Roberto Nepomuceno de Souza Lima

Doutor em Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro pela Universidade de São Paulo (2013), possui graduação em Odontologia pela Faculdade de Odontologia da Universidade de São Paulo (2006). Trabalha com obtenção de mutantes isogênicos e proteínas heterólogas para estudos de fisiologia e patogenicidade bacterianos. Tem experiência em Biologia Molecular de microrganismos, sistemas de transporte bacterianos do tipo I e tipo III, genômica voltados para o estudo dos modelos biológicos de Escherichia coli diarreiogênica e Streptococcus mutans.

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Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro

2007 - 2013

Instituto de Ciências Biomédicas II - USP
Título: Estudo de sistemas de captação de oligopeptídeos e poliaminas na fisiologia e patogenicidade de bactérias do trato gastro-intestinal
Rita de Cássia Café Ferreira. Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Palavras-chave: Poliaminas; Oligopeptídeos; Fosfato inorgânico; Glutamato e glutamina; Bactérias do trato gastro-intestinal.

Graduação em Odontologia

2001 - 2006

Faculdade de Odontologia da Universidade de São Paulo

Curso técnico/profissionalizante em Habilitação Plena Tec. Prótese Dentária

1997 - 1999

Colégio Unisa

Ensino Fundamental (1º grau)

1989 - 1996

Escola Municipal de Primeiro Grau Dr. Miguel Vieira Ferreira

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Pós-doutorado

2013

Pós-Doutorado. , Instituto Butantan, IBU, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas

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Formação complementar

2018 - 2018

Workshop internacional - conceitos contemporâneos em resistência bacteriana. (Carga horária: 4h). , Instituto de Ciências Biomédicas da USP, ICB-USP, Brasil.

2017 - 2017

Research connect course. (Carga horária: 24h). , British Council, Inglaterra.

2015 - 2015

Procedimentos de segurança e contenção infectantes. (Carga horária: 2h). , Instituto Butantan, IBU, Brasil.

2015 - 2015

Treinamento em Biossegurança. (Carga horária: 6h). , Instituto Butantan, IBU, Brasil.

2013 - 2013

Biossegurança do laboratório de bacteriologia. (Carga horária: 2h). , Instituto Butantan, IBU, Brasil.

2013 - 2013

Diagnóstico Laboratorial de Doenças Genéticas. (Carga horária: 10h). , Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, FMUSP, Brasil.

2013 - 2013

Métodos lógico para redação científica. (Carga horária: 16h). , Instituto Butantan, IBU, Brasil.

2010 - 2010

Treinamento prático do sistema LabScale TFF. (Carga horária: 12h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2009 - 2009

VIII Simpósio de Biossegurança e Descarte de PQ. (Carga horária: 8h). , Faculdade de Ciências de Farmacêuticas da Universidade de São Paulo, FCF-USP, Brasil.

2009 - 2009

Mycroarray como ferramenta para análise de exp.. (Carga horária: 4h). , GE Healthcare Life Sciences, GE, Brasil.

2007 - 2007

Proteção Radiológica. (Carga horária: 45h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2007 - 2007

Estágio de Doutorado no exterior. (Carga horária: 80h). , University of Rochester Medical Center, URMC, Estados Unidos.

2006 - 2006

Real Time PCR- Princípios e Novas Aplicações. (Carga horária: 3h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.

2006 - 2006

Treinamento no uso de Animais de Experimentação. (Carga horária: 3h). , Instituto de Ciências Biomédicas II / USP, ICB II / USP, Brasil.

2005 - 2005

Principles of Gene Regulation in Bacteria. (Carga horária: 8h). , Instituição de Ciências Biomédicas/USP, ICB-USP, Brasil.

2004 - 2004

Iniciação Científica no Exterior. (Carga horária: 80h). , University of Oklahoma, OU, Estados Unidos.

2003 - 2003

Localização de genes: dos mapas genéticos. (Carga horária: 3h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.

2003 - 2003

Utilizando a técnica de RNAi. (Carga horária: 3h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.

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Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

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Áreas de atuação

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Biologia e Fisiologia dos Microorganismos.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Biologia e Fisiologia dos Microorganismos/Especialidade: Bacteriologia.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética.

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Organização de eventos

ELIAS, WALDIR P. ; PIAZZA, ROXANE M.F. ; DOBRINDT, U. ; NEPOMUCENO, R. . Intestinal pathogenic Escherichia coli: pathogenesis, epidemiology and diagnostics. 2019. (Congresso).

NEPOMUCENO, ROBERTO . Ciclo de seminários Científicos do Laboratório de Bacteriologia do Instituto Butantan. 2013. (Outro).

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Participação em eventos

Intestinal pthogenic Escherichia coli: pathogenesis, epidemiology and diagnostics.Enteroaggregative Escherichia coli 042 type three secretion system 2 (ETT2): transcription profile and secretome analysis. 2019. (Simpósio).

10o Encontro Paulistano sobre Escherichia coli patogênica "Luiz Rachid Trabulsi". 2018. (Encontro).

