João Costa Filho

Pós-doutorado

Formação complementar

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Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• RIET, JADE ; NORNBERG, BRUNA FÉLIX ; COSTA-FILHO, JOÃO ; DOS SANTOS AZEVEDO, RAIZA ; CARDOSO, ARTHUR ; DALL?AGNO, LAURA ; MAGALHÃES, ANA MIGUEL ; ANNI, IURI SALIM ABOU ; MEIRELLES, MARCELA ; REYES, MIRNA ENRÍQUEZ ; FERNANDES, ARTHUR ZANETTI NUNES ; SILVEIRA, TONY ; ACOSTA, IZANI BONNEL ; JUNIOR, ANTONIO SERGIO VARELA ; CAMPOS, VINICIUS FARIAS ; MARINS, LUIS FERNANDO . Dietary Supplementation with Recombinant Bacillus subtilis Expressing Insulin-Like Growth Factor 1a (IGF1a) Promotes Muscle Hypertrophy in Zebrafish (Danio rerio). Probiotics and Antimicrobial Proteins , v. 17, p. 10658, 2025.

• RIET, JADE ; COSTA-FILHO, JOÃO ; DALL'AGNO, LAURA ; MEDEIROS, LUIZA ; AZEVEDO, RAÍZA ; NOGUEIRA, LUIZ F. ; MAGGIONI, RODRIGO ; PEDROSA, VIRGÍNIA F. ; ROMANO, LUIS A. ; ALTENBUCHNER, JOSEF ; WASIELESKY, WILSON ; MARINS, LUIS F. . Bacillus subtilis expressing double-strand RNAs (dsRNAs) induces RNA interference mechanism (RNAi) and increases survival of WSSV-challenged Litopenaeus vannamei. AQUACULTURE , v. 542, p. 736834, 2021.

• SANTOS, KAMILA OLIVEIRA ; COSTA-FILHO, JOÃO ; SPAGNOL, KÉROLIN LUANA ; NORNBERG, BRUNA FELIX ; LOPES, FERNANDA MOREIRA ; TESSER, MARCELO BORGES ; MARINS, LUIS FERNANDO . The inclusion of a transgenic probiotic expressing recombinant phytase in a diet with a high content of vegetable matter markedly improves growth performance and the expression of growth-related genes and other selected genes in zebrafish. AQUACULTURE , v. 519, p. 734878, 2020.

• BARBOSA, ERLEI JOSE ALESSIO ; ALESSIO, DILETA REGINA MORO ; VELHO, JOÃO PEDRO ; COSTA FILHO, JOÃO ; COSTA, NILSON LUIZ . Pre-harvesting, harvesting, and transport of soybean to brazilian ports: Bioeconomic losses. RESEARCH, SOCIETY AND DEVELOPMENT , v. 9, p. e744997878, 2020.

• COSTA FILHO, JOÃO ; RIET, JADE ; SANTOS, KAMILA ; DE SOUSA, OSCARINA VIANA ; MAGGIONI, RODRIGO ; FEIJÓ, RUBENS GALDINO ; WASIELESKY, WILSON ; MARINS, LUIS FERNANDO . Genetic manipulation of native : a biotechnological tool for aquaculture. Journal of Applied Aquaculture (Print) , v. 32, p. 1-11, 2020.

• SANTOS, KAMILA OLIVEIRA ; COSTA-FILHO, JOÃO ; SPAGNOL, KÉROLIN LUANA ; MARINS, LUIS FERNANDO . Comparing methods of genetic manipulation in Bacillus subtilis for expression of recombinant enzyme: Replicative or integrative (CRISPR-Cas9) plasmid?. JOURNAL OF MICROBIOLOGICAL METHODS , v. 164, p. 105667, 2019.

