Alberto Monteiro dos Santos

Pós-doutorado

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• SOUZA GUIMARÃES, AMABRILHA VIRGÍNIA ; MONTEIRO DOS SANTOS, ALBERTO ; DE OLIVEIRA ARAÚJO, JÉSSICA ; RESENDE, DANIELA MELO ; SOUZA GUIMARÃES, PAUL ANDERSON ; LAMEIRA, JERÔNIMO ; REIS CARVALHO, MARIA GABRIELA ; RUIZ, JERONIMO CONCEIÇÃO . Unveiling potential Helicobacter pylori vaccine candidates: A comprehensive multi-epitope approach. COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE , v. 202, p. 111441, 2026.

• GANGULY, CHHANDOSEE ; ARIBAM, SWARMISTHA DEVI ; DOS SANTOS, ALBERTO MONTEIRO ; MARTIN, LINDSIE ; THOMAS, LEONARD M. ; SHAO, YIHAN ; RAJAN, RAKHI . Bridge helix of Cas12a is an allosteric regulator of R-loop formation and RuvC activation. Nature Communications , v. 1, p. 1, 2026.

• EHRLICH, HERMANN ; MIKSIK, IVAN ; TSURKAN, MIKHAIL V. ; SIMON, PAUL ; PORZUCEK, FILIP ; RYBKA, JAKUB DALIBOR ; MANKOWSKA, MONIKA ; GALLI, ROBERTA ; VIEHWEGER, CHRISTINE ; BRENDLER, ERICA ; VORONKINA, ALONA ; PAJEWSKA-SZMYT, MARTYNA ; TABACHNIK, ALEKSEI ; TABACHNICK, KONSTANTIN R. ; VOGT, CARLA ; WYSOKOWSKI, MARCIN ; JESIONOWSKI, TEOFIL ; BUCHWALD, TOMASZ ; SZYBOWICZ, MIROSLAW ; SANTOS, A. M. ; et.al . Discovery of mammalian collagens I and III within ancient poriferan biopolymer spongin. Nature Communications , v. 16, p. 2515, 2025.

• COSTA, C. H. S. ; FREITAS, C. A. B. ; DOS SANTOS, ALBERTO M. ; SOUZA, C. G. S. ; SILVA, J. R. ; SILVA, J. L. ; MOLINER, V. ; SKAF, MUNIR S. . Conformational Dynamics and Binding Interactions of SARS-CoV-2 Spike Protein Variants: Omicron, XBB.1.9.2, and EG.5. Journal of Chemical Information and Modeling , v. 1, p. 1, 2025.

• NASCIMENTO, WELLINGTON DA CONCEIÇÃO LOBATO DO ; SANTOS, ALBERTO MONTEIRO DOS ; SOUSA, NATANAEL DE SOUSA ; LIRA JÚNIOR, CARLOS ALBERTO ; SILVA, JERÔNIMO LAMEIRA ; MACIEL, ADEILTON PEREIRA . COMPUTATIONAL INSIGHTS INTO THE ESTERIFICATION OF LAURIC ACID (C12) WITH α-BISABOLOL OVER CeO2 AS A HETEROGENEOUS CATALYST. REVISTA MULTIDISCIPLINAR DO NORDESTE MINEIRO , v. 20, p. 1-21, 2025.

• LIRA JUNIOR, CARLOS ALBERTO ; NASCIMENTO, WELLINGTON DA CONCEIÇÃO LOBATO DO ; LIMA, EMANUEL DA CRUZ ; SOEIRO, YURI RAMOS MENEZES SANTOS ; SOUSA, NATANAEL DE SOUSA ; SANTOS, ALBERTO MONTEIRO DOS ; MACIEL, ADEILTON PEREIRA . Química computacional: uma revisão sobre métodos, fundamentos e aplicações científicas. CUADERNOS DE EDUCACIÓN Y DESARROLLO , v. 17, p. e7238, 2025.