1st International Symposium on Microbial Pathogenesis and Drug Development.Cytotoxic effects of SepA: a serine protease autotransporter protein of Enterobacteriaceae (SPATE). 2017. (Simpósio).

29o Congresso Brasileiro de Microbiologia. Type Three Secretion System 2 (ETT2) of Enteroaggregative Escherichia coli 042: Expression and Comparative Secretome Analysis. 2017. (Congresso).

9o Encontro Paulistano sobre Escherichia coli patogênica "Luiz Rachid Trabulsi".Type Three Secretion System 2 (ETT2) of Enteroaggregative Escherichia coli 042: Expression and Comparative Secretome Analysis. 2017. (Encontro).

VI Reunião LACER (Coalisão Latinoamericana de Pesquisadores em Escherichia coli).Type Three Secretion System 2 (ETT2) of Enteroaggregative Escherichia coli 042: Expression and Comparative Secretome Analysis. 2017. (Encontro).

18a Reunião Científica Anual do Instituto Butantan. 2016. (Simpósio).

8o Encontro Paulistano sobre Escherichia coli patogênica "Luiz Rachid Trabulsi".Estudo do sistema de secreção do tipo três (ETT2) de E. coli enteroagregativa. 2016. (Encontro).

XXIII Congreso Latinoamericano de Microbiología. Analysis of the type three secretion system 2 (ETT2) of enteroaggregative Escherichia coli. 2016. (Congresso).

17th annual scientific meeting of Instituto Butantan.Occurrence of SPATE genes in uropathogenic Escherichia coli (UPEC). 2015. (Encontro).

28o Congresso Brasileiro de Microbiologia. Expression profiles of heat labile and heat stable toxins in enterotoxigenic Escherichia coli. 2015. (Congresso).

7o Encontro Paulistano sobre Escherichia coli patogênica "Luiz Rachid Trabulsi". 2015. (Simpósio).

XXII Congreso Latinoamericano de Microbiología y 4 Congreso Colombiano de MicMicrobiología. Clonagem in tandem e expressão de duas cópias do gene estA produtor da enterotoxicina termoestável (ST) de Escherichia coli enterotoxigênica. 2014. (Congresso).

V Encontro sobre Escherichia coli patogênica "Luiz Rachid Trabulsi".Estudo do sistema de Oligopeptídeos (Opp) de Escherichia coli. 2013. (Encontro).

XV Reunião Científica Anual do Instituto Butantan. 2013. (Encontro).

IV Encontro sobre Escherichia coli patogênica "Luiz Rachid Trabulsi". 2012. (Encontro).

XXI Congresso Latinoamericano de Microbiologia. Role of glutamate and glutamine uptake systems on the pathogenicity of Streptococcus mutans. 2012. (Congresso).

110th General Meeting. The oligopeptide permease of gastrointestinal pathogens. 2011. (Congresso).

57o Congresso Brasileiro de Genética. The oligopeptide permease (OppA) and toxin expression/secretion by O157:H7 enterohemorragic Escherichia coli (EHEC). 2011. (Congresso).

27a Reunião de Genética de Microrganismos.Characterization of the polyamine uptake system of Streptococcus mutans. 2010. (Simpósio).

56o Congresso Brasileiro de Genética. Characterization of the polyamine uptake system of Streptococcus mutans. 2010. (Congresso).

I Workshop em Vacinas e fisiologia bacteriana de São Paulo.The oligopeptide permease of gastrointestinal pathogens. 2010. (Outra).

55o Congresso Brasileiro de Genética. Conservancy and genetic diversity of the oligopeptide permease of pathogenic bacterial species inhabiting the human gastrointestinal tract. 2009. (Congresso).

I Encontro Paulistano sobre Escherichia coli patogênica "Luiz Rachid Trabulsi". 2009. (Encontro).

V Congresso do Instituto de Ciências Biomédicas. Generation of specific polyamine uptake knockout mutants of Streptococcus mutans UA159 strain. 2009. (Congresso).

108o General Meeting of American Society for Microbiology. Role of the Pot system of Streptococcus mutans in stress tolerance. 2008. (Congresso).

54o Congresso Brasileiro de Genética. Geração de mutantes específicos por knockout do sistema de captação de poliaminas de Streptococcus mutans cepa UA159. 2008. (Congresso).

24o Congresso Brasileiro de Microbilogia. In silico study of the penicillin-binding proteins (PBPs) of Streptococcus species. 2007. (Congresso).

53o Congresso Brasileiro de Genética. In silico analysis of polyamine uptake system and molecular cloning of potD of Streptococcus mutans. 2007. (Congresso).

VII Reunião Científica do Departamento de Microbiologia.In silico study of the penicillin-binding proteins (PBPs) of Streptococcus species. 2007. (Encontro).

106th General Meeting. 106th General Meeting. 2006. (Congresso).

52 Congresso Brasileiro de Genética. 52 Congresso Brasileiro de Genética. 2006. (Congresso).

51ºCongresso Brasileiro de Genética. 51ºCongresso Brasileiro de Genética. 2005. (Congresso).