• SANTOS, KAMILA OLIVEIRA ; COSTA-FILHO, JOÃO ; RIET, JADE ; SPAGNOL, KÉROLIN LUANA ; NORNBERG, BRUNA FÉLIX ; KÜTTER, MATEUS TAVARES ; TESSER, MARCELO BORGES ; MARINS, LUIS FERNANDO . Probiotic expressing heterologous phytase improves the immune system and attenuates inflammatory response in zebrafish fed with a diet rich in soybean meal. FISH & SHELLFISH IMMUNOLOGY , v. 93, p. 652-658, 2019.

• FILHO, JOÃO COSTA ; JORGE, SÉRGIO ; KREMER, FREDERICO SCHMITT ; DE OLIVEIRA, NATASHA RODRIGUES ; CAMPOS, VINICIUS FARIAS ; DA SILVA PINTO, LUCIANO ; DELLAGOSTIN, ODIR ANTÔNIO ; FEIJÓ, RUBENS GALDINO ; DE MENEZES, FRANCISCA GLEIRE RODRIGUES ; DE SOUSA, OSCARINA VIANA ; MAGGIONI, RODRIGO ; MARINS, LUIS FERNANDO . Complete genome sequence of native Bacillus cereus strains isolated from intestinal tract of the crab Ucides sp.. DATA IN BRIEF , v. 16, p. 381-385, 2018.

• CORREIA, DANIEL ; DAVID, LUIZ HENRIQUE CASTRO ; PINHO, SARA MELLO ; COSTA-FILHO, JOÃO ; EMERENCIANO, MAURÍCIO GUSTAVO COELHO ; MELLO, GIOVANNI LEMOS DE . Performance of fat snook juveniles reared at different temperatures. ACTA SCIENTIARUM. ANIMAL SCIENCES , v. 40, p. 39766, 2018.

• COSTA FILHO, JOÃO ; TSUZUKI, MÔNICA YUMI ; MELLO, GIOVANNI LEMOS DE ; MILETTI, LUIZ CLÁUDIO ; LÜCHMANN, KARIM HAHN ; LIMA-ROSA, CARLOS ANDRÉ DA VEIGA . Growth of juvenile common snook ( Centropomus undecimalis Bloch, 1792) reared at different temperatures and salinities: Morphometric parameters, RNA/DNA, and protein/DNA ratios. Journal of Applied Aquaculture (Print) , v. 29, p. 1-8, 2017.

• FRECCIA, A. ; MEURER, E. S. ; COSTA FILHO, J. ; JERONIMO, G. T. ; EMERENCIANO, M. G. C. . Farinha de inseto em dietas de alevinos de tilápia. Archivos de Zootecnia , v. 65, p. 541-547, 2016.

• COSTA FILHO, J. ; FABREGAT, T. E. H. P. ; HERKENHOFF, M. ; PALUDO, E. ; BATTILANA, J. ; GUIDOLIN, A. F. . Effiiency of DNA extraction from different carp tissue using the sodium chloride (NaCl) protocol. REVISTA DE CIÊNCIAS AGROVETERINÁRIAS (UDESC) , v. 14, p. 84-88, 2015.

• COSTA FILHO, J. ; MELLO, G. L. . Correlações fenotípicas entre características de crescimento em juvenis de Robalo-flecha, Centropomus undecimalis. Arquivos de Ciências do Mar , v. 48, p. 27-32, 2015.

• COSTA FILHO, J. ; MELLO, G. L. . CRESCIMENTO ALOMÉTRICO POSITIVO ENTRE CARACTERÍSTICAS BIOMÉTRICAS DE JUVENIS DE ROBALO-FLECHA (Centropomus undecimalis BLOCH, 1972) CULTIVADOS. ARQUIVOS DE CIÊNCIAS VETERINÁRIAS E ZOOLOGIA DA UNIPAR , v. 18, p. 21-26, 2015.

• COSTA FILHO, J. ; FABREGAT, T. E. H. P. ; LIMA-ROSA, C. A. V. L. . Uma revisão sobre os principais aspectos no cultivo do robalo. REVISTA DE CIÊNCIAS AGROVETERINÁRIAS , v. 12, p. 317-325, 2013.

