Flávia da Silva Fernandes

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Orientou

Produções bibliográficas

• FONSECA, RAISSA SAYUMY KATAKI ; LOTAS, KEVYN MELO ; CORTEZ, ANA CLAUDIA ALVES ; FERNANDES, FLÁVIA DA SILVA ; DE SOUZA, ÉRICA SIMPLÍCIO ; DUFOSSÉ, LAURENT ; DE SOUZA, JOÃO VICENTE BRAGA . Exploration of carotenoid-producing Rhodotorula yeasts from amazonian substrates for sustainable biotechnology applications. Current Research In Microbial Sciences , v. 8, p. 100373, 2025.

• LOTAS, K. M. ; FONSECA, R. S. K. ; COSTA, J. C. M. ; CORTEZ, A. C. A. ; SOUZA, F. C. A. ; FERNANDES, F. S. ; ENNES, J. F. V. ; SILVA, J. P. A. ; CARNEIRO, L. M. ; CANTO, E. S. M. ; ZELSKI, S. E. ; SOUZA, J. V. B. ; SOUZA, E. S. . Enhancing Pleurotus ostreatus P. Kumm cultivation on peel of the fruit of Astrocaryum aculeatum (Jacq.) G. Mey by investigating the influence of moisture and supplementation with wheat bran. BRAZILIAN JOURNAL OF BIOLOGY (ONLINE) , v. 85, p. e288450, 2025.

• DE FÁTIMA LAZAMETH-DINIZ, NAYARA ; DA SILVA QUEIROZ, ADRIANA OLIVEIRA ; DA SILVA FERNANDES, FLÁVIA ; ENNES, JOÃO FERNANDO VIEIRA ; DE SOUSA, NAIRA SULANY OLIVEIRA ; CORTEZ, ANA CLAUDIA ALVES ; DA SILVA BATISTA, JACQUELINE ; CANTO, EVELEISE SAMIRA MARTINS ; CRUZ, KÁTIA SANTANA ; JACKISCH-MATSUURA, ANI BEATRIZ ; FERNANDES, ORMEZINDA CELESTE CRISTO ; DE ANDRADE, SUANNI LEMOS ; DE SOUZA, ÉRICA SIMPLÍCIO ; FRICKMANN, HAGEN ; DE SOUZA, JOÃO VICENTE BRAGA . Feline Cryptococcosis due to VGII (Recently Renamed as ) in an FIV-Positive Cat With Demodicosis From Manaus, Central Amazon, Brazil. CASE REPORTS IN VETERINARY MEDICINE , v. 2025, p. 1, 2025.

• SOUSA, NAIRA SULANY OLIVEIRA DE ; ALMEIDA, JUAN DIEGO RIBEIRO DE ; ROCHA, LINNEK SILVA DA ; MOREIRA, IZABELA DE MESQUITA BÁRCIA ; FERNANDES, FLÁVIA DA SILVA ; MATSUURA, ANI BEATRIZ JACKISCH ; CRUZ, KÁTIA SANTANA ; LIMA, EMERSOM SILVA ; SOUZA, ÉRICA SIMPLÍCIO DE ; FRICKMANN, HAGEN ; SOUZA, JOÃO VICENTE BRAGA DE . Antifungal Activity of Selected Naphthoquinones and Their Synergistic Combination with Amphotericin B Against Cryptococcus neoformans H99. ANTIBIOTICS-BASEL , v. 14, p. 602-700, 2025.

• JALKH, A. P. ; SOUSA, NAIRA SULANY OLIVEIRA DE ; ALMEIDA, JUAN DIEGO RIBEIRO DE ; FERNANDES, FLÁVIA DA SILVA ; CRUZ, KÁTIA SANTANA ; FRICKMANN, HAGEN ; LACERDA, M. V. G. ; SOUZA, JOÃO VICENTE BRAGA DE . Cutaneous cryptococcosis resembling keratoacanthoma. doi.org/10.1590/0037-8682-0300-2024 , v. 58, p. 1-7, 2025.

