Fernando Gomes Barcellos

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Produções bibliográficas

• DE ARAÚJO, TALES GUSTAVO FERRETO ; Rodrigues, Elisete Pains ; HUNGRIA, Mariangela ; Barcellos, Fernando Gomes . Soil and climatic conditions determine the rhizobia in association with Phaseolus vulgaris in southern Brazil. BRAZILIAN JOURNAL OF MICROBIOLOGY , v. 1, p. 1, 2025.

• FERREIRA, EVERTON GERALDO CAPOTE ; GOMES, DOUGLAS FABIANO ; DELAI, CAROLINE VANZZO ; BARREIROS, MARCO ANTÔNIO BACELLAR ; GRANGE, LUCIANA ; Rodrigues, Elisete Pains ; HENNING, LILIANE MARCIA MERTZ ; Barcellos, Fernando Gomes ; HUNGRIA, Mariangela . Revealing potential functions of hypothetical proteins induced by genistein in the symbiosis island of Bradyrhizobium japonicum commercial strain SEMIA 5079 (=-CPAC 15). BMC MICROBIOLOGY , v. 22, p. 122, 2022.

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• VOLPINI, A. F. N. ; THOMAZINE, T. ; UMEO, S. H. ; PEREIRA, G. A. ; Colauto, Giani Andrea Linde ; VALLE, J. S. ; Barcellos, Fernando G. ; Colauto, Nelson Barros . Identification and characterization of genes related to cellulolytic activity in basidiomycetes. Genetics and Molecular Research , v. 15, p. 1, 2016.

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• RAMOS, PABLO IVAN ; PICÃO, RENATA C ; ALMEIDA, LUIZ GONZAGA ; LIMA, NICHOLAS COSTA ; GIRARDELLO, RAQUEL ; VIVAN, ANA CAROLINA ; XAVIER, DANILO E ; Barcellos, Fernando G ; PELISSON, MARSILENI ; VESPERO, ELIANA C ; MÉDIGUE, CLAUDINE ; VASCONCELOS, ANA TEREZA ; GALES, ANA C ; Nicolás, Marisa F . Comparative analysis of the complete genome of KPC-2-producing Klebsiella pneumoniae Kp13 reveals remarkable genome plasticity and a wide repertoire of virulence and resistance mechanisms. BMC Genomics , v. 15, p. 54, 2014.

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• MARINOTTI, O. ; CERQUEIRA, G. C. ; DE ALMEIDA, L. G. P. ; FERRO, M. I. T. ; LORETO, E. L. D. S. ; ZAHA, A. ; TEIXEIRA, S. M. R. ; WESPISER, A. R. ; ALMEIDA E SILVA, A. ; SCHLINDWEIN, A. D. ; PACHECO, A. C. L. ; SILVA, A. L. D. C. D. ; GRAVELEY, B. R. ; WALENZ, B. P. ; LIMA, B. D. A. ; RIBEIRO, C. A. G. ; NUNES-SILVA, C. G. ; DE CARVALHO, C. R. ; SOARES, C. M. D. A. ; BARCELLOS, Fernando Gomes ; et.al . The Genome of Anopheles darlingi, the main neotropical malaria vector. NUCLEIC ACIDS RESEARCH , v. 41, p. 7387-7400, 2013.

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• Abreu, Fernanda ; Cantão, Mauricio E ; Nicolás, Marisa F ; Barcellos, Fernando G ; Morillo, Viviana ; Almeida, Luiz GP ; do Nascimento, Fabrícia F ; Lefèvre, Christopher T ; Bazylinski, Dennis A ; R de Vasconcelos, Ana Tereza ; Lins, Ulysses . Common ancestry of iron oxide- and iron-sulfide-based biomineralization in magnetotactic bacteria. The ISME Journal (Print) , p. 1, 2011.

• BARCELLOS, Fernando Gomes ; Pedrosa, Fábio O. ; Monteiro, Rose Adele ; Wassem, Roseli ; Cruz, Leonardo M. ; Ayub, Ricardo A. ; Colauto, Nelson B. ; Fernandez, Maria Aparecida ; Fungaro, Maria Helena P. ; Grisard, Edmundo C. ; HUNGRIA, Mariangela ; Madeira, Humberto M. F. ; Nodari, Rubens O. ; Osaku, Clarice A. ; Petzl-Erler, Maria Luiza ; Terenzi, Hernán ; Vieira, Luiz G. E. ; Steffens, Maria Berenice R. ; Weiss, Vinicius A. ; Pereira, Luiz F. P. ; et.al . Genome of Herbaspirillum seropedicae Strain SmR1, a Specialized Diazotrophic Endophyte of Tropical Grasses. PLOS Genetics (Online) , v. 7, p. e1002064, 2011.

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• Pinto, Fabiana G. S. ; Chueire, Ligia M. O. ; Vasconcelos, Ana Tereza R. ; Nicolás, Marisa F. ; Almeida, Luiz G. P. ; Souza, Rangel C. ; MENNA, Pâmela ; Barcellos, Fernando G. ; Megías, Manuel ; HUNGRIA, Mariangela . Novel genes related to nodulation, secretion systems, and surface structures revealed by a genome draft of Rhizobium tropici strain PRF 81. Functional & Integrative Genomics , v. 9, p. 263-270, 2009.

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• PEREIRA, G. A. ; Gutuzzo, G. O. ; BARCELLOS, Fernando Gomes ; REZENDE, M. I. . Otimização do Cultivo de Bacillus toyonensis Isolados a partir do Solo/Serapilheira do Parque Estadual Mata dos Godoy Através de um Delineamento Composto Central.. In: VI Simpósio de Bioquímica e Biotecnologia, 2017, Londrina. Anais do VI Simpósio de Bioquímica e Biotecnologia, 2017. v. 1.

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• BARCELLOS, Fernando Gomes ; PEREIRA, G. A. . BIOPROSPECÇÃO FUNCIONAL REALIZADA A PARTIR DE ESTUDOS METABARCODING DO GENE 16S. In: VII SIMPÓSIO DE BIOQUÍMICA E BIOTECNOLOGIA, 2019, Londrina. ANAIS DO VII SIMPÓSIO DE BIOQUÍMICA E BIOTECNOLOGIA. Londrina: UEL, 2019. v. 1. p. 1-1.

• BARCELLOS, Fernando Gomes ; PEREIRA, G. A. . PREDIÇÃO DO METABOLISMO EM COMUNIDADES BACTERIANAS OBTIDAS A PARTIR DE UM BANCO DE DADOS METAGENÔMICO. In: VII SIMPÓSIO DE BIOQUÍMICA E BIOTECNOLOGIA, 2019, Londrina. ANAIS DO VII SIMPÓSIO DE BIOQUÍMICA E BIOTECNOLOGIA. Londrina: Editora da UEL, 2019. v. 1. p. 1-1.

• BINDE, Daisy Rickli ; HUNGRIA, Mariangela ; CHUEIRE, Ligia Maria de Oliveira ; LUCAS, Ismael Hernandez ; NICOLÁS, Marisa Fabiana ; VASCONCELOS, Ana Tereza Ribeiro ; GONZAGA, Luiz de Paula ; MARTINEZ-ROMERO, Esperanza ; BARCELLOS, Fernando Gomes ; SILVA, Miriam Francisca da . Análise estrutural do plasmídio simbiótico de Rhizobium tropici CFN299. In: II Jornada Acadêmica da Embrapa Soja, 2006, Londrina. Anais da II Jornada Acadêmica da Embrapa Soja, 2006. p. 102-105.

• MENNA, Pâmela ; BARCELLOS, Fernando Gomes ; BARCELLOS, Ferrnando Gomes ; BANGEL, Eliane ; HUNGRIA, Mariangela . Diversidade de estirpes de Bradyrhizobium isoladas de diferentes leguminosas, com base na análise do gene ribossomal 16S e dos genes de nodulação nodY/KA. In: II Jornada Acadêmica da Embrapa Soja, 2006, Londrina. Anais da II Jornada Acadêmica da Embrapa Soja, 2006. p. 126-131.

