Rafael Espigolan

Pós-doutorado

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Produções bibliográficas

• VAZ, R. Z. ; CONCEICAO, V. G. D. ; ESPIGOLAN, R. ; DUTRA, M. M. M . Abordagem multivariada de variáveis potencializadoras de contusões em carcaças bovinas. THEMA ET SCIENTIA , v. 14, p. 261-274, 2025.

• MARINHO DE NEGREIROS, MARIA PAULA ; AMORIM, SABRINA THAISE ; LÔBO, RAYSILDO BARBOSA ; BRUNES, LUDMILLA COSTA ; MAGNABOSCO, CLAUDIO ULHOA ; BERGMANN, JOSÉ AURÉLIO GARCIA ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; CRAVO PEREIRA, ANGELICA SIMONE ; BALDI, FERNANDO . Genetic correlation estimates between calving ease in primiparous cows and economically important traits in Nellore cattle. Journal of Animal Breeding and Genetics , v. 00, p. 1-12, 2024.

• ESTEVAM, DANIELA D. ; SOUZA, JOHNNY M. ; REY, FERNANDO S. B. ; MARTINS, CYNTIA L. ; STAFUZZA, NEDENIA B. ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; MILLEN, DANILO D. ; ARRIGONI, MARIO D. B. . Identification of genomic regions and pathways associated with traits related to rumen acidosis in feedlot Nellore cattle. Journal of Animal Breeding and Genetics , v. 00, p. 1-18, 2024.

• REIS, HUGO BORGES DOS ; CARVALHO, MINOS ESPERÂNDIO ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; POLETI, MIRELE DAIANA ; AMBRIZI, DEWISON RICARDO ; BERTON, MARIANA PIATTO ; FERRAZ, JOSÉ BENTO STERMAN ; DE MATTOS OLIVEIRA, ELISÂNGELA CHICARONI ; ELER, JOANIR PEREIRA . Genome-Wide Association (GWAS) Applied to Carcass and Meat Traits of Nellore Cattle. METABOLITES , v. 14, p. 6, 2024.

• BIS, F. C. ; SANCHES, A. C. ; ESPIGOLAN, R. ; RIBEIRO, B. C. G. ; FABRICIO, E. C. ; BRUNES, L. C. ; SILVA, S. L. ; FERRAZ, J. B. S. ; BALDI, F . Impact of the phenotypic and genetic merit of growth, reproduction, and carcass traits on sexual precocity in Nelore heifers using multivariate analysis techniques. GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH , v. 23, p. 1/19273-11, 2024.

• OLIVEIRA, E.C.M. ; MEDEIROS, G.C. ; BALDI, F.S. ; GIACOMINI, G. ; NUÑEZ-DOMINGUEZ, R. ; ELER, J.P. ; ESPIGOLAN, R. ; GAMA, L.T. ; FERRAZ, J.B.S. . Genetic structure of the Montana Beef Composite, a program to increase beef production in tropical and subtropical environment. GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH , v. 23, p. 1/19252-15, 2024.

• SANTOS, CAMILA ALVES DOS ; ELER, JOANIR PEREIRA ; OLIVEIRA, ELISANGELA CHICARONI DE MATTOS ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; GIACOMINI, GABRIELA ; FERRAZ, JOSÉ BENTO STERMAN ; PAIM, TIAGO DO PRADO . Selective signatures in composite MONTANA TROPICAL beef cattle reveal potential genomic regions for tropical adaptation. PLoS One , v. 19, p. e0301937-18, 2024.

• RODRÍGUEZ, JUAN DIEGO ; PERIPOLLI, ELISA ; LONDOÑO-GIL, MARISOL ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; LÔBO, RAYSILDO BARBOSA ; LÓPEZ-CORREA, RODRIGO ; AGUILAR, IGNACIO ; BALDI, FERNANDO . Effect of minor allele frequency and density of single nucleotide polymorphism marker arrays on imputation performance and prediction ability using the single-step genomic Best Linear Unbiased Prediction in a simulated beef cattle population. Animal Production Science , v. 1, p. 1, 2023.

• KAVA, RAFAELA ; PERIPOLLI, ELISA ; BRUNES, LUDMILLA C. ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; MENDES, EGLEU D. M. ; DA SILVA NETO, JOÃO BARBOSA ; LONDOÑO'GIL, MARISOL ; SAINZ, ROBERTO D. ; LOBO, RAYSILDO B. ; BALDI, FERNANDO . Estimates of genetic and phenotypic parameters for feeding behaviour and feed efficiency-related traits in Nelore cattle. JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS , v. 140, p. 264-275, 2023.

• CARVALHO, FELIPE E. ; FERRAZ, JOSÉ BENTO S. ; PEDROSA, VICTOR B. ; MATOS, ELISANGELA C. ; ELER, JOANIR P. ; SILVA, MARCIO R. ; GUIMARÃES, JOSÉ D. ; BUSSIMAN, FERNANDO O. ; SILVA, BARBARA C. A. ; CANÇADO, FERNANDO A. ; MULIM, HENRIQUE A. ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; BRITO, LUIZ F. . Genetic parameters for various semen production and quality traits and indicators of male and female reproductive performance in Nellore cattle. BMC GENOMICS , v. 24, p. 1, 2023.

• LONDOÑO-GIL, MARISOL ; CARDONA-CIFUENTES, DANIEL ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; PERIPOLLI, ELISA ; LÔBO, RAYSILDO B. ; PEREIRA, ANGÉLICA S. C. ; AGUILAR, IGNACIO ; BALDI, FERNANDO . Genomic evaluation of commercial herds with different pedigree structures using the single-step genomic BLUP in Nelore cattle. TROPICAL ANIMAL HEALTH AND PRODUCTION , v. 55, p. 1-9, 2023.

• POLIZEL, GUILHERME HENRIQUE GEBIM ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; FANTINATO-NETO, PAULO ; DE FRANCISCO STREFEZZI, RICARDO ; RANGEL, RAISSA BRAIDO ; DE CARLI, CYNTHIA ; FERNANDES, ARÍCIA CHRISTOFARO ; DIAS, EVANDRO FERNANDO FERREIRA ; CRACCO, ROBERTA CAVALCANTE ; DE ALMEIDA SANTANA, MIGUEL HENRIQUE . Different prenatal supplementation strategies and its impacts on reproductive and nutrigenetics assessments of bulls in finishing phase. VETERINARY RESEARCH COMMUNICATIONS , v. 1, p. 1, 2022.

• RODRIGUES, MARIANA ROCHA ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; FERRAZ, JOSÉ BENTO STERMAN ; BUSSIMAN, FERNANDO OLIVEIRA ; TONIOLLI, RICARDO ; LÔBO, RAYSILDO BARBOSA ; SANTOS, HELCILEIA DIAS ; NEPOMUCENO, LEANDRO LOPES ; FERREIRA, JORGE LUÍS . Genetic parameters and trends of growth traits in Nelore cattle raised in the Northern region of Brazil. BRAZILIAN JOURNAL VETERINARY RES. AND ANIMAL SCIENCE , v. 59, p. E194204, 2022.