IV Congresso do Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo. Genetic and physiological analysis of the OppA of Streptococcus mu. 2005. (Congresso).

XXIII Congresso Brasileiro de Microbiologia. XXIII Congresso Brasilerio de Microbiologia. 2005. (Congresso).

12º Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo.12º Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo. 2004. (Simpósio).

22.º Congresso Internacional de Odontologia de São Paulo. 22.º Congresso Internacional de Odontologia de São Paulo. 2004. (Congresso).

XXXIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. XXXIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. 2004. (Congresso).

11º Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo.11º Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo. 2003. (Simpósio).

21º Congresso Internacional de Odontologia de São Paulo. 2003. (Congresso).

49º Congresso Brasileiro de Genética. 2003. (Congresso).

II Congresso do Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo. II Congresso do Instituto de Ci6encias Biomédicas da Universidade de São Paulo. 2003. (Congresso).

XXII Congresso Brasileiro de Microbiologia. XXII Congresso Brasileiro de Microbiologia. 2003. (Congresso).

XXVIII Congresso Universitário Brasilerio de Odontologia. XXVIII Congresso Universitário Brasileiro de Odontologia. 2003. (Congresso).

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Participação em bancas

Aluno: Priscilla Yuri Okochi

HEINEMANN, M. B.;NEPOMUCENO, R.; MOSIG, J. M. A.. Importância das vias do sistema complemento na eliminação de diferentes estirpes patogênicas e não patogênicas de Leptospira. 2018 - Instituto de Ciências Biomédicas da USP.

Aluno: Larissa do Rêgo Barros Matos

NEPOMUCENO, ROBERTOABREU, PATRÍCIA A. E.; GREGORI, F.; AZEVEDO, A. M. T.; FRANZOLIN, M. R.. Caracterização de proteínas secretadas por Leptospira spp. e sua possível aplicação no diagnóstico de leptorpirose. 2017. Tese (Doutorado em Epidemiologia Experimental Aplicada às Zoonoses) - Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da USP.

Aluno: Natália Salazar de Castro

DAU, A. P. M. A.; SPERANCA, M. A.; SILVA, C. A.; BERTONCINI, M. D. S.;NEPOMUCENO, R. S. L.. Caracterização funcional da proteína MntC de Staphylococcus aureus e estudo de dinâmica molecular das proteínas do cluster 9. 2014. Tese (Doutorado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Kamila Oliveira Nunes

NEPOMUCENO, R.; HEINEMANN, M. B.; MORENO, A. M.. Caracterização funcional de quatro termolisinas presentes nas espécies patogênicas de Leptospira. 2018 - Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da USP.

Aluno: Gabriel Soares Guerra

NEPOMUCENO, R.ELIAS, WALDIR P.; TADEI, C.. Desenvolvimento de uma estratégica de inibição de transportadores ABC utilizando anticorpos. 2018 - Instituto de Ciências Biomédicas da USP.

Aluno: Camila Massae Sato

GOTO, H.;NEPOMUCENO, R.; KESPER JUNIOR, N.. Diagnóstico sorológico da Leishmaniose tegumentar americana causada por espécies da Leishmania. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Medicina Tropical) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Gabriela Sergini Pereira Sabino

NEPOMUCENO, R.; Motta, RHL; Montalli, VAM. Identificação de cepas isoladas de pacientes usuários de aparelho ortondôntico e avaliação da resistência aos antimicrobianos. 2019. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Odontologia) - Faculdade de Odontologia São Leopoldo Mandic.

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Comissão julgadora das bancas

Paulo Henrique Rodrigues

RODRIGUES, P. H.; SILBER, A. M.; ELIAS JUNIOR, W. P.; FERNANDES, A. B.; FERREIRA, R. C. C.. Análise do papel dos transportadores ABC de oligopeptídeos, poliaminas, fosfato inorgânico, glutamato e glutamina na fisiologia e patogênese de bactérias do trato gastro-intestinal. 2013. Tese (Doutorado em Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro) - Universidade de São Paulo.

RITA DE CÁSSIA CAFÉ FERREIRA

FERREIRA, R.C.C.; ELIAS JUNIOR, W. P.;BALAN, A.; RODRIGUES, P. H.; SILBER, A. M.. Análise do papel dos transportadores ABC de oligopeptídeos, poliaminas, fosfato inorgânico, glutamato e glutamina na fisiologia e patogênese de bactérias do trato gastro-intestinal.. 2013. Tese (Doutorado em Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro) - Universidade de São Paulo.

WALDIR PEREIRA ELIAS JUNIOR

ELIAS, W. P.. Análise do papel dos transportadores ABC de oligopeptídeos, poliaminas, fosfato inorgânico, glutamato e glutamina na fisiologia e patogênese de bactérias do trato gastro-intestinal. 2013. Tese (Doutorado em Ciências (Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro)pgbmp@icb.usp.br) - Universidade de São Paulo.

WALDIR PEREIRA ELIAS JUNIOR

ELIAS, W. P.. Estudo de sistemas de captação de oligopeptídeos e poliaminas na fisiologia e patogenicidade de Streptococcus mutans. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências (Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro)pgbmp@icb.usp.br) - Universidade de São Paulo.

