Camilla Reginatto de Pierri

Pós-doutorado

Formação complementar

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Organização de eventos

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Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• PINTO, A. C. S. M. ; PIERRI, C. R. ; EVANGELISTA, A. G. ; GOMES, A. S. L. B. ; LUCIANO, F. B. . Deoxynivalenol: Toxicology, Degradation by Bacteria, and Phylogenetic Analysis. Toxins , v. 14, p. 1-19, 2022.

• PERICO, CAMILA P. ; DE PIERRI, CAMILLA R. ; NETO, GIUSEPPE PASQUALATO ; FERNANDES, DANRLEY R. ; PEDROSA, FABIO O. ; DE SOUZA, EMANUEL M. ; RAITTZ, ROBERTO T. . Genomic landscape of the SARS-CoV-2 pandemic in Brazil suggests an external P.1 variant origin. Frontiers in Microbiology , v. 13, p. 01-18, 2022.

• RAITTZ, R. T. ; DE PIERRI, CAMILLA REGINATTO ; MALUK, M. ; BATISTA, M. B. ; CARMONA, M. ; JUNGHARE, M. ; FAORO, H. ; CRUZ, L. M. ; BATTISTONI, F. ; SOUZA, E. ; PEDROSA, F. O. ; CHEN, W. ; POOLE, P. S. ; DIXON, R. A. ; JAMES, E. . Comparative Genomics Provides Insights into the Taxonomy of Azoarcus and Reveals Separate Origins of Nif Genes in the Proposed Azoarcus and Aromatoleum Genera. Genes , v. 12(1), p. 1-21, 2021.

• SILVA FILHO, A. C. ; MARCHAUKOSKI, JERONIZA NUNES ; RAITTZ, R. T. ; PIERRI, C. R. ; MACHADO, D. J. S. ; FADEL-PICHETH, C. M. T. ; PICHETH, G. . Prediction and analysis in silico of genomic islands in Aeromonas hydrophila. Frontiers in Microbiology , v. 12, p. 1-16, 2021.

• PIERRI, C. R. ; VOYCEIK, R. ; SANTOS, LETICIA GRAZIELA COSTA ; KULIK, M. G. ; CAMARGO, J. O. ; OLIVEIRA, A.M.R ; DE LIMA NICHIO, BRUNO THIAGO ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; SILVA FILHO, A. C. ; Guizelini, D ; Ortega, J.M. ; PEDROSA, F. O. ; RAITTZ, R. T. . SWeeP: representing large biological sequences datasets in compact vectors. Scientific Reports , v. 10, p. 1-10, 2020.

• DE LIMA NICHIO, BRUNO THIAGO ; DE OLIVEIRA, ARYEL MARLUS REPULA ; DE PIERRI, CAMILLA REGINATTO ; SANTOS, LETICIA GRAZIELA COSTA ; LEJAMBRE, ALEXANDRE QUADROS ; VIALLE, RICARDO ASSUNÇÃO ; DA ROCHA COIMBRA, NILSON ANTÔNIO ; GUIZELINI, DIEVAL ; MARCHAUKOSKI, JERONIZA NUNES ; DE OLIVEIRA PEDROSA, FABIO ; RAITTZ, ROBERTO TADEU . RAFTS3G: an efficient and versatile clustering software to analyses in large protein datasets. BMC BIOINFORMATICS , v. 20, p. 1-7, 2019.

• SILVA FILHO, A. C. ; RAITTZ, R. T. ; Guizelini, D ; PIERRI, C. R. ; AUGUSTO, D. W. ; SANTOS-WEISS, I. C. R. ; MARCHAUKOSKI, J. N. . Comparative Analysis of Genomic Island Prediction Tools. Frontiers in Genetics , v. 9, p. 1-15, 2018.

• PIERRI, C. R. ; SILVA FILHO, A. C. ; TÚRMINA, J. A. . Biologia Molecular e Bioinformática na prática clínica: Caracterização estrutural e funcional da Anemia Falciforme. R.E.V.I. REVISTA DE ESTUDOS DO VALE IGUAÇU , v. 27, p. 65-80, 2016.