• BARCELLOS, Fernando Gomes ; MENNA, Pâmela ; Ballati, Pedro Alberto ; HUNGRIA, Mariangela . Caracterização da estirpe de Sinorhizobium fredii CPAC 402: provável evento de transferência lateral de genes simbióticos em solos dos Cerrados entre gêneros distintos re rizóbios. In: II Jornada Acadêmica da Embrapa Soja, 2006. Anáis da II Jornada Acadêmica da Embrapa Soja, 2006. p. 132-138.

• BARCELLOS, Fernando Gomes ; MENNA, Pâmela ; BATISTA, Jesiane Stefânia da Silva ; HUNGRIA, Mariangela . Transferência horizontal de genes simbióticos de estirpes inoculantes de B. japonicum para estirpes de rizóbios nativas dos solos dos Cerrados. In: II Jornada Acadêmica da Embrapa Soja, 2006, Londrina. Anais da II Jornada Acadêmica da Embrapa Soja, 2006. p. 139-144.

• GODOY, Leandro Pereira ; CHUEIRE, Ligia Maria de Oliveira ; BARCELLOS, Fernando Gomes ; VASCONCELOS, Ana Tereza Ribeiro ; GONZAGA, Luiz de Paula ; NICOLÁS, Maria Fabiana ; Souza, Rangel C. ; HUNGRIA, Mariangela . Panorama genômico da estirpe de Bradyrhizobium japonicum CPAC 15, recomendada para o uso em inoculantes comerciais para a cultura da soja. In: II Jornada Acadêmica da Embrapa Soja, 2006, Londrina. Anais da II Jornada Acadêmica da Embrapa Soja, 2006. p. 156-161.

• BARCELLOS, Fernando Gomes ; MENNA, Pâmela ; BATISTA, Jesiane Stefênia da Silva ; HUNGRIA, Mariangela . Avaliação da eficiência na fixação biológica do nitrogênio com a cultura da soja e caracterização genotípica e da diversidade de estirpes de Bradyrhizobium japonicum. In: Jornada Acadêmica da Embrapa Soja, 2005, Londrina. Anais da Primeira Jornada Acadêmica da Embrapa Soja. Brasília - DF: Embrapa, 2005. v. 1.

• MENNA, Pâmela ; BARCELLOS, Fernando Gomes ; BATISTA, Jesiane Stefênia da Silva ; BANGEL, Eliane ; CAMPO, Rubens José ; HUNGRIA, Mariangela . Análise filogenética de rizóbios, utilizados em inoculantes comerciais brasileiros, com base no seqüenciamento do gene ribossomal 16S.. In: Jornada Acadêmica da Embrapa Soja, 2005, Londrina. Anais da Primeira Jornada Acadêmica da Embrapa Soja, 2005.

• BINDE, Daisy Rickli ; BARCELLOS, Fernando Gomes ; CHUEIRE, Ligia Maria de Oliveira ; LUCAS, Ismael Hernandez ; NICOLÁS, Marisa Fabiana ; VASCONCELOS, Ana Tereza Ribeiro ; GONZAGA, Luiz de Paula ; MARTINEZ-ROMERO, Esperanza ; SILVA, Miriam Francisca da ; GARCIA, José Eduardo ; HUNGRIA, Mariangela . Seqüenciamento do plasmídeo simbiótico da estirpe CFN 299 de Rhizobium tropici. In: Jornada Acadêmica da Embrapa Soja, 2005, Londrina - PR. Anais da Primeira Jornada Acadêmica da Embrapa Soja, 2005.

• GODOY, Leandro Pereira ; BARCELLOS, Fernando Gomes ; CHUEIRE, Ligia Maria de Oliveira ; VASCONCELOS, Ana Tereza Ribeiro ; GONZAGA, Luiz de Paula ; NICOLÁS, Marisa Fabiana ; HUNGRIA, Mariangela . Panorama genômico da estirpe de Bradyrhizobium japonicum CPAC 15, recomendada para o uso em inoculantes comerciais na cultura da soja. In: Jornada Acadêmica da Embrapa Soja, 2005, Londrina. Anais da Primeira Jornada Acadêmica da Embrapa Soja, 2005.

• BATISTA, Jesiane Stefânia da Silva ; BARCELLOS, Fernando Gomes ; MENNA, Pâmela ; MENDES, Iêda Carvalho ; HUNGRIA, Mariangela . Diversidade de estirpes de Bradyrhizobium japonicum e Bradyrhizobium elkanii estabelecidas por inoculação em solos dos cerrados. In: Jornada Acadêmica da Embrapa Soja, 2005, Londrina. Anais da Jornada Acadêmica da Embrapa Soja, 2005.

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• Coelho, C. M. ; Perin, J. G. ; Medeiros, C. ; Santello, W. A. ; MARTINEZ, W. D. ; Barcellos, F. G. . CARACTERIZAÇÃO DOS GENES nopP, aapP DE Bradyrhizobium japonicum RELACIONADOS À EFICIÊNCIA NA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DO NITROGÊNIO COM A SOJA EM ESTIRPES CONTRASTANTES PARA ESTA CARACTERÍSTICA. In: 11 Encontro de Iniciação Científica e Fórum de Pesquisa da UNIPAR, 2012, Umuarama - Parná. Anais do 11 Encontro de Iniciação Científica e Fórum de Pesquisa da UNIPAR, 2012.

• SANTANA, T. T. ; SILVA, J. J. ; Barcellos, F. G. ; Colauto, Giani Andrea Linde ; Colauto, Nelson Barros ; VALLE, J. S. . PRODUÇÃO DE LACASE DE Pleurotus ostreatus EM FERMENTAÇÃO SUBMERSA COM VINHAÇA DE CANA-DEAÇÚCAR. In: 11 Encontro de Iniciação Científica e Fórum de Pesquisa da UNIPAR, 2012, Umuarama - Parná. Anais do 11 Encontro de Iniciação Científica e Fórum de Pesquisa da UNIPAR, 2012.

• DIAS, P. F. ; OLIVEIRA, A. C. C. ; DIAS, D. C. ; VALLE, J. S. ; Colauto, Nelson B. ; Barcellos, F. G. . CARACTERIZAÇÃO DA DIVERSIDADE GENÉTICA DE LINHAGENS DE Lentinula edodes. In: 11 Encontro de Iniciação Científica e Fórum de Pesquisa da UNIPAR, 2012, Umuarama - Parná. Anais do 11 Encontro de Iniciação Científica e Fórum de Pesquisa da UNIPAR, 2012.

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• SANTANA, T. T. ; SILVA, J. J. ; Barcellos, F. G. ; Colauto, Giani Andrea Linde ; Colauto, Nelson B. ; Valle, J. S. . USO DE DIFERENTES LINHAGENS DE FUNGOS DO GÊNERO Pleurotus NA DESCOLORAÇÃO DE VINHAÇA DE CANA DE AÇÚCAR. In: 11 Encontro de Iniciação Científica e Fórum de Pesquisa da UNIPAR, 2012, Umuarama - Parná. Anais do 11 Encontro de Iniciação Científica e Fórum de Pesquisa da UNIPAR, 2012.

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• HUNGRIA, Mariangela ; CAMPO, Rubens José ; Barcellos, Fernando Gomes ; CHUEIRE, Ligia Maria de Oliveira ; MENNA, Pâmela ; BATISTA, Jesiane Stefânia da Silva ; PINTO, Fabiana Gisele ; BINDE, Daisy Rickli ; GODOY, Leandro Pereira ; Pereira, A. A. . Biological nitrogen fixation with the soybean and common bean crops in the tropics. In: 15 th International Nitrogen Fixation Congress, 2008, Pretoria - South Africa. Biological Nitrogen Fixation: Towards Poverty Alleviation thtough Sustainable Agriculture. Cape Town: Springer, 2008. v. 42.

• HUNGRIA, Mariangela ; Souza, R. A. ; CAMPO, Rubens José ; Franchini, Júlio César ; CHUEIRE, Ligia Maria de Oliveira ; BARCELLOS, Fernando Gomes . Validação dos parâmetros do protocolo da RELARE recomendados para a avaliação da eficiência agronômica com a soja. In: XIII Reunião da Rede de Laboratórios para Recomendação, Padronização e Difusão de Inoculantes Microbianos de Interesse Agrícola (RELARE), 2007, Londrina. Anais da XIII Reunião da Rede de Laboratórios para Recomendação, Padronização e Difusão de Inoculantes Microbianos de Interesse Agrícola (RELARE), 2007. p. 290-290.

