Valdecy Aparecida Rocha da Cruz

Pós-doutorado

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Produções bibliográficas

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• OLIVEIRA ; MACIEL, S. V. S. A. ; CRUZ, V. A. R. ; ALVES, JACKELINE SANTOS ; BASTOS, MARISA SILVA ; OLIVEIRA, LOUISE SARMENTO MARTINS ; DIAZ, IARA DEL PILAR SOLAR ; CAMARGO, G. M. . Gene TYR e a coloração da pelagem em bubalinos. In: XXIII Encontro de Genética do Nordeste (ENGENE), 2021, Petrolina. Genética: Da produção de alimentos à saúde única, 2021.

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• OLIVEIRA, A. C. B. ; OLIVEIRA, C. P. G. ; CRUZ, V. A. R. ; TORRES, J. M. ; DAMASCENO, D. F. ; CUNHA, D. M. ; VERARDO, L. L. ; BONAFE, C. M. . Efeito do ambiente de armazenamento de ovos e fase de postura sobre a qualidade da carne do peito de codornas de corte. In: VI Semana da Integração Ensino, Pesquisa e Extensão, 2018, DIAMANTINA. VI Semana da Integração Ensino, Pesquisa e Extensão. Diamantina, 2018. v. -. p. ---.

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• DAMACENO, D. F. ; ASSIS, C. S. ; CRUZ, V. A. R. ; SOUZA, M. F. ; ANTUNES, H. C. F. ; TORRES, J. M. ; VERARDO, L. L. ; BONAFE, C. M. . Efeito do sexo, ambiente e tempo de armazenamento de ovos no desempenho de codornas de corte. In: VI Semana da Integração Ensino, Pesquisa e Extensão, 2018, Diamantina. VI Semana da Integração Ensino, Pesquisa e Extensão. Diamantina, 2018.

• TORRES, J. M. ; CRUZ, V. A. R. ; SOUZA, M. F. ; OLIVEIRA, A. C. B. ; ANTUNES, H. C. F. ; CUNHA, D. M. ; BONAFE, C. M. ; VERARDO, L. L. . Interação genótipo X ambiente em tilápia do Nilo: boas perspectivas aos produtores. In: VI Semana da Integração Ensino, Pesquisa e Extensão, 2018, Diamantina. VI Semana da Integração Ensino, Pesquisa e Extensão, 2018.

• VIEIRA, J. I. G. ; CAMPIDELLI, T. S. ; CRUZ, V. A. R. ; FONCECA, N. O. ; SOUZA, R. N. ; SANTOS, L. A. R. ; VERARDO, L. L. ; BONAFE, C. M. . Interação genótipo x ambiente para a relação comprimento Padrão/Total (CP/CT) em Tilápia do Nilo. In: VI Semana da Integração Ensino, Pesquisa e Extensão, 2018, Diamantina. VI Semana da Integração Ensino, Pesquisa e Extensão, 2018.

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• PINTO, Adriana Paiva de Paula ; GARCIA, Diogo Anastácio ; PESSOA, Matilde da Conceição ; CRUZ, V. A. R. ; MEGALI, Guilherme de Freitas ; PIRES, Aldrin Vieira ; PEREIRA, Idalmo Garcia . FATORES AMBIENTAIS QUE INFLUENCIAM A PRODUTIVIDADE ACUMULADA DE FÊMEAS EM UM REBANHO NELORE NO NORTE DE MINAS GERAIS. In: X Jornada Científica e Tecnológica da UFVJM, 2008, Diamantina. X Jornada Científica e Tecnológica da UFVJM, 2008.

• GARCIA, Diogo Anastácio ; PINTO, Adriana Paiva de Paula ; Farah, M.M ; CRUZ, V. A. R. ; PEREIRA, Idalmo Garcia ; SILVA, F. F. . Estimativa de herdabilidade para prenhes de novilhas aos14 meses em um rebanho nelore por meio de modelos lineares mistos e generalizados. In: IX Jornada Acadêmica, Científica e Tecnológica da UFVJM, 2007, Diamantina. IX Jornada Acadêmica, Científica e Tecnológica da UFVJM, 2007. p. 259.