• DOS SANTOS, ALBERTO MONTEIRO ; ROSTAMI, SAADI ; VAN, RICHARD ; LONG, KOLE ; ARIBAM, SWARMISTHA DEVI ; SHAO, YIHAN ; RAJAN, RAKHI . Conformational alterations in the protein-DNA complex facilitates efficient integration of diverse DNA substrates by the CRISPR Cas1-Cas2 proteins. Structural Dynamics , v. 12, p. A293-A293, 2025.

• MARTINS, MANOELA ; DOS SANTOS, ALBERTO M. ; DA COSTA, CLAUBER H. S. ; CANNER, SAMUEL W. ; CHUNGYOUN, MICHAEL ; GRAY, JEFFREY J. ; SKAF, MUNIR S. ; OSTERMEIER, MARC ; GOLDBECK, ROSANA . Thermostability Enhancement of GH 62 α- l -Arabinofuranosidase by Directed Evolution and Rational Design. Journal of Agricultural and Food Chemistry , v. 72, p. 4225, 2024.

• DOS SANTOS, ALBERTO M. ; DA COSTA, CLAUBER H. S. ; SILVA, PEDRO H. A. ; SKAF, MUNIR S. ; LAMEIRA, JERÔNIMO . Exploring the Reaction Mechanism of Polyethylene Terephthalate Biodegradation through QM/MM Approach. JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B , v. 1, p. 1, 2024.

• DAS NEVES, MONICA A. ; DO NASCIMENTO, JESSYANE R. ; MACIEL-SILVA, VERA LUCIA ; DOS SANTOS, ALBERTO M. ; JUNIOR, JALDYR DE JESUS G.V. ; COELHO, ANA JESSICA S. ; LIMA, MAYARA INGRID S. ; PEREIRA, SILMA REGINA F. ; DA ROCHA, CLÁUDIA Q. . Anti-Leishmania activity and molecular docking of unusual flavonoids-rich fraction from Arrabidaea brachypoda (Bignoniaceae). MOLECULAR AND BIOCHEMICAL PARASITOLOGY , v. 259, p. 111629, 2024.

• DOS SANTOS, ALBERTO M. ; DA COSTA, CLAUBER H. S. ; MARTINS, MANOELA ; GOLDBECK, ROSANA ; SKAF, MUNIR S. . Exploring the Structural and Dynamic Properties of a Chimeric Glycoside Hydrolase Protein in the Presence of Calcium Ions. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES , v. 25, p. 11961, 2024.

• SANTOS, A. M. ; OLIVEIRA, A. R. S. ; COSTA, C. H. S. ; KENNY, P. ; MONTANARI, CARLOS ; VARELA JUNIOR, J. J. G. ; LAMEIRA, JERONIMO . Assessment of Reversibility for Covalent Cysteine Protease Inhibitors Using Quantum Mechanics/Molecular Mechanics Free Energy Surfaces. Journal of Chemical Information and Modeling , v. X, p. X-X, 2022.

• COSTA, C. H. S. ; SANTOS, A. M. ; ALVES, C. N. ; MARTI, S. ; MOLINER, V. ; COSTA, K. S. ; LAMEIRA, J. S. . Assessment of the PETase Conformational Changes Induced by Poly(ethylene terephthalate) Binding. PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS , v. 90, p. 1-13, 2021.

• COSTA, C. H. S. ; BONATTO, V. ; SANTOS, A. M. ; LAMEIRA, J. S. ; LEITAO, ANDREI ; MONTANARI, CARLOS . Evaluating QM/MM free energy surfaces for ranking cysteine protease covalent inhibitors. Journal of Chemical Information and Modeling , v. X, p. X, 2020.

• COSTA, K. ; DOS SANTOS, ALBERTO MONTEIRO ; COSTA, C. H. S. ; LIMA, A. H. ; LAMEIRA, JERONIMO . Unraveling the Conformational Dynamics of Glycerol 3-phosphate Dehydrogenase, a Nicotinamide Adenine Dinucleotide-dependent Enzyme of. JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS , v. 1, p. 1-15, 2020.