Andrea Balan

BALAN, AndreaFERREIRA, Rita de Cassia Cafe. Análise do papel dos transportadores ABC de oligopeptídeos, poliaminas, fosfatoinorgânico, glutamato e glutamina na fisiologia e patogênese de bactérias de trato gastro intestinal. 2013. Tese (Doutorado em Ciências (Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro)pgbmp@icb.usp.br) - Universidade de São Paulo.

Ariel Mariano Silber

SILBER, A. M.. Análise do papel dos transportadores ABC de oligopeptídeos, poliaminas, fosfato inorgánico, glutamato e glutamina na fisiologia e patogênese de bactérias do trato gastro-intestinal". 2013. Tese (Doutorado em Biologia da relação patógeno-hspedeiro.) - Departamento de Parasitologia - Instituto de Ciências Biomédicas - USP.

Gerhard Wunderlich

SILBER, A. M.; ELIAS JUNIOR, W. P.;Wunderlich, Gerhard. Estudo de sistemas de captação de oligopeptideos e poliaminas na fisiologia e patogenicidade de Streptococcus mutans. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Biologia da Relacao Parasita-Hospedeiro) - Instituto Ciências Biomédicas.

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Orientou

Gustavo Ragozzini

Clonagem e expressão da proteína ligadora de penicilina 2b (PBP2b) de Streptococcus; 2010; Iniciação Científica; (Graduando em Odontologia) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Roberto Nepomuceno de Souza Lima;

Natália Bolini de Araújo

Clonagem e expressão da proteína ligadora de penicilina 2b (PBP2b) de Streptococcus; 2010; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia e Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Roberto Nepomuceno de Souza Lima;

Suzana Maria Amaral

Análise da proteína ligadora de substrato (PotD) do sistema de transporte de poliaminas de Streptococcus mutans UA159; 2007; Iniciação Científica; (Graduando em Odontologia) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Roberto Nepomuceno de Souza Lima;

Karine de Souza Guimarães

Análise molecular e estrutural da proteína OppA de Streptococcus mutans; 2005; Iniciação Científica; (Graduando em Odontologia) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Roberto Nepomuceno de Souza Lima;

Milene Tavares Batista

Caracterização do sistema de transporte de oligopeptídeos Opp em Streptococcus mutans; 2005; Iniciação Científica; (Graduando em Odontologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Roberto Nepomuceno de Souza Lima;

Carolina Salcedo Rivillas

Análise genética e funcional de proteínas ligadoras do sistema de transporte ativo do tipo ABC em Streptococcus mutans; 2010; Orientação de outra natureza; (Abi - Ciências Biológicas) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Roberto Nepomuceno de Souza Lima;

Jaime Henrique Amorim dos Santos

Análise genética e funcional de proteínas ligadoras do sistema de transporte ativo do tipo ABC em Streptococcus mutans; 2009; Orientação de outra natureza; (Ciências Biomédicas) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Roberto Nepomuceno de Souza Lima;

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Foi orientado por

RITA DE CÁSSIA CAFÉ FERREIRA

Estudo de sistemas de captação de oligopeptídeos e poliaminas na fisiologia e patogenicidade de Streptococcus mutans; 2009; Tese (Doutorado em Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro) - Instituto de Ciências Biomédicas II - USP,; Orientador: Rita de Cassia Cafe Ferreira;

RITA DE CÁSSIA CAFÉ FERREIRA

Aplicação da técnica de ?splicing overlap extension (SOE)? para a geração de mutantes alterados no gene oppA de Streptococcus mutans; 2006; Iniciação Científica - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Rita de Cassia Cafe Ferreira;

RITA DE CÁSSIA CAFÉ FERREIRA

Análise computacional e funcional de sistemas; 2002; Iniciação Científica - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Rita de Cassia Cafe Ferreira;

WALDIR PEREIRA ELIAS JUNIOR

2018; Instituto Butantan, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Waldir Pereira Elias Junior;

WALDIR PEREIRA ELIAS JUNIOR

2017; Instituto Butantan, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Waldir Pereira Elias Junior;

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Produções bibliográficas

  • MARTINS, FERNANDO H. ; NEPOMUCENO, ROBERTO ; PIAZZA, ROXANE M.F. ; ELIAS, WALDIR P. . Phylogenetic distribution of tir-cytoskeleton coupling protein (tccP and tccP2) genes in atypical enteropathogenic Escherichia coli. FEMS Microbiology Letters , v. 364, p. fnx101, 2017.

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; Costa, S.O.P. ; Ferreira, R.C.C. . Sistema de transporte de oligopeptídeos na fisiologia e patogênese de bactérias do gênero Streptococcus. Microbiologia in Foco , v. 23, p. 17-23, 2015.