• RODRIGUEZ NEIRA, JUAN DIEGO ; PERIPOLLI, ELISA ; DE NEGREIROS, MARIA PAULA MARINHO ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; LÓPEZ-CORREA, RODRIGO ; AGUILAR, IGNACIO ; LOBO, RAYSILDO B. ; BALDI, FERNANDO . Prediction ability for growth and maternal traits using SNP arrays based on different marker densities in Nellore cattle using the ssGBLUP. JOURNAL OF APPLIED GENETICS , v. 63, p. 389-400, 2022.

• NEGREIROS, M. P. ; PERIPOLLI, E. ; ESPIGOLAN, R. ; LONDOÑO-GIL, M. ; RODRIGUEZ, J. D. ; BRUNES, L. ; MAGNABOSCO, C. U. ; GUIMARÃES, N. C. ; SAINZ, R. D. ; PEREIRA, A. S. C. ; LOBO, R. B. ; BALDI, F. . Selection criteria for frame score and its association with growth-, reproductive-, feed efficiency- and carcass-related traits in Nellore cattle. Animal Production Science , v. 62, p. 1551-1562, 2022.

• BRUNES, L.C. ; BALDI, F. ; LOPES, F.B. ; NARCISO, M.G. ; LOBO, R.B. ; ESPIGOLAN, R. ; COSTA, M.F.O. ; MAGNABOSCO, C.U. . Genomic prediction ability for feed efficiency traits using different models and pseudo-phenotypes under several validation strategies in Nelore cattle. Animal , v. 15, p. 100085, 2021.

• BRUNES, L. C. ; BALDI, F. ; LOPES, F. B. ; LOBO, R. B. ; ESPIGOLAN, R. ; COSTA, M. F. O. ; MAGNABOSCO, C. U. . Selection criteria for feed efficiency-related traits and their association with growth, reproductive and carcass traits in Nelore cattle. Animal Production Science , v. 1, p. 1-10, 2021.

• SILVA, ROSIANE P. ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; BERTON, MARIANA P. ; LÔBO, RAYSILDO B. ; MAGNABOSCO, CLÁUDIO U. ; PEREIRA, ANGÉLICA S.C. ; BALDI, FERNANDO . Genomic prediction ability for carcass composition indicator traits in Nellore cattle. Livestock Science , v. 245, p. 104421, 2021.

• TONUSSI, RAFAEL LARA ; LONDOÑO-GIL, MARISOL ; DE OLIVEIRA SILVA, RAFAEL MEDEIROS ; MAGALHÃES, ANA FABRÍCIA BRAGA ; AMORIM, SABRINA THAISE ; KLUSKA, SABRINA ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; PERIPOLLI, ELISA ; PEREIRA, ANGELICA SIMONE CRAVO ; LÔBO, RAYSILDO BARBOSA ; AGUILAR, IGNÁCIO ; LOURENÇO, DANIELA ANDRESSA LINO ; BALDI, FERNANDO . Accuracy of genomic breeding values and predictive ability for postweaning liveweight and age at first calving in a Nellore cattle population with missing sire information. TROPICAL ANIMAL HEALTH AND PRODUCTION , v. 53, p. 1-9, 2021.

• ALVES, A. A. C. ; ESPIGOLAN, R. ; BRESOLIN, T. ; COSTA, R. M. ; FERNANDES JÚNIOR, G. A. ; VENTURA, R. V. ; CARVALHEIRO, R. ; ALBUQUERQUE, L. G. . Genome-enabled prediction of reproductive traits in Nellore cattle using parametric models and machine learning methods. ANIMAL GENETICS , v. 52, p. 32-46, 2021.

• FEITOSA, FABIELI LOISE BRAGA ; PEREIRA, ANGÉLICA SIMONE CRAVO ; MUELLER, LENISE FREITAS ; FONSECA, PABLO AUGUSTO DE SOUZA ; BRAZ, CAMILA U. ; AMORIN, SABRINA ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; LEMOS, MARCOS ANTUNES ; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVÃO ; SCHENKEL, FLAVIO SCHRAMM ; BRITO, LUIZ FERNANDO ; STAFUZZA, NEDENIA BONVINO ; BALDI, FERNANDO . Genome-wide association study for beef fatty acid profile using haplotypes in Nellore cattle. Livestock Science , v. 245, p. 104396, 2021.

• CARVALHO, F.E. ; ESPIGOLAN, R. ; BERTON, M.P. ; NETO, J.B.S. ; SILVA, R.P. ; GRIGOLETTO, L. ; SILVA, R.M.O. ; FERRAZ, J.B.S. ; ELER, J.P. ; AGUILAR, I. ; LÔBO, R.B. ; BALDI, F. . Genome-wide association study and predictive ability for growth traits in Nellore cattle. Livestock Science , v. 231, p. 103861, 2020.

• MOTA, L. F. M. ; FERNANDES, G. A. ; HERRERA, A. C. ; SCALEZ, D. C. B. ; ESPIGOLAN, R. ; MAGALHÃES, A. F. B. ; CARVALHEIRO, R. ; BALDI, F. ; ALBUQUERQUE, L. G. . Genomic reaction norm models exploiting genotype × environment interaction on sexual precocity indicator traits in Nellore cattle. Animal Genetics , v. 51, p. 210-223, 2020.

• BRUNES, LUDMILLA C. ; BALDI, FERNANDO ; LOPES, FERNANDO B. ; LÔBO, RAYSILDO B. ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; COSTA, MARCOS F. O. ; STAFUZZA, NEDENIA B. ; MAGNABOSCO, CLÁUDIO U. . Weighted single-step genome-wide association study and pathway analyses for feed efficiency traits in Nellore cattle. Journal of Animal Breeding and Genetics , v. 00, p. 1-22, 2020.

• SILVA, R.P. ; ESPIGOLAN, R. ; BERTON, M.P. ; STAFUZZA, N.B. ; SANTOS, F.S. ; NEGREIROS, M.P. ; SCHUCHMANN, R.K. ; RODRIGUEZ, J.D. ; LÔBO, R.B. ; Banchero, G. ; PEREIRA, A.S.C. ; BERGMANN, J.A.G. ; BALDI, F. . Genetic parameters and genomic regions associated with calving ease in primiparous Nellore heifers. Livestock Science , v. 240, p. 104183, 2020.