• COSTA FILHO, J. ; GAYA, L. G. . Recent approaches of fish breeding / Abordagens recentes do melhoramento genético de peixes. AMBIÊNCIA , v. 8, p. 195-210, 2012.

• COSTA FILHO, J. ; MARINS, L. F. . Engenharia genética em probióticos nativos: Uma potencial aplicação no controle das viroses que afetam a carcinicultura. Aquaculture Brasil, 23 jul. 2017.

• COSTA FILHO, J. . Consumo de peixes, comer é mais que apenas matar a fome. Jornal Sul Brasil - Encarte Sul Brasil Rural, Chapecó - SC, p. 3 - 3, 01 abr. 2010.

• COSTA FILHO, J. . Genômica de Aves. Jornal Sul Brasil - Encarte Sul Brasil Rural, Chapecó - SC, p. 2 - 2, 28 maio 2009.

• COSTA FILHO, J. . Criação de Emas. Jornal Sul Brasil - Encarte Sul Brasil Rural, Chapecó - SC, p. 2 - 2, 16 abr. 2009.

• COSTA FILHO, J. ; CUNHA NETO, O. C. . Qualidade do Leite destinado ao consumo humano e utilizado na elaboração de derivados. Jornal Sul Brasil - Encarte Sul Brasil Rural, Chapecó - SC, p. 2 - 2, 19 mar. 2009.

• COSTA FILHO, J. ; CUNHA NETO, O. C. . Importância do manejo pré-abate na qualidade da carcaça suína. Jornal Sul Brasil - Encarte Sul Brasil Rural, Chapecó - SC, p. 2 - 2, 05 mar. 2009.

• COSTA FILHO, J. ; GAYA, L. G. . Consequências do melhoramento genético de suínos. Jornal Sul Brasil - Encarte Sul Brasil Rural, Chapecó - SC, p. 2 - 2, 19 fev. 2009.

• COSTA FILHO, J. ; GAYA, L. G. . Melhoramento genético em peixes. Jornal Sul Brasil - Encarte Sul Brasil Rural, Chapecó - SC, p. 2 - 2, 05 fev. 2009.

• COSTA FILHO, J. ; GAYA, L. G. . Consequências do melhoramento genético de frangos. Jornal Sul Brasil - Encarte Sul Brasil Rural, Chapecó - SC, p. 2 - 2, 22 jan. 2009.

• COSTA FILHO, J. ; GAYA, L. G. . Fatores que afetam o rendimento de carcaça de frangos de corte. Jornal Sul Rural - Encarte Sul Brasil Rural, Chapecó - SC, p. 2 - 2, 08 jan. 2009.

• COSTA FILHO, J. ; GAYA, L. G. ; LORENTZ, L. H. ; FERRAZ, J. B. S. ; SOARES, M. P. ; MATTOS, E. C. ; MICHELAN FILHO, T. . Grupos de contemporâneos para peso ao abate, peso eviscerado e rendimento de carcaça em frangos de linhagem macho. In: 46ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2009, Maringá - PR. Inovação Científica e Tecnológica em Zootecnia, 2009.

• COSTA FILHO, J. ; LORENTZ, L. H. ; GAYA, L. G. ; FERRAZ, J. B. S. ; MATTOS, E. C. ; REZENDE, F. M. ; MICHELAN FILHO, T. . Efeito da estação do ano ao abate e do sexo sobre as características peso ao abate, peso eviscerado e rendimento de carcaça em linhagem macho de frangos. In: 46ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2009, Maringá - PR. Inovação Científica e Tecnológica em Zootecnia, 2009.

• COSTA-FILHO, JOÃO ; FERNANDES, A. Z. N. ; GUEIROS-FILHO, F. J. . Optimization of intracellular delivery of proteins in Bacillus: delivery of Cas9 ribonucleoprotein complexes for CRISPR/Cas9 genome editing. In: 21st International Conference on Bacilli and Gram-Positive Bacteria, 2022, Praga. Cell Metabolism / Biotechnology, 2022.