• FERNANDES, D. R. ; KULIK, M. G. ; PIERRI, C. R. ; RAITTZ, R. T. . rSWeeP: An R/Bioconductor package to represent large biological sequences data sets in compact vectors. In: Bioconductor Annual Conference 2020, 2020. Bioconductor Annual Conference 2020, 2020. v. 9. p. 1-6.

• DE PIERRI, CAMILLA R. ; SILVA FILHO, A. C. ; RAITTZ, ROBERTO T. ; VANDRESEN, D. P. ; COLLEMARE, J. ; GLIENKE, C. . Westerdijk Spring Symposium Fungal Evolution. In: Westerdijk Spring Symposium Fungal Evolution, 2023, Amsterdam. Fungal Evolution Spring Symposium, 2023. p. 01-41.

• DE PIERRI, CAMILLA R. ; MONTEIRO, R. A. ; SILVA FILHO, A. C. ; JAMES, E. K. ; RAITTZ, R. T. ; DE SOUZA, EMANUEL M. . Comparative Genomics Reveals Mechanisms for Efficient Diazotrophic Colonization of Grasses by Herbaspirillum rubrisubalbicans M1 and Related Strains. In: X-Meeting, 2023, Curitiba. Proceedings X-Meeting, 2023.

• DE PIERRI, CAMILLA R. ; SILVA FILHO, A. C. ; RAITTZ, R. T. ; VANDRESEN, D. P. ; COLLEMARE, J. ; GLIENKE, C. . Diversity of gene clusters associated with the production of bioactive compounds in endophytic fungi isolated from plants of Brazilian biome. In: X-Meeting, 2023, Curitiba. Proceedings X-Meeting, 2023.

• PIERRI, C. R. ; SILVA FILHO, A. C. ; SANTOS, L. G. C. ; KULIK, M. G. ; NICHIO, B. T. L. ; PEDROSA, F. O. ; RAITTZ, R. T. . Representção vetorial de proteomas bacterianos: Aplicações do método SWeeP. In: I Congresso Latinoamericano de Biomedicina e Ciências do Laboratório, 2019, Florianópolis. Representação vetorial de proteomas bacterianos: Aplicações do método SWeeP, 2019.

• SILVA FILHO, A. C. ; PIERRI, C. R. ; RAITTZ, R. T. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; FADEL-PICHETH, C. M. T. . Análise comparativa de ferramentas de predição de ilhas genômicas. In: I Congresso Latinoamericano de Biomedicina e Ciências do Laboratório, 2019, Florianópolis. Análise comparativa de ferramentas de predição de ilhas genômicas, 2019.

• MACHADO, D. J. S. ; PIERRI, C. R. ; RAITTZ, R. T. . Collscience: A Text Mining web service tool for extraction knowledge from scientific texts. In: X-Meeting 2019, 2019, Campos do Jordão - SP. Proceedings X-Meeting 2019, 2019.

• PIERRI, C. R. ; MACHADO, D. J. S. ; SILVA FILHO, A. C. ; NICHIO, B. T. L. ; PEDROSA, F. O. ; RAITTZ, R. T. . Text Minig for Biological data: An update from the last decade. In: X-Meeting 2019, 2019, Campos do Jordão - SP. Proceedings X-Meeting 2019, 2019.

• SILVA FILHO, A. C. ; PIERRI, C. R. ; MACHADO, D. J. S. ; RAITTZ, R.T. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; FADEL-PICHETH, C. M. T. ; PICHETH, G. . Prediction, identification and characterization of genomics islands in Aeromonas spp.. In: X-Meeting 2019, 2019, Campos do Jordão - SP. Proceedings X-Meeting 2019, 2019.

• PIERRI, C. R. ; VOYCEIK, R. ; SANTOS, L. G. C. ; NICHIO, B. T. L. ; PEDROSA, F. O. ; RAITTZ, R. T. . Graphic representation of mammalian mitochondrial proteomes using the SVect algorithm. In: X-meeting 2018, 2018, São Pedro - SP. Proceedings X-Meeting 2018. São Paulo: AB3C, 2018.

