Amanda Ribeiro Guimarães

Pós-doutorado

Formação complementar

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Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em eventos

Produções bibliográficas

• R. L. C. GONÇALVES, PÂMELLA ; S. PENHA, ROSIANE ; J. F. CARDOSO, JACIENE ; R. GUIMARÃES, AMANDA ; B. BEZERRA, CÍCERO WELLINGTON . Green and Effective: Chitosan Blends with Fish Collagen and Aloe vera Exudate. JOURNAL OF THE BRAZILIAN CHEMICAL SOCIETY , v. 36, p. e-20240184, 2025.

• OLIVEIRA, ALINE ALVES ; GUIMARÃES, AMANDA RIBEIRO ; VIANNA, CARLOS ALBERTO FONSECA JARDIM . ENSINO DE GEOMETRIA MOLECULAR UTILIZANDO SOFTWARE: UMA PROPOSTA DE UNIDADE DE ENSINO POTENCIALMENTE SIGNIFICATIVA. REVISTA CIÊNCIAS & IDÉIAS , v. 15, p. e24152444, 2024.

• DA SILVA, ALDINEIA P. ; CHIARI, LAISE P.A. ; GUIMARAES, AMANDA R. ; HONORIO, KATHIA M. ; DA SILVA, ALBÉRICO B.F. . Drug design of new 5-HT6R antagonists aided by artificial neural networks. JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING , v. 104, p. 107844, 2021.

• DA SILVA, ALDINEIA P. ; CHIARI, LAISE P.A. ; A.R. Guimarães ; HONORIO, KATHIA M. ; DA SILVA, ALBÉRICO B.F. . New D2R partial agonist candidates: an in silico approach from statistical models, molecular docking, and ADME/Tox properties. STRUCTURAL CHEMISTRY , v. 32, p. 2019-2033, 2021.

• R. GUIMARÃES, AMANDA ; BARBOSA, RUGLES C. ; MORA TELLO, ANA CRISTINA ; P. DA SILVA, ALDINEIA ; A. ALVES, JÚLIA M. ; PALHARES MARINGOLO, MILENA ; B. F. DA SILVA, ALBÉRICO . Generation, contraction, and polarisation of Gaussian basis sets for atomic and molecular calculations using the generator coordinate method with polynomial discretisation: atoms from Na through Cl. PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS , v. 23, p. 16989-16997, 2021.

• MARINGOLO, MILENA PALHARES ; TELLO, ANA CRISTINA MORA ; GUIMARÃES, AMANDA RIBEIRO ; ALVES, JÚLIA MARIA ARAGON ; DAS CHAGAS ALVES LIMA, FRANCISCO ; LONGO, ELSON ; DA SILVA, ALBÉRICO BORGES FERREIRA . On polarization functions for Gaussian basis sets. JOURNAL OF MOLECULAR MODELING (ONLINE) , v. 26, p. 293, 2020.

• CELESTE, R. ; MARINGOLO, M. ; COMAR, M. ; VIANA, R. ; A.R. Guimarães ; HAIDUKE, R. ; SILVA, A. B. F. . Accurate Gaussian basis sets for atomic and molecular calculations obtained from the generator coordinate method with polynomial discretization. Journal of Molecular Modeling (Print) , v. 21, p. 01-07, 2015.

• VIANA, ROMMEL B. ; GUIMARÃES, AMANDA R. ; SOUZA, AGUINALDO R. ; SILVA, ALBÉRICO B. F. . Molecular properties of the PCO radical: heat of formation and the isomerization pathways. JOURNAL OF MOLECULAR MODELING , v. 20, p. 2074-9, 2014.

• GUIMARÃES, AMANDA R. ; Da Silva A. B. F . Generation, contraction, and polarization of the Gaussian basis sets p-GCHF. In: New horizons in density functional theory Faraday Discussion, 2020. New horizons in density functional theory Faraday Discussion, 2020.

• A.R. Guimarães . GERAÇÃO DE BASES GAUSSIANAS PARA CÁLCULOS QUÂNTICOS DE ÁTOMOS E MOLÉCULAS. In: XXXVIII Congresso de Químicos Teóricos de Expressão Latina, 2012, Natal-RN. XXXVIII Congress of Theoretical Chemists of Latin Expression, 2012.

• A. M. de Arandas ; A.R. Guimarães . Espectros de fluorescência e UV - vis do complexo morin - Mg 2+ usando a teoria do funcional da densidade dependente do tempo (TD - DFT). In: XXXVIII Congress of Theoretical Chemists of Latin Expression, 2012, Natal-RN. XXXVIII Congress of Theoretical Chemists of Latin Expression, 2012.