• AGNO, L. D. ; RIET, J. ; SANTOS, K. O. ; COSTA FILHO, J. ; KRUMMENAUER, D. ; WASILIESKY, W. J. ; MARINS, L. F. . Activation of RNA interference mechanism (RNAi) in shrimp Litopenaeus vannamei via probiotic Bacillus subtilis manipulated by CRISPR/Cas9. In: 65 Brazilian Congress of genetics, 2019, Águas de Lindóia. Genética, 2019, 2019.

• SPAGNOL, K. L. ; SANTOS, K. O. ; COSTA FILHO, J. ; RIET, J. ; MARINS, L. F. . Bacillus subtilis geneticamente modificado para produção de fitase fúngica na alimentação do zebrafish (Danio rerio). In: 18 Mostra de Produção Universitária, 2019, Rio Grande. 28º Congresso de Iniciação Científica., 2019.

• AGNO, L. D. ; RIET, J. ; SANTOS, K. O. ; COSTA FILHO, J. ; MARINS, L. F. . Enrichment of culture medium increases the production of double-stranded RNA (dsRNA) in the probiotic Bacillus subtilis. In: XXXIV Reunião Anual da FeSBE, 2019, Campos do Jordão. XXXIV Reunião Anual da FeSBE, 2019.

• MAZON, A. ; WIGGERS, P. ; AQUINI, E. N. ; MELLO, G.L. ; COSTA FILHO, J. . O impacto da síndrome da mancha branca (WSSV) na carcinicultura nacional. In: VI SENPEX, 2015, Orleans - SC. Seminário de ensino, pesquisa e extensão, 2015.

• WIGGERS, P. ; MAZON, A. ; VICENTE, L. R. M. ; PADILHA, P. J. M. ; KUHN, F. ; COSTA FILHO, J. . Utilização do extrato da planta uncaria tomentosa como potencial antiviral no vírus da mancha branca (WSSV) em Litopenaeus vannamei cultivados. In: VI SENPEX, 2015, Orleans - SC. Seminário de Ensino, Pesquisa e Extenção, 2015.

• MELLO, G. L. ; VIEIRA, W. J. ; CORREIA, D. ; EMERENCIANO, M. G. C. ; COSTA FILHO, J. ; TSUZUKI, M. Y. . Growth and survival of juvenile common snook Centropomus undecimalis at different temperatures and salinities in a recirculating aquaculture system. In: World Aquaculture Society, 2014, Adelaide. World Aquaculture International Conference & Exposition, 2014.

• OLIER, B. S. ; SANCHES, E. G. ; COSTA FILHO, J. ; MOLINARI, D. ; RAINICHESKI, D. L. ; PEREIRA, F. A. ; MATTOS, G. S. ; AMARAL JUNIOR, H. ; MELLO, G.L. . Pré-engorda do robalo-flecha (Centropomus undecimalis) em viveiros de carcinicultura no Sul do Brasil. In: Aquaciência, 2012, Palmas - TO. V Congresso da Sociedade Brasileira de Aquicultura e Biologia Aquática, 2012.

• MOLINARI, D. ; SANCHES, E. G. ; COSTA FILHO, J. ; OLIER, B. S. ; RAINICHESKI, D. L. ; PEREIRA, F. A. ; MATTOS, G. S. ; AMARAL JUNIOR, H. ; MELLO, G.L. . Diferentes densidade para a pré-engorda do robalo-flecha (Centropomus undecimalis) em viveiros de carcinicultura no Sul do Brasil. In: Aquaciência, 2012, Palmas - TO. V Congresso da Sociedade Brasileira de Aquicultura e Biologia Aquática, 2012.

• FABREGAT, T. E. H. P. ; COSTA FILHO, J. ; STEFFEN, A. . Análise do rendimento de carcaça da truta-arco-íris (Oncorhynchus mykiss). In: Aquaciência, 2012, Palmas - TO. V Congresso da Sociedade Brasileira de Aquicultura e Biologia Aquática, 2012.