• ARAUJO, J. O. ; SANTOS, A. M. ; LAMEIRA, J. ; ALVES, C. N. ; LIMA, A. H. . Computational Investigation of Bisphosphate Inhibitors of 3-Deoxy-d-manno-octulosonate 8-phosphate Synthase. MOLECULES , v. 24, p. 2370, 2019.

• COSTA, K. ; GALUCIO, J. M. ; JESUS, D. A. ; CARDOSO, G. ; LIMA, A. H. ; TAUBE, P. S. ; DOS SANTOS, ALBERTO M. ; LAMEIRA, J. . Targeting Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 1: A Structure-based Virtual Screening Approach to Find Novel Inhibitors. Current Computer-Aided Drug Design , v. 15, p. 176172, 2019.

• DOS SANTOS, ALBERTO MONTEIRO ; CIANNI, LORENZO ; DE VITA, DANIELA ; ROSINI, FABIANA ; LEITAO, ANDREI ; LAUGHTON, CHARLES A ; LAMEIRA, JERONIMO ; MONTANARI, CARLOS . Experimental Study and Computational Modelling of Cruzain Cysteine Protease Inhibition by Dipeptidyl Nitriles. PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS , v. 1, p. 1, 2018.

• COSTA, C. H. S. ; OLIVEIRA, A. R. S. ; DOS SANTOS, ALBERTO M. ; COSTA, K. S. ; LIMA, A. H. ; ALVES, C. N. ; LAMEIRA, J. . Computational Study of Conformational Changes in Human 3-hydroxy-3-methylglutaryl Coenzyme Reductase induced by Substrate Binding. JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS , v. 1, p. 1, 2018.

• DOS SANTOS, ALBERTO MONTEIRO ; LIMA, ANDERSON HENRIQUE ; ALVES, CLAUDIO NAHUM ; LAMEIRA, JERONIMO . Unraveling the Addition-Elimination Mechanism of EPSP Synthase through Computer Modeling. JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B , v. 121, p. 8626-8637, 2017.

• LIMA, ANDERSON H. ; DOS SANTOS, ALBERTO M. ; ALVES, CLÁUDIO NAHUM ; LAMEIRA, JERÔNIMO . Computed insight into a peptide inhibitor preventing the induced fit mechanism of MurA enzyme from Pseudomonas aeruginosa. Chemical Biology & Drug Design , v. 89, p. 599-607, 2016.

• COSTA, K. S. ; LEAL, E. S. ; SANTOS, A. M. ; LIMA, A. H. ; ALVES, C. N. ; LAMEIRA, J. . Structural Analysis of Viral Infectivity Factor of HIV Type 1 and Its Interaction with A3G, EloC and EloB. PLoS One , v. 9, p. e89116, 2014.

• Lima, Anderson Henrique Lima e ; Costa, Kauê Santana da ; SANTOS, ALBERTO MONTEIRO DOS . MÉTODOS DE PREDIÇÃO THREADING E AB INITIO. Métodos de modelagem da estrutura tridimensional de proteínas: Um guia teórico e prático. 1ed.: Atena Editora, 2022, v. , p. 33-40.

• Lima, Anderson Henrique Lima e ; Costa, Kauê Santana da ; SANTOS, ALBERTO MONTEIRO DOS . ALGORÍTMOS DE MODELAGEM THREADING E AB INITIO. Métodos de modelagem da estrutura tridimensional de proteínas: Um guia teórico e prático. 1ed.: Atena Editora, 2022, v. , p. 41-46.

• Lima, Anderson Henrique Lima e ; SANTOS, ALBERTO MONTEIRO DOS ; Costa, Kauê Santana da . APLICAÇÕES DA MODELAGEM POR HOMOLOGIA, AB INITIO E THREADING. Métodos de modelagem da estrutura tridimensional de proteínas: Um guia teórico e prático. 1ed.: Atena Editora, 2022, v. , p. 53-59.