• SILVEIRA, J.P.M. ; GARCIA, Diogo Anastácio ; PESSOA, Matilde da Conceição ; CRUZ, V. A. R. ; FONSECA JUNIOR, Armando M da ; PEREIRA, Idalmo Garcia ; PIRES, Aldrin Vieira . Efeito do dia de abate em características de filé em Tilápias. In: IX Jornada Acadêmica, Científica e Tecnológica da UFVJM, 2007, Diamantina. IX Jornada Acadêmica, Científica e Tecnológica da UFVJM, 2007. p. p. 258-258..

• GARCIA, Diogo Anastácio ; Farah, M.M ; SILVEIRA, João Paulo Morais ; CRUZ, V. A. R. ; SILVA, Natan Rodriguez Ferreira de Melo e ; PEREIRA, Idalmo Garcia . Desempenho na fase de cria de produtos de fêmeas sexualmente precoces da raça nelore. In: I Simpósio de Pesquisa em Ciências Agrárias no Semi-Árido Mineiro, 2007, Janaúba. I Simpósio de Pesquisa em Ciências Agrárias no Semi-Árido Mineiro, 2007.

• CRUZ, V. A. R. . Estudos de associação genômica em animais de produção. 2021. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• CRUZ, V. A. R. ; OLIVEIRA, C. P. G. ; GOMES, J. I. ; DAMASCENO, D. F. ; TORRES, J. M. ; MACEDO, V. C. L. E. ; RODRIGUES, R. F. M. ; FERREIRA, T. A. ; SOUZA, M. F. ; BONAFE, C. M. . Influência da fase de postura de matrizes de codorna europeia na qualidade e rendimento da carne. 2017. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• CRUZ, V. A. R. ; SARGOLZAEI, M. ; LARMER, S. G. ; NARAYANA, S. G. ; BONFATTI, V. ; MIGLIOR, F. ; SCHENKEL, F. S. . Genome-Wide Association Study for Milk Fatty Acids in First Lactation Holstein Cows. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CRUZ, V. A. R. . Genome prediction for MIR predicted groups of milk fatty acids in Holstein cattle. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CRUZ, V. A. R. ; SAVEGNAGO, R. P. ; SCHMIDT, G.S. ; LEDUR, M. C. ; MUNARI, D. P. . . Neural networks to predict breeding values of egg production using phenotypic information.. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CRUZ, V. A. R. ; IBELLI, A. M. G. ; MARCHESI, J. A. P. ; PANDOLFI, J. R. C. ; PEIXOTO, J.O ; LEDUR, M.C. ; MUNARI, D. P. . Associação do receptor da adiponectina com cortes nobres e características relacionadas à deposição de gordura em uma linhagem paterna de frangos de corte. 2013. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• CRUZ, V. A. R. ; VENTURINI, G. C. ; PIRES, A. V. ; Filho, R. A. T. ; MUNARI, D. P. ; BAINY,A.M. . Estimativas de parâmetros genéticos dos parâmetros da curva de produção de ovos de uma linha fêmea de frango de corte. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• CRUZ, V. A. R. ; VENTURINI, G. C. ; PEIXOTO, J.O ; LEDUR, M.C. ; SCHMIDT, G.S. ; MUNARI, D. P. . Estimativas de parâmetros genéticos para peso corporal, gordura abdominal e peso de peles em linhagem pura de frangos de corte. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• TEIXERA, Bruno Bastos ; PEREIRA, Idalmo Garcia ; CRUZ, V. A. R. . Proteína bruta e energia metabolizável para codornas de corte (linha 1), dos 36 aos 49 dias de idade. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• TEIXEIRA, B. B. ; PIRES, A. V. ; FIGUEIREDO, F. C. ; CRUZ, V. A. R. ; DRUMOND, E. S. C. ; PEREIRA, I. G . Níveis de proteína bruta e energia metabolizável para codornas de corte (linha 1) de 22 a 35 dias. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2022 - Atual

  Identificação de variantes genéticas associadas ao caráter mocho em bovinos da raça Nelore, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Valdecy Aparecida Rocha da Cruz - Integrante / CAMARGO, GREGÓRIO MIGUEL FERREIRA - Coordenador / Caio Victor Damasceno Carvalho - Integrante / Lucia Galvão de Albuquerque - Integrante / LIMA, DIOGO FELIPE PEREIRA DE ASSIS - Integrante.