• HUNGRIA, Mariangela ; MENDES, Iêda Carvalho ; BARCELLOS, Fernando Gomes ; BARCELLOS, Ferrnando Gomes ; CHUEIRE, Ligia Maria de Oliveira ; CAMPO, Rubens José . CPAC 15 ou CPAC 7? Eis a questão!. In: XIII Reunião da Rede de Laboratórios para Recomendação, Padronização e Difusão de Inoculantes Microbianos de Interesse Agrícola (RELARE), 2007, Londrina. Anais da XIII Reunião da Rede de Laboratórios para Recomendação, Padronização e Difusão de Inoculantes Microbianos de Interesse Agrícola (RELARE), 2007. p. 24-24.

• MENNA, Pâmela ; BARCELLOS, Fernando Gomes ; BANGEL, E. V. ; HUNGRIA, Mariangela . Taxonomia das estirpes de rizóbios recomendadas para o uso em inoculantes comerciais no Brasil. In: XIII Reunião da Rede de Laboratórios para Recomendação, Padronização e Difusão de Inoculantes Microbianos de Interesse Agrícola (RELARE), 2007, Londrina. Anais da XIII Reunião da Rede de Laboratórios para Recomendação, Padronização e Difusão de Inoculantes Microbianos de Interesse Agrícola (RELARE), 2007. p. 53-53.

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• BARCELLOS, Fernando Gomes ; MENNA, Pâmela ; BATISTA, Jesiane Stefânia da Silva ; HUNGRIA, Mariangela . Transferência Horizontal de genes entre diferentes espécies de rizóbios nos solos dos Cerrados. In: XXVII Reunião Brasileira de Fertilidade do Solo e Nutrição de Plantas, 2006, Bonito - MS. Anais da XXVII Reunião Brasileira de Fertilidade do Solo e Nutrição de Plantas, 2006.

• BARCELLOS, Fernando Gomes ; MENNA, Pâmela ; BATISTA, Jesiane ; HUNGRIA, Mariangela . Caracterização genotípica e da diversidade de estirpes de Bradyrhizobium japonicum e avaliação da eficiencia na fixação biológica do nitrogênio (FBN) com a cultura da soja (Glycine Max (L) Merr). In: XXIII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2005, Santos - SP. XXIII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2005.

• MENNA, Pâmela ; BARCELLOS, Fernando Gomes ; BATISTA, Jesiane Stefânia da Silva ; BANGEL, E. V. ; HUNGRIA, Mariangela . Filogenia molecular de rizóbios utilizados em inoculantes comerciais Brasileiros, com base no seqüenciamento do gene ribossomal 16S. In: XXIII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2005, Santos - SP. Anais do XXIII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2005.

• BATISTA, Jesiane Stefânia da Silva ; BARCELLOS, Fernando Gomes ; MENNA, Pâmela ; HUNGRIA, Mariangela . Caracterização genética de estirpes de Bradyrhizobium japonicum e Bradyrhizobium elkanii reisoladas de solos dos cerrados. In: XXIII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2005, Santos - SP. Anais do XXIII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2005.

• BARCELLOS, Fernando Gomes ; RODRIGUES, Maria Beatriz C ; KLEINER, Aline Aparecida Pizzirani . Avaliação da produção de celulases em mutantes de Trichoderma pseudokoningii. In: X Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP - SIICUSP, 2002, Piracicaba - SP, 2002.

• BARCELLOS, Fernando Gomes ; KLEINER, Aline Aparecida Pizzirani . Parameiose em Trichoderma pseudokoningii. In: 47 Congresso Nacional de Genética, 2001, Águas de Lindóia - SP. Anais do 47 Congresso Nacional de Genética, 2001.

• BARCELLOS, Fernando Gomes ; RODRIGUES, Maria Beatriz Calderan ; KLEINER, Aline Aparecida Pizzirani . Obtenção de mutantes e análise do cariótipo eletroforético em Trichoderma. In: 9 Simpósio Internacional de Iniciação Ciêntífica da USP - SIICUSP, 2001, Piracicaba - SP, 2001.

• BARCELLOS, Fernando Gomes ; FURLANETO, Márcia Cristina ; FUNGARO, Maria Helena Pelegrinelli . Genetic instability of Aspergillus nidulans transformants. In: XXI Reunião de Genética de Microrganismos, 1997, Londrina. Anais da XXI Reunião de Genética de Microrganismos, 1997.

• BARCELLOS, Fernando Gomes ; FURLANETO, Márcia Cristina ; FUNGARO, Maria Helena Pelegrinelli . Instabilidade Mitótica de transformantes de Aspergillus nidulans obtidos por biobalística. In: III Encontro Paranaense de Genética, 1996, Curitiba - PR. Anais do III Encontro Paranaense de Genética, 1996.

• BARCELLOS, Fernando Gomes ; LIMA, E A L A ; FUNGARO, Maria Helena Pelegrinelli . Condição nuclear, obtenção de mutantes e perfil de RAPD do isolado Ma 12 de Metarhizium anisopliae. In: XIX Reunião de Genética de Microrganismos, 1994, Serra Negra - SP. Anais da XIX RAGM, 1994.

• Barcellos, Fernando Gomes . Metagenômica do solo - Aplicações na Agricultura. 2021. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Barcellos, F. G. . Metagenômica e suas aplicações. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• NICOLÁS, Maria Fabiana ; Márcia Dellamano ; Rosseli Celso Souza ; Luciane Ciapina Prioli ; Barcellos, Fernando Gomes ; Almeida, Luiz Gonzaga de Paula . Progress on the High-Throughput Sequencing Projects at Brazilian Bioinformatics Laboratory. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• BARCELLOS, Fernando Gomes . Transferência Horizontal de Genes: Ocorrência em Solos Brasileiros. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• BARCELLOS, Fernando Gomes . Transferência Horizontal de Genes: Ocorrência em Solos Brasileiros. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• BARCELLOS, Fernando Gomes . Recursos Genéticos Microbianos e Bioprospecção. 2007. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• BARCELLOS, Fernando Gomes . Caracterização genética e citológica da recombinação somática em Trichoderma psedokoningii. 2002. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• BARCELLOS, Fernando Gomes . Migração nuclear em fungos filamentosos. 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• BARCELLOS, Fernando Gomes . Movimento Nuclear em Fungos Filamentosos. 2000. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2020 - Atual