• FABREGAT, T. E. H. P. ; COSTA FILHO, J. ; HERKENHOFF, M. ; PALUDO, E. ; BATTILANA, J. ; GUIDOLIN, A. F. . Extração de DNA em peixes através do protocolo de cloreto de sódio para análise de marcadores RAPD. In: Aquaciência, 2012, Palmas - TO. V Congresso da Sociedade Brasileira de Aquicultura e Biologia Aquática, 2012.

• PINHO, S. ; COSTA FILHO, J. ; ALESSIO, D. R. M. ; MOLINARI, D. ; VIEIRA, W. J. ; MELLO, G.L. . Análise biométrica em características de crescimento de robalos-flecha (Centropomus undecimalis). In: Aquaciência, 2012, Palmas - TO. V Congresso da Sociedade Brasileira de Aquicultura e Biologia Aquática, 2012.

• HERKENHOFF, M. ; PALUDO, E. ; COSTA FILHO, J. ; GAULKE, R. ; BRANCO, L. C. ; PITLOVANCIV, A. K. ; REMUALDO, V. R. ; LIMA-ROSA, C. A. V. L. . Frequency of the genotypes and three new possible genotypes to the human papillomavirus (HPV) in women in Blumenau (SC) - Brazil. In: 58º Congresso Brasileiro de Genética, 2012, Foz do Iguaçu - PR. Genética de Microrganismos, 2012.

• LIMA-ROSA, C. A. V. L. ; DALLA COSTA, F. A. ; POSSAMAI, M. H. P. ; HERKENHOFF, M. E. ; PERTILLE, F. ; PALUDO, E. ; COSTA FILHO, J. ; BATTILANA, J. . Genetic diversity of the control region (D-loop) in mitochondrial DNA in caipira?s chickens lineages. In: 57º Congresso Brasileiro de Genética, 2011, Águas de Lindóia - SP. Resumos do 57º Congresso Brasileiro de Genética, 2011.

• COSTA FILHO, J. . Ciclo de Palestras Sobre Tópicos em Melhoramento Animal. In: IV Encontro de Extensão - UDESC, 2009, Florianópolis - SC. Cultura e Comunidade da Universidade do Estado de Santa Catarina, 2009.