• 2022 - Atual

  Estudos genômico-moleculares para tamanho corporal, resistência a parasitas e doenças, variabilidade genética e viabilidade bioquímica de tecidos em equinos e asininos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Raphael Bermal Costa em 20/03/2023., Descrição: Descrição: O presente projeto tem como objetivo propor estudos genômico-moleculares para equinos e asininos. Propõe-se realizar estudos de associação genômica ampla com equinos da raça Campolina para quinze características morfométricas, realizar prospecção e associação de variação do número de cópias, na mesma população, verificar transferabilidade, desequilíbrio de ligação e rearranjo cromossômico em asininos genotipados com chips de SNPs. Estudo de prospecção de polimorfimos e comparação de populações em genes do MHC e PRDM9 em diversas raças de equinos e asininos. Esses genes possuem funções em resistência parasitária e aumento da variabilidade genética. Estudar genes expressos no leite e pele de asininos a fim de se melhor compreender o potencial biológico desses tecidos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (10) / Mestrado acadêmico: (5) / Doutorado: (8) . , Integrantes: Valdecy Aparecida Rocha da Cruz - Integrante / ALVES, JACKELINE SANTOS - Integrante / PINTO, LUIS FERNANDO BATISTA - Integrante / COSTA, RAPHAEL BERMAL - Coordenador / FEITOSA, F. L. B. - Integrante / DE CAMARGO, G.M.F. - Integrante / Diercles Francisco Cardoso - Integrante / Daiane Cristina Becker Scalez - Integrante / aercio Ribeiro Porto-Neto - Integrante / Marina. R. S. Fortes - Integrante / ernanda Nascimento de Godoi - Integrante / arlos Henrique Mendes Malhado - Integrante / Paulo Luiz Souza Carneiro - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2021 - 2022

  Estudo genômico de redemoinhos no pescoço de cavalos da raça Quarto de Milha, Descrição: O objetivo com este projeto é estudar a característica de número de redemoinhos no pescoço em cavalos da raça Quarto de Milha por meio de análises genômicas. Dessa forma, pretende-se identificar regiões genômicas que expressam a característica número de redemoinhos na linhagem trabalho.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Valdecy Aparecida Rocha da Cruz - Coordenador / COSTA, RAPHAEL BERMAL - Integrante / Gregório Miguel Camargo - Integrante / Victoria Camilla Parente Rocha - Integrante / RAFAEL ALVES CASTOR DE CERQUEIRA - Integrante.

• 2021 - 2021

  Parâmetros genéticos para características de redemoinhos em cavalos, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Valdecy Aparecida Rocha da Cruz - Coordenador / COSTA, RAPHAEL BERMAL - Integrante / Gregório Miguel Camargo - Integrante / LIMA, D.F.P DE A. - Integrante.