• DA SILVA NETO, JOÃO BARBOSA ; PERIPOLLI, ELISA ; DA COSTA E SILVA, ELIANE VIANNA ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; NEIRA, JUAN DIEGO RODRÍGUEZ ; SCHETTINI, GUSTAVO ; DA COSTA FILHO, LUIZ CARLOS CESAR ; BARBOSA, FERNANDA BATTISTOTTI ; MACEDO, GUSTAVO GUERINO ; COSTA-BRUNES, LUDMILLA ; LOBO, RAYSILDO B. ; PEREIRA, ANGELICA SIMONE CRAVO ; BALDI, FERNANDO . Genetic correlation estimates between age at puberty and growth, reproductive, and carcass traits in young Nelore bulls. Livestock Science , v. 241, p. 104266, 2020.

• ESPIGOLAN, RAFAEL ; DA COSTA, REBEKA MAGALHÃES ; CARVALHEIRO, ROBERTO ; RIBEIRO, ANDRÉ MAURIC FROSSARD ; ALVES, ANDERSON ANTONIO CARVALHO ; FERNANDES JÚNIOR, GERARDO ALVES ; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVÃO ; BRESOLIN, TIAGO . Genome-wide prediction for complex traits under the presence of dominance effects in simulated populations using GBLUP and machine learning methods. JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE , v. 98, p. 1-11, 2020.

• BRAZ, CAMILA U. ; TAYLOR, JEREMY F. ; BRESOLIN, TIAGO ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; FEITOSA, FABIELI L. B. ; CARVALHEIRO, ROBERTO ; BALDI, FERNANDO ; DE ALBUQUERQUE, LUCIA G. ; DE OLIVEIRA, HENRIQUE N. . Sliding window haplotype approaches overcome single SNP analysis limitations in identifying genes for meat tenderness in Nelore cattle. BMC GENETICS , v. 20, p. 2-12, 2019.

• CARREÑO, LUIS ORLANDO DUITAMA ; DA CONCEIÇÃO PESSOA, MATILDE ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; TAKADA, LUCIANA ; BRESOLIN, TIAGO ; CAVANI, LIGIA ; BALDI, FERNANDO ; CARVALHEIRO, ROBERTO ; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVÃO ; DA FONSECA, RICARDO . Genome Association Study for Visual Scores in Nellore Cattle Measured at Weaning. BMC GENOMICS , v. 20, p. 1-9, 2019.

• FEITOSA, FABIELI LOISE BRAGA ; PEREIRA, ANGÉLICA SIMONE CRAVO ; AMORIM, SABRINA THAISE ; PERIPOLLI, ELISA ; SILVA, RAFAEL MEDEIROS DE OLIVEIRA ; BRAZ, CAMILA URBANO ; FERRINHO, ADRIELLE MATIAS ; SCHENKEL, FLAVIO SCHRAMM ; BRITO, LUIZ FERNANDO ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; ALBUQUERQUE, LUCIA GALVÃO ; BALDI, FERNANDO . Comparison between haplotype-based and individual snp-based genomic predictions for beef fatty acid profile in Nelore cattle. Journal of Animal Breeding and Genetics , v. 00, p. 1-9, 2019.

• SANT?ANNA, ALINE CRISTINA ; VALENTE, TIAGO DA SILVA ; MAGALHÃES, ANA FABRÍCIA BRAGA ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; CEBALLOS, MARIA CAMILA ; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVÃO ; PARANHOS DA COSTA, MATEUS JOSÉ RODRIGUES . Relationships between temperament, meat quality, and carcass traits in Nellore cattle1. JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE , v. 97, p. 4721-4731, 2019.

• MAGALHÃES, ANA FABRÍCIA BRAGA ; SCHENKEL, FLAVIO SCHRAMM ; GARCIA, DIOGO ANASTÁCIO ; GORDO, DANIEL GUSTAVO MANSAN ; TONUSSI, RAFAEL LARA ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; SILVA, RAFAEL MEDEIROS DE OLIVEIRA ; BRAZ, CAMILA URBANO ; FERNANDES JÚNIOR, GERARDO ALVES ; BALDI, FERNANDO ; CARVALHEIRO, ROBERTO ; BOLIGON, ARIONE AUGUSTI ; DE OLIVEIRA, HENRIQUE NUNES ; CHARDULO, LUIS ARTHUR LOYOLA ; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVÃO . Genomic selection for meat quality traits in Nelore cattle. MEAT SCIENCE , v. 148, p. 32-37, 2019.

• GORDO, DANIEL GUSTAVO M ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; BRESOLIN, TIAGO ; FERNANDES JÚNIOR, GERARDO A ; MAGALHÃES, ANA F B ; BRAZ, CAMILA U ; FERNANDES, WILLIAN BRUNO ; BALDI, FERNANDO ; ALBUQUERQUE, LUCIA G . Genetic analysis of carcass and meat quality traits in Nelore cattle1. JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE , v. 96, p. 3558-3564, 2018.

• BRAZ, CAMILA URBANO ; TAYLOR, JEREMY FRANCIS ; DECKER, JARED EGAN ; BRESOLIN, TIAGO ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; GARCIA, DIOGO ANASTÁCIO ; GORDO, DANIEL GUSTAVO MANSAN ; MAGALHÃES, ANA FABRÍCIA BRAGA ; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVÃO ; DE OLIVEIRA, HENRIQUE NUNES . Polymorphism analysis in genes associated with meat tenderness in Nelore cattle. META GENE , v. 18, p. 73-78, 2018.

• CHIAIA, HERMENEGILDO LUCAS JUSTINO ; PERIPOLLI, E. ; DE OLIVEIRA SILVA, RAFAEL MEDEIROS ; FEITOSA, FABIELE LOISE BRAGA ; DE LEMOS, MARCOS VINÍCIUS ANTUNES ; BERTON, MARIANA PIATTO ; OLIVIERI, BIANCA FERREIRA ; ESPIGOLAN, R. ; TONUSSI, RAFAEL LARA ; GORDO, DANIEL GUSTAVO MANSAN ; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVÃO ; DE OLIVEIRA, HENRIQUE NUNES ; FERRINHO, ADRIELLE MATHIAS ; MUELLER, LENISE FREITAS ; KLUSKA, SABRINA ; TONHATI, HUMBERTO ; PEREIRA, ANGÉLICA SIMONE CRAVO ; AGUILAR, IGNACIO ; BALDI, FERNANDO . Genomic prediction ability for beef fatty acid profile in Nelore cattle using different pseudo-phenotypes. JOURNAL OF APPLIED GENETICS , v. 59, p. 493-501, 2018.

• CHIAIA, HERMENEGILDO LUCAS JUSTINO ; PERIPOLI, ELISA ; DE OLIVEIRA SILVA, RAFAEL MEDEIROS ; ABOUJAOUDE, CAROLYN ; FEITOSA, FABIELE LOISE BRAGA ; DE LEMOS, MARCOS VINICIUS ANTUNES ; BERTON, MARIANA PIATTO ; OLIVIERI, BIANCA FERREIRA ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; TONUSSI, RAFAEL LARA ; GORDO, DANIEL GUSTAVO MANSAN ; BRESOLIN, TIAGO ; MAGALHÃES, ANA FABRÍCIA BRAGA ; JÚNIOR, GERARDO ALVES FERNANDES ; DE ALBUQUERQUE, LÚCIA GALVÃO ; DE OLIVEIRA, HENRIQUE NUNES ; DE JESUS MANGINI FURLAN, JOYCE ; FERRINHO, ADRIELLE MATHIAS ; MUELLER, LENISE FREITAS ; TONHATI, HUMBERTO ; et.al . Genomic prediction for beef fatty acid profile in Nellore cattle. Meat Science , v. 128, p. 60-67, 2017.