• MAGALHAES, A. B. M. ; COSTA-FILHO, JOÃO ; AZEVEDO, RAÍZA ; MEIRELLES, M. G. ; MARINS, LUIS F. . Avaliação da Atividade de β-Glicosidases da Família GH3. 2024. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• AGNO, L. D. ; RIET, J. ; SANTOS, K. O. ; COSTA FILHO, J. ; MARINS, L. F. . Otimização da produção de duplas fitas de RNA no probiótico Bacillus subtilis. 2019. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• RIET, J. ; AGNO, L. D. ; SANTOS, K. O. ; COSTA FILHO, JOÃO ; WASILIESKY, W. J. ; MARINS, L. F. . Activation of RNA interference (RNAi) mechanism of Litopenaeus vannamei shrimp by dsRNA produced by the probiotic Bacillus subtilis: a potential tool in the control of viruses in shrimp farming. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• COSTA FILHO, J. ; MARINS, L. F. ; ALTENBUCHNER, J. . Edition of the genome of Bacillus subtilisusing CRISPR-Cas9 system to produce dsRNA against viruses that affect shrimps. 2018. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• SPAGNOL, K. L. ; SANTOS, K. O. ; COSTA-FILHO, JOÃO ; RIET, J. ; MARINS, L. F. . Estabilidade de um vetor de manipulação genética em Bacillus velezensis para produção de fitase recombinante. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• RIET, J. ; COSTA FILHO, JOÃO ; LOPES, J. L. ; SANSAO, G. S. ; MARINS, L. F. . Isolamento de uma cepa comercial de Bacillus subtilis utilizada na carcinicultura e avaliação do seu potencial de manipulação genética. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• COSTA FILHO, J. ; RIET, J. ; SOUSA, O. V. ; MAGGIONI, R. ; FEIJO, R. G. ; NUNES, A. J. P. ; PERAZZOLO, L. M. ; ROSA, R. D. ; WASILIESKY, W. J. ; MARINS, L. F. . Manipulação genética de probióticos com potencial aplicação no controle de viroses que afetam a carcinicultura. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• RIET, J. ; COSTA FILHO, J. ; SOUSA, O. V. ; MAGGIONI, R. ; MARINS, L. F. . Avaliação da atividade da ribonuclease III em cepas de Bacillus com potencial para manipulação genética. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• MARTENS, S. B. B. ; COSTA FILHO, J. ; SOUSA, O. V. ; MAGGIONI, R. ; FEIJO, R. G. ; LANES, C. F. C. ; MARINS, L. F. . Identificação do gene da ribonuclease III (rnc) em cepas de Bacillus com potencial probiótico. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• FERREIRA, C. P. ; LIMA-ROSA, C. A. V. L. ; MELLO, G. L. ; COSTA FILHO, J. . Avaliação na condição de crescimento de juvenis de robalo-flecha (Centropomus undecimalis) cultivados em diferentes temperaturas e salinidades. 2013. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• PINHO, S. ; LIMA-ROSA, C. A. V. L. ; MELLO, G.L. ; COSTA FILHO, J. ; HERKENHOFF, M. . Extração do DNA da nadadeira caudal de robalos-flecha. 2012. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• COSTA FILHO, J. . Genética Molecular na Avicultura - validação de marcadores moleculares para frangos de corte. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• HERKENHOFF, M. ; POSSAMAI, M. H. P. ; PALUDO, E. ; PERTILLE, F. ; DALLA COSTA, F. A. ; COSTA FILHO, J. ; LIMA-ROSA, C. A. V. L. . Análise da variabilidade genética da região controladora do mtDNA (alça-D) em linhagens industriais de galinhas caipiras. 2011. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• COSTA FILHO, J. ; GAYA, L. G. . Análise de grupos de contemporâneos para peso ao abate, peso eviscerado e rendimento de carcaça em frangos de linhagem macho. 2009. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

Projetos de pesquisa

• 2025 - Atual

  Mecanismos de transporte intestinal de moléculas recombinantes produzidas pela bactéria probiótica Bacillus subtilis: estudo comparativo entre um hormônio proteico (IGF1a) e um RNA de dupla fita (dsRNA) em zebrafish (Danio rerio), Descrição: Probióticos são organismos vivos que colonizam o trato gastrointestinal do hospedeiro e quando consumidos em quantidades adequadas, promovem benefícios à saúde, como a melhora da digestão e a modulação da imunidade. Avanços na engenharia genética permitiram o desenvolvimento de probióticos modificados geneticamente, capazes de produzir localmente no intestino moléculas bioativas com efeitos terapêuticos. Dentre os microrganismos utilizados, Bacillus subtilis destaca-se por sua robustez, segurança e facilidade de modificação genética, sendo amplamente empregado como plataforma biotecnológica. Portanto, o foco deste trabalho é entender os mecanismos de interação entre duas cepas recombinantes de B. subtilis e o epitélio intestinal do hospedeiro. A primeira produz RNA de dupla fita (dsRNA), com potencial para silenciar genes por meio do mecanismo de RNA de interferência. A segunda cepa sintetiza o fator de crescimento semelhante à insulina tipo 1a (IGF1a). Ambas as cepas apresentaram resultados positivos em relação às suas finalidades. No entanto, apesar dos resultados promissores, os mecanismos de absorção intestinal dessas biomoléculas ainda não são compreendidos. Sendo assim, o objetivo deste projeto é investigar os mecanismos fisiológicos envolvidos na absorção intestinal do IGF1a e do dsRNA produzidos por B. subtilis recombinante, utilizando o zebrafish como modelo experimental. Os métodos envolvem análises transcriptômicas, de expressão gênica e rastreamento das moléculas nos tecidos do hospedeiro. A elucidação desses mecanismos é essencial para entender como biomoléculas produzidas por probióticos no lúmen intestinal atingem alvos sistêmicos. Os resultados contribuirão na ampliação do uso de probióticos recombinantes como ferramentas terapêuticas e nutricionais.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: João Costa Filho - Integrante / LUIS FERNANDO MARINS - Coordenador / Maidana da Silva Idiarte - Integrante., Número de orientações: 1