• 2021 - Atual

  Associação genômica ampla para características relacionadas com a saúde dos cascos de bovinos usando sequência completa do genoma, Descrição: Dentre os problemas sanitários que afligem os bovinos e, consequentemente, seu bem-estar, estão as lesões nos cascos, que causam a claudicação e diminuem a produção leiteira. Assim, processos de seleção que promovam redução da ocorrência de doenças nos cascos podem gerar grande retorno econômico ao sistema de produção, além de proporcionar bem-estar aos animais. Assim, este projeto tem como objetivo realizar análises genômicas para características relacionadas com a saúde do casco em bovinos leiteiros como as dermatites digital e interdigital, hiperplasia interdigital, erosão do talão, úlcera de sola, hemorragia de sola, úlcera de pinça e a doença da linha branca. Serão estimados parâmetros genéticos (herdabilidade e correlações) para todas as variáveis, bem como identificadas regiões genômicas que expliquem parte da variância genética aditiva dessas características. Além disso, será realizado um estudo funcional dos genes encontrados nessas regiões, a fim de gerar novos conhecimentos sobre o controle genético das doenças de casco. Nestes estudos serão utilizadas sequências genômicas completas de bovinos, obtidas após um processo de imputação, que será conduzido em três passos consecutivos: 1) imputação de baixa para média densidade; e 2) imputação de média para alta densidade; 3) imputação de alta densidade para sequência genômica completa. A população da raça Holandesa a ser estudada já se encontra com genótipos e fenótipos controlados. Espera-se com este projeto gerar novos conhecimento sobre o controle genético de características ligadas a doenças de casco em bovinos leiteiros, os quais serão publicados em revistas científicas de alto impacto, bem como gerar conhecimento para ser aplicado nos programas comerciais de seleção em bovinos da raça Holandesa.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Valdecy Aparecida Rocha da Cruz - Integrante / Flavio Schramm Schenkel - Integrante / Luiz F. Brito - Integrante / PINTO, LUIS FERNANDO BATISTA - Coordenador / Victor Breno Pedrosa - Integrante / Luis Paulo Batista Sousa Junior - Integrante.

• 2021 - Atual

  Associação genômica ampla para intervalo entre partos em bovinos da raça Nelore, Descrição: Um intervalo entre partos de 12 meses tem como função maximizar a atividade reprodutiva de bovinos, gerando importantes ganhos econômicos para o sistema produtivo. Assim, esse projeto tem pro objetivo realizar um estudo de associação genômica ampla para intervalo entre partos de bovinos da raça Nelore, a fim de identificar regiões genômicas que expliquem a variação genético-aditiva dessa características bem como identificar genes candidatos que estejam associados a essa fonte de variação. Um total de 3.000 animais genotipados com um chip de SNPs desenvolvido especificamente para zebuínos, o GGP-Indicus 35K serão analisados. Para análises de associação será utilizado o método WssGBLUP, com SNPs adjacentes em janelas de 1,0 Mb. Como controle de qualidade do banco de dados genotípico serão excluídos das análises os SNPs com menor frequência alélica inferior a 5%, diferenças entre heterozigosidades observada e esperada maior que 0,15 (Hardy-Weinberg equilibrium), além dos SNPs e indivíduos com Call rate menor que 90%. No presente estudo apenas marcadores moleculares contidos nos cromossomos autossomos serão utilizados nas análises.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Valdecy Aparecida Rocha da Cruz - Integrante / PINTO, LUIS FERNANDO BATISTA - Coordenador / Victor Breno Pedrosa - Integrante / Mayra Silva Dias - Integrante.

• 2021 - Atual

  Associação genômica ampla para variáveis da reprodução em gado leiteiro utilizando sequência completa do genoma, Descrição: Descrição: Alguns estudos demonstraram que os longos processos de seleção para ampliar a produção de leite ocasionaram também a queda no desempenho reprodutivo dos bovinos. Logo, aprimorar os processos seletivos para melhorar o desempenho reprodutivo de bovinos é um objetivo de fundamental importância econômica. Contudo, características ligadas à fertilidade são de herança complexa e, geralmente, apresentam baixa herdabilidade, o que reduz os ganhos genéticos anuais. A seleção genômica é uma ferramenta que pode contribuir para melhoria desses processos seletivos, especialmente de animais jovens, para critérios ligados à reprodução. Assim, este projeto tem como objetivo realizar análises genômicas para 20 características relacionadas com a fertilidade de bovinos leiteiros. Serão estimados parâmetros genéticos (herdabilidade e correlações) para todas as variáveis, bem como identificadas regiões genômicas que expliquem parte da variância genética aditiva dessas características. Além disso, será realizado um estudo funcional dos genes encontrados nessas regiões, a fim de gerar novos conhecimentos sobre o controle genético da fertilidade. Nestes estudos serão utilizadas sequências genômicas completas de bovinos, obtidas após um processo de imputação, que será conduzido em três passos consecutivos: 1) imputação de baixa para média densidade; 2) imputação de média para alta densidade; e 3) imputação de alta densidade para sequência genômica completa. A população a ser estudada já se encontra com genótipos e fenótipos controlados, sendo composta de animais da raça Holandesa. Ressalta-se que informações no cromossomo X serão também utilizadas neste projeto, o que não tem sido observado em muitos estudos anteriores. Espera-se com este projeto gerar novos conhecimento sobre o controle genético de características ligadas à fertilidade em bovinos leiteiros, os quais serão publicados em revistas científicas de alto impacto, bem como gerar conhecimento para ser aplicado nos programas comerciais de seleção em bovinos da raça Holandesa. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Valdecy Aparecida Rocha da Cruz - Integrante / Flavio Schramm Schenkel - Integrante / Luiz F. Brito - Integrante / PINTO, LUIS FERNANDO BATISTA - Coordenador / Tatiana Cortez de Souza - Integrante / Victor Breno Pedrosa - Integrante.