• BRESOLIN, TIAGO ; ROSA, GUILHERME JORD'O DE MAGALH'ES ; VALENTE, BRUNO DOURADO ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; GORDO, DANIEL GUSTAVO MANSAN ; BRAZ, CAMILA URBANO ; FERNANDES, GERARDO ALVES ; MAGALH'ES, ANA FABR'CIA BRAGA ; GARCIA, DIOGO ANASTACIO ; FREZARIM, GABRIELA BONF' ; LE'O, GUILHERME FONSECA CARNEIRO ; CARVALHEIRO, ROBERTO ; BALDI, FERNANDO ; NUNES DE OLIVEIRA, HENRIQUE ; GALV'O DE ALBUQUERQUE, LUCIA . Effect of quality control, density and allele frequency of markers on the accuracy of genomic prediction for complex traits in Nellore cattle. Animal Production Science , v. 58, p. 1-7, 2017.

• TONUSSI, RAFAEL LARA ; SILVA, RAFAEL MEDEIROS DE OLIVEIRA ; MAGALHÃES, ANA FABRÍCIA BRAGA ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; PERIPOLLI, ELISA ; OLIVIERI, BIANCA FERREIRA ; FEITOSA, FABIELI LOISE BRAGA ; LEMOS, MARCOS VINICÍUS ANTUNES ; BERTON, MARIANA PIATTO ; CHIAIA, HERMENEGILDO LUCAS JUSTINO ; PEREIRA, ANGELICA SIMONE CRAVO ; LÔBO, RAYSILDO BARBOSA ; BEZERRA, LUIZ ANTÔNIO FRAMARTINO ; MAGNABOSCO, CLÁUDIO DE ULHOA ; LOURENÇO, DANIELA ANDRESSA LINO ; AGUILAR, IGNÁCIO ; BALDI, FERNANDO . Application of single step genomic BLUP under different uncertain paternity scenarios using simulated data. PLoS One , v. 12, p. e0181752, 2017.

• FERNANDES JÚNIOR, GERARDO A. ; ROSA, GUILHERME J. M. ; VALENTE, BRUNO D. ; CARVALHEIRO, ROBERTO ; BALDI, FERNANDO ; GARCIA, DIOGO A. ; GORDO, DANIEL G. M. ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; TAKADA, LUCIANA ; TONUSSI, RAFAEL L. ; DE ANDRADE, WILLIAN B. F. ; MAGALHÃES, ANA F. B. ; CHARDULO, LUIS A. L. ; TONHATI, HUMBERTO ; DE ALBUQUERQUE, LUCIA G. . Genomic prediction of breeding values for carcass traits in Nellore cattle. Genetics Selection Evolution , v. 48, p. 1-8, 2016.

• DIAS, VICTOR AUGUSTO DOMINGOS ; CURI, ROGÉRIO ABDALLAH ; PEREIRA, GUILHERME LUIS ; MALHEIROS, JÉSSICA MORAES ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; ALBUQUERQUE, LÚCIA GALVÃO DE ; CHARDULO, LUIS ARTUR LOYOLA ; OLIVEIRA, HENRIQUE NUNES DE . Frequencies of candidate genes and associations with carcass and meat traits in Nellore and crossbred cattle. Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online) , v. 51, p. 169-176, 2016.

• BALDASSINI, W. A. ; CHARDULO, L. A. L. ; SILVA, J. A. V. ; MALHEIROS, J. M. ; DIAS, V. A. D. ; ESPIGOLAN, R. ; BALDI, F. S. ; ALBUQUERQUE, L. G. ; FERNANDES, T. T. ; PADILHA, P. M. . Meat quality traits of Nellore bulls according to different degrees of backfat thickness: a multivariate approach. Animal Production Science (Print) , v. 57, p. X-XX, 2016.

• LEMOS, MARCOS V. A. ; CHIAIA, HERMENEGILDO LUCAS JUSTINO ; BERTON, MARIANA PIATTO ; FEITOSA, FABIELI L. B. ; ABOUJAOUD, CAROLYN ; CAMARGO, GREGÓRIO M. F. ; PEREIRA, ANGÉLICA S. C. ; ALBUQUERQUE, LUCIA G. ; FERRINHO, ADRIELLE M. ; MUELLER, LENISE F. ; MAZALLI, MONICA R. ; FURLAN, JOYCE J. M. ; CARVALHEIRO, ROBERTO ; GORDO, DANIEL M. ; TONUSSI, RAFAEL ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; SILVA, RAFAEL MEDEIROS DE OLIVEIRA ; DE OLIVEIRA, HENRIQUE NUNES ; DUCKETT, SUSAN ; AGUILAR, IGNACIO ; et.al . Genome-wide association between single nucleotide polymorphisms with beef fatty acid profile in Nellore cattle using the single step procedure. BMC Genomics , v. 17, p. 1-X, 2016.

• GORDO, D. G. M. ; ESPIGOLAN, R. ; TONUSSI, R. L. ; JÚNIOR, G.A.F. ; BRESOLIN, T. ; MAGALHÃES, A. F. BRAGA ; FEITOSA, F. L. ; BALDI, F. ; CARVALHEIRO, R. ; TONHATI, H. ; DE OLIVEIRA, H. N. ; CHARDULO, L. A. L. ; DE ALBUQUERQUE, L. G. . Genetic parameter estimates for carcass traits and visual scores including or not genomic information. Journal of Animal Science , v. 94, p. 1821-1826, 2016.

• MAGALHÃES, ANA F. B. ; DE CAMARGO, GREGÓRIO M. F. ; FERNANDES, GERARDO A. ; GORDO, DANIEL G. M. ; TONUSSI, RAFAEL L. ; COSTA, RAPHAEL B. ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; SILVA, RAFAEL M. DE O. ; BRESOLIN, TIAGO ; DE ANDRADE, WILLIAN B. F. ; TAKADA, LUCIANA ; FEITOSA, FABIELI L. B. ; BALDI, FERNANDO ; CARVALHEIRO, ROBERTO ; CHARDULO, LUIS A. L. ; DE ALBUQUERQUE, LUCIA G. . Genome-Wide Association Study of Meat Quality Traits in Nellore Cattle. Plos One , v. 11, p. e0157845, 2016.