  • OZAKI, CHRISTIANE Y. ; SILVEIRA, CAIO R. F. ; ANDRADE, FERNANDA B. ; NEPOMUCENO, ROBERTO ; SILVA, ANDERSON ; MUNHOZ, DANIELLE D. ; YAMAMOTO, BRUNO B. ; LUZ, DANIELA ; ABREU, PATRÍCIA A. E. ; HORTON, DENISE S. P. Q. ; ELIAS, WALDIR P. ; RAMOS, OSCAR H. P. ; PIAZZA, ROXANE M. F. . Single Chain Variable Fragments Produced in Escherichia coli against Heat-Labile and Heat-Stable Toxins from Enterotoxigenic E. coli. Plos One , v. 10, p. e0131484, 2015.

  • ROJAS, ROBERT ; NISHIDOMI, SABRINA ; NEPOMUCENO, ROBERTO ; OSHIRO, ELISA ; CASSIA CAFÉ FERREIRA, RITA . Glutamate transport and xanthan gum production in the plant pathogen Xanthomonas axonopodis pv. citri. World Journal of Microbiology & Biotechnology , v. 29, p. 2173-2180, 2013.

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; Luz, D.E. ; SPIRA, B. ; FERREIRA, R.C.C. . The Pst system of Streptococcus mutans is important for phosphate transport and adhesion to abiotic surfaces. Molecular Oral Microbiology , v. 27, p. 172-181, 2012.

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; TAVARES, M. B. ; LEMOS, J. A. C. ; GRISWOLD, A. R. ; Ribeiro, J. ; Balan, A. ; Guimarães, K,.S. ; Cai, S. ; BURNE, R. A. ; Ferreira, L.C.S. ; FERREIRA, R. C. C. . The Oligopeptide (opp) gene cluster of Streptococcus mutans: identification, prevalence, and characterization. Oral Microbiology and Immunology , v. 22, p. 277-284, 2007.

  • OSHIRO, E. E. ; NEPOMUCENO, R. S. L. ; Faria, J.B. ; Ferreira, L.C.S. ; FERREIRA, R. C. C. . Site-directed gene replacement of the phytopathogen Xanthomonas axonopodis pv. citri. Journal of Microbiological Methods , v. 65, n.1, p. 171-179, 2006.

  • FERREIRA, E. O. ; NEPOMUCENO, R. S. L. . Genética da Virulência. In: Luiz Rachid Trabulsi; Flavio Alterthum. (Org.). Microbiologia. 6ed.São Paulo: Atheneu, 2015, v. , p. 161-168.

  • ELIAS, WALDIR P. ; NEPOMUCENO, R. S. L. ; CAMPOS, L. C. . Sistemas de Secreção de Proteínas. In: Luiz Rachid Trabulsi; Flavio Alterthum. (Org.). Microbiologia. 6ed.São Paulo: Atheneu, 2015, v. , p. 169-178.