• 2021 - Atual

  Modelagem genômica e GWAS para longevidade usando sequência completa do genoma em bovinos da raça holandesa, Descrição: O crescimento da população mundial e, consequentemente, da demanda por produtos lácteos, exige maiores estudos para otimizar o sistema de produção de leite. Assim, tem-se buscado vacas que apresentem maior longevidade produtiva. Grande parte dos descartes precoces de vacas estão relacionados com enfermidades ou problemas reprodutivos. Logo, selecionar vacas de maior longevidade pode contribuir para a redução desses problemas no rebanho e reduzir custos no sistema de produção. Assim, este projeto tem como objetivo realizar análises genômicas para características relacionadas com a longevidade em bovinos leiteiros. Serão buscadas diferentes formas de mensurar longevidade em bovinos leiteiros e posteriormente definidas a melhor forma de estimar parâmetros genéticos (herdabilidade e correlações) para longevidade dentro de um estudo genômico com animais genotipados para chips de 50k. Além disso, será realizado um estudo funcional dos genes encontrados nas regiões genômicas associadas a longevidade. Espera-se com este projeto gerar novos conhecimento sobre o controle genético de características ligadas a longevidade produtiva em bovinos leiteiros, os quais serão publicados em revistas científicas de alto impacto, bem como gerar conhecimento para ser aplicado nos programas comerciais de seleção em bovinos da raça Holandesa.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Valdecy Aparecida Rocha da Cruz - Integrante / Luiz F. Brito - Integrante / PINTO, LUÍS FERNANDO BATISTA - Coordenador / Taiana Cortez de Souza - Integrante / Victor Breno Pedrosa - Integrante.

• 2020 - 2022

  Estimação de índice de eficiência reprodutiva e parâmetros genéticos em ovelhas., Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Valdecy Aparecida Rocha da Cruz - Integrante / Gregório Miguel Camargo - Coordenador / SENES, B. B. - Integrante.

• 2020 - 2021

  O gene PRDM9 na diversidade genética de bovinos, Descrição: O objetivo do trabalho é estudar o gene PRDM9 na espécie bovina, conhecer o comportamento deste na evolução e diversidades das raças e fornecer subsídios para futuros estudos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Valdecy Aparecida Rocha da Cruz - Coordenador / CAMARGO, GREGÓRIO MIGUEL FERREIRA - Integrante / COSTA, R.B. - Integrante / Victoria Camilla Parente Rocha - Integrante.

• 2020 - Atual

  Estudo do gene ASIP em pelagem de búfalo, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Valdecy Aparecida Rocha da Cruz - Coordenador / Gregório Miguel Camargo - Integrante.

• 2019 - 2021

  Identificação de genes que atuam na posição do redemoinho na cabeça de equinos, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Valdecy Aparecida Rocha da Cruz - Integrante / Gregório Miguel Camargo - Coordenador / Diogo F P A Lima - Integrante / CURI, ROGÉRIO ABDALLAH - Integrante.