• FEITOSA, FABIELI LOISE BRAGA ; OLIVIERI, BIANCA FERREIRA ; ABOUJAOUDE, CAROLYN ; PEREIRA, ANGÉLICA SIMONE CRAVO ; DE LEMOS, MARCOS VINICIUS ANTUNES ; CHIAIA, HERMENEGILDO LUCAS JUSTINO ; BERTON, MARIANA PIATTO ; PERIPOLLI, ELISA ; FERRINHO, ADRIELLE MATIAS ; MUELLER, LENISE FREITAS ; MAZALLI, MÔNICA ROBERTA ; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVÃO ; DE OLIVEIRA, HENRIQUE NUNES ; TONHATI, HUMBERTO ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; TONUSSI, RAFAEL LARA ; DE OLIVEIRA SILVA, RAFAEL MEDEIROS ; GORDO, DANIEL GUSTAVO MANSAN ; MAGALHÃES, ANA FABRÍCIA BRAGA ; AGUILAR, IGNACIO ; et.al . Genetic correlation estimates between beef fatty acid profile with meat and carcass traits in Nellore cattle finished in feedlot. Journal of Applied Genetics , v. 58, p. 1-10, 2016.

• BERTON, MARIANA P. ; FONSECA, LARISSA F. S. ; GIMENEZ, DANIELA F. J. ; UTEMBERGUE, BRUNO L. ; CESAR, ALINE S. M. ; COUTINHO, LUIZ L. ; DE LEMOS, MARCOS VINICIUS A. ; ABOUJAOUDE, CAROLYN ; PEREIRA, ANGÉLICA S. C. ; SILVA, RAFAEL M. DE O ; STAFUZZA, NEDENIA B. ; FEITOSA, FABIELI L. B. ; CHIAIA, HERMENEGILDO L. J. ; OLIVIERI, BIANCA F. ; PERIPOLLI, ELISA ; TONUSSI, RAFAEL L. ; GORDO, DANIEL M. ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; FERRINHO, ADRIELLE M. ; MUELLER, LENISE F. ; et.al . Gene expression profile of intramuscular muscle in Nellore cattle with extreme values of fatty acid. BMC Genomics , v. 17, p. 1-16, 2016.

• ABOUJAOUDE, CAROLYN ; PEREIRA, ANG'LICA SIMONE CRAVO ; FEITOSA, FABIELI LOUISE BRAGA ; ANTUNES DE LEMOS, MARCOS VINICIUS ; CHIAIA, HERMENEGILDO LUCAS JUSTINO ; PIATTO BERTON, MARIANA ; PERIPOLLI, ELISA ; SILVA, RAFAEL MEDEIROS DE OLIVEIRA ; FERRINHO, ADRIELLE MATHIAS ; MUELLER, LENISE FREITAS ; OLIVIERI, BIANCA FERREIRA ; GALV'O DE ALBUQUERQUE, LUCIA ; NUNES DE OLIVEIRA, HENRIQUE ; TONHATI, HUMBERTO ; ESPIGOLAN, RAFAEL ; TONUSSI, RAFAEL ; GORDO, DANIEL MANSAN ; MAGALHAES, ANA FABRICIA BRAGA ; BALDI, FERNANDO . Genetic parameters for fatty acids in intramuscular fat from feedlot-finished Nelore carcasses. Animal Production Science (Print) , v. 1, p. 1-10, 2016.

• JÚNIOR, G. A. FERNANDES ; COSTA, R. B. ; DE CAMARGO, G. M. F. ; CARVALHEIRO, R. ; ROSA, G. J. M. ; BALDI, F. ; GARCIA, D. A. ; GORDO, D. G. M. ; ESPIGOLAN, R. ; TAKADA, L. ; MAGALHÃES, A. F. B. ; BRESOLIN, T. ; FEITOSA, F. L. B. ; CHARDULO, L. A. L. ; DE OLIVEIRA, H. N. ; DE ALBUQUERQUE, L. G. . Genome scan for postmortem carcass traits in Nellore cattle1. JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE , v. 94, p. 4087-4095, 2016.

• ESPIGOLAN, R. ; BALDI, F. ; BOLIGON, A.A. ; SOUZA, F.R.P. ; FERNANDES JÚNIOR, G.A. ; GORDO, D.G.M. ; VENTURINI, G.C. ; DE CAMARGO, G.M.F. ; FEITOSA, F.L.B. ; GARCIA, D.A. ; TONHATI, H. ; CHARDULO, L.A.L. ; OLIVEIRA, H.N. ; ALBUQUERQUE, L.G. . Associations between single nucleotide polymorphisms and carcass traits in Nellore cattle using high-density panels. Genetics and Molecular Research , v. 14, p. 11133-11144, 2015.

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Projetos de pesquisa

• 2024 - Atual

  Impacto da inclusão da informação genômica nas avaliações genéticas de bovinos compostos Montana Tropical (Processo FAPERGS 24/2551-0000679-6), Descrição: O Projeto de Pesquisa tem o objetivo de avaliar os impactos da inclusão da informação genômica na avaliação genética de bovinos compostos Montana Tropical para as características de importância econômica relacionadas ao crescimento, reprodução, carcaça e qualidade da carne. O banco de dados será compartilhado pelo Grupo de Melhoramento Animal e Biotecnologia da Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos da Universidade de São Paulo (FZEA/USP, Campus de Pirassununga, São Paulo, Brasil). Os conjuntos de dados disponíveis para as análises incluem registros de fenótipos de 405.624 animais, nascidos entre 1994 e 2023, criados em 58 fazendas distribuídas nos estados brasileiros de São Paulo, Minas Gerais, Goiás, Mato Grosso do Sul, Pará, Rio Grande do Sul e também no Paraguai e no Uruguai. O arquivo de pedigree contém 635.963 indivíduos, dos quais 4.013 são touros e 282.993 são matrizes. As características estudadas serão: peso ao nascer, peso à desmama, peso ao sobreano, ganho de peso pós-desmama, idade ao primeiro parto, probabilidade de prenhez aos 14 meses de idade, longevidade (stayability), perímetro escrotal, área de olho de lombo, espessura de gordura subcutânea e marmoreio. Na execução do Projeto, um total de, aproximadamente, 3.911 animais genotipados utilizando o painel GeneSeek Genomic Profiler Bovine 50K contendo 54.791 marcadores do tipos SNP (single nucleotide polymorphisms), será disponibilizado pela Associação Internacional de Criadores de Montana. Os procedimentos para obtenção das estimativas dos componentes de variância e da herdabilidade utilizarão o algoritmo AI-REML (average-information restricted maximum likelihood). Os valores genéticos considerando a informação genômica serão preditos por meio dos programas inclusos no pacote BLUPF90, aplicando a metodologia do ssGBLUP (single-step Genomic Best Linear Unbiased Prediction). É importante destacar que, as características de crescimento, reprodução, carcaça e qualidade da carne, utilizadas como critérios de seleção para o Montana, possuem grande relevância econômica na bovinocultura de corte. Desse modo, os resultados gerados no desenvolvimento do Projeto de Pesquisa permitirão avaliar qual o impacto das informações genômicas incorporadas na avaliação genética (genômica) do programa de melhoramento genético do composto Montana Tropical. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Espigolan - Coordenador / Joanir Pereira Eler - Integrante / Ricardo Zambarda Vaz - Integrante / Elson Martins Coelho - Integrante / João Pedro Velho - Integrante.