• SANTOS, L. G. C. ; OLIVEIRA, A.M.R ; MACHADO, D. J. S. ; NICHIO, B. T. L. ; PIERRI, C. R. ; RAITTZ, R. T. . DEVELOPMENT OF A PIPELINE FOR DATA MINING IN LARGE PROTEIN SEQUENCE DATASETS. In: X-Meeting 2018, 2018, São Pedro - SP. Proceedings X-Meeting 2018. São Paulo: AB3C, 2018.

• VOYCEIK, R. ; Ortega, J.M. ; PIERRI, C. R. ; SANTOS, L. G. C. ; RAITTZ, R.T. . EXPLORATION OF REPRESENTATION OF POLYPEPTIDE CHAINS IN VECTORIAL MODELS FOR GENOMIC AND PROTEOMIC ANALYSIS. In: X-Meeting, 2017, São Pedro. EXPLORATION OF REPRESENTATION OF POLYPEPTIDE CHAINS IN VECTORIAL MODELS FOR GENOMIC AND PROTEOMIC ANALYSIS. São Paulo: AB3C, 2017. p. 244-244.

• PIERRI, C. R. ; NICHIO, B. T. L. ; Sakamoto, T. ; Ortega, J.M. ; Castro, M. A. A. ; RAITTZ, R.T. . mtDNA Data Mining: A Global Analysis. In: X-meeting, 2016, Belo Horizonte. Proceedings X-Meeting 2016. São Paulo: AB3C, 2016. p. 1-315.

• PIERRI, C. R. . Inteligência Artificial aplicada à Bioinformática. 2022. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• PIERRI, C. R. . Representação de sequências biológicas em vetores compactos utilizando o modelo SWeeP. 2021. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• PIERRI, C. R. . A utilização de ferramentas de Mineração de textos para análise de textos científicos na área de Biociências. 2021. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• PIERRI, C. R. . A utilização de Text Mining como suporte na análise de textos científicos em Biociências. 2020. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• PIERRI, C. R. . Introdução à Bioinformática. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• PIERRI, C. R. . Minicurso de Introdução à Bioinformática. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• FERNANDES, D. R. ; PIERRI, C. R. ; KULIK, M. G. ; NICHIO, B. T. L. ; RAITTZ, R. T. . rSWeeP: Um pacote de R/Bioconductor para a representação de grandes conjuntos de dados de sequências biológicas em vetores compactos. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• NICHIO, B. T. L. ; OLIVEIRA, A.M.R ; PIERRI, C. R. ; SANTOS, L. G. C. ; Lejambre, A.Q ; VIALLE, R.A. ; Coimbra, N.A.R. ; GUIZELINI, DIEVAL ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; DE OLIVEIRA PEDROSA, FABIO ; RAITTZ, R. T. . RAFTSG ? uma abordagem alignment-free para clusterização de sequências biológicas em grandes volumes de dados. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SILVA FILHO, A. C. ; RAITTZ, R. T. ; PIERRI, C. R. ; Guizelini, D ; FADEL-PICHETH, C. M. T. ; MARCHAUKOSKI, J. N. . ANÁLISE COMPARATIVA DE FERRAMENTAS DE PREDIÇÃO DE ILHAS GENÔMICAS. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• PIERRI, C. R. ; VOYCEIK, R. ; SANTOS, L. G. C. ; KULIK, M. G. ; OLIVEIRA, A.M.R ; CAMARGO, J. O. ; NICHIO, B. T. L. ; SILVA FILHO, A. C. ; Guizelini, D ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; Ortega, J.M. ; PEDROSA, F. O. ; RAITTZ, R. T. . SWeeP (Spaced Words Projection): Modelo vetorial compacto para representação de sequências biológicas. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• DE PIERRI, CAMILLA REGINATTO . Minicurso de Introdução à Bioinformática. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• PIERRI, C. R. . Minicurso de Inteligência Artificial. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• PIERRI, C. R. . Minicurso de Processamento de Texto. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• PIERRI, C. R. ; MACHADO, D. J. S. ; SILVA, L. H. B. ; SILVA FILHO, A. C. ; PEDROSA, F. O. ; RAITTZ, R. T. . Abordagens de Mineração de Texto: Revisão Integrativa da Literatura. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• PIERRI, C. R. ; SANTOS, L. G. C. . Introdução à Bionformática. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• PIERRI, C. R. ; SANTOS, L. G. C. ; NICHIO, B. T. L. ; PEDROSA, F. O. ; RAITTZ, R. T. . Graphical representation of mammalian mitochondrial proteomes using svect algorithm. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SANTOS, L. G. C. ; OLIVEIRA, A.M.R ; MACHADO, D. J. S. ; NICHIO, B. T. L. ; PIERRI, C. R. ; RAITTZ, R. T. . DEVELOPMENT OF A PIPELINE FOR DATA MINING IN LARGE PROTEIN SEQUENCE DATASETS. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• PIERRI, C. R. . Egressos de Biomedicina: Suas trajetórias e progressos. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• PIERRI, C. R. ; NICHIO, B. T. L. ; Sakamoto, T. ; Ortega, J.M. ; Castro, M. A. A. ; RAITTZ, R.T. . mtDNA Data Mining: A Global Analysis. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• PIERRI, C. R. ; SILVA FILHO, A. C. ; WOUK, J. . CONTEXTO HISTÓRICO E EVOLUÇÃO DA RESSONÂNCIA MAGNÉTICA. 2013. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• PIERRI, C. R. ; SILVA FILHO, A. C. ; SBARDELOTO, C. V. . A IMPORTÂNCIA DO USO DE DOSÍMETRO PARA TRABALHADORES DA ÁREA DE IMAGINOLOGIA. 2013. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• PIERRI, C. R. ; SBARDELOTO, C. V. ; WOUK, J. . A IMPORTÂNCIA DO DESTINO CORRETO DOS RESÍDUOS HOSPITALARES. 2013. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• PIERRI, C. R. ; WOUK, J. ; THEODORO, B. . BIOSSEGURANÇA E RADIOPROTEÇÃO: UMA REVISÃO DE LITERATURA. 2012. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• PIERRI, C. R. . Representação Vetorial de Sequências e Textos para Aprimorar a Consistência da Taxonomia Bacteriana. Curitiba - PR: Universidade Federal do Paraná, 2022 (Tese de doutorado).