  • NEPOMUCENO, R. ; SANTIAGO, A. E. ; BARRETO, S. S. ; SONOBE, M. H. ; ABE, C. M. ; NATARO, J. P. ; ELIAS, WALDIR P. . Enteroaggregative Escherichia coli 042 type three secretion system 2 (ETT2): transcription profile and secretome analysis. 2019. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • NEPOMUCENO, R. ; BARRETO, S. S. ; SONOBE, M. H. ; ABE, C. M. ; ELIAS, WALDIR P. . Type three secretion system 2 (ETT2) of enteroaggregative Escherichia coli 042: expression and comparative secretome analysis. 2017. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • ANDRADE, FERNANDA B. ; NEPOMUCENO, R. ; PIAZZA, ROXANE M. F. ; ELIAS, WALDIR P. . Cytotoxic effects of SepA: a serine protease autotransporter protein of Enterobacteriaceae (SPATE). 2017. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • NEPOMUCENO, R. ; MELO, K. C. ; BARRETO, S. S. ; SANTOS, A. P. ; SONOBE, M. H. ; GOMES, T. A. T. ; ELIAS, WALDIR P. . Analysis of the type three secretion system 2 (ETT2) of enteroaggregative Escherichia coli. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • NEPOMUCENO, R. ; ELIAS, WALDIR P. . Estudo do sistema de secreção do tipo três (ETT2) de E. coli enteroagregativa. 2016. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • YAMAMOTO, BRUNO B. ; NEPOMUCENO, R. ; MARTINS, F. H. ; JENSEN, J. R. ; PIAZZA, ROXANE M. F. . Expression profiles of heat labile and heat stable toxins in enterotoxigenic Escherichia coli. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • MITSUNARI, T. ; Luz, D.E. ; MARTINS, F. H. ; NEPOMUCENO, R. ; PIAZZA, ROXANE M. F. . Generation of recombinant heat-stable toxin from enterotoxigenic Escherichia coli using synthetic genes. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • SANTOS, A. P. ; NUNES, K. O. ; NEPOMUCENO, R. ; ABREU, A. G. ; GOMES, T. A. T. ; ELIAS, WALDIR P. . Occurrence of SPATE genes in uropathogenic Escherichia coli (UPEC). 2015. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • NEPOMUCENO, R. ; MARTINS, F. H. ; ELIAS, WALDIR P. . Inactivation of the type three secretion system ETT2 does not affect the physiology or adherence patterns of enteroaggregative Escherichia coli 042. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • NEPOMUCENO, R. ; MARTINS, F. H. ; BARRETO, S. S. ; SONOBE, M. H. ; ELIAS, WALDIR P. . Role of the ETT2 system on the physiology and adherence traits of enteroaggregative Escherichia coli 042. 2015. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • ABREU, A. G. ; NEPOMUCENO, R. ; NAVARRO-GARCIA, F. ; BARBOSA, A. S. ; PIAZZA, ROXANE M. F. ; ELIAS, WALDIR P. . Biological activities of Pic from atypical enteropathogenic Escherichia coli. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • MITSUNARI, T. ; NEPOMUCENO, R. ; ROCHA, L. B. ; PIAZZA, ROXANE M. F. . Clonagem in tandem e expressão de duas cópias do gene estA produtor da enterotoxicina termoestável (ST) de Escherichia coli enterotoxigênica. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • ABREU, A. G. ; NEPOMUCENO, R. ; NAVARRO-GARCIA, F. ; BARBOSA, A. S. ; PIAZZA, ROXANE M. F. ; ELIAS, WALDIR P. . Biological activities of Pic from atypical enteropathogenic Escherichia coli. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. . Análise do papel dos transportadores ABC de oligopeptídeos, poliaminas, fosfato inorgânico, glutamato e glutamina na fisiologia e patogênese de bactérias do trato gastro-intestinal. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; Gomes ; Ferreira, R.C.C. . Estudo do sistema de Oligopeptídeos (Opp) de Escherichia coli. 2013. (Apresentação de Trabalho/Outra).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; RODRIGUES, P. H. ; ALMEIDA, R. S. ; FERREIRA, E. L. ; Guimarães, K,.S. ; SIMONATO, M. R. L. ; GOLDMAN, G. H. ; Ferreira, R.C.C. . Role of glutamate and glutamine uptake systems on the pathogenicity of Streptococcus mutans. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; Alencar, H. ; Castro, A.P. ; Ferreira, L.C.S. ; Ferreira, R.C.C. . The oligopeptide permease of gastrointestinal pathogens. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • Luz, D.E. ; NEPOMUCENO, R. S. L. ; SPIRA, B. ; Ferreira, R.C.C. . The inorganic phosphate biding protein (PstS) of Streptococcus mutans. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • NISHIDOMI, SABRINA ; ROJAS, ROBERT ; NEPOMUCENO, R. S. L. ; Ferreira, R.C.C. ; OSHIRO, E. E. . Transporte de L-glutamato e produção de goma xantana em Xanthomonas axonopodis pv. Citri. 2010. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; Luz, D.E. ; LEMOS, J. A. C. ; FERREIRA, R. C. C. . Characterization of the polyamine uptake system of Streptococcus mutans. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; Luz, D.E. ; ALENCAR, H. ; Gomes ; Castro, A.P. ; Costa, S.O.P. ; Ferreira, R.C.C. . The oligopeptide permease of gastrointestinal pathogens. 2010. (Apresentação de Trabalho/Outra).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; Luz, D.E. ; LEMOS, J. A. C. ; Ferreira, R.C.C. . Characterization of the polyamine uptake system of Streptococcus mutans. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • NISHIDOMI, SABRINA ; ROJAS, ROBERT ; NEPOMUCENO, R. S. L. ; OSHIRO, E. E. ; Ferreira, R.C.C. . Transporte de L-glutamato e produção de goma xantana em Xanthomonas axonopodis pv. Citri. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; Alencar, H. ; Castro, A.P. ; Ferreira, L.C.S. ; Ferreira, R.C.C. . The oligopeptide permease of gastrointestinal pathogens. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • Ragozzini, G ; NEPOMUCENO, R. S. L. ; Ferreira, R.C.C. . Análise in silico e clonagem da proteína ligadora de penicilina 2b (PBP2b) de Streptococcus mutans. 2010. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; FERREIRA, R. C. C. . Generation of specific polyamine uptake knockout mutants of Streptococcus mutans UA159 strain. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; Alencar, H. ; Castro, A.P. ; Ferreira, L.C.S. ; Ferreira, R.C.C. . Conservancy and genetic diversity of the oligopeptide permease of pathogenic bacterial species inhabiting the human gastrointestinal tract. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • Luz, D.E. ; NEPOMUCENO, R. S. L. ; SPIRA, B. ; Ferreira, L.C.S. ; Ferreira, R.C.C. . Sequence analysis and molecular cloning of a Streptococcus mutans orthophosphate permease. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; LEMOS, J. A. C. ; Ferreira, L.C.S. ; Ferreira, R.C.C. . Role of the Pot system of Streptococcus mutans in stress tolerance. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; LEMOS, J. A. C. ; Luz, D.E. ; Ferreira, L.C.S. ; Ferreira, R.C.C. . Geração de mutantes específicos por knockout do sistema de captação de poliaminas de Streptococcus mutans UA159. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; CAVALCANTE, R. C. M. ; CATARINO, M. H. ; Ferreira, R.C.C. . In silico study of the penicillin-binding proteins (PBPs) of Streptococcus species. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; AMARAL, S. M. ; Ferreira, R.C.C. . In silico analysis of polyamine uptake system and molecular cloning of potD of Streptococcus mutans. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; CAVALCANTE, R. C. M. ; CATARINO, M. H. ; Ferreira, R.C.C. . In silico study of the penicillin-binding proteins (PBPs) of Streptococcus species. 2007. (Apresentação de Trabalho/Outra).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; LEMOS, J. A. C. ; TAVARES, M. B. ; Guimarães, K,.S. ; GRISWOLD, A. R. ; Burne, R.A. ; Ferreira, L.C.S. ; Ferreira, R.C.C. . Biofilm formation and the oligopeptide uptake pathway in Streptococcus mutans UA159. 2006. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • TAVARES, M. B. ; MOTTA, B.S. ; PACCEZ, J. D. ; LUIZ, W. B. ; NEPOMUCENO, R. S. L. ; GUIMARAES, K. S. ; Cai, S. ; Ferreira, L.C.S. ; Ferreira, R.C.C. . Expressão da proteína OppA de Streptococcus mutans em linhagens de Bacillus subtilis. 2006. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; TAVARES, M. B. ; Ribeiro, J. ; Balan, A. ; Guimarães, K,.S. ; Cai, S. ; Ferreira, L.C.S. ; Ferreira, R.C.C. . The oligopeptide binding protein (OppA) of Streptococcus mutans. 2006. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; Gomes ; ALENCAR, H. ; Ferreira, L.C.S. ; Ferreira, R.C.C. . Generation of a Escherichia coli O157:H7 mutant with inactivated oppA gene mutant using splycing-overlap-extension and allelic replacement techniques. 2005. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; TAVARES, M. B. ; Ribeiro, J. ; GUIMARAES, K. S. ; Cai, S. ; Ferreira, L.C.S. ; Ferreira, R.C.C. . Determination of antibiotic resistance patterns among clinical and laboratorial strains of Streptococcus mutans. 2005. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; TAVARES, M. B. ; Ribeiro, J. ; GUIMARAES, K. S. ; Cai, S. ; Ferreira, L.C.S. . Genetic and physiological analyses of the oligopeptide binding protein (OppA) of Streptococcus mutans. 2005. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • TAVARES, M. B. ; NEPOMUCENO, R. S. L. ; Ribeiro, J. ; Guimarães, K,.S. ; SPIRA, B. ; Cai, S. ; Ferreira, L.C.S. ; Ferreira, R.C.C. . Ocorrência do gene oppA em amostras clínicas de Streptococcus mutans. 2005. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; TAVARES, M. B. ; Ribeiro, J. ; GUIMARAES, K. S. ; Cai, S. ; Ferreira, L.C.S. . Genetic and physiological analyses of the oligopeptide binding protein (OppA) of Streptococcus mutans. 2005. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • GUIMARAES, K. S. ; NEPOMUCENO, R. S. L. ; TAVARES, M. B. ; Ferreira, R.C.C. ; Cai, S. ; Ribeiro, J. ; Ferreira, L.C.S. . Análise molecular e estrutural da proteína OppA de Streptococcus mutans. 2005. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; TAVARES, M. B. ; Ferreira, R.C.C. . A evolução dos estudos genômicos das bactérias orais. 2004. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; OSHIRO, E. E. ; Faria, J.B. ; Ferreira, R.C.C. . Geração de mutantes de Xanthomonas citri deficientes na expressão da proteína OppA por técnica de interrupção gênica. 2004. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; Ferreira, R.C.C. . Cloning and expression of the oligopeptide binding protein of Streptotoccus mutans UA159. 2004. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; MOUTRAN, A. ; FERREIRA, R. C. C. . O interesse na genômica das bactérias da cavidade oral. 2003. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; TAVARES, M. B. ; Rosseto, J.H.F. ; MOUTRAN, A. ; Cai, S. . Análise de sequencias e clonagem molecular do transportador de oligopeptideos em bactérias da cavidade oral. 2003. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; TAVARES, M. B. ; MOUTRAN, A. ; Ferreira, R.C.C. . Sequence ana;ysis and molecular cloning of the streptococcus mutans oligopeptide permease. 2003. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • NEPOMUCENO, R. S. L. ; OSHIRO, E. E. ; MOUTRAN, A. ; Ferreira, R.C.C. . Análise computacional e funcional de sistema bacteriano de captação de oligopeptídeos. 2003. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