• 2019 - 2022

  Genomic information for genetic evaluation and mating design in commercial Nellore cattle populations (Processo FAPESP 2018/18921-9), Descrição: The objective of this project is to evaluate the application of Best Linear Unbiased Predictor (BLUP) and single step Genomic Best Linear Unbiased Predictor (ssGBLUP) methods using scenarios with different proportions of genotyped animals with missing pedigree and estimate the inbreeding coefficients for mating designs considering distinct proportions of multiple sires involving a set of simulated data and in a commercial beef cattle population. A commercial beef cattle population (CBCP) will be simulated considering different proportions of young animals with unknown sires and maternal grandsires. In addition, a breeding program population (BPP) with phenotypic records, complete pedigree and genomic information (20 of genotyped animals) will be simulated. The information obtained in this study will be useful to establish genetic linkages with the use of genomic information (matrix G) between the commercial herd and the breeding program population, using information from genotyped young animals. The phenotypes and genotypes data will be simulated using the QMSim version 1.10 software. Ten replicates will be performed considering a trait with heritability equal to 0.34 (in order to simulate the trait weight at 450 days, W450) according to estimates of real data and phenotypic variance of 1.0. A genome with a total length of 2,333cM, 735,293 markers, and 7,000 quantitative trait loci (QTL) will be simulated and it will be assumed that QTLs explain 100 of the genetic variance. All markers will be bi-allelic, mimicking SNPs present in bovine commercial panels. Minor allele frequencies (MAF) will be assumed equal for all markers and QTL alleles. QTL allele effects will be sampled from a gamma distribution with a shape parameter equal to 0.4. To evaluate the BLUP and ssGBLUP methods in a CBCP considering different population structures and genotyping strategies, the A matrix will be created using different proportions of young animals (calves) with unknown sires (25, 50, and 75) and maternal grandsires (0, 25, 50, and 100). In this population, calves belonging to the last three generation will be genotyped in a proportion of 25, 50, 75, and 100. For the real data, data from Nellore cattle belonging to farms, which participates in the Nellore Brazil breeding program, will be used. For the W450 analysis, a database containing approximately 90,000 records and 15,000 genotyped animals will be used. Genotypic and phenotypic records will be used to evaluate the same scenarios as those proposed for the simulated data. The accuracies and bias will be calculated in each simulated and real scenario. The inbreeding coefficient based on the pedigree (FPED) and genotype (FGRM and FROH) data will be estimated and evaluated using different mating designs. The information obtained in this study will be useful to evaluate and design strategies regarding the impact of the genomic information upon genetic evaluations under different scenarios in CBCP, identifying more accurately genetically superior animals. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Espigolan - Integrante / Fernando Baldi - Integrante / Joanir Pereira Eler - Coordenador.

• 2017 - 2018

  Estudo de associação genômica ampla entre polimorfismos de base única com características de qualidade de carne em bovinos da raça Nelore utilizando abordagem semi-paramétrica (Processo CNPq 150382/2017-0), Descrição: A produção de gado de corte em regiões tropicais e subtropicais é predominantemente baseada em raças Bos indicus e suas cruzas com Bos taurus. Mesmo as raças zebuínas apresentando maiores vantagens adaptativas às condições tropicais em comparação com as raças taurinas, elas têm algumas limitações relacionadas à produtividade e a qualidade de carne. Embora o Brasil produza e exporte grandes quantidades de carne, pouco tem sido feito em relação ao melhoramento genético de características relacionadas à qualidade da carne, já que as mesmas não têm sido consideradas nos programas de avaliação genética para gado de corte no Brasil, por serem de mensuração difícil e alto custo, exigindo o abate dos animais. Uma alternativa para inclusão destas medidas em programas de melhoramento é o uso dos SNPs em estudos de associação genômica. Entretanto, são raros os trabalhos que exploram uma abordagem semi-paramétrica em um estudo de associação genômica ampla com dados de carcaça e carne de animais zebuínos. Assim, no presente projeto é proposto o estudo da associação de polimorfismos de base única (marcadores do tipo SNP) com as características de carcaça e qualidade da carne no genoma bovino, bem como estimar os efeitos destes marcadores sobre estas características, utilizando, para isso, um modelo de passo único (ssGWAS) com abordagem semi-paramétrica. Posteriormente, serão realizadas prospecções gênicas para descrever a função biológica das regiões genômicas associadas aos dados de carcaça e qualidade da carne de animais da raça Nelore. Diante do exposto, torna-se necessário examinar de forma mais minuciosa o potencial da metodologia semi-paramétrica e com os resultados espera-se obter informações para melhor entender a arquitetura genética dessas características. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Espigolan - Coordenador / Fernando Baldi - Integrante / Lucia G. Albuquerque - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2015 - 2016

  Implementation of kernel regressions in the single step model (ssGBLUP) to predict genomic breeding values of productive importance traits in Nelore cattle (Processo FAPESP 2015/13084-3), Descrição: A large amount of genomic data is now available for the identification and selection of genetically superior individuals with the potential to increase the accuracy of prediction of genetic values and thus the efficiency of animal breeding programs. Thus, several statistical methods have been proposed for use in genomic data. Although many studies are being conducted, the number of studies determining the predictive ability with parametric and semi-parametric statistical models with a set of real genomic data is very limited. Thus, in the proposed project, the predictive ability of genomic values of the parametric models BLUP (Best Linear Unbiased Predictor), GBLUP (Genomic Best Linear Unbiased Predictor), ssGBLUP (Single Step Genomic Best Linear Unbiased Predictor), and the semi-parametric approach of RKHS (Reproducing Kernel Hilbert Spaces regression) will be studied using a set of genomic data of Nelore cattle for meat quality, carcass and growth traits. With the results, is expected to have important and relevant information in the genetic evaluation of commercial cattle populations. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Espigolan - Coordenador / Lucia Galvão de Albuquerque - Integrante / Fernando Baldi - Integrante / Ignacio Aguilar - Integrante.