  POTENCIAL DE FIXAÇÃO BIOLÓGICA DO NITROGÊNIO NO FEIJOEIRO (PHASEOLUS VULGARIS) DE RIZÓBIOS OBTIDOS DE SOLOS DE DIFERENTES REGIÕES DO ESTADO DO PARANÁ., Descrição: O FEIJÃO COMUM, COMO É CONHECIDA A PLANTA PHASEOLUS VULGARIS TEM UM GRANDE PAPEL ECONÔMICO ESOCIAL NO BRASIL, SENDO ESTE O MAIOR PRODUTOR MUNDIAL DESTA LEGUMINOSA. APESAR DISSO SEURENDIMENTO MÉDIO NACIONAL É MUITO BAIXO, POR CONTA DO BAIXO INVESTIMENTO EM PESQUISAS E EM NOVASBIOTECNOLOGIAS, COMO A BUSCA POR NOVAS ESTIRPES DE INOCULANTES PARA A FIXAÇÃO BIOLÓGICA DENITROGÊNIO (FBN). NESTE SENTIDO, A PHASEOLUS VULGARIS FOI ESCOLHIDA NESTE ESTUDO COMO UMA PLANTAISCA DE RIZÓBIOS PRESENTES EM SOLOS NATIVOS DE DUAS REGIÕES PRODUTORAS DIFERENTES DO PARANÁ(PONTA-GROSSA E LONDRINA), A FIM DE SE ISOLAR E AVALIAR O POTENCIAL DE FBN COM O FEIJOEIRO ECORRELACIONAR A BIODIVERSIDADE DOS RIZÓBIOS PRESENTES NO INTERIOR DOS NÓDULOS DO FEIJÃO COM ASVARIÁVEIS QUÍMICAS DOS SOLOS A SEREM ESTUDADAS. COM ESTA ESTRATÉGIA PRETENDE-SE ISOLAR RIZÓBIOSMAIS ADAPTADOS A CONDIÇÕES QUÍMICAS DOS SOLOS ESPECÍFICAS, COMO POR EXEMPLO, O BAIXO NÍVEL DEPH. OS ISOLADOS (RIZÓBIOS) OBTIDOS SERÃO AVALIADOS QUANTO A DIVERSIDADE GENÉTICA, COM O USO DOMARCADOR BOX PCR. OS ISOLADOS OBTIDOS SERÃO RE-INOCULADOS NO FEIJOEIRO PARA AVALIAÇÃO DASCARACTERÍSTICAS DE EFICIÊNCIA NA FBN EM EXPERIMENTOS CONDUZIDOS EM CASA DE VEGETAÇÃO. OSISOLADOS APRESENTANDO CARACTERÍSTICAS DE FBN COM O FEIJOEIRO MAIS PROMISSORAS SERÃO ESTUDADOSQUANTO À IDENTIFICAÇÃO TAXONÔMICA E FILOGENIA UTILIZANDO O GENE RIBOSSOMAL 16S E A TÉCNICA DEMLSA. OS ISOLADOS MAIS PROMISSORES NA FBN COM O FEIJOEIRO SERÃO TAMBÉM ESTUDADOS QUANTO APRESENÇA E FILOGENIA DOS GENES NODC E NIFH, RELACIONADOS AOS PROCESSOS DE NODULAÇÃO E FBN EMRIZÓBIOS, RESPECTIVAMENTE. DESTA FORMA, PRETENDE-SE COMO RESULTADO DO DESENVOLVIMENTO DESTEPROJETO O ISOLAMENTO DE ESTIRPES DE RIZÓBIOS MAIS EFICIENTES NO PROCESSO DE FBN COM O FEIJOEIROE PROMISSORAS E/OU ADAPTADAS ÀS CONDIÇÕES QUÍMICAS ESPECÍFICAS DOS SOLOS DAS REGIÕES PRODUTORASSELECIONADAS, COMO O BAIXO NÍVEL DE PH, POR EXEMPLO.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Fernando Gomes Barcellos - Coordenador / Mariangela Hungria - Integrante / Gisele Maria de Andrade de Nóbrega - Integrante / Elisete Pains Rodrigues - Integrante.

• 2017 - Atual

  MICRORGANISMOS PROMOTORES DO CRESCIMENTO DE PLANTAS VISANDO À SUSTENTABILIDADE AGRÍCOLA E À RESPONSABILIDADE AMBIENTAL? (MPCPAGRO), Descrição: MISSÃO DO INCT-MPCPAGRO: ?CONDUZIR PESQUISAS BÁSICAS E DE DESENVOLVIMENTO BIOTECNOLÓGICO, FORMAR RECURSOS HUMANOS E REALIZAR TRANSFERÊNCIA DE CONHECIMENTO, PRODUTOS E TECNOLOGIAS PARA SETORES PÚBLICOS E PRIVADOS, VISANDO INCREMENTAR O USO DE MICRORGANISMOS PROMOTORES DO CRESCIMENTO DE PLANTAS (MPCP), PROCESSOS MICROBIANOS E BIOMOLÉCULAS DE ORIGEM MICROBIANA NA AGRICULTURA BRASILEIRA, MAXIMIZANDO A NUTRIÇÃO DAS PLANTAS E O RENDIMENTO DAS CULTURAS COM MENOR APORTE DE FERTILIZANTES QUÍMICOS E IMPACTO AMBIENTAL? O INCT-MPCAGRO É COMPOSTO POR GRUPOS DE PESQUISA QUE INCLUEM UNIDADES DA EMBRAPA, UNIVERSIDADES QUE POSSUEM FORTES PARCERIAS COM A EMBRAPA, O IAPAR E COMPLEMENTADO POR REPRESENTANTES DO SETOR PRIVADO EMPRESARIAL. O PROGRAMA DO INCT-MPCAGRO ENGLOBA ATIVIDADES QUE VISAM AO AVANÇO NO CONHECIMENTO, AO DESENVOLVIMENTO BIOTECNOLÓGICO, À FORMAÇÃO DE RECURSOS HUMANOS E À TRANSFERÊNCIA DE CONHECIMENTO PARA OS SETORES EMPRESARIAL, PÚBLICO E PARA A SOCIEDADE EM GERAL, RELACIONADOS A MICRORGANISMOS PROMOTORES DO CRESCIMENTO DE PLANTAS (MPCP) DE IMPORTÂNCIA PARA O AGRONEGÓCIO, OU A REPRESENTANTES DA BIODIVERSIDADE DOS SOLOS BRASILEIROS, BEM COMO DA INTERAÇÃO PLANTAS-MPCP.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Fernando Gomes Barcellos - Integrante / Mariangela Hungria - Integrante / André Luis Martinez de Oliveira - Integrante / Elisete Pains Rodrigues - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 5

• 2016 - 2019

  ESTUDO METAGENÔMICO E BIOPROSPECÇÃO DE MICRORGANISMOS COM POTENCIAL BIOTECNOLÓGICO CELULOLÍTICO PROVENIENTES DE AMOSTRAS DE SOLO DO PARQUE ESTADUAL MATA DOS GODOY EM LONDRINA ? PR, Descrição: VÁRIOS PROCESSOS INDUSTRIAIS UTILIZAM ENZIMAS, DENTRE ELES PODEMOS INCLUIR APLICAÇÕES NO PROCESSAMENTO DE ALIMENTOS, NA FABRICAÇÃO DE RAÇÃO ANIMAL, FABRICAÇÃO DE MEDICAMENTOS E COSMÉTICOS, NA INDÚSTRIA TÊXTIL E DE PAPEL E CELULOSE, BEM COMO NA PESQUISA E DESENVOLVIMENTO BIOTECNOLÓGICO; UM MERCADO POUCO EXPLORADO E DESENVOLVIDO NO BRASIL, MAS QUE EM ESCALA MUNDIAL MOVIMENTOU APROXIMADAMENTE US $ 4,8 BILHÕES EM 2013 E ONDE SE PREVÊ QUE EM 2018 ESTA MOVIMENTAÇÃO SUPERE A CASA DOS US $ 7,0 BILHÕES CONFIGURANDO ASSIM UM MERCADO PROMISSOR. AS ENZIMAS DE ORIGEM MICROBIANA SÃO AS MAIS UTILIZADAS NOS PROCESSOS INDUSTRIAIS POIS NÃO ESTÃO SUJEITAS A FATORES QUE POSSAM COMPLICAR SUA PRODUÇÃO, COMO DISPONIBILIDADE DE TERRA OU FLUTUAÇÕES DE COLHEITAS NO CASO DAS PLANTAS, NEM SUJEITAS A CONDIÇÕES DE ABATE NO CASO DE ORIGEM ANIMAL. SENDO ASSIM, A BUSCA POR MICRO-ORGANISMOS PRODUTORES DE ENZIMAS, EM ESPECIAL LEVEDURAS, NOS MAIS VARIADOS HABITATS E A EXTENSIVA SELEÇÃO DE ISOLADOS PODE LEVAR A DESCOBERTA DE ENZIMAS COM CARACTERÍSTICAS ÚNICAS DE INTERESSE PARA APLICAÇÃO BIOTECNOLÓGICA. A OBTENÇÃO DESTES MICRO-ORGANISMOS PODE SER FEITA DE VÁRIAS MANEIRAS, TAIS COMO: ISOLAMENTO A PARTIR DE RECURSOS NATURAIS, COMPRA EM COLEÇÕES DE CULTURAS, OBTENÇÃO DE MUTANTES NATURAIS, OBTENÇÃO DE MUTANTES INDUZIDOS POR MÉTODOS CONVENCIONAIS E OBTENÇÃO DE MICRO-ORGANISMOS RECOMBINANTES POR TÉCNICAS DE ENGENHARIA GENÉTICA ENTRE OUTROS. A ABORDAGEM METAGENÔMICA SE CARACTERIZA POR CONTORNAR A NECESSIDADE DE CULTIVO E, EM FUNÇÃO DA VASTA DIVERSIDADE MICROBIANA, É CONDUZIDA EM GRANDE ESCALA; AS INFORMAÇÕES OBTIDAS A PARTIR DA ANÁLISE DE METAGENOMAS PODEM SER USADAS PARA DETERMINAR A DIVERSIDADE DE UMA COMUNIDADE, A PRESENÇA DE MICRORGANISMOS ESPECÍFICOS OU DOMINANTES, ROTAS METABÓLICAS, BEM COMO DETERMINAR A PRESENÇA DE GENES DE INTERESSE, COMO NO CASO OS GENES DE CELULASES. DESTA FORMA O OBJETIVO DESTA PROPOSTA É CARACTERIZAR A DIVERSIDADE DE MICRO-ORGANISMOS NÃO-CULTIVÁVEIS ASSOCIADOS AO SOLO/SERRAPILHEIRA DO PARQUE ESTADUAL MATA DOS GODOY E EXPLORAR O SEU POTENCIAL ENZIMÁTICO ESPECIALMENTE COM RELAÇÃO AS ENZIMAS CELULOLÍTICAS; ALÉM DISSO PRETENDE-SE ISOLAR E CARACTERIZAR O POTENCIAL CELULOLÍTICO DE LEVEDURAS CULTIVÁVEIS ISOLADAS A PARTIR DO SOLO/SERAPILHEIRA DO PARQUE ESTADUAL MATA DOS GODOY;. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Fernando Gomes Barcellos - Coordenador / Gisele Maria de Andrade de Nóbrega - Integrante / Elisete Pains Rodrigues - Integrante.