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Outras produções

NEPOMUCENO, R. S. L. . Bactérias e Toxinas. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

NEPOMUCENO, R. S. L. . Papel do sistema de transporte do tipo ABC na patogenicidade bacteriana. 2013. .

NEPOMUCENO, R. S. L. . Genômica e as bactérias. 2013. .

NEPOMUCENO, R. S. L. . Membrana externa bacteriana. 2011. .

NEPOMUCENO, R. S. L. . Sistemas ABC de transporte. 2011. .

NEPOMUCENO, R. S. L. . Membrana citoplasmática e espaço periplasmático. 2010. .

NEPOMUCENO, R. S. L. . Membrana externa bacteriana. 2010. .

NEPOMUCENO, R. S. L. . Especialização em Microbiologia. 2009. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

NEPOMUCENO, R. S. L. . Membrana externa bacteriana. 2009. .

NEPOMUCENO, R. S. L. . Sistema de captação de oligopeptídeos de Streptococcus mutans. 2007. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

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Prêmios

2008

Menção Honrosa - Prêmio Pós-Graduação em Genética de Microrganismos, Sociedade Brasileira de Genética.

2007

Menção honrosa (Iniciação Científica) em publicação científica, Instituto de Ciências Biomédicas- Departamento de Microbiologia - USP.

2007

Prêmio Prof. João Sampaio Doria - primeiro lugar no curso de odontologia da Faculdade de Odontologia da Universidade de São Paulo, Conselho Regional de Odontologia de São Paulo.

2007

Prêmio APCD - melhor aluno do curso de odontologia da Universidade de São Paulo, Associação Paulista de Cirurgiões Dentistas.

2007

Prêmio 3M ESPE - Melhor aluno do curso de Odontologia da Faculdade de Odontologia da Universidade de São Paulo, 3M.

2006

Menção Honrosa em publicação científica, Instituto de Ciências Biomédicas da USP.

2006

Menção Honrosa em publicação científica, Instituto de Ciências Biomédicas da USP.

2005

Prêmio de Iniciação Científica - 1º colocado, Sociedade Brasileira de Genética.

2005

Menção Honrosa, Instituto de Ciências Biomédicas - USP.

2004

Menção Honrosa, Congresso Universitário Brasileiro de Odontologia.

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Faculdade São Leopoldo Mandic - Campinas, Curso de Medicina. , Rua Dr. José Junqueira, 13, Butantã, 05503900 - São Paulo, SP - Brasil, Telefone: (019) 32113600, URL da Homepage:

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Experiência profissional

  • 2019 - Atual

    Faculdade São Leopoldo Mandic - Campinas

    Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor Doutor, Carga horária: 8

  • 2018 - Atual

    Instituto Butantan

    Vínculo: Pesquisador convidado, Enquadramento Funcional: Pesquisador Científico, Carga horária: 32

  • 2014 - 2018

    Instituto Butantan

    Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutorando, Carga horária: 40

  • 2007 - 2013

    Instituto de ciencias Biomedicas da USP

    Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Doutorando, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

    Atividades

    • 05/2007 - 08/2013

      Pesquisa e desenvolvimento , Laboratório de genética e fisiologia bacteriana, .,Linhas de pesquisa

  • 2018 - Atual

    Sociedade Brasileira de Microbiologia

    Vínculo: Professor convidado, Enquadramento Funcional: Professor convidado, Carga horária: 12

    Outras informações:
    Ministrar aulas no curso de Especilaização em Microbiologia de Sociedade Brasileira de Microbiologia em um pedíodo total de 48 horas

  • 2009 - 2014

    Sociedade Brasileira de Microbiologia

    Vínculo: Professor Convidado, Enquadramento Funcional: Professor Convidado, Carga horária: 30

    Outras informações:
    Professor convidado de Microbiologia básica para o curso de especialização em microbiologia da Sociedade Brasileira de Microbiologia que ocorre anualmente no primeiro semestre de cada ano.

  • 2010 - 2010

    Instituto de Ciências Biomédicas II - USP

    Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Monitor, Carga horária: 6

    Outras informações:
    Monitor do programa PAE (Programa de aperfeiçoamento de ensino) da disciplina BMM0271 - Microbiologia Básica

  • 2008 - 2010

    Universidade de São Paulo

    Vínculo: Monitor, Enquadramento Funcional: Monitor disciplina BMM 0271, Carga horária: 16

  • 2003 - 2007

    Universidade de São Paulo

    Vínculo: Monitor, Enquadramento Funcional: Monitor disciplina BMM 0271, Carga horária: 16

    Outras informações:
    Monitor voluntário das aulas da disciplina BMM0271 - Microbiologia Básica. Atuando nas aulas práticas e seminários.

  • 2008 - 2008

    Instituto de Ciências Biomédicas II / USP

    Vínculo: Monitor, Enquadramento Funcional: Monitor, Carga horária: 4

    Outras informações:
    Monitor da IV Mostra de Microbiologia

  • 2007 - 2007

    Instituto de Ciências Biomédicas II / USP

    Vínculo: Monitor, Enquadramento Funcional: Monitor, Carga horária: 4

    Outras informações:
    Monitor da III Mostra de Microbiologia da USP

  • 2013 - 2013

    Força Ensino Orientado

    Vínculo: Professor Convidado, Enquadramento Funcional: Professor Convidado, Carga horária: 30

    Outras informações:
    Professor Convidado à ministrar aulas particulares e de acompanhamento escolar para o ensino fundamental e médio.

  • 2007 - Atual

    Sociedade Brasileira de Genética

    Vínculo: Sócio, Enquadramento Funcional: Sócio

  • 2006 - Atual

    American society for microbiology

    Vínculo: Sócio, Enquadramento Funcional: Sócio