• LAZAMETH-DINIZ, NAYARA FÁTIMA ; ALMEIDA, DANIELLE BARRETO DE ; FERNANDES, FLÁVIA DA SILVA ; QUEIROZ, ADRIANA OLIVEIRA DA SILVA ; SOUZA, ÉRICA SIMPLICIO DE ; CRUZ, KÁTIA SANTANA ; MATSUURA, ANI BEATRIZ JACKISCH ; FRICKMANN, HAGEN ; SOUZA, JOÃO VICENTE BRAGA DE . Clinical and Molecular Characterization of Feline Sporotrichosis in the Brazilian Amazon: PCR-Based Identification of Sporothrix brasiliensis. ANIMALS , v. 15, p. 2318-2322, 2025.

• FERNANDES, FLÁVIA DA SILVA ; DA SILVA, LUAN REIS HONORATO ; DE SOUZA, ÉRICA SIMPLÍCIO ; CARNEIRO, LÍVIA MELO ; SILVA, JOÃO PAULO ALVES ; ZELSKI, STEVEN ; DE SOUZA, JOÃO VICENTE BRAGA ; BATISTA, JACQUELINE DA SILVA . Isolation, genetic identification of Amazonian yeasts and analysis of thermotolerance and alcohol tolerance of Saccharomyces cerevisiae from Theobroma grandiflorum and Eugenia stipitata. AIMS BIOENGINEERING (ONLINE) , v. 11, p. 24-42, 2024.

• DA SILVA, LUAN REIS HONORATO ; FERNANDES, FLÁVIA DA SILVA ; SANTOS, JOCÉLIA PINHEIRO ; DE SOUZA, ÉRICA SIMPLÍCIO ; CARNEIRO, LÍVIA MELO ; SILVA, JOÃO PAULO ALVES ; BATISTA, JACQUELINE DA SILVA ; DE SOUZA, JOÃO VICENTE BRAGA . Bioprospecting Saccharomyces cerevisiae in fruits from Amazonian region for beer brewing. AIMS BIOENGINEERING (ONLINE) , v. 11, p. 130-146, 2024.

• LOTAS, K. M. ; FONSECA, R. S. K. ; COSTA, J. C. M. ; CORTEZ, A. C. A. ; SOUZA, F. C. A. ; BARRETO, M. R. ; CARNEIRO, LÍVIA MELO ; ALVES SILVA, JOÃO PAULO ; CANTO, E. S. M. ; DA SILVA FERNANDES, FLÁVIA ; DE SOUZA, JOÃO VICENTE BRAGA ; DE SOUZA, ÉRICA SIMPLÍCIO . Optimization of laccase production by Pleurotus ostreatus (Jacq.) P. Kumm. using agro-industrial residues: a comparative study on peels of tucumã (Astrocaryum aculeatum G. Mey.) and pupunha (Bactris gasipaes Kunth) fruits. AIMS BIOENGINEERING (ONLINE) , v. 11, p. 4, 2024.

• DA SILVA FERNANDES, FLÁVIA ; DE SOUZA, ÉRICA SIMPLÍCIO ; CARNEIRO, LÍVIA MELO ; ALVES SILVA, JOÃO PAULO ; DE SOUZA, JOÃO VICENTE BRAGA ; DA SILVA BATISTA, JACQUELINE . Current Ethanol Production Requirements for the Yeast Saccharomyces cerevisiae. International Journal of Microbiology , v. 2022, p. 1-14, 2022.

• FERNANDES, F. S. ; FARIAS, A. V. ; CARNEIRO, L. M. ; SANTOS, R. A. ; TORRES, D. R. ; SILVA, J. P. A. ; SOUZA, J.V.B. ; SOUZA, E.S . Dilute acid hydrolysis of wastes of fruits from Amazon for ethanol production. AIMS BIOENGINEERING (ONLINE) , v. 8, p. 221-224, 2021.