• RAITTZ, R. I. ; PIERRI, C. R. ; PERICO, C. P. ; MACHADO, D. J. S. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; RAITTZ, R. T. . What are we learning with Yoga: a text mining approach to literature 2022 (Preprint).

• MACHADO, D. J. S. ; PIERRI, C. R. ; SANTOS, L. G. C. ; PEDROSA, F. O. ; RAITTZ, R. T. . Biotext: Exploiting Biological-like format for text mining. BioRxiv, 2021 (Preprint).

• PERICO, C. P. ; DE PIERRI, CAMILLA REGINATTO ; P. NETO, G. ; FERNANDES, D. R. ; PEDROSA, F. O. ; SOUZA, E. ; RAITTZ, R. T. . Genomic landscape of SARS-CoV-2 pandemic in Brazil suggests an external P.1 variant origin 2021 (Preprint).

• FERNANDES, D. R. ; KULIK, M. G. ; MACHADO, D. J. S. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; PEDROSA, F. O. ; PIERRI, C. R. ; RAITTZ, R. T. . rSWeeP: A R/Bioconductor package deal with SWeeP sequences representation. bioRXvi, 2020 (Preprint).

• NICHIO, B. T. L. ; OLIVEIRA, A.M.R ; PIERRI, C. R. ; SANTOS, L. G. C. ; VIALLE, R.A. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; PEDROSA, F. O. ; RAITTZ, R. T. . RAFTSG ? An efficient and versatile clustering software to analyses in large protein datasets. bioRXvi, 2018 (Preprint).

• PIERRI, C. R. . Representações vetoriais de Proteomas: Um estudo de caso com sequências mitocondriais. Curitiba: Universidade Federal do Paraná, 2017 (Dissertação de Mestrado).