• 2014 - 2017

  IDENTIFICAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO DE GENES RELACIONADOS À EFICIÊNCIA E COMPETITIVIDADE NA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DO NITROGÊNIO EM ESTIRPES DE Bradyrhizobium japonicum MICROSSIMBIONTES DA SOJA, Descrição: Este projeto tem como objetivo a identificação, por meio da técnica de "Representative Difference Annalysis - RDA", e a caracterização de genes relacionados aos processos de eficiência e/ou competitividade na Fixação Biológica do Nitrogênio (FBN) com a soja em estirpes de Bradyrhizobium japonicum. A identificação e caracterização destes genes permitirá uma melhor compreensão da base genética destes processos e permitirá o desenvolvimento de novas estratégias para a seleção e/ou obtenção de estirpes de B. japonicum mais eficientes e promissoras para o uso como inoculantes na cultura da soja. O projeto permitirá o desenvolvimento de marcadores moleculares úteis na seleção de genótipos superiores (estirpes) de Bradyrhizobium japonicum, com relação às características de eficiência e competitividade na Fixação Biológica do Nitrogênio (FBN) com a soja. Estes marcadores moleculares serão utilizados nos programas de seleção de estirpes de B. japonicum, para o uso em inoculantes comerciais para a cultura da soja. Desta forma, contribuindo para o desenvolvimento da indústria de inoculantes microbianos para a cultura da soja.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Fernando Gomes Barcellos - Coordenador / Renan Augusto Ribeiro - Integrante / HUNGRIA, M - Integrante / Rodrigues, Elisete Pains - Integrante / Gilberto de Aguiar Pereira - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa., Número de produções C, T & A: 1

• 2014 - 2017

  BIOPROSPECÇÃO E CARACTERIZAÇÃO FUNCIONAL DE GENES POSSIVELMENTE RELACIONADOS AOS PROCESSOS DE FIXAÇÃO BIOLÓGICA DO NITROGÊNIO EM ESTIRPES DE BRADYRHIZOBIUM UTILIZADAS COMO INOCULANTES NA SOJA (GLYCINE MAX, Descrição: Diferenças entre os genomas de espécies do genêro Bradyrhizobium têm corroborado a enorme diversidade metabólica apresentada por eles. Isto inclui a existência de um grande número de genes, muitos dos quais ligados às ilhas simbióticas. O papel da maioria destes genes permanece desconhecido, enquanto investigações futuras, entre elas, através de técnicas de transcriptoma podem revelar mapas poderosos de expressão gênica. As estirpes de Bradyrhizobium (CPAC 07 e CPAC 15) constituem genótipos promissores para a bioprospecção de genes e proteínas relacionadas aos processos de FBN, incluindo as características de eficiência e competitividade. Estudos relatam que estirpes de CPAC 07 é mais eficiente na fixação no N2, enquanto estirpes de CPAC 15 é mais competitiva (NISHI & HUNGRIA, 1996; MENDES et al, 2004; HUNGRIA et al, 2006). Devido à escassez de informação quanto aos genes (?ORFs ? Open Reading Frames?), encontradas através do sequenciamento recente dos genomas destes microrganismos (aproximadamente 50% de todo o genoma, como descrito anteriormente), pouco ainda se sabe, por exemplo, se estas têm realmente funções (se são genes hipotéticos), ou se existem outros genes envolvidos nos mecanismos de nodulação ou FBN; além dos genes conhecidos (fix e nod), os quais são fundamentais para o processo de eficiência e competitividade de qualidade no processo completo da FBN. Neste contexto, as ORFs descritas representam bastante interesse para estudos, sendo de fundamental importância à caracterização destas, levando provavelmente a um maior conhecimento sobre suas atividades em funções críticas no processo da FBN.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Fernando Gomes Barcellos - Coordenador / Gilberto de Aguiar Pereira - Integrante / Mariangela Hungria - Integrante / Elisete Pains Rodrigues - Integrante / Ilmara Varotto - Integrante / Everton Geraldo Capote Ferreira - Integrante., Número de produções C, T & A: 2

• 2013 - 2016

  Estudo da diversidade de bactérias endofíticas da planta medicinal Baccharis trimera (Asteraceae) e avaliação do potencial biotecnológico dos isolados quanto à produção de compostos com atividade antimicrobiana, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Elisete Pains Rodrigues em 22/08/2014., Descrição: A demanda por novos agentes antimicrobianos e agroquímicos que sejam efetivos no controle de doenças infecciosas em plantas e animais, incluindo o homem, é cada vez mais crescente devido ao surgimento de microrganismos multirresistentes que afetam a saúde da população humana e a sanidade vegetal. Neste sentido, pesquisas utilizando novas abordagens que levem a descoberta de novos fármacos se fazem necessárias. A presente proposta, portanto, tem por finalidade estudar a diversidade de bactérias e actinobactérias (cultivável e não-cultivável) endofíticas da planta medicinal B. trimera (carqueja), uma espécie promissora para a busca de microrganismos endofíticos produtores de compostos bioativos, devido as suas propriedades antimicrobiana, anti-inflamatória, anti-ulcerogênica, entre outras. Para alcançar os objetivos da presente proposta serão utilizadas abordagens dependentes e independentes do cultivo. Nas abordagens dependentes de cultivo serão utilizadas diferentes estratégias visando obter uma estimativa mais próxima da diversidade de espécies bacterianas endofíticas de B. trimera. Os isolados obtidos, deste modo, serão identificados pelo sequenciamento do gene 16S rRNA e avaliados quanto ao seu potencial biotecnológico. Adicionalmente, a comunidade bacteriana endofítica de B. trimera será avaliada pela análise do gene 16S rRNA com o uso da técnica de fingerprinting T-RFLP (terminal-restriction fragment length polymorphism) e pela clonagem, sequenciamento e análise do gene 16S rRNA, possibilitando, deste modo, a compreensão da comunidade bacteriana endofítica de B. trimera. Espera-se com o presente projeto contribuir para o conhecimento científico e biotecnológico das bactérias endofíticas de B. trimera e a identificação de espécies bacterianas promissoras na produção de compostos com atividade antimicrobiana. Este projeto, portanto, é um estudo de Diversidade e bioprospecção que pode contribuir para a descoberta de compostos de interesse farmacêutico úteis para ao homem bem como, para a ampliação do conhecimento atual da biodiversidade microbiana, uma área de pesquisa que precisa ser estimulada tendo em vista o enorme potencial dos microrganismos em produzir compostos de interesse biotecnológico.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Fernando Gomes Barcellos - Integrante / HUNGRIA, M - Integrante / Rodrigues, Elisete Pains - Coordenador / André Luis Martinez de Oliveira - Integrante / DIVA DE SOUZA ANDRADE - Integrante / GISELE MARIA ANDRADE DE NOBREGA - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2012 - 2016

  BIOPROSPECÇÃO DE MICRORGANISMOS ENDOFÍTICOS COM ATIVIDADE ANTIMICROBIANA, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Elisete Pains Rodrigues em 30/03/2013., Descrição: O objetivo deste projeto é explorar as comunidades de microrganismos endofíticos de diferentes plantas nativas da flora brasileira visando à identificação e seleção de microrganismos com atividade antimicrobiana contra patógenos de interesse agronômico e de importância clínica.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Fernando Gomes Barcellos - Integrante / Rodrigues, Elisete Pains - Coordenador / Gisele Maria de Andrade de Nóbrega - Integrante / Gilberto de Aguiar Pereira - Integrante / Luzia Doretto Paccola Meirelles - Integrante.