• FERNANDES, F. S. ; FARIAS, A. V. ; SANTOS, R. A. ; SOUZA, E. S. ; SOUZA, J. V. B. . DETERMINAÇÃO DA QUANTIDADE DE AÇÚCARES REDUTORES DOS HIDROLISADOS ENZIMÁTICOS DE RESÍDUOS AMAZÔNICOS PARA OBTENÇÃO DE BIOETANOL. The Journal of Engineering and exact sciences , v. 3, p. 1-7, 2017.

• FERNANDES, F. S. ; SOUZA, J.V.B. ; BATISTA, J. S. . Existe Saccharomyces cerevisiae tolerante a temperatura no cupuaçuzeiro?. In: Junielson Silva; Renato Lima; Simone Soares; Jacqueline Batista; Kyara Formiga. (Org.). DNAlogando sobre conservação e biologia evolutiva na Amazônia. 1ed.Ananindeua: Itacaiúnas, 2021, v. 1, p. 1-105.

• SANTOS, RALYVAN ARAÚJO DOS ; FERNANDES, FLÁVIA DA SILVA ; FARIAS, A. V. ; SOUZA, JOÃO VICENTE BRAGA DE ; SOUZA, ÉRICA SIMPLÍCIO DE . Potencial da levedura Candida humilis inpa1105 para a produção de proteína unicelular e etanol a partir dos hidrolisados ácidos de resíduos vegetais Amazônicos. In: Oliveira L.A., Bentes J.L.S., Jesus M.A., Rocha L.C.,Fernandes O.C., Andrade S.L., Souza A.Q.L.. (Org.). Diversidade Microbiana da Amazônia. 1ed.Manaus: Editora INPA, 2017, v. 2, p. 40-47.

• FARIAS, A. V. ; FERNANDES, F. S. ; SANTOS, R. A. ; SOUZA, E.S ; SOUZA, J.V.B. . Determinação da quantidade de glicose dos hidrolisados de resíduos amazônicos para obtenção de bioetanol. In: 21° Congresso de Engenharia Química, 2016, Fortaleza. Anais do 21° Congresso de Engenharia Química, 2016.

• FERNANDES, F. S. ; GOES, A. F. ; SOUZA, JOÃO VICENTE BRAGA DE ; BATISTA, J. S. . Searching for yeast with biotechnology importance: Isolation and genetic identification in amazon sample plants. In: 66th Brazilian Congress of Genetics, 2021. 66th Brazilian Congress of Genetics, 2021.

• FERNANDES, FLÁVIA DA SILVA ; SANCHES, M. A. ; SEGUNDO, W. O. P. F. ; SOUZA NETO, J. N. ; SOUZA, J.V.B. . Influência das condições nutricionais na produção de biossurfactante pelo fungo filamentoso Fusarium oxysporum 2LIVI. In: 6º CONGRESSO SOBRE DIVERSIDADE MICROBIANA DA AMAZÔNIA-CDMICRO, 2016, Manaus. 6º CDMICRO, 2016.

• FERNANDES, F. S. ; SANTOS, R. A. ; FARIAS, A. V. ; CARMO, E. J. ; SOUZA, J.V.B. ; SOUZA, E.S . Performance of saccharomyces cerevisiae strains widely used for production of Fuel-Ethanol in fermentation medium. In: 28 Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2015, Florianopólis. ANAIS DO 28º CBM 2015, 2015.

• FARIAS, A. V. ; DE SOUZA, JOÃO VICENTE BRAGA ; FERNANDES, F. S. ; SANTOS, RALYVAN ARAÚJO DOS ; SOUZA, E.S . Chemical composition of enzymatic hydrolysates obtained from residues of open market places in the city of manaus-am, brazil: potencial study of such as substracts for production of bioethanol. In: 28 Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2015, Florianópolis. 28 Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2015.