• 2019 - 2019

  Estudo do gene MC1R na pelagem de Búfalo, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Valdecy Aparecida Rocha da Cruz - Coordenador / Gregório Miguel Camargo - Integrante.

• 2018 - 2020

  Análise funcional de genes/proteínas relacionadas a eficiência alimentar em bovinos de corte, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Valdecy Aparecida Rocha da Cruz - Integrante / Cristina Moreira Bonafé - Integrante / LUCAS LIMA VERARDO - Coordenador / JOÃO INACIO GOMES VIEIRA - Integrante.

• 2018 - 2019

  Implementação de criação de Tenébrio molitor e inclusão de diferentes níveis de farinha de inseto na alimentação de codornas, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Valdecy Aparecida Rocha da Cruz - Integrante / Sandra Regina Freitas Pinheiro - Integrante / Danielle Freitas Damasceno - Integrante / Mariele Freitas Souza - Integrante / Cristina Moreira Bonafé - Coordenador / LUCAS LIMA VERARDO - Integrante / JOÃO INACIO GOMES VIEIRA - Integrante / RODRIGO NUNES DE SOUZA - Integrante.

• 2018 - 2019

  Avaliação Genética em Famílias de Tilápias do Nilo da Linhagem Gift, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Valdecy Aparecida Rocha da Cruz - Integrante / Cristina Moreira Bonafé - Integrante / Hellen Cristina Ferreira Antunes - Integrante / LUCAS LIMA VERARDO - Coordenador / MARIANA ALMEIDA DUMONT - Integrante.

• 2017 - 2019

  Avaliação Genética de Tilápias do Nilo Utilizando Modelos de Regressão Aleatória Via Inferência Bayesiana, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Valdecy Aparecida Rocha da Cruz - Integrante / Mariele Freitas Souza - Integrante / Cristina Moreira Bonafé - Coordenador / LUCAS LIMA VERARDO - Integrante / JOÃO INACIO GOMES VIEIRA - Integrante / LUCIO FLAVIO MACEDO MOTA - Integrante / Martinho de Almeida Silva - Integrante.

• 2017 - 2018

  Avaliação genética da produção de carne e ovos de linhagens de codornas de corte, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Valdecy Aparecida Rocha da Cruz - Integrante / Cristina Moreira Bonafé - Coordenador.

• 2016 - 2017

  Ultra-low density SNP panel for early selection of the EBV pigs in Canada, Descrição: Genotyping costs and large number of selection candidates are factors that have substantially contributed to lower uptake of genomics by the swine industry. To reduce costs, genotype imputation is a key approach that allows selection candidates to be genotyped with an affordable low-density (LD) panel and imputed to a high-density SNP panel. However, genotyping all piglets of each farrow using the commercially available SNP chips is still cost prohibitive. Therefore, this study aimed to investigate the accuracy of imputation from nine LD panels (300~10,000 SNPs) to 60K panel and its ability to accurately screen selection candidates within-litter, using genomic and phenotypic simulated data.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Valdecy Aparecida Rocha da Cruz - Coordenador / Zeny Z-Q Feng - Integrante / Mosen Jafarikia - Integrante., Financiador(es): Canadian Centre for Swine Improvement, - Bolsa.