• 2010 - 2013

  IDENTIFICAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO DE GENES RELACIONADOS À EFICIÊNCIA DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DO NITROGÊNIO (FBN) E À COMPETITIVIDADE EM ESTIRPES DE Bradyrhizobium japonicum, Bradyrhizobium elkanii E Rhizobium tropici, MICROSIMBIONTES DA SOJA E DO FEIJOEIRO, Descrição: Este projeto pretende utilizar a metodologia de RDA ?Representational Difference Annalysis? na identificação de genes relacionados à eficiência na FBN com a soja e competitividade em genótipos superiores de B. japonicum e B. elkanii. A partir da identificação dos genes, pretende-se realizar a caracterização funcional dos mesmos com o uso da técnica de mutagênese sítio-dirigida (nocaute de genes) e os genes identificados como relacionados às características de eficiência na FBN e/ou competitividade serão testados como genes marcadores na obtenção e/ou seleção de genótipos superiores. Da mesma forma que na soja, a cultura do feijoeiro tem sido grandemente beneficiada com o uso de estirpes selecionadas de rizóbios propiciando um aumento na produtividade a um baixo custo. A estirpe de Rhizobium tropici PRF 81 é uma das três estirpes autorizadas para uso como inoculantes comerciais para a cultura do feijoeiro, sendo considerada uma das mais eficientes em fixar o N2, além disso, é caracterizada por apresentar alta capacidade competitiva contra os rizóbios indígenas do solo e estabilidade genética. Devido a estas características, o seqüenciamento e a caracterização funcional de genes relacionados à competitividade e eficiência na fixação do N2 com o feijoeiro na estirpe PRF 81 constituem uma estratégia promissora no estudo destes processos e na busca de genes marcadores para a seleção e/ou obtenção de estirpes de R. tropici mais eficientes na FBN com o feijoeiro. Recentemente o genoma da estirpe PRF 81 foi parcialmente seqüenciado (~30%) por nosso grupo de pesquisa, sendo identificados genes relacionados à nodulação ainda não identificados e caracterizados nesta espécie. Um destes genes identificados é o gene nodN, possivelmente relacionado à modificações na estrutura do fator de nodulação. Portanto a caracterização funcional destes genes proporcionará um melhor conhecimento do processo de nodulação rizóbio ? feijoeiro e permitirá o desenvolvimento de estratégias mais efic. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Fernando Gomes Barcellos - Coordenador / Pâmela Menna Pereira - Integrante / Mariangela Hungria da Cunha - Integrante / Odair Alberton - Integrante / Nelson Barros Colauto - Integrante / Giani Andrea Linde Colauto - Integrante., Financiador(es): Fundação Araucária de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 6

• 2010 - 2012

  ESTRATÉGIAS INOVADORAS VISANDO O INCREMENTO NA EFICIÊNCIA DO PROCESSO DE FIXAÇÃO BIOLÓGICA DO NITROGÊNIO COM LEGUMINOSAS DE GRÃOS E OLEAGINOSAS: da genômica estrutural e funcional ao desenvolvimento de novos inoculantes, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Mariangela Hungria da Cunha em 05/09/2012., Descrição: Objetivo Geral Estabelecer linhas de pesquisa inovadoras, básicas e aplicadas, com bactérias fixadoras de nitrogênio e promotoras do crescimento de plantas visando, além de obter avanços no conhecimento da interação plantas-microrganismos, maximizar a nutrição de leguminosas de grãos e oleaginosas via utilização de microrganismos, permitindo a substituição total ou parcial de fertilizantes, com ênfase nos fertilizantes nitrogenados, garantindo altos rendimentos com baixo custo e baixo impacto ambiental, e resultando em benefícios científicos, econômicos, sociais e ambientais para o País.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Fernando Gomes Barcellos - Integrante / Eliane V. Bangel - Integrante / Marisa Fabiana Nicolás - Integrante / Pâmela Menna Pereira - Integrante / Mariangela Hungria da Cunha - Coordenador / Iêda Carvalho Mendes - Integrante / Renan Augusto Ribeiro - Integrante / Diva de Souza Andrade - Integrante / Luciana Grange - Integrante., Financiador(es): Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 7

• 2010 - 2012

  Caracterização Taxonômica e da Diversidade Genética de Isolados de Fungos Basidiomicetos, Descrição: O projeto tem como objetivos a caracterização taxonômica e da diversidade de isolados de fungos basidiomicetos, pertencentes à coleção (micoteca) de isolados de fungos basidiomicetos do Laboratório de Biologia Molecular na Universidade Paranaense (UNIPAR), os quais foram isolados de diferentes amostras ambientais, como restos vegetais, amostras de solo, madeira em decomposição, entre outros. Estes estudos são importantes para permitir o melhor aproveitamento do potencial biotecnológico destes isolados, como, por exemplo, na capacidade de degradação de fibras vegetais, na produção de enzimas de interesse industrial, entre outros. Os objetivos específicos do projeto são: - A caracterização taxonômica dos isolados com base na região ITS1, 5.8S e ITS2 do DNA ribossomal, comparando-se, por meio de análises de similaridade, com sequências de linhagens fúngicas depositadas em bancos de dados de sequências nucleotídicas (GenBank ? NCBI); - A caracterização da diversidade genética dos isolados com base na análise de polimorfismo de DNA com o uso da técnica de RAPD.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Fernando Gomes Barcellos - Coordenador / Nelson Barros Colauto - Integrante / Giani Andrea Linde Colauto - Integrante / Juliana S. Valle - Integrante., Financiador(es): Universidade Paranaense - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 3

• 2010 - 2012

  CARACTERIZAÇÃO DA ATIVIDADE LIGNO-CELULOLÍTICA E IDENTIFICAÇÃO DE GENES RELACIONADOS A ESTA ATIVIDADE EM ISOLADOS DE FUNGOS BASIDIOMICETOS, Descrição: O laboratório de Biologia Molecular da Universidade Paranaense possui uma coleção (micoteca) de isolados de fungos basidiomicetos, os quais foram isolados de diferentes amostras ambientais, como restos vegetais, amostras de solo, madeira em decomposição, entre outros. Para permitir o estudo e aproveitamento do potencial biotecnológico destes isolados, como, por exemplo, na capacidade de degradação de fibras vegetais, faz-se necessário a caracterização da atividade ligno-celulolítica destes isolados. Além disso, a identificação de genes que codificam enzimas celulolíticas e ligninolíticas nestes isolados, permitirá o melhor entendimento dos processos multienzimáticos envolvidos na degradação destes compostos, além de permitir o desenvolvimento de novas estratégias e aplicações biotecnológicas nos processos industriais que utilizam resíduos e fibras vegetais para as mais diversas aplicações. O objetivo do projeto é caracterizar a produção de enzimas ligno-celulolíticas e identificar os genes codificadores dessas enzimas em isolados de fungos basidiomicetos da micoteca do Laboratório de Biologia Molecular da UNIPAR. Os objetivos específicos do projeto são: - Caracterizar o tipo de atividade lignocelulolítica dos isolados da coleção de basidiomicetos; - Os isolados apresentando atividade lignocelulolítica serão caracterizados quanto a presença de genes que codificam enzimas celulolíticas (endoglicanases, exoglicanases, β-glicosidades) e genes que codificam enzimas ligninolíticas (peroxidases, lacases). A identificação será realizada através da amplificação por PCR, clonagem, sequenciamento e comparação, por similaridade, das sequências gênicas obtidas com sequências de genes depositados em bancos de dados de genes, como o GenBank (NCBI).. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Fernando Gomes Barcellos - Coordenador / Nelson Barros Colauto - Integrante / Giani Andrea Linde Colauto - Integrante / Juliana S. Valle - Integrante., Financiador(es): Universidade Paranaense - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2