• SANTOS, RALYVAN ARAÚJO DOS ; SOUZA, J.V.B. ; FERNANDES, FLAVIA DA SILVA ; SOUZA, E.S . Chemical composition of acid hydrolysates obtained from residues of open market places in the city of Manaus- AM,Brasil. In: 28 Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2015, Florianópolis. 28 Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2015.

• FERNANDES, F. S. ; ARAUJO, A.E ; ALMEIDA, V.C ; SOUZA, N. R. ; SILVA.G.F . Lenght polymorphism in the ribosomal DNA intergenic spacers from Colletotrichum species. In: 27° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2013, Natal-RN. 27° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2013.

• FERNANDES, F. S. ; ALMEIDA, V.C ; ARAUJO, A.E ; SOUZA, N. R. ; SILVA.G.F . Analysis of ribosomal RNA intergenic spacer (IGS) in Colletotrichum gossypii and Colletotrichum gossypii var. cephalosporioides. In: 27° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2013, Natal-RN. 27° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2013.

• FERNANDES, F. S. ; SOUZA, N. R. ; GASPAROTTO, L. ; DITA, M. A. ; SILVA.G.F . Mutagênese insercional mediada por Agrobacterium tumefaciens (ATMT) em Fusarium oxysporum f. sp. cubense: seleção de transformantes com deficiência na esporulação. In: 45º Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2012, Manaus. Anais do 45º Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2012.

• SOUZA, R. F. ; FERNANDES, F. S. ; GASPAROTTO, L. ; HANADA, R. E. ; SOUZA, N. R. ; SILVA.G.F . Estrutura genética e diversidade do agente etiológico da Sigatoka-negra coletado em sete estados do brasil.. In: Anais do 45º Congresso Brasileiro de Fitopatologia., 2012, Manaus. Anais do 45º Congresso Brasileiro de Fitopatologia.., 2012.

• FERNANDES, F. S. ; SOUZA, E.S ; FARIAS, A. V. ; SANTOS, R. A. ; CARMO, E. J. ; SOUZA, J.V.B. . Performance of saccharomyces cerevisiae strains widely used for production of Fuel-Ethanol in fermentation medium. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• FERNANDES, F. S. ; ALMEIDA, V.C ; SILVA.G.F ; SOUZA, N. R. ; ARAUJO, A.E . Analysis of ribossomal RNA intergenic spacer (IGS) in isolates of Colletrotrichum gossypii and C. gossypii var. cephalosporioides. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• FERNANDES, F. S. ; SOUZA, N. R. ; GASPAROTTO, L. ; DITA, M. A. ; SILVA.G.F . Mutagênese insercional mediada por Agrobacterium tumefaciens (ATMT) em Fusarium oxysporum f. sp. cubense: seleção de transformantes com deficiência na esporulação. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• FERNANDES, F. S. . Produção de Cerveja Artesanal. 2016. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

• FERNANDES, F. S. . Fermentação Alcóolica. 2016. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

Projetos de pesquisa

• 2023 - 2024

  Efeito antifúngico de naftoquinonas semissintéticas de forma isolada e em associação com Anfotericina B frente a cepas do complexo C. neoformans e C. gattii, Descrição: Nesse projeto em que estou desenvolvendo após o doutorado me dedico a estudar a genética e a preservação dos agentes causadores de Criptococose em nossa região e Investigar o efeito antifúngico de naftoquinonas semissintéticas de forma isolada e em associação com Anfotericina B frente a cepas do complexo C. neoformans e C. gattii. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Flávia da Silva Fernandes - Integrante / DE SOUZA, ÉRICA SIMPLÍCIO - Integrante / DE SOUZA, JOÃO VICENTE BRAGA - Coordenador.