• Costa, Kauê Santana da ; Lima, Anderson Henrique Lima e ; SANTOS, ALBERTO MONTEIRO DOS . ATUAIS LIMITAÇÕES E PERSPECTIVAS DOS MÉTODOS THREADING E AB INITIO. Métodos de modelagem da estrutura tridimensional de proteínas: Um guia teórico e prático. 1ed.: Atena Editora, 2022, v. , p. 60-79.

• ALBUQUERQUE, E. M. ; DOS SANTOS, ALBERTO M. . USO DA INFORMÁTICA NA EDUCAÇÃO AMBIENTAL NAS SÉRIES INICIAIS: BRINCANDO E APRENDENDO ATRAVÉS DAS TECNOLOGIAS DIGITAIS. In: Tania Suely Azevedo Brasileiro, Marciana Lima Góes, Claudir de Oliveira. (Org.). PESQUISA, CONHECIMENTO E PRÁTICAS PEDAGÓGICAS NA CULTURA DIGITAL: Contribuições dos TCC da Licenciatura em Informática Educacional da UFOPA. 1ed.Brasília: Rosivan Diagramação & Artes Gráficas, 2021, v. 2, p. 132-158.

• ALBUQUERQUE, E. M. ; DOS SANTOS, ALBERTO M. . Uso da Informática na Educação Ambiental nas Séries Iniciais: Brincando e aprendendo através das Tecnologias Digitais. In: I Congresso Internacional Educação, Culturas e Tecnologias na Amazônia - I CIECTA, 2019, Santarém. I Congresso Internacional Educação, Culturas e Tecnologias na Amazônia - I CIECTA, 2019.

• MOTA, C. R. V. ; SOARES, A. L. O. ; DOS SANTOS, ALBERTO M. . Criação de um Protótipo do Aplicativo MyFish como prática de metodologia ativa no ensino médio.. In: I Congresso Internacional Educação, Culturas e Tecnologias na Amazônia - I CIECTA, 2019, Santarém. I Congresso Internacional Educação, Culturas e Tecnologias na Amazônia - I CIECTA, 2019.

• SOARES, A. L. O. ; MOTA, C. R. V. ; DOS SANTOS, ALBERTO M. . Desenvolvimento do Protótipo RecarrÉgua: Uma experiência de extensão em empreendedorismo no ensino médio. In: I Congresso Internacional Educação, Culturas e Tecnologias na Amazônia - I CIECTA, 2019, Santarém. I Congresso Internacional Educação, Culturas e Tecnologias na Amazônia - I CIECTA, 2019.

• LEAL, M. C. ; PANTOJA, R. P. ; FERREIRA, D. T. ; DOS SANTOS, ALBERTO M. ; PINHEIRO, G. L. M. . REDUÇÃO DA INCLUSÃO DIGITAL POR MEIO DO ACESSO A COMPUTADORES EM LABORATÓRIOS ESCOLARES EM BREVES. In: III Encontro de Ciências e suas Tecnologias no Marajó, 2019, Breves. III Encontro de Ciências e suas Tecnologias no Marajó, 2019.

• LIMA, A. H. ; SANTOS, A. M. ; ALVES, C. N. ; LAMEIRA, J. S. . Activation Free Energies for the SN2 Step of the SalL Methyltransferase. In: III ESCOLA BRASILEIRA DE MODELAGEM (EBMM 2015), 2015, Santo André. III Escola Brasileira de Modelagem Molecular, 2015.

• COSTA, K. ; SANTOS, A. M. ; ALENCAR, N. A. N. ; LEAL, E. S. ; ALVES, C. N. ; LIMA, A. H. ; LAMEIRA, J. . Molecular dynamic and docking study of virion infectivity factor (HIV-1) with proteins of E3 ubiquitin ligase complex and APOBEC3G. In: International Conference of the AB3C and Brazilian Symposium on Bioinformatics 2013, 2013, Recife, PE. International Conference of the AB3C and Brazilian Symposium on Bioinformatics 2013, 2013.