• 2010 - 2012

  IDENTIFICAÇÃO DE GENES RELACIONADOS À EFICIÊNCIA DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DO NITROGÊNIO (FBN) E À COMPETITIVIDADE EM ESTIRPES DE Bradyrhizobium japonicum, MICROSIMBIONTES DA SOJA, Descrição: A fixação biológica no nitrogênio (FBN), através do uso de estirpes selecionadas de Bradyrhizobium japonicum e Bradyrhizobium elkanii para uso como inoculantes no lugar de adubação nitrogenada, tem sido essencial na viabilidade econômica da cultura da soja no Brasil. No entanto, devido ao constante aprimoramento das práticas agrícolas e ao lançamento de variedades mais produtivas e adaptadas às diferentes condições ambientais e ao estabelecimento de populações de estirpes em solos previamente inoculados, faz-se necessário uma constante busca por genótipos de rizóbios mais competitivos e eficientes no processo de FBN. Para esta busca é necessário um melhor entendimento dos genes e proteínas existentes nos diferentes genótipos de rizóbios relacionados à maior competitividade e eficiência no processo de FBN, os quais poderão ser utilizados como marcadores genotípicos úteis na seleção e/ou obtenção de genótipos mais promissores para utilização nos inoculantes. O estudo comparativo entre genomas que diferem quanto à eficiência e competitividade na FBN constitui-se em uma estratégia importante para a elucidação das bases genéticas relacionadas a estas diferenças, possibilitando, assim, uma busca mais eficiente por genótipos superiores. Desta forma, este projeto tem como objetivo a identificação de genes relacionados à eficiência e competitividade no processo de FBN com a soja, em genótipos superiores para estas características, e a verificação da viabilidade da utilização destes genes como marcadores na seleção de genótipos superiores em programas de seleção de estirpes para uso em inoculantes comerciais. Os objetivos do projeto são: - Identificar sequências gênicas relacionadas às diferenças na eficiência do processo de fixação biológica do nitrogênio (FBN) com a soja e à competitividade entre estirpes de Bradyrhizobium japonicum contrastantes para estas características com o uso da técnica de hibridização subtrativa denominada de ?Representational Difference Anal. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Fernando Gomes Barcellos - Coordenador / Odair Alberton - Integrante / Nelson Barros Colauto - Integrante / Giani Andrea Linde Colauto - Integrante., Financiador(es): Universidade Paranaense - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 7

• 2010 - 2012

  IDENTIFICAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO DE GENES RELACIONADOS À EFICIÊNCIA DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DO NITROGÊNIO (FBN) E À COMPETITIVIDADE EM ESTIRPES DE Bradyrhizobium japonicum, Bradyrhizobium elkanii E Rhizobium tropici, MICROSIMBIONTES DA SOJA E DO FEIJOEIRO, Descrição: Este projeto pretende utilizar a metodologia de RDA na identificação de genes relacionados à eficiência na FBN com a soja e competitividade em genótipos superiores de B. japonicum e B. elkanii. A partir da identificação dos genes, pretende-se realizar a caracterização funcional dos mesmos com o uso da técnica de mutagênese sítio-dirigida (nocaute de genes) e os genes identificados como relacionados às características de eficiência na FBN e/ou competitividade serão testados como genes marcadores na obtenção e/ou seleção de genótipos superiores. Além disso, pretende-se realizar a análise funcional do gene nodN de Rhizobium tropici através da metodologia de mutagênese sítio-dirigida ?nocaute gênico?, a qual possibilitará verificar a provável função deste gene no processo de nodulação de R. tropici no feijoeiro e sua aplicação como gene marcador na seleção e/ou obtenção de estirpes eficientes no processo de FBN.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Fernando Gomes Barcellos - Coordenador / Pâmela Menna Pereira - Integrante / Mariangela Hungria da Cunha - Integrante / Renan Augusto Ribeiro - Integrante / Odair Alberton - Integrante / Nelson Barros Colauto - Integrante / Giani Andrea Linde Colauto - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa., Número de produções C, T & A: 7

• 2008 - 2011

  Inovação na pesquisa em fixação biológica do nitrogênio com a cultura da soja: da genômica estrutural e funcional de Bradyrhizobium à tecnologia de inoculação, Descrição: O processo de fixação biológica do N2 (FBN) é essencial para a viabilidade econômica do cultivo da soja brasileira. Contudo, o constante aprimoramento das práticas agrícolas, o lançamento de cultivares mais produtivas e adaptadas às diferentes condições ambientais e o estabelecimento, no solo, de estirpes de Bradyrhizobium que nem sempre são as mais eficientes, indicam a necessidade de incrementar a contribuição do processo biológico. Hoje, são necessários 300 g de N.ha-1 para conseguir rendimentos de 2.500 g.ha-1, contudo, serão necessários 1.000 g de N.ha-1 para produzir os 8.000 g.ha-1 estimados como potencial genético da cultura. Somente com a adoção de estratégias inovadoras e com o conhecimento da dinâmica das populações de Bradyrhizobium estabelecidas nos solos brasileiros será possível, a médio e longo prazo, incrementar a contribuição da FBN. Em relação à ecologia dos rizóbios, resultados recentes de nosso grupo de pesquisa indicam a ocorrência de taxas elevadas de recombinação gênica e de transferência horizontal de genes simbióticos das estirpes inoculantes para os rizóbios nativos do solo, situação que pode ser agravada pela inoculação maciça. A dinâmica dessas populações precisa ser monitorada, visando delinear as estratégias futuras de inoculação. Para isso, proceder-se-á à caracterização de populações estabelecidas em agroecossistemas no PR, DF, MS, MT e RR, sob diferentes manejos do solo, das culturas, de sistemas agrícolas, das estirpes e de freqüência de inoculação. Adicionalmente, será iniciado um ensaio de longa duração no DF para quantificar a variabilidade genética das estirpes inoculantes após a introdução das mesmas no solo. Outra meta do projeto é a obtenção e validação de marcadores moleculares, visando acelerar os programas de seleção de estirpes. Variantes naturais das estirpes SEMIA 566 e CB 1809 de B. japonicum, com diferentes capacidades de FBN e/ou competitividade, estão disponíveis e serão comparadas, por RDA (Representational Differ. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Fernando Gomes Barcellos - Integrante / Jesiane Stefênia da Silva Batista - Integrante / Pâmela Menna Pereira - Integrante / Mariangela Hungria da Cunha - Coordenador / Renan Augusto Ribeiro - Integrante., Financiador(es): Universidade Paranaense - Cooperação / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 12

• 2006 - 2009

  Projeto Taxonomia CNPQ/CAPES/MCT, Descrição: Este Projeto Taxonomia tem como objetivos a formação de recursos humanos em taxonomia, curadoria e apoio técnico para coleções biológicas, além de promover novos avanços em taxonomia microbiana, principalmente no desenvolvimento e adoção de novas metodologias em sistemática bacteriana. Projeto financiado pela CAPES, MCT e CNPQ para o desenvolvimento de pesquisa em Taxonomia e Filogenia de bactérias (Rizóbios) fixadoras de nitrogênio em plantas leguminosas (soja, feijão, entre outras). Para isso os objetivos desenvolvidos junto ao Programa de Pós Graduação em Microbiologia da Universidade Estadual de Londrina são: 1 - Ministração da seguintes disciplinas: - Fundamentos em Taxonomia e Filogenia de Microrganismos; - Taxonomia e Filogenia de Bactérias: Conceitos avançados na era da genômica. 2 - Orientação de aluno de Mestrado com dissertação na área de taxonomia de bactérias diazotróficas fixadoras de nitrogênio. Atividades de pesquisa relativas ao projeto Taxonomia desenvolvidadas na Embrapa Soja: Desenvolvimento do projeto de pesquisa: Descrição de novas espécies de bactérias diazotróficas simbióticas isoladas de nódulos de leguminosas no Brasil. As atividades desenvolvidas no projeto são as seguintes: - Caracterização taxonômica das bactérias (rizóbios) da coleção de bactérias diazotróficas e promotoras do crescimento de plantas do Laboratório de Biotecnologia dos Solos da Embrapa - Soja, em Londrina PR.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Fernando Gomes Barcellos - Coordenador / Márcia Cristina Furlaneto - Integrante / Mariangela Hungria - Integrante / Jacinta Sanchez Pelayo - Integrante / Renan Augusto Ribeiro - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovações - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2005 - 2012