• 2025 - Atual

  Silenciamento da Miostatina do Zebrafish (Danio rerio) Através de RNA Interferente Mediado por Probiótico Recombinante, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: João Costa Filho - Integrante / LUIS FERNANDO MARINS - Coordenador / Tatiane Penteado Gonçalves - Integrante., Número de orientações: 1

• 2023 - Atual

  Biotecnologia e bioinformática no desenvolvimento de beta-glicosidases otimizadas para produção de etanol de segunda geração, Descrição: A associação entre as ferramentas da biologia computacional e as técnicas de engenharia genética podem gerar novas plataformas biológicas (biofábricas) de produção de enzimas otimizadas para a aplicação industrial. Embora a maioria das proteínas recombinantes sejam produzidas em bactérias ( Escherichia coli) e leveduras ( Pichia pastoris), essas biofábricas apresentam desvantagens relacionadas principalmente ao custo de produção. A alimentação contínua dos biorreatores com fontes de carbono representa uma fração bastante significativa do custo total da geração de bioprodutos que, associada a preocupação com as mudanças climáticas globais, vem impulsionando pesquisas por processos que unem a conversão direta de CO2 à síntese de produtos químicos. Assim, o objetivo deste projeto é desenvolver #946;-glicosidases otimizadas para a produção de etanol 2G através de técnicas computacionais e expressá-las em uma biofábrica fotossintetizante que utiliza o CO2 como fonte primária de carbono, assim como disseminar a importância dos biocombustíveis na mitigação dos efeitos do aquecimento global.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: João Costa Filho - Integrante / MARINS, LUIS F. - Coordenador / Betania Ferraz Quirino - Integrante.

• 2019 - 2022

  Development of a simplified and innovative CRISPR/Cas9 methodology for Bacillus amyloliquefaciens FZB42 genome editing: an alternative for the biocontrol of agricultural pathogens, Descrição: The main objective of this proposal is to develop an efficient, innovative and simplified methodology of genomic editing with the CRISPR/Cas9 system in vitro and to apply it in the optimization of the production of bioactive metabolites in B. amyloliquefaciens FZB42.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: João Costa Filho - Integrante / Frederico José Gueiros Filho - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

• 2017 - 2018

  Genetic manipulation in Bacillus subtilis using CRISPR/Cas9: a potential application in the control of viruses that affect shrimp farming, Descrição: The viruses have promoted constant economic losses in the shrimp farming. RNA interference machinery, activated by RNA double strands, is an important method for antiviral intervention. The production of these molecules can be performed with genetic manipulation of Bacillus. Therefore, the present research project intends to perform the genome edition in genes of B. subtilis (#916;Skin e #916;SP#946;) aiming to produce RNA double strands related to shrimp viruses, using CRISPR/Cas9.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: João Costa Filho - Coordenador / LUIS FERNANDO MARINS - Integrante / Josef Altenbuchner - Integrante.