• 2014 - 2016

  Eficiência de imputação e estudo de associação de características de qualidade de leite da raça Holandesa, Descrição: O objetivo do projeto é estimar parâmetros genéticos para características de glóbulo de gordura, caseína e ácidos graxos, assim como, realizar estudo de associação genômica ampla e análises in silico para mapear genes e pathways associados com os marcadores e regiões cromossômicas identificadas. Para realização do presente estudo será utilizada uma base de dados fenotípicos de características de composição do leite e genotípicos de aproximadamente 1000 touros e 3000 vacas genotipados com a Illumina Bovine SNP50 BeadChip (Illumina Inc., San Diego, EUA), pertencente ao Centre for Genetic Improvement of Livestock, Guelph, ON, Canada. A imputação de genótipos será realizada por meio do software Fimpute utilizando genótipos imputados do painel de SNP 50k para o painel de alta densidade 777k (Illuminia Inc., San Diego, CA, USA). O estudo de associação dos genótipos imputados será realizado pelo método de regressão implementado ao programa SNP1101. Posteriormente será realizada análise in silicio com os SNP significativos para as características de composição do leite. Estes serão anotados para seus genes correspondentes ou próximos a uma distância de 100 kbp utilizando o NGS-SNP, a montagem do genoma bovino será feita pelo UMD3.1 e o Ensembl database 66. A lista de genes será anotada utilizando a web ferramenta Database for Annotation, Visualization, and Integrated Discovery (DAVID) 6.7. Em DAVID, a ontologia do gene (GO) será utilizada para identificar genes funcionalmente relacionados, bem como vias biológicas. As associações significativas com FDR de 5% serão alinhadas ao QTL disponível ao público em QTLdb Animal. O objetivo destas análises é identificar possíveis regiões genômicas e genes candidatos relacionadas com a expressão de tais polimorfismos e fornecer subsídios ao programa de avaliação genética da raça Holandesa.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Valdecy Aparecida Rocha da Cruz - Integrante / Mehdi Sargolzaei - Integrante / Flavio Schramm Schenkel - Coordenador / Filippo Miglior - Integrante / Steven G Larmer - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2014 - 2016

  Estudo do nível de mistura em animais da raça Canchim e grupo genético MA utilizando painel de polimorfismos de nucleotídeo único de alta densidade, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Marcos Eli Buzanskas em 14/09/2015., Descrição: Tecnologias de sequenciamento do genoma em conjunto com metodologias estatísticas têm contribuído para a aplicação de ferramentas genômicas no melhoramento genético animal. O desenvolvimento de raças sintéticas no Brasil,provenientes de cruzamentos entre as subespécies Bos taurus indicus (Zebu) e Bos taurus taurus (Taurino), é de grande valia quando deseja-se combinar a resistência e adaptabilidade de animais zebuínos com o elevado rendimento de carcaça e precocidade de animais taurinos. A troca de material genético entre duas ou mais populações (raças)resultará em indivíduos com diferentes níveis de mistura ( admixture ), em que ocorre a fragmentação de genomas ancestrais e consequente combinação de tais fragmentos nos indivíduos decorrentes deste evento. Ainda, informações a respeito da época em que tais eventos ocorreram e a respectiva contribuição de cada população (raça) na formação de uma população cruzada podem ser estimadas de forma acurada com a utilização de ferramentas moleculares. Assim, o objetivo deste projeto de pesquisa é estimar a contribuição das raças Nelore e Charolês na formação da raça sintética Canchim, por meio de análise de nível de mistura. Serão utilizados genótipos obtidos por meio de genotipagem de polimorfismos de nucleotídeo único (SNP) de alta densidade de 285indivíduos da raça Canchim, 114 do grupo genético MA, 790 da raça Nelore e 15 da raça Charolês, provenientes de um rebanho de estudo da Empresa Brasileira da Pesquisa Agropecuária. Análises serão conduzidas utilizando-se as metodologias Bayesiana,regressão simples e multivariada.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (4) . , Integrantes: Valdecy Aparecida Rocha da Cruz - Integrante / Danísio Prado Munari - Integrante / Salvador Boccaletti Ramos - Integrante / Maurício Mello de Alencar - Integrante / SAVEGNAGO, R.P - Integrante / BUZANSKAS, M. E. - Coordenador / Tatiane Cristina Selequim Chud - Integrante / Fernando Baldi - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2009 - 2010

  Seleção e avaliação genética de linhagens de codornas de corte e de seus cruzamentos, submetidos a dietas contendo diferentes níveis de proteína e energia, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Valdecy Aparecida Rocha da Cruz - Integrante / Aldrin Vieira Pires - Coordenador.

• 2008 - 2009

  Seleção e Avaliação genética de linhagens de codornas de corte, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Valdecy Aparecida Rocha da Cruz - Integrante / Aldrin Vieira Pires - Coordenador.

Prêmios