São PauloVínculo: Bolsista Pós-Doutorado, Enquadramento Funcional: pós-doutor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações:
MELHORAMENTO GENÉTICO DE MICRORGANISMOS VISANDO A BIORREMEDIAÇÃO DE EFLUENTES DE METAIS PESADOS Coordenação: Ana Clara Guerrini Schenberg NAP-Biotecnologia Universidade de São Paulo Companhia Vale do Rio Doce BIOSSEGURANÇA EM RELAÇÃO AOS MICRORGANISMOS GENETICAMENTE MODIFICADOS Andrea Balan Ana Clara Guerrini Schenberg 1. Resumo Em trabalhos anteriores do nosso laboratório, foi criado um sistema suicida para microrganismos do tipo OGM (Organismos Geneticamente Modificados), que garante a biossegurança, uma vez que evita a disseminação do OGM na natureza por meio da destruição do material genético do próprio OGM. Nestes trabalhos, a ação de uma nuclease, cuja produção pela célula é controlada pela concentração de glicose presente no meio de cultura, é responsável pela destruição do DNA e RNA celulares. Este sistema, também desenvolvido para bactérias, se mostrou efetivo na contenção do OGM após o exercício de sua função. Neste trabalho, serão desenvolvidos sistemas suicidas para todas as linhagens recombinantes produzidas ao longo do presente projeto, que se destinarem aos processos de biorremediação de ambientes contaminados com diferentes metais.
2001 - 2004
Universidade de São PauloVínculo: Bolsista pós-doutorado, Enquadramento Funcional: pós-doutor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
1999 - 2001
Universidade de São PauloVínculo: bolsista pós-doutorado, Enquadramento Funcional: pós-doutor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
1995 - 1999
Universidade de São PauloVínculo: Doutorando, Enquadramento Funcional: Aluno de Doutorado, Carga horária: 40
Outras informações:
Aluna de doutorado pelo Departamento de Microbiologia da Universidade de São Paulo sob orientação da Profa. Ana Clara G. Schenberg
1991 - 1994
Universidade de São PauloVínculo: Mestrando, Enquadramento Funcional: Aluno de Mestrado, Carga horária: 40
Outras informações:
Aluna de Mestrado em Biotecnologia pelas institutições: USP-IPT-I. Butantã
1991 - 1991
Universidade de São PauloVínculo: Estagiário, Enquadramento Funcional: Aluno de aperfeiçoamento, Carga horária: 40
Outras informações:
Estágio realizado no Departamento de Microbiologia da Universidade de São Paulo, sob orientação do Prof. Gabriel Padilla
Atividades
Pesquisa e desenvolvimento , Departamento de Microbiologia, .,Linhas de pesquisa
Ensino, Pós Graduação Em Biotecnologia, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Metabolismo Microbiano, Biologia Molecular
Treinamentos ministrados , American Society For Microbiology, Instituto de Ciências Biomédicas II.,Treinamentos ministrados, Preparação do Curso e Ministrar aulas
Pesquisa e desenvolvimento , Departamento de Parasitologia, .,Linhas de pesquisa
Estágios , Departamento de Microbiologia, Instituto de Ciências Biomédicas II.,Estágio realizado, Estágio em Genética Molecular e de Microrganismos.
2008 - 2008
Universidade de CambridgeVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: pós-doutor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
Pesquisa e desenvolvimento , Universidade de Cambridge - Departamento de Bioquímica, .,Linhas de pesquisa
Pesquisa e desenvolvimento , Universidade de Cambridge - Departamento de Bioquímica, .,Linhas de pesquisa
Pesquisa e desenvolvimento , Universidade de Cambridge - Departamento de Bioquímica, .,Linhas de pesquisa
2012 - Atual
Diamond Light Source, DiamondVínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Colaborador
Atividades
Pesquisa e desenvolvimento , Membrane Protein Laboratory - Diamond Light Source, .,Linhas de pesquisa
2010 - 2014
Centro Nacional de Pesquisa em Energia e MateriaisVínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2007 - 2009
Centro Nacional de Pesquisa em Energia e MateriaisVínculo: Bolsista recém-doutor, Enquadramento Funcional: pós-doutor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
Pesquisa e desenvolvimento , Laboratório Nacional de Biociências, .,Linhas de pesquisa
2006 - 2006
California Institute of TechnologyVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pos-doutor, Carga horária: 40
Atividades
Estágios , Howard Hughes Medical Institute Research, Division Of Biology.,Estágio realizado, Estágio em Biofísica e Estrutura de Proteínas.
2010 - 2010
Stockholm UniversityVínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: colaborador
Atividades
Pesquisa e desenvolvimento , Dept. Biochemistry & Biophysics, .,Linhas de pesquisa
2019 - Atual
Universidade Estadual de CampinasVínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor Colaborador
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