• PIERRI, C. R. ; SILVA FILHO, A. C. ; OLIVEIRA, A.M.R ; GUERRA, B. S. ; RISSI, D. V. ; AUGUSTO, D. W. ; CAMARGO, J. O. ; COSTA, J. C. M. ; OLIVEIRA, K. G. ; OLIVEIRA, W. K. ; PALHETA, J. S. . Desvendando a Bioinformática 2016 (Apostila - Curso de Bioinformática para Ensino Médio).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2021 - Atual

  Envolvimento das Proteinas Efetoras do Sistema de Secreção do Tipo 3 na Interação entre Herbaspirillum rubrisubalbicans e Gramineas, Descrição: Proteinas efetoras do Sistema de Secreção do Tipo 3 tem uma função essencial na interação entre patógeno-hospedeiro, mimetizando a função e estrutura de proteínas do hospedeiro, e inibindo o sistema imune do hospedeiro (DEAN et al., 2011), devido a importância dessas efetoras para a virulência das bactérias patogênicas, o objetivo desse projeto é caracterizar as proteínas efetoras do sistema de secreção do tipo 3 de H. rubrisubalbicans M1, e determinar o papel dessas proteínas no fenótipo patogênico e na interação benéfica de H. rubrisubalbicans M1 com as plantas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Camilla Reginatto De Pierri - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Emanuel de Souza - Integrante / Rose Adele Monteiro - Coordenador / Valter Baura - Integrante / Thalita Tuleski - Integrante / Eduardo Balsanelli - Integrante / Edileusa Gerhardt - Integrante.

• 2020 - Atual

  Análise genômica, clonagem e expressão heteróloga de gene clusters associados a produção de metabólitos secundários com atividade biológica produzidos por fungos endofíticos, Descrição: O projeto visa identificar os clusters gênicos envolvidos na produção dos metabólitos secundários produzidos pelas linhagens de fungos endofíticos isolados dos biomas Pantanal e Cerrado, além de explorar as vias biossintéticas envolvidas na produção dos compostos com ação antimicrobiana. Para alcançar tais objetivos, iremos realizar a identificação e caracterização genômica dos clusters gênicos envolvidos na produção de metabólitos secundários; Realizar a predição dos genes envolvidos na produção de metabólitos secundários produzidos por esses endófitos; Selecionar os metabólitos de interesse para estudo com base na análise genômica em conjunto com testes in vitro; Realizar a prova de conceito dos genes candidatos envolvidos na produção de metabólitos secundários dos isolados selecionados; Avaliar o potencial antimicrobiano do (s) composto (s) obtido (s) na expressão heteróloga; Realizar a identificação química do (s) composto (s) obtido (s). , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Camilla Reginatto De Pierri - Integrante / Antonio Camilo da Silva Filho - Integrante / Desirrê Petters Vandresen - Integrante / Jérôme Collemare - Integrante / Chirlei Glienke - Coordenador / vania aparecida vicente - Integrante / beatriz maia - Integrante / Khaled A. Shaaban - Integrante / Jon S. thorson - Integrante / Jurgen Rohr - Integrante / Sonia Raboni - Integrante / Keiti Noguiera - Integrante / Jorge Navarro - Integrante.

• 2018 - Atual

  Inteligência Artificial aplicada à Bioinformática da fixação biológica do nitrogênio, Descrição: Descrição: Tendo em vista que o volume de dados de sequencias genéticas depositadas nos bancos de dados públicos cresce exponencialmente, é fato que existe a necessidade de desenvolvimento de ferramentas e algoritmos de Bioinformática que atendam às demandas das pesquisas científicas atuais. O grupo de pesquisa de IA aplicada à Bioinformática, da UFPR, dispõe de potencial computacional e parcerias científicas importantes que favorecem execução de empreendimentos colaborativos. Mediante esta afirmação, este projeto propõe o desenvolvimento de estratégias computacionais de mineração de dados (Data mining) conjuntamente com estratégias de mineração de textos (text mining) para obter um novo potencial para melhoria da capacidade de análise de informações de textos científicos, genômica e proteômica referentes à fixação biológica do nitrogênio.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (5) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Camilla Reginatto De Pierri - Integrante / Bruno Thiago de Lima Nichio - Integrante / Aryel Marlus Repula de Oliveira - Integrante / Josué Oliveira Camargo - Integrante / Jeroniza Nunes Marchaukoski - Integrante / Ricardo Voyceik - Integrante / Leticia Graziela Costa Santos - Integrante / Amanda Wilczek - Integrante / Helisson Faoro - Integrante / Diogo de Jesus Soares Machado - Integrante / Roberto Tadeu Raittz - Coordenador., Financiador(es): Fundação Araucária de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

Prêmios