• COSTA, K. ; ALENCAR, N. A. N. ; SANTOS, A. M. ; LIMA, A. H. ; ALVES, C. N. ; LEAL, E. S. ; LAMEIRA, J. . Homology modeling and molecular dynamics simulation of antiretroviral human APOBEC3H. In: International Conference of the AB3C and Brazilian Symposium on Bioinformatics 2013, 2013, Recife, PE. International Conference of the AB3C and Brazilian Symposium on Bioinformatics 2013, 2013.

• PINHEIRO, S. S. ; NASCIMENTO, S. B. ; SILVA, N. S. ; SILVA, R. C. ; SILVA, A. P. ; RAMOS, F. C. ; SANTOS, A. M. ; MIRANDA, R. M. ; LIMA, A. H. ; OLIVEIRA, R. L. S. ; LAMEIRA, J. ; ALVES, C. N. . Theoretical study of the HOGT protein complexed with the substrate UDP-GLCNAC by Molecular Modeling technique. In: The 6th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry, 2012, Canela, RS. The 6th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry, 2012.

• COSTA, K. ; SANTOS, A. M. ; LIMA, A. H. ; LEAL, E. S. ; ALVES, C. N. ; LAMEIRA, J. . Ab initio Modeling of Viral Infectivity Factor of HIV-1. In: 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2012, Campinas, SP. 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2012.

• SANTOS, A. M. ; ALVES, C. N. . Proposta de novos inibidores antimaláricos através do estudo do Mecanismo Catalítico da enzima 5-enolpiruvilchiquimato-3-fosfato sintase pelos métodos de Dinâmica Molecular e QM/MM. In: XXII Seminário de Iniciação Científica da UFPA, 2011, Belém, PA. XXII Seminário de Iniciação Científica da UFPA, 2011.

• LIMA, A. H. ; SANTOS, A. M. ; SILVA, R. C. ; ALENCAR, N. A. N. ; SILVA, A. P. ; RAMOS, F. C. ; LAMEIRA, J. ; ALVES, C. N. . Employing Docking and QM/MM Methods to study Protein-ligand interaction of T. cruzi Trans-sialidase Inhibitors. In: 7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2011, Florianópolis, SC. 7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2011.

• SANTOS, A. M. ; LIMA, ANDERSON H. ; LAMEIRA, JERÔNIMO ; ALVES, CLÁUDIO NAHUM . Semiempirical determination of the base catalytic residue in the elimination step of EPSPS enzyme. In: XVI Simpósio Brasileiro de Química Teórica - SBQT 2011, 2011, Ouro Preto, MG. Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 2011.

• SANTOS, A. M. ; LIMA, A. H. ; ALENCAR, N. A. N. ; LAMEIRA, J. ; ALVES, C. N. . Study of the catalytic mechanism of the enzyme 5-enolpyruvylshikimate 3-phosphate synthase using methods of molecular dynamics and QM / MM. In: 6th International Conference of Brazilian Assiciation for Bioinformatics and Computational Biology, 2010, Ouro Preto, MG. 6th International Conference of Brazilian Assiciation for Bioinformatics and Computational Biology, 2010.

• SANTOS, A. M. ; LIMA, A. H. ; LAMEIRA, J. ; ALVES, C. N. . A QM/MM and Molecular Dynamics Simulation of Wild-Type and two mutants of 5-enolpyruvylshikimate 3-phosphate synthase. In: III Congresso Brasileiro de Biotecnologia, 2010, Fortaleza, CE. III Congresso Brasileiro de Biotecnologia, 2010.