• A.R. Guimarães ; RIVILLA, I. ; OLAIZOLA, I. ; ODRIOZOLA-GIMENO, M. ; OLAIZOLA, P. ; ASENSIO, M. ; CABALLERO-CAMINO, F. J. ; HERRAEZ, E. ; BRIZ, O. ; RODRIGUES, P. M. ; PERUGORRIA, M. J. ; BUJANDA, L. ; MARIN, J. ; BANALES, J. M. ; COSSIO, F. P. . In silico assessment of novel polyelectrophylic chemistry agents. 2023. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• A.R. Guimarães ; RIVILLA, I. ; OLAVEA, B. ; SCHAFER, T. . On DNA Catalysis: a Theoretical Point of View. 2023. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• A.R. Guimarães ; RIVILLA, I. ; ODRIOZOLA-GIMENO, M. ; OLAIZOLA, I. ; OLAIZOLA, P. ; BANALES, J. M. ; COSSIO, F. P. . In silico design and assessment of novel polyelectrophylic chemistry agents. 2022. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• GUIMARÃES, AMANDA R. ; DA SILVA, ALBÉRICO B.F. . Generation, contraction, and polarization of the Gaussian basis sets p-GCHF. 2020. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• A.R. Guimarães ; DA SILVA, ALBÉRICO B.F. . Generation, contraction, and polarization of the Gaussian basis sets p-GCHF.. 2020. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• A.R. Guimarães . Vamos falar sobre química?. 2015. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• A.R. Guimarães . Química Computacional: Os métodos e a participação na abordagem experimental. 2014. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• A.R. Guimarães . Um pouco de Química Quântica. 2013. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• A. M. de Arandas ; A.R. Guimarães ; GEHLEN, M. H. . Espectros de fluorescência e UV - vis do complexo morin - Mg 2+ usando a teoria do funcional da densidade dependente do tempo (TD - DFT). 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• A.A. Oliveira ; A.R. Guimarães ; GOMES, F. E. R. ; FRACCA, M. P. . Blog 'Química geral e +': Uma ferremanta educacional. 2013. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• A.R. Guimarães ; Da Silva A. B. F . Geração de bases gaussianas para cálculos quântico de átomos e moléculas. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• A.R. Guimarães ; Da Silva A. B. F . Geração, Contração e Polarização de Bases Gaussianas para Cálculos Quânticos de Átomos e Moléculas. 2012. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2023 - Atual

  Catalytic DNA-Stereospecifity to the Industrial Scale, Descrição: The focus of Funambulist project is to tackle existing bottlenecks to bring DNA-based catalysis to the industrial scale from the molecular basis of the synthesis of DNA-based catalysis to the engineering of implementing this concept in a process. For this purpose, we have joined a creative and competent team of experts in their respective fields. Our aim is to achieve the breakthrough in DNA-based catalysis on the industrial scale.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Amanda Ribeiro Guimarães - Coordenador / Fernando P. Cossio - Integrante / Iván Rivilla - Integrante / Thomas Schäfer - Integrante / Óscar Rodríguez Ballesteros - Integrante / Philipp Holliger - Integrante / Carlos Afonso - Integrante / Philipp Menke - Integrante / Kim Stryk - Integrante / Giuliana Mosconi - Integrante / Jean-François Lutz - Integrante / Michael Ryckelynck - Integrante / Juan Luis Vázquez Rodriguez - Integrante / Emma TIXIER - Integrante / Ala Covas - Integrante / Leire San José - Integrante / Francisco Gama - Integrante / philippe harb - Integrante.

• 2021 - Atual

  SN2-DNA, Descrição: Administration of DNA-damaging reagents constitutes one of the most effective chemotherapeutic strategies for the cancer treatment. The families of drugs developed over the years for this purpose are based on second-order nucleophilic substitution (SN2) reactions. Innovative candidates to improve the therapeutic action of these compounds have been designed based on increasing the number of electrophilic positions (En) of the reagent by making n>2. This increased electrophilicity must generate interstrand crosslink adducts that should result in irreversible lesions in the DNA of cancer cells. Computational chemistry tools based on quantum mechanics and molecular modelling, constitute key tools for a better understanding of DNA damage and repair after the formation of the covalently bound complexes that distort the double helix. Thus, the aim of the project described in this proposal is to: 1) compute the structures and evaluate the distorting effects of DNA adducts with polyelectrophilic chemotherapeutic reagents, 2) compute the kinetics of the consecutive SN2 processes (on both carbon atoms and metallic centres) involving interstrand and intrastrand crosslinks and 3) assess in silico the ADME (Adsorption, Distribution, Metabolism and Excretion) properties of the synthesised candidates. Those objectives will be achieved by computing the behaviour of different families of molecules through quantum mechanical - at DFT level of theory- and Molecular Mechanics calculations - based on QM/MM method. Some of these candidates have been synthesised in the laboratories of the hosting group and the corresponding preliminary and promising biological results are already available. The outputs of this project will result in a patent proposal and research articles to be published in high impact journals. Our findings will be open-access available in order to contribute with the research on anticancer drugs design.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Amanda Ribeiro Guimarães - Integrante / Fernando P. Cossio - Coordenador.

• 2013 - 2018

  Geração de Funções de Base Gaussianas a partir do Método da Coordenada Geradora., Descrição: Funções de base gaussianas foram geradas atomicamente pelo programa ATOM-SCF, que utiliza o Método da Coordenada Geradora (MCG) juntamente com a técnica de Discretização Integral Polinomial (DIP), partindo do pressuposto de que uma melhor descrição da camada de valência, reduzirá o número de funções de polarização a serem utilizadas, diminuindo assim o custo computacional. Submeter os conjuntos de funções assim gerados a cálculos moleculares da energia, eletrônica foi a forma adotada para avaliar tanto a qualidade (valor da energia eletrônica obtido) quanto o esforço computacional necessário para completar o ciclo de cálculo.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Amanda Ribeiro Guimarães - Integrante / Albérico Borges Ferreira da Silva - Coordenador.