• 2015 - 2019

  Desenvolvimento de probióticos anti-IMNV e anti-WSSV para o controle da replicação viral através do mecanismo de RNA de interferência no camarão Litopenaeus vannamei, Descrição: Um dos principais desafios da carcinicultura tem sido o surgimento de doenças infecciosas, principalmente de etiologia viral como o IMNV e WSSV, que promovem constantes prejuízos ao setor. Sendo assim, é indispensável o desenvolvimento de medidas para o controle e tratamento dessas enfermidades. Um excelente método de intervenção terapêutica aplicada aos crustáceos é o silenciamento gênico via RNAi, no entanto a sua aplicação em larga escala no cultivo dos camarões possui limitações quanto a síntese de moléculas produzidas in vitro e a forma de aplicação. Nesse sentido, a manipulação genética de bactérias pode ser uma importante ferramenta para a produção de moléculas específicas que participam da ativação do mecanismo do RNAi contra infecções virais. Desta forma, o objetivo do presente projeto é desenvolver bactérias recombinantes do gênero Bacillus para auxiliar no controle da replicação viral em camarões Litopenaeus vannamei desafiados experimentalmente com o IMNV e WSSV. O estudo será conduzido em parceria com três Instituições Federais de Ensino, FURG, UFC e UFSC. Inicialmente serão realizadas manipulações genéticas nas bactérias do gênero Bacillus. Na sequência serão realizados experimentos envolvendo a suplementação das bactérias recombinantes na ração e desafios com inóculos virais nos camarões. Assim, será possível a avaliação da eficiência dos Bacillus como veículo de entrada para moléculas envolvidas na ativação do mecanismo RNAi, visando o controle da replicação viral e tratamento das viroses alvo. Contudo, o desenvolvimento desse estudo permitirá a possível criação de uma poderosa e inovadora ferramenta terapêutica molecular, aplicada no controle e combate de enfermidades causadas pelo IMNV e WSSV.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: João Costa Filho - Integrante / OSCARINA VIANA DE SOUSA - Integrante / RODRIGO MAGGIONI - Integrante / RUBENS GALDINO FEIJÓ - Integrante / LUIS FERNANDO MARINS - Coordenador / Alberto Jorge Pinto Nunes - Integrante / Luciane Maria Perazzolo - Integrante / Rafael Diego Rosa - Integrante.

• 2012 - 2013

  Utilização de parâmetros morfológicos e componentes bioquímicos na avaliação do crescimento de juvenis de robalos-flecha (Centropomus undecimalis) cultivados em diferentes temperaturas e salinidades, Descrição: Atualmente a piscicultura marinha encontra-se em expansão e diante disso existe a necessidade da criação e aplicação de novas tecnologias, como métodos bioquímicos e moleculares, para avaliar a condição nutricional e o crescimento de diferentes espécies de peixes. Dentre estes, o robalo-flecha, Centropomus undecimalis, possui grande potencial de cultivo o longo da costa brasileira. Neste sentido a análises da razão RNA/DNA e proteína/DNA podem ser utilizadas para aperfeiçoar e avaliar a produção desta espécie. Diante desse quadro, o objetivo desse trabalho foi determinar a condição nutricional e do crescimento em juvenis de robalo-flecha cultivados em diferentes temperaturas e salinidades, através das razões RNA/DNA e proteína/DNA.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: João Costa Filho - Coordenador / Giovanni Lemos de Mello - Integrante / Karim Hahn Lüchmann - Integrante / Luiz Claudio Miletti - Integrante / Carlos André da Veiga Lima Rosa - Integrante.

• 2007 - 2009

  Análise dos grupos contemporâneos para estruturação de modelo animal de características de desempenho, carcaça e qualidade da carne de frangos de linhagem macho, Descrição: Este projeto de pesquisa teve como objetivo a análise de um banco de dados de frangos de linhagem macho composto por características de desempenho, carcaça e qualidade de carne, provenientes de um programa de melhoramento animal. Para tanto, realizou-se neste projeto a identificação e a análise das fontes de variação destas características quanto à sua significância estatística, por intermédio da metodologia dos modelos lineares generalizados, possibilitando a montagem dos grupos de contemporâneos das referidas características.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: João Costa Filho - Integrante / Leila de Genova Gaya - Coordenador / Leandro Homrich Lorentz - Integrante., Número de produções C, T & A: 2