• DOS SANTOS, ALBERTO M. ; VARELA JUNIOR, J. J. G. ; SOEIRO, Y. R. M. S. . Estudo Molecular da Proteína G9a: uma abordagem a nível computacional. 2021. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• DOS SANTOS, ALBERTO M. ; VARELA JUNIOR, J. J. G. ; SOEIRO, Y. R. M. S. . Estudo Computacional da clivagem da proteína Spike do vírus SARS-Cov2. 2021. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• SANTOS, A. M. . Bioinformática Estrutural de proteínas: Modelos e aplicações biotecnológicas. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• LEAL, M. C. ; PANTOJA, R. P. ; FERREIRA, D. T. ; SANTOS, A. M. ; MORAES, G. L. . Redução da Inclusão Digital por Meio do Acesso a Computadores em Laboratórios Escolares em Breves. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SANTOS, V. F. ; PANTOJA, R. P. ; FERREIRA, A. A. ; Balieiro, M. O. ; LEAL, M. C. ; DOS SANTOS, ALBERTO M. ; Costa de Freitas, M.C. ; MORAES, G. L. . LABORATÓRIOS DE INFORMÁTICA EM ESCOLAS PÚBLICAS DE ENSINO FUNDAMENTAL (6o AO 9o ANO) E ENSINO MÉDIO EM BREVES-ILHA DO MARAJÓ. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• COSTA, K. ; SANTOS, A. M. ; ALENCAR, N. A. N. ; LEAL, E. S. ; ALVES, C. N. ; LIMA, A. H. ; LAMEIRA, J. . Molecular dynamic and docking study of virion infectivity factor (HIV-1) with proteins of E3 ubiquitin ligase complex and APOBEC3G. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SANTOS, A. M. ; LIMA, A. H. ; LAMEIRA, J. ; ALVES, C. N. . Theoretical study of mutations Asp313Ala and Glu341Ala of enzyme 5-enolpyruvylshikimate 3-phosphate synthase using methods of QM/MM and Molecular Dynamics. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SANTOS, A. M. ; LIMA, A. H. ; LAMEIRA, J. ; ALVES, C. N. . Study of the catalytic mechanism of the enzyme 5-enolpyruvylshikimate 3-phosphate synthase using methods of molecular dynamics and QM / MM. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SANTOS, A. M. ; LIMA, A. H. ; LAMEIRA, J. S. ; ALVES, C. N. . Estudo da Participação dos Resíduos Glu341 e Lys22 na Etapa de Eliminação do Mecanismo da EPSP sintase através usando métodos QM/MM e Dinâmica Molecular. 2010. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2018 - Atual

  Estudo da resistência multi-droga apresentada por L,D-Transpeptidases: Um fator chave para o entendimento da resistência aos antimicrobianos., Descrição: A simples imagem de bactérias como micro-organismos isolados, planctônicos, onde apenas é destacada sua capacidade de auto-clonagem, foi extinta. As bactérias são agora reconhecidas como micro-organismos de grande variedade e alta adaptação. Evidências convincentes indicam que o número de infecções por micobactérias causadas por ambas as espécies está aumentando em todo o mundo, emergindo a necessidade de novos potentes antibióticos capazes de superar a resistência observada em relação aos antibióticos comerciais. Assim, nesta proposta pretende-se utilizar métodos computacionais e experimentais, para o planejamento, desenvolvimento, síntese e avaliação biológica de compostos (peptídeos) que elucidem o mecanismo de resistência aos antimicrobianos a partir da formação da parede celular bacteriana. Desta forma, levando ao desenvolvimento de promissores protópitos a fármacos contra infecções bacterianas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (8) . , Integrantes: Alberto Monteiro dos Santos - Integrante / Anderson Henrique Lima - Integrante / Cláudio Nahum Alves - Coordenador / Gleiciane Leal Moraes - Integrante / Jerônimo Lameira Silva - Integrante / Paulo Robson Monteiro de Sousa - Integrante / Kaue Santana da Costa - Integrante / José Rogério Silva - Integrante / Carla Carolina Ferreira Meneses - Integrante / Marcos Pires - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2014 - Atual