• 2022 - 2023

  Construção de chaves de identificação molecular de peixes processados a partir de qPCR e marcadores microssatélites, Descrição: O presente projeto teve por objetivo realizar a análise para certificação molecular das espécies de peixes Colossoma macropomum, Plagioscion squamosissimus e Arapaima gigas, com o desenvolvimento de sistemas de detecção molecular espécie-específica (kits biotecnológicos) envolvendo o uso de DNA minibarcodes, associados a técnica de PCR em tempo real (qPCR), e de marcadores microssatélites, a fim de identificar uma maior quantidade de espécies destes grupos de peixes comercializados como pescado processado em postas ou filés, e com menor custo-benefício possível a atender o merca. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Flávia da Silva Fernandes - Integrante / Jacqueline da Silva Batista - Coordenador.

• 2017 - 2023

  Isolamento de leveduras presentes em mel de abelha e frutos da região amazônica e caracterização molecular de Saccharomyces cerevisiae tolerantes à temperatura e ao etanol, Descrição: O etanol é uma alternativa para reduzir, em escala global, problemas ambientais e energéticos em razão da escassez e alta dos preços dos combustíveis fósseis e da poluição por eles ocasionada. No entanto, faz se necessária a busca de leveduras com maior tolerância para os processos de produção de etanol de 2 geração (etanol produzido de resíduos) onde a sacarificação e a fermentação devem ocorrer a 50C. Desse modo, a descoberta nesse estudo de leveduras amazônicas termotolerantes capazes de produzir etanol a temperaturas acima daquelas toleradas por linhagens industriais e em mostos com altas concentrações de etanol é importante para um processo de produção de etanol mais eficiente e de baixo custo. Com a grande biodiversidade que a Amazônia apresenta temos como objetivo isolar cepas de Saccharomyces cerevisiae tolerantes a temperatura e ao etanol de frutos e mel de abelha da região amazônica e investigar geneticamente a presença de SNPS em três genes nessa espécie: ASR1 (essencial para o crescimento normal da célula em meio contendo altas concentrações de álcool), FPS1 (aumenta a habilidade da levedura de produzir elevadas concentrações de álcool) CDC25 (gene ligado a termotolerância) e por fim avaliar a produção de etanol com as leveduras selecionadas em temperatura e concentração de etanol elevadas para verificar seu potencial na indústria alcooleira. Os resultados obtidos contribuíram para a compreensão da diversidade microbiana na região, os genes importantes para o estresse nesses organismos, e para o potencial de aplicação biotecnológica dessas leveduras.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Flávia da Silva Fernandes - Coordenador / João Vicente Braga de Souza - Integrante / Jacqueline da Silva Batista - Integrante.

• 2017 - 2018

  Infecções fúngicas pulmonares em pacientes da policlínica Cardoso Fontes Manaus/AM, Descrição: Nesse estudo o objetivo foi estimar a frequência de infecções fúngicas em pacientes com suspeita clínica e radiológica de tuberculose pulmonar, utilizando diversas ferramentas laboratoriais, inclusive a biologia molecular como a reação em cadeia da polimerase (PCR), para o diagnóstico etiológico, em pacientes atendidos na Policlínica Cardoso Fontes. As cepas foram preservadas na coleção para estudos posteriores.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Flávia da Silva Fernandes - Integrante / DE SOUZA, JOÃO VICENTE BRAGA - Coordenador / Joycenéa da Silva Matsuda - Integrante.

• 2014 - 2016

  Utilização do hidrolisado ácido e enzimático produzido a partir de resíduos vegetais obtidos em feiras abertas da cidade de Manaus para produção de bioetanol, Descrição: Neste projeto, investigou-se a utilização do hidrolisado ácido e enzimático produzido a partir de resíduos vegetais obtidos em feiras abertas da cidade de Manaus para produção de bioetanol. Foram reativadas cepas comerciais que foram preservadas na coleção com diferentes métodos: repique contínuo, água destilada esterilizada e liofilização para que possam ser utilizadas em estudos posteriores. Os resultados destacaram o potencial desses resíduos como substrato para a produção de biocombustíveis e a habilidade dessas leveduras de fermentar mesmo após diferentes métodos de preservação.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Flávia da Silva Fernandes - Integrante / Erica Simplício de Souza - Coordenador / João Vicente Braga de Souza - Integrante.