• 2013 - 2017

  Parametric and semi-parametric models for predicting genomic breeding values of complex traits in Nelore cattle (Processo FAPESP 2014/00779-0), Descrição: Uma grande quantidade de dados genômicos está agora disponível para identificação e seleção de indivíduos geneticamente superiores, com potencial para aumentar a acurácia da predição dos valores genéticos e com isso a eficiência dos programas de melhoramento genético animal. Dessa forma, diversos métodos estatísticos têm sido propostos para aplicação em dados genômicos. Apesar de vários estudos estarem sendo realizados, ainda é muito limitado o número de trabalhos determinando a habilidade de predição com modelos estatísticos paramétricos e semi-paramétricos com um conjunto de dados genômico reais. Assim, no projeto proposto, a habilidade de predição de valores genômicos dos modelos paramétricos BLUP (Best Linear Unbiased Predictor), ssGBLUP (Single Step Genomic Best Linear Unbiased Predictor), BayesianLasso e o modelo semi-paramétrico RKHS (Reproducing Kernel Hilbert Spaces regression) serão estudadas utilizando um conjunto de dados genômicos reais e simulados, para as características de crescimento, reprodutivas e de carcaça e carne em animais da raça Nelore. Com os resultados, espera-se obter informações importantes e aplicáveis na avaliação genética de populações comerciais de bovinos. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Espigolan - Coordenador / Lucia Galvão de Albuquerque - Integrante / Fernando Baldi - Integrante / Daniel Gustavo Mansan Gordo - Integrante / Gerardo Alves Fernandes Júnior - Integrante.

• 2012 - 2016

  Study of the genetic variability of meat fatty acid profile in Nelore cattle finished in feedlot (Processo FAPESP 2011/21241-0), Descrição: Among the attributes of beef meat, the fatty acid profile is important because it affects not only the meat palatability, but also the human health. In recent years, fatty acids harmful to human health have received considerable attention. Several studies, working with taurine breeds, showed that there is genetic variability for meat fatty acid profile and, therefore the possibility of genetic improvement of fatty acid composition in beef cattle. Moreover, the results of these studies showed favorable genetic correlations estimates between fatty acids. However, genetic parameter estimates for fatty acid profile in zebu cattle are scarce. The meat fatty acid profile is difficult and costly to measure. For this type of trait is indicated the application of genomic selection, which is a type of marker-assisted selection. Despite the major advances in genetic molecular techniques that allow the genotyping of hundreds of animals in less time and in an automated fashion, there are still being developed methodologies that allow the incorporation of genomic information in animal breeding programs. The objective of this project is to study the genetic variability of meat fatty acid profile in Nelore cattle finished in feedlot conditions, and implement models and methods that use genomic information to improve the fatty acid composition of beef meat. To attain this objective we propose the following specific objectives: 1) Study and characterize the profile of meat fatty acids of Nelore cattle finished in feedlot 2) Estimate genetic parameters for meat fatty acid composition in Nelore cattle finished in feedlot 3) Implement genome wide association studies between single nucleotide polymorphisms markers (SNPs) with meat fatty acid composition 4) Predict the genomic breeding values for meat fatty acid profile considering different models 5) Verified the expression patterns of genes involved in lipid metabolism and fatty acid synthesis 6) Study the influence of polymorphisms. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Espigolan - Integrante / Lucia Galvão de Albuquerque - Integrante / Fernando Baldi - Coordenador / Arione Augusti Boligon - Integrante / Luis Artur Loyola Chardulo - Integrante / Daniel Gustavo Mansan Gordo - Integrante / Rafael Lara Tonussi - Integrante / Roberto Carvalheiro - Integrante / Henrique Nunes de Oliveira - Integrante / Humberto Tonhati - Integrante / Angélica Simone Cravo Pereira - Integrante / Diogo Anastácio Garcia - Integrante / Fabio Ricardo Pablos de Souza - Integrante / Natália Irano - Integrante / Guilherme Jordão de Magalhães Rosa - Integrante / Rusbel Raul Aspilcueta-Borquis - Integrante / Luis Felipe Prada da Silva - Integrante / Francisco Palma Rennó - Integrante / Gerardo Alves Fernandes Júnior - Integrante / Juliane Diniz Magalhães - Integrante / Roberta Carrilho Canesin - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2017

  Ferramentas genômicas no melhoramento genético de características de importância econômica direta em bovinos da raça Nelore (Processo FAPESP 2009/16118-5), Descrição: Os importantes avanços nas técnicas de genética molecular, com o desenvolvimento de um painel de marcadores de polimorfismos de base única (SNP´s) de alta densidade, permitirão ganhos genéticos significativos, sobretudo em características de alto custo e de difícil mensuração, como é o caso das características de carcaça e carne bem como da eficiência de conversão alimentar. Cabe ressaltar que os efeitos dos SNPs são estimados e Procura-se com este projeto criar um banco de dados de características de qualidade de carcaça e carne e de eficiência alimentar, bem como utilizar uma base de dados de características de importância econômica que, normalmente, são contempladas em programas de melhoramento genético de gado de corte, como as características de crescimento e reprodutivas, para a detecção de polimorfismos de DNA associados a estas características e desenvolvimento de métodos e softwares visando seleção genômica. Para alcançar este objetivo serão desenvolvidos os seguintes tópicos no projeto: a) Análise genética quantitativa de características de carcaça, carne e eficiência alimentar e suas associações com outras características de importância econômica. b) Estudo de associação de polimorfismos de base única (SNP) com características de importância econômica em bovinos da raça Nelore c) Estudo da expressão de genes associados às características da qualidade de carne e eficiência alimentar. d) Desenvolvimento e implementação de algoritmos para simulação de informações moleculares e avaliação genética utilizando marcadores SNPs. e) Seleção genômica para características de carcaça e carne e eficiência alimentar em bovinos da raça Nelore. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Espigolan - Integrante / Lucia Galvão de Albuquerque - Coordenador / Fernando Baldi - Integrante / Arione Augusti Boligon - Integrante / Luis Artur Loyola Chardulo - Integrante / Daniel Gustavo Mansan Gordo - Integrante / Rafael Lara Tonussi - Integrante / Ana Fabrícia Braga Magalhães - Integrante / Henrique Nunes de Oliveira - Integrante / Humberto Tonhati - Integrante / Fabio Ricardo Pablos de Souza - Integrante / Guilherme Jordão de Magalhães Rosa - Integrante / Gerardo Alves Fernandes Júnior - Integrante / José Fernando Garcia - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2013

  Implementação de dados genômicos para o melhoramento genético de características da carcaça e da carne em bovinos da raça Nelore (Processo CNPq 475130/2011-1), Descrição: Em bovinos de corte, para características onde é necessário o abate do animal para realizar a avaliação, como características relacionadas a qualidade da carcaça e carne, a seleção tradicional tem sido pouco efetiva, uma vez que para a avaliação de reprodutores, é necessária a adoção de teste de progênie, aumentando o custo operacional e o intervalo de gerações. Atualmente, estão disponíveis técnicas para selecionar animais com base nos valores genômicos preditos a partir de marcadores de alta densidade espalhados em todo o genoma, possibilitando maiores ganhos genéticos para este tipo de características. O objetivo deste projeto é implementar metodologias para a aplicação da seleção genômica em características relacionadas a qualidade da carcaça e carne em bovinos da raça Nelore terminados em confinamento. Para isso, será utilizada uma população de referência formada por bovinos da raça Nelore com informações genotípicas e registros fenotípicos das características relacionadas a qualidade da carcaça (pesos da carcaça, área de olho de lombo, espessura de gordura subcutânea e índice de marmorização) e da carne (maciez, coloração, pH e gordura química). A população referência será formada por animais provenientes de fazendas que integram o programa de melhoramento genético da Conexão Delta G, que disponibilizará as informações necessárias para análise dos dados. Para a genotipagem dos animais será utilizado um painel com cerca de 777.000 SNPs (High-Density Bovine BeadChip da Illumina). As informações genômicas serão analisadas considerando diferentes metodologias. Uma vez determinada a melhor distribuição para as variâncias e efeitos dos SNPs, será realizada a predição dos valores genômicos. Além disso, as predições genômicas também serão obtidas utilizando um procedimento, em uma única etapa, baseado na modificação do numerador da matriz de parentesco, o que permite a predição de valores genéticos usando todas as informações fenotípicas, de pedigree e genômica. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Espigolan - Integrante / Lucia Galvão de Albuquerque - Integrante / Fernando Baldi - Integrante / Arione Augusti Boligon - Integrante / Luis Artur Loyola Chardulo - Integrante / Daniel Gustavo Mansan Gordo - Integrante / Ana Fabrícia Braga Magalhães - Integrante / Henrique Nunes de Oliveira - Coordenador / Humberto Tonhati - Integrante / Fabio Ricardo Pablos de Souza - Integrante / Gerardo Alves Fernandes Júnior - Integrante / Victor Augusto Domingos Dias - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2013

  Desequilíbrio de ligação e associação entre polimorfismos de base única com maciez da carne e espessura de gordura em bovinos Nelore utilizando painéis de alta densidade (Processo FAPESP 2010/14580-0), Descrição: A carne produzida no Brasil a partir de raças zebuínas possui características organolépticas que não são bem aceitas nos mercados mais exigentes. A falta de uniformidade em idade dos animais ao abate, a falta de cobertura de gordura subcutânea em padrões não desejáveis e a marmorização da carne em quantidades não satisfatórias, têm grande influência na maciez, coloração e palatabilidade do produto final. Apesar de sua relevância, o melhoramento genético para a maciez da carne e espessura de gordura subcutânea não tem sido praticado, especialmente, por estas características serem de expressão tardia, e/ou por exigirem o abate dos animais, ou ainda devido ao custo de mensuração. Nos últimos anos, após o sequenciamento do genoma humano e de várias espécies de animais domésticos, uma quantidade significativa de trabalhos sobre a aplicação de dados genômicos em diversas áreas tem sido publicada no mundo. Atualmente, está disponível uma série de ferramentas que permitem obter informações genômicas, marcadores genéticos do tipo SNP, em larga escala em várias espécies de animais domésticos. A utilização do painel de marcadores de polimorfismos de base única (SNPs) de alta densidade, para avaliação genética, permitirá ganhos genéticos significativos, sobretudo em características de difícil e/ou alto custo de mensuração, como é o caso da maciez da carne e da espessura de gordura subcutânea. Apesar dos grandes avanços nas técnicas de biologia molecular que possibilitam a genotipagem dos animais, ainda estão sendo desenvolvidas as metodologias e modelos que permitam a aplicação dos dados genômicos em programas de melhoramento genético. O presente projeto tem como objetivo geral verificar a associação entre marcadores genéticos (SNPs) com dados de maciez da carne e espessura de gordura subcutânea de aproximadamente 800 bovinos da raça Nelore. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Espigolan - Integrante / Lucia Galvão de Albuquerque - Coordenador / Fernando Baldi - Integrante.

• 2009 - 2013

  Estudo genético quantitativo da qualidade da carcaça e da carne em bovinos da raça Nelore (Processo CNPq 480369/2009-7), Descrição: A carne produzida no Brasil, a partir de raças zebuínas, possui características organolépticas que não são bem aceitas nos mercados mais exigentes. Vários métodos de avaliação visual vêm sendo utilizados nos diferentes programas de avaliação genética, visando o melhoramento da conformação da carcaça, precocidade do acabamento e musculosidade. No Brasil, ainda são escassos os estudos que associem as medidas de escores visuais, tomadas no animal in vivo, com as características da carcaça e, sobretudo com as características da carne medidas no post mortem. O objetivo geral deste projeto é formar uma base de dados de características de carcaça e carne que permita o estudo genético quantitativo das mesmas e suas relações com as características hoje empregadas como critério de seleção em gado de corte, em especial com os escores visuais, visando propor alternativas para o melhoramento genético das mesmas por meio da seleção. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Espigolan - Integrante / Lucia Galvão de Albuquerque - Coordenador / Fernando Baldi - Integrante / Arione Augusti Boligon - Integrante / Luis Artur Loyola Chardulo - Integrante / Daniel Gustavo Mansan Gordo - Integrante / Henrique Nunes de Oliveira - Integrante / Humberto Tonhati - Integrante / Inaê Cristina Regatieri - Integrante / Marcos Jun-Iti Yokoo - Integrante / Eduardo Paulino Castam - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2009 - 2010

  Análise das características de crescimento e carcaça em função da idade em bovinos da raça Hereford utilizando diferentes metodologias de análise (Processo FAPESP 2009/08058-2), Descrição: O objetivo deste projeto é estudar a evolução das características de crescimento e carcaça em função da idade em bovinos da raça Hereford submetidos à diferentes manejos e aplicando várias metodologias de análise. Serão utilizados dados de 240 animais machos da raça Hereford. As características estudadas serão: peso dos animais, altura na cernelha, área de olho de lombo, espessura de gordura e marmoreio, obtidos por ultrasom entre a 12ª e 13ª costela. Os animais serão submetidos a deferentes manejos alimentares desde o desmame até o abate. As medições de peso foram realizadas a cada 15 (+/- 3) dias durante todo o período. As mensurações de ultrasom e altura dos animais foram realizadas a cada 90 dias, desde o desmame até o abate dos animais. As características estudadas serão analisadas por meio de análises com medidas repetidas no tempo considerando diferentes arranjos para o resíduo, serão ajustadas curvas de crescimento utilizando modelos não-lineares (Brody, Gompertz, Logístico e von Bertalanffy), e aplicando modelos de regressão aleatória. Estes modelos permitirão predizer o desempenho dos animais em diferentes situações produtivas, e ajudará à tomada de decisões. Além disso, os resultados deste projeto auxiliarão com informação para um melhor entendimento dos processos de crescimento e deposição de tecidos. Finalmente, este projeto fornecerá modelos de análise para as características da carcaça, prevendo sua possível aplicação em programas de melhoramento genético para bovinos de corte no Brasil. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Espigolan - Integrante / Lucia Galvão de Albuquerque - Coordenador / Fernando Baldi - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.