  SIMULAÇÃO COMPUTACIONAL DE REAÇÕES CATALISADAS POR METILTRANSFERASES, Descrição: Com esta proposta, pretende-se estudar o mecanismo de reação das enzimas catecol-metiltransferase (COMT), fosfoetanolamina metiltransferase (PfPMT) e proteínas lisina metiltransferases (PKMT) usando um tratamento ab initio QM/MM. A COMT é uma enzima metabolizadora de catecolaminas e está relacionada com a Doença de Parkinson. PfPMT é essencial para o crescimento e sobrevivência do parasita Plasmodium falciparum causador da Malária em humanos. Proteínas lisinas metiltransferases (PKMTs) estão envolvidas em eventos epigenéticos, em que são responsáveis pela metilação do DNA e estão relacionadas com certos tipos de câncer. Estas enzimas apresentam diferentes funções bioquímicas, mas catalisam a transferência do grupo metil usando a S-adenosil metionina (SAM) como co-substrato através de uma reação substituição nucleofílica bimolecular SN2. Com esta Proposta, pretende-se explicar a nível molecular a origem do poder catalítico destas enzimas usando os métodos QM/MM e técnicas de cálculos de energia livre... , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Alberto Monteiro dos Santos - Integrante / Cláudio Nahum Alves - Integrante / Gleiciane Leal Moraes - Integrante / Jerônimo Lameira Silva - Coordenador / Paulo Robson Monteiro de Sousa - Integrante / LIMA, ANDERSON H. - Integrante / arie warshel - Integrante / José Rogério Silva - Integrante / Natalia de Farias Silva - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2013 - 2014

  Desenho de peptídeos como potenciais inibidores da enzima MurA, Descrição: Este projeto tem como objetivo a realização de modelagem e docking molecular de peptídeos que possam atuar como inibidores da enzima UDP-N-acetilglucosamina enolpiruvil transferase.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Alberto Monteiro dos Santos - Integrante / Cláudio Nahum Alves - Integrante / Anderson H. Lima - Integrante / Jerônimo Lameir a - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2011 - 2012

  Estudo do estado de protonação dos resíduos do sítio catalítico da enzima 5-enolpiruvilchiquimato 3-fosfato sintase através dos métodos de Dinâmica Molecular e QM/MM., Descrição: Neste projeto propõe-se o estudo, através das metodologias de Dinâmica Molecular e do método híbrido de Mecânica Quântica/Mecânica Molecular, do estado de protonação do sítio catalítico da enzima EPSP sintase envolvendo seu intermediário de reação tetraédrico, o qual é o substrato da segunda etapa da reação. Pretende-se também, realizar cálculos de energia de interação entre o intermediário e a EPSP sintase, com intuito de produzir informações científicas que levem à síntese e ensaios biológicos de novos inibidores teoricamente mais ativos e seletivos. Dessa forma, pretende-se propor estruturas teóricas que podem vir apresentar atividade biológica (caso sejam sintetizadas e testadas experimentalmente) atuando como inibidores, inibindo assim a via do chiquimato e impedindo a síntese de aminoácidos aromáticos e outros compostos aromáticos em diversos organismos patógenos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Alberto Monteiro dos Santos - Coordenador / Anderson Henrique Lima - Integrante / Jerônimo Lameira Silva - Integrante / Cláudio Nahum Alves - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2010 - 2011

  Aplicação dos Métodos de Dinâmica Molecular QM/MM no Estudo do Mecanismo Catalítico da Enzima 5-enolpiruvilchiquimato 3-fostato sintase (EPSPS), Descrição: Neste projeto pretende-se utilizar as metodologias QM/MM e de dinâmica molecular para estudar o mecanismo catalítico da enzima EPSPS, também conhecida como AroA, na adição da porção enolpiruvil do fosfoenolpiruvato ao chiquimato-3-fosfato. Bem como, estudar a interação entre essa enzima e o seu principal inibidor glifosato e outros como análogos do Intermediário de Reação. Pretende-se desta forma identificar os principais tipos de interações que ocorrem entre os resíduos da EPSPS e estes inibidores, desta forma criar um modelo que possa ser utilizado para novos inibidores de diversos organismos patógenos como bactérias, fungos e parasitas apicomplexa, assim como dar uma explicação a nível molecular para o mecanismo de atuação de novos inibidores.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Alberto Monteiro dos Santos - Coordenador / Anderson Henrique Lima - Integrante / Cláudio Nahum Alves - Integrante / Jerônimo Lameir a - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa., Número de produções C, T & A: 2

Prêmios