• 2013 - 2014

  Caracterização molecular de Colletotrichum gossypii e Colletotrichum gossypii var cephalosporioides agentes causais da antracnose e da ramulose do algodoeiro, por meio de análise da região IGS (Intergenic spacer) do rDNA.A antracnose e a ramulose causadas, Descrição: A antracnose e a ramulose causadas respectivamente por Colletotrichum gossypii (GC) e C. gossypii var. cephalosporioides (GCC) são importantes doenças do algodoeiro. Os patógenos são transmitidos por sementes e morfologicamente similares, tornando difícil diferenciá-los por métodos convencionais. Uma alternativa seria o uso de técnicas moleculares. Regiões do espaço intergenético (IGS) do DNA ribossomal apresentam elevado polimorfismo inter e intraespecífico, por isso são muito utilizadas na análise filogenética. Este trabalho objetiva estudar a variabilidade da região IGS do rDNA entre isolados desses fungos por meio de PCR-RFLP. Durante o projeto foram utilizadas técnicas de preservação em oléo mineral e água destilada.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Flávia da Silva Fernandes - Integrante / Gilvan Ferreira da Silva - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2012 - 2013

  Silenciamento do gene fow2 por meio de RNA de interferência em Fusarium oxysporum f. sp. cubense, Descrição: Descrição: Fusarium oxysporum f. sp. cubense (FOC) é o agente causador do Mal-do-Panamá em bananeiras, uma das principais doenças para a cultura de bananas no mundo. Avanços no conhecimento genético deste patógeno são necessários para a combinação de estratégias, visando ao controle da doença que causa perdas significativas nas cadeias produtivas da banana. Com a disponibilidade de dados de sequência do genoma completo é possível estudar a função de genes em FOC por meio de duas abordagens: knockout e knockdown de genes específicos, sendo este último um silenciamento por meio de RNA de interferência (RNAi), onde a função do gene é avaliada pelo fenótipo gerado mediante a redução do transcrito do gene que se deseja estudar. Para determinar a função do gene fow2 em FOC, o objetivo deste trabalho é obter linhagens recombinantes contendo o cassete para silenciamento por RNAi.Foram utilizadas técnicas de preservação como repique contínuo e criopreservação durante projeto.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Flávia da Silva Fernandes - Integrante / Gilvan Ferreira da Silva - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2012

  Silenciamento do gene que codifica o fator de transcrição Fow2 em Fusarium oxysporum f. sp. cubense, Descrição: Fusarium oxysporum f. sp. cubense (FOC) é o agente causador do Mal-do-Panamá em bananeiras, uma das principais doenças para a cultura de bananas no mundo. Avanços no conhecimento genético deste patógeno são necessários para a combinação de estratégias, visando ao controle da doença que causa perdas significativas nas cadeias produtivas da banana. A abordagem utilizando genética reversa tem sido favorecida pelos avanços das técnicas de sequenciamento em larga escala e, com isto, o número de transcriptomas e genomas completos de fungos está aumentando rapidamente. Com a disponibilidade de dados de sequência do genoma completo é possível estudar a função de genes em FOC por meio de duas abordagens: knockout e knockdown de genes específicos, o knockout a função do gene é avaliada pelo fenótipo gerado mediante a perda do transcrito do gene que se deseja estudar. Para determinar a função do gene fow2 em FOC, o objetivo deste trabalho é obter linhagens via recombinação homóloga para o gene fwo2 por meio de transformação genética mediada por Agrobacterium tumefaciens em F. oxysporum f. sp cubense Foram utilizadas técnicas de criopreservação e repique continuo durante projeto para manutenção dos microrganismos,. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Flávia da Silva Fernandes - Integrante / Gilvan Ferreira da Silva - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas - Bolsa.