  Rede Centro-Sul para a manutenção, bioprospecção e caracterização da biodiversidade de coleções de culturas e de genes de bactérias de importância agroindustrial: diazotróficas e promotoras do crescimento, Descrição: O projeto de coleções de culturas tem por finalidade o conhecimento da biodiversidade, a bioprospecção de genes de interesse biotecnológico, o conhecimento dos processos genéticos que resultam da adaptação aos solos brasileiros e que afetam as respostas à inoculação e a identificação de estirpes mais eficientes e competitivas para serem utilizadas em inoculantes comerciais para diversas leguminosas. O projeto incluiu sete coleções de culturas, das seguintes instituições: Laboratórios de Biotecnologia do Solo da Embrapa Soja (Londrina, PR), Laboratório de Fixação Biológica do Nitrogênio da FEPAGRO (Porto Alegre, RS), laboratórios de Microbiologia do Solo do IAPAR (Londrina, PR), da Embrapa Cerrados (Planaltina, DF), da Embrapa Agropecuária Oeste (Dourados, MS), da UFMT-FCAV (Cuiabá, MT) e da UDESC-Faculdade de Agronomia (Lages, SC). O LNCC-Laboratório de Bioinformática (Petrópolis, RJ), é responsável pela criação do banco de dados e operacionalização da ?homepage? das coleções (http://www.bmrc.lncc.br). O acervo das coleções dos laboratórios envolvidos conta com, aproximadamente, 16.000 estirpes e reúne coleções de serviço, de referência e de estudo.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Fernando Gomes Barcellos - Integrante / Mariangela Hungria - Coordenador / Ligia Maria de Oliveira Chueire - Integrante / Pâmela Menna Pereira - Integrante / Adalgisa Ribeiro Torres - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2005 - 2008

  Melhoramento da Produtividade Agrícola Brasileira via Fixação Biológica do Nitrogênio e Transgenia, Descrição: As atividades que estão sendo desenvolvidadas por nosso grupo de pesquisa na Embrapa Soja relativas ao projetosão: 1) o seqüenciamento do plasmídeo simbiótico da estirpe CFN 299 de Rhizobium tropici, procurando genes relacionados à competitividade e eficiência do processo de fixação biológica do nitrogênio; 2) Identificação de genes e estudo da expressão gênica (genômica funcional) relacionados à competitividade e eficiência no processo de fixação biológica do nitrogênio (FBN) em estirpes de Bradyrhizobium japonicum utilizados como inoculantes na soja.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Fernando Gomes Barcellos - Integrante / Mariangela Hungria - Coordenador / Daisy Rickli Binde - Integrante / Ligia Maria de Oliveira Chueire - Integrante / Ana Tereza Ribeiro Vasconcelos - Integrante / Marisa Fabiana Nicolás - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 3

• 2004 - 2008

  Estratégias para maximizar a contribuição da fixação biológica do nitrogênio com a cultura da soja, Descrição: O projeto teve como objetivo a identificação e caracterização de estirpes de Bradyrhizobium japonicum eficientes no processo de fixação biológica do nitrogênio (FBN) com a soja, incluindo a caracterização genotípica e a identificação de genes relacionados ao processo de nodulação e FBN.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Fernando Gomes Barcellos - Integrante / Mariangela Hungria - Coordenador / Ligia Maria de Oliveira Chueire - Integrante / Pâmela Menna Pereira - Integrante / Jesiane Stefânia da Silva Batista - Integrante., Financiador(es): Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 3

• 2004 - 2007

  Estratégias para maximizar a fixação biológica do nitrogênio com as culturas da soja e do feijoeiro: Panorama estrutural e funcional dos genes das estirpes CPAC15 de Bradyrhizobium japonicum e PRF 81 de Rhizobium tropici, Descrição: Objetivo O projeto teve como objetivo realizar o seqüenciamento de 30% do genoma das estirpes CPAC 15 de Bradyrhizobium japonicum e PRF81 de Rizobium tropici, procurando genes relacionados à capacidade saprofítica, competitividade e eficiência do processo de fixação biológica do nitrogênio. Além disso, o projeto também teve como objetivo estudar a expressão de alguns genes identificados por "RT- PCR" e análise proteômica. Financiamento: EMBRAPA e CNPQ. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Fernando Gomes Barcellos - Integrante / Mariangela Hungria - Coordenador / Leandro Pereira Godoy - Integrante / Ligia Maria de Oliveira Chueire - Integrante / Ana Tereza Ribeiro Vasconcelos - Integrante / Marisa Fabiana Nicolás - Integrante / Fabiana Gisele Pinto - Integrante., Financiador(es): Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2

• 2004 - 2006

  Bioprospeção de genes na estirpe PRF81 (=SEMIA 4080) de Rhizobium tropici, utilizada em inoculantes comerciais para a cultura do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.)., Descrição: O projeto teve como objetivo o sequenciamento de aproximadamente 30% do genoma da estirpe PRF81 de Rhizobium tropici e a identificação de genes relacionado ao processo de nodulação e fixação fiológica do nitrogênio (FBN) com a soja.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Fernando Gomes Barcellos - Integrante / Mariangela Hungria - Coordenador / Daisy Rickli Binde - Integrante / Ligia Maria de Oliveira Chueire - Integrante / Pâmela Menna Pereira - Integrante., Financiador(es): Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1

• 2003 - 2011

  Projeto GENOPAR -, Descrição: Sequenciamento completo do genoma da bactéria Herbaspirillum seropedicae linhagem Z78 Realização: Programa Genoma do Paraná (GENOPAR), um consórcio de 10 Intituições de Pesquisa e Universidades do Paraná e Santa Catarina (UFPR, UEL, UEM, UEPG, UNIOESTE, UNIPAR, IAPAR, EMBRAPA-SOJA, PUC-PR, UFSC). O Projeto teve financiamento pelo FUNPAR.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Fernando Gomes Barcellos - Integrante / Mariangela Hungria - Coordenador / Daisy Rickli Binde - Integrante / Ligia Maria de Oliveira Chueire - Integrante / Maria Fabiana Nicolás - Integrante., Financiador(es): Fundação da UFPR para o Desenvolvimento da Ciência, Tecnologia e Cultura - Auxílio financeiro / Governo do Estado do Paraná - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa., Número de produções C, T & A: 2

• 2003 - 2006

  Caracterização de genes de Bradyrhizobium japonicum relacionados à eficiência na fixação biológica do nitrogênio (FBN) com a cultura da soja e capacidade competitiva, Descrição: Projeto relativo à bolsa de Recém Doutor (atual Pós Doutorado Júnior) pelo CNPQ. Neste projeto tivemos como objetivos a identificação e caracterização de genes relacionados à maior eficiência na fixação biológica do nitrogênio (FBN) e à maior capacidade competitiva de estirpes de Bradyrhizobium japonicum, para isso foi utilizada a metodologia de RDA (Representational Difference Annalysis), sendo utilizadas estirpes contrastantes para as características avaliadas. Como resultado deste projeto também, tivemos a caracterização da transferência horizontal de genes simbióticos a partir da estirpe de Bradyrhizobium japonicum utilizada nos inoculantes para estirpes nativas do solo dos Cerrados, o que resultou na publicação de um artigo no periódico "Applied and Environmental Microbiology" em abril de 2007.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Fernando Gomes Barcellos - Coordenador / Mariangela Hungria - Integrante / Pâmela Menna - Integrante / Jesiane Stefênia da Silva Batista - Integrante., Financiador(es): Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa., Número de produções C, T & A: